# TARGET T0361 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0361.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9.29976 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.085 0.064 0.021 0.029 0.044 0.096 0.210 0.449 2 A 0.065 0.110 0.018 0.032 0.040 0.115 0.109 0.511 3 T 0.064 0.131 0.018 0.014 0.030 0.099 0.087 0.555 4 L 0.044 0.120 0.017 0.019 0.017 0.135 0.043 0.604 5 T 0.113 0.497 0.011 0.008 0.012 0.055 0.069 0.236 6 E 0.039 0.735 0.003 0.002 0.003 0.026 0.039 0.153 7 D 0.015 0.802 0.009 0.003 0.004 0.019 0.074 0.075 8 D 0.006 0.929 0.007 0.004 0.003 0.006 0.021 0.024 9 V 0.035 0.896 0.010 0.002 0.004 0.007 0.022 0.024 10 L 0.114 0.567 0.051 0.009 0.007 0.015 0.193 0.044 11 E 0.060 0.594 0.021 0.008 0.008 0.029 0.073 0.207 12 Q 0.077 0.343 0.027 0.006 0.008 0.042 0.116 0.382 13 L 0.128 0.209 0.024 0.008 0.008 0.083 0.151 0.388 14 D 0.155 0.115 0.014 0.005 0.005 0.069 0.231 0.407 15 A 0.056 0.283 0.004 0.001 0.002 0.046 0.055 0.553 16 Q 0.069 0.389 0.010 0.002 0.003 0.078 0.059 0.391 17 D 0.023 0.213 0.016 0.005 0.003 0.086 0.276 0.376 18 N 0.011 0.888 0.004 0.001 0.001 0.011 0.042 0.043 19 L 0.007 0.975 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.009 20 F 0.007 0.960 0.003 0.001 0.001 0.003 0.015 0.012 21 S 0.003 0.185 0.003 0.001 0.001 0.005 0.790 0.012 22 F 0.002 0.824 0.003 0.001 0.001 0.003 0.163 0.004 23 M 0.004 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.023 0.005 24 K 0.005 0.754 0.009 0.003 0.003 0.008 0.183 0.035 25 T 0.006 0.907 0.004 0.001 0.002 0.006 0.060 0.014 26 A 0.009 0.960 0.002 0.001 0.001 0.002 0.020 0.007 27 H 0.010 0.934 0.004 0.001 0.001 0.003 0.033 0.016 28 S 0.007 0.869 0.007 0.001 0.001 0.009 0.066 0.041 29 I 0.011 0.903 0.013 0.001 0.001 0.005 0.050 0.017 30 L 0.024 0.915 0.005 0.001 0.001 0.002 0.045 0.007 31 L 0.024 0.821 0.007 0.001 0.001 0.006 0.095 0.047 32 Q 0.009 0.741 0.011 0.001 0.001 0.013 0.125 0.099 33 G 0.034 0.622 0.033 0.001 0.001 0.017 0.247 0.046 34 I 0.116 0.734 0.007 0.001 0.001 0.011 0.084 0.047 35 R 0.200 0.302 0.020 0.001 0.002 0.030 0.108 0.336 36 Q 0.012 0.088 0.066 0.003 0.003 0.100 0.241 0.486 37 F 0.046 0.123 0.145 0.006 0.006 0.134 0.162 0.378 38 L 0.315 0.049 0.082 0.007 0.006 0.116 0.074 0.350 39 P 0.047 0.025 0.045 0.005 0.009 0.112 0.041 0.717 40 S 0.028 0.013 0.198 0.011 0.044 0.114 0.096 0.497 41 L 0.015 0.003 0.220 0.061 0.068 0.118 0.075 0.439 42 F 0.018 0.002 0.249 0.090 0.082 0.081 0.040 0.437 43 V 0.038 0.002 0.090 0.021 0.028 0.117 0.027 0.676 44 D 0.047 0.005 0.042 0.018 0.025 0.187 0.027 0.650 45 N 0.041 0.012 0.004 0.003 0.004 0.058 0.011 0.867 46 D 0.184 0.304 0.008 0.010 0.014 0.077 0.059 0.344 47 E 0.028 0.447 0.024 0.027 0.056 0.063 0.047 0.309 48 E 0.010 0.288 0.048 0.113 0.168 0.051 0.077 0.245 49 I 0.021 0.249 0.063 0.155 0.170 0.048 0.144 0.151 50 V 0.060 0.280 0.037 0.117 0.149 0.031 0.218 0.108 51 E 0.037 0.272 0.031 0.117 0.231 0.029 0.094 0.189 52 Y 0.022 0.204 0.059 0.131 0.214 0.057 0.068 0.244 53 A 0.007 0.239 0.045 0.147 0.232 0.061 0.049 0.219 54 V 0.042 0.312 0.061 0.088 0.089 0.056 0.072 0.280 55 K 