# TARGET T0341 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0341/T0341.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 857 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.016 0.007 0.021 0.030 0.001 0.058 0.004 0.001 0.003 0.002 0.058 0.122 0.665 0.001 0.002 0.009 2 A 0.006 0.012 0.016 0.017 0.001 0.019 0.002 0.001 0.001 0.001 0.070 0.080 0.767 0.002 0.002 0.005 3 A 0.001 0.004 0.006 0.004 0.001 0.018 0.004 0.001 0.001 0.001 0.028 0.058 0.861 0.005 0.002 0.006 4 R 0.003 0.008 0.020 0.005 0.001 0.010 0.025 0.001 0.001 0.001 0.017 0.027 0.848 0.016 0.011 0.007 5 R 0.003 0.031 0.027 0.019 0.001 0.007 0.010 0.003 0.001 0.001 0.010 0.025 0.775 0.001 0.060 0.030 6 A 0.013 0.053 0.078 0.039 0.001 0.002 0.004 0.001 0.011 0.001 0.002 0.003 0.136 0.005 0.003 0.651 7 L 0.060 0.002 0.165 0.044 0.001 0.436 0.007 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.274 0.001 0.001 0.002 8 K 0.001 0.957 0.029 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 9 A 0.001 0.001 0.005 0.989 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 V 0.001 0.001 0.959 0.038 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 11 L 0.001 0.001 0.002 0.991 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 12 V 0.001 0.007 0.005 0.963 0.009 0.012 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 13 D 0.001 0.003 0.001 0.041 0.067 0.871 0.001 0.002 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 14 L 0.001 0.027 0.001 0.006 0.341 0.009 0.013 0.009 0.001 0.001 0.570 0.002 0.001 0.021 0.001 0.001 15 N 0.001 0.028 0.001 0.005 0.001 0.008 0.001 0.453 0.004 0.001 0.003 0.065 0.001 0.001 0.430 0.001 16 G 0.001 0.004 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.435 0.018 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.529 17 T 0.979 0.001 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 18 L 0.005 0.010 0.913 0.045 0.002 0.012 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.002 19 H 0.002 0.040 0.025 0.754 0.042 0.104 0.005 0.004 0.001 0.002 0.005 0.003 0.007 0.001 0.001 0.003 20 I 0.004 0.067 0.024 0.264 0.070 0.417 0.009 0.032 0.006 0.006 0.062 0.012 0.018 0.003 0.003 0.002 21 E 0.006 0.297 0.044 0.159 0.010 0.086 0.011 0.047 0.022 0.014 0.197 0.057 0.029 0.004 0.007 0.010 22 D 0.035 0.105 0.082 0.106 0.005 0.105 0.016 0.011 0.034 0.013 0.046 0.348 0.051 0.004 0.021 0.016 23 A 0.049 0.069 0.277 0.073 0.006 0.068 0.020 0.009 0.010 0.006 0.129 0.067 0.124 0.004 0.014 0.075 24 A 0.042 0.167 0.288 0.161 0.002 0.037 0.004 0.006 0.006 0.003 0.034 0.114 0.088 0.001 0.006 0.040 25 V 0.017 0.004 0.045 0.016 0.110 0.456 0.100 0.001 0.001 0.007 0.028 0.053 0.140 0.017 0.001 0.004 26 P 0.002 0.023 0.009 0.007 0.001 0.039 0.001 0.124 0.001 0.001 0.607 0.034 0.136 0.001 0.016 0.001 27 G 0.001 0.006 0.001 0.005 0.001 0.009 0.001 0.001 0.032 0.022 0.088 0.612 0.216 0.001 0.001 0.009 28 A 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.124 0.851 0.001 0.001 0.001 29 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.035 0.949 0.001 0.001 0.001 30 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.978 0.001 0.001 0.001 31 