PFRMAT RR
TARGET T0348
AUTHOR 5370-1100-4902
REMARK From group SAM-TO6 under the direction of
REMARK Kevin Karplus.
REMARK Residue-residue contact predictions
REMARK  by George Shackelford and Kevin Karplus
REMARK The value given is an approximation of the probability
REMARK as provided by the neural network.
REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which
REMARK is an approximation of the probability.
REMARK
METHOD The predictor is an artificial neural network.
METHOD NN: logseploglen.5xt04_ent.5xnearNS_str2.miRpz_entR_pplR.n45.net
METHOD Inputs may include separation and sequence length,
METHOD e-value statistic based on mutual information values,
METHOD a statistic based on propensity of residues in contact.
METHOD Other inputs are distributions from alignments and
METHOD secondary predictions from SAM-t04 and/or SAM-t06 of
METHOD the University of California, Santa Cruz
MODEL 1
MDAKFLEILVCPLCKGPLVFDKSKDELICKGDRLAFPIKDGIPMMLESEA
RELAPEEEVK
3 12 0 8 0.137143926204
3 14 0 8 0.149972227535
3 16 0 8 0.202656582602
3 17 0 8 0.233627325762
3 18 0 8 0.156133130258
3 19 0 8 0.148787476084
3 21 0 8 0.137185890217
3 24 0 8 0.131414374502
3 25 0 8 0.141285026139
3 26 0 8 0.138086327344
3 30 0 8 0.184856684231
3 31 0 8 0.220491938937
3 32 0 8 0.148509017204
3 33 0 8 0.138641618592
3 35 0 8 0.150554518885
3 36 0 8 0.133420839891
4 13 0 8 0.1757765175
4 14 0 8 0.150713591773
4 15 0 8 0.158822080146
4 16 0 8 0.171767165049
4 28 0 8 0.13227479943
5 14 0 8 0.19951188401
5 15 0 8 0.177585524314
5 16 0 8 0.209897489393
5 17 0 8 0.180964115353
5 18 0 8 0.264247718205
5 19 0 8 0.199173894785
5 20 0 8 0.247870042059
5 26 0 8 0.175373793092
5 27 0 8 0.260523655985
5 28 0 8 0.217016407774
5 29 0 8 0.211490820696
5 32 0 8 0.158670814516
5 33 0 8 0.133729226595
5 34 0 8 0.214561350334
5 35 0 8 0.195806038726
5 36 0 8 0.236019925135
5 37 0 8 0.155131198774
5 38 0 8 0.243580604216
5 40 0 8 0.198267927517
5 41 0 8 0.131424133575
5 42 0 8 0.216628972579
5 43 0 8 0.214721399129
5 44 0 8 0.215681366601
5 45 0 8 0.215060038959
5 46 0 8 0.351992762887
5 49 0 8 0.135932174652
5 50 0 8 0.200512188983
5 53 0 8 0.174384223099
5 58 0 8 0.144069289638
6 15 0 8 0.192749171791
6 16 0 8 0.209881549574
6 17 0 8 0.193595608714
6 18 0 8 0.253413846073
6 19 0 8 0.183935753052
6 20 0 8 0.226126827631
6 21 0 8 0.16353864008
6 26 0 8 0.205848775348
6 27 0 8 0.296827958175
6 28 0 8 0.233661157215
6 29 0 8 0.204292528523
6 32 0 8 0.143123635474
6 33 0 8 0.154097062348
6 34 0 8 0.210940083682
6 35 0 8 0.216067825888
6 36 0 8 0.232698912626
6 37 0 8 0.176582291619
6 38 0 8 0.2366711806
6 42 0 8 0.200722659655
