# TARGET T0362 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0362.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 212 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.022 0.029 0.003 0.018 0.195 0.733 2 N 0.029 0.059 0.010 0.025 0.586 0.291 3 P 0.027 0.030 0.025 0.018 0.712 0.187 4 E 0.014 0.006 0.024 0.008 0.811 0.137 5 N 0.068 0.029 0.022 0.003 0.695 0.183 6 W 0.197 0.022 0.017 0.003 0.323 0.437 7 L 0.419 0.027 0.012 0.003 0.208 0.332 8 L 0.712 0.017 0.005 0.002 0.101 0.163 9 L 0.776 0.012 0.003 0.002 0.059 0.149 10 R 0.822 0.003 0.003 0.002 0.046 0.124 11 R 0.898 0.002 0.001 0.002 0.025 0.073 12 V 0.952 0.004 0.001 0.001 0.011 0.032 13 V 0.903 0.012 0.001 0.001 0.017 0.067 14 R 0.816 0.009 0.002 0.002 0.039 0.132 15 F 0.432 0.023 0.087 0.011 0.200 0.248 16 G 0.133 0.016 0.163 0.018 0.474 0.197 17 D 0.077 0.028 0.137 0.021 0.445 0.292 18 T 0.060 0.071 0.032 0.034 0.350 0.454 19 D 0.023 0.041 0.008 0.027 0.488 0.413 20 A 0.009 0.006 0.052 0.458 0.404 0.071 21 A 0.009 0.002 0.063 0.462 0.442 0.022 22 G 0.021 0.008 0.053 0.657 0.246 0.015 23 V 0.066 0.006 0.029 0.762 0.111 0.026 24 M 0.069 0.018 0.033 0.719 0.128 0.032 25 H 0.050 0.014 0.015 0.783 0.091 0.048 26 F 0.009 0.002 0.014 0.776 0.096 0.103 27 H 0.001 0.001 0.013 0.937 0.025 0.023 28 Q 0.001 0.001 0.012 0.962 0.014 0.010 29 L 0.001 0.001 0.004 0.991 0.003 0.001 30 F 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 31 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 32 W 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 33 C 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.002 34 H 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.003 35 E 0.001 0.001 0.002 0.989 0.004 0.004 36 S 0.001 0.001 0.003 0.982 0.005 0.009 37 W 0.001 0.001 0.001 0.993 0.003 0.003 38 E 0.001 0.001 0.001 0.990 0.006 0.002 39 E 0.001 0.001 0.001 0.983 0.011 0.005 40 S 0.001 0.001 0.002 0.980 0.014 0.003 41 L 0.001 0.001 0.006 0.964 0.025 0.004 42 E 0.001 0.001 0.015 0.956 0.022 0.006 43 S 0.001 0.001 0.016 0.945 0.023 0.016 44 Y 0.001 0.001 0.007 0.876 0.025 0.090 45 G 0.001 0.001 0.001 0.023 0.048 0.925 46 L 0.005 0.005 0.002 0.023 0.085 0.881 47 N 0.021 0.006 0.007 0.043 0.137 0.785 48 P 0.025 0.008 0.284 0.442 0.149 0.092 49 A 0.030 0.003 0.452 0.372 0.104 0.039 50 D 0.024 0.003 0.432 0.422 0.092 0.027 51 I 0.022 0.011 0.146 0.646 0.092 0.084 52 F 0.017 0.015 0.049 0.358 0.341 0.219 53 P 0.007 0.003 0.056 0.221 0.488 0.225 54 G 0.006 0.002 0.051 0.131 0.604 0.206 55 S 0.011 0.016 0.080 0.161 0.594 0.139 56 R 0.020 0.015 0.104 0.214 0.475 0.173 57 K 0.031 0.010 0.108 0.208 0.441 0.202 58 S 0.060 0.022 0.103 0.195 0.396 0.224 59 E 0.066 0.036 0.093 0.248 0.297 0.259 60 V 0.061 0.013 0.070 0.161 0.329 0.365 61 T 0.051 0.009 0.120 0.178 0.407 0.236 62 P 0.068 0.012 0.069 0.114 0.422 0.315 63 E 0.139 0.007 0.030 0.032 0.360 0.432 64 V 0.428 0.019 0.008 0.017 0.185 0.343 65 A 0.573 0.023 0.003 0.007 0.080 0.314 66 L 0.712 0.006 0.001 0.006 0.042 0.233 67 P 0.822 0.003 0.002 0.007 0.027 0.139 68 I 0.926 0.005 0.002 0.004 0.014 0.049 69 I 0.959 0.002 0.002 0.004 0.010 0.023 70 H 0.955 0.001 0.002 0.004 0.011 0.026 71 C 0.938 0.003 0.002 0.007 0.015 0.035 72 Q 0.932 0.004 0.003 0.008 0.020 0.032 73 A 0.928 0.003 0.005 0.005 0.027 0.031 74 D 0.871 0.006 0.007 0.006 0.057 0.053 75 F 0.807 0.006 0.013 0.009 0.084 0.080 76 R 0.652 0.020 0.013 0.014 0.141 0.159 77 R 0.609 0.010 