# cost function cost = # ( 15 * wet6.5(6.5, /log(length)) + 5 * near_backbone(9.65) + 5 * way_back(8.9) + 15 * dry5(5) + 25 * dry6.5(6.5) + 20 * dry8(8) + 5 * dry12(12) + 3 * phobic_fit + 5 * sidechain + 5 * n_ca_c + 10 * bad_peptide + 5 * bystroff + 40 * soft_clashes + 2 * backbone_clashes + 100 * break + 2 * pred_alpha2k + 3 * pred_alpha04 + 4 * pred_alpha06 + 10 * hbond_geom + 10 * hbond_geom_backbone + 50 * hbond_geom_beta + 100 * hbond_geom_beta_pair + 1 * missing_atoms + 0.5 * maybe_metal + 1 * maybe_ssbond ) name length wet6.5 near_backbone way_back dry5 dry6.5 dry8 dry12 phobic_fit sidechain n_ca_c bad_peptide bystroff soft_clashes backbone_clashes break pred_alpha2k pred_alpha04 pred_alpha06 hbond_geom hbond_geom_backbone hbond_geom_beta hbond_geom_beta_pair missing_atoms maybe_metal maybe_ssbond cost 10S 5N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N T0339.try13-opt2.pdb.gz 416 0.5166 1.7020 1.7137 3.0189 2.9826 3.2123 3.4381 0.8459 -5.0910 0.4121 0.1123 -0.2010 0.0727 0.0168 0.0487 0.1607 0.1677 0.1592 -0.6073 -0.4119 -0.1028 -0.0717 0.0000 0.0000 0.0000 192.1407 T0339.try13-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5236 1.7020 1.7137 3.0444 3.0107 3.2297 3.4362 0.8388 -4.8073 0.4121 0.1123 -0.2010 0.0487 0.0168 0.0487 0.1607 0.1677 0.1592 -0.6143 -0.4119 -0.1028 -0.0717 0.0000 0.0000 0.0000 194.0362 T0339.try13-opt1.pdb.gz 416 0.5175 1.7028 1.7104 3.0146 3.0014 3.2141 3.4388 0.8498 -5.1414 0.3941 0.1145 -0.1929 0.1030 0.0240 0.0549 0.1719 0.1831 0.1750 -0.5920 -0.4044 -0.1011 -0.0707 0.0000 0.0000 0.0000 194.7179 T0339.try14-opt2.pdb.gz 416 0.5113 1.6934 1.7091 2.9919 2.9908 3.2193 3.4234 0.8947 -4.9475 0.4355 0.1118 -0.1522 0.1098 0.0433 0.0524 0.1871 0.1948 0.1902 -0.6042 -0.4044 -0.1066 -0.0721 0.0000 0.0000 0.0000 195.1307 T0339.try4-opt2.pdb.gz 416 0.5221 1.6862 1.7318 3.0454 3.0018 3.2140 3.4443 1.0397 -5.1529 0.5747 0.1230 -0.2129 0.1314 0.0553 0.0585 0.1483 0.1690 0.1610 -0.6007 -0.4039 -0.1115 -0.0805 0.0000 0.0000 0.0000 196.5373 T0339.try10-opt2.pdb.gz 416 0.5180 1.6936 1.7111 3.0077 2.9969 3.2081 3.4360 0.8554 -5.2906 0.3204 0.1301 -0.1919 0.1159 0.0144 0.0816 0.1777 0.1944 0.1865 -0.5775 -0.4027 -0.1015 -0.0704 0.0000 0.0000 0.0000 196.8196 T0339.try12-opt2.pdb.gz 416 0.5216 1.6529 1.6990 3.0134 2.9744 3.2253 3.4494 0.9462 -4.6127 0.8280 0.1816 -0.1837 0.0260 0.0337 0.0312 0.4084 0.3733 0.3461 -0.6093 -0.4138 -0.0894 -0.0641 0.0000 0.0000 0.0000 197.1470 T0339.try14-opt1.pdb.gz 416 0.5085 1.6872 1.7036 2.9909 2.9964 3.2241 3.4225 0.9213 -4.9570 0.4196 0.1129 -0.1474 0.1292 0.0577 0.0599 0.2058 0.2140 0.2106 -0.5911 -0.3980 -0.1057 -0.0717 0.0000 0.0000 0.0000 197.2409 T0339.try14-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5177 1.6934 1.7091 3.0628 3.0389 3.2478 3.4281 0.8897 -4.9941 0.4355 0.1118 -0.1522 0.1027 0.0433 0.0524 0.1871 0.1948 0.1902 -0.5911 -0.4044 -0.1066 -0.0721 0.0000 0.0000 0.0000 197.6846 T0339.try9-opt2.pdb.gz 416 0.5230 1.6474 1.6918 3.0112 2.9849 3.2347 3.4551 0.9577 -5.2379 0.7201 0.1302 -0.1876 0.1008 0.0457 0.0675 0.1475 0.1495 0.1283 -0.6020 -0.4204 -0.0927 -0.0646 0.0000 0.0000 0.0000 197.7543 T0339.try3-opt2.pdb.gz 416 0.5192 1.6773 1.7258 3.0261 2.9798 3.2070 3.4390 1.0597 -4.9474 0.5881 0.1191 -0.1914 0.1625 0.0745 0.0570 0.1476 0.1439 0.1500 -0.5662 -0.3972 -0.1073 -0.0792 0.0000 0.0000 0.0000 198.3952 T0339.try13-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5177 1.7062 1.7376 3.0310 2.9991 3.2127 3.4405 0.8446 -4.1411 0.2530 0.2194 -0.1559 0.0167 0.0096 0.0273 0.5687 0.6594 0.6490 -0.6037 -0.3997 -0.1011 -0.0703 0.0000 0.0000 0.0000 198.3981 T0339.try11-opt2.pdb.gz 416 0.5064 1.6745 1.7035 2.9944 2.9940 3.2184 3.4221 0.9187 -5.1295 0.3963 0.1208 -0.1463 0.1522 0.0721 0.0759 0.1820 0.1905 0.1873 -0.5843 -0.3962 -0.1055 -0.0714 0.0000 0.0000 0.0000 198.5885 T0339.try10-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5251 1.6936 1.7111 3.0445 3.0313 3.2277 3.4369 0.8410 -4.8425 0.3204 0.1301 -0.1919 0.0699 0.0144 0.0816 0.1777 0.1944 0.1865 -0.5941 -0.4027 -0.1015 -0.0704 0.0000 0.0000 0.0000 198.9260 T0339.try4-opt1.pdb.gz 416 0.5243 1.6898 1.7302 3.0523 3.0045 3.2111 3.4453 1.0310 -5.1694 0.5616 0.1247 -0.2125 0.1702 0.0625 0.0614 0.1910 0.2089 0.2019 -0.5855 -0.4019 -0.1119 -0.0801 0.0000 0.0000 0.0000 198.9571 T0339.try12-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5312 1.6529 1.6990 3.0413 3.0096 3.2373 3.4516 0.9302 -4.6436 0.8280 0.1816 -0.1837 0.0357 0.0337 0.0312 0.4084 0.3733 0.3461 -0.5891 -0.4138 -0.0894 -0.0641 0.0000 0.0000 0.0000 199.2250 T0339.try12-opt1.pdb.gz 416 0.5234 1.6530 1.7043 3.0260 2.9916 3.2299 3.4539 0.9508 -4.5330 0.8068 0.2015 -0.1676 0.0351 0.0433 0.0298 0.4182 0.3837 0.3606 -0.6032 -0.4051 -0.0882 -0.0620 0.0000 0.0000 0.0000 199.2866 T0339.try2-opt2.pdb.gz 416 0.5266 1.6896 1.7236 3.0522 3.0098 3.2137 3.4468 1.0320 -5.2298 0.4410 0.1308 -0.2066 0.1794 0.0553 0.0757 0.1500 0.1732 0.1779 -0.5836 -0.4046 -0.1110 -0.0805 0.0000 0.0000 0.0000 199.8364 T0339.try9-opt1.pdb.gz 416 0.5230 1.6426 1.6884 3.0158 2.9978 3.2406 3.4584 0.9495 -5.3099 0.7474 0.1312 -0.1839 0.1426 0.0409 0.0702 0.1194 0.1205 0.1119 -0.5871 -0.4150 -0.0904 -0.0635 0.0000 0.0000 0.0000 200.1810 T0339.try13-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5249 1.7062 1.7376 3.0520 3.0278 3.2334 3.4415 0.8212 -4.0585 0.2530 0.2194 -0.1559 0.0192 0.0096 0.0273 0.5687 0.6594 0.6490 -0.5924 -0.3997 -0.1011 -0.0703 0.0000 0.0000 0.0000 200.5109 T0339.try3-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5223 1.6773 1.7258 3.0605 3.0273 3.2413 3.4445 1.0544 -4.7526 0.5881 0.1191 -0.1914 0.1311 0.0745 0.0570 0.1476 0.1439 0.1500 -0.5530 -0.3972 -0.1073 -0.0792 0.0000 0.0000 0.0000 200.6932 