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 32 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 33 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 34 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.005 0.001 0.002 35 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.923 0.047 0.012 0.008 36 R 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.923 0.006 0.038 0.017 37 A 0.006 0.002 0.009 0.001 0.001 0.002 0.044 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.421 0.311 0.012 0.186 38 T 0.031 0.022 0.062 0.003 0.001 0.006 0.040 0.007 0.001 0.001 0.017 0.009 0.412 0.017 0.333 0.037 39 S 0.013 0.083 0.208 0.011 0.001 0.008 0.019 0.002 0.010 0.002 0.009 0.011 0.151 0.008 0.019 0.447 40 V 0.312 0.058 0.300 0.145 0.001 0.017 0.010 0.002 0.002 0.001 0.013 0.017 0.082 0.002 0.007 0.031 41 M 0.019 0.057 0.576 0.138 0.002 0.119 0.005 0.002 0.001 0.001 0.008 0.012 0.050 0.001 0.001 0.008 42 V 0.010 0.062 0.094 0.483 0.005 0.133 0.003 0.005 0.001 0.001 0.132 0.012 0.053 0.001 0.001 0.003 43 R 0.003 0.132 0.074 0.633 0.005 0.031 0.002 0.005 0.003 0.001 0.019 0.053 0.034 0.001 0.002 0.002 44 F 0.007 0.019 0.092 0.664 0.017 0.057 0.006 0.005 0.003 0.002 0.016 0.010 0.086 0.003 0.003 0.011 45 V 0.011 0.050 0.175 0.456 0.067 0.068 0.030 0.010 0.002 0.003 0.022 0.013 0.069 0.010 0.004 0.010 46 T 0.012 0.063 0.050 0.406 0.044 0.193 0.018 0.057 0.006 0.008 0.028 0.020 0.061 0.008 0.014 0.011 47 N 0.015 0.144 0.058 0.290 0.019 0.118 0.011 0.044 0.031 0.023 0.096 0.032 0.063 0.006 0.012 0.037 48 T 0.060 0.129 0.078 0.234 0.011 0.119 0.013 0.019 0.021 0.017 0.071 0.106 0.078 0.007 0.010 0.026 49 T 0.030 0.047 0.102 0.072 0.006 0.281 0.014 0.015 0.005 0.008 0.122 0.117 0.152 0.003 0.013 0.012 50 K 0.014 0.103 0.048 0.050 0.003 0.069 0.005 0.007 0.006 0.003 0.325 0.118 0.219 0.003 0.006 0.020 51 E 0.034 0.093 0.087 0.125 0.002 0.019 0.007 0.007 0.006 0.004 0.052 0.308 0.219 0.007 0.007 0.022 52 T 0.003 0.004 0.026 0.011 0.001 0.370 0.003 0.002 0.001 0.002 0.014 0.074 0.482 0.001 0.004 0.003 53 K 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.512 0.015 0.436 0.001 0.001 0.001 54 K 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.038 0.604 0.351 0.001 0.001 0.001 55 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.020 0.974 0.001 0.001 0.001 56 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.993 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.991 0.001 0.001 0.001 58 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 59 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.982 0.010 0.001 0.004 60 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.967 0.008 0.008 0.004 61 K 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.952 0.007 0.012 0.014 62 K 0.005 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.030 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.266 0.574 0.011 0.097 63 L 0.007 0.007 0.082 0.002 0.001 0.004 0.043 0.006 0.001 0.001 0.007 0.005 0.282 0.014 0.524 0.017 64 E 0.009 0.041 0.132 0.011 0.001 0.011 0.027 0.003 0.009 0.004 0.013 0.010 0.230 0.016 0.024 0.459 65 F 0.451 0.036 0.122 0.082 0.001 0.015 0.014 0.004 0.004 