(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
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Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0342 CESG35223, Homo sapiens, 188 res
    • gi|8655989|gb|AAF78262.1|_1:166 Contains similarity to cation transport protein CHAC from Escherichia coli gi|2506988. ESTs gb|AA605474, gb|AI995104, gb|R90162 come from this gene. [Arabidopsis thaliana]
    • gi|49259570|pdb|1VKB|A_13:156 Chain A, Crystal Structure Of Hypothetical Protein From Mus Musculus At 1.90 A Resolution [Taxonomy]
    • gi|90109757|pdb|2G0Q|A_2:138 Chain A, Solution Structure Of At5g39720.1 From Arabidopsis Thaliana [Taxonomy]
    • gi|58177343|pdb|1XHS|A_1:104 Chain A, Solution Structure Of The Hypothetical Protein Ytfp From Escherichia Coli. Northeast Structural Genomics Target Er111 [Taxonomy]
    • gi|56966298|pdb|1V30|A_4:87 Chain A, Crystal Structure Of Uncharacterized Protein Ph0828 From Pyrococcus Horikoshii [Taxonomy]
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   7 H.....L.R.N.....P.S.....AV.FC..C.V..A...C.L..Q...D...F.K..L.....D
   8 -.....K.V.D.....F.P.....YQ.DK..L.V..G...Y.I..T...G...Y.N..R.....R
   9 H.....L.R.N.....P.S.....AV.FC..C.V..A...R.L..Q...D...F.K..L.....D
  10 -.....N.P.A.....L.E.....FT.ES..C.T..G...T.L..V...G...W.H..R.....A
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  18 -.....N.P.A.....L.E.....FT.ES..C.T..G...T.L..V...G...W.H..R.....A
  19 Q.....M.R.N.....P.S.....AA.VH..C.V..A...R.L..K...D...Y.K..L.....V
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  23 -.....N.P.A.....L.E.....FT.ES..C.T..G...T.L..V...G...W.H..R.....A
  24 -.....N.P.A.....L.E.....FT.ES..C.T..G...T.L..V...G...W.H..R.....A
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 172 -.....N.P.G.....F.P.....VS.ET..R.I..A...R.L..H...D...W.H..R.....S
 173 -.....K.Q.N.....F.E.....FD.AE..Y.E..A...Y.I..K...G...Y.K..R.....V
 174 G.....H.R.T.....V.D.....FK.EA..R.R..A...R.L..Q...G...Y.R..L.....T
 175 K.....Q.R.T.....P.H.....SP.VI..G.T..G...W.I..R...G...W.R..L.....T
 176 -.....R.P.E.....F.E.....SA.ED..R.F..A...T.L..H...G...Y.H..R.....A
 177 K.....R.S.L.....G.Enth..PY.II..G.P..G...V.L..K...G...Y.R..L.....G
 178 -.....K.V.D.....F.P.....YQ.DK..L.V..G...Y.I..T...N...Y.S..R.....R
 179 -.....N.P.G.....F.D.....FD.EK..L.I..G...Y.I..K...D...Y.K..R.....V
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             150                        160                            
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  18 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
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  20 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
  21 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
  22 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
  23 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
  24 .S.GP....LG.T...N..A..Q..YLF..S.....Le.Q...E....LI...K...L.....G.
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 121 .K.GP....SG.P...N..R..D..YLF..N.....Le.E...A....LA...Q...L.....G.
 122 .H.GP....SG.S...N..A..D..YLL..S.....La.A...A....LR...E...L.....G.
 123 .S.GD....SG.P...N..S..E..YLF..N.....La.A...E....LR...K...I.....Q.
 124 .H.GQ....SG.P...N..Q..D..YVL..S.....Tv.A...A....LE...T...Q.....G.
 125 .V.GL....YG.P...A..R..E..YLQ..R.....Tl.I...G....LA...S...N.....G.
 126 .V.GL....YG.P...A..R..E..YLQ..Q.....Tl.L...G....LA...T...N.....G.
 127 .A.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.D...A....LR...A...S.....G.
 128 .S.GK....LG.S...C..A..D..YLM..K.....Tv.D...G....LI...A...E.....G.
 129 .V.GG....RG.P...N..T..E..YLY..N.....Ta.E...H....LS...E...I.....G.
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 131 .T.GL....SG.P...N..R..E..YLY..N.....Ld.R...A....LR...D...M.....G.
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 134 .C.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.H...A....LR...E...S.....G.
 135 .H.GP....CG.N...N..R..E..YIF..K.....Me.K...A....LY...D...I.....D.
 136 .H.GP....CG.N...N..R..E..YIF..K.....Me.K...A....LY...D...I.....D.
 137 .I.GP....SG.R...N..I..D..YLL..K.....La.N...S....LH...D...M.....G.
 138 .E.GP....SG.P...N..K..E..YLF..K.....Le.D...A....LN...K...I.....G.
 139 .A.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.D...A....LR...A...S.....G.
 140 .V.GL....SG.P...N..I..D..YLR..D.....Lv.M...H....LH...E...D.....G.
 141 .A.IE....SS.V...P..E..D..YVQ..R.....L..R...S....IK...H...N.....G.