T0339.try2-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5262 1.6896 1.7236 3.0623 3.0347 3.2387 3.4453 1.0356 -4.9302 0.4410 0.1308 -0.2066 0.1276 0.0553 0.0757 0.1500 0.1732 0.1779 -0.5621 -0.4046 -0.1110 -0.0805 0.0000 0.0000 0.0000 200.7458 T0339.try7-opt2.pdb.gz 416 0.5234 1.6486 1.6861 3.0172 3.0021 3.2449 3.4588 0.9439 -5.3989 0.5324 0.1412 -0.1815 0.1490 0.0433 0.0892 0.1026 0.1179 0.1000 -0.5851 -0.4144 -0.0914 -0.0639 0.0000 0.0000 0.0000 201.0008 T0339.try10-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5166 1.7163 1.7258 3.0287 2.9998 3.2132 3.4376 0.8544 -4.2329 0.2872 0.2333 -0.1539 0.0291 0.0192 0.0499 0.5144 0.5885 0.5850 -0.5819 -0.3884 -0.0988 -0.0682 0.0000 0.0000 0.0000 201.0946 T0339.try11-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5165 1.6745 1.7035 3.0762 3.0293 3.2391 3.4279 0.9024 -5.0477 0.3963 0.1208 -0.1463 0.1386 0.0721 0.0759 0.1820 0.1905 0.1873 -0.5763 -0.3962 -0.1055 -0.0714 0.0000 0.0000 0.0000 201.1876 T0339.try10-opt1.pdb.gz 416 0.5211 1.7121 1.7152 3.0205 3.0148 3.2172 3.4431 0.8863 -5.2505 0.3090 0.1306 -0.1928 0.1695 0.0312 0.0911 0.2036 0.2216 0.2195 -0.5719 -0.3969 -0.0992 -0.0681 0.0000 0.0000 0.0000 201.9299 T0339.try7-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5262 1.6486 1.6861 3.0671 3.0329 3.2699 3.4574 0.9427 -5.0630 0.5324 0.1412 -0.1815 0.1021 0.0433 0.0892 0.1026 0.1179 0.1000 -0.5970 -0.4144 -0.0914 -0.0639 0.0000 0.0000 0.0000 202.7352 T0339.try11-opt1.pdb.gz 416 0.5102 1.6806 1.7178 3.0270 3.0138 3.2457 3.4294 0.9563 -5.1732 0.3852 0.1160 -0.1309 0.2003 0.0697 0.0740 0.2328 0.2471 0.2440 -0.5613 -0.3902 -0.1023 -0.0705 0.0000 0.0000 0.0000 202.9397 T0339.try16-opt2.pdb.gz 416 0.5200 1.6770 1.7062 3.0123 3.0057 3.2657 3.4670 1.1128 -5.2613 0.5573 0.1661 -0.1364 0.1738 0.0865 0.0938 0.0986 0.1224 0.0995 -0.5656 -0.4273 -0.1028 -0.0785 0.0000 0.0000 0.0000 203.0427 T0339.try12-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5231 1.6514 1.6959 3.0295 2.9864 3.2294 3.4509 0.9447 -3.9201 0.4217 0.2618 -0.1568 0.0122 0.0144 0.0421 0.6894 0.6587 0.6273 -0.5988 -0.4010 -0.0879 -0.0631 0.0000 0.0000 0.0000 203.5922 T0339.try13-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5284 1.7028 1.7104 3.0735 3.0316 3.2390 3.4384 0.8291 -5.4381 0.3941 0.1145 -0.1929 0.3045 0.0240 0.0549 0.1719 0.1831 0.1750 -0.5619 -0.4044 -0.1011 -0.0707 0.0000 0.0000 0.0000 203.8296 T0339.try14-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5122 1.7018 1.7108 3.0227 3.0120 3.2316 3.4243 0.8934 -3.7924 0.3660 0.2199 -0.1363 0.0288 0.0264 0.0477 0.6199 0.6540 0.6501 -0.5971 -0.4002 -0.1028 -0.0701 0.0000 0.0000 0.0000 203.8611 T0339.try10-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5319 1.7163 1.7258 3.0721 3.0254 3.2318 3.4446 0.8183 -4.0765 0.2872 0.2333 -0.1539 0.0353 0.0192 0.0499 0.5144 0.5885 0.5850 -0.5712 -0.3884 -0.0988 -0.0682 0.0000 0.0000 0.0000 204.0494 