0.200 0.481 0.033 0.058 0.031 0.023 0.091 0.082 56 P 0.173 0.247 0.062 0.030 0.038 0.058 0.093 0.300 57 L 0.133 0.028 0.116 0.030 0.041 0.076 0.225 0.351 58 L 0.268 0.013 0.029 0.026 0.027 0.071 0.072 0.493 59 A 0.109 0.003 0.006 0.007 0.009 0.062 0.029 0.776 60 Q 0.007 0.002 0.006 0.006 0.013 0.101 0.008 0.857 61 S 0.018 0.002 0.007 0.006 0.014 0.096 0.013 0.844 62 G 0.054 0.008 0.025 0.033 0.015 0.143 0.040 0.682 63 P 0.151 0.028 0.018 0.011 0.016 0.089 0.042 0.644 64 L 0.296 0.065 0.014 0.006 0.007 0.059 0.091 0.463 65 D 0.060 0.182 0.024 0.014 0.020 0.102 0.097 0.501 66 D 0.012 0.483 0.012 0.004 0.013 0.037 0.052 0.386 67 I 0.003 0.847 0.010 0.015 0.016 0.017 0.034 0.058 68 D 0.002 0.736 0.030 0.016 0.023 0.008 0.162 0.022 69 V 0.002 0.891 0.005 0.010 0.010 0.002 0.076 0.005 70 A 0.002 0.869 0.014 0.005 0.010 0.002 0.094 0.004 71 L 0.003 0.778 0.014 0.020 0.020 0.003 0.153 0.009 72 R 0.007 0.778 0.044 0.022 0.030 0.008 0.091 0.020 73 L 0.038 0.583 0.155 0.028 0.033 0.019 0.104 0.039 74 I 0.061 0.207 0.297 0.059 0.054 0.046 0.157 0.119 75 Y 0.279 0.055 0.131 0.035 0.032 0.074 0.072 0.323 76 A 0.131 0.045 0.034 0.014 0.019 0.127 0.051 0.579 77 L 0.023 0.031 0.021 0.007 0.016 0.118 0.032 0.751 78 G 0.036 0.093 0.040 0.022 0.038 0.171 0.058 0.542 79 K 0.029 0.162 0.038 0.029 0.031 0.131 0.063 0.518 80 M 0.082 0.380 0.054 0.020 0.025 0.061 0.137 0.241 81 D 0.107 0.694 0.012 0.006 0.009 0.020 0.084 0.068 82 K 0.071 0.571 0.019 0.005 0.006 0.039 0.059 0.230 83 W 0.024 0.589 0.052 0.015 0.013 0.037 0.082 0.187 84 L 0.094 0.692 0.013 0.003 0.005 0.028 0.047 0.117 85 Y 0.110 0.193 0.038 0.007 0.006 0.041 0.454 0.151 86 A 0.014 0.439 0.012 0.006 0.006 0.045 0.218 0.258 87 D 0.038 0.847 0.002 0.001 0.001 0.011 0.025 0.077 88 I 0.028 0.494 0.008 0.004 0.003 0.029 0.330 0.103 89 T 0.014 0.366 0.012 0.003 0.004 0.022 0.501 0.079 90 H 0.030 0.866 0.003 0.001 0.001 0.010 0.053 0.036 91 F 0.037 0.859 0.011 0.002 0.002 0.012 0.034 0.043 92 S 0.041 0.700 0.018 0.004 0.006 0.032 0.066 0.134 93 Q 0.016 0.793 0.017 0.002 0.003 0.022 0.039 0.109 94 Y 0.071 0.791 0.027 0.002 0.003 0.016 0.036 0.054 95 W 0.128 0.280 0.094 0.013 0.010 0.047 0.287 0.141 96 H 0.081 0.254 0.052 0.008 0.010 0.064 0.079 0.451 97 Y 0.132 0.086 0.138 0.010 0.014 0.091 0.069 0.459 98 L 0.053 0.020 0.056 0.016 0.014 0.134 0.068 0.639 99 N 0.142 0.018 0.016 0.005 0.010 0.077 0.048 0.684 100 E 0.076 0.010 0.008 0.005 0.006 0.091 0.041 0.762 101 Q 0.059 0.013 0.016 0.013 0.019 0.150 0.048 0.683 102 D 0.027 0.007 0.011 0.010 0.020 0.112 0.034 0.780 103 E 0.037 0.010 0.022 0.026 0.032 0.128 0.029 0.714 104 T 0.108 0.024 0.028 0.029 0.038 0.096 0.050 0.626 105 P 0.038 0.019 0.030 0.032 0.042 0.138 0.036 0.665 106 G 0.024 0.024 0.065 0.035 0.066 0.130 0.051 0.606 107 F 0.062 0.054 0.038 0.039 0.049 0.115 0.071 0.572 108 A 0.084 0.073 0.051 0.031 0.037 0.095 0.251 0.379 109 D 0.068 0.226 0.032 0.036 0.068 0.076 0.172 0.321 110 D 0.043 0.149 0.048 0.030 0.067 0.093 0.066 0.504 111 I 0.016 0.166 0.097 0.120 0.142 0.095 0.053 0.310 112 T 0.034 0.453 0.049 0.029 0.080 0.051 0.074 0.230 113 