0.002 0.029 0.038 0.138 0.004 0.015 0.046 66 E 0.033 0.089 0.533 0.087 0.004 0.069 0.016 0.002 0.003 0.002 0.012 0.018 0.080 0.005 0.005 0.043 67 I 0.023 0.113 0.258 0.426 0.007 0.045 0.012 0.007 0.001 0.001 0.029 0.014 0.047 0.002 0.006 0.010 68 S 0.003 0.019 0.023 0.038 0.010 0.811 0.004 0.006 0.002 0.005 0.015 0.030 0.032 0.001 0.001 0.002 69 E 0.002 0.026 0.007 0.014 0.001 0.069 0.001 0.013 0.001 0.001 0.786 0.019 0.054 0.002 0.002 0.002 70 D 0.003 0.055 0.009 0.020 0.001 0.010 0.002 0.002 0.007 0.001 0.026 0.799 0.056 0.001 0.006 0.003 71 E 0.019 0.011 0.085 0.032 0.002 0.016 0.017 0.002 0.004 0.001 0.030 0.050 0.643 0.010 0.014 0.064 72 I 0.016 0.024 0.329 0.048 0.003 0.020 0.024 0.005 0.002 0.001 0.029 0.027 0.404 0.010 0.012 0.046 73 F 0.015 0.050 0.230 0.121 0.006 0.042 0.033 0.005 0.003 0.002 0.016 0.026 0.394 0.008 0.012 0.038 74 T 0.017 0.038 0.109 0.150 0.005 0.125 0.014 0.010 0.003 0.006 0.033 0.032 0.420 0.003 0.008 0.027 75 S 0.008 0.018 0.021 0.030 0.003 0.295 0.003 0.007 0.002 0.004 0.159 0.052 0.385 0.002 0.002 0.009 76 L 0.004 0.027 0.009 0.012 0.001 0.033 0.001 0.002 0.001 0.001 0.346 0.182 0.375 0.001 0.002 0.003 77 T 0.001 0.008 0.007 0.008 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.358 0.567 0.001 0.002 0.002 78 A 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.028 0.935 0.001 0.001 0.002 79 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.028 0.947 0.001 0.001 0.001 80 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.021 0.966 0.001 0.001 0.001 81 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.989 0.001 0.001 0.001 82 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.985 0.003 0.001 0.003 83 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.979 0.002 0.004 0.002 84 E 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.941 0.021 0.006 0.017 85 Q 0.003 0.002 0.009 0.002 0.001 0.002 0.018 0.001 0.001 0.001 0.008 0.003 0.820 0.068 0.029 0.033 86 K 0.005 0.007 0.050 0.004 0.001 0.004 0.023 0.003 0.001 0.001 0.013 0.011 0.729 0.018 0.075 0.055 87 Q 0.020 0.021 0.065 0.012 0.001 0.018 0.034 0.002 0.004 0.002 0.013 0.020 0.593 0.021 0.019 0.155 88 V 0.062 0.106 0.230 0.056 0.001 0.017 0.021 0.004 0.003 0.001 0.023 0.025 0.354 0.007 0.026 0.065 89 R 0.025 0.053 0.313 0.108 0.003 0.127 0.017 0.004 0.003 0.003 0.019 0.034 0.250 0.004 0.010 0.029 90 P 0.025 0.065 0.140 0.187 0.003 0.123 0.006 0.009 0.002 0.001 0.158 0.026 0.233 0.004 0.006 0.011 91 M 0.011 0.154 0.094 0.334 0.004 0.047 0.007 0.004 0.006 0.001 0.051 0.110 0.154 0.006 0.005 0.013 92 L 0.012 0.030 0.179 0.463 0.006 0.027 0.010 0.005 0.002 0.001 0.019 0.025 0.191 0.004 0.009 0.017 93 L 0.013 0.030 0.216 0.322 0.033 0.108 0.027 0.006 0.003 0.004 0.015 0.014 0.165 0.010 0.005 0.030 94 L 0.018 0.075 0.085 0.326 0.078 0.108 0.040 0.035 0.003 0.005 0.059 0.017 0.099 0.029 0.010 0.014 95 D 0.008 0.084 0.040 0.132 0.013 0.327 0.012 0.080 0.010 0.013 0.058 0.060 0.104 0.008 0.039 0.014 96 D 0.017 0.061 0.031 0.053 0.005 0.107 0.011 0.017 0.023 0.022 0.354 0.072 0.171 0.007 0.013 0.039 97 R 0.070 0.109 0.062 0.056 0.003 0.034 0.012 0.009 0.011 0.003 0.141 0.294 