# TARGET T0344
# Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    6 (1 EBGHTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0344.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 4
#
Pos	AA	E	B	G	H	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	L	0.355	0.010	0.013	0.024	0.163	0.435
2	I	0.655	0.026	0.005	0.012	0.091	0.211
3	I	0.741	0.025	0.003	0.007	0.073	0.151
4	G	0.434	0.014	0.009	0.006	0.174	0.362
5	L	0.200	0.010	0.010	0.004	0.190	0.585
6	P	0.184	0.007	0.054	0.005	0.242	0.508
7	R	0.337	0.033	0.083	0.003	0.240	0.304
8	Y	0.563	0.031	0.048	0.002	0.151	0.206
9	M	0.731	0.003	0.015	0.001	0.103	0.146
10	E	0.893	0.004	0.003	0.001	0.039	0.060
11	V	0.951	0.006	0.001	0.001	0.013	0.028
12	N	0.965	0.002	0.001	0.001	0.011	0.020
13	I	0.943	0.006	0.001	0.001	0.019	0.030
14	K	0.608	0.015	0.003	0.002	0.311	0.061
15	D	0.053	0.001	0.010	0.004	0.868	0.063
16	G	0.042	0.001	0.009	0.003	0.884	0.059
17	K	0.489	0.040	0.006	0.004	0.389	0.073
18	I	0.761	0.046	0.001	0.003	0.056	0.134
19	I	0.818	0.016	0.001	0.004	0.049	0.111
20	G	0.624	0.013	0.008	0.005	0.156	0.193
21	R	0.458	0.019	0.011	0.009	0.208	0.296
22	S	0.358	0.035	0.008	0.010	0.178	0.411
23	L	0.177	0.036	0.006	0.017	0.165	0.600
24	D	0.182	0.041	0.010	0.019	0.340	0.409
25	P	0.085	0.030	0.103	0.106	0.533	0.142
26	R	0.039	0.011	0.112	0.046	0.726	0.066
27	E	0.105	0.016	0.129	0.028	0.674	0.047
28	G	0.093	0.018	0.102	0.017	0.602	0.168
29	G	0.209	0.020	0.013	0.003	0.379	0.376
30	L	0.538	0.022	0.008	0.001	0.172	0.258
31	Y	0.746	0.009	0.004	0.001	0.104	0.137
32	G	0.853	0.008	0.002	0.001	0.070	0.066
33	S	0.871	0.006	0.001	0.001	0.054	0.068
34	A	0.928	0.001	0.001	0.001	0.024	0.047
35	E	0.963	0.004	0.001	0.001	0.010	0.023
36	V	0.935	0.004	0.001	0.001	0.020	0.040
37	S	0.878	0.008	0.003	0.001	0.044	0.066
38	V	0.651	0.031	0.005	0.001	0.163	0.149
39	P	0.138	0.016	0.011	0.002	0.772	0.061
40	E	0.028	0.007	0.030	0.006	0.880	0.049
41	G	0.072	0.002	0.010	0.002	0.815	0.100
42	V	0.583	0.021	0.004	0.002	0.281	0.110
43	K	0.820	0.032	0.001	0.001	0.025	0.121
44	W	0.927	0.007	0.001	0.001	0.011	0.053
45	E	0.936	0.002	0.002	0.001	0.012	0.048
46	I	0.895	0.019	0.002	0.001	0.019	0.065
47	Y	0.460	0.027	0.002	0.003	0.253	0.255
48	P	0.168	0.034	0.001	0.003	0.427	0.366
49	N	0.024	0.018	0.001	0.003	0.600	0.356
50	P	0.027	0.007	0.007	0.117	0.699	0.142
51	V	0.115	0.017	0.026	0.272	0.502	0.068
52	A	0.179	0.028	0.042	0.290	0.408	0.054
53	R	0.265	0.015	0.068	0.286	0.299	0.067
54	R	0.427	0.023	0.037	0.186	0.224	0.102
55	F	0.586	0.005	0.017	0.144	0.145	0.103
56	M	0.778	0.002	0.003	0.056	0.056	0.105
57	I	0.942	0.004	0.001	0.021	0.008	0.026
58	F	0.957	0.002	0.001	0.013	0.005	0.023
59	E	0.928	0.002	0.001	0.021	0.009	0.039
60	I	0.898	0.002	0.002	0.015	0.025	0.058
61	F	0.542	0.005	0.009	0.025	0.117	0.302
62	S	0.210	0.011	0.013	0.025	0.201	0.539
63	K	0.080	0.017	0.010	0.020	0.135	0.738
64	R	0.002	0.002	0.001	0.002	0.021	0.973