# TARGET T0357 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0357.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 15.107 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.034 0.041 0.022 0.048 0.095 0.088 0.048 0.624 2 V 0.027 0.066 0.032 0.150 0.196 0.087 0.059 0.382 3 K 0.027 0.055 0.040 0.078 0.153 0.088 0.057 0.501 4 F 0.048 0.080 0.049 0.128 0.143 0.073 0.101 0.379 5 A 0.065 0.091 0.050 0.100 0.142 0.083 0.108 0.360 6 C 0.024 0.034 0.045 0.078 0.132 0.067 0.228 0.392 7 R 0.010 0.029 0.083 0.174 0.263 0.068 0.149 0.225 8 A 0.016 0.018 0.094 0.131 0.240 0.068 0.120 0.314 9 I 0.055 0.013 0.088 0.176 0.160 0.084 0.077 0.347 10 T 0.111 0.017 0.040 0.073 0.098 0.076 0.087 0.498 11 R 0.034 0.011 0.031 0.034 0.081 0.120 0.038 0.652 12 G 0.028 0.014 0.054 0.067 0.178 0.125 0.046 0.487 13 R 0.017 0.013 0.057 0.115 0.126 0.131 0.054 0.488 14 A 0.015 0.027 0.086 0.133 0.176 0.095 0.041 0.427 15 E 0.050 0.052 0.073 0.101 0.200 0.069 0.081 0.374 16 G 0.060 0.047 0.052 0.179 0.211 0.067 0.088 0.295 17 E 0.012 0.008 0.095 0.203 0.344 0.047 0.111 0.179 18 A 0.005 0.007 0.074 0.193 0.437 0.041 0.068 0.175 19 L 0.005 0.005 0.082 0.301 0.449 0.026 0.024 0.108 20 V 0.014 0.004 0.094 0.284 0.324 0.048 0.038 0.194 21 T 0.082 0.017 0.033 0.140 0.217 0.061 0.066 0.385 22 K 0.089 0.012 0.024 0.049 0.088 0.119 0.049 0.570 23 E 0.021 0.017 0.033 0.053 0.098 0.151 0.048 0.580 24 Y 0.019 0.018 0.044 0.059 0.103 0.116 0.046 0.595 25 I 0.029 0.024 0.069 0.107 0.121 0.102 0.086 0.462 26 S 0.067 0.019 0.102 0.116 0.152 0.078 0.144 0.322 27 F 0.318 0.014 0.040 0.069 0.068 0.070 0.049 0.373 28 L 0.065 0.005 0.034 0.047 0.088 0.095 0.028 0.638 29 G 0.018 0.006 0.023 0.031 0.085 0.116 0.015 0.707 30 G 0.005 0.004 0.037 0.093 0.210 0.159 0.031 0.461 31 I 0.007 0.001 0.037 0.040 0.036 0.094 0.052 0.732 32 D 0.483 0.023 0.018 0.056 0.025 0.039 0.273 0.083 33 K 0.136 0.006 0.017 0.009 0.014 0.130 0.041 0.647 34 E 0.026 0.005 0.049 0.022 0.096 0.126 0.040 0.637 35 T 0.006 0.003 0.063 0.036 0.132 0.077 0.041 0.642 36 G 0.008 0.003 0.127 0.203 0.216 0.121 0.039 0.282 37 I 0.006 0.003 0.134 0.139 0.173 0.079 0.046 0.420 38 V 0.052 0.007 0.086 0.078 0.082 0.117 0.060 0.518 39 K 0.417 0.034 0.035 0.026 0.026 0.083 0.089 0.290 40 E 0.057 0.034 0.016 0.015 0.023 0.109 0.026 0.721 41 D 0.052 0.038 0.021 0.013 0.030 0.110 0.027 0.708 42 C 0.095 0.078 0.033 0.073 0.085 0.107 0.126 0.401 43 E 0.192 0.037 0.012 0.030 0.049 0.107 0.043 0.530 44 I 0.165 0.035 0.014 0.048 0.050 0.094 0.106 0.489 45 K 0.019 0.021 0.010 0.025 0.057 0.109 0.026 0.732 46 G 0.067 