6 43 0 8 0.214770519796
6 44 0 8 0.205357568679
6 45 0 8 0.220589854968
6 46 0 8 0.231353787078
6 49 0 8 0.151237328685
6 50 0 8 0.213631961291
6 53 0 8 0.162241984593
6 58 0 8 0.140277564513
7 16 0 8 0.194934878818
7 17 0 8 0.146908854551
7 18 0 8 0.17918731348
7 19 0 8 0.149116356841
7 27 0 8 0.133873010269
7 28 0 8 0.174024113309
7 34 0 8 0.162495720489
7 35 0 8 0.192410857263
7 36 0 8 0.145717922354
7 43 0 8 0.14732784408
8 17 0 8 0.196795283416
8 18 0 8 0.249714506838
8 19 0 8 0.184622791784
8 20 0 8 0.237527701899
8 26 0 8 0.155830598998
8 27 0 8 0.246591278206
8 28 0 8 0.23031802414
8 29 0 8 0.262177168237
8 32 0 8 0.146430659978
8 34 0 8 0.202090881676
8 35 0 8 0.179962509171
8 36 0 8 0.204729084384
8 37 0 8 0.140440866333
8 38 0 8 0.229942299834
8 42 0 8 0.206941791513
8 43 0 8 0.175805144114
8 44 0 8 0.213283237086
8 45 0 8 0.193957345016
8 46 0 8 0.261349598855
8 50 0 8 0.164323269541
8 53 0 8 0.168848551646
9 18 0 8 0.5999550663
9 19 0 8 0.250735305863
9 20 0 8 0.257933923339
9 21 0 8 0.183145593449
9 22 0 8 0.142161716188
9 26 0 8 0.198824194673
9 27 0 8 0.347329135707
9 28 0 8 0.244470306362
9 29 0 8 0.253396930346
9 31 0 8 0.170880065322
9 32 0 8 0.185074962162
9 33 0 8 0.182086083434
9 34 0 8 0.258625516305
9 35 0 8 0.221206953678
9 36 0 8 0.264670936666
9 37 0 8 0.217760374431
9 38 0 8 0.558581032679
9 39 0 8 0.131641435599
9 40 0 8 0.15262604476
9 42 0 8 0.406207524051
9 43 0 8 0.221250218901
9 44 0 8 0.230446843903
9 45 0 8 0.311042856805
9 46 0 8 0.348985670837
9 47 0 8 0.183145918752
9 49 0 8 0.155637694657
9 50 0 8 0.249951977612
9 53 0 8 0.210284273983
10 19 0 8 0.235721622807
10 20 0 8 0.253616184184
10 25 0 8 0.157212158419
10 26 0 8 0.203827020745
10 27 0 8 0.259647616541
10 28 0 8 0.232898648318
10 29 0 8 0.232865142168
10 30 0 8 0.191791481436
10 31 0 8 0.207322720659
10 32 0 8 0.197269574359
10 33 0 8 0.207486022479
10 34 0 8 0.219424621664
10 35 0 8 0.258207827985
10 36 0 8 0.253161411387
10 37 0 8 0.195464145872
10 38 0 8 0.265822573913
10 40 0 8 0.205476954671
10 41 0 8 0.178784589071
10 42 0 8 0.221497123446
10 43 0 8 0.210458961388
10 44 0 8 0.255272298856
10 45 0 8 0.216950696683
10 46 0 8 0.224830497447
10 47 0 8 0.190332174735
10 49 0 8 0.17612719352
10 50 0 8 0.199880126361
10 52 0 8 0.142147728184
10 53 0 8 0.219684863608
11 20 0 8 0.236032286628
11 21 0 8 0.195293687399
11 24 0 8 0.143365335179
11 25 0 8 0.134340469861
11 26 0 8 0.216241212083
11 27 0 8 0.256116783964
11 28 0 8 0.222718634071
11 29 0 8 0.391595180723
11 30 0 8 0.145648307634
11 31 0 8 0.13859444974
11 32 0 8 0.234865426811
11 33 0 8 0.196097509704
11 34 0 8 0.248708346421
