# TARGET T0364 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0364.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 151 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.029 0.008 0.007 0.005 0.170 0.781 2 P 0.068 0.027 0.010 0.004 0.216 0.676 3 A 0.143 0.026 0.012 0.003 0.268 0.548 4 L 0.230 0.007 0.013 0.003 0.253 0.494 5 I 0.521 0.014 0.007 0.002 0.149 0.308 6 T 0.757 0.019 0.002 0.001 0.066 0.155 7 Y 0.810 0.007 0.002 0.001 0.049 0.131 8 R 0.836 0.004 0.001 0.001 0.039 0.119 9 T 0.853 0.004 0.001 0.001 0.029 0.112 10 T 0.777 0.016 0.001 0.002 0.034 0.168 11 V 0.479 0.056 0.001 0.003 0.057 0.405 12 Q 0.122 0.009 0.003 0.006 0.103 0.757 13 E 0.036 0.006 0.296 0.270 0.222 0.170 14 D 0.026 0.003 0.461 0.260 0.201 0.049 15 W 0.035 0.007 0.521 0.219 0.186 0.032 16 V 0.103 0.043 0.178 0.321 0.242 0.114 17 D 0.063 0.053 0.065 0.268 0.457 0.094 18 Y 0.026 0.005 0.043 0.245 0.625 0.055 19 N 0.010 0.002 0.022 0.081 0.823 0.061 20 G 0.012 0.011 0.038 0.084 0.777 0.077 21 H 0.076 0.027 0.046 0.130 0.544 0.177 22 L 0.142 0.056 0.066 0.169 0.403 0.163 23 R 0.119 0.017 0.059 0.181 0.358 0.266 24 D 0.057 0.008 0.061 0.371 0.293 0.209 25 A 0.032 0.007 0.037 0.651 0.142 0.132 26 F 0.036 0.012 0.027 0.783 0.061 0.080 27 Y 0.014 0.002 0.011 0.947 0.014 0.013 28 L 0.005 0.001 0.004 0.981 0.005 0.004 29 L 0.005 0.001 0.004 0.981 0.006 0.004 30 I 0.003 0.001 0.003 0.983 0.006 0.006 31 F 0.001 0.001 0.003 0.986 0.004 0.006 32 S 0.001 0.001 0.003 0.986 0.004 0.007 33 Y 0.001 0.001 0.004 0.986 0.005 0.005 34 A 0.001 0.001 0.003 0.981 0.005 0.010 35 T 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 36 D 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 37 A 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 38 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.004 0.001 39 M 0.001 0.001 0.002 0.989 0.008 0.001 40 D 0.001 0.001 0.010 0.976 0.011 0.003 41 R 0.001 0.001 0.014 0.958 0.017 0.011 42 I 0.001 0.001 0.010 0.843 0.034 0.111 43 G 0.001 0.001 0.001 0.006 0.044 0.947 44 L 0.005 0.006 0.001 0.003 0.047 0.940 45 D 0.008 0.003 0.001 0.007 0.065 0.917 46 A 0.001 0.001 0.071 0.836 0.065 0.026 47 D 0.002 0.001 0.049 0.902 0.040 0.005 48 S 0.001 0.001 0.049 0.927 0.022 0.001 49 R 0.002 0.001 0.016 0.966 0.012 0.004 50 G 0.001 0.001 0.016 0.967 0.012 0.003 51 Q 0.001 0.001 0.016 0.955 0.022 0.006 52 S 0.001 0.001 0.010 0.870 0.052 0.067 53 G 0.001 0.001 0.001 0.036 0.100 0.861 54 N 0.014 0.003 0.001 0.015 0.120 0.847 55 S 0.101 0.012 0.002 0.018 0.094 0.773 56 L 0.469 0.010 0.004 0.257 0.053 0.207 57 F 0.520 0.003 0.007 0.370 0.032 0.068 58 T 0.474 0.007 0.010 0.418 0.031 0.061 59 L 0.299 0.002 0.019 0.614 0.031 0.034 60 E 0.177 0.002 0.026 0.710 0.050 0.034 61 A 0.092 0.003 0.025 0.823 0.034 0.022 62 H 0.108 0.003 0.024 0.800 0.037 0.027 63 I 0.288 0.008 0.034 0.582 0.050 0.037 64 N 0.343 0.006 0.040 0.437 0.091 0.083 65 Y 0.345 0.003 0.039 0.401 0.101 0.111 66 L 0.483 0.012 0.027 0.198 0.117 0.164 67 H 0.562 0.013 0.022 0.117 0.118 0.168 68 E 0.532 0.012 0.031 0.075 0.140 0.210 69 V 0.403 0.042 0.015 0.047 0.151 0.342 70 K 0.146 0.022 0.012 0.027 0.736 0.056 71 L 0.032 0.005 0.014 0.019 0.885 0.045 72 G 0.023 0.001 0.003 0.002 0.920 0.053 73 T 0.409 0.028 0.001 0.001 0.488 0.072 74 E 0.844 0.009 0.001 0.001 0.022 0.125 75 V 0.973 0.003 0.001 0.001 0.004 0.020 76 W 0.987 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 77 V 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 78 