# TARGET T0341 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0341/T0341.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2264 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 S 0.053 0.040 0.093 0.131 0.009 0.131 0.015 0.013 0.007 0.006 0.091 0.098 0.281 0.007 0.009 0.016 2 A 0.016 0.060 0.072 0.088 0.012 0.079 0.019 0.012 0.005 0.004 0.136 0.119 0.335 0.012 0.010 0.022 3 A 0.017 0.044 0.045 0.055 0.006 0.062 0.015 0.018 0.006 0.003 0.116 0.129 0.428 0.009 0.020 0.025 4 R 0.045 0.072 0.149 0.078 0.006 0.048 0.030 0.009 0.019 0.004 0.040 0.073 0.336 0.014 0.024 0.050 5 R 0.053 0.097 0.188 0.172 0.001 0.044 0.015 0.010 0.004 0.002 0.032 0.048 0.267 0.002 0.027 0.037 6 A 0.020 0.217 0.271 0.289 0.001 0.010 0.002 0.001 0.011 0.001 0.005 0.006 0.046 0.001 0.002 0.116 7 L 0.025 0.003 0.090 0.183 0.001 0.639 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.049 0.001 0.001 0.001 8 K 0.001 0.942 0.026 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 9 A 0.001 0.001 0.004 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 V 0.001 0.001 0.922 0.075 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 11 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 12 V 0.001 0.005 0.004 0.970 0.009 0.010 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 13 D 0.001 0.003 0.001 0.054 0.054 0.876 0.001 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 14 L 0.001 0.036 0.001 0.011 0.300 0.014 0.008 0.010 0.001 0.001 0.605 0.002 0.001 0.011 0.001 0.001 15 N 0.001 0.071 0.002 0.011 0.001 0.013 0.001 0.463 0.007 0.002 0.005 0.114 0.001 0.001 0.310 0.001 16 G 0.002 0.006 0.010 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.435 0.022 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.509 17 T 0.958 0.001 0.020 0.009 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.001 0.001 0.002 18 L 0.009 0.016 0.842 0.079 0.004 0.025 0.008 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.007 0.001 0.001 0.003 19 H 0.002 0.052 0.025 0.809 0.017 0.065 0.003 0.005 0.002 0.002 0.006 0.003 0.006 0.001 0.001 0.003 20 I 0.005 0.063 0.026 0.280 0.027 0.489 0.005 0.015 0.009 0.010 0.035 0.013 0.018 0.001 0.001 0.003 21 E 0.010 0.290 0.051 0.164 0.006 0.105 0.005 0.022 0.009 0.007 0.237 0.053 0.033 0.001 0.003 0.005 22 D 0.014 0.041 0.045 0.057 0.005 0.228 0.009 0.006 0.009 0.006 0.087 0.416 0.062 0.004 0.006 0.005 23 A 0.013 0.070 0.115 0.051 0.003 0.039 0.008 0.010 0.004 0.002 0.308 0.120 0.213 0.003 0.013 0.026 24 A 0.018 0.089 0.088 0.103 0.002 0.038 0.004 0.004 0.009 0.003 0.032 0.286 0.267 0.002 0.005 0.052 25 V 0.014 0.003 0.043 0.009 0.027 0.191 0.076 0.001 0.001 0.002 0.037 0.048 0.530 0.012 0.001 0.005 26 P 0.001 0.012 0.009 0.004 0.001 0.031 0.001 0.043 0.001 0.001 0.383 0.054 0.449 0.001 0.011 0.001 27 G 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.008 0.001 0.001 0.007 0.005 0.059 0.343 0.565 0.001 0.001 0.006 28 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.053 0.937 0.001 0.001 0.001 29 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.021 0.972 0.001 0.001 0.001 30 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.991 0.001 