# TARGET T0361 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0361.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.19624 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.100 0.073 0.021 0.024 0.034 0.098 0.207 0.444 2 A 0.057 0.112 0.019 0.028 0.040 0.113 0.103 0.528 3 T 0.056 0.122 0.018 0.013 0.028 0.098 0.085 0.580 4 L 0.045 0.128 0.023 0.022 0.019 0.143 0.051 0.569 5 T 0.116 0.487 0.013 0.009 0.014 0.056 0.069 0.237 6 E 0.038 0.713 0.003 0.002 0.003 0.028 0.040 0.172 7 D 0.014 0.792 0.011 0.003 0.004 0.020 0.075 0.080 8 D 0.006 0.927 0.007 0.004 0.003 0.006 0.022 0.024 9 V 0.037 0.894 0.010 0.002 0.004 0.007 0.022 0.024 10 L 0.115 0.565 0.052 0.009 0.007 0.015 0.194 0.044 11 E 0.060 0.596 0.020 0.008 0.008 0.029 0.073 0.207 12 Q 0.077 0.342 0.026 0.006 0.008 0.042 0.116 0.384 13 L 0.129 0.213 0.024 0.008 0.008 0.083 0.152 0.384 14 D 0.155 0.115 0.013 0.005 0.005 0.068 0.231 0.407 15 A 0.057 0.285 0.004 0.001 0.002 0.046 0.055 0.551 16 Q 0.069 0.390 0.010 0.002 0.003 0.077 0.059 0.389 17 D 0.023 0.213 0.016 0.005 0.003 0.086 0.276 0.377 18 N 0.011 0.887 0.004 0.001 0.001 0.011 0.042 0.043 19 L 0.007 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.009 20 F 0.007 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.015 0.012 21 S 0.003 0.185 0.003 0.001 0.001 0.005 0.790 0.012 22 F 0.002 0.824 0.003 0.001 0.001 0.003 0.163 0.005 23 M 0.004 0.964 0.001 0.001 0.001 0.002 0.024 0.005 24 K 0.006 0.754 0.009 0.003 0.003 0.008 0.183 0.036 25 T 0.006 0.907 0.004 0.001 0.002 0.006 0.060 0.014 26 A 0.009 0.960 0.002 0.001 0.001 0.002 0.020 0.007 27 H 0.010 0.933 0.004 0.001 0.001 0.003 0.033 0.016 28 S 0.007 0.869 0.007 0.001 0.001 0.009 0.065 0.041 29 I 0.011 0.902 0.013 0.001 0.001 0.005 0.050 0.018 30 L 0.024 0.915 0.006 0.001 0.001 0.002 0.045 0.007 31 L 0.024 0.821 0.007 0.001 0.001 0.006 0.094 0.047 32 Q 0.009 0.741 0.011 0.001 0.001 0.013 0.125 0.099 33 G 0.034 0.621 0.033 0.001 0.001 0.017 0.247 0.046 34 I 0.116 0.734 0.007 0.001 0.001 0.011 0.084 0.047 35 R 0.201 0.301 0.020 0.001 0.002 0.030 0.109 0.336 36 Q 0.012 0.088 0.065 0.003 0.004 0.100 0.241 0.486 37 F 0.046 0.123 0.144 0.006 0.006 0.134 0.162 0.380 38 L 0.317 0.049 0.082 0.007 0.006 0.116 0.074 0.349 39 P 0.047 0.025 0.045 0.005 0.009 0.112 0.041 0.717 40 S 0.028 0.013 0.196 0.011 0.043 0.114 0.096 0.499 41 L 0.015 0.003 0.220 0.061 0.067 0.118 0.075 0.440 42 F 0.018 0.002 0.249 0.090 0.081 0.081 0.040 0.438 43 V 0.038 0.002 0.091 0.021 0.028 0.117 0.027 0.675 44 D 0.047 0.005 0.042 0.018 0.024 0.186 0.027 0.650 45 N 0.041 0.012 0.004 0.003 0.004 0.058 0.011 0.867 46 D 0.183 0.304 0.008 0.010 0.014 0.077 0.059 0.345 47 E 0.028 0.446 0.024 0.027 0.056 0.063 0.047 0.309 48 E 0.010 0.288 0.048 0.113 0.168 0.051 0.077 0.245 49 I 0.022 0.249 0.063 0.155 0.170 0.048 0.144 0.151 50 V 0.060 0.280 0.036 0.117 0.150 0.031 0.218 0.108 51 E 0.037 0.271 0.031 0.117 0.231 0.030 0.094 0.190 52 Y 0.022 0.203 0.059 0.131 0.215 0.057 0.068 0.244 53 A 0.007 0.238 0.045 0.148 0.232 0.061 0.049 0.219 54 V 0.042 0.312 0.061 0.088 0.090 0.056 0.072 0.280 55 K 0.200 