PFRMAT QA TARGET T0348 AUTHOR 7072-3475-1278 METHOD linear combination of alignment based constraints and METHOD undertaker cost functions MODEL 1 QMODE 1 SAM_T06_server_TS1 0.674 Zhang-Server_TS3 0.674 MetaTasser_TS4 0.669 Zhang-Server_TS1 0.668 Pmodeller6_TS5 0.666 ROBETTA_TS3 0.666 PROTINFO-AB_TS4 0.662 Zhang-Server_TS2 0.660 MetaTasser_TS1 0.660 PROTINFO-AB_TS3 0.658 PROTINFO_TS1 0.658 PROTINFO-AB_TS1 0.656 Zhang-Server_TS5 0.655 ROBETTA_TS4 0.653 ROBETTA_TS1 0.650 MetaTasser_TS2 0.649 ROBETTA_TS2 0.647 PROTINFO_TS4 0.639 MetaTasser_TS5 0.639 PROTINFO-AB_TS2 0.637 PROTINFO-AB_TS5 0.637 MetaTasser_TS3 0.634 Phyre-2_TS1 0.632 ROBETTA_TS5 0.620 keasar-server_TS2 0.617 keasar-server_TS4 0.611 3Dpro_TS4 0.608 ABIpro_TS1 0.608 PROTINFO_TS3 0.603 SAM_T06_server_TS5 0.600 UNI-EID_expm_TS1 0.597 Zhang-Server_TS4 0.578 Phyre-2_TS3 0.577 Pcons6_TS1 0.577 Pmodeller6_TS4 0.577 keasar-server_TS1 0.576 Pcons6_TS5 0.575 Pcons6_TS4 0.573 Pmodeller6_TS2 0.573 ABIpro_TS3 0.572 HHpred1_TS1 0.571 HHpred2_TS1 0.571 GeneSilicoMetaServer_TS2 0.571 HHpred3_TS1 0.570 SP3_TS2 0.570 Pcons6_TS3 0.566 ABIpro_TS5 0.565 keasar-server_TS5 0.563 SP4_TS3 0.561 beautshot_TS1 0.559 Pmodeller6_TS1 0.559 SAM_T06_server_TS3 0.555 Phyre-2_TS4 0.552 SPARKS2_TS3 0.551 GeneSilicoMetaServer_TS1 0.550 CaspIta-FOX_TS3 0.550 Pcons6_TS2 0.548 SAM_T06_server_TS4 0.545 SP3_TS3 0.544 SP4_TS2 0.544 SP3_TS5 0.544 beautshotbase_TS1 0.543 3Dpro_TS1 0.542 Phyre-2_TS2 0.540 mGen-3D_TS1 0.539 Pmodeller6_TS3 0.538 3Dpro_TS5 0.534 ABIpro_TS2 0.534 Phyre-2_TS5 0.531 Ma-OPUS-server2_TS3 0.530 keasar-server_TS3 0.527 FOLDpro_TS1 0.524 BayesHH_TS1 0.523 FUNCTION_TS1 0.517 ABIpro_TS4 0.515 FOLDpro_TS3 0.508 CIRCLE_TS2 0.506 FAMS_TS3 0.506 FOLDpro_TS2 0.504 CIRCLE_TS1 0.503 FAMS_TS2 0.503 FAMSD_TS2 0.497 3Dpro_TS3 0.493 PROTINFO_TS2 0.493 shub_TS1 0.486 SP4_TS4 0.485 GeneSilicoMetaServer_TS4 0.484 FAMSD_TS1 0.475 PROTINFO_TS5 0.471 FOLDpro_TS5 0.470 GeneSilicoMetaServer_TS3 0.469 SAM_T06_server_TS2 0.466 Phyre-1_TS1 0.465 karypis.srv.2_TS3 0.462 RAPTOR_TS5 0.461 RAPTOR-ACE_TS3 0.457 FAMS_TS1 0.457 ROKKY_TS3 0.455 SP3_TS4 0.445 FAMSD_TS5 0.433 LOOPP_TS4 0.431 RAPTORESS_TS5 0.424 RAPTOR-ACE_TS5 0.420 CIRCLE_TS4 0.420 Ma-OPUS-server_TS4 0.419 ROKKY_TS2 0.417 ROKKY_TS4 0.417 ROKKY_TS1 0.417 Ma-OPUS-server2_TS4 0.413 RAPTORESS_TS2 0.409 LOOPP_TS2 0.404 ROKKY_TS5 0.404 RAPTOR_TS2 0.395 RAPTOR_TS1 0.394 RAPTORESS_TS3 0.394 CIRCLE_TS5 0.390 FUNCTION_TS3 0.389 nFOLD_TS2 0.380 3D-JIGSAW_RECOM_TS4 0.379 Ma-OPUS-server_TS2 0.376 3D-JIGSAW_TS2 0.375 UNI-EID_sfst_AL1 0.372 POMYSL_TS2 0.369 CIRCLE_TS3 0.368 FAMS_TS4 0.368 3D-JIGSAW_RECOM_TS5 0.366 karypis.srv.2_TS5 0.364 3D-JIGSAW_RECOM_TS3 