# TARGET T0364 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0364.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 151 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 2 P 0.020 0.024 0.005 0.008 0.010 0.031 0.903 3 A 0.045 0.013 0.009 0.009 0.305 0.044 0.574 4 L 0.197 0.012 0.014 0.010 0.146 0.060 0.562 5 I 0.600 0.019 0.008 0.006 0.052 0.016 0.299 6 T 0.815 0.017 0.004 0.003 0.022 0.006 0.133 7 Y 0.822 0.009 0.003 0.003 0.019 0.004 0.141 8 R 0.853 0.004 0.002 0.002 0.030 0.004 0.106 9 T 0.845 0.007 0.001 0.001 0.017 0.003 0.125 10 T 0.876 0.007 0.001 0.001 0.015 0.003 0.097 11 V 0.732 0.049 0.001 0.001 0.028 0.003 0.187 12 Q 0.226 0.020 0.001 0.001 0.062 0.004 0.688 13 E 0.019 0.002 0.190 0.216 0.244 0.218 0.110 14 D 0.010 0.003 0.220 0.288 0.158 0.275 0.047 15 W 0.028 0.008 0.347 0.266 0.078 0.152 0.120 16 V 0.067 0.037 0.104 0.368 0.113 0.076 0.236 17 D 0.059 0.024 0.052 0.342 0.074 0.160 0.290 18 Y 0.019 0.005 0.053 0.346 0.071 0.442 0.063 19 N 0.010 0.002 0.022 0.310 0.079 0.536 0.041 20 G 0.058 0.011 0.023 0.263 0.164 0.291 0.190 21 H 0.146 0.025 0.016 0.227 0.132 0.102 0.352 22 L 0.172 0.027 0.024 0.446 0.072 0.079 0.180 23 R 0.069 0.005 0.019 0.638 0.059 0.066 0.145 24 D 0.013 0.001 0.012 0.917 0.016 0.023 0.018 25 A 0.008 0.001 0.007 0.958 0.005 0.011 0.010 26 F 0.007 0.001 0.007 0.958 0.005 0.016 0.006 27 Y 0.007 0.001 0.005 0.971 0.003 0.010 0.004 28 L 0.005 0.001 0.003 0.977 0.004 0.007 0.004 29 L 0.005 0.001 0.003 0.974 0.005 0.008 0.005 30 I 0.002 0.001 0.003 0.974 0.004 0.011 0.005 31 F 0.001 0.001 0.002 0.983 0.003 0.007 0.004 32 S 0.001 0.001 0.002 0.983 0.003 0.009 0.003 33 Y 0.001 0.001 0.001 0.977 0.003 0.015 0.003 34 A 0.001 0.001 0.001 0.979 0.003 0.010 0.005 35 T 0.001 0.001 0.001 0.983 0.003 0.008 0.004 36 D 0.001 0.001 0.001 0.983 0.002 0.010 0.003 37 A 0.001 0.001 0.001 0.978 0.003 0.014 0.004 38 L 0.001 0.001 0.001 0.979 0.004 0.010 0.005 39 M 0.001 0.001 0.003 0.976 0.005 0.010 0.006 40 D 0.001 0.001 0.010 0.961 0.003 0.022 0.002 41 R 0.001 0.001 0.020 0.863 0.007 0.104 0.004 42 I 0.001 0.001 0.015 0.402 0.029 0.538 0.014 43 G 0.003 0.006 0.009 0.035 0.075 0.735 0.139 44 L 0.011 0.028 0.002 0.006 0.254 0.020 0.678 45 D 0.013 0.016 0.001 0.009 0.074 0.006 0.879 46 A 0.001 0.001 0.057 0.896 0.015 0.021 0.011 47 D 0.001 0.001 0.037 0.938 0.006 0.013 0.004 48 S 0.001 0.001 0.024 0.960 0.004 0.006 0.005 49 R 0.002 0.001 0.008 0.975 0.003 0.007 0.005 50 G 0.003 0.001 0.009 0.936 0.004 0.040 0.007 51 Q 0.004 0.001 0.019 0.773 0.010 0.182 0.011 52 S 0.001 0.001 0.010 0.279 0.038 0.656 0.015 