# TARGET T0367 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0367.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 38 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.995 2 D 0.006 0.015 0.007 0.531 0.002 0.032 0.407 3 E 0.001 0.003 0.009 0.747 0.059 0.060 0.121 4 L 0.001 0.001 0.006 0.895 0.016 0.028 0.054 5 E 0.001 0.001 0.004 0.947 0.014 0.014 0.020 6 L 0.001 0.001 0.003 0.971 0.008 0.010 0.007 7 R 0.001 0.001 0.002 0.982 0.003 0.007 0.005 8 I 0.001 0.001 0.001 0.988 0.003 0.006 0.002 9 R 0.001 0.001 0.001 0.974 0.003 0.019 0.003 10 K 0.001 0.001 0.001 0.960 0.003 0.029 0.007 11 A 0.001 0.001 0.002 0.962 0.004 0.020 0.012 12 E 0.001 0.001 0.002 0.965 0.005 0.023 0.005 13 K 0.001 0.001 0.002 0.951 0.008 0.030 0.008 14 L 0.001 0.001 0.002 0.949 0.005 0.036 0.008 15 V 0.001 0.001 0.002 0.971 0.007 0.011 0.009 16 Q 0.001 0.001 0.004 0.978 0.003 0.012 0.003 17 D 0.001 0.001 0.003 0.969 0.002 0.022 0.003 18 A 0.001 0.001 0.003 0.970 0.006 0.015 0.006 19 K 0.001 0.001 0.004 0.971 0.004 0.017 0.004 20 K 0.001 0.001 0.006 0.932 0.007 0.046 0.008 21 E 0.001 0.001 0.011 0.882 0.010 0.080 0.015 22 F 0.003 0.005 0.016 0.778 0.043 0.089 0.066 23 E 0.003 0.003 0.027 0.668 0.040 0.177 0.082 24 M 0.001 0.001 0.017 0.336 0.058 0.534 0.053 25 G 0.002 0.001 0.008 0.194 0.092 0.609 0.094 26 L 0.007 0.010 0.010 0.356 0.127 0.080 0.409 27 Y 0.008 0.006 0.011 0.795 0.046 0.019 0.114 28 E 0.007 0.001 0.008 0.905 0.019 0.024 0.036 29 R 0.005 0.001 0.008 0.947 0.011 0.017 0.012 30 C 0.003 0.001 0.004 0.967 0.005 0.012 0.008 31 C 0.001 0.001 0.001 0.982 0.004 0.006 0.005 32 S 0.001 0.001 0.001 0.988 0.003 0.005 0.003 33 T 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.006 0.004 34 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.002 35 Y 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 36 Y 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 37 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 38 M 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 39 F 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 40 H 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.005 0.001 41 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 42 A 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 43 K 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 44 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 45 M 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.003 0.001 46 L 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.006 0.002 47 L 0.001 0.001 0.002 0.966 0.002 0.027 0.002 48 G 0.001 0.001 0.005 0.895 0.007 0.086 0.007 49 Y 0.001 0.001 0.007 0.363 0.024 0.591 0.013 50 G 0.001 0.001 0.005 0.031 0.053 0.829 0.080 51 R 0.006 0.014 0.004 0.008 0.135 0.022 0.812 52 D 0.023 0.043 0.007 0.007 0.111 0.016 0.794 53 S 0.018 0.011 0.118 0.059 0.236 0.204 0.354 54 K 0.012 0.006 0.140 0.072 0.173 0.431 0.167 55 T 0.042 0.015 0.148 0.158 0.152 0.277 0.209 56 H 0.117 0.025 0.049 0.281 0.135 0.080 0.312 57 R 0.126 0.015 0.038 0.411 0.068 0.092 0.250 58 G 0.218 0.017 0.058 0.464 0.045 0.091 0.106 59 T 0.198 0.016 0.066 0.547 0.033 0.053 0.088 60 I 0.221 0.009 0.078 0.535 0.025 0.045 0.087 61 Y 0.225 0.005 0.089 