# TARGET T0354 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0354.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 305 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 2 E 0.012 0.023 0.002 0.082 0.003 0.014 0.864 3 I 0.002 0.001 0.009 0.756 0.058 0.023 0.152 4 Q 0.001 0.001 0.007 0.912 0.016 0.020 0.044 5 E 0.001 0.001 0.004 0.944 0.015 0.016 0.020 6 I 0.001 0.001 0.001 0.965 0.008 0.013 0.012 7 S 0.001 0.001 0.001 0.983 0.006 0.006 0.005 8 K 0.001 0.001 0.001 0.987 0.004 0.005 0.004 9 L 0.001 0.001 0.001 0.986 0.002 0.005 0.006 10 A 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.005 0.003 11 I 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.008 0.002 12 E 0.001 0.001 0.001 0.971 0.002 0.024 0.002 13 A 0.001 0.001 0.001 0.946 0.003 0.043 0.006 14 L 0.001 0.001 0.008 0.926 0.011 0.037 0.017 15 E 0.001 0.001 0.055 0.783 0.016 0.131 0.016 16 D 0.001 0.001 0.104 0.530 0.016 0.330 0.018 17 I 0.002 0.005 0.049 0.225 0.189 0.361 0.170 18 K 0.010 0.018 0.040 0.051 0.073 0.508 0.300 19 G 0.029 0.013 0.110 0.018 0.151 0.158 0.520 20 K 0.078 0.014 0.221 0.016 0.257 0.166 0.248 21 D 0.189 0.004 0.069 0.010 0.209 0.096 0.423 22 I 0.670 0.004 0.003 0.004 0.044 0.014 0.262 23 I 0.941 0.002 0.001 0.003 0.019 0.003 0.031 24 E 0.978 0.003 0.001 0.002 0.002 0.001 0.014 25 L 0.956 0.004 0.001 0.003 0.002 0.001 0.034 26 D 0.775 0.003 0.001 0.003 0.008 0.002 0.209 27 T 0.257 0.004 0.028 0.022 0.070 0.150 0.468 28 S 0.054 0.004 0.098 0.016 0.285 0.385 0.157 29 K 0.019 0.001 0.169 0.022 0.296 0.425 0.067 30 L 0.038 0.025 0.191 0.029 0.218 0.278 0.222 31 T 0.149 0.065 0.039 0.011 0.208 0.066 0.463 32 S 0.234 0.031 0.060 0.019 0.141 0.085 0.430 33 L 0.312 0.028 0.126 0.045 0.145 0.149 0.195 34 F 0.443 0.010 0.033 0.009 0.098 0.026 0.382 35 Q 0.579 0.002 0.009 0.002 0.181 0.012 0.215 36 R 0.963 0.002 0.001 0.001 0.008 0.002 0.023 37 M 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 38 I 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 39 V 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 40 A 0.939 0.003 0.001 0.001 0.007 0.001 0.050 41 T 0.582 0.006 0.002 0.001 0.063 0.010 0.336 42 G 0.122 0.013 0.011 0.005 0.344 0.097 0.409 43 D 0.036 0.014 0.012 0.009 0.387 0.099 0.444 44 S 0.038 0.010 0.016 0.097 0.306 0.064 0.470 45 N 0.003 0.001 0.020 0.832 0.054 0.051 0.039 46 R 0.001 0.001 0.014 0.948 0.012 0.015 0.009 47 Q 0.001 0.001 0.006 0.980 0.003 0.006 0.004 48 V 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.003 0.001 49 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 50 A 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.005 0.001 51 L 0.001 0.001 0.001 0.991 0.001 0.007 0.001 52 A 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.004 0.001 53 N 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.008 0.001 54 S 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.009 0.002 55 V 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.002 56 Q 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 57 V 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.003 0.001 58 K 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.004 0.001 59 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.003 0.001 60 K 0.001 0.001 0.002 0.983 0.001 0.011 0.002 61 E 0.001 0.001 0.004 0.915 0.006 0.072 0.002 62 A 0.001 0.001 