T0339.try3-opt1.pdb.gz 416 0.5248 1.6783 1.7283 3.0607 3.0029 3.2196 3.4437 1.0455 -4.9292 0.5882 0.1229 -0.1871 0.2285 0.0913 0.0651 0.1864 0.2090 0.2115 -0.5527 -0.3916 -0.1077 -0.0798 0.0000 0.0000 0.0000 204.0911 T0339.try16-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5195 1.6770 1.7062 3.0337 3.0452 3.2856 3.4651 1.0537 -5.1297 0.5573 0.1661 -0.1364 0.1435 0.0865 0.0938 0.0986 0.1224 0.0995 -0.5455 -0.4273 -0.1028 -0.0785 0.0000 0.0000 0.0000 204.2032 T0339.try2-opt1.pdb.gz 416 0.5317 1.6841 1.7253 3.0727 3.0291 3.2270 3.4500 1.0321 -5.1790 0.4381 0.1309 -0.2104 0.2396 0.0841 0.0778 0.2027 0.2128 0.2095 -0.5652 -0.4018 -0.1097 -0.0800 0.0000 0.0000 0.0000 204.5383 T0339.try3-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5219 1.6934 1.7279 3.0509 2.9862 3.2151 3.4389 1.0602 -3.5587 0.3584 0.2383 -0.1625 0.0372 0.0337 0.0444 0.6734 0.6957 0.6751 -0.5777 -0.3969 -0.1060 -0.0778 0.0000 0.0000 0.0000 204.9110 T0339.try12-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5250 1.6514 1.6959 3.0488 3.0152 3.2378 3.4489 0.9273 -3.9843 0.4217 0.2618 -0.1568 0.0241 0.0144 0.0421 0.6894 0.6587 0.6273 -0.5888 -0.4010 -0.0879 -0.0631 0.0000 0.0000 0.0000 204.9933 T0339.try4-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5245 1.6886 1.7312 3.0711 3.0092 3.2226 3.4448 1.0404 -3.6045 0.3762 0.2423 -0.1840 0.0300 0.0361 0.0483 0.6515 0.6797 0.6561 -0.6015 -0.3949 -0.1103 -0.0785 0.0000 0.0000 0.0000 205.1567 T0339.try7-opt1.pdb.gz 416 0.5248 1.6452 1.6894 3.0339 3.0079 3.2391 3.4553 0.9467 -5.3061 0.5342 0.1457 -0.1773 0.2155 0.0673 0.0954 0.1215 0.1431 0.1283 -0.5717 -0.4089 -0.0871 -0.0621 0.0000 0.0000 0.0000 205.9617 T0339.try14-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5188 1.7018 1.7108 3.0841 3.0456 3.2434 3.4314 0.8721 -3.7680 0.3660 0.2199 -0.1363 0.0350 0.0264 0.0477 0.6199 0.6540 0.6501 -0.6149 -0.4002 -0.1028 -0.0701 0.0000 0.0000 0.0000 206.1249 T0339.try14-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5201 1.6872 1.7036 3.0561 3.0551 3.2514 3.4295 0.9279 -5.4086 0.4196 0.1129 -0.1474 0.3184 0.0577 0.0599 0.2058 0.2140 0.2106 -0.5276 -0.3980 -0.1057 -0.0717 0.0000 0.0000 0.0000 206.4071 T0339.try8-opt2.pdb.gz 416 0.5128 1.6810 1.7222 3.0364 3.0139 3.2397 3.4287 0.9406 -5.2981 0.2912 0.1280 -0.1256 0.2441 0.0697 0.0995 0.2389 0.2572 0.2503 -0.5498 -0.3885 -0.1028 -0.0710 0.0000 0.0000 0.0000 206.4602 T0339.try4-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5276 1.6898 1.7302 3.1039 3.0371 3.2385 3.4538 1.0153 -5.5531 0.5616 0.1247 -0.2125 0.3428 0.0625 0.0614 0.1910 0.2089 0.2019 -0.5493 -0.4019 -0.1119 -0.0801 0.0000 0.0000 0.0000 206.4871 T0339.try9-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5229 1.6474 1.7028 3.0385 2.9974 3.2407 3.4551 0.9566 -3.9960 0.5959 0.2479 -0.1634 0.0249 0.0312 0.0612 0.6447 0.6207 0.5944 -0.5957 -0.4037 -0.0909 -0.0639 0.0000 0.0000 