0.045 0.014 0.047 0.113 0.075 0.077 0.562 47 E 0.014 0.022 0.030 0.210 0.204 0.106 0.080 0.332 48 S 0.107 0.011 0.052 0.048 0.093 0.152 0.094 0.444 49 V 0.518 0.018 0.019 0.065 0.042 0.057 0.071 0.210 50 A 0.012 0.007 0.026 0.016 0.080 0.143 0.022 0.695 51 G 0.003 0.002 0.050 0.038 0.276 0.099 0.034 0.497 52 R 0.002 0.001 0.092 0.525 0.288 0.026 0.033 0.033 53 I 0.003 0.001 0.194 0.218 0.253 0.036 0.050 0.245 54 L 0.001 0.001 0.355 0.212 0.363 0.012 0.026 0.032 55 V 0.003 0.001 0.292 0.200 0.304 0.040 0.030 0.130 56 F 0.096 0.001 0.212 0.206 0.160 0.086 0.119 0.119 57 P 0.019 0.001 0.048 0.042 0.087 0.167 0.059 0.577 58 G 0.041 0.001 0.068 0.008 0.032 0.199 0.058 0.592 59 G 0.080 0.004 0.044 0.025 0.037 0.169 0.138 0.504 60 K 0.022 0.006 0.072 0.029 0.051 0.216 0.061 0.543 61 G 0.018 0.011 0.063 0.024 0.073 0.164 0.048 0.599 62 S 0.038 0.032 0.074 0.045 0.057 0.158 0.108 0.487 63 T 0.067 0.272 0.070 0.031 0.037 0.099 0.141 0.284 64 V 0.043 0.616 0.025 0.022 0.036 0.055 0.033 0.170 65 G 0.017 0.804 0.011 0.012 0.030 0.018 0.033 0.075 66 S 0.006 0.896 0.004 0.010 0.023 0.007 0.033 0.020 67 Y 0.005 0.705 0.016 0.050 0.072 0.011 0.112 0.029 68 V 0.003 0.866 0.005 0.039 0.046 0.004 0.028 0.009 69 L 0.009 0.907 0.012 0.011 0.026 0.004 0.022 0.009 70 L 0.016 0.779 0.016 0.069 0.051 0.005 0.043 0.020 71 N 0.036 0.332 0.082 0.087 0.087 0.019 0.258 0.099 72 L 0.187 0.073 0.112 0.066 0.056 0.047 0.305 0.155 73 R 0.855 0.004 0.009 0.009 0.007 0.014 0.025 0.077 74 K 0.085 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.007 0.879 75 N 0.002 0.001 0.002 0.001 0.002 0.065 0.004 0.924 76 G 0.004 0.003 0.007 0.005 0.008 0.127 0.016 0.831 77 V 0.030 0.028 0.016 0.026 0.010 0.138 0.018 0.735 78 A 0.247 0.251 0.042 0.014 0.012 0.059 0.041 0.335 79 P 0.201 0.418 0.018 0.011 0.019 0.041 0.055 0.236 80 K 0.029 0.143 0.132 0.027 0.059 0.055 0.265 0.289 81 A 0.018 0.163 0.135 0.072 0.144 0.064 0.197 0.208 82 I 0.066 0.123 0.184 0.121 0.166 0.070 0.080 0.191 83 I 0.030 0.035 0.163 0.110 0.141 0.063 0.199 0.259 84 N 0.035 0.047 0.091 0.052 0.121 0.083 0.216 0.356 85 K 0.033 0.016 0.035 0.036 0.049 0.138 0.195 0.498 86 K 0.069 0.048 0.021 0.025 0.033 0.135 0.087 0.581 87 T 0.075 0.089 0.012 0.013 0.023 0.121 0.097 0.570 88 E 0.016 0.144 0.037 0.027 0.061 0.132 0.068 0.516 89 T 0.013 0.177 0.181 0.064 0.165 0.063 0.155 0.182 90 I 0.006 0.094 0.217 0.134 0.117 0.060 0.153 0.219 91 I 0.015 0.071 0.399 0.169 0.161 0.033 0.093 0.059 92 A 0.027 0.082 0.213 0.079 0.129 0.067 0.246 0.156 93 V 0.016 0.118 0.271 0.115 0.196 0.055 0.082 0.147 94 G 0.024 0.068 