11 35 0 8 0.227408844508
11 36 0 8 0.228147281024
11 37 0 8 0.197869757343
11 38 0 8 0.22261811562
11 40 0 8 0.15355640971
11 41 0 8 0.163086469702
11 42 0 8 0.21314726067
11 43 0 8 0.216823828735
11 44 0 8 0.209266727981
11 45 0 8 0.24063889434
11 46 0 8 0.211376964845
11 47 0 8 0.138146833596
11 49 0 8 0.150945207103
11 50 0 8 0.212804391909
11 53 0 8 0.161868862706
12 21 0 8 0.187139006081
12 22 0 8 0.141619111735
12 24 0 8 0.168283176023
12 25 0 8 0.168087669262
12 26 0 8 0.199319955576
12 27 0 8 0.222473681341
12 28 0 8 0.212334329897
12 29 0 8 0.226985951349
12 30 0 8 0.157044627668
12 31 0 8 0.164793331553
12 32 0 8 0.197975805935
12 33 0 8 0.203788309756
12 34 0 8 0.221704341094
12 35 0 8 0.218617546335
12 36 0 8 0.219520911183
12 37 0 8 0.206631452995
12 38 0 8 0.195377615426
12 40 0 8 0.178247189457
12 41 0 8 0.178551672531
12 42 0 8 0.188788614704
12 43 0 8 0.193507777058
12 44 0 8 0.190016306075
12 45 0 8 0.21156368844
12 46 0 8 0.186563871385
12 47 0 8 0.134894785202
12 49 0 8 0.168593839843
12 50 0 8 0.197536322352
12 53 0 8 0.154940896852
13 22 0 8 0.193738416481
13 23 0 8 0.197736383346
13 24 0 8 0.148697692614
13 25 0 8 0.212889295843
13 26 0 8 0.198631290332
13 27 0 8 0.216442248985
13 28 0 8 0.218687161055
13 29 0 8 0.205380665151
13 30 0 8 0.158766778733
13 31 0 8 0.143473660889
13 32 0 8 0.209694175375
13 33 0 8 0.198980990444
13 34 0 8 0.211613459712
13 35 0 8 0.194374057429
13 36 0 8 0.221687425367
13 37 0 8 0.148265365684
13 38 0 8 0.196168750936
13 39 0 8 0.144742990971
13 40 0 8 0.141302267168
13 41 0 8 0.136300742305
13 42 0 8 0.166999532634
13 43 0 8 0.162826227758
13 44 0 8 0.170201809755
13 45 0 8 0.179996340623
13 46 0 8 0.17687148548
13 47 0 8 0.194118695021
13 49 0 8 0.132598150046
13 50 0 8 0.171649080267
13 53 0 8 0.176202663684
14 23 0 8 0.15198487367
14 24 0 8 0.176039036561
14 25 0 8 0.175981783333
14 26 0 8 0.213805347486
14 27 0 8 0.229369116952
14 28 0 8 0.21786056758
14 29 0 8 0.771115892066
14 30 0 8 0.167409738998
14 31 0 8 0.240939148483
14 32 0 8 0.425713922901
14 33 0 8 0.227114771111
14 34 0 8 0.229469635403
14 35 0 8 0.211819701453
14 36 0 8 0.220668252854
14 37 0 8 0.195221470259
14 38 0 8 0.21978017722
14 39 0 8 0.142904706938
14 40 0 8 0.189988004764
14 41 0 8 0.162148622796
14 42 0 8 0.197048043404
14 43 0 8 0.18141758694
14 44 0 8 0.217217769978
14 45 0 8 0.205661075846
14 46 0 8 0.213378876
14 47 0 8 0.140937277841
14 49 0 8 0.16806327158
14 50 0 8 0.203393067303
14 53 0 8 0.178495395211
14 58 0 8 0.183168364619
15 24 0 8 0.216957528034
15 27 0 8 0.190361126651
15 28 0 8 0.222642513302
15 29 0 8 0.22770356851
15 31 0 8 0.146511334981