0.001 0.001 31 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 32 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 33 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 34 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 35 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.002 0.001 36 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.002 37 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.103 0.861 0.002 0.021 38 T 0.001 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.109 0.003 0.852 0.005 39 S 0.002 0.006 0.037 0.002 0.001 0.002 0.007 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.106 0.003 0.004 0.820 40 V 0.798 0.016 0.046 0.034 0.001 0.006 0.004 0.001 0.001 0.001 0.009 0.008 0.059 0.002 0.002 0.013 41 M 0.018 0.116 0.574 0.081 0.002 0.082 0.007 0.002 0.002 0.001 0.008 0.021 0.068 0.003 0.003 0.012 42 V 0.008 0.062 0.140 0.468 0.007 0.114 0.007 0.006 0.002 0.001 0.086 0.011 0.074 0.003 0.004 0.006 43 R 0.005 0.097 0.130 0.614 0.008 0.027 0.003 0.009 0.003 0.001 0.024 0.031 0.039 0.002 0.003 0.005 44 F 0.012 0.020 0.111 0.598 0.026 0.068 0.011 0.006 0.006 0.004 0.014 0.014 0.083 0.005 0.003 0.016 45 V 0.016 0.050 0.133 0.402 0.115 0.074 0.052 0.013 0.003 0.004 0.029 0.015 0.057 0.020 0.005 0.012 46 T 0.010 0.081 0.037 0.229 0.046 0.315 0.022 0.085 0.008 0.009 0.033 0.032 0.050 0.008 0.023 0.012 47 N 0.015 0.189 0.053 0.171 0.020 0.079 0.016 0.043 0.047 0.033 0.166 0.045 0.054 0.009 0.014 0.048 48 T 0.085 0.114 0.083 0.136 0.013 0.113 0.029 0.017 0.023 0.018 0.066 0.179 0.061 0.015 0.023 0.026 49 T 0.040 0.074 0.144 0.055 0.002 0.184 0.013 0.021 0.007 0.009 0.143 0.111 0.118 0.003 0.044 0.030 50 K 0.040 0.143 0.079 0.056 0.003 0.074 0.007 0.003 0.019 0.005 0.220 0.128 0.139 0.003 0.007 0.075 51 E 0.091 0.158 0.240 0.132 0.001 0.015 0.006 0.004 0.003 0.002 0.032 0.183 0.107 0.003 0.006 0.016 52 T 0.002 0.002 0.015 0.004 0.001 0.786 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.035 0.146 0.001 0.001 0.001 53 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.022 0.001 0.001 0.001 0.001 0.843 0.006 0.127 0.001 0.001 0.001 54 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.891 0.089 0.001 0.001 0.001 55 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.983 0.001 0.001 0.001 56 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 57 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 58 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 59 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.989 0.004 0.001 0.004 60 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.927 0.044 0.005 0.005 61 K 0.001 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.920 0.005 0.045 0.010 62 K 0.004 0.002 0.007 0.002 0.001 0.001 0.031 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.277 0.320 0.009 0.340 63 L 0.036 0.012 0.158 0.006 0.001 0.006 0.059 0.006 0.001 0.001 0.008 0.006 0.336 0.013 0.332 0.021 64 E 0.012 0.061 0.192 0.021 0.002 0.034 0.044 0.005 0.010 0.007 0.022 0.015 0.235 0.029 0.019 0.292 65 F 0.293 0.069 0.120 0.145 0.003 0.023 0.018 0.009 0.007 0.003 0.054 0.054 0.135 0.007 0.025 0.034 66 E 