53 G 0.002 0.001 0.006 0.044 0.075 0.802 0.070 54 N 0.033 0.009 0.005 0.039 0.141 0.033 0.739 55 S 0.203 0.015 0.010 0.088 0.115 0.030 0.540 56 L 0.475 0.009 0.016 0.200 0.061 0.022 0.216 57 F 0.580 0.009 0.017 0.255 0.025 0.010 0.104 58 T 0.658 0.005 0.013 0.235 0.015 0.007 0.066 59 L 0.618 0.003 0.019 0.286 0.012 0.013 0.047 60 E 0.508 0.005 0.017 0.390 0.014 0.013 0.053 61 A 0.423 0.005 0.024 0.459 0.019 0.023 0.046 62 H 0.481 0.006 0.021 0.390 0.021 0.039 0.042 63 I 0.381 0.012 0.030 0.450 0.025 0.035 0.068 64 N 0.340 0.006 0.044 0.456 0.040 0.055 0.058 65 Y 0.260 0.008 0.088 0.418 0.035 0.120 0.072 66 L 0.303 0.018 0.166 0.235 0.046 0.109 0.122 67 H 0.296 0.005 0.136 0.163 0.113 0.142 0.145 68 E 0.338 0.009 0.102 0.099 0.121 0.151 0.179 69 V 0.203 0.019 0.026 0.045 0.129 0.048 0.530 70 K 0.122 0.026 0.031 0.012 0.081 0.067 0.662 71 L 0.016 0.004 0.039 0.007 0.130 0.745 0.059 72 G 0.011 0.002 0.031 0.001 0.162 0.746 0.046 73 T 0.097 0.011 0.009 0.001 0.274 0.028 0.581 74 E 0.543 0.011 0.001 0.001 0.058 0.018 0.369 75 V 0.897 0.005 0.001 0.001 0.012 0.001 0.084 76 W 0.982 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.014 77 V 0.984 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 78 Q 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 79 T 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 80 Q 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 81 I 0.976 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.020 82 L 0.922 0.005 0.001 0.001 0.012 0.003 0.056 83 G 0.787 0.005 0.003 0.001 0.024 0.020 0.160 84 F 0.215 0.003 0.018 0.002 0.141 0.565 0.057 85 D 0.045 0.002 0.012 0.001 0.125 0.791 0.025 86 R 0.175 0.002 0.018 0.001 0.338 0.334 0.132 87 K 0.700 0.007 0.002 0.001 0.076 0.017 0.197 88 R 0.946 0.007 0.001 0.001 0.005 0.001 0.041 89 L 0.968 0.002 0.001 0.001 0.003 0.001 0.026 90 H 0.972 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.021 91 V 0.968 0.001 0.002 0.001 0.005 0.001 0.023 92 Y 0.978 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.015 93 H 0.984 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.013 94 S 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 95 L 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 96 H 0.971 0.003 0.001 0.001 0.004 0.001 0.021 97 R 0.849 0.009 0.001 0.001 0.008 0.003 0.129 98 A 0.198 0.004 0.017 0.004 0.094 0.546 0.137 99 G 0.023 0.001 0.017 0.003 0.145 0.772 0.039 100 F 0.016 0.001 0.011 0.006 0.295 0.629 0.042 101 D 0.112 0.003 0.006 0.015 0.261 0.361 0.243 102 E 0.689 0.031 0.001 0.013 0.024 0.007 0.236 103 V 0.878 0.029 0.001 0.017 