# TARGET T0361 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0361.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.8219 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.080 0.126 0.022 0.020 0.035 0.077 0.273 0.366 2 A 0.043 0.199 0.021 0.037 0.049 0.101 0.122 0.427 3 T 0.052 0.180 0.021 0.017 0.039 0.092 0.098 0.501 4 L 0.039 0.162 0.022 0.025 0.020 0.131 0.071 0.530 5 T 0.092 0.600 0.012 0.009 0.013 0.043 0.073 0.158 6 E 0.035 0.778 0.002 0.001 0.002 0.020 0.033 0.128 7 D 0.012 0.819 0.010 0.002 0.003 0.017 0.069 0.067 8 D 0.006 0.936 0.007 0.003 0.003 0.005 0.021 0.020 9 V 0.040 0.895 0.009 0.002 0.003 0.006 0.022 0.023 10 L 0.118 0.569 0.052 0.007 0.006 0.015 0.186 0.046 11 E 0.059 0.586 0.020 0.007 0.006 0.029 0.071 0.222 12 Q 0.073 0.348 0.026 0.005 0.006 0.041 0.113 0.388 13 L 0.132 0.217 0.026 0.008 0.007 0.082 0.151 0.378 14 D 0.160 0.115 0.013 0.005 0.004 0.067 0.235 0.400 15 A 0.057 0.298 0.003 0.001 0.001 0.044 0.054 0.540 16 Q 0.068 0.400 0.010 0.001 0.003 0.075 0.058 0.384 17 D 0.023 0.220 0.016 0.005 0.003 0.084 0.283 0.366 18 N 0.011 0.891 0.003 0.001 0.001 0.011 0.042 0.041 19 L 0.007 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.009 20 F 0.007 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.015 0.012 21 S 0.003 0.180 0.003 0.001 0.001 0.005 0.796 0.012 22 F 0.002 0.827 0.003 0.001 0.001 0.003 0.160 0.004 23 M 0.004 0.965 0.001 0.001 0.001 0.002 0.023 0.005 24 K 0.005 0.761 0.009 0.003 0.003 0.008 0.177 0.035 25 T 0.006 0.915 0.004 0.001 0.002 0.006 0.056 0.012 26 A 0.008 0.966 0.001 0.001 0.001 0.002 0.018 0.006 27 H 0.008 0.938 0.004 0.001 0.001 0.003 0.033 0.013 28 S 0.006 0.875 0.007 0.001 0.001 0.008 0.069 0.034 29 I 0.010 0.912 0.012 0.001 0.001 0.005 0.047 0.014 30 L 0.022 0.924 0.005 0.001 0.001 0.002 0.040 0.007 31 L 0.022 0.829 0.007 0.001 0.001 0.005 0.092 0.044 32 Q 0.009 0.762 0.011 0.001 0.001 0.012 0.114 0.090 33 G 0.037 0.652 0.036 0.001 0.001 0.016 0.216 0.042 34 I 0.119 0.741 0.007 0.001 0.001 0.010 0.079 0.043 35 R 0.215 0.301 0.022 0.001 0.001 0.028 0.111 0.321 36 Q 0.013 0.087 0.064 0.003 0.003 0.098 0.243 0.490 37 F 0.037 0.136 0.138 0.005 0.004 0.131 0.164 0.384 38 L 0.276 0.081 0.076 0.006 0.006 0.125 0.078 0.353 39 P 0.081 0.034 0.039 0.004 0.007 0.115 0.053 0.667 40 S 0.046 0.016 0.127 0.010 0.028 0.104 0.092 0.578 41 L 0.020 0.005 0.184 0.038 0.053 0.155 0.076 0.468 42 F 0.019 0.004 0.192 0.036 0.050 0.125 0.037 0.538 43 V 0.042 0.004 0.068 0.016 0.021 0.132 0.015 0.702 44 D 0.068 0.015 0.030 0.010 0.013 0.151 0.030 0.683 45 N 0.079 0.106 0.008 0.005 0.009 0.089 0.024 0.681 46 D 0.126 0.442 0.011 0.010 0.019 0.061 0.058 0.272 47 E 0.026 0.591 0.015 0.037 0.047 0.035 0.039 0.209 48 E 0.013 0.418 0.031 0.099 0.120 0.047 0.060 0.212 49 I 0.027 0.340 0.036 0.103 0.148 0.058 0.128 0.161 50 V 0.067 0.343 0.025 0.088 0.139 0.027 0.227 0.084 51 E 0.042 0.359 0.016 0.104 0.190 0.027 0.089 0.173 52 Y 0.024 0.249 0.041 0.122 0.216 0.056 0.059 0.232 53 A 0.008 0.260 0.035 0.153 0.238 0.057 0.049 0.199 54 V 0.045 0.320 0.058 0.075 0.075 0.058 0.071 0.299 55 K 0.208 0.457 0.038 