15 33 0 8 0.200562610859
15 34 0 8 0.203157873647
15 35 0 8 0.207936241042
15 36 0 8 0.222377391822
15 37 0 8 0.196216245091
15 38 0 8 0.190795730698
15 40 0 8 0.169321216077
15 42 0 8 0.134016468641
15 43 0 8 0.174611284195
15 44 0 8 0.142727417114
15 45 0 8 0.14386207199
15 46 0 8 0.135761390876
15 49 0 8 0.160994775076
15 50 0 8 0.170330629518
16 25 0 8 0.190093728054
16 27 0 8 0.220003009384
16 28 0 8 0.231524245551
16 29 0 8 0.235787333898
16 30 0 8 0.208585544693
16 31 0 8 0.176017891903
16 32 0 8 0.189441496681
16 33 0 8 0.202421714247
16 34 0 8 0.234406750384
16 35 0 8 0.202783450549
16 36 0 8 0.198589001016
16 37 0 8 0.19401004401
16 38 0 8 0.200893768733
16 40 0 8 0.140347179233
16 42 0 8 0.16853040587
16 43 0 8 0.202687486333
16 44 0 8 0.2056682325
16 45 0 8 0.162729612936
16 46 0 8 0.19174105956
16 49 0 8 0.144747870507
16 50 0 8 0.202882667791
16 53 0 8 0.164920850105
17 27 0 8 0.141829582407
17 29 0 8 0.261915950386
17 30 0 8 0.200529104709
17 31 0 8 0.159278479455
17 32 0 8 0.175420311339
17 33 0 8 0.148245196933
17 34 0 8 0.168109464525
17 35 0 8 0.17966258033
17 36 0 8 0.156143539936
17 37 0 8 0.149033404721
17 40 0 8 0.16267528743
17 43 0 8 0.134254915322
18 27 0 8 0.367849181895
18 28 0 8 0.297592074778
18 29 0 8 0.328040114894
18 30 0 8 0.234000122347
18 31 0 8 0.220091166343
18 32 0 8 0.212846355922
18 33 0 8 0.214973833815
18 34 0 8 0.264843672257
18 35 0 8 0.26193254081
18 36 0 8 0.256046843942
18 37 0 8 0.248539189158
18 38 0 8 0.559648609112
18 39 0 8 0.141100579661
18 40 0 8 0.19189232519
18 41 0 8 0.188431757938
18 42 0 8 0.304411620314
18 43 0 8 0.229243224911
18 44 0 8 0.257549415867
18 45 0 8 0.573472634564
18 46 0 8 0.327903276596
18 47 0 8 0.192690942656
18 49 0 8 0.179136240998
18 50 0 8 0.242435539662
18 51 0 8 0.154224906203
18 53 0 8 0.220748277252
18 58 0 8 0.135004737423
19 28 0 8 0.271365892807
19 29 0 8 0.235666646696
19 30 0 8 0.238108692039
19 31 0 8 0.144221856478
19 33 0 8 0.188771698978
19 34 0 8 0.20658526005
19 35 0 8 0.250467907266
19 36 0 8 0.221450605198
19 37 0 8 0.182246782835
19 38 0 8 0.149960516647
19 40 0 8 0.143743011301
19 42 0 8 0.142329897544
19 43 0 8 0.174791501742
19 44 0 8 0.188842289605
19 45 0 8 0.189078784472
19 46 0 8 0.131305072886
19 50 0 8 0.134826471692
19 53 0 8 0.135923066184
20 29 0 8 0.251328006891
20 30 0 8 0.22039727593
20 31 0 8 0.210503527821
20 32 0 8 0.205582352658
20 33 0 8 0.210933252331
20 34 0 8 0.240183145636
20 35 0 8 0.239973000266
20 36 0 8 0.243622568229
20 37 0 8 0.200734695845
20 38 0 8 0.25754453633
20 40 0 8 0.198936098709
20 41 0 8 0.168835539549
20 42 0 8 0.216245766317
20 43 0 8 0.201167022774
