# TARGET T0341 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0341/T0341.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4797 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.054 0.022 0.073 0.109 0.008 0.123 0.016 0.006 0.012 0.013 0.064 0.094 0.364 0.006 0.006 0.030 2 A 0.031 0.054 0.082 0.081 0.011 0.061 0.020 0.011 0.002 0.002 0.133 0.102 0.375 0.012 0.009 0.015 3 A 0.010 0.041 0.051 0.059 0.008 0.073 0.014 0.023 0.006 0.004 0.086 0.133 0.434 0.013 0.022 0.024 4 R 0.033 0.051 0.113 0.070 0.007 0.052 0.030 0.010 0.016 0.005 0.055 0.057 0.419 0.014 0.025 0.044 5 R 0.046 0.088 0.127 0.126 0.001 0.045 0.015 0.012 0.005 0.003 0.049 0.069 0.351 0.002 0.026 0.037 6 A 0.026 0.233 0.224 0.225 0.001 0.015 0.004 0.001 0.014 0.001 0.009 0.015 0.092 0.002 0.003 0.134 7 L 0.030 0.006 0.119 0.173 0.001 0.540 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 0.008 0.110 0.001 0.001 0.002 8 K 0.001 0.907 0.044 0.041 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 9 A 0.001 0.001 0.008 0.985 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 V 0.001 0.002 0.885 0.108 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 11 L 0.001 0.001 0.002 0.988 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 12 V 0.001 0.008 0.006 0.958 0.010 0.013 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 13 D 0.001 0.004 0.001 0.057 0.052 0.868 0.001 0.002 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 14 L 0.002 0.037 0.001 0.012 0.282 0.014 0.013 0.011 0.001 0.001 0.607 0.003 0.001 0.016 0.001 0.001 15 N 0.001 0.065 0.003 0.011 0.001 0.017 0.001 0.400 0.006 0.002 0.005 0.116 0.001 0.001 0.370 0.001 16 G 0.003 0.008 0.011 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.375 0.023 0.004 0.002 0.004 0.001 0.001 0.561 17 T 0.950 0.002 0.020 0.010 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.003 0.001 0.001 0.002 18 L 0.011 0.022 0.833 0.072 0.003 0.025 0.009 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.011 0.001 0.001 0.005 19 H 0.003 0.058 0.035 0.770 0.021 0.070 0.005 0.005 0.002 0.002 0.006 0.005 0.010 0.001 0.001 0.004 20 I 0.006 0.058 0.035 0.252 0.043 0.475 0.009 0.018 0.007 0.009 0.037 0.014 0.028 0.002 0.002 0.004 21 E 0.008 0.234 0.050 0.144 0.009 0.105 0.009 0.034 0.010 0.009 0.282 0.050 0.041 0.003 0.005 0.007 22 D 0.017 0.059 0.045 0.060 0.005 0.163 0.012 0.010 0.016 0.009 0.078 0.431 0.068 0.005 0.014 0.008 23 A 0.023 0.074 0.138 0.050 0.004 0.039 0.013 0.011 0.008 0.004 0.229 0.116 0.215 0.004 0.018 0.055 24 A 0.035 0.108 0.153 0.104 0.002 0.038 0.005 0.004 0.009 0.004 0.029 0.218 0.218 0.002 0.007 0.063 25 V 0.020 0.004 0.063 0.012 0.036 0.257 0.089 0.001 0.001 0.004 0.041 0.051 0.399 0.014 0.001 0.006 26 P 0.002 0.016 0.011 0.006 0.001 0.040 0.001 0.051 0.001 0.001 0.471 0.059 0.330 0.001 0.011 0.001 27 G 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.009 0.001 0.001 0.011 0.007 0.090 0.421 0.446 0.001 0.001 0.006 28 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.085 0.903 0.001 0.001 0.001 29 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.023 0.969 0.001 0.001 0.001 30 