0.0000 206.5048 T0339.try8-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5190 1.6810 1.7222 3.0908 3.0298 3.2522 3.4287 0.9536 -4.9085 0.2912 0.1280 -0.1256 0.1637 0.0697 0.0995 0.2389 0.2572 0.2503 -0.5639 -0.3885 -0.1028 -0.0710 0.0000 0.0000 0.0000 206.6434 T0339.try11-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5074 1.7004 1.7160 3.0176 3.0104 3.2262 3.4234 0.9175 -3.5878 0.4002 0.2288 -0.1113 0.0417 0.0337 0.0509 0.6303 0.6766 0.6725 -0.5777 -0.3886 -0.1012 -0.0672 0.0000 0.0000 0.0000 206.7685 T0339.try6-opt2.pdb.gz 416 0.5198 1.7161 1.7349 3.0109 3.0215 3.2191 3.4321 0.8931 -5.3157 0.3005 0.1379 -0.1931 0.2262 0.0697 0.1190 0.1964 0.2136 0.2031 -0.5495 -0.3938 -0.0999 -0.0699 0.0000 0.0000 0.0000 206.8313 T0339.try2-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5281 1.6951 1.7385 3.0755 3.0189 3.2187 3.4463 1.0323 -3.6161 0.4626 0.2496 -0.1721 0.0427 0.0312 0.0516 0.6559 0.6791 0.6593 -0.5849 -0.3970 -0.1095 -0.0790 0.0000 0.0000 0.0000 206.9855 T0339.try6-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5274 1.7161 1.7349 3.0519 3.0268 3.2265 3.4329 0.8887 -4.7741 0.3005 0.1379 -0.1931 0.1491 0.0697 0.1190 0.1964 0.2136 0.2031 -0.5951 -0.3938 -0.0999 -0.0699 0.0000 0.0000 0.0000 206.9978 T0339.try3-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5283 1.6934 1.7279 3.0730 3.0260 3.2432 3.4415 1.0643 -3.4581 0.3584 0.2383 -0.1625 0.0360 0.0337 0.0444 0.6734 0.6957 0.6751 -0.5716 -0.3969 -0.1060 -0.0778 0.0000 0.0000 0.0000 207.4355 T0339.try7-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5257 1.6526 1.6987 3.0562 3.0120 3.2431 3.4589 0.9421 -4.1127 0.6099 0.2505 -0.1537 0.0354 0.0312 0.0648 0.6003 0.5765 0.5487 -0.5880 -0.3974 -0.0890 -0.0631 0.0000 0.0000 0.0000 207.4557 T0339.try6-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5201 1.7262 1.7442 3.0372 3.0325 3.2214 3.4347 0.8935 -4.2076 0.6190 0.2452 -0.1353 0.0617 0.0577 0.0729 0.4966 0.5559 0.5645 -0.5697 -0.3830 -0.0989 -0.0696 0.0000 0.0000 0.0000 207.9917 T0339.try5-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5248 1.6424 1.6931 3.0561 3.0120 3.2655 3.4521 0.9381 -4.9720 0.3878 0.1636 -0.1742 0.1566 0.0577 0.1219 0.1128 0.1354 0.1274 -0.5825 -0.4078 -0.0891 -0.0620 0.0000 0.0000 0.0000 208.0736 T0339.try11-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5172 1.7004 1.7160 3.0764 3.0395 3.2413 3.4295 0.8983 -3.5933 0.4002 0.2288 -0.1113 0.0458 0.0337 0.0509 0.6303 0.6766 0.6725 -0.6218 -0.3886 -0.1012 -0.0672 0.0000 0.0000 0.0000 208.4955 T0339.try11-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5151 1.6806 1.7178 3.0595 3.0528 3.2629 3.4309 0.9366 -5.3958 0.3852 0.1160 -0.1309 0.3107 0.0697 0.0740 0.2328 0.2471 0.2440 -0.5182 -0.3902 -0.1023 -0.0705 0.0000 0.0000 0.0000 208.5009 T0339.try4-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5269 1.6886 1.7312 3.0872 3.0556 3.2542 3.4449 