0.481 0.034 0.058 0.031 0.024 0.091 0.082 56 P 0.173 0.247 0.062 0.030 0.038 0.058 0.092 0.300 57 L 0.133 0.028 0.116 0.030 0.041 0.076 0.226 0.350 58 L 0.268 0.013 0.029 0.026 0.027 0.071 0.071 0.494 59 A 0.109 0.003 0.006 0.007 0.009 0.062 0.029 0.776 60 Q 0.007 0.002 0.006 0.006 0.013 0.101 0.008 0.858 61 S 0.018 0.002 0.007 0.006 0.014 0.096 0.013 0.844 62 G 0.054 0.008 0.025 0.033 0.015 0.143 0.040 0.682 63 P 0.151 0.028 0.018 0.011 0.016 0.089 0.042 0.644 64 L 0.294 0.065 0.014 0.006 0.007 0.059 0.091 0.464 65 D 0.060 0.182 0.024 0.014 0.020 0.102 0.097 0.500 66 D 0.012 0.484 0.012 0.004 0.013 0.037 0.052 0.384 67 I 0.003 0.848 0.010 0.015 0.016 0.017 0.034 0.058 68 D 0.002 0.737 0.030 0.017 0.023 0.008 0.161 0.022 69 V 0.002 0.891 0.005 0.010 0.010 0.002 0.075 0.005 70 A 0.002 0.869 0.014 0.005 0.010 0.002 0.094 0.004 71 L 0.003 0.779 0.014 0.020 0.020 0.003 0.152 0.009 72 R 0.007 0.779 0.044 0.022 0.030 0.008 0.091 0.020 73 L 0.038 0.584 0.154 0.028 0.033 0.019 0.104 0.039 74 I 0.062 0.207 0.296 0.059 0.054 0.046 0.157 0.120 75 Y 0.278 0.055 0.129 0.035 0.032 0.074 0.072 0.324 76 A 0.131 0.045 0.034 0.014 0.019 0.127 0.051 0.579 77 L 0.023 0.031 0.021 0.007 0.016 0.118 0.032 0.751 78 G 0.036 0.092 0.040 0.022 0.038 0.171 0.058 0.543 79 K 0.029 0.161 0.038 0.029 0.031 0.131 0.063 0.519 80 M 0.082 0.380 0.053 0.020 0.025 0.061 0.137 0.242 81 D 0.107 0.693 0.012 0.006 0.009 0.020 0.084 0.069 82 K 0.071 0.570 0.019 0.005 0.006 0.039 0.059 0.230 83 W 0.024 0.588 0.052 0.015 0.013 0.037 0.082 0.188 84 L 0.094 0.691 0.013 0.003 0.005 0.028 0.047 0.117 85 Y 0.110 0.194 0.037 0.007 0.006 0.041 0.452 0.152 86 A 0.014 0.439 0.012 0.006 0.006 0.046 0.218 0.259 87 D 0.038 0.846 0.002 0.001 0.001 0.011 0.025 0.077 88 I 0.028 0.495 0.008 0.004 0.003 0.030 0.329 0.104 89 T 0.014 0.367 0.012 0.003 0.004 0.023 0.498 0.079 90 H 0.030 0.866 0.003 0.001 0.001 0.010 0.053 0.036 91 F 0.037 0.859 0.011 0.002 0.002 0.012 0.034 0.043 92 S 0.041 0.698 0.018 0.004 0.006 0.032 0.066 0.135 93 Q 0.016 0.791 0.017 0.002 0.003 0.022 0.039 0.110 94 Y 0.071 0.790 0.027 0.002 0.003 0.016 0.036 0.054 95 W 0.128 0.281 0.094 0.013 0.010 0.047 0.286 0.142 96 H 0.081 0.255 0.052 0.008 0.010 0.064 0.079 0.451 97 Y 0.132 0.086 0.137 0.010 0.014 0.091 0.069 0.459 98 L 0.053 0.020 0.056 0.016 0.015 0.134 0.068 0.638 99 N 0.142 0.018 0.016 0.006 0.010 0.077 0.048 0.684 100 E 0.076 0.010 0.008 0.005 0.006 0.091 0.042 0.762 101 Q 0.059 0.013 0.016 0.013 0.019 0.150 0.048 0.682 102 D 0.027 0.007 0.011 0.010 0.020 0.112 0.034 0.780 103 E 0.037 0.010 0.022 0.026 0.032 0.128 0.029 0.715 104 T 0.108 0.024 0.028 0.029 0.038 0.096 0.050 0.626 105 P 0.038 0.019 0.030 0.032 0.042 0.139 0.036 0.665 106 G 0.024 0.024 0.064 0.034 0.066 0.130 0.051 0.607 107 F 0.063 0.054 0.038 0.039 0.049 0.115 0.071 0.572 108 A 0.084 0.074 0.051 0.031 0.037 0.095 0.250 0.379 109 D 0.068 0.226 0.032 0.036 0.068 0.076 0.171 0.323 110 D 0.043 0.149 0.048 0.030 0.067 0.093 0.065 0.504 111 I 0.016 0.166 0.097 0.120 0.142 0.095 0.053 0.310 112 T 0.034 0.454 0.049 0.029 0.080 0.051 0.074 0.229 113 W 