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.989 0.001 0.001 0.001 31 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 32 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 33 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 34 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 35 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.004 0.002 0.002 36 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.002 0.003 37 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.046 0.922 0.001 0.016 38 T 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.039 0.001 0.938 0.003 39 S 0.002 0.006 0.021 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.019 0.001 0.002 0.936 40 V 0.930 0.005 0.029 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.004 41 M 0.007 0.032 0.864 0.075 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 42 V 0.003 0.014 0.065 0.880 0.001 0.023 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 43 R 0.001 0.011 0.052 0.906 0.009 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 44 F 0.002 0.011 0.026 0.820 0.046 0.066 0.002 0.004 0.001 0.001 0.006 0.002 0.010 0.001 0.001 0.001 45 V 0.003 0.053 0.025 0.574 0.184 0.069 0.021 0.014 0.004 0.007 0.017 0.007 0.008 0.010 0.001 0.004 46 T 0.006 0.101 0.012 0.246 0.021 0.424 0.006 0.093 0.008 0.007 0.018 0.023 0.015 0.001 0.014 0.003 47 N 0.010 0.203 0.052 0.150 0.020 0.073 0.011 0.023 0.064 0.059 0.231 0.032 0.022 0.004 0.003 0.042 48 T 0.128 0.143 0.091 0.179 0.007 0.086 0.010 0.018 0.011 0.008 0.053 0.209 0.026 0.005 0.017 0.010 49 T 0.015 0.039 0.132 0.046 0.003 0.358 0.009 0.011 0.005 0.013 0.129 0.084 0.119 0.002 0.016 0.018 50 K 0.017 0.083 0.022 0.028 0.002 0.084 0.004 0.003 0.006 0.002 0.462 0.123 0.141 0.002 0.003 0.017 51 E 0.025 0.113 0.063 0.055 0.001 0.012 0.003 0.004 0.003 0.001 0.048 0.493 0.164 0.002 0.005 0.009 52 T 0.002 0.002 0.018 0.005 0.001 0.354 0.002 0.001 0.001 0.002 0.011 0.079 0.520 0.001 0.002 0.003 53 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.478 0.012 0.485 0.001 0.001 0.001 54 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.028 0.614 0.354 0.001 0.001 0.001 55 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.985 0.001 0.001 0.001 56 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 58 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 59 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.896 0.085 0.002 0.012 60 L 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.881 0.016 0.059 0.007 61 K 0.001 0.002 0.013 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.808 0.019 0.025 0.111 62 K 0.052 0.010 0.027 0.007 0.002 0.005 0.049 0.002 0.003 0.002 0.007 0.005 0.378 0.233 0.029 0.187 63 L 0.031 0.033 0.204 0.009 0.002 0.029 0.079 0.011 0.001 0.001 0.023 0.013 0.307 0.025 0.195 0.038 64 E 0.025 0.144 0.248 0.058 0.001 0.029 0.019 0.010 0.013 0.004 0.042 0.031 0.181 0.008 0.035 0.152 65 F 0.197 0.047 0.176 0.211 0.003 0.032 0.013 0.004 0.012 0.004 0.044 0.074 0.129 0.005 0.007 0.040 66 E 0.037 0.065 0.445 0.218 0.008 0.048 0.016 0.003 0.003 0.001 0.018 0.022 0.084 0.005 0.004 0.021 67 I 0.010 0.053 0.141 