20 44 0 8 0.23300990175
20 45 0 8 0.22091808512
20 46 0 8 0.239886469819
20 47 0 8 0.155184873675
20 50 0 8 0.197715563991
20 53 0 8 0.180995344386
21 30 0 8 0.199800752568
21 31 0 8 0.150376253153
21 32 0 8 0.234210593019
21 34 0 8 0.216319284666
21 35 0 8 0.263401281282
21 36 0 8 0.18682964347
21 37 0 8 0.14264121197
21 38 0 8 0.162916661833
21 43 0 8 0.142703670037
21 44 0 8 0.151980970041
21 46 0 8 0.133815431739
21 50 0 8 0.141617810525
22 31 0 8 0.154219701365
22 32 0 8 0.135872969609
22 35 0 8 0.185301372653
22 36 0 8 0.156708590257
22 37 0 8 0.146682118757
22 38 0 8 0.174452861912
22 44 0 8 0.131845400222
23 33 0 8 0.193250137533
23 34 0 8 0.159599552954
23 35 0 8 0.150177493368
23 45 0 8 0.131369157465
23 49 0 8 0.188188431721
23 50 0 8 0.193194510817
24 33 0 8 0.208177615445
24 34 0 8 0.212455667704
24 35 0 8 0.211146325423
24 36 0 8 0.203822141209
24 37 0 8 0.173064145838
24 40 0 8 0.131917617362
24 42 0 8 0.134887953851
24 43 0 8 0.137036901704
24 44 0 8 0.193195812027
24 46 0 8 0.19741563515
24 49 0 8 0.173247616408
25 35 0 8 0.224871810856
25 36 0 8 0.200482911764
25 39 0 8 0.179664206842
25 42 0 8 0.192334411192
25 43 0 8 0.151186906809
25 45 0 8 0.185066829601
25 47 0 8 0.131008722372
25 49 0 8 0.158400488196
25 53 0 8 0.164916621174
25 54 0 8 0.138375846507
25 57 0 8 0.199406486023
26 35 0 8 0.334779682672
26 36 0 8 0.231556775794
26 37 0 8 0.204623035792
26 38 0 8 0.203200813567
26 39 0 8 0.13473115808
26 41 0 8 0.13992103305
26 42 0 8 0.187415187844
26 43 0 8 0.193646355893
26 44 0 8 0.223795710417
26 45 0 8 0.197851865709
26 46 0 8 0.18232778314
26 47 0 8 0.140208275095
26 49 0 8 0.136142645324
26 50 0 8 0.187350777963
26 51 0 8 0.167238955222
26 53 0 8 0.206568669626
27 36 0 8 0.440272680106
27 37 0 8 0.248320911227
27 38 0 8 0.499230927945
27 39 0 8 0.163414049249
27 40 0 8 0.196108244684
27 41 0 8 0.237745329225
27 42 0 8 0.318932174746
27 43 0 8 0.248663454686
27 44 0 8 0.367119283418
27 45 0 8 0.418112645985
27 46 0 8 0.464737955527
27 47 0 8 0.220867663244
27 49 0 8 0.196054569783
27 50 0 8 0.254172126037
27 51 0 8 0.153747687539
27 53 0 8 0.22486563011
27 58 0 8 0.151037592993
28 37 0 8 0.219037186469
28 38 0 8 0.232162814222
28 39 0 8 0.13351029806
28 40 0 8 0.175794083831
28 41 0 8 0.208459002047
28 42 0 8 0.216648816028
28 43 0 8 0.256568954342
28 44 0 8 0.246989123078
28 45 0 8 0.236267480285
28 46 0 8 0.220340022702
28 47 0 8 0.170615269144
28 49 0 8 0.180282606762
28 50 0 8 0.208655484715
28 53 0 8 0.206377066495
28 58 0 8 0.179847026808
29 38 0 8 0.27310160396
29 39 0 8 0.15745450873
29 40 0 8 0.186550208683
29 41 0 8 0.183416245071