0.004 0.224 0.009 0.760 0.003 63 G 0.001 0.001 0.001 0.006 0.027 0.935 0.030 64 V 0.020 0.011 0.002 0.003 0.063 0.017 0.883 65 D 0.180 0.051 0.007 0.007 0.110 0.015 0.630 66 I 0.255 0.023 0.021 0.010 0.092 0.031 0.568 67 V 0.359 0.024 0.027 0.012 0.093 0.061 0.423 68 G 0.479 0.025 0.029 0.011 0.120 0.057 0.279 69 S 0.487 0.020 0.047 0.020 0.112 0.088 0.227 70 E 0.339 0.017 0.049 0.033 0.136 0.191 0.234 71 G 0.274 0.041 0.052 0.023 0.137 0.155 0.317 72 H 0.170 0.038 0.039 0.014 0.173 0.117 0.449 73 E 0.112 0.064 0.064 0.013 0.214 0.184 0.350 74 S 0.056 0.009 0.047 0.009 0.160 0.591 0.129 75 G 0.089 0.008 0.015 0.002 0.285 0.368 0.233 76 E 0.418 0.004 0.003 0.001 0.281 0.019 0.274 77 W 0.889 0.010 0.001 0.001 0.006 0.001 0.093 78 V 0.988 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.008 79 L 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 80 V 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 81 D 0.919 0.003 0.001 0.001 0.006 0.002 0.071 82 A 0.350 0.002 0.019 0.002 0.158 0.147 0.321 83 G 0.038 0.004 0.037 0.002 0.473 0.355 0.090 84 D 0.080 0.005 0.094 0.009 0.232 0.298 0.282 85 V 0.468 0.014 0.036 0.017 0.136 0.113 0.216 86 V 0.864 0.010 0.006 0.019 0.026 0.014 0.061 87 V 0.917 0.006 0.008 0.015 0.008 0.009 0.037 88 H 0.927 0.003 0.004 0.014 0.008 0.011 0.033 89 V 0.811 0.009 0.008 0.009 0.024 0.019 0.120 90 M 0.444 0.024 0.003 0.007 0.141 0.009 0.372 91 L 0.117 0.005 0.002 0.010 0.114 0.007 0.745 92 P 0.001 0.001 0.130 0.738 0.029 0.086 0.015 93 A 0.001 0.001 0.076 0.827 0.023 0.067 0.006 94 V 0.001 0.001 0.079 0.836 0.013 0.058 0.013 95 R 0.002 0.001 0.050 0.856 0.013 0.056 0.022 96 D 0.018 0.003 0.086 0.647 0.024 0.192 0.030 97 Y 0.031 0.004 0.074 0.691 0.035 0.120 0.045 98 Y 0.045 0.009 0.027 0.728 0.051 0.040 0.100 99 D 0.043 0.015 0.024 0.674 0.045 0.057 0.144 100 I 0.007 0.001 0.024 0.898 0.016 0.027 0.026 101 E 0.003 0.001 0.029 0.917 0.009 0.021 0.020 102 A 0.002 0.001 0.037 0.886 0.009 0.058 0.008 103 L 0.004 0.001 0.048 0.838 0.016 0.077 0.015 104 W 0.006 0.007 0.086 0.696 0.056 0.106 0.043 105 G 0.010 0.002 0.063 0.426 0.054 0.403 0.042 106 G 0.008 0.004 0.037 0.187 0.124 0.494 0.146 107 Q 0.015 0.009 0.009 0.032 0.353 0.037 0.546 108 K 0.052 0.010 0.012 0.018 0.176 0.062 0.669 109 P 0.239 0.055 0.035 0.041 0.095 0.059 0.476 110 S 0.321 0.037 0.029 0.037 0.065 0.018 0.494 111 F 0.339 0.018 0.033 0.041 0.063 0.022 0.484 112 A 0.205 0.023 0.069 0.081 0.120 0.061 0.441 113 V 0.091 0.020 0.073 0.064 0.141 0.096 0.515 114 G 0.040 0.008 0.092 0.081 0.169 0.185 0.424 115 A 0.028 0.011 0.072 0.058 0.203 0.191 0.437 116 A 0.020 0.011 0.050 0.070 0.299 0.140 0.410 117 K 0.022 0.014 0.033 0.112 0.201 0.132 0.487 118 P 0.019 0.015 0.038 0.237 0.174 0.145 0.371 119 W 0.020 0.012 0.031 0.392 0.161 0.072 0.312 120 S 0.014 0.004 0.044 0.694 0.067 0.080 0.098 121 A 0.016 0.004 0.037 0.760 0.033 0.094 0.055 122 V 0.028 0.007 0.029 0.794 0.020 0.074 0.048 123 L 0.042 0.007 0.026 0.782 0.033 0.056 0.054 124 E 0.057 0.004 0.029 0.732 0.047 0.063 0.068 125 H 0.055 0.010 0.038 0.726 0.029 0.079 0.064 126 H 0.063 0.019 0.054 0.630 0.044 0.091 0.099 127 H 0.088 0.010 0.073 0.453 0.077 0.157 0.142 128 H 0.079 0.011 0.060 0.290 0.123 0.219 0.219 129 H 0.065 0.037 0.029 0.140 0.053 0.161 0.515 130 H 0.002 0.002 0.003 0.016 0.018 0.007 0.953