0.559 0.027 0.068 0.020 0.009 0.002 0.002 0.020 0.017 0.053 0.004 0.005 0.009 68 S 0.006 0.038 0.041 0.093 0.124 0.502 0.026 0.021 0.004 0.008 0.036 0.024 0.061 0.007 0.005 0.006 69 E 0.009 0.120 0.029 0.066 0.037 0.048 0.026 0.093 0.011 0.010 0.410 0.031 0.051 0.033 0.014 0.012 70 D 0.018 0.083 0.035 0.057 0.004 0.088 0.011 0.050 0.047 0.020 0.037 0.329 0.056 0.005 0.145 0.016 71 E 0.072 0.065 0.131 0.039 0.002 0.018 0.012 0.005 0.049 0.011 0.083 0.036 0.127 0.007 0.017 0.326 72 I 0.264 0.040 0.239 0.095 0.003 0.035 0.015 0.005 0.007 0.003 0.031 0.127 0.093 0.005 0.007 0.032 73 F 0.023 0.054 0.518 0.115 0.008 0.069 0.019 0.005 0.002 0.002 0.020 0.021 0.118 0.003 0.005 0.017 74 T 0.013 0.097 0.123 0.403 0.008 0.087 0.008 0.015 0.003 0.004 0.042 0.038 0.136 0.002 0.005 0.016 75 S 0.009 0.020 0.038 0.089 0.004 0.485 0.002 0.011 0.004 0.008 0.072 0.063 0.187 0.001 0.002 0.006 76 L 0.005 0.020 0.012 0.023 0.002 0.062 0.002 0.003 0.001 0.002 0.524 0.078 0.264 0.001 0.001 0.002 77 T 0.002 0.015 0.005 0.013 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.042 0.596 0.301 0.001 0.001 0.001 78 A 0.001 0.002 0.003 0.004 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.027 0.049 0.889 0.001 0.001 0.003 79 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.035 0.930 0.001 0.001 0.001 80 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.022 0.963 0.001 0.001 0.001 81 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.987 0.001 0.001 0.002 82 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.978 0.004 0.001 0.004 83 I 0.001 0.001 0.005 0.002 0.001 0.002 0.007 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.957 0.006 0.007 0.005 84 E 0.001 0.003 0.009 0.004 0.001 0.004 0.007 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.890 0.027 0.014 0.030 85 Q 0.008 0.008 0.022 0.007 0.003 0.006 0.051 0.002 0.002 0.001 0.013 0.006 0.551 0.204 0.035 0.081 86 K 0.012 0.022 0.123 0.013 0.001 0.009 0.045 0.009 0.001 0.001 0.015 0.018 0.483 0.015 0.181 0.054 87 Q 0.024 0.045 0.128 0.029 0.002 0.041 0.030 0.004 0.010 0.006 0.020 0.023 0.367 0.012 0.016 0.242 88 V 0.160 0.134 0.222 0.143 0.002 0.019 0.013 0.005 0.004 0.002 0.039 0.032 0.165 0.005 0.013 0.044 89 R 0.025 0.041 0.280 0.128 0.006 0.258 0.014 0.004 0.003 0.005 0.019 0.055 0.141 0.003 0.006 0.012 90 P 0.012 0.064 0.080 0.140 0.005 0.144 0.005 0.014 0.002 0.002 0.322 0.028 0.167 0.004 0.004 0.007 91 M 0.008 0.129 0.044 0.221 0.005 0.054 0.006 0.007 0.008 0.002 0.079 0.261 0.157 0.005 0.006 0.009 92 L 0.015 0.028 0.114 0.210 0.005 0.036 0.014 0.007 0.004 0.002 0.040 0.072 0.418 0.004 0.011 0.021 93 L 0.017 0.033 0.126 0.134 0.021 0.115 0.032 0.007 0.004 0.004 0.035 0.042 0.369 0.016 0.006 0.039 94 L 0.014 0.078 0.088 0.157 0.009 0.089 0.015 0.038 0.002 0.003 0.081 0.052 0.319 0.011 0.027 0.016 95 D 0.005 0.021 0.022 0.033 0.002 0.302 0.004 0.011 0.005 0.010 0.055 0.091 0.405 0.003 0.015 0.015 96 D 0.007 0.005 0.006 0.007 0.001 0.025 0.001 0.002 0.001 0.002 0.490 0.050 0.394 0.001 0.002 0.006 97 R 0.007 0.022 0.010 0.009 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.059 0.469 0.400 