# TARGET T0339 # Using neural net t04-2621-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0339.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2101 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 E 0.483 0.153 0.062 0.113 0.063 0.042 0.033 0.019 0.014 0.010 0.007 2 R 0.310 0.160 0.052 0.153 0.116 0.073 0.066 0.033 0.020 0.011 0.005 3 K 0.039 0.117 0.060 0.226 0.219 0.144 0.100 0.051 0.026 0.012 0.007 4 V 0.004 0.006 0.003 0.016 0.033 0.059 0.141 0.201 0.213 0.189 0.135 5 Y 0.005 0.010 0.014 0.068 0.111 0.139 0.223 0.164 0.122 0.079 0.065 6 M 0.002 0.002 0.002 0.006 0.006 0.010 0.047 0.109 0.226 0.285 0.305 7 D 0.007 0.010 0.012 0.053 0.064 0.093 0.188 0.199 0.196 0.110 0.067 8 Y 0.008 0.009 0.007 0.019 0.020 0.040 0.114 0.175 0.235 0.219 0.154 9 N 0.026 0.021 0.016 0.042 0.043 0.061 0.137 0.167 0.195 0.172 0.121 10 A 0.019 0.014 0.010 0.028 0.033 0.053 0.133 0.156 0.201 0.178 0.175 11 T 0.021 0.028 0.018 0.048 0.051 0.064 0.117 0.139 0.172 0.177 0.165 12 T 0.026 0.037 0.015 0.053 0.068 0.087 0.146 0.152 0.169 0.138 0.107 13 P 0.164 0.090 0.036 0.098 0.116 0.100 0.124 0.097 0.078 0.058 0.038 14 L 0.015 0.049 0.015 0.059 0.099 0.126 0.198 0.148 0.127 0.102 0.063 15 E 0.043 0.128 0.047 0.147 0.172 0.150 0.135 0.070 0.052 0.031 0.025 16 P 0.496 0.186 0.063 0.128 0.075 0.031 0.014 0.004 0.002 0.001 0.001 17 E 0.302 0.183 0.082 0.212 0.107 0.065 0.034 0.009 0.004 0.001 0.001 18 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.014 0.076 0.142 0.242 0.263 0.252 19 I 0.001 0.001 0.006 0.015 0.035 0.114 0.281 0.195 0.164 0.111 0.078 20 Q 0.005 0.023 0.555 0.269 0.094 0.034 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 21 A 0.001 0.002 0.025 0.035 0.061 0.161 0.353 0.188 0.092 0.057 0.025 22 M 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.027 0.069 0.202 0.337 0.357 23 T 0.001 0.002 0.030 0.040 0.089 0.196 0.341 0.149 0.094 0.043 0.017 24 K 0.006 0.025 0.442 0.304 0.131 0.061 0.020 0.006 0.003 0.001 0.001 25 A 0.003 0.004 0.013 0.012 0.023 0.061 0.242 0.192 0.204 0.154 0.093 26 M 0.003 0.002 0.009 0.013 0.012 0.027 0.105 0.165 0.241 0.232 0.190 27 W 0.005 0.015 0.114 0.099 0.143 0.169 0.221 0.118 0.068 0.035 0.014 28 E 0.019 0.053 0.397 0.184 0.117 0.100 0.069 0.030 0.018 0.009 0.004 29 A 0.043 0.037 0.053 0.064 0.076 0.108 0.204 0.147 0.132 0.091 0.045 30 W 0.037 0.036 0.021 0.057 0.057 0.080 0.156 0.156 0.178 0.139 0.085 31 G 0.132 0.091 0.062 0.084 0.080 0.081 0.111 0.096 0.106 0.087 0.070 32 N 0.108 0.108 0.042 0.127 0.114 0.108 0.132 0.094 0.079 0.054 0.033 33 P 0.140 0.069 0.027 0.080 0.101 0.113 0.133 0.111 0.103 0.073 0.049 34 S 0.261 0.148 0.048 0.120 0.091 0.075 0.080 0.059 0.051 0.040 0.028 35 S 0.156 0.080 0.030 0.075 0.075 0.076 0.118 0.109 0.118 0.099 0.063 36 P 0.128 0.143 0.058 0.127 0.102 0.098 