0.057 0.030 0.025 0.094 0.091 56 P 0.179 0.230 0.062 0.028 0.034 0.063 0.091 0.312 57 L 0.157 0.026 0.114 0.025 0.033 0.076 0.213 0.355 58 L 0.264 0.012 0.026 0.023 0.023 0.072 0.066 0.513 59 A 0.097 0.003 0.005 0.006 0.007 0.059 0.025 0.798 60 Q 0.006 0.002 0.006 0.006 0.012 0.104 0.008 0.855 61 S 0.019 0.002 0.007 0.006 0.014 0.100 0.014 0.837 62 G 0.055 0.008 0.026 0.031 0.014 0.144 0.041 0.680 63 P 0.162 0.030 0.017 0.010 0.013 0.085 0.041 0.641 64 L 0.335 0.073 0.012 0.005 0.005 0.055 0.091 0.424 65 D 0.055 0.205 0.021 0.011 0.017 0.101 0.096 0.495 66 D 0.010 0.544 0.010 0.003 0.010 0.033 0.047 0.342 67 I 0.002 0.887 0.007 0.010 0.010 0.012 0.029 0.042 68 D 0.001 0.790 0.021 0.011 0.015 0.006 0.141 0.015 69 V 0.001 0.919 0.003 0.006 0.006 0.001 0.060 0.003 70 A 0.002 0.890 0.010 0.003 0.007 0.002 0.083 0.003 71 L 0.002 0.803 0.011 0.014 0.014 0.003 0.147 0.007 72 R 0.005 0.818 0.034 0.015 0.021 0.006 0.085 0.015 73 L 0.034 0.638 0.132 0.022 0.025 0.016 0.099 0.034 74 I 0.064 0.233 0.284 0.052 0.047 0.045 0.162 0.113 75 Y 0.301 0.058 0.120 0.031 0.027 0.072 0.072 0.320 76 A 0.131 0.045 0.032 0.013 0.016 0.124 0.049 0.591 77 L 0.022 0.030 0.020 0.006 0.014 0.116 0.031 0.760 78 G 0.036 0.093 0.036 0.020 0.035 0.173 0.056 0.551 79 K 0.029 0.168 0.036 0.028 0.029 0.130 0.060 0.520 80 M 0.082 0.400 0.048 0.018 0.023 0.059 0.129 0.240 81 D 0.101 0.713 0.011 0.005 0.008 0.018 0.080 0.064 82 K 0.069 0.589 0.019 0.005 0.006 0.037 0.057 0.218 83 W 0.025 0.595 0.053 0.014 0.012 0.036 0.085 0.181 84 L 0.101 0.686 0.014 0.003 0.005 0.028 0.048 0.116 85 Y 0.118 0.191 0.037 0.007 0.006 0.041 0.444 0.156 86 A 0.014 0.434 0.012 0.006 0.006 0.046 0.205 0.276 87 D 0.039 0.834 0.002 0.001 0.001 0.012 0.025 0.087 88 I 0.028 0.479 0.009 0.004 0.003 0.032 0.336 0.109 89 T 0.014 0.365 0.013 0.003 0.004 0.024 0.496 0.082 90 H 0.030 0.866 0.003 0.001 0.001 0.011 0.053 0.036 91 F 0.035 0.860 0.011 0.002 0.002 0.012 0.034 0.043 92 S 0.041 0.697 0.018 0.004 0.006 0.032 0.069 0.133 93 Q 0.016 0.783 0.018 0.002 0.003 0.023 0.043 0.111 94 Y 0.074 0.781 0.027 0.002 0.003 0.017 0.038 0.057 95 W 0.125 0.277 0.090 0.014 0.011 0.048 0.286 0.148 96 H 0.078 0.250 0.050 0.009 0.011 0.066 0.078 0.458 97 Y 0.125 0.088 0.131 0.011 0.016 0.093 0.070 0.465 98 L 0.051 0.021 0.054 0.017 0.015 0.135 0.068 0.639 99 N 0.148 0.019 0.016 0.006 0.011 0.079 0.053 0.667 100 E 0.076 0.010 0.009 0.005 0.007 0.092 0.043 0.757 101 Q 0.061 0.013 0.016 0.013 0.020 0.151 0.050 0.675 102 D 0.027 0.007 0.011 0.011 0.021 0.113 0.034 0.775 103 E 0.037 0.010 0.022 0.026 0.033 0.129 0.029 0.715 104 T 0.111 0.025 0.028 0.028 0.038 0.099 0.049 0.622 105 P 0.037 0.021 0.029 0.031 0.040 0.140 0.035 0.667 106 G 0.025 0.031 0.055 0.030 0.058 0.130 0.048 0.624 107 F 0.075 0.072 0.032 0.032 0.039 0.114 0.067 0.568 108 A 0.091 0.092 0.039 0.025 0.029 0.083 0.301 0.341 109 D 0.070 0.326 0.021 0.023 0.043 0.063 0.185 0.269 110 D 0.049 0.239 0.034 0.023 0.049 0.087 0.064 0.455 111 I 0.019 0.273 0.064 0.096 0.104 0.088 0.049 0.307 112 T 0.037 0.580 0.026 0.017 0.049 0.041 0.064 0.185 113 W 0.090 0.273 0.048 