0.002 0.003 0.006 98 A 0.002 0.007 0.029 0.010 0.001 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.007 0.044 0.873 0.002 0.004 0.010 99 L 0.001 0.001 0.014 0.003 0.001 0.022 0.004 0.001 0.001 0.001 0.009 0.009 0.934 0.001 0.001 0.002 100 P 0.001 0.006 0.003 0.005 0.001 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.040 0.017 0.912 0.001 0.001 0.002 101 E 0.001 0.010 0.004 0.012 0.001 0.010 0.003 0.001 0.001 0.001 0.008 0.076 0.851 0.009 0.004 0.011 102 F 0.001 0.002 0.019 0.004 0.003 0.005 0.062 0.001 0.001 0.001 0.007 0.007 0.789 0.079 0.010 0.012 103 T 0.001 0.008 0.035 0.007 0.001 0.005 0.007 0.014 0.001 0.001 0.012 0.010 0.780 0.004 0.101 0.016 104 G 0.008 0.007 0.016 0.015 0.002 0.009 0.021 0.002 0.015 0.007 0.019 0.015 0.494 0.126 0.007 0.238 105 V 0.079 0.032 0.096 0.028 0.002 0.012 0.051 0.004 0.001 0.001 0.017 0.026 0.508 0.020 0.099 0.024 106 Q 0.007 0.030 0.217 0.037 0.004 0.047 0.048 0.009 0.003 0.005 0.028 0.031 0.376 0.022 0.031 0.104 107 T 0.075 0.088 0.097 0.082 0.009 0.113 0.027 0.011 0.010 0.004 0.066 0.039 0.263 0.015 0.026 0.075 108 Q 0.035 0.264 0.274 0.189 0.001 0.007 0.005 0.009 0.005 0.003 0.037 0.033 0.073 0.003 0.016 0.044 109 D 0.011 0.004 0.038 0.017 0.007 0.766 0.012 0.001 0.001 0.006 0.006 0.038 0.085 0.002 0.002 0.004 110 P 0.002 0.016 0.007 0.004 0.001 0.039 0.001 0.007 0.001 0.001 0.848 0.006 0.067 0.001 0.001 0.001 111 N 0.001 0.069 0.003 0.012 0.001 0.004 0.001 0.001 0.005 0.001 0.006 0.863 0.029 0.001 0.002 0.002 112 A 0.013 0.004 0.073 0.050 0.001 0.009 0.009 0.001 0.003 0.001 0.021 0.016 0.748 0.003 0.009 0.038 113 V 0.009 0.015 0.389 0.049 0.002 0.019 0.010 0.002 0.001 0.001 0.011 0.023 0.438 0.003 0.004 0.025 114 V 0.010 0.010 0.056 0.065 0.081 0.088 0.122 0.005 0.001 0.002 0.028 0.015 0.321 0.181 0.004 0.013 115 I 0.005 0.077 0.072 0.123 0.007 0.025 0.018 0.139 0.003 0.001 0.045 0.024 0.273 0.010 0.166 0.012 116 G 0.007 0.029 0.032 0.101 0.006 0.053 0.015 0.012 0.092 0.057 0.026 0.033 0.244 0.012 0.010 0.272 117 L 0.264 0.090 0.160 0.131 0.003 0.018 0.014 0.008 0.005 0.002 0.046 0.031 0.171 0.005 0.018 0.036 118 A 0.021 0.027 0.229 0.083 0.010 0.286 0.024 0.005 0.003 0.007 0.024 0.074 0.178 0.006 0.007 0.015 119 P 0.014 0.068 0.055 0.070 0.011 0.165 0.013 0.017 0.002 0.002 0.307 0.043 0.206 0.010 0.009 0.009 120 E 0.010 0.215 0.029 0.112 0.004 0.044 0.010 0.012 0.018 0.003 0.075 0.257 0.155 0.015 0.014 0.026 121 H 0.025 0.030 0.182 0.095 0.003 0.032 0.026 0.005 0.009 0.004 0.037 0.111 0.372 0.005 0.029 0.036 122 F 0.021 0.027 0.224 0.061 0.004 0.064 0.016 0.005 0.003 0.004 0.042 0.043 0.422 0.003 0.005 0.056 123 H 0.023 0.051 0.093 0.105 0.003 0.067 0.003 0.007 0.002 0.003 0.083 0.089 0.448 0.002 0.005 0.015 124 Y 0.004 0.003 0.011 0.010 0.010 0.278 0.011 0.001 0.001 0.003 0.085 0.089 0.485 0.006 0.001 0.002 125 Q 0.001 0.008 0.002 0.003 0.001 0.009 0.001 0.005 0.001 0.001 0.462 0.069 0.437 0.001 0.003 0.001 126 L 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.015 0.484 0.485 0.001 0.001 0.004 127 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.018 0.976 0.001 0.001 0.001 128 