# TARGET T0357 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0357.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 9 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 P 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.987 2 K 0.319 0.010 0.007 0.025 0.028 0.028 0.583 3 A 0.713 0.011 0.008 0.016 0.056 0.012 0.183 4 I 0.871 0.007 0.005 0.019 0.011 0.005 0.081 5 I 0.870 0.016 0.003 0.020 0.011 0.004 0.076 6 N 0.551 0.011 0.006 0.021 0.036 0.015 0.360 7 K 0.094 0.005 0.054 0.071 0.117 0.448 0.210 8 K 0.015 0.004 0.029 0.041 0.187 0.662 0.062 9 T 0.038 0.009 0.019 0.127 0.353 0.293 0.160 10 E 0.064 0.009 0.005 0.081 0.262 0.066 0.512 11 T 0.101 0.013 0.033 0.197 0.169 0.099 0.389 12 I 0.394 0.038 0.032 0.323 0.043 0.050 0.119 13 I 0.343 0.004 0.019 0.515 0.028 0.028 0.063 14 A 0.363 0.004 0.019 0.547 0.007 0.024 0.036 15 V 0.191 0.003 0.017 0.704 0.008 0.054 0.023 16 G 0.172 0.002 0.030 0.675 0.024 0.067 0.029 17 A 0.147 0.004 0.045 0.704 0.026 0.033 0.041 18 A 0.129 0.013 0.076 0.594 0.027 0.106 0.056 19 M 0.105 0.013 0.119 0.421 0.037 0.221 0.082 20 A 0.092 0.013 0.093 0.243 0.123 0.324 0.113 21 E 0.084 0.006 0.044 0.071 0.250 0.269 0.275 22 I 0.124 0.017 0.014 0.034 0.228 0.030 0.554 23 P 0.198 0.023 0.010 0.020 0.096 0.027 0.627 24 L 0.332 0.043 0.028 0.023 0.084 0.066 0.423 25 V 0.391 0.030 0.024 0.020 0.122 0.046 0.367 26 E 0.264 0.031 0.026 0.021 0.134 0.033 0.491 27 V 0.146 0.021 0.074 0.063 0.180 0.081 0.436 28 R 0.076 0.013 0.135 0.053 0.160 0.255 0.308 29 D 0.074 0.018 0.089 0.037 0.185 0.219 0.378 30 E 0.083 0.041 0.041 0.051 0.386 0.075 0.323 31 K 0.096 0.028 0.013 0.041 0.168 0.047 0.606 32 F 0.009 0.004 0.246 0.622 0.028 0.055 0.038 33 F 0.006 0.002 0.294 0.636 0.011 0.029 0.021 34 E 0.015 0.001 0.283 0.625 0.009 0.053 0.015 35 A 0.027 0.006 0.193 0.655 0.014 0.075 0.030 36 V 0.038 0.024 0.081 0.640 0.051 0.102 0.065 37 K 0.025 0.009 0.077 0.545 0.048 0.219 0.077 38 T 0.015 0.003 0.029 0.194 0.262 0.450 0.047 39 G 0.030 0.005 0.013 0.022 0.282 0.501 0.148 40 D 0.072 0.005 0.004 0.001 0.273 0.118 0.527 41 R 0.773 0.007 0.001 0.001 0.042 0.010 0.167 42 V 0.959 0.003 0.001 0.001 0.003 0.001 0.033 43 V 0.982 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 44 V 0.970 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.026 45 N 0.797 0.006 0.001 0.001 0.007 0.003 0.187 46 A 0.077 0.001 0.018 0.003 0.063 0.792 0.045 47 D 0.027 0.002 0.020 0.002 0.122 0.794 0.032 48 E 0.055 0.004 0.044 0.013 0.244 0.544 0.096 49 G 0.200 0.011 0.020 0.008 0.147 0.360 0.253 50 Y 0.757 0.035 0.010 0.013 0.025 0.020 0.140 51 V 0.914 0.008 0.004 0.009 0.008 0.007 0.050 52 E 0.896 0.003 0.006 0.016 0.020 0.007 0.050 53 L 0.812 0.011 0.010 0.019 0.021 0.014 0.114 54 I 0.402 0.023 0.009 0.022 0.005 0.036 0.504 55 E 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.993