0.029 0.093 0.327 0.113 0.010 0.131 0.026 0.004 0.009 0.005 0.025 0.049 0.109 0.008 0.007 0.054 67 I 0.030 0.117 0.230 0.335 0.013 0.043 0.024 0.014 0.002 0.002 0.061 0.027 0.072 0.005 0.011 0.014 68 S 0.006 0.027 0.036 0.050 0.018 0.672 0.009 0.015 0.005 0.009 0.024 0.062 0.055 0.003 0.005 0.005 69 E 0.007 0.058 0.023 0.031 0.004 0.049 0.005 0.025 0.005 0.003 0.657 0.029 0.085 0.005 0.007 0.009 70 D 0.011 0.051 0.019 0.032 0.001 0.038 0.005 0.005 0.013 0.003 0.030 0.685 0.081 0.003 0.015 0.008 71 E 0.028 0.019 0.103 0.026 0.003 0.029 0.025 0.004 0.005 0.002 0.099 0.061 0.494 0.012 0.017 0.075 72 I 0.032 0.064 0.221 0.058 0.003 0.025 0.024 0.008 0.005 0.001 0.043 0.086 0.329 0.011 0.018 0.072 73 F 0.025 0.061 0.358 0.122 0.003 0.024 0.020 0.004 0.004 0.004 0.009 0.028 0.268 0.004 0.014 0.054 74 T 0.017 0.014 0.088 0.051 0.003 0.303 0.007 0.005 0.001 0.009 0.027 0.033 0.424 0.001 0.003 0.014 75 S 0.002 0.003 0.003 0.002 0.001 0.229 0.001 0.002 0.001 0.001 0.462 0.033 0.261 0.001 0.001 0.001 76 L 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.250 0.504 0.235 0.001 0.001 0.001 77 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.267 0.723 0.001 0.001 0.001 78 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.993 0.001 0.001 0.001 79 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.001 80 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 81 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 82 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 0.002 83 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.002 0.001 84 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.956 0.019 0.005 0.014 85 Q 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.035 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.355 0.543 0.018 0.038 86 K 0.002 0.005 0.053 0.001 0.001 0.001 0.035 0.005 0.001 0.001 0.004 0.004 0.353 0.011 0.491 0.033 87 Q 0.011 0.016 0.059 0.006 0.001 0.010 0.024 0.001 0.008 0.005 0.007 0.008 0.275 0.010 0.012 0.547 88 V 0.422 0.080 0.182 0.055 0.001 0.008 0.013 0.003 0.002 0.001 0.020 0.018 0.131 0.005 0.012 0.047 89 R 0.025 0.048 0.397 0.075 0.004 0.245 0.015 0.003 0.002 0.004 0.012 0.036 0.111 0.003 0.006 0.013 90 P 0.013 0.079 0.092 0.152 0.004 0.158 0.005 0.012 0.002 0.001 0.315 0.025 0.130 0.003 0.004 0.006 91 M 0.009 0.127 0.045 0.240 0.004 0.065 0.005 0.006 0.009 0.002 0.089 0.271 0.114 0.004 0.004 0.008 92 L 0.016 0.030 0.132 0.219 0.005 0.041 0.014 0.006 0.003 0.002 0.052 0.092 0.355 0.004 0.010 0.018 93 L 0.014 0.040 0.141 0.143 0.028 0.111 0.045 0.006 0.004 0.003 0.033 0.046 0.322 0.019 0.006 0.040 94 L 0.015 0.111 0.125 0.226 0.009 0.050 0.017 0.054 0.002 0.003 0.052 0.038 0.226 0.012 0.038 0.022 95 D 0.004 0.010 0.016 0.019 0.001 0.551 0.003 0.009 0.004 0.016 0.028 0.051 0.264 0.002 0.011 0.012 96 D 0.004 0.002 0.002 0.002 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.774 0.021 0.172 0.001 0.001 0.002 97 R 0.003 0.014 0.003 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.040 0.781 0.147 0.001 0.002 0.002 98 A 0.001 0.003 0.014 0.003 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.005 0.040 0.915 0.001 