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.011 0.985 0.001 0.001 0.001 129 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.992 0.001 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.997 0.001 0.001 0.001 131 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 132 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 133 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.001 0.004 134 L 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.962 0.021 0.005 0.006 135 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.951 0.001 0.002 136 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.975 0.002 137 G 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.978 138 A 0.990 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 139 P 0.003 0.105 0.846 0.028 0.001 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 140 L 0.002 0.006 0.018 0.951 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 141 I 0.005 0.008 0.201 0.738 0.021 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.001 0.001 0.001 142 A 0.003 0.012 0.021 0.709 0.166 0.053 0.012 0.003 0.001 0.002 0.003 0.002 0.006 0.003 0.001 0.001 143 I 0.003 0.056 0.017 0.521 0.079 0.157 0.006 0.113 0.005 0.006 0.016 0.006 0.008 0.002 0.005 0.002 144 H 0.005 0.137 0.011 0.156 0.026 0.349 0.005 0.055 0.051 0.073 0.079 0.025 0.016 0.001 0.003 0.009 145 K 0.053 0.107 0.042 0.122 0.012 0.071 0.005 0.037 0.029 0.027 0.331 0.122 0.027 0.002 0.005 0.008 146 A 0.022 0.054 0.075 0.052 0.005 0.219 0.005 0.013 0.007 0.008 0.093 0.340 0.084 0.003 0.014 0.006 147 R 0.013 0.042 0.046 0.045 0.005 0.069 0.008 0.009 0.006 0.004 0.343 0.115 0.263 0.007 0.008 0.018 148 Y 0.014 0.059 0.037 0.067 0.002 0.038 0.008 0.007 0.006 0.001 0.060 0.346 0.329 0.004 0.009 0.011 149 Y 0.009 0.027 0.097 0.060 0.002 0.035 0.016 0.003 0.005 0.002 0.025 0.061 0.608 0.005 0.010 0.035 150 K 0.010 0.032 0.125 0.100 0.002 0.028 0.012 0.004 0.002 0.001 0.025 0.033 0.588 0.003 0.008 0.027 151 R 0.010 0.010 0.057 0.047 0.013 0.152 0.016 0.004 0.002 0.003 0.038 0.031 0.591 0.010 0.004 0.013 152 K 0.009 0.057 0.047 0.061 0.021 0.033 0.029 0.031 0.002 0.002 0.203 0.050 0.382 0.052 0.011 0.011 153 D 0.003 0.040 0.017 0.041 0.001 0.101 0.004 0.030 0.007 0.002 0.017 0.188 0.444 0.007 0.085 0.013 154 G 0.005 0.005 0.026 0.021 0.002 0.016 0.011 0.002 0.005 0.003 0.097 0.014 0.727 0.008 0.006 0.052 155 L 0.029 0.019 0.028 0.031 0.002 0.009 0.007 0.005 0.001 0.001 0.038 0.161 0.647 0.004 0.010 0.008 156 A 0.002 0.002 0.011 0.005 0.022 0.003 0.060 0.001 0.002 0.001 0.002 0.002 0.042 0.820 0.002 0.025 157 L 0.004 0.015 0.156 0.040 0.001 0.002 0.009 0.033 0.001 0.001 0.002 0.003 0.050 0.001 0.678 0.006 158 G 0.005 0.004 0.038 0.013 0.067 0.112 0.138 0.002 0.019 0.172 0.008 0.005 0.077 0.029 0.001 0.310 159 P 0.482 0.091 0.021 0.051 0.001 0.009 0.001 0.144 0.001 0.001 0.116 0.018 0.030 0.001 0.030 0.003 160 G 0.007 0.043 0.062 0.045 0.004 0.211 0.006 0.002 0.119 0.108 0.027 0.257 0.072 0.003 0.002 0.030 161 P 0.156 0.082 0.085 0.085 0.002 0.048 0.006 0.007 0.001 0.001 0.252 0.059 0.206 0.001 0.006 0.004 162 F 0.005 0.152 0.116 0.184 