# TARGET T0366 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0366.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1382 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 T 0.375 0.043 0.018 0.116 0.149 0.299 2 E 0.434 0.022 0.043 0.146 0.136 0.218 3 N 0.365 0.021 0.089 0.127 0.200 0.198 4 L 0.258 0.020 0.113 0.152 0.264 0.192 5 Y 0.256 0.020 0.092 0.183 0.245 0.205 6 F 0.309 0.025 0.098 0.144 0.249 0.176 7 Q 0.215 0.015 0.062 0.074 0.390 0.243 8 S 0.160 0.030 0.041 0.027 0.556 0.186 9 M 0.125 0.012 0.039 0.020 0.629 0.175 10 G 0.118 0.013 0.022 0.010 0.579 0.258 11 L 0.313 0.022 0.011 0.005 0.316 0.333 12 R 0.542 0.011 0.004 0.005 0.098 0.340 13 T 0.859 0.007 0.001 0.003 0.025 0.104 14 V 0.939 0.003 0.001 0.003 0.011 0.044 15 E 0.961 0.002 0.001 0.002 0.007 0.028 16 M 0.963 0.002 0.001 0.001 0.007 0.026 17 K 0.889 0.004 0.002 0.003 0.032 0.070 18 K 0.653 0.012 0.003 0.003 0.105 0.224 19 G 0.211 0.012 0.011 0.003 0.503 0.259 20 P 0.059 0.008 0.028 0.003 0.691 0.211 21 T 0.047 0.009 0.045 0.003 0.708 0.187 22 D 0.125 0.017 0.040 0.003 0.592 0.223 23 S 0.267 0.005 0.011 0.002 0.329 0.387 24 L 0.660 0.015 0.006 0.001 0.144 0.173 25 G 0.897 0.006 0.002 0.001 0.039 0.056 26 I 0.962 0.001 0.001 0.001 0.009 0.027 27 S 0.971 0.001 0.001 0.001 0.006 0.020 28 I 0.948 0.007 0.001 0.001 0.011 0.033 29 A 0.793 0.004 0.003 0.003 0.060 0.137 30 G 0.478 0.016 0.004 0.003 0.187 0.312 31 G 0.241 0.028 0.005 0.003 0.456 0.268 32 V 0.235 0.046 0.010 0.006 0.450 0.254 33 G 0.119 0.031 0.019 0.008 0.553 0.270 34 S 0.065 0.034 0.043 0.010 0.685 0.162 35 P 0.035 0.016 0.054 0.020 0.602 0.272 36 L 0.026 0.017 0.087 0.026 0.657 0.187 37 G 0.048 0.018 0.041 0.014 0.539 0.340 38 D 0.121 0.040 0.026 0.006 0.375 0.433 39 V 0.293 0.025 0.011 0.003 0.284 0.384 40 P 0.520 0.008 0.005 0.001 0.144 0.322 41 I 0.900 0.004 0.001 0.001 0.025 0.069 42 F 0.979 0.001 0.001 0.001 0.005 0.014 43 I 0.983 0.002 0.001 0.001 0.004 0.011 44 A 0.964 0.001 0.001 0.001 0.009 0.025 45 M 0.916 0.002 0.001 0.001 0.021 0.059 46 M 0.738 0.028 0.001 0.002 0.063 0.169 47 H 0.279 0.037 0.003 0.005 0.582 0.094 48 P 0.043 0.007 0.007 0.010 0.857 0.076 49 T 0.012 0.004 0.004 0.011 0.827 0.142 50 G 0.066 0.059 0.008 0.051 0.743 0.074 51 V 0.050 0.030 0.021 0.358 0.292 0.248 52 A 0.045 0.023 0.106 0.473 0.226 0.127 53 A 0.023 0.003 0.328 0.396 0.217 0.032 54 Q 0.012 0.002 0.319 0.425 0.207 0.035 55 T 0.011 0.007 0.114 0.325 0.396 0.146 56 Q 0.011 0.006 0.025 0.028 0.431 0.499 57 K 0.061 0.014 0.018 0.014 0.390 0.503 58 L 0.210 0.159 0.017 0.010 0.325 0.280 59 R 0.086 0.021 0.013 0.012 0.780 0.088 60 V 0.086 0.007 0.044 0.015 0.787 0.062 61 G 0.139 0.003 0.018 0.005 0.774 0.060 62 D 0.554 0.006 0.012 0.004 0.381 0.043 63 R 0.920 0.007 0.001 0.002 0.027 0.043 64 I 0.976 0.004 0.001 0.001 0.008 0.010 65 V 0.985 0.001 0.001 0.001 0.006 0.007 66 T 0.983 0.001 0.001 0.001 0.009 0.006 67 I 0.944 0.003 0.001 0.001 0.033 0.018 68 C 0.330 0.002 0.009 0.008 0.556 0.095 69 G 0.065 0.004 0.035 0.020 0.770 0.106 70 T 0.268 0.076 0.021 0.020 0.468 0.147 71 S 0.242 0.059 0.020 0.034 0.373 0.273 72 T 0.164 0.044 0.062 0.028 0.575 0.128 73 E 0.122 0.008 0.066 0.019 0.714 0.071 74 G 0.056 0.002 0.064 0.019 0.761 0.097 75 M 0.145 0.053 0.012 0.021 0.555 0.214 76 T 0.044 0.037 0.003 0.024 0.108 0.784 77 H 0.003 0.001 0.012 0.946 0.018 0.020 78 T 0.001 0.001 0.004 0.983 0.008 0.003 79 Q 0.001 0.001 0.004 0.993 0.003 0.001 80 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 81 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 82 N 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.001 83 L 0.001 0.001 0.003 0.992 0.003 0.002 84 L 0.001 0.001 0.005 0.985 0.006 0.003 85 K 0.001 0.001 0.012 0.969 0.011 0.007 86 N 0.005 0.002 0.019 0.695 0.140 0.138 87 A 0.015 0.007 0.034 0.198 0.442 0.304 88 S 0.017 0.008 0.013 0.020 0.588 0.353 89 G 0.022 0.010 0.022 0.009 0.639 0.299 90 S 0.159 0.007 0.008 0.002 0.345 0.479 91 I 0.754 0.007 0.002 0.001 0.065 0.171 92 E 0.952 0.003 0.001 0.001 0.007 0.037 93 M 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 94 Q 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 95 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 96 V 0.944 0.001 0.001 0.001 0.010 0.044 97 A 0.742 0.009 0.001 0.001 0.040 0.208 98 G 0.203 0.008 0.002 0.001 0.160 0.627 99 G 0.043 0.008 0.005 0.002 0.215 0.726 100 D 0.044 0.011 0.009 0.005 0.200 0.731 101 V 0.076 0.036 0.024 0.011 0.251 0.601 102 S 0.096 0.019 0.026 0.019 0.227 0.613 103 E 0.104 0.033 0.077 0.035 0.318 0.432 104 T 0.060 0.011 0.054 0.048 0.314 0.513 105 S 0.032 0.014 0.025 0.036 0.241 0.653 106 V 0.009 0.014 0.015 0.043 0.176 0.743