0.002 0.009 99 L 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 0.008 0.007 0.964 0.001 0.001 0.001 100 P 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.015 0.956 0.001 0.001 0.001 101 E 0.001 0.003 0.001 0.005 0.001 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.044 0.925 0.004 0.001 0.005 102 F 0.001 0.001 0.010 0.002 0.001 0.002 0.029 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.903 0.033 0.007 0.006 103 T 0.001 0.003 0.011 0.002 0.001 0.003 0.003 0.004 0.001 0.001 0.007 0.006 0.912 0.002 0.039 0.007 104 G 0.004 0.003 0.006 0.006 0.001 0.004 0.011 0.001 0.005 0.002 0.017 0.010 0.653 0.138 0.004 0.133 105 V 0.031 0.016 0.042 0.011 0.001 0.005 0.022 0.002 0.001 0.001 0.008 0.021 0.691 0.012 0.121 0.016 106 Q 0.004 0.011 0.142 0.016 0.002 0.019 0.037 0.003 0.002 0.002 0.016 0.014 0.554 0.021 0.020 0.136 107 T 0.080 0.069 0.100 0.070 0.007 0.058 0.036 0.007 0.004 0.001 0.042 0.030 0.392 0.017 0.023 0.063 108 Q 0.026 0.213 0.320 0.190 0.002 0.008 0.011 0.009 0.005 0.002 0.016 0.019 0.085 0.008 0.020 0.066 109 D 0.017 0.010 0.093 0.037 0.029 0.593 0.052 0.003 0.002 0.008 0.007 0.021 0.104 0.006 0.006 0.011 110 P 0.005 0.048 0.023 0.014 0.003 0.083 0.007 0.025 0.001 0.001 0.713 0.007 0.059 0.004 0.004 0.003 111 N 0.004 0.391 0.014 0.049 0.001 0.004 0.002 0.004 0.035 0.002 0.005 0.461 0.013 0.001 0.008 0.007 112 A 0.075 0.012 0.355 0.256 0.001 0.010 0.008 0.002 0.013 0.002 0.012 0.008 0.133 0.002 0.009 0.103 113 V 0.018 0.007 0.841 0.092 0.002 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.019 0.001 0.001 0.005 114 V 0.009 0.014 0.060 0.315 0.262 0.211 0.033 0.004 0.001 0.002 0.021 0.005 0.031 0.029 0.001 0.003 115 I 0.003 0.135 0.029 0.487 0.017 0.036 0.004 0.187 0.003 0.001 0.033 0.012 0.025 0.002 0.023 0.002 116 G 0.004 0.039 0.016 0.250 0.017 0.197 0.008 0.018 0.146 0.131 0.025 0.042 0.051 0.003 0.003 0.049 117 L 0.184 0.138 0.110 0.229 0.008 0.034 0.009 0.019 0.008 0.004 0.129 0.038 0.065 0.002 0.007 0.017 118 A 0.021 0.034 0.169 0.150 0.020 0.260 0.019 0.010 0.007 0.013 0.034 0.166 0.075 0.007 0.007 0.010 119 P 0.015 0.065 0.065 0.098 0.016 0.180 0.014 0.028 0.004 0.004 0.256 0.050 0.168 0.010 0.016 0.011 120 E 0.013 0.208 0.028 0.120 0.004 0.053 0.013 0.013 0.028 0.006 0.096 0.200 0.149 0.015 0.014 0.041 121 H 0.042 0.041 0.169 0.097 0.003 0.037 0.029 0.006 0.011 0.005 0.038 0.160 0.296 0.005 0.027 0.034 122 F 0.022 0.029 0.238 0.053 0.004 0.070 0.017 0.005 0.003 0.004 0.044 0.046 0.394 0.003 0.005 0.062 123 H 0.022 0.058 0.099 0.092 0.002 0.066 0.003 0.006 0.002 0.003 0.084 0.101 0.441 0.002 0.004 0.016 124 Y 0.003 0.002 0.008 0.005 0.008 0.317 0.009 0.001 0.001 0.003 0.083 0.088 0.466 0.004 0.001 0.001 125 Q 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.004 0.001 0.001 0.563 0.067 0.350 0.001 0.002 0.001 126 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.541 0.440 0.001 0.001 0.002 127 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.015 0.982 0.001 0.001 0.001 128 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.991 0.001 0.001 0.001 129 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.996 0.001 0.001 