0.006 0.002 0.066 104 L 0.863 0.004 0.005 0.049 0.012 0.005 0.062 105 A 0.797 0.003 0.009 0.110 0.015 0.010 0.056 106 A 0.857 0.002 0.005 0.070 0.014 0.009 0.043 107 S 0.917 0.002 0.003 0.035 0.011 0.005 0.026 108 E 0.937 0.002 0.003 0.021 0.008 0.003 0.026 109 Q 0.935 0.001 0.003 0.017 0.015 0.003 0.026 110 M 0.943 0.001 0.003 0.018 0.015 0.004 0.016 111 L 0.938 0.003 0.003 0.027 0.005 0.005 0.019 112 L 0.918 0.002 0.003 0.039 0.006 0.009 0.024 113 H 0.843 0.003 0.003 0.052 0.021 0.013 0.065 114 V 0.611 0.013 0.004 0.056 0.058 0.020 0.237 115 D 0.212 0.011 0.006 0.022 0.049 0.035 0.666 116 L 0.012 0.002 0.043 0.029 0.042 0.842 0.030 117 A 0.006 0.002 0.051 0.017 0.089 0.816 0.020 118 G 0.040 0.008 0.042 0.026 0.467 0.213 0.205 119 P 0.065 0.014 0.011 0.009 0.226 0.150 0.525 120 Q 0.251 0.061 0.015 0.014 0.178 0.046 0.435 121 S 0.242 0.051 0.019 0.011 0.125 0.038 0.512 122 A 0.157 0.013 0.029 0.019 0.187 0.061 0.533 123 P 0.078 0.037 0.028 0.015 0.112 0.074 0.656 124 F 0.010 0.012 0.003 0.010 0.075 0.007 0.883 125 G 0.006 0.003 0.002 0.040 0.025 0.006 0.919 126 H 0.001 0.001 0.030 0.916 0.012 0.028 0.014 127 T 0.001 0.001 0.029 0.934 0.008 0.020 0.007 128 T 0.001 0.001 0.013 0.973 0.003 0.007 0.003 129 V 0.001 0.001 0.003 0.986 0.002 0.006 0.002 130 C 0.001 0.001 0.003 0.966 0.003 0.024 0.003 131 R 0.001 0.001 0.004 0.955 0.003 0.033 0.004 132 L 0.001 0.001 0.004 0.955 0.007 0.025 0.007 133 N 0.001 0.001 0.010 0.912 0.009 0.059 0.009 134 H 0.001 0.001 0.017 0.842 0.013 0.106 0.022 135 L 0.001 0.004 0.030 0.816 0.032 0.061 0.057 136 V 0.002 0.002 0.053 0.791 0.036 0.073 0.043 137 E 0.001 0.001 0.076 0.713 0.033 0.125 0.052 138 Q 0.001 0.002 0.092 0.600 0.049 0.173 0.084 139 Q 0.002 0.004 0.159 0.345 0.062 0.314 0.114 140 E 0.003 0.004 0.176 0.245 0.054 0.446 0.073 141 G 0.004 0.010 0.177 0.199 0.110 0.371 0.129 142 A 0.007 0.009 0.029 0.057 0.365 0.115 0.418 143 Q 0.011 0.019 0.010 0.017 0.230 0.105 0.607 144 A 0.021 0.071 0.008 0.027 0.206 0.027 0.641 145 P 0.016 0.012 0.022 0.023 0.056 0.030 0.840 146 Q 0.019 0.009 0.169 0.069 0.154 0.332 0.248 147 Y 0.037 0.025 0.216 0.085 0.141 0.287 0.209 148 M 0.068 0.025 0.157 0.084 0.126 0.212 0.328 149 G 0.133 0.017 0.085 0.058 0.185 0.226 0.296 150 R 0.237 0.016 0.075 0.039 0.180 0.082 0.371 151 T 0.427 0.044 0.046 0.053 0.074 0.075 0.282 152 I 0.490 0.032 0.026 0.054 0.066 0.121 0.211 153 K 0.333 0.010 0.010 0.025 0.150 0.110 0.362 154 L 0.225 0.032 0.003 0.012 0.214 0.023 0.492 155 P 0.089 0.024 0.001 0.004 0.005 0.013 0.864 156 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999