# TARGET T0357 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0357.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 39 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.028 0.002 0.001 0.002 0.126 0.841 2 V 0.400 0.024 0.002 0.006 0.052 0.516 3 K 0.740 0.017 0.001 0.004 0.023 0.215 4 F 0.862 0.006 0.001 0.003 0.023 0.105 5 A 0.833 0.004 0.001 0.003 0.029 0.129 6 C 0.832 0.003 0.002 0.004 0.041 0.117 7 R 0.845 0.004 0.002 0.003 0.047 0.100 8 A 0.842 0.006 0.002 0.004 0.048 0.099 9 I 0.759 0.014 0.004 0.005 0.088 0.130 10 T 0.596 0.036 0.006 0.007 0.188 0.167 11 R 0.337 0.004 0.008 0.005 0.402 0.244 12 G 0.346 0.010 0.012 0.003 0.421 0.208 13 R 0.650 0.030 0.006 0.002 0.190 0.121 14 A 0.799 0.007 0.002 0.001 0.069 0.122 15 E 0.856 0.003 0.002 0.001 0.036 0.102 16 G 0.870 0.008 0.004 0.001 0.040 0.076 17 E 0.891 0.003 0.005 0.002 0.035 0.065 18 A 0.932 0.002 0.002 0.001 0.021 0.042 19 L 0.943 0.004 0.001 0.001 0.016 0.034 20 V 0.930 0.010 0.001 0.001 0.025 0.032 21 T 0.752 0.009 0.005 0.004 0.126 0.104 22 K 0.227 0.007 0.017 0.009 0.464 0.276 23 E 0.201 0.021 0.019 0.011 0.505 0.243 24 Y 0.231 0.027 0.029 0.032 0.365 0.317 25 I 0.371 0.026 0.061 0.045 0.271 0.225 26 S 0.413 0.030 0.114 0.039 0.281 0.122 27 F 0.325 0.009 0.180 0.035 0.319 0.132 28 L 0.279 0.010 0.102 0.024 0.349 0.236 29 G 0.231 0.018 0.052 0.015 0.283 0.400 30 G 0.244 0.016 0.010 0.003 0.241 0.487 31 I 0.373 0.130 0.008 0.001 0.145 0.343 32 D 0.222 0.039 0.016 0.001 0.594 0.127 33 K 0.015 0.003 0.160 0.003 0.798 0.022 34 E 0.007 0.001 0.211 0.002 0.762 0.017 35 T 0.039 0.006 0.107 0.002 0.813 0.033 36 G 0.229 0.021 0.018 0.003 0.299 0.431 37 I 0.631 0.125 0.003 0.001 0.058 0.181 38 V 0.639 0.098 0.005 0.002 0.077 0.179 39 K 0.295 0.040 0.018 0.004 0.415 0.226 40 E 0.069 0.016 0.041 0.009 0.686 0.178 41 D 0.013 0.007 0.053 0.007 0.767 0.153 42 C 0.019 0.048 0.049 0.006 0.781 0.097 43 E 0.028 0.044 0.072 0.010 0.557 0.290 44 I 0.032 0.024 0.085 0.010 0.779 0.070 45 K 0.037 0.011 0.053 0.008 0.814 0.078 46 G 0.085 0.016 0.026 0.006 0.730 0.138 47 E 0.328 0.044 0.013 0.004 0.477 0.134 48 S 0.488 0.090 0.008 0.005 0.219 0.189 49 V 0.385 0.083 0.012 0.004 0.473 0.043 50 A 0.210 0.006 0.008 0.002 0.727 0.047 51 G 0.143 0.001 0.006 0.002 0.797 0.052 52 R 0.784 0.011 0.001 0.001 0.167 0.036 53 I 0.950 0.009 0.001 0.001 0.013 0.027 54 L 0.966 0.002 0.001 0.001 0.008 0.023 55 V 0.950 0.010 0.001 0.001 0.010 0.029 56 F 0.609 0.013 0.003 0.003 0.118 0.254 57 P 0.257 0.007 0.005 0.004 0.309 0.418 58 G 0.066 0.024 0.008 0.008 0.475 0.420 59 G 0.039 0.080 0.024 0.028 0.652 0.178 60 K 0.038 0.020 0.037 0.040 0.668 0.197 61 G 0.012 0.008 0.066 0.052 0.698 0.164 62 S 0.007 0.016 0.084 0.117 0.626 0.152 63 T 0.003 0.012 0.095 0.382 0.359 0.148 64 V 0.002 0.005 0.041 0.640 0.220 0.091 65 G 0.001 0.001 0.008 0.925 0.040 0.025 66 S 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 67 Y 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 68 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 69 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 