0.001 130 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 131 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 132 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 133 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.002 134 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.970 0.019 0.003 0.005 135 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.970 0.001 0.001 136 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.985 0.001 137 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.989 138 A 0.993 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 139 P 0.002 0.127 0.837 0.019 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 140 L 0.001 0.005 0.014 0.956 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 141 I 0.005 0.009 0.267 0.670 0.022 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.003 0.005 0.001 0.001 0.001 142 A 0.003 0.013 0.021 0.798 0.081 0.051 0.007 0.004 0.001 0.002 0.004 0.003 0.008 0.002 0.001 0.002 143 I 0.003 0.057 0.020 0.606 0.059 0.143 0.006 0.056 0.006 0.007 0.015 0.006 0.010 0.002 0.003 0.003 144 H 0.007 0.132 0.013 0.180 0.027 0.420 0.005 0.041 0.025 0.036 0.061 0.025 0.018 0.001 0.003 0.006 145 K 0.026 0.104 0.043 0.127 0.012 0.091 0.005 0.039 0.021 0.022 0.371 0.097 0.029 0.002 0.004 0.007 146 A 0.018 0.067 0.058 0.060 0.006 0.192 0.007 0.011 0.008 0.007 0.100 0.358 0.084 0.004 0.013 0.006 147 R 0.015 0.052 0.055 0.055 0.006 0.058 0.010 0.011 0.007 0.004 0.294 0.114 0.276 0.009 0.011 0.024 148 Y 0.018 0.071 0.066 0.085 0.003 0.039 0.013 0.008 0.009 0.002 0.052 0.274 0.321 0.007 0.013 0.019 149 Y 0.014 0.030 0.135 0.075 0.003 0.046 0.022 0.004 0.006 0.002 0.028 0.050 0.529 0.005 0.012 0.038 150 K 0.014 0.053 0.155 0.137 0.004 0.034 0.015 0.006 0.002 0.002 0.033 0.037 0.462 0.004 0.007 0.034 151 R 0.015 0.014 0.062 0.067 0.024 0.220 0.021 0.005 0.003 0.004 0.035 0.042 0.457 0.013 0.005 0.013 152 K 0.009 0.064 0.056 0.062 0.034 0.036 0.042 0.037 0.002 0.002 0.238 0.039 0.286 0.068 0.013 0.012 153 D 0.005 0.056 0.024 0.061 0.002 0.083 0.005 0.055 0.012 0.004 0.020 0.204 0.317 0.006 0.131 0.017 154 G 0.011 0.007 0.042 0.031 0.004 0.025 0.014 0.003 0.014 0.009 0.115 0.018 0.584 0.013 0.007 0.101 155 L 0.070 0.046 0.065 0.061 0.003 0.012 0.009 0.011 0.002 0.001 0.039 0.160 0.488 0.005 0.017 0.012 156 A 0.009 0.007 0.050 0.030 0.056 0.024 0.120 0.004 0.006 0.004 0.009 0.012 0.177 0.439 0.006 0.048 157 L 0.011 0.045 0.222 0.096 0.009 0.014 0.033 0.059 0.002 0.001 0.014 0.013 0.164 0.004 0.298 0.014 158 G 0.007 0.019 0.050 0.035 0.099 0.076 0.147 0.008 0.029 0.093 0.020 0.020 0.111 0.072 0.004 0.211 159 P 0.302 0.080 0.068 0.098 0.003 0.017 0.005 0.145 0.007 0.003 0.058 0.029 0.079 0.003 0.088 0.013 160 G 0.018 0.037 0.090 0.068 0.003 0.154 0.006 0.005 0.054 0.168 0.052 0.147 0.138 0.002 0.004 0.053 161 P 0.111 0.020 0.025 0.041 0.002 0.131 0.002 0.006 0.001 0.002 0.327 0.113 0.214 0.001 0.002 0.003 162 F 0.002 0.019 0.013 0.018 0.001 0.063 0.001 0.002 0.002 0.001 0.264 0.363 0.248 0.001 0.001 0.002 163 V 0.002 0.020 0.013 0.022 0.001 0.014 0.004 0.001 0.001 0.001 0.026 0.332 0.560 0.001 0.002 0.001 164 