# TARGET T0348
# Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0348.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 155
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.013	0.010	0.004	0.022	0.138	0.812
2	D	0.026	0.021	0.011	0.074	0.178	0.690
3	A	0.008	0.003	0.158	0.563	0.165	0.101
4	K	0.014	0.003	0.209	0.565	0.146	0.063
5	F	0.020	0.004	0.108	0.686	0.101	0.082
6	L	0.013	0.004	0.020	0.914	0.021	0.027
7	E	0.012	0.002	0.016	0.942	0.021	0.008
8	I	0.011	0.002	0.021	0.925	0.029	0.013
9	L	0.009	0.003	0.019	0.912	0.039	0.019
10	V	0.007	0.009	0.026	0.806	0.096	0.055
11	C	0.009	0.005	0.021	0.259	0.391	0.315
12	P	0.004	0.004	0.070	0.047	0.625	0.250
13	L	0.009	0.011	0.350	0.061	0.499	0.070
14	C	0.013	0.010	0.303	0.051	0.557	0.066
15	K	0.020	0.017	0.172	0.047	0.611	0.133
16	G	0.054	0.010	0.057	0.027	0.483	0.369
17	P	0.159	0.031	0.064	0.027	0.334	0.384
18	L	0.395	0.049	0.041	0.022	0.211	0.282
19	V	0.610	0.031	0.021	0.016	0.119	0.203
20	F	0.628	0.041	0.020	0.015	0.098	0.198
21	D	0.320	0.018	0.030	0.022	0.424	0.187
22	K	0.036	0.002	0.204	0.075	0.618	0.065
23	S	0.028	0.004	0.180	0.068	0.666	0.055
24	K	0.051	0.011	0.175	0.060	0.648	0.055
25	D	0.102	0.007	0.047	0.042	0.454	0.347
26	E	0.648	0.027	0.018	0.018	0.135	0.154
27	L	0.826	0.028	0.008	0.011	0.061	0.067
28	I	0.748	0.050	0.008	0.020	0.071	0.103
29	C	0.399	0.036	0.034	0.043	0.334	0.153
30	K	0.025	0.002	0.198	0.138	0.597	0.041
31	G	0.007	0.001	0.392	0.111	0.472	0.018
32	D	0.010	0.003	0.301	0.076	0.574	0.037
33	R	0.036	0.007	0.091	0.035	0.554	0.277
34	L	0.139	0.018	0.022	0.017	0.273	0.531
35	A	0.315	0.035	0.019	0.011	0.200	0.419
36	F	0.521	0.020	0.012	0.008	0.161	0.277
37	P	0.453	0.020	0.032	0.014	0.263	0.218
38	I	0.292	0.023	0.079	0.027	0.343	0.235
39	K	0.231	0.010	0.099	0.034	0.435	0.190
40	D	0.131	0.007	0.029	0.023	0.628	0.181
41	G	0.078	0.012	0.022	0.022	0.651	0.215
42	I	0.240	0.117	0.028	0.027	0.454	0.134
43	P	0.380	0.014	0.037	0.029	0.293	0.246
44	M	0.634	0.021	0.042	0.039	0.140	0.124
45	M	0.691	0.067	0.013	0.021	0.081	0.127
46	L	0.370	0.028	0.012	0.103	0.166	0.321
47	E	0.008	0.001	0.274	0.609	0.094	0.014
48	S	0.004	0.001	0.363	0.481	0.140	0.012
49	E	0.004	0.001	0.279	0.546	0.155	0.015
50	A	0.019	0.005	0.047	0.583	0.188	0.158
51	R	0.036	0.015	0.028	0.644	0.125	0.151
52	E	0.075	0.014	0.017	0.279	0.242	0.373
53	L	0.043	0.004	0.012	0.158	0.216	0.568
54	A	0.023	0.008	0.026	0.167	0.342	0.434
55	P	0.012	0.003	0.091	0.471	0.274	0.147
56	E	0.015	0.007	0.152	0.461	0.275	0.089
57	E	0.034	0.008	0.168	0.365	0.304	0.121
58	E	0.067	0.025	0.105	0.249	0.245	0.308
59	V	0.035	0.025	0.032	0.141	0.147	0.619
60	K	0.012	0.009	0.013	0.064	0.182	0.720