0.002 0.069 0.003 0.002 0.009 0.002 0.040 0.273 0.123 0.002 0.001 0.018 163 V 0.013 0.012 0.129 0.153 0.005 0.189 0.016 0.002 0.001 0.001 0.032 0.059 0.381 0.002 0.003 0.003 164 T 0.002 0.357 0.072 0.186 0.001 0.038 0.004 0.004 0.002 0.001 0.017 0.052 0.253 0.001 0.004 0.008 165 A 0.008 0.016 0.036 0.658 0.001 0.021 0.002 0.002 0.004 0.001 0.026 0.014 0.180 0.003 0.003 0.024 166 L 0.012 0.015 0.465 0.210 0.009 0.025 0.016 0.001 0.001 0.001 0.009 0.010 0.212 0.004 0.003 0.009 167 E 0.006 0.057 0.108 0.589 0.016 0.033 0.012 0.008 0.001 0.001 0.010 0.006 0.119 0.010 0.005 0.018 168 Y 0.009 0.044 0.055 0.515 0.033 0.160 0.013 0.013 0.006 0.005 0.012 0.010 0.093 0.006 0.008 0.019 169 A 0.018 0.074 0.065 0.155 0.100 0.228 0.050 0.021 0.007 0.013 0.104 0.017 0.104 0.020 0.006 0.020 170 T 0.020 0.170 0.043 0.139 0.012 0.085 0.008 0.122 0.011 0.008 0.164 0.114 0.062 0.005 0.026 0.010 171 D 0.020 0.092 0.057 0.103 0.007 0.138 0.009 0.021 0.053 0.029 0.103 0.155 0.142 0.008 0.016 0.047 172 T 0.060 0.070 0.119 0.112 0.006 0.057 0.017 0.010 0.008 0.004 0.147 0.110 0.239 0.005 0.013 0.023 173 K 0.024 0.095 0.173 0.142 0.004 0.078 0.011 0.011 0.009 0.003 0.044 0.149 0.217 0.005 0.012 0.024 174 A 0.022 0.050 0.129 0.208 0.011 0.089 0.023 0.007 0.007 0.003 0.055 0.039 0.306 0.012 0.009 0.030 175 M 0.019 0.097 0.215 0.257 0.007 0.043 0.013 0.009 0.005 0.002 0.027 0.042 0.222 0.004 0.014 0.023 176 V 0.022 0.019 0.099 0.177 0.093 0.085 0.108 0.010 0.007 0.008 0.040 0.022 0.143 0.127 0.005 0.034 177 V 0.025 0.132 0.176 0.246 0.006 0.023 0.012 0.074 0.006 0.002 0.020 0.025 0.122 0.005 0.106 0.019 178 G 0.021 0.030 0.094 0.264 0.007 0.063 0.015 0.006 0.052 0.090 0.032 0.036 0.123 0.006 0.005 0.156 179 K 0.266 0.039 0.125 0.204 0.016 0.084 0.013 0.006 0.002 0.003 0.060 0.039 0.124 0.003 0.004 0.011 180 P 0.011 0.066 0.104 0.230 0.007 0.102 0.003 0.023 0.003 0.010 0.154 0.132 0.140 0.002 0.004 0.009 181 E 0.002 0.012 0.006 0.020 0.002 0.462 0.001 0.003 0.002 0.006 0.069 0.145 0.269 0.001 0.001 0.001 182 K 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.030 0.001 0.001 0.001 0.001 0.476 0.066 0.423 0.001 0.001 0.001 183 T 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.756 0.218 0.001 0.001 0.001 184 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.980 0.001 0.001 0.001 185 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.994 0.001 0.001 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 187 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 189 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 190 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.980 0.009 0.004 0.005 191 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.982 0.001 0.003 192 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.976 0.002 193 D 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.985 194 C 0.961 0.005 0.024 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 195 A 0.001 0.001 0.082 0.001 0.001 0.908 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 196 P 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.029 0.001 0.002 0.001 0.001 0.961 