0.105 0.079 0.072 0.053 0.036 37 Y 0.047 0.048 0.029 0.087 0.101 0.117 0.161 0.128 0.123 0.092 0.067 38 S 0.217 0.104 0.082 0.133 0.103 0.088 0.095 0.060 0.054 0.038 0.027 39 A 0.031 0.051 0.033 0.105 0.105 0.118 0.174 0.131 0.120 0.081 0.049 40 G 0.030 0.023 0.025 0.039 0.044 0.071 0.136 0.142 0.180 0.157 0.155 41 R 0.122 0.061 0.155 0.159 0.120 0.113 0.118 0.060 0.044 0.031 0.018 42 K 0.010 0.046 0.136 0.151 0.178 0.166 0.176 0.070 0.038 0.020 0.010 43 A 0.007 0.011 0.051 0.022 0.017 0.029 0.093 0.117 0.194 0.238 0.221 44 K 0.046 0.042 0.160 0.236 0.201 0.139 0.117 0.033 0.017 0.006 0.002 45 D 0.110 0.091 0.632 0.123 0.029 0.010 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 46 I 0.002 0.007 0.033 0.031 0.047 0.154 0.352 0.172 0.108 0.063 0.032 47 I 0.001 0.002 0.024 0.014 0.022 0.071 0.331 0.229 0.170 0.094 0.041 48 N 0.025 0.044 0.725 0.128 0.046 0.020 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 49 A 0.006 0.021 0.359 0.279 0.186 0.097 0.041 0.008 0.002 0.001 0.001 50 A 0.001 0.001 0.017 0.002 0.002 0.007 0.061 0.103 0.244 0.310 0.252 51 R 0.001 0.001 0.044 0.031 0.073 0.184 0.421 0.142 0.065 0.029 0.011 52 E 0.001 0.006 0.763 0.143 0.061 0.018 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 53 S 0.001 0.003 0.038 0.054 0.139 0.267 0.342 0.095 0.037 0.017 0.007 54 L 0.001 0.001 0.017 0.002 0.002 0.002 0.025 0.074 0.244 0.306 0.329 55 A 0.001 0.001 0.030 0.046 0.138 0.233 0.313 0.132 0.062 0.032 0.013 56 K 0.005 0.021 0.772 0.134 0.050 0.014 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 57 M 0.001 0.001 0.009 0.008 0.026 0.081 0.345 0.217 0.182 0.085 0.045 58 I 0.002 0.001 0.002 0.005 0.008 0.021 0.106 0.151 0.201 0.244 0.259 59 G 0.302 0.375 0.137 0.134 0.035 0.012 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 60 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.049 0.108 0.223 0.267 0.342 61 K 0.311 0.568 0.059 0.053 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 62 P 0.010 0.017 0.009 0.060 0.126 0.186 0.293 0.138 0.095 0.039 0.027 63 Q 0.780 0.143 0.028 0.035 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 64 D 0.001 0.013 0.010 0.101 0.240 0.345 0.221 0.047 0.016 0.004 0.002 65 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.031 0.105 0.198 0.269 0.389 66 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.030 0.143 0.191 0.201 0.198 0.225 67 F 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.048 0.120 0.237 0.294 0.290 68 T 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.010 0.047 0.109 0.200 0.281 0.344 69 S 0.004 0.004 0.003 0.021 0.040 0.072 0.160 0.208 0.213 0.162 0.113 70 G 0.009 0.017 0.010 0.052 0.078 0.108 0.212 0.195 0.149 0.109 0.061 71 G 0.004 0.007 0.005 0.023 0.046 0.073 0.185 0.194 0.202 0.149 0.112 72 T 0.033 0.018 0.013 0.035 0.038 0.056 0.117 