1.0380 -3.4577 0.3762 0.2423 -0.1840 0.0360 0.0361 0.0483 0.6515 0.6797 0.6561 -0.5658 -0.3949 -0.1103 -0.0785 0.0000 0.0000 0.0000 208.5539 T0339.try10-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5274 1.7121 1.7152 3.0752 3.0538 3.2367 3.4426 0.8744 -5.4156 0.3090 0.1306 -0.1928 0.2957 0.0312 0.0911 0.2036 0.2216 0.2195 -0.5496 -0.3969 -0.0992 -0.0681 0.0000 0.0000 0.0000 208.6139 T0339.try1-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5285 1.6776 1.7164 3.0663 3.0393 3.2472 3.4497 1.0462 -4.9140 0.4076 0.1440 -0.1950 0.2113 0.0913 0.1120 0.1878 0.2073 0.2074 -0.5528 -0.4002 -0.1087 -0.0803 0.0000 0.0000 0.0000 208.8095 T0339.try9-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5328 1.6474 1.7028 3.0483 3.0259 3.2512 3.4507 0.9511 -3.8993 0.5959 0.2479 -0.1634 0.0383 0.0312 0.0612 0.6447 0.6207 0.5944 -0.5795 -0.4037 -0.0909 -0.0639 0.0000 0.0000 0.0000 208.8636 T0339.try9-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5326 1.6426 1.6884 3.0739 3.0363 3.2680 3.4603 0.9445 -5.7038 0.7474 0.1312 -0.1839 0.3401 0.0409 0.0702 0.1194 0.1205 0.1119 -0.5561 -0.4150 -0.0904 -0.0635 0.0000 0.0000 0.0000 208.9443 T0339.try3-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5295 1.6783 1.7283 3.0904 3.0233 3.2399 3.4532 1.0518 -5.3142 0.5882 0.1229 -0.1871 0.3579 0.0913 0.0651 0.1864 0.2090 0.2115 -0.5378 -0.3916 -0.1077 -0.0798 0.0000 0.0000 0.0000 208.9916 T0339.try7-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5331 1.6526 1.6987 3.0559 3.0340 3.2586 3.4572 0.9420 -4.0028 0.6099 0.2505 -0.1537 0.0359 0.0312 0.0648 0.6003 0.5765 0.5487 -0.5783 -0.3974 -0.0890 -0.0631 0.0000 0.0000 0.0000 209.0773 T0339.try1-opt2.pdb.gz 416 0.5267 1.6776 1.7164 3.0589 3.0170 3.2212 3.4454 1.0477 -5.2835 0.4076 0.1440 -0.1950 0.3022 0.0913 0.1120 0.1878 0.2073 0.2074 -0.5535 -0.4002 -0.1087 -0.0803 0.0000 0.0000 0.0000 209.3593 T0339.try16-opt1.pdb.gz 416 0.5193 1.6914 1.7034 3.0241 3.0118 3.2815 3.4711 1.1323 -5.2839 0.4363 0.1757 -0.1399 0.2611 0.1250 0.1122 0.1557 0.1876 0.1603 -0.5539 -0.4237 -0.1023 -0.0774 0.0000 0.0000 0.0000 209.4223 T0339.try2-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5335 1.6841 1.7253 3.1142 3.0410 3.2441 3.4530 1.0425 -5.4616 0.4381 0.1309 -0.2104 0.3577 0.0841 0.0778 0.2027 0.2128 0.2095 -0.5372 -0.4018 -0.1097 -0.0800 0.0000 0.0000 0.0000 209.4660 T0339.try12-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5325 1.6530 1.7043 3.0824 3.0199 3.2462 3.4582 0.9641 -5.2230 0.8068 0.2015 -0.1676 0.3133 0.0433 0.0298 0.4182 0.3837 0.3606 -0.5508 -0.4051 -0.0882 -0.0620 0.0000 0.0000 0.0000 209.5661 T0339.try6-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5245 1.7262 1.7442 3.0808 3.0520 3.2347 3.4343 0.8775 -4.1103 0.6190 0.2452 -0.1353 0.0549 0.0577 0.0729 0.4966 0.5559 0.5645 -0.5731 -0.3830 -0.0989 -0.0696 0.0000 0.0000 0.0000 209.5968 