# TARGET T0344
# Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    7 (1 EBGHSTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0344.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 4
#
Pos	AA	E	B	G	H	S	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	L	0.165	0.019	0.008	0.005	0.030	0.011	0.762
2	I	0.537	0.076	0.009	0.003	0.025	0.037	0.312
3	I	0.498	0.050	0.006	0.002	0.074	0.074	0.297
4	G	0.204	0.034	0.004	0.002	0.261	0.104	0.391
5	L	0.057	0.019	0.007	0.004	0.371	0.036	0.505
6	P	0.050	0.012	0.035	0.003	0.268	0.088	0.544
7	R	0.108	0.021	0.105	0.004	0.364	0.267	0.131
8	Y	0.477	0.101	0.071	0.003	0.043	0.135	0.170
9	M	0.592	0.019	0.009	0.001	0.034	0.038	0.306
10	E	0.842	0.005	0.001	0.001	0.046	0.011	0.094
11	V	0.880	0.006	0.001	0.001	0.019	0.001	0.094
12	N	0.891	0.010	0.001	0.001	0.005	0.001	0.094
13	I	0.609	0.036	0.001	0.001	0.007	0.002	0.346
14	K	0.356	0.028	0.004	0.001	0.062	0.038	0.512
15	D	0.008	0.001	0.004	0.001	0.192	0.782	0.012
16	G	0.011	0.001	0.008	0.001	0.180	0.769	0.031
17	K	0.443	0.078	0.003	0.001	0.063	0.015	0.397
18	I	0.768	0.123	0.001	0.001	0.008	0.005	0.095
19	I	0.793	0.041	0.002	0.001	0.022	0.016	0.124
20	G	0.498	0.011	0.007	0.003	0.145	0.074	0.262
21	R	0.354	0.011	0.010	0.004	0.334	0.089	0.197
22	S	0.388	0.036	0.015	0.006	0.194	0.076	0.286
23	L	0.197	0.092	0.014	0.010	0.198	0.043	0.447
24	D	0.071	0.023	0.009	0.006	0.103	0.021	0.767
25	P	0.009	0.005	0.343	0.081	0.071	0.444	0.048
26	R	0.009	0.005	0.316	0.064	0.105	0.448	0.053
27	E	0.012	0.012	0.411	0.048	0.113	0.289	0.115
28	G	0.038	0.010	0.122	0.030	0.192	0.388	0.218
29	G	0.116	0.016	0.134	0.026	0.198	0.295	0.215
30	L	0.332	0.058	0.094	0.027	0.153	0.097	0.240
31	Y	0.606	0.028	0.031	0.018	0.064	0.068	0.186
32	G	0.756	0.010	0.015	0.008	0.054	0.040	0.117
33	S	0.893	0.006	0.004	0.002	0.020	0.008	0.067
34	A	0.898	0.004	0.001	0.001	0.009	0.002	0.084
35	E	0.936	0.006	0.001	0.001	0.010	0.001	0.046
36	V	0.851	0.005	0.001	0.001	0.010	0.002	0.129
37	S	0.818	0.019	0.003	0.001	0.042	0.010	0.107
38	V	0.420	0.039	0.004	0.003	0.051	0.012	0.471
39	P	0.119	0.009	0.024	0.002	0.144	0.217	0.484
40	E	0.015	0.004	0.015	0.002	0.141	0.789	0.033
41	G	0.052	0.006	0.020	0.001	0.168	0.597	0.157
42	V	0.116	0.006	0.001	0.001	0.024	0.002	0.850
43	K	0.779	0.017	0.001	0.001	0.030	0.002	0.171
44	W	0.936	0.009	0.001	0.001	0.005	0.002	0.047
45	E	0.961	0.004	0.001	0.001	0.004	0.002	0.028
46	I	0.887	0.004	0.001	0.002	0.015	0.003	0.088
47	Y	0.506	0.005	0.002	0.002	0.086	0.014	0.386
48	P	0.156	0.021	0.003	0.004	0.363	0.029	0.424
49	N	0.051	0.007	0.004	0.006	0.149	0.016	0.768
50	P	0.036	0.004	0.125	0.172	0.187	0.204	0.271
51	V	0.134	0.015	0.130	0.191	0.162	0.214	0.154
52	A	0.291	0.018	0.141	0.137	0.115	0.092	0.206
53	R	0.514	0.020	0.054	0.081	0.078	0.050	0.203
54	R	0.617	0.010	0.035	0.035	0.087	0.055	0.160
55	F	0.648	0.008	0.037	0.036	0.087	0.043	0.141
56	M	0.778	0.012	0.014	0.032	0.024	0.014	0.126
57	I	0.877	0.005	0.007	0.021	0.014	0.013	0.063
58	F	0.892	0.002	0.004	0.022	0.011	0.009	0.059
59	E	0.851	0.010	0.004	0.027	0.014	0.009	0.086
60	I	0.760	0.011	0.004	0.024	0.028	0.020	0.154
61	F	0.672	0.011	0.006	0.016	0.062	0.043	0.190
62	S	0.412	0.012	0.013	0.026	0.147	0.094	0.295
63	K	0.176	0.022	0.010	0.022	0.016	0.083	0.670
64	R	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.998