0.128 0.202 0.193 0.168 73 E 0.013 0.010 0.011 0.052 0.098 0.152 0.233 0.159 0.128 0.086 0.058 74 S 0.003 0.005 0.023 0.015 0.015 0.023 0.080 0.118 0.208 0.241 0.271 75 N 0.001 0.002 0.007 0.011 0.014 0.027 0.107 0.144 0.220 0.258 0.209 76 N 0.004 0.008 0.053 0.053 0.059 0.086 0.173 0.134 0.165 0.150 0.116 77 L 0.002 0.003 0.037 0.018 0.027 0.057 0.207 0.195 0.176 0.158 0.121 78 V 0.001 0.001 0.006 0.002 0.002 0.003 0.020 0.061 0.180 0.317 0.409 79 I 0.001 0.001 0.005 0.003 0.003 0.008 0.053 0.094 0.199 0.323 0.310 80 H 0.001 0.002 0.063 0.047 0.074 0.127 0.253 0.145 0.150 0.089 0.048 81 S 0.001 0.001 0.019 0.009 0.014 0.040 0.186 0.175 0.213 0.198 0.144 82 V 0.001 0.001 0.002 0.004 0.004 0.007 0.046 0.107 0.253 0.335 0.241 83 V 0.001 0.001 0.007 0.015 0.028 0.075 0.212 0.201 0.224 0.158 0.078 84 K 0.007 0.017 0.217 0.171 0.163 0.134 0.132 0.070 0.051 0.025 0.011 85 H 0.006 0.011 0.032 0.054 0.090 0.167 0.286 0.154 0.113 0.062 0.024 86 F 0.004 0.005 0.006 0.015 0.015 0.042 0.125 0.171 0.220 0.247 0.150 87 H 0.015 0.027 0.040 0.089 0.126 0.172 0.209 0.142 0.092 0.060 0.026 88 A 0.065 0.111 0.290 0.160 0.102 0.073 0.074 0.047 0.034 0.027 0.016 89 N 0.114 0.094 0.076 0.145 0.133 0.110 0.130 0.066 0.058 0.050 0.024 90 Q 0.159 0.070 0.047 0.088 0.067 0.093 0.119 0.091 0.092 0.096 0.077 91 T 0.067 0.090 0.064 0.155 0.153 0.121 0.138 0.078 0.060 0.044 0.030 92 S 0.164 0.114 0.163 0.118 0.075 0.066 0.087 0.055 0.053 0.054 0.050 93 K 0.193 0.146 0.069 0.189 0.134 0.087 0.080 0.036 0.030 0.023 0.012 94 G 0.262 0.115 0.065 0.112 0.084 0.077 0.074 0.053 0.060 0.053 0.045 95 H 0.125 0.102 0.061 0.153 0.125 0.099 0.121 0.068 0.063 0.048 0.036 96 T 0.187 0.117 0.091 0.120 0.086 0.076 0.100 0.066 0.070 0.055 0.034 97 G 0.197 0.117 0.046 0.135 0.115 0.096 0.101 0.067 0.063 0.041 0.021 98 G 0.228 0.128 0.063 0.132 0.096 0.081 0.088 0.058 0.054 0.040 0.031 99 H 0.147 0.102 0.051 0.109 0.092 0.083 0.117 0.084 0.086 0.073 0.056 100 H 0.210 0.119 0.060 0.125 0.113 0.099 0.096 0.066 0.057 0.038 0.019 101 S 0.214 0.155 0.054 0.118 0.108 0.087 0.095 0.064 0.051 0.035 0.020 102 P 0.152 0.121 0.064 0.135 0.126 0.101 0.123 0.070 0.054 0.033 0.020 103 V 0.026 0.023 0.016 0.050 0.068 0.091 0.181 0.153 0.137 0.136 0.118 104 K 0.137 0.212 0.101 0.201 0.117 0.082 0.070 0.033 0.023 0.014 0.011 105 G 0.218 0.084 0.053 0.088 0.076 0.092 0.121 0.085 0.072 0.055 0.055 106 A 0.325 0.207 0.073 0.137 0.078 0.051 0.056 0.027 0.019 0.014 0.012 107 K 0.066 0.102 0.055 0.169 0.195 0.135 0.136 0.067 0.042 0.021 0.011 108 P 0.018 0.046 0.038 0.142 0.187 0.150 0.179 0.115 0.067 0.036 0.023 109 H 0.001 0.002 0.004 0.027 0.087 0.211 0.318 0.181 0.088 0.050 0.031 110 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.053 0.163 0.241 0.286 0.246 111 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.068 