0.500 0.033 0.061 0.087 62 L 0.186 0.009 0.075 0.481 0.051 0.092 0.106 63 I 0.123 0.011 0.058 0.535 0.064 0.080 0.128 64 W 0.089 0.007 0.052 0.548 0.077 0.092 0.134 65 E 0.093 0.004 0.047 0.638 0.042 0.077 0.099 66 C 0.111 0.005 0.035 0.661 0.049 0.061 0.079 67 R 0.188 0.010 0.027 0.589 0.054 0.046 0.086 68 E 0.142 0.006 0.023 0.629 0.049 0.053 0.098 69 E 0.079 0.007 0.023 0.604 0.057 0.120 0.110 70 L 0.023 0.003 0.032 0.435 0.072 0.357 0.079 71 G 0.025 0.004 0.034 0.159 0.121 0.502 0.154 72 L 0.102 0.021 0.050 0.169 0.154 0.115 0.389 73 S 0.185 0.036 0.054 0.202 0.092 0.084 0.347 74 D 0.154 0.014 0.063 0.167 0.117 0.113 0.373 75 D 0.169 0.011 0.109 0.283 0.115 0.116 0.197 76 D 0.262 0.012 0.083 0.266 0.094 0.118 0.165 77 C 0.350 0.013 0.075 0.225 0.083 0.079 0.175 78 S 0.428 0.012 0.044 0.188 0.060 0.053 0.215 79 K 0.417 0.012 0.049 0.200 0.056 0.055 0.212 80 L 0.416 0.012 0.040 0.200 0.057 0.052 0.223 81 S 0.270 0.025 0.031 0.237 0.084 0.049 0.305 82 R 0.198 0.018 0.020 0.182 0.064 0.028 0.490 83 A 0.119 0.009 0.051 0.334 0.048 0.079 0.360 84 F 0.091 0.009 0.092 0.403 0.071 0.118 0.216 85 D 0.080 0.007 0.127 0.414 0.097 0.099 0.177 86 L 0.048 0.011 0.105 0.512 0.087 0.101 0.136 87 R 0.038 0.009 0.099 0.457 0.086 0.139 0.171 88 E 0.021 0.005 0.087 0.364 0.091 0.318 0.115 89 E 0.017 0.008 0.051 0.294 0.143 0.351 0.136 90 S 0.028 0.015 0.017 0.126 0.351 0.062 0.402 91 D 0.030 0.016 0.018 0.056 0.092 0.073 0.714 92 Y 0.022 0.013 0.203 0.272 0.077 0.265 0.147 93 G 0.026 0.005 0.260 0.251 0.113 0.218 0.128 94 I 0.026 0.006 0.300 0.284 0.083 0.184 0.115 95 Y 0.074 0.015 0.136 0.228 0.136 0.218 0.192 96 K 0.127 0.017 0.076 0.229 0.106 0.106 0.339 97 E 0.190 0.027 0.047 0.252 0.096 0.080 0.307 98 V 0.123 0.036 0.034 0.242 0.142 0.067 0.356 99 S 0.050 0.016 0.013 0.226 0.126 0.037 0.532 100 K 0.002 0.001 0.018 0.927 0.017 0.015 0.020 101 D 0.001 0.001 0.012 0.954 0.009 0.014 0.010 102 L 0.001 0.001 0.012 0.963 0.004 0.014 0.006 103 A 0.001 0.001 0.003 0.976 0.005 0.008 0.006 104 I 0.001 0.001 0.001 0.980 0.005 0.010 0.003 105 K 0.001 0.001 0.001 0.974 0.003 0.018 0.003 106 I 0.001 0.001 0.001 0.973 0.002 0.021 0.004 107 L 0.001 0.001 0.001 0.980 0.003 0.012 0.004 108 K 0.001 0.001 0.001 0.974 0.003 0.019 0.002 109 D 0.001 0.001 0.001 0.971 0.001 0.024 0.002 110 A 0.001 0.001 0.001 0.988 0.002 0.007 0.003 111 E 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 112 I 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.006 0.001 113 F 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.005 0.001 114 V 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 115 Q 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 116 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 117 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 118 K 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 119 N 0.001 0.001 0.002 0.986 0.002 0.008 0.001 120 A 0.001 0.001 0.004 0.978 0.002 0.014 0.002 121 V 0.002 0.002 0.005 0.939 0.008 0.036 0.008 122 N 0.005 0.001 0.010 0.747 0.030 0.170 0.036 123 K 0.008 0.002 0.009 0.386 0.104 0.402 0.090 124 N 0.010 0.008 0.007 0.112 0.008 0.179 0.676 125 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998