Q 0.992 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 79 T 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 80 Q 0.988 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 81 I 0.976 0.001 0.001 0.001 0.009 0.012 82 L 0.965 0.002 0.002 0.001 0.017 0.013 83 G 0.884 0.005 0.004 0.002 0.081 0.025 84 F 0.516 0.005 0.013 0.008 0.394 0.064 85 D 0.139 0.006 0.018 0.018 0.762 0.057 86 R 0.149 0.003 0.046 0.033 0.711 0.057 87 K 0.633 0.009 0.012 0.024 0.229 0.092 88 R 0.935 0.006 0.002 0.004 0.023 0.030 89 L 0.975 0.001 0.001 0.002 0.004 0.018 90 H 0.991 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 91 V 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 92 Y 0.988 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 93 H 0.981 0.001 0.001 0.002 0.006 0.010 94 S 0.972 0.001 0.003 0.002 0.011 0.011 95 L 0.967 0.002 0.003 0.002 0.013 0.013 96 H 0.942 0.006 0.004 0.002 0.023 0.023 97 R 0.863 0.034 0.002 0.002 0.058 0.041 98 A 0.173 0.012 0.011 0.013 0.763 0.028 99 G 0.013 0.001 0.015 0.032 0.929 0.010 100 F 0.014 0.002 0.012 0.019 0.947 0.007 101 D 0.057 0.005 0.007 0.020 0.869 0.042 102 E 0.675 0.018 0.002 0.009 0.114 0.182 103 V 0.920 0.016 0.001 0.003 0.019 0.041 104 L 0.963 0.004 0.001 0.002 0.009 0.022 105 A 0.971 0.003 0.001 0.002 0.010 0.013 106 A 0.966 0.002 0.003 0.003 0.013 0.013 107 S 0.945 0.001 0.006 0.005 0.024 0.020 108 E 0.957 0.001 0.004 0.004 0.019 0.015 109 Q 0.967 0.001 0.003 0.003 0.015 0.011 110 M 0.972 0.001 0.001 0.003 0.012 0.012 111 L 0.983 0.001 0.001 0.002 0.005 0.008 112 L 0.981 0.001 0.001 0.001 0.006 0.011 113 H 0.976 0.001 0.001 0.001 0.008 0.013 114 V 0.955 0.008 0.001 0.001 0.012 0.024 115 D 0.721 0.025 0.002 0.004 0.171 0.078 116 L 0.034 0.002 0.143 0.026 0.764 0.031 117 A 0.015 0.001 0.169 0.023 0.759 0.032 118 G 0.043 0.006 0.137 0.027 0.741 0.046 119 P 0.130 0.021 0.009 0.012 0.333 0.496 120 Q 0.342 0.058 0.005 0.005 0.136 0.454 121 S 0.434 0.029 0.008 0.008 0.111 0.409 122 A 0.316 0.022 0.006 0.012 0.113 0.531 123 P 0.075 0.018 0.003 0.012 0.076 0.816 124 F 0.025 0.005 0.001 0.011 0.052 0.906 125 G 0.008 0.002 0.002 0.039 0.057 0.893 126 H 0.001 0.001 0.011 0.804 0.045 0.139 127 T 0.001 0.001 0.022 0.895 0.053 0.029 128 T 0.001 0.001 0.021 0.907 0.057 0.013 129 V 0.001 0.001 0.014 0.935 0.036 0.013 130 C 0.001 0.001 0.014 0.908 0.050 0.026 131 R 0.001 0.001 0.015 0.918 0.035 0.031 132 L 0.001 0.001 0.010 0.925 0.034 0.030 133 N 0.001 0.001 0.009 0.921 0.037 0.031 134 H 0.001 0.001 0.009 0.894 0.039 0.056 135 L 0.002 0.001 0.009 0.812 0.071 0.105 136 V 0.003 0.002 0.017 0.810 0.098 0.070 137 E 0.003 0.002 0.019 0.677 0.172 0.126 138 Q 0.002 0.001 0.025 0.668 0.155 0.148 139 Q 0.003 0.006 0.082 0.471 0.270 0.169 140 E 0.003 0.002 0.069 0.336 0.367 0.223 141 G 0.005 0.004 0.108 0.282 0.321 0.280 142 A 0.010 0.005 0.024 0.109 0.320 0.532 143 Q 0.013 0.006 0.012 0.054 0.179 0.737 144 A 0.033 0.018 0.010 0.066 0.182 0.691 145 P 0.040 0.010 0.023 0.084 0.211 0.631 146 Q 0.055 0.009 0.084 0.183 0.261 0.409 147 Y 0.056 0.010 0.101 0.169 0.372 0.292 148 M 0.084 0.019 0.087 0.152 0.421 0.238 149 G 0.073 0.010 0.077 0.152 0.403 0.285 150 R 0.116 0.016 0.101 0.152 0.343 0.272 151 T 0.170 0.034 0.105 0.138 0.278 0.275 152 I 0.182 0.007 0.048 0.112 0.235 0.416 153 K 0.173 0.015 0.020 0.042 0.204 0.546 154 L 0.104 0.018 0.005 0.017 0.119 0.737 155 P 0.046 0.011 0.003 0.012 0.079 0.849 156 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.019 0.977