T 0.001 0.005 0.005 0.016 0.001 0.019 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.026 0.913 0.001 0.001 0.002 165 A 0.002 0.017 0.017 0.027 0.001 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 0.013 0.033 0.858 0.002 0.001 0.016 166 L 0.002 0.003 0.014 0.022 0.001 0.021 0.005 0.001 0.001 0.001 0.009 0.025 0.891 0.003 0.002 0.002 167 E 0.001 0.031 0.028 0.031 0.001 0.007 0.009 0.001 0.001 0.001 0.007 0.010 0.850 0.008 0.005 0.012 168 Y 0.004 0.015 0.020 0.139 0.001 0.011 0.011 0.001 0.001 0.001 0.006 0.012 0.706 0.008 0.015 0.049 169 A 0.013 0.018 0.245 0.063 0.016 0.021 0.125 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 0.322 0.054 0.010 0.099 170 T 0.022 0.143 0.200 0.270 0.005 0.034 0.019 0.032 0.002 0.001 0.012 0.008 0.155 0.007 0.051 0.040 171 D 0.015 0.061 0.091 0.167 0.010 0.354 0.012 0.010 0.020 0.035 0.027 0.017 0.114 0.005 0.006 0.057 172 T 0.045 0.073 0.046 0.058 0.006 0.196 0.008 0.011 0.003 0.003 0.396 0.032 0.109 0.003 0.004 0.006 173 K 0.009 0.294 0.067 0.076 0.002 0.036 0.003 0.011 0.010 0.001 0.096 0.322 0.054 0.004 0.006 0.008 174 A 0.019 0.056 0.174 0.262 0.005 0.046 0.014 0.006 0.010 0.002 0.037 0.088 0.231 0.006 0.016 0.028 175 M 0.019 0.050 0.419 0.197 0.005 0.028 0.012 0.004 0.003 0.002 0.013 0.018 0.189 0.002 0.006 0.032 176 V 0.026 0.019 0.116 0.316 0.089 0.082 0.072 0.011 0.003 0.005 0.044 0.014 0.109 0.074 0.003 0.017 177 V 0.016 0.129 0.148 0.387 0.009 0.028 0.010 0.075 0.007 0.002 0.012 0.018 0.082 0.004 0.060 0.014 178 G 0.015 0.022 0.069 0.438 0.008 0.062 0.009 0.007 0.046 0.084 0.031 0.020 0.086 0.004 0.003 0.096 179 K 0.217 0.046 0.118 0.266 0.027 0.099 0.012 0.005 0.003 0.004 0.053 0.037 0.096 0.003 0.002 0.011 180 P 0.012 0.066 0.094 0.318 0.007 0.096 0.003 0.029 0.002 0.009 0.141 0.107 0.104 0.002 0.004 0.006 181 E 0.002 0.013 0.006 0.025 0.002 0.534 0.001 0.004 0.003 0.008 0.058 0.127 0.215 0.001 0.001 0.001 182 K 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.030 0.001 0.001 0.001 0.001 0.560 0.056 0.350 0.001 0.001 0.001 183 T 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.816 0.162 0.001 0.001 0.001 184 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.979 0.001 0.001 0.001 185 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.992 0.001 0.001 0.001 186 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 187 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 188 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 189 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 190 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.984 0.006 0.004 0.004 191 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.983 0.001 0.003 192 A 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.978 0.001 193 D 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.983 194 C 0.970 0.003 0.018 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 195 A 0.002 0.002 0.144 0.002 0.002 0.841 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 196 P 0.001 0.007 0.001 0.003 0.001 0.063 0.001 0.002 0.001 0.001 0.922 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 197 E 0.001 0.467 