0.082 0.221 0.070 0.043 0.038 0.051 0.305 0.188 114 D 0.022 0.135 0.076 0.044 0.028 0.054 0.502 0.140 115 F 0.104 0.587 0.016 0.005 0.008 0.031 0.079 0.171 116 I 0.184 0.392 0.034 0.008 0.010 0.055 0.076 0.241 117 S 0.036 0.253 0.031 0.017 0.019 0.069 0.137 0.438 118 N 0.054 0.487 0.010 0.002 0.006 0.047 0.082 0.311 119 V 0.051 0.224 0.043 0.012 0.011 0.076 0.396 0.187 120 N 0.044 0.359 0.057 0.018 0.021 0.066 0.221 0.215 121 S 0.064 0.245 0.063 0.007 0.019 0.060 0.201 0.342 122 I 0.119 0.245 0.128 0.026 0.025 0.079 0.135 0.243 123 T 0.103 0.077 0.071 0.020 0.026 0.081 0.189 0.433 124 R 0.039 0.071 0.022 0.007 0.009 0.105 0.064 0.683 125 N 0.098 0.190 0.028 0.008 0.014 0.094 0.084 0.483 126 A 0.067 0.166 0.022 0.012 0.010 0.108 0.058 0.559 127 T 0.050 0.451 0.023 0.007 0.011 0.061 0.032 0.366 128 L 0.060 0.708 0.013 0.004 0.005 0.028 0.025 0.157 129 Y 0.075 0.710 0.025 0.005 0.005 0.023 0.037 0.120 130 D 0.057 0.762 0.018 0.005 0.005 0.018 0.035 0.100 131 A 0.090 0.563 0.047 0.006 0.008 0.031 0.083 0.173 132 L 0.198 0.396 0.049 0.010 0.010 0.045 0.089 0.205 133 K 0.127 0.157 0.034 0.011 0.010 0.052 0.091 0.517 134 A 0.102 0.117 0.011 0.003 0.005 0.067 0.038 0.657 135 M 0.075 0.066 0.021 0.008 0.008 0.099 0.066 0.658 136 K 0.048 0.080 0.008 0.005 0.006 0.087 0.029 0.738 137 F 0.160 0.247 0.007 0.004 0.005 0.052 0.047 0.477 138 A 0.042 0.314 0.015 0.012 0.013 0.086 0.051 0.467 139 D 0.043 0.457 0.017 0.012 0.029 0.055 0.074 0.313 140 F 0.041 0.257 0.027 0.027 0.033 0.069 0.247 0.298 141 A 0.014 0.472 0.044 0.056 0.062 0.064 0.115 0.172 142 V 0.025 0.719 0.015 0.012 0.025 0.029 0.039 0.136 143 W 0.026 0.810 0.016 0.016 0.015 0.017 0.035 0.066 144 S 0.045 0.815 0.005 0.008 0.011 0.011 0.046 0.058 145 E 0.045 0.317 0.013 0.010 0.012 0.028 0.457 0.119 146 A 0.014 0.282 0.024 0.023 0.019 0.052 0.451 0.137 147 R 0.109 0.593 0.009 0.006 0.007 0.030 0.062 0.183 148 F 0.106 0.600 0.004 0.004 0.006 0.025 0.056 0.200 149 S 0.024 0.492 0.009 0.004 0.011 0.044 0.079 0.337 150 G 0.013 0.242 0.015 0.017 0.024 0.064 0.447 0.177 151 M 0.006 0.675 0.015 0.017 0.014 0.030 0.157 0.087 152 V 0.015 0.838 0.009 0.007 0.012 0.013 0.060 0.046 153 K 0.008 0.713 0.020 0.010 0.011 0.012 0.181 0.044 154 T 0.002 0.942 0.005 0.003 0.003 0.003 0.031 0.010 155 A 0.002 0.976 0.005 0.001 0.002 0.002 0.007 0.006 156 L 0.004 0.973 0.002 0.002 0.002 0.002 0.010 0.004 157 T 0.005 0.145 0.004 0.001 0.001 0.004 0.831 0.009 158 L 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.976 0.001 159 A 0.002 0.577 0.005 0.003 0.006 0.008 0.386 0.014 160 V 0.006 0.949 0.002 0.002 0.003 0.004 0.021 0.013 161 T 0.014 0.888 0.010 0.006 0.009 0.008 0.037 0.027 162 T 0.049 0.628 0.033 0.013 0.011 0.032 0.118 0.116 163 T 0.212 0.368 0.033 0.007 0.007 0.052 0.181 0.140 164 L 0.390 0.049 0.045 0.007 0.007 0.060 0.243 0.199 165 K 0.069 0.021 0.014 0.006 0.008 0.089 0.046 0.747 166 E 0.010 0.005 0.015 0.003 0.007 0.065 0.018 0.878 167 L 0.022 0.004 0.024 0.012 0.014 0.157 0.031 0.738 168 T 0.170 0.011 0.016 0.016 0.018 0.128 0.056 0.585 169 P 0.046 0.007 0.008 0.005 0.008 0.085 0.017 0.824