0.140 0.009 0.017 0.028 98 A 0.029 0.099 0.337 0.105 0.002 0.031 0.012 0.007 0.006 0.002 0.018 0.081 0.182 0.006 0.021 0.061 99 L 0.020 0.031 0.260 0.102 0.006 0.183 0.027 0.003 0.004 0.003 0.023 0.031 0.272 0.004 0.008 0.024 100 P 0.013 0.048 0.076 0.069 0.008 0.186 0.017 0.010 0.002 0.002 0.207 0.041 0.305 0.004 0.004 0.010 101 E 0.009 0.135 0.043 0.122 0.006 0.051 0.005 0.014 0.009 0.002 0.113 0.212 0.249 0.006 0.007 0.017 102 F 0.012 0.015 0.056 0.047 0.084 0.036 0.176 0.004 0.006 0.003 0.030 0.054 0.194 0.255 0.007 0.021 103 T 0.006 0.049 0.176 0.050 0.001 0.015 0.011 0.124 0.002 0.001 0.016 0.018 0.157 0.002 0.359 0.013 104 G 0.011 0.016 0.064 0.098 0.004 0.047 0.011 0.006 0.080 0.067 0.051 0.024 0.201 0.010 0.005 0.305 105 V 0.437 0.053 0.085 0.124 0.004 0.021 0.011 0.005 0.002 0.001 0.041 0.044 0.151 0.005 0.007 0.010 106 Q 0.013 0.060 0.228 0.172 0.013 0.143 0.030 0.010 0.005 0.005 0.031 0.077 0.162 0.016 0.011 0.022 107 T 0.015 0.111 0.134 0.217 0.018 0.154 0.022 0.018 0.006 0.002 0.072 0.027 0.150 0.006 0.021 0.028 108 Q 0.017 0.239 0.172 0.362 0.003 0.019 0.006 0.011 0.009 0.004 0.029 0.032 0.054 0.002 0.008 0.033 109 D 0.044 0.022 0.139 0.125 0.019 0.452 0.020 0.005 0.006 0.011 0.015 0.041 0.083 0.004 0.004 0.012 110 P 0.014 0.123 0.087 0.075 0.003 0.133 0.005 0.023 0.002 0.001 0.422 0.015 0.084 0.003 0.005 0.006 111 N 0.007 0.299 0.042 0.192 0.001 0.033 0.002 0.006 0.019 0.002 0.021 0.321 0.042 0.001 0.005 0.008 112 A 0.030 0.024 0.253 0.374 0.003 0.031 0.005 0.003 0.005 0.001 0.035 0.019 0.187 0.002 0.005 0.023 113 V 0.012 0.024 0.487 0.311 0.005 0.023 0.004 0.003 0.001 0.001 0.012 0.011 0.094 0.001 0.002 0.009 114 V 0.008 0.019 0.085 0.438 0.157 0.095 0.036 0.006 0.001 0.002 0.019 0.008 0.075 0.043 0.002 0.007 115 I 0.005 0.082 0.068 0.481 0.025 0.052 0.010 0.129 0.003 0.002 0.022 0.009 0.056 0.005 0.042 0.008 116 G 0.008 0.061 0.046 0.375 0.015 0.123 0.010 0.023 0.071 0.072 0.030 0.020 0.061 0.003 0.006 0.076 117 L 0.171 0.143 0.098 0.336 0.009 0.053 0.009 0.012 0.009 0.007 0.051 0.032 0.043 0.003 0.005 0.019 118 A 0.025 0.071 0.157 0.198 0.009 0.328 0.008 0.011 0.005 0.007 0.035 0.070 0.061 0.002 0.005 0.008 119 P 0.013 0.071 0.067 0.111 0.015 0.223 0.011 0.011 0.005 0.005 0.282 0.060 0.108 0.005 0.004 0.008 120 E 0.014 0.149 0.031 0.134 0.007 0.060 0.006 0.016 0.010 0.003 0.158 0.255 0.134 0.004 0.008 0.011 121 H 0.018 0.067 0.123 0.107 0.007 0.045 0.015 0.007 0.012 0.005 0.037 0.169 0.323 0.007 0.011 0.046 122 F 0.014 0.010 0.084 0.029 0.017 0.128 0.050 0.006 0.001 0.004 0.051 0.063 0.514 0.011 0.006 0.011 123 H 0.004 0.018 0.018 0.014 0.001 0.074 0.002 0.026 0.002 0.002 0.240 0.076 0.503 0.002 0.012 0.005 124 Y 0.004 0.015 0.006 0.018 0.001 0.012 0.001 0.002 0.010 0.004 0.136 0.255 0.517 0.001 0.002 0.016 125 Q 0.006 0.004 0.008 0.005 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.136 0.811 0.001 0.001 0.002 126 L 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.014 0.002 0.001 0.001 0.001 0.015 0.019 0.937 0.001 0.001 0.001 127 L 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.038 0.940 0.001 0.001 0.001 128 