 142 .H.GR....SG.A...N..R..D..YVL..A.....Tv.R...S....LE...A...Q.....G.
 143 .A.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.D...A....LR...A...S.....G.
 144 .A.TE....SG.V...P..D..E..YIE..W.....L..R...G....IK...H...N.....G.
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 146 .R.GS....SG.H...N..I..E..YLV..R.....L..A...E....FM...R...Mccp..E.
 147 .H.GK....SG.P...N..T..D..YVV..A.....Tv.K...A....LE...G...L.....G.
 148 .A.GP....SG.K...N..T..E..YLF..E.....La.N...S....MR...S...Lvp...E.
 149 .V.GG....RG.P...N..S..E..YLF..N.....Ta.G...H....LD...E...I.....G.
 150 .N.GP....CG.N...N..R..D..YLF..L.....Le.K...A....MH...D...I.....G.
 151 .V.GP....LG.R...A..S..D..YLL..D.....Tv.S...A....LE...S...M.....N.
 152 .N.GP....CG.N...N..R..D..YLF..L.....Le.K...A....MH...D...I.....G.
 153 .A.EI....AG.A...P..S..D..YVH..D.....L..R...T....RP...A...R.....N.
 154 .N.GP....NG.N...N..R..D..YLF..S.....Me.K...A....LS...N...I.....C.
 155 .V.GR....SG.A...C..L..D..YVR..E.....Th.R...A....LN...E...H.....G.
 156 .H.GG....RG.P...N..T..D..YLV..N.....Th.D...H....LG...Q...L.....G.
 157 .A.GE....KG.P...N..C..D..YLW..N.....Ta.A...R....LR...E...L.....C.
 158 .C.GL....YG.P...A..R..E..YLQ..Q.....Tl.L...G....LT...T...N.....G.
 159 .V.GR....SG.A...C..L..D..YVR..E.....Th.R...A....LN...E...H.....G.
 160 .V.GR....SG.A...C..L..D..YVR..E.....Th.R...A....LN...E...H.....G.
 161 .A.IT....CG.L...S..E..E..YCW..N.....Lf.N...H....MY...K...L.....Q.
 162 .S.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.E...A....LR...D...S.....G.
 163 .S.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.E...A....LR...D...S.....G.
 164 .A.IE....SG.L...P..S..D..YVE..K.....L..K...T....IK...H...N.....G.
 165 .W.GR....TG.H...N..A..E..YLF..R.....L..V...D....FM...H...Ktvp..D.
 166 .A.EI....AG.A...P..A..D..YVH..D.....L..R...T....RP...A...R.....N.
 167 .A.KE....TG.L...P..D..D..YVS..L.....L..K...R....IK...H...N.....G.
 168 .S.GR....YG.T...T..L..D..YVS..R.....Tv.A...A....LR...D...S.....G.
 169 .E.GL....SG.P...N..S..E..YLF..K.....La.E...A....LR...K...L.....E.
 170 .R.GK....SG.D...N..F..V..YLF..E.....La.K...C....LR...H...Lsp...E.
 171 .F.GP....CG.N...N..R..E..YLF..L.....Le.K...A....LH...D...I.....N.
 172 .V.GG....RG.P...N..D..E..YLY..N.....Ta.A...H....LT...E...L.....G.
 173 .A.GV....SG.S...N..R..E..YLF..F.....La.D...C....LR...A...M.....G.
 174 .A.RE....HG.L...P..P..D..YIH..Q.....I..E...A....M-...G...L.....G.
 175 .A.EK....AG.A...P..S..E..YVT..E.....L..R...G....-R...P...I.....-.
 176 .C.GR....YG.T...T..R..D..YAQ..L.....Ty.D...K....LR...T...L.....G.
 177 .A.VT....CG.L...P..E..E..YCW..H.....Lf.N...H....MH...K...L.....Q.
 178 .A.GP....SG.R...N..T..E..YLF..E.....La.D...S....VR...K...Lvp...E.
 179 .S.GP....CG.N...N..R..E..YLF..K.....Le.K...A....MF...D...I.....E.
 180 .S.GT....LG.S...A..R..D..YLF..R.....Tc.E...G....LR...A...S.....G.
 181 .A.EI....AG.A...P..S..D..YVH..D.....L..R...T....RP...A...R.....N.
 182 .K.GP....SG.E...N..R..E..YLY..R.....Ly.E...S....LI...E...Lap...E.
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  25 Y..A....GpvP....I.LEE..I..EAT..I.K...A...N.K..I...N...F...A.....
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  31 A..E....D..A....H.VAT..L..SDA..V.R...R...L.G..P...-...-...-.....
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  40 D..A....D..E....H.LFS..L..EKL..V.K...E...R.L..-...-...-...-.....
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  42 L..H....D..P....S.LAW..L..HDR..V.K...T...L.C..-...-...-...-.....
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  44 F..R....D..P....N.LHR..L..AAQ..L.H...N...E.-..-...-...-...-.....
  45 A..Q....D..E....H.LAA..I..VDA..V.G...T...M.L..-...P...C...Fcpte.
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