# TARGET T0348
# Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-ebghtl-stride-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    3	   13
#	    7	   13
#	    9	   13
#	   11	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0348.t04-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1)
# The weighting was determined by the posterior distribution
# after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp.
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 16.8038
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	M	0.005	0.005	0.004	0.037	0.090	0.859
2	D	0.007	0.008	0.004	0.105	0.081	0.796
3	A	0.002	0.003	0.024	0.764	0.064	0.142
4	K	0.005	0.002	0.045	0.830	0.070	0.047
5	F	0.014	0.004	0.108	0.736	0.108	0.030
6	L	0.051	0.006	0.099	0.577	0.176	0.091
7	E	0.082	0.006	0.069	0.612	0.132	0.100
8	I	0.176	0.012	0.043	0.633	0.072	0.065
9	L	0.190	0.026	0.025	0.582	0.070	0.108
10	V	0.198	0.045	0.045	0.278	0.148	0.286
11	C	0.119	0.019	0.068	0.090	0.320	0.383
12	P	0.080	0.006	0.112	0.049	0.427	0.325
13	L	0.078	0.026	0.073	0.022	0.390	0.410
14	C	0.092	0.041	0.033	0.024	0.474	0.336
15	K	0.091	0.025	0.029	0.044	0.486	0.326
16	G	0.106	0.015	0.032	0.031	0.438	0.378
17	P	0.258	0.025	0.074	0.053	0.338	0.252
18	L	0.445	0.027	0.088	0.045	0.198	0.197
19	V	0.512	0.032	0.038	0.054	0.158	0.205
20	F	0.556	0.050	0.025	0.043	0.115	0.211
21	D	0.364	0.030	0.014	0.028	0.367	0.197
22	K	0.060	0.006	0.209	0.072	0.611	0.044
23	S	0.044	0.007	0.168	0.044	0.688	0.049
24	K	0.023	0.005	0.174	0.037	0.724	0.036
25	D	0.073	0.005	0.054	0.016	0.597	0.255
26	E	0.467	0.061	0.045	0.034	0.173	0.220
27	L	0.697	0.033	0.029	0.029	0.102	0.110
28	I	0.742	0.026	0.020	0.021	0.058	0.132
29	C	0.420	0.015	0.022	0.033	0.197	0.313
30	K	0.108	0.008	0.068	0.046	0.441	0.329
31	G	0.058	0.008	0.083	0.031	0.536	0.284
32	D	0.060	0.015	0.159	0.032	0.548	0.187
33	R	0.124	0.014	0.220	0.045	0.406	0.191
34	L	0.269	0.029	0.092	0.053	0.264	0.293
35	A	0.411	0.024	0.052	0.059	0.179	0.275
36	F	0.481	0.013	0.018	0.024	0.133	0.329
37	P	0.570	0.024	0.012	0.012	0.118	0.265
38	I	0.520	0.082	0.023	0.014	0.302	0.060
39	K	0.311	0.017	0.020	0.010	0.615	0.026
40	D	0.053	0.003	0.022	0.016	0.877	0.030
41	G	0.070	0.009	0.013	0.014	0.836	0.058
42	I	0.352	0.042	0.009	0.014	0.321	0.263
43	P	0.599	0.020	0.029	0.034	0.120	0.199
44	M	0.692	0.021	0.068	0.058	0.071	0.090
45	M	0.687	0.024	0.053	0.066	0.066	0.105
46	L	0.548	0.021	0.045	0.126	0.087	0.174
47	E	0.105	0.004	0.127	0.496	0.131	0.135
48	S	0.037	0.003	0.184	0.536	0.162	0.078
49	E	0.008	0.003	0.231	0.630	0.104	0.024
50	A	0.008	0.006	0.202	0.627	0.111	0.045
51	R	0.007	0.003	0.120	0.706	0.108	0.056
52	E	0.012	0.006	0.047	0.550	0.146	0.239
53	L	0.010	0.012	0.018	0.308	0.160	0.492
54	A	0.011	0.009	0.009	0.032	0.375	0.564
55	P	0.004	0.002	0.203	0.159	0.393	0.238
56	E	0.008	0.002	0.442	0.198	0.283	0.067
57	E	0.032	0.008	0.373	0.184	0.312	0.092
58	E	0.040	0.016	0.071	0.228	0.184	0.460
59	V	0.045	0.036	0.013	0.141	0.113	0.652
60	K	0.020	0.005	0.001	0.014	0.055	0.904