W 0.082 0.220 0.071 0.043 0.038 0.052 0.305 0.189 114 D 0.022 0.136 0.076 0.044 0.028 0.054 0.501 0.140 115 F 0.104 0.587 0.015 0.005 0.008 0.031 0.079 0.171 116 I 0.184 0.393 0.034 0.007 0.010 0.055 0.076 0.241 117 S 0.036 0.254 0.031 0.017 0.019 0.069 0.137 0.437 118 N 0.054 0.488 0.010 0.002 0.006 0.047 0.083 0.310 119 V 0.051 0.227 0.043 0.012 0.011 0.076 0.394 0.186 120 N 0.044 0.361 0.058 0.018 0.021 0.066 0.219 0.214 121 S 0.064 0.252 0.063 0.007 0.019 0.059 0.197 0.339 122 I 0.122 0.250 0.125 0.026 0.025 0.079 0.131 0.242 123 T 0.098 0.080 0.071 0.020 0.026 0.082 0.188 0.434 124 R 0.037 0.080 0.021 0.007 0.009 0.104 0.062 0.681 125 N 0.100 0.207 0.028 0.008 0.013 0.093 0.086 0.464 126 A 0.069 0.187 0.023 0.012 0.010 0.106 0.061 0.533 127 T 0.057 0.464 0.022 0.006 0.010 0.058 0.034 0.349 128 L 0.065 0.704 0.013 0.004 0.005 0.028 0.027 0.155 129 Y 0.074 0.691 0.025 0.005 0.005 0.025 0.038 0.136 130 D 0.060 0.747 0.017 0.005 0.005 0.019 0.035 0.112 131 A 0.089 0.547 0.044 0.006 0.008 0.034 0.087 0.186 132 L 0.206 0.397 0.041 0.009 0.009 0.045 0.083 0.210 133 K 0.123 0.165 0.031 0.012 0.010 0.052 0.095 0.512 134 A 0.095 0.127 0.011 0.003 0.005 0.068 0.040 0.651 135 M 0.083 0.080 0.022 0.009 0.008 0.099 0.073 0.627 136 K 0.047 0.089 0.007 0.005 0.005 0.085 0.027 0.734 137 F 0.161 0.300 0.006 0.003 0.004 0.047 0.043 0.435 138 A 0.040 0.415 0.011 0.009 0.011 0.075 0.048 0.391 139 D 0.035 0.546 0.013 0.008 0.020 0.046 0.069 0.262 140 F 0.030 0.323 0.021 0.024 0.027 0.055 0.306 0.214 141 A 0.011 0.596 0.031 0.038 0.045 0.044 0.115 0.119 142 V 0.025 0.783 0.012 0.012 0.023 0.021 0.036 0.089 143 W 0.022 0.808 0.016 0.018 0.017 0.017 0.037 0.066 144 S 0.038 0.814 0.005 0.009 0.014 0.011 0.049 0.060 145 E 0.044 0.336 0.014 0.014 0.016 0.032 0.413 0.131 146 A 0.015 0.257 0.024 0.026 0.022 0.056 0.451 0.149 147 R 0.128 0.565 0.009 0.008 0.008 0.031 0.071 0.179 148 F 0.122 0.551 0.004 0.004 0.006 0.028 0.059 0.226 149 S 0.025 0.450 0.009 0.005 0.012 0.049 0.075 0.375 150 G 0.014 0.228 0.017 0.018 0.027 0.068 0.430 0.198 151 M 0.006 0.663 0.016 0.019 0.016 0.032 0.152 0.096 152 V 0.016 0.819 0.011 0.009 0.014 0.015 0.064 0.053 153 K 0.008 0.695 0.021 0.012 0.013 0.012 0.190 0.048 154 T 0.002 0.940 0.005 0.003 0.004 0.003 0.032 0.011 155 A 0.002 0.975 0.005 0.001 0.002 0.002 0.007 0.006 156 L 0.004 0.973 0.002 0.002 0.002 0.002 0.010 0.004 157 T 0.004 0.141 0.004 0.001 0.001 0.004 0.837 0.009 158 L 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.001 159 A 0.002 0.547 0.005 0.003 0.006 0.008 0.417 0.013 160 V 0.005 0.952 0.002 0.002 0.003 0.004 0.020 0.013 161 T 0.013 0.901 0.008 0.005 0.008 0.007 0.032 0.025 162 T 0.041 0.674 0.029 0.011 0.009 0.029 0.102 0.104 163 T 0.190 0.452 0.027 0.006 0.006 0.046 0.149 0.124 164 L 0.359 0.058 0.049 0.007 0.006 0.055 0.293 0.174 165 K 0.076 0.033 0.016 0.006 0.008 0.089 0.061 0.711 166 E 0.013 0.006 0.019 0.003 0.007 0.064 0.024 0.863 167 L 0.021 0.005 0.028 0.014 0.015 0.161 0.036 0.720 168 T 0.152 0.012 0.018 0.017 0.021 0.123 0.060 0.598 169 P 0.046 0.007 0.009 0.005 0.009 0.088 0.018 0.818