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 0.509 0.001 0.001 0.001 0.001 198 E 0.026 0.018 0.603 0.247 0.001 0.004 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.004 0.046 0.001 0.007 0.036 199 A 0.001 0.001 0.976 0.018 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 200 V 0.004 0.009 0.154 0.819 0.003 0.004 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 201 M 0.001 0.003 0.007 0.812 0.141 0.028 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 202 I 0.002 0.031 0.015 0.639 0.080 0.081 0.002 0.132 0.001 0.001 0.007 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 203 G 0.001 0.082 0.005 0.195 0.013 0.429 0.001 0.047 0.066 0.103 0.038 0.010 0.004 0.001 0.001 0.005 204 D 0.068 0.178 0.012 0.133 0.006 0.071 0.003 0.020 0.022 0.032 0.295 0.142 0.013 0.001 0.001 0.003 205 D 0.009 0.045 0.023 0.027 0.002 0.357 0.002 0.006 0.002 0.002 0.065 0.396 0.055 0.001 0.004 0.002 206 C 0.003 0.006 0.024 0.009 0.003 0.038 0.004 0.004 0.001 0.002 0.595 0.087 0.211 0.005 0.004 0.006 207 R 0.005 0.030 0.009 0.018 0.001 0.010 0.003 0.004 0.002 0.001 0.080 0.566 0.247 0.006 0.012 0.005 208 D 0.006 0.004 0.013 0.011 0.001 0.008 0.002 0.003 0.004 0.002 0.026 0.032 0.830 0.003 0.014 0.041 209 D 0.002 0.005 0.011 0.001 0.001 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 0.009 0.033 0.912 0.001 0.001 0.007 210 V 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.023 0.005 0.001 0.001 0.001 0.043 0.025 0.894 0.002 0.001 0.001 211 D 0.001 0.017 0.004 0.007 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.021 0.096 0.840 0.001 0.007 0.001 212 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.960 0.002 0.001 0.016 213 A 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.002 0.018 0.001 0.001 0.001 0.006 0.003 0.952 0.006 0.001 0.002 214 Q 0.001 0.004 0.004 0.001 0.001 0.002 0.003 0.002 0.001 0.001 0.003 0.011 0.955 0.001 0.011 0.002 215 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.033 0.897 0.001 0.030 216 I 0.003 0.001 0.015 0.002 0.001 0.001 0.005 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.047 0.001 0.897 0.002 217 G 0.001 0.017 0.029 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.036 0.006 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.891 218 M 0.964 0.001 0.006 0.021 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 219 L 0.002 0.220 0.711 0.058 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 220 G 0.001 0.001 0.009 0.974 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 221 I 0.001 0.023 0.203 0.760 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 222 L 0.001 0.001 0.008 0.980 0.004 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 223 V 0.002 0.010 0.023 0.601 0.170 0.182 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 224 K 0.001 0.050 0.003 0.205 0.499 0.159 0.010 0.026 0.001 0.004 0.031 0.001 0.002 0.007 0.001 0.001 225 T 0.002 0.197 0.006 0.202 0.013 0.068 0.002 0.380 0.023 0.008 0.035 0.034 0.003 0.001 0.024 0.001 226 G 0.014 0.048 0.032 0.091 0.015 0.092 0.012 0.017 0.195 0.227 0.109 0.058 0.030 0.003 0.004 0.052 227 K 0.294 0.132 0.096 0.133 0.006 0.020 0.009 0.020 0.011 0.004 