0.020 0.012 0.167 0.182 78 P 0.594 0.013 0.035 0.009 0.170 0.179 79 I 0.515 0.033 0.022 0.009 0.179 0.242 80 H 0.352 0.022 0.016 0.006 0.528 0.076 81 T 0.099 0.012 0.031 0.007 0.786 0.065 82 G 0.046 0.001 0.012 0.001 0.877 0.062 83 D 0.359 0.008 0.009 0.002 0.550 0.073 84 A 0.912 0.009 0.001 0.001 0.024 0.054 85 L 0.980 0.003 0.001 0.001 0.003 0.014 86 A 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 87 M 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 88 E 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 89 L 0.986 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 90 R 0.977 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 91 P 0.914 0.003 0.004 0.001 0.025 0.053 92 E 0.907 0.002 0.009 0.001 0.044 0.038 93 R 0.814 0.006 0.015 0.002 0.104 0.059 94 L 0.567 0.016 0.011 0.004 0.226 0.176 95 N 0.218 0.014 0.009 0.005 0.527 0.226 96 P 0.156 0.003 0.028 0.007 0.580 0.226 97 N 0.509 0.012 0.009 0.004 0.283 0.184 98 S 0.867 0.008 0.002 0.001 0.051 0.072 99 F 0.951 0.001 0.001 0.001 0.005 0.043 100 Q 0.983 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 101 V 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 102 H 0.989 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 103 F 0.986 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 104 E 0.987 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 105 F 0.981 0.001 0.001 0.001 0.008 0.009 106 R 0.974 0.001 0.001 0.001 0.013 0.010 107 C 0.875 0.007 0.001 0.001 0.097 0.019 108 E 0.180 0.001 0.009 0.003 0.772 0.035 109 E 0.092 0.002 0.018 0.004 0.846 0.038 110 Q 0.747 0.008 0.004 0.002 0.208 0.031 111 I 0.927 0.002 0.001 0.001 0.026 0.044 112 A 0.980 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 113 A 0.989 0.002 0.001 0.001 0.003 0.006 114 H 0.984 0.001 0.001 0.001 0.005 0.010 115 A 0.971 0.001 0.001 0.001 0.007 0.021 116 L 0.985 0.001 0.001 0.001 0.005 0.009 117 I 0.988 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 118 R 0.987 0.001 0.001 0.001 0.004 0.009 119 H 0.989 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 120 L 0.978 0.001 0.001 0.001 0.006 0.014 121 A 0.965 0.001 0.001 0.001 0.011 0.021 122 I 0.916 0.012 0.001 0.001 0.021 0.051 123 N 0.541 0.051 0.003 0.002 0.272 0.130 124 A 0.015 0.001 0.139 0.017 0.806 0.022 125 Q 0.005 0.001 0.171 0.023 0.779 0.022 126 T 0.023 0.007 0.159 0.036 0.745 0.029 127 R 0.084 0.024 0.013 0.019 0.450 0.410 128 H 0.310 0.054 0.006 0.007 0.173 0.450 129 R 0.431 0.035 0.014 0.010 0.149 0.361 130 C 0.389 0.039 0.007 0.013 0.106 0.446 131 A 0.152 0.027 0.003 0.015 0.075 0.729 132 L 0.048 0.005 0.001 0.015 0.051 0.879 133 P 0.016 0.003 0.004 0.066 0.080 0.831 134 E 0.004 0.001 0.016 0.630 0.088 0.261 135 G 0.001 0.001 0.024 0.839 0.070 0.064 136 I 0.002 0.002 0.023 0.839 0.088 0.046 137 D 0.001 0.001 0.019 0.890 0.055 0.034 138 R 0.001 0.001 0.024 0.902 0.045 0.028 139 W 0.001 0.001 0.030 0.917 0.035 0.017 140 L 0.001 0.001 0.015 0.910 0.048 0.026 141 E 0.001 0.001 0.014 0.944 0.032 0.009 142 A 0.001 0.001 0.009 0.920 0.049 0.021 143 S 0.001 0.001 0.011 0.826 0.098 0.063 144 G 0.004 0.006 0.017 0.594 0.238 0.140 145 V 0.005 0.007 0.031 0.426 0.370 0.161 146 G 0.004 0.002 0.015 0.104 0.463 0.413 147 K 0.010 0.004 0.014 0.016 0.324 0.631 148 I 0.045 0.023 0.018 0.021 0.266 0.627 149 G 0.076 0.025 0.014 0.022 0.183 0.680 150 S 0.060 0.033 0.009 0.025 0.111 0.762 151 I 0.002 0.002 0.001 0.003 0.015 0.978