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.019 0.970 0.001 0.001 0.001 129 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.006 0.982 0.001 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.981 0.001 0.001 0.001 131 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 132 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 133 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.973 0.006 0.002 0.009 134 L 0.002 0.001 0.005 0.001 0.009 0.002 0.043 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.369 0.527 0.013 0.025 135 L 0.001 0.003 0.013 0.001 0.008 0.001 0.192 0.011 0.001 0.001 0.006 0.001 0.096 0.399 0.252 0.017 136 D 0.004 0.016 0.021 0.003 0.001 0.001 0.006 0.056 0.009 0.004 0.003 0.003 0.048 0.002 0.629 0.195 137 G 0.240 0.015 0.032 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.095 0.007 0.001 0.002 0.010 0.001 0.001 0.581 138 A 0.701 0.011 0.242 0.032 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 139 P 0.003 0.034 0.623 0.320 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 140 L 0.001 0.004 0.020 0.966 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 141 I 0.001 0.002 0.031 0.944 0.012 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 142 A 0.001 0.006 0.011 0.799 0.130 0.040 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 143 I 0.001 0.046 0.007 0.694 0.087 0.095 0.003 0.043 0.002 0.004 0.007 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 144 H 0.003 0.097 0.007 0.194 0.032 0.504 0.003 0.057 0.019 0.029 0.028 0.014 0.008 0.001 0.002 0.003 145 K 0.020 0.106 0.026 0.122 0.014 0.100 0.004 0.045 0.025 0.031 0.422 0.051 0.019 0.002 0.003 0.007 146 A 0.027 0.100 0.046 0.076 0.008 0.132 0.007 0.014 0.012 0.008 0.090 0.404 0.051 0.005 0.013 0.006 147 R 0.020 0.061 0.097 0.078 0.008 0.065 0.016 0.014 0.010 0.005 0.214 0.099 0.250 0.011 0.017 0.036 148 Y 0.026 0.110 0.128 0.139 0.004 0.040 0.020 0.012 0.013 0.003 0.045 0.181 0.219 0.011 0.015 0.033 149 Y 0.024 0.039 0.201 0.133 0.006 0.067 0.027 0.007 0.009 0.004 0.027 0.045 0.354 0.005 0.016 0.037 150 K 0.021 0.070 0.204 0.209 0.008 0.049 0.020 0.009 0.004 0.003 0.046 0.033 0.270 0.005 0.007 0.041 151 R 0.021 0.026 0.065 0.102 0.043 0.298 0.020 0.010 0.005 0.006 0.042 0.061 0.269 0.012 0.006 0.012 152 K 0.007 0.052 0.050 0.047 0.120 0.039 0.098 0.028 0.003 0.003 0.233 0.029 0.129 0.143 0.009 0.010 153 D 0.005 0.070 0.026 0.054 0.003 0.037 0.006 0.150 0.013 0.003 0.016 0.150 0.109 0.006 0.341 0.011 154 G 0.016 0.013 0.062 0.046 0.006 0.021 0.020 0.004 0.073 0.039 0.069 0.016 0.255 0.015 0.010 0.336 155 L 0.344 0.045 0.117 0.091 0.005 0.014 0.012 0.013 0.004 0.002 0.033 0.102 0.181 0.004 0.018 0.014 156 A 0.013 0.015 0.118 0.040 0.148 0.054 0.176 0.006 0.006 0.006 0.013 0.014 0.072 0.274 0.005 0.041 157 L 0.015 0.086 0.213 0.216 0.005 0.011 0.007 0.131 0.004 0.002 0.014 0.012 0.055 0.001 0.219 0.010 158 G 0.006 0.007 0.027 0.033 0.110 0.281 0.074 0.003 0.035 0.250 0.015 0.025 0.053 0.015 0.001 0.065 159 P 0.203 0.115 0.032 0.063 0.001 0.018 0.001 0.176 0.002 0.001 0.269 0.034 0.051 0.001 0.030 0.003 160 G 0.006 0.021 0.039 0.046 0.002 0.118 0.003 0.002 0.071 0.088 0.044 