0.098 0.114 0.034 0.004 0.011 0.014 228 Y 0.025 0.053 0.278 0.208 0.008 0.125 0.014 0.013 0.011 0.011 0.025 0.112 0.081 0.004 0.013 0.019 229 K 0.023 0.072 0.112 0.176 0.009 0.249 0.010 0.013 0.006 0.008 0.084 0.050 0.162 0.002 0.007 0.017 230 A 0.018 0.060 0.041 0.112 0.010 0.164 0.008 0.011 0.007 0.005 0.262 0.112 0.172 0.006 0.003 0.011 231 A 0.016 0.083 0.088 0.124 0.004 0.052 0.008 0.023 0.005 0.003 0.087 0.265 0.212 0.006 0.015 0.009 232 D 0.007 0.019 0.037 0.047 0.003 0.185 0.008 0.007 0.005 0.004 0.043 0.100 0.495 0.007 0.012 0.021 233 E 0.011 0.023 0.052 0.034 0.003 0.029 0.014 0.005 0.003 0.001 0.200 0.045 0.533 0.013 0.010 0.026 234 E 0.012 0.028 0.054 0.050 0.003 0.027 0.011 0.008 0.003 0.001 0.035 0.169 0.553 0.008 0.021 0.017 235 K 0.014 0.016 0.069 0.028 0.020 0.020 0.095 0.005 0.005 0.002 0.020 0.013 0.319 0.257 0.012 0.104 236 I 0.024 0.053 0.213 0.081 0.004 0.012 0.056 0.049 0.003 0.001 0.023 0.015 0.178 0.014 0.236 0.038 237 N 0.029 0.047 0.317 0.094 0.004 0.039 0.031 0.005 0.047 0.019 0.005 0.010 0.091 0.004 0.012 0.245 238 P 0.390 0.047 0.180 0.245 0.003 0.020 0.011 0.004 0.003 0.003 0.028 0.007 0.034 0.002 0.003 0.021 239 P 0.022 0.160 0.279 0.403 0.007 0.059 0.006 0.004 0.004 0.002 0.007 0.018 0.014 0.004 0.003 0.010 240 P 0.015 0.014 0.056 0.415 0.003 0.385 0.004 0.009 0.002 0.002 0.061 0.006 0.022 0.001 0.003 0.002 241 Y 0.003 0.769 0.035 0.159 0.001 0.004 0.001 0.001 0.004 0.001 0.002 0.017 0.002 0.001 0.001 0.002 242 L 0.006 0.004 0.047 0.934 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 243 T 0.004 0.003 0.778 0.180 0.004 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 244 C 0.001 0.004 0.003 0.099 0.035 0.808 0.001 0.002 0.001 0.001 0.037 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 245 E 0.001 0.621 0.002 0.158 0.001 0.019 0.001 0.040 0.002 0.001 0.092 0.057 0.005 0.001 0.001 0.001 246 S 0.002 0.012 0.002 0.031 0.001 0.525 0.001 0.002 0.010 0.014 0.011 0.284 0.101 0.001 0.001 0.003 247 F 0.002 0.001 0.012 0.001 0.001 0.033 0.001 0.001 0.001 0.001 0.649 0.020 0.279 0.001 0.001 0.001 248 P 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.088 0.635 0.267 0.001 0.001 0.001 249 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.027 0.963 0.001 0.001 0.001 250 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.992 0.001 0.001 0.001 251 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.991 0.001 0.001 0.001 252 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.995 0.001 0.001 0.001 253 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.993 0.001 0.001 0.002 254 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.003 0.001 0.001 255 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.003 0.002 256 Q 0.001 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.834 0.070 0.011 0.064 257 H 0.006 0.002 0.052 0.003 0.001 0.002 0.025 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.765 0.021 0.077 0.040 258 L 0.008 0.011 0.061 0.006 0.008 0.013 0.100 0.002 0.001 0.001 0.013 0.006 0.508 0.133 0.013 0.117 259 L 0.038 0.046 0.074 0.029 0.017 0.023 0.106 0.030 0.003 0.001 0.033 0.032 0.348 0.076 0.109 0.037