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 197 E 0.001 0.285 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.696 0.001 0.001 0.001 0.001 198 E 0.024 0.018 0.662 0.161 0.001 0.003 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.004 0.060 0.001 0.007 0.050 199 A 0.002 0.001 0.971 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 200 V 0.005 0.011 0.209 0.751 0.005 0.006 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 201 M 0.001 0.003 0.007 0.708 0.238 0.027 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 202 I 0.002 0.030 0.016 0.549 0.101 0.080 0.004 0.193 0.001 0.001 0.008 0.001 0.004 0.001 0.006 0.001 203 G 0.001 0.097 0.007 0.244 0.013 0.234 0.002 0.065 0.113 0.156 0.039 0.011 0.005 0.001 0.001 0.010 204 D 0.116 0.155 0.015 0.135 0.012 0.132 0.006 0.018 0.033 0.037 0.157 0.158 0.016 0.001 0.002 0.006 205 D 0.019 0.078 0.075 0.041 0.011 0.249 0.007 0.014 0.004 0.005 0.160 0.261 0.062 0.003 0.007 0.005 206 C 0.006 0.020 0.049 0.021 0.015 0.086 0.017 0.014 0.003 0.006 0.391 0.181 0.141 0.023 0.016 0.011 207 R 0.012 0.055 0.020 0.035 0.002 0.022 0.004 0.021 0.008 0.005 0.158 0.332 0.246 0.005 0.058 0.017 208 D 0.021 0.012 0.024 0.019 0.001 0.022 0.003 0.005 0.020 0.011 0.056 0.107 0.586 0.003 0.009 0.103 209 D 0.009 0.007 0.015 0.002 0.001 0.037 0.004 0.001 0.001 0.001 0.024 0.073 0.823 0.001 0.001 0.004 210 V 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.028 0.004 0.001 0.001 0.001 0.115 0.052 0.784 0.003 0.001 0.001 211 D 0.001 0.011 0.003 0.008 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.022 0.167 0.773 0.001 0.006 0.001 212 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.964 0.001 0.001 0.012 213 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.968 0.003 0.001 0.001 214 Q 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.968 0.001 0.007 0.002 215 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.039 0.904 0.001 0.024 216 I 0.002 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.006 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.059 0.001 0.892 0.002 217 G 0.001 0.012 0.030 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.008 0.001 0.001 0.029 0.001 0.001 0.884 218 M 0.953 0.001 0.008 0.018 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.002 219 L 0.004 0.268 0.635 0.062 0.001 0.011 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.004 0.008 0.001 0.002 0.002 220 G 0.001 0.006 0.027 0.905 0.001 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.001 0.007 0.001 0.001 0.002 221 I 0.006 0.038 0.216 0.705 0.003 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.004 0.012 0.001 0.001 0.001 222 L 0.001 0.004 0.029 0.934 0.008 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 223 V 0.003 0.017 0.035 0.533 0.155 0.226 0.005 0.004 0.001 0.001 0.003 0.002 0.013 0.001 0.001 0.001 224 K 0.002 0.087 0.007 0.236 0.349 0.173 0.017 0.041 0.003 0.006 0.053 0.004 0.007 0.013 0.001 0.002 225 T 0.004 0.172 0.015 0.245 0.009 0.060 0.002 0.310 0.030 0.012 0.044 0.048 0.009 0.001 0.036 0.003 226 G 0.023 0.037 0.048 0.115 0.014 0.105 0.011 0.013 0.143 0.170 0.118 0.071 0.064 