0.456 0.083 0.001 0.001 0.019 161 P 0.087 0.026 0.040 0.050 0.001 0.051 0.002 0.004 0.001 0.001 0.235 0.110 0.389 0.001 0.002 0.002 162 F 0.001 0.033 0.017 0.035 0.001 0.078 0.001 0.001 0.002 0.001 0.074 0.318 0.433 0.001 0.001 0.004 163 V 0.001 0.004 0.010 0.017 0.001 0.027 0.003 0.001 0.001 0.001 0.026 0.100 0.809 0.001 0.001 0.001 164 T 0.001 0.012 0.004 0.015 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.041 0.901 0.001 0.001 0.002 165 A 0.001 0.003 0.003 0.019 0.001 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.011 0.019 0.919 0.004 0.001 0.008 166 L 0.001 0.002 0.014 0.007 0.001 0.004 0.004 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 0.942 0.002 0.004 0.002 167 E 0.001 0.005 0.009 0.014 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 0.001 0.006 0.007 0.913 0.014 0.004 0.015 168 Y 0.005 0.010 0.018 0.041 0.001 0.008 0.011 0.001 0.001 0.001 0.005 0.010 0.829 0.008 0.021 0.032 169 A 0.009 0.012 0.096 0.031 0.013 0.015 0.124 0.002 0.001 0.001 0.008 0.007 0.442 0.107 0.013 0.119 170 T 0.027 0.075 0.139 0.085 0.006 0.052 0.033 0.041 0.002 0.001 0.022 0.017 0.327 0.014 0.118 0.040 171 D 0.020 0.127 0.109 0.111 0.006 0.081 0.019 0.012 0.036 0.024 0.046 0.023 0.178 0.016 0.015 0.177 172 T 0.140 0.121 0.135 0.130 0.003 0.105 0.015 0.009 0.006 0.003 0.074 0.060 0.159 0.003 0.016 0.020 173 K 0.024 0.186 0.301 0.127 0.003 0.074 0.007 0.006 0.009 0.002 0.067 0.065 0.091 0.004 0.005 0.028 174 A 0.027 0.069 0.200 0.362 0.007 0.076 0.010 0.007 0.004 0.001 0.053 0.052 0.110 0.004 0.007 0.011 175 M 0.011 0.109 0.314 0.379 0.005 0.027 0.005 0.006 0.004 0.002 0.011 0.020 0.082 0.002 0.006 0.017 176 V 0.017 0.012 0.094 0.474 0.095 0.084 0.041 0.008 0.003 0.004 0.038 0.008 0.063 0.042 0.002 0.014 177 V 0.017 0.135 0.192 0.399 0.009 0.028 0.007 0.074 0.005 0.002 0.011 0.014 0.056 0.002 0.038 0.010 178 G 0.013 0.025 0.055 0.567 0.007 0.062 0.006 0.006 0.036 0.074 0.025 0.017 0.045 0.002 0.002 0.058 179 K 0.182 0.046 0.112 0.333 0.028 0.129 0.009 0.005 0.003 0.004 0.043 0.029 0.066 0.002 0.002 0.009 180 P 0.010 0.074 0.086 0.350 0.007 0.116 0.002 0.024 0.002 0.009 0.157 0.083 0.071 0.001 0.002 0.005 181 E 0.002 0.014 0.005 0.024 0.002 0.595 0.001 0.003 0.002 0.006 0.058 0.152 0.135 0.001 0.001 0.001 182 K 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 0.595 0.056 0.313 0.001 0.001 0.001 183 T 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.808 0.169 0.001 0.001 0.001 184 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.018 0.977 0.001 0.001 0.001 185 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.992 0.001 0.001 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 187 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 189 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.002 0.001 0.001 190 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.976 0.009 0.007 0.005 191 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.968 0.001 0.007 192 A 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.959 0.003 193 D 0.001 0.004 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.974 194 C 0.951 0.005 0.029 