29 42 0 8 0.222528332149
29 43 0 8 0.226454081876
29 44 0 8 0.252601240602
29 45 0 8 0.242610877672
29 46 0 8 0.251245380074
29 47 0 8 0.192773894775
29 49 0 8 0.175033852052
29 50 0 8 0.219304259765
29 51 0 8 0.139748297459
29 53 0 8 0.183049629232
29 58 0 8 0.139694297256
30 42 0 8 0.181621551564
30 43 0 8 0.164586764509
30 44 0 8 0.211050686508
30 53 0 8 0.149302104529
31 42 0 8 0.146689600713
31 43 0 8 0.137249974796
31 44 0 8 0.156210226934
31 45 0 8 0.13886087243
31 46 0 8 0.133449141203
31 50 0 8 0.133296574363
32 41 0 8 0.173071627794
32 42 0 8 0.19442512991
32 43 0 8 0.184216814351
32 44 0 8 0.20560805155
32 45 0 8 0.19627512483
32 46 0 8 0.211505459305
32 47 0 8 0.190739453377
32 50 0 8 0.189199146371
32 53 0 8 0.164253329519
33 42 0 8 0.198237349089
33 43 0 8 0.196013906979
33 44 0 8 0.234256460662
33 45 0 8 0.206659103702
33 46 0 8 0.195152180842
33 47 0 8 0.154749293721
33 49 0 8 0.178821022943
33 50 0 8 0.195745207172
34 43 0 8 0.227270265673
34 44 0 8 0.255885819239
34 45 0 8 0.257456054069
34 46 0 8 0.248566189259
34 47 0 8 0.18548028899
34 49 0 8 0.198010938597
34 50 0 8 0.274460190083
34 51 0 8 0.13769498852
34 53 0 8 0.21520870217
34 58 0 8 0.144941750756
35 44 0 8 0.275010603306
35 45 0 8 0.261321297544
35 46 0 8 0.234720992532
35 47 0 8 0.203390139582
35 49 0 8 0.198876243062
35 50 0 8 0.230212300851
35 51 0 8 0.174993839853
35 53 0 8 0.246180421237
35 58 0 8 0.134227264615
36 45 0 8 0.390248402551
36 46 0 8 0.482977096589
36 47 0 8 0.21848970248
36 48 0 8 0.131590688419
36 49 0 8 0.206955128913
36 50 0 8 0.250708305762
36 51 0 8 0.188685819136
36 52 0 8 0.162672359708
36 53 0 8 0.223984060524
36 57 0 8 0.147542868987
36 58 0 8 0.196833994405
37 46 0 8 0.23552123651
37 47 0 8 0.217704097111
37 49 0 8 0.176138253802
37 50 0 8 0.197878540508
37 53 0 8 0.178672359733
38 47 0 8 0.238852008092
38 49 0 8 0.210453431246
38 50 0 8 0.257926116081
38 51 0 8 0.171705032285
38 52 0 8 0.139013764572
38 53 0 8 0.23759211178
38 54 0 8 0.133637816612
38 57 0 8 0.144822364764
38 58 0 8 0.17736008973
39 48 0 8 0.142082667698
39 50 0 8 0.181741262858
39 53 0 8 0.147081264838
40 50 0 8 0.185650096859
40 53 0 8 0.153052516245
41 50 0 8 0.225906923188
41 54 0 8 0.222386174987
41 58 0 8 0.17102840323
42 51 0 8 0.193882525457
42 52 0 8 0.140727457774
42 53 0 8 0.231079231827
42 58 0 8 0.165667744485
43 52 0 8 0.196018786516
43 53 0 8 0.238844851438
43 54 0 8 0.187686490071
43 55 0 8 0.13678869595
43 57 0 8 0.173148073865
43 58 0 8 0.240904341123
44 53 0 8 0.211360049119
44 58 0 8 0.157511111352
45 54 0 8 0.139264572746
45 58 0 8 0.206310054194
46 58 0 8 0.169035275241
47 58 0 8 0.147655423628
END