70 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 71 N 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 72 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 73 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 74 K 0.001 0.001 0.001 0.990 0.005 0.004 75 N 0.001 0.001 0.002 0.864 0.044 0.088 76 G 0.002 0.001 0.001 0.008 0.108 0.881 77 V 0.017 0.006 0.001 0.004 0.132 0.840 78 A 0.076 0.013 0.001 0.004 0.233 0.673 79 P 0.081 0.007 0.011 0.009 0.270 0.622 80 K 0.556 0.011 0.042 0.018 0.165 0.208 81 A 0.840 0.005 0.022 0.008 0.064 0.061 82 I 0.922 0.004 0.006 0.006 0.026 0.035 83 I 0.906 0.005 0.006 0.006 0.028 0.049 84 N 0.705 0.009 0.011 0.020 0.084 0.171 85 K 0.425 0.007 0.017 0.030 0.218 0.303 86 K 0.114 0.007 0.014 0.058 0.261 0.546 87 T 0.080 0.023 0.005 0.085 0.202 0.606 88 E 0.076 0.005 0.004 0.098 0.131 0.686 89 T 0.268 0.012 0.012 0.296 0.074 0.337 90 I 0.606 0.006 0.012 0.274 0.026 0.076 91 I 0.797 0.002 0.008 0.165 0.008 0.021 92 A 0.823 0.001 0.006 0.148 0.006 0.016 93 V 0.645 0.002 0.005 0.321 0.008 0.019 94 G 0.536 0.002 0.010 0.410 0.015 0.027 95 A 0.577 0.004 0.013 0.342 0.027 0.037 96 A 0.508 0.005 0.028 0.361 0.049 0.049 97 M 0.504 0.009 0.031 0.356 0.057 0.043 98 A 0.233 0.005 0.056 0.546 0.090 0.070 99 E 0.165 0.006 0.021 0.192 0.235 0.382 100 I 0.105 0.010 0.015 0.043 0.331 0.497 101 P 0.137 0.028 0.020 0.046 0.367 0.403 102 L 0.108 0.025 0.101 0.094 0.461 0.211 103 V 0.074 0.017 0.171 0.101 0.450 0.187 104 E 0.109 0.011 0.148 0.135 0.362 0.235 105 V 0.121 0.013 0.050 0.056 0.342 0.419 106 R 0.106 0.039 0.011 0.021 0.242 0.582 107 D 0.098 0.010 0.009 0.023 0.170 0.690 108 E 0.158 0.015 0.055 0.093 0.216 0.463 109 K 0.174 0.021 0.036 0.117 0.176 0.477 110 F 0.248 0.011 0.036 0.135 0.138 0.432 111 F 0.195 0.008 0.026 0.145 0.144 0.481 112 E 0.252 0.023 0.029 0.133 0.127 0.435 113 A 0.233 0.011 0.104 0.170 0.172 0.310 114 V 0.200 0.009 0.071 0.184 0.222 0.314 115 K 0.241 0.010 0.090 0.147 0.254 0.257 116 T 0.215 0.009 0.057 0.081 0.337 0.301 117 G 0.114 0.005 0.025 0.024 0.431 0.401 118 D 0.274 0.007 0.029 0.019 0.321 0.351 119 R 0.640 0.015 0.015 0.014 0.142 0.175 120 V 0.803 0.013 0.007 0.009 0.063 0.105 121 V 0.813 0.016 0.005 0.006 0.081 0.079 122 V 0.664 0.020 0.005 0.006 0.127 0.177 123 N 0.339 0.013 0.009 0.005 0.420 0.215 124 A 0.080 0.004 0.089 0.027 0.720 0.081 125 D 0.085 0.007 0.126 0.064 0.620 0.098 126 E 0.259 0.026 0.059 0.080 0.477 0.100 127 G 0.392 0.015 0.015 0.099 0.226 0.252 128 Y 0.561 0.025 0.009 0.091 0.089 0.225 129 V 0.756 0.011 0.019 0.089 0.055 0.069 130 E 0.782 0.003 0.020 0.081 0.041 0.073 131 L 0.826 0.006 0.020 0.071 0.031 0.045 132 I 0.771 0.007 0.027 0.101 0.041 0.053 133 E 0.717 0.006 0.031 0.102 0.065 0.078 134 L 0.530 0.013 0.038 0.126 0.131 0.161 135 E 0.233 0.021 0.016 0.059 0.226 0.445 136 H 0.076 0.016 0.012 0.027 0.305 0.563 137 H 0.045 0.018 0.031 0.020 0.586 0.300 138 H 0.021 0.014 0.117 0.044 0.579 0.224 139 H 0.022 0.023 0.099 0.043 0.512 0.301 140 H 0.026 0.015 0.030 0.042 0.391 0.495 141 H 0.001 0.006 0.001 0.007 0.054 0.930