# TARGET T0342
# Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net
# This is a 4-layer network, with 
#	window	units
#	    5	   15
#	    7	   15
#	    9	   15
#	   13	    7 (1 EBGHSTL )
# The input amino acid frequencies were determined from
# alignment T0342.t2k-thin90.a2m.gz
# with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1)
# Counts were regularized to probabilities using
# /projects/compbio/lib/recode3.20comp
# Total sequence weight for alignment was 9
#
Pos	AA	E	B	G	H	S	T	C
10N	1S	5N	5N	5N	5N	5N	5N	5N
1	K	0.361	0.008	0.005	0.010	0.095	0.017	0.504
2	K	0.655	0.008	0.002	0.006	0.055	0.008	0.266
3	I	0.843	0.024	0.001	0.005	0.012	0.003	0.112
4	I	0.752	0.010	0.002	0.019	0.026	0.004	0.187
5	C	0.749	0.007	0.002	0.036	0.025	0.010	0.170
6	M	0.625	0.006	0.003	0.081	0.038	0.033	0.213
7	G	0.442	0.007	0.008	0.147	0.127	0.053	0.216
8	A	0.277	0.010	0.019	0.270	0.107	0.048	0.268
9	K	0.084	0.031	0.042	0.425	0.125	0.103	0.190
10	E	0.026	0.014	0.030	0.468	0.149	0.180	0.133
11	N	0.003	0.003	0.007	0.108	0.111	0.695	0.074
12	G	0.001	0.004	0.003	0.016	0.074	0.714	0.189
13	L	0.001	0.006	0.001	0.007	0.109	0.006	0.872
14	P	0.004	0.007	0.004	0.100	0.070	0.023	0.792
15	L	0.002	0.002	0.038	0.842	0.024	0.049	0.045
16	E	0.001	0.002	0.032	0.915	0.009	0.022	0.018
17	Y	0.002	0.001	0.014	0.960	0.006	0.010	0.009
18	Q	0.003	0.001	0.007	0.974	0.004	0.007	0.006
19	E	0.002	0.001	0.007	0.970	0.003	0.012	0.005
20	K	0.001	0.001	0.009	0.949	0.003	0.034	0.004
21	L	0.002	0.002	0.023	0.893	0.009	0.059	0.013
22	K	0.003	0.001	0.040	0.762	0.011	0.171	0.013
23	A	0.005	0.001	0.054	0.500	0.054	0.327	0.059
24	I	0.013	0.015	0.047	0.292	0.226	0.158	0.248
25	E	0.042	0.022	0.029	0.084	0.246	0.104	0.473
26	P	0.054	0.024	0.052	0.055	0.233	0.159	0.422
27	N	0.075	0.046	0.053	0.041	0.236	0.138	0.412
28	D	0.055	0.012	0.051	0.023	0.170	0.109	0.580
29	Y	0.046	0.013	0.045	0.042	0.151	0.505	0.199
30	T	0.042	0.012	0.025	0.037	0.195	0.562	0.126
31	G	0.040	0.003	0.005	0.023	0.601	0.090	0.238
32	K	0.167	0.065	0.007	0.045	0.121	0.021	0.573
33	V	0.236	0.174	0.027	0.177	0.056	0.019	0.310
34	S	0.113	0.007	0.022	0.323	0.050	0.020	0.465
35	E	0.005	0.001	0.061	0.876	0.010	0.033	0.015
36	E	0.001	0.001	0.020	0.921	0.011	0.033	0.012
37	I	0.001	0.001	0.012	0.952	0.006	0.017	0.011
38	E	0.001	0.001	0.007	0.973	0.006	0.007	0.006
39	D	0.002	0.001	0.006	0.974	0.005	0.007	0.006
40	I	0.001	0.001	0.006	0.981	0.003	0.005	0.004
41	I	0.001	0.001	0.003	0.981	0.003	0.008	0.003
42	K	0.001	0.001	0.003	0.940	0.003	0.049	0.004
43	K	0.001	0.001	0.003	0.731	0.009	0.247	0.009
44	G	0.003	0.002	0.005	0.443	0.092	0.307	0.147
45	E	0.016	0.009	0.011	0.194	0.198	0.092	0.481
46	T	0.065	0.013	0.026	0.140	0.170	0.073	0.512
47	Q	0.087	0.017	0.027	0.121	0.183	0.125	0.440
48	T	0.060	0.017	0.010	0.069	0.007	0.083	0.754
49	L	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.001	0.999