0.027 0.026 0.046 0.326 0.164 114 D 0.021 0.173 0.049 0.033 0.020 0.046 0.534 0.123 115 F 0.075 0.678 0.010 0.003 0.005 0.023 0.064 0.143 116 I 0.155 0.502 0.024 0.006 0.008 0.045 0.064 0.195 117 S 0.030 0.306 0.030 0.014 0.014 0.060 0.171 0.375 118 N 0.044 0.632 0.006 0.001 0.004 0.032 0.074 0.207 119 V 0.050 0.265 0.037 0.008 0.007 0.060 0.427 0.146 120 N 0.034 0.425 0.047 0.016 0.016 0.057 0.234 0.171 121 S 0.062 0.318 0.063 0.005 0.015 0.054 0.181 0.301 122 I 0.120 0.338 0.112 0.021 0.020 0.069 0.117 0.202 123 T 0.096 0.097 0.084 0.017 0.024 0.072 0.228 0.383 124 R 0.041 0.107 0.021 0.007 0.009 0.103 0.071 0.640 125 N 0.086 0.188 0.041 0.008 0.014 0.103 0.098 0.461 126 A 0.072 0.224 0.025 0.013 0.011 0.105 0.056 0.495 127 T 0.053 0.352 0.027 0.006 0.010 0.072 0.047 0.433 128 L 0.056 0.658 0.017 0.005 0.005 0.035 0.036 0.187 129 Y 0.078 0.751 0.014 0.003 0.004 0.019 0.036 0.095 130 D 0.060 0.781 0.012 0.003 0.003 0.016 0.027 0.097 131 A 0.065 0.633 0.032 0.007 0.009 0.029 0.067 0.160 132 L 0.184 0.369 0.047 0.011 0.011 0.048 0.096 0.235 133 K 0.147 0.152 0.040 0.018 0.015 0.063 0.124 0.441 134 A 0.108 0.087 0.013 0.004 0.007 0.072 0.036 0.674 135 M 0.067 0.045 0.016 0.006 0.007 0.102 0.045 0.712 136 K 0.043 0.063 0.006 0.004 0.004 0.082 0.025 0.773 137 F 0.194 0.279 0.005 0.003 0.004 0.047 0.043 0.425 138 A 0.045 0.377 0.011 0.010 0.012 0.077 0.048 0.419 139 D 0.036 0.484 0.016 0.010 0.026 0.053 0.071 0.304 140 F 0.034 0.299 0.026 0.031 0.038 0.065 0.248 0.257 141 A 0.013 0.488 0.040 0.056 0.063 0.058 0.118 0.164 142 V 0.022 0.756 0.014 0.013 0.024 0.026 0.037 0.109 143 W 0.022 0.836 0.015 0.015 0.014 0.014 0.031 0.054 144 S 0.041 0.842 0.004 0.007 0.010 0.009 0.040 0.047 145 E 0.046 0.347 0.013 0.010 0.012 0.025 0.436 0.111 146 A 0.015 0.284 0.021 0.021 0.018 0.050 0.460 0.131 147 R 0.120 0.583 0.008 0.006 0.007 0.029 0.066 0.181 148 F 0.110 0.578 0.003 0.004 0.005 0.026 0.055 0.219 149 S 0.023 0.474 0.008 0.004 0.011 0.045 0.077 0.357 150 G 0.013 0.249 0.015 0.017 0.024 0.066 0.437 0.179 151 M 0.006 0.696 0.014 0.016 0.013 0.028 0.144 0.083 152 V 0.014 0.847 0.009 0.007 0.011 0.012 0.058 0.043 153 K 0.007 0.720 0.019 0.010 0.010 0.010 0.184 0.039 154 T 0.002 0.946 0.004 0.003 0.003 0.003 0.031 0.009 155 A 0.001 0.981 0.004 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 156 L 0.003 0.979 0.002 0.002 0.002 0.001 0.008 0.003 157 T 0.004 0.135 0.003 0.001 0.001 0.003 0.846 0.007 158 L 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.982 0.001 159 A 0.002 0.569 0.004 0.002 0.004 0.006 0.402 0.011 160 V 0.004 0.962 0.002 0.001 0.002 0.003 0.016 0.010 161 T 0.012 0.909 0.008 0.005 0.007 0.007 0.032 0.022 162 T 0.040 0.684 0.029 0.010 0.008 0.027 0.110 0.093 163 T 0.194 0.461 0.028 0.005 0.005 0.043 0.155 0.110 164 L 0.389 0.064 0.050 0.006 0.005 0.052 0.266 0.167 165 K 0.083 0.030 0.016 0.005 0.007 0.088 0.055 0.716 166 E 0.012 0.006 0.016 0.002 0.006 0.060 0.023 0.874 167 L 0.025 0.005 0.025 0.010 0.011 0.150 0.034 0.741 168 T 0.175 0.011 0.015 0.013 0.016 0.123 0.053 0.593 169 P 0.039 0.006 0.007 0.003 0.006 0.082 0.015 0.841