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 195 A 0.003 0.002 0.200 0.003 0.002 0.782 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 196 P 0.001 0.009 0.001 0.005 0.001 0.091 0.001 0.003 0.001 0.001 0.889 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 197 E 0.001 0.486 0.001 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.485 0.001 0.001 0.001 0.001 198 E 0.021 0.021 0.545 0.304 0.001 0.005 0.003 0.001 0.004 0.001 0.002 0.005 0.057 0.001 0.007 0.024 199 A 0.001 0.001 0.968 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 200 V 0.005 0.007 0.144 0.823 0.006 0.005 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 201 M 0.001 0.002 0.005 0.460 0.488 0.026 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 202 I 0.002 0.023 0.007 0.369 0.079 0.064 0.002 0.429 0.001 0.001 0.007 0.001 0.003 0.001 0.009 0.001 203 G 0.001 0.063 0.004 0.123 0.011 0.181 0.001 0.051 0.192 0.307 0.040 0.010 0.005 0.001 0.001 0.010 204 D 0.203 0.131 0.011 0.091 0.006 0.079 0.004 0.019 0.027 0.033 0.179 0.194 0.017 0.001 0.002 0.004 205 D 0.015 0.053 0.061 0.032 0.004 0.267 0.004 0.009 0.004 0.004 0.120 0.337 0.077 0.002 0.006 0.005 206 C 0.005 0.012 0.041 0.018 0.005 0.060 0.006 0.006 0.002 0.003 0.437 0.161 0.219 0.007 0.007 0.009 207 R 0.009 0.034 0.015 0.029 0.002 0.019 0.005 0.006 0.004 0.002 0.107 0.422 0.318 0.007 0.014 0.008 208 D 0.007 0.007 0.015 0.015 0.001 0.014 0.003 0.004 0.005 0.002 0.038 0.056 0.789 0.002 0.011 0.031 209 D 0.002 0.006 0.009 0.002 0.001 0.020 0.004 0.001 0.001 0.001 0.012 0.045 0.895 0.001 0.001 0.006 210 V 0.002 0.001 0.005 0.002 0.001 0.018 0.007 0.001 0.001 0.001 0.049 0.032 0.877 0.004 0.001 0.002 211 D 0.001 0.016 0.006 0.008 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.001 0.018 0.092 0.836 0.001 0.012 0.002 212 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.012 0.948 0.002 0.001 0.025 213 A 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.002 0.016 0.001 0.001 0.001 0.007 0.005 0.949 0.005 0.001 0.002 214 Q 0.001 0.005 0.006 0.002 0.001 0.003 0.003 0.002 0.001 0.001 0.003 0.015 0.948 0.001 0.008 0.003 215 N 0.001 0.001 0.002 0.002 0.015 0.001 0.052 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.078 0.807 0.002 0.034 216 I 0.004 0.002 0.026 0.004 0.001 0.001 0.005 0.047 0.001 0.001 0.002 0.002 0.087 0.001 0.817 0.003 217 G 0.002 0.024 0.040 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.052 0.012 0.001 0.001 0.032 0.001 0.001 0.818 218 M 0.929 0.001 0.009 0.035 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 219 L 0.002 0.335 0.567 0.080 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.001 0.001 220 G 0.001 0.001 0.011 0.974 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 221 I 0.002 0.015 0.244 0.726 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 222 L 0.001 0.001 0.008 0.978 0.005 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 223 V 0.001 0.013 0.016 0.615 0.155 0.185 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 224 K 0.001 0.033 0.002 0.149 0.633 0.103 0.014 0.017 0.001 0.004 0.024 0.001 0.002 0.014 0.001 0.001 225 T 0.002 0.167 0.007 0.141 0.008 0.052 0.002 0.494 