T0339.try8-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5127 1.6883 1.7046 3.0508 3.0317 3.2483 3.4318 0.9413 -3.8407 0.5308 0.2344 -0.0989 0.0638 0.0361 0.0646 0.5994 0.6411 0.6355 -0.5620 -0.3781 -0.1015 -0.0675 0.0000 0.0000 0.0000 209.9814 T0339.try5-opt2.pdb.gz 416 0.5254 1.6424 1.6931 3.0466 3.0005 3.2417 3.4563 0.9422 -5.4245 0.3878 0.1636 -0.1742 0.2773 0.0577 0.1219 0.1128 0.1354 0.1274 -0.5570 -0.4078 -0.0891 -0.0620 0.0000 0.0000 0.0000 210.0282 T0339.try16-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5214 1.6876 1.6974 3.0215 3.0126 3.2717 3.4705 1.1104 -3.7727 0.5165 0.2583 -0.0838 0.0482 0.0577 0.0845 0.6121 0.6551 0.6170 -0.5693 -0.4212 -0.1024 -0.0791 0.0000 0.0000 0.0000 210.5987 T0339.try5-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5271 1.6485 1.7066 3.0614 3.0122 3.2400 3.4569 0.9424 -4.1317 0.6360 0.2584 -0.1612 0.0669 0.0457 0.0823 0.5844 0.5711 0.5460 -0.5714 -0.3989 -0.0873 -0.0610 0.0000 0.0000 0.0000 211.0194 T0339.try1-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5245 1.6831 1.7316 3.0776 3.0235 3.2237 3.4439 1.0490 -3.5531 0.5388 0.2570 -0.1591 0.0722 0.0457 0.0700 0.6229 0.6531 0.6370 -0.5597 -0.3982 -0.1075 -0.0790 0.0000 0.0000 0.0000 211.1177 T0339.try8-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5190 1.6883 1.7046 3.0994 3.0410 3.2474 3.4352 0.9302 -3.7353 0.5308 0.2344 -0.0989 0.0595 0.0361 0.0646 0.5994 0.6411 0.6355 -0.5771 -0.3781 -0.1015 -0.0675 0.0000 0.0000 0.0000 211.2055 T0339.try5-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5299 1.6485 1.7066 3.0444 3.0219 3.2482 3.4475 0.9432 -3.8676 0.6360 0.2584 -0.1612 0.0449 0.0457 0.0823 0.5844 0.5711 0.5460 -0.5673 -0.3989 -0.0873 -0.0610 0.0000 0.0000 0.0000 211.6510 T0339.try7-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5329 1.6452 1.6894 3.0629 3.0316 3.2565 3.4613 0.9465 -5.5809 0.5342 0.1457 -0.1773 0.3533 0.0673 0.0954 0.1215 0.1431 0.1283 -0.5557 -0.4089 -0.0871 -0.0621 0.0000 0.0000 0.0000 211.7880 T0339.try16-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5238 1.6876 1.6974 3.0309 3.0446 3.2882 3.4709 1.0724 -3.7386 0.5165 0.2583 -0.0838 0.0377 0.0577 0.0845 0.6121 0.6551 0.6170 -0.5414 -0.4212 -0.1024 -0.0791 0.0000 0.0000 0.0000 211.8261 T0339.try15-opt2.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5219 1.6836 1.6958 3.0529 3.0732 3.3125 3.4836 1.0640 -4.9757 0.3974 0.2000 -0.1067 0.2043 0.1442 0.1697 0.1465 0.1767 0.1502 -0.5522 -0.4189 -0.1003 -0.0783 0.0000 0.0000 0.0000 217.0808 T0339.try8-opt1.pdb.gz 416 0.5223 1.6869 1.7241 3.0936 3.0618 3.2622 3.4433 0.9562 -4.9624 0.2949 0.1200 -0.1039 0.3754 0.1034 0.0908 0.3929 0.4147 0.4294 -0.5230 -0.3708 -0.0972 -0.0676 0.0000 0.0000 0.0000 218.0084 T0339.try15-opt2.pdb.gz 416 0.5226 1.6836 1.6958 3.0320 3.0452 3.2969 3.4844 1.1404 -5.2860 0.3974 0.2000 -0.1067 0.2949 0.1442 0.1697 0.1465 0.1767 0.1502 -0.5412 -0.4189 -0.1003 -0.0783 0.0000 0.0000 0.0000 218.1859 T0339.try8-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5152 1.6869 1.7241 3.0851 3.0733 3.2619 3.4351 0.9564 -4.9809 0.2949 0.1200 -0.1039 0.3912 0.1034 0.0908 0.3929 0.4147 0.4294 -0.5050 -0.3708 -0.0972 -0.0676 0.0000 0.0000 0.0000 218.7312 T0339.try16-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5321 1.6914 1.7034 3.0982 3.0467 3.3001 3.4823 1.1079 -5.5808 0.4363 0.1757 -0.1399 0.4943 0.1250 0.1122 0.1557 0.1876 0.1603 -0.5388 -0.4237 -0.1023 -0.0774 0.0000 0.0000 0.0000 219.9504 T0339.try6-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5274 1.7093 1.7493 3.0847 3.0756 3.2570 3.4426 0.9144 -5.2323 0.2790 0.1273 -0.1802 0.3797 0.0962 0.1185 0.3940 0.4226 0.4195 -0.5259 -0.3829 -0.0928 -0.0630 0.0000 0.0000 0.0000 220.0034 T0339.try6-opt1.pdb.gz 416 0.5279 1.7093 1.7493 3.0853 3.0685 3.2584 3.4455 0.9161 -5.0637 0.2790 0.1273 -0.1802 0.3921 0.0962 0.1185 0.3940 0.4226 0.4195 -0.5208 -0.3829 -0.0928 -0.0630 0.0000 0.0000 0.0000 221.2783 T0339.try15-opt2.gromacs0.pdb.gz 416 0.5227 1.6883 1.7036 3.0328 3.0444 3.2990 3.4862 1.1369 -3.5426 0.8398 0.2954 -0.0379 0.1031 0.1010 0.1133 0.5628 0.6170 0.5825 -0.5359 -0.4058 -0.0990 -0.0771 0.0000 0.0000 0.0000 221.3497 T0339.try15-opt2.gromacs0.repack-nonPC.pdb.gz 416 0.5216 1.6883 1.7036 3.0559 3.0759 3.3189 3.4900 1.1253 -3.4383 0.8398 0.2954 -0.0379 0.0966 0.1010 0.1133 0.5628 0.6170 0.5825 -0.5424 -0.4058 -0.0990 -0.0771 0.0000 0.0000 0.0000 223.0454 T0339.try5-opt1.pdb.gz 416 0.5223 1.6444 1.6985 3.1259 3.0648 3.2801 3.4758 1.1572 -5.1403 0.3852 0.1579 -0.1623 0.3746 0.0577 0.1386 0.3515 0.3688 0.3483 -0.5354 -0.4013 -0.0900 -0.0570 0.0000 0.0000 0.0000 224.0982 T0339.try1-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5328 1.6863 1.7252 3.0920 3.0594 3.2654 3.4577 1.0639 -5.1422 0.5910 0.1457 -0.2058 0.5090 0.1587 0.1295 0.3567 0.3778 0.3757 -0.5316 -0.3840 -0.1056 -0.0768 0.0000 0.0000 0.0000 226.2302 T0339.try5-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5264 1.6444 1.6985 3.1132 3.0814 3.2825 3.4771 1.1712 -5.2714 0.3852 0.1579 -0.1623 0.4520 0.0577 0.1386 0.3515 0.3688 0.3483 -0.5445 -0.4013 -0.0900 -0.0570 0.0000 0.0000 0.0000 226.8311 T0339.try1-opt1.pdb.gz 416 0.5371 1.6863 1.7252 3.0859 3.0393 3.2705 3.4580 1.0753 -5.1288 0.5910 0.1457 -0.2058 0.5373 0.1587 0.1295 0.3567 0.3778 0.3757 -0.5311 -0.3840 -0.1056 -0.0768 0.0000 0.0000 0.0000 227.0401 T0339.try15-opt1.pdb.gz 416 0.5274 1.6923 1.7010 3.1123 3.0952 3.3244 3.4910 1.1922 -5.0010 0.3780 0.1895 -0.0716 0.4227 0.1394 0.1609 0.3470 0.3732 0.3541 -0.5030 -0.3934 -0.0949 -0.0704 0.0000 0.0000 0.0000 230.6368 T0339.try15-opt1-scwrl.pdb.gz 416 0.5310 1.6923 1.7010 3.1139 3.1074 3.3400 3.4934 1.1883 -5.1542 0.3780 0.1895 -0.0716 0.4724 0.1394 0.1609 0.3470 0.3732 0.3541 -0.5008 -0.3934 -0.0949 -0.0704 0.0000 0.0000 0.0000 232.5738