0.004 0.004 0.059 227 K 0.225 0.102 0.088 0.153 0.009 0.030 0.010 0.018 0.007 0.003 0.121 0.136 0.072 0.006 0.009 0.011 228 Y 0.015 0.042 0.185 0.217 0.015 0.124 0.020 0.016 0.010 0.007 0.034 0.129 0.144 0.010 0.015 0.018 229 K 0.017 0.080 0.106 0.212 0.012 0.126 0.018 0.018 0.007 0.006 0.069 0.048 0.234 0.004 0.015 0.026 230 A 0.030 0.064 0.067 0.171 0.014 0.125 0.017 0.017 0.014 0.010 0.125 0.080 0.211 0.012 0.009 0.033 231 A 0.035 0.090 0.161 0.142 0.007 0.071 0.015 0.028 0.007 0.006 0.076 0.121 0.190 0.009 0.023 0.020 232 D 0.013 0.037 0.057 0.056 0.004 0.283 0.008 0.012 0.007 0.006 0.062 0.092 0.319 0.006 0.014 0.024 233 E 0.016 0.036 0.050 0.039 0.004 0.066 0.012 0.006 0.004 0.002 0.271 0.070 0.383 0.010 0.009 0.022 234 E 0.015 0.053 0.053 0.054 0.002 0.029 0.008 0.007 0.003 0.001 0.065 0.249 0.423 0.005 0.018 0.015 235 K 0.017 0.025 0.084 0.039 0.016 0.025 0.095 0.004 0.008 0.002 0.020 0.027 0.300 0.228 0.011 0.099 236 I 0.020 0.048 0.311 0.094 0.002 0.011 0.047 0.033 0.003 0.001 0.020 0.014 0.177 0.006 0.184 0.029 237 N 0.022 0.041 0.365 0.132 0.004 0.025 0.021 0.004 0.036 0.012 0.004 0.007 0.066 0.004 0.006 0.253 238 P 0.325 0.030 0.188 0.359 0.003 0.020 0.009 0.003 0.002 0.002 0.014 0.004 0.025 0.002 0.002 0.012 239 P 0.013 0.128 0.217 0.399 0.014 0.160 0.006 0.005 0.003 0.003 0.010 0.014 0.017 0.003 0.002 0.007 240 P 0.011 0.028 0.033 0.395 0.004 0.340 0.003 0.013 0.003 0.002 0.133 0.008 0.021 0.001 0.002 0.002 241 Y 0.004 0.702 0.038 0.186 0.001 0.006 0.001 0.001 0.008 0.001 0.002 0.045 0.004 0.001 0.001 0.003 242 L 0.010 0.006 0.091 0.873 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.004 0.001 0.001 0.005 243 T 0.006 0.005 0.746 0.208 0.005 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 244 C 0.002 0.007 0.006 0.153 0.041 0.740 0.002 0.003 0.001 0.002 0.029 0.002 0.011 0.001 0.001 0.001 245 E 0.001 0.512 0.004 0.218 0.002 0.030 0.001 0.044 0.003 0.001 0.127 0.043 0.010 0.001 0.001 0.001 246 S 0.003 0.019 0.003 0.039 0.002 0.477 0.001 0.003 0.011 0.017 0.015 0.313 0.092 0.001 0.001 0.004 247 F 0.002 0.001 0.011 0.002 0.001 0.051 0.001 0.001 0.001 0.001 0.635 0.026 0.267 0.001 0.001 0.001 248 P 0.001 0.005 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.122 0.632 0.233 0.001 0.001 0.001 249 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.051 0.935 0.001 0.001 0.001 250 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.991 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.989 0.001 0.001 0.001 252 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 253 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 254 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 255 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 256 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.953 0.023 0.004 0.016 257 H 0.001 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.891 0.014 0.038 0.027 258 L 0.003 0.002 0.021 0.002 0.004 0.004 0.082 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.616 0.180 0.009 0.070 259 L 0.013 0.020 0.040 0.008 0.006 0.010 0.090 0.019 0.001 0.001 0.018 0.012 0.484 0.085 0.161 0.031