0.192 0.099 0.248 0.062 0.095 0.211 95 A 0.010 0.018 0.302 0.151 0.167 0.057 0.143 0.152 96 A 0.068 0.019 0.191 0.228 0.307 0.034 0.062 0.092 97 M 0.107 0.006 0.110 0.071 0.110 0.098 0.110 0.389 98 A 0.009 0.004 0.099 0.069 0.116 0.165 0.034 0.505 99 E 0.023 0.005 0.034 0.019 0.059 0.109 0.026 0.725 100 I 0.038 0.011 0.043 0.053 0.054 0.134 0.062 0.606 101 P 0.026 0.019 0.192 0.118 0.214 0.094 0.074 0.264 102 L 0.028 0.019 0.098 0.066 0.152 0.070 0.070 0.496 103 V 0.017 0.017 0.244 0.222 0.158 0.049 0.049 0.244 104 E 0.062 0.060 0.131 0.076 0.100 0.078 0.052 0.441 105 V 0.053 0.061 0.080 0.052 0.052 0.104 0.060 0.538 106 R 0.057 0.111 0.041 0.020 0.018 0.080 0.061 0.613 107 D 0.221 0.484 0.008 0.005 0.005 0.024 0.089 0.164 108 E 0.068 0.505 0.011 0.008 0.008 0.047 0.042 0.312 109 K 0.024 0.590 0.008 0.011 0.013 0.037 0.030 0.287 110 F 0.050 0.722 0.006 0.007 0.010 0.025 0.054 0.126 111 F 0.150 0.562 0.012 0.016 0.019 0.033 0.078 0.130 112 E 0.072 0.096 0.024 0.076 0.071 0.048 0.319 0.294 113 A 0.026 0.018 0.034 0.033 0.055 0.084 0.381 0.368 114 V 0.203 0.009 0.051 0.034 0.053 0.111 0.171 0.368 115 K 0.250 0.002 0.011 0.009 0.012 0.069 0.023 0.625 116 T 0.024 0.001 0.005 0.002 0.007 0.077 0.010 0.873 117 G 0.006 0.001 0.029 0.010 0.054 0.187 0.024 0.689 118 D 0.011 0.001 0.097 0.179 0.299 0.074 0.056 0.283 119 R 0.002 0.001 0.094 0.247 0.231 0.027 0.029 0.369 120 V 0.001 0.001 0.207 0.291 0.284 0.027 0.009 0.180 121 V 0.001 0.001 0.147 0.350 0.332 0.020 0.011 0.139 122 V 0.005 0.001 0.133 0.192 0.122 0.045 0.023 0.479 123 N 0.232 0.012 0.086 0.101 0.081 0.069 0.124 0.295 124 A 0.457 0.015 0.015 0.016 0.019 0.070 0.035 0.373 125 D 0.121 0.029 0.013 0.014 0.030 0.077 0.025 0.691 126 E 0.016 0.022 0.020 0.021 0.088 0.116 0.021 0.696 127 G 0.013 0.047 0.037 0.121 0.280 0.089 0.052 0.361 128 Y 0.034 0.079 0.039 0.220 0.207 0.058 0.052 0.313 129 V 0.029 0.096 0.083 0.198 0.183 0.048 0.051 0.311 130 E 0.029 0.170 0.062 0.147 0.207 0.049 0.043 0.293 131 L 0.076 0.173 0.089 0.096 0.109 0.055 0.082 0.319 132 I 0.088 0.241 0.047 0.108 0.083 0.054 0.091 0.288 133 E 0.166 0.214 0.025 0.031 0.045 0.050 0.081 0.389 134 L 0.136 0.128 0.022 0.031 0.032 0.079 0.083 0.490 135 E 0.120 0.087 0.017 0.025 0.027 0.084 0.059 0.579 136 H 0.115 0.044 0.011 0.012 0.017 0.084 0.052 0.665 137 H 0.079 0.024 0.017 0.020 0.023 0.109 0.053 0.675 138 H 0.155 0.016 0.013 0.013 0.019 0.088 0.051 0.646 139 H 0.109 0.009 0.011 0.012 0.015 0.103 0.043 0.698 140 H 0.039 0.006 0.014 0.012 0.023 0.117 0.031 0.758 141 H 0.034 0.007 0.014 0.013 0.028 0.095 0.034 0.776