0.361 3D-JIGSAW_RECOM_TS2 0.358 SP3_TS1 0.355 GeneSilicoMetaServer_TS5 0.354 Ma-OPUS-server2_TS1 0.352 Ma-OPUS-server_TS1 0.352 3D-JIGSAW_RECOM_TS1 0.351 UNI-EID_bnmx_TS3 0.351 POMYSL_TS1 0.347 Frankenstein_TS2 0.346 RAPTOR_TS3 0.343 LOOPP_TS1 0.342 SP4_TS1 0.341 karypis.srv_TS5 0.341 UNI-EID_bnmx_TS1 0.339 RAPTORESS_TS1 0.338 UNI-EID_bnmx_TS5 0.337 FAMSD_TS3 0.336 UNI-EID_sfst_AL2 0.336 SAM-T02_AL4 0.335 SAM-T99_AL1 0.331 3D-JIGSAW_TS1 0.331 LOOPP_TS5 0.329 3D-JIGSAW_TS4 0.328 SAM-T02_AL1 0.328 FUGUE_AL4 0.327 UNI-EID_bnmx_TS2 0.326 karypis.srv.2_TS1 0.326 FORTE1_AL2 0.325 FORTE2_AL3 0.325 FUNCTION_TS2 0.324 CaspIta-FOX_TS5 0.324 FAMS_TS5 0.321 SAM-T02_AL3 0.319 LOOPP_TS3 0.317 SPARKS2_TS1 0.317 SPARKS2_TS4 0.315 3Dpro_TS2 0.315 RAPTOR_TS4 0.315 karypis.srv_TS4 0.314 FORTE1_AL5 0.314 Distill_TS1 0.312 FUGUE_AL3 0.312 RAPTORESS_TS4 0.312 Distill_TS4 0.312 Distill_TS3 0.310 SAM-T02_AL2 0.304 FORTE1_AL1 0.304 FORTE2_AL1 0.304 UNI-EID_bnmx_TS4 0.304 3D-JIGSAW_TS3 0.301 3D-JIGSAW_POPULUS_TS1 0.301 nFOLD_TS4 0.300 FPSOLVER-SERVER_TS3 0.300 forecast-s_AL3 0.300 Ma-OPUS-server2_TS5 0.299 SAM-T02_AL5 0.296 Distill_TS5 0.296 UNI-EID_sfst_AL4 0.295 CaspIta-FOX_TS1 0.294 Distill_TS2 0.292 karypis.srv.4_TS1 0.291 forecast-s_AL1 0.290 FORTE1_AL3 0.290 FORTE2_AL2 0.290 karypis.srv_TS1 0.290 karypis.srv.2_TS2 0.289 RAPTOR-ACE_TS1 0.289 RAPTOR-ACE_TS4 0.289 RAPTOR-ACE_TS2 0.288 3D-JIGSAW_POPULUS_TS3 0.288 FUNCTION_TS5 0.288 UNI-EID_sfst_AL3 0.287 FPSOLVER-SERVER_TS5 0.286 FUGUE_AL2 0.285 forecast-s_AL5 0.285 forecast-s_AL4 0.285 FORTE2_AL5 0.284 FUGMOD_TS4 0.283 SPARKS2_TS2 0.283 forecast-s_AL2 0.283 Bilab-ENABLE_TS1 0.282 Ma-OPUS-server_TS3 0.282 Ma-OPUS-server2_TS2 0.281 Ma-OPUS-server_TS5 0.281 FORTE1_AL4 0.281 FORTE2_AL4 0.281 karypis.srv.2_TS4 0.280 FUNCTION_TS4 0.278 FUGMOD_TS3 0.277 Huber-Torda-Server_TS3 0.274 karypis.srv_TS3 0.273 FUGMOD_TS1 0.273 nFOLD_TS3 0.273 Huber-Torda-Server_TS2 0.273 Frankenstein_TS1 0.272 Huber-Torda-Server_TS5 0.272 karypis.srv.4_TS3 0.270 FUGUE_AL5 0.270 Huber-Torda-Server_TS4 0.269 UNI-EID_sfst_AL5 0.269 karypis.srv_TS2 0.268 FAMSD_TS4 0.266 POMYSL_TS3 0.264 Huber-Torda-Server_TS1 0.261 FPSOLVER-SERVER_TS4 0.257 CaspIta-FOX_TS4 0.256 FPSOLVER-SERVER_TS2 0.251 POMYSL_TS5 0.249 FUGUE_AL1 0.247 NN_PUT_lab_TS1 0.247 FPSOLVER-SERVER_TS1 0.245 Bilab-ENABLE_TS3 0.235 nFOLD_TS5 0.230 Bilab-ENABLE_TS5 0.226 3D-JIGSAW_POPULUS_TS4 0.226 Bilab-ENABLE_TS4 0.226 FOLDpro_TS4 0.226 Bilab-ENABLE_TS2 0.225 SP4_TS5 0.223 SPARKS2_TS5 0.217 3D-JIGSAW_TS5 0.215 nFOLD_TS1 0.204 FUGMOD_TS2 0.203 3D-JIGSAW_POPULUS_TS2 0.196 3D-JIGSAW_POPULUS_TS5 0.194 POMYSL_TS4 0.184 CaspIta-FOX_TS2 0.179 FUGMOD_TS5 0.168 END