# TARGET T0357 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0357.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 P 0.026 0.003 0.006 0.016 0.120 0.829 2 K 0.241 0.024 0.033 0.073 0.108 0.521 3 A 0.486 0.020 0.040 0.057 0.111 0.286 4 I 0.626 0.018 0.036 0.061 0.111 0.148 5 I 0.578 0.024 0.022 0.045 0.138 0.192 6 N 0.309 0.022 0.038 0.066 0.251 0.314 7 K 0.213 0.010 0.076 0.051 0.433 0.216 8 K 0.116 0.014 0.089 0.109 0.414 0.257 9 T 0.146 0.055 0.044 0.077 0.442 0.236 10 E 0.145 0.010 0.013 0.036 0.358 0.437 11 T 0.248 0.014 0.015 0.046 0.204 0.472 12 I 0.662 0.011 0.011 0.028 0.102 0.187 13 I 0.888 0.003 0.004 0.013 0.025 0.067 14 A 0.956 0.002 0.002 0.006 0.008 0.026 15 V 0.957 0.003 0.001 0.005 0.008 0.026 16 G 0.929 0.002 0.003 0.007 0.015 0.044 17 A 0.892 0.003 0.005 0.009 0.028 0.062 18 A 0.807 0.010 0.012 0.014 0.067 0.090 19 M 0.652 0.012 0.051 0.026 0.142 0.118 20 A 0.376 0.009 0.059 0.031 0.285 0.239 21 E 0.257 0.013 0.034 0.022 0.355 0.318 22 I 0.228 0.030 0.017 0.013 0.402 0.310 23 P 0.187 0.017 0.024 0.020 0.478 0.274 24 L 0.119 0.018 0.305 0.070 0.393 0.096 25 V 0.134 0.025 0.200 0.073 0.380 0.187 26 E 0.107 0.022 0.227 0.106 0.330 0.208 27 V 0.083 0.018 0.182 0.066 0.374 0.277 28 R 0.079 0.034 0.122 0.062 0.410 0.293 29 D 0.089 0.014 0.077 0.101 0.343 0.375 30 E 0.116 0.012 0.094 0.244 0.335 0.199 31 K 0.141 0.011 0.040 0.162 0.307 0.339 32 F 0.164 0.005 0.091 0.325 0.240 0.174 33 F 0.244 0.015 0.105 0.375 0.158 0.102 34 E 0.288 0.015 0.070 0.460 0.097 0.070 35 A 0.274 0.008 0.077 0.405 0.121 0.114 36 V 0.351 0.019 0.029 0.329 0.112 0.160 37 K 0.322 0.017 0.030 0.252 0.270 0.108 38 T 0.178 0.007 0.016 0.058 0.564 0.179 39 G 0.069 0.003 0.003 0.001 0.673 0.250 40 D 0.371 0.005 0.003 0.001 0.400 0.220 41 R 0.858 0.007 0.001 0.001 0.046 0.088 42 V 0.957 0.006 0.001 0.001 0.010 0.027 43 V 0.971 0.004 0.001 0.001 0.013 0.012 44 V 0.946 0.006 0.001 0.001 0.023 0.025 45 N 0.733 0.007 0.002 0.001 0.177 0.081 46 A 0.124 0.003 0.037 0.002 0.780 0.054 47 D 0.072 0.005 0.122 0.005 0.721 0.075 48 E 0.238 0.021 0.066 0.003 0.624 0.048 49 G 0.444 0.014 0.024 0.004 0.361 0.153 50 Y 0.788 0.025 0.005 0.001 0.072 0.110 51 V 0.939 0.003 0.002 0.001 0.018 0.037 52 E 0.933 0.002 0.001 0.001 0.011 0.052 53 L 0.884 0.009 0.001 0.001 0.016 0.089 54 I 0.592 0.019 0.003 0.002 0.033 0.350 55 E 0.009 0.001 0.001 0.001 0.018 0.970