0.016 0.005 0.025 0.025 0.003 0.001 0.051 0.001 226 G 0.010 0.043 0.029 0.075 0.007 0.049 0.006 0.012 0.268 0.268 0.080 0.035 0.022 0.002 0.003 0.090 227 K 0.491 0.084 0.080 0.118 0.005 0.018 0.007 0.009 0.007 0.003 0.053 0.085 0.024 0.003 0.005 0.009 228 Y 0.020 0.050 0.352 0.209 0.006 0.138 0.009 0.012 0.006 0.007 0.024 0.072 0.071 0.003 0.009 0.012 229 K 0.013 0.081 0.079 0.230 0.009 0.277 0.007 0.011 0.006 0.007 0.080 0.053 0.130 0.002 0.004 0.011 230 A 0.015 0.052 0.030 0.120 0.012 0.191 0.008 0.011 0.006 0.004 0.253 0.108 0.173 0.006 0.003 0.008 231 A 0.012 0.091 0.093 0.123 0.006 0.044 0.012 0.024 0.006 0.003 0.099 0.228 0.217 0.011 0.020 0.012 232 D 0.010 0.024 0.056 0.063 0.005 0.122 0.016 0.010 0.009 0.005 0.040 0.092 0.467 0.012 0.028 0.041 233 E 0.026 0.047 0.126 0.055 0.005 0.031 0.026 0.009 0.006 0.002 0.130 0.033 0.385 0.022 0.019 0.078 234 E 0.043 0.058 0.161 0.109 0.005 0.049 0.024 0.013 0.006 0.003 0.031 0.110 0.302 0.012 0.036 0.038 235 K 0.035 0.057 0.217 0.080 0.015 0.047 0.077 0.006 0.009 0.004 0.026 0.017 0.218 0.056 0.016 0.119 236 I 0.058 0.082 0.250 0.235 0.005 0.027 0.035 0.034 0.006 0.003 0.045 0.020 0.109 0.009 0.045 0.039 237 N 0.039 0.085 0.388 0.258 0.004 0.040 0.014 0.004 0.030 0.007 0.004 0.012 0.039 0.002 0.005 0.068 238 P 0.120 0.036 0.201 0.557 0.004 0.021 0.007 0.002 0.002 0.002 0.016 0.004 0.015 0.001 0.001 0.011 239 P 0.012 0.098 0.206 0.565 0.010 0.074 0.003 0.004 0.002 0.001 0.004 0.009 0.006 0.001 0.001 0.004 240 P 0.007 0.012 0.023 0.434 0.003 0.407 0.002 0.009 0.002 0.002 0.082 0.003 0.011 0.001 0.001 0.001 241 Y 0.002 0.789 0.023 0.151 0.001 0.003 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 242 L 0.006 0.004 0.051 0.931 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 243 T 0.003 0.002 0.796 0.174 0.003 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 244 C 0.001 0.003 0.002 0.083 0.037 0.842 0.001 0.002 0.001 0.001 0.023 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 245 E 0.001 0.628 0.002 0.144 0.001 0.017 0.001 0.046 0.002 0.001 0.108 0.045 0.004 0.001 0.001 0.001 246 S 0.001 0.008 0.001 0.020 0.001 0.505 0.001 0.002 0.010 0.015 0.010 0.334 0.089 0.001 0.001 0.002 247 F 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.023 0.001 0.001 0.001 0.001 0.656 0.022 0.288 0.001 0.001 0.001 248 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.055 0.686 0.255 0.001 0.001 0.001 249 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 0.976 0.001 0.001 0.001 250 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.995 0.001 0.001 0.001 252 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 253 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.997 0.001 0.001 0.001 254 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 255 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 256 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 257 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.967 0.012 0.005 0.014 258 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.682 0.250 0.008 0.026 259 L 0.001 0.003 0.016 0.001 0.001 0.001 0.059 0.002 0.001 0.001 0.003 0.002 0.669 0.050 0.168 0.025