0.172 0.245 0.261 0.241 112 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.076 0.190 0.296 0.408 113 S 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.017 0.071 0.142 0.234 0.269 0.254 114 S 0.007 0.018 0.008 0.067 0.103 0.133 0.212 0.184 0.131 0.086 0.053 115 V 0.022 0.021 0.014 0.059 0.070 0.075 0.137 0.182 0.169 0.155 0.095 116 E 0.025 0.036 0.015 0.076 0.114 0.129 0.198 0.149 0.124 0.074 0.061 117 H 0.015 0.021 0.010 0.041 0.049 0.074 0.139 0.157 0.187 0.169 0.138 118 D 0.168 0.085 0.033 0.132 0.131 0.129 0.115 0.074 0.062 0.043 0.028 119 S 0.016 0.021 0.015 0.040 0.045 0.061 0.124 0.156 0.209 0.177 0.137 120 I 0.002 0.006 0.003 0.010 0.015 0.027 0.084 0.139 0.222 0.255 0.239 121 R 0.005 0.009 0.010 0.045 0.081 0.148 0.216 0.145 0.148 0.107 0.085 122 L 0.026 0.049 0.068 0.140 0.149 0.155 0.172 0.100 0.073 0.045 0.024 123 P 0.001 0.003 0.005 0.020 0.024 0.036 0.112 0.180 0.232 0.221 0.167 124 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.027 0.064 0.185 0.309 0.406 125 E 0.002 0.004 0.044 0.137 0.184 0.232 0.212 0.085 0.058 0.027 0.014 126 H 0.001 0.008 0.086 0.141 0.160 0.208 0.229 0.091 0.050 0.018 0.007 127 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.013 0.075 0.135 0.226 0.288 0.254 128 V 0.001 0.001 0.003 0.010 0.014 0.032 0.118 0.186 0.263 0.238 0.135 129 E 0.010 0.033 0.261 0.300 0.215 0.110 0.047 0.015 0.006 0.002 0.001 130 E 0.030 0.050 0.126 0.163 0.157 0.201 0.162 0.062 0.030 0.014 0.006 131 Q 0.024 0.034 0.016 0.100 0.107 0.151 0.221 0.168 0.102 0.058 0.020 132 V 0.146 0.219 0.081 0.206 0.142 0.099 0.060 0.023 0.012 0.006 0.005 133 A 0.002 0.002 0.003 0.008 0.014 0.026 0.095 0.164 0.261 0.249 0.177 134 A 0.102 0.262 0.089 0.330 0.153 0.047 0.015 0.002 0.001 0.001 0.001 135 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.026 0.084 0.225 0.287 0.369 136 T 0.043 0.108 0.049 0.295 0.241 0.156 0.078 0.019 0.007 0.002 0.001 137 F 0.004 0.018 0.009 0.055 0.078 0.108 0.204 0.172 0.173 0.111 0.067 138 V 0.001 0.002 0.001 0.011 0.021 0.043 0.111 0.149 0.213 0.230 0.219 139 P 0.082 0.224 0.073 0.266 0.168 0.082 0.063 0.022 0.012 0.005 0.003 140 V 0.008 0.008 0.005 0.026 0.037 0.053 0.141 0.173 0.205 0.207 0.135 141 S 0.184 0.309 0.060 0.206 0.118 0.058 0.034 0.014 0.008 0.005 0.005 142 K 0.200 0.163 0.059 0.218 0.152 0.095 0.065 0.025 0.013 0.006 0.003 143 V 0.272 0.085 0.038 0.092 0.089 0.087 0.112 0.070 0.062 0.050 0.043 144 S 0.192 0.206 0.072 0.170 0.127 0.078 0.080 0.033 0.024 0.012 0.005 145 G 0.497 0.117 0.036 0.102 0.074 0.058 0.052 0.026 0.019 0.013 0.006 146 Q 0.114 0.123 0.054 0.179 0.144 0.119 0.137 0.058 0.039 0.021 0.011 147 T 0.014 0.023 0.011 0.039 0.055 0.077 0.143 0.165 0.199 0.172 0.101 148 E 0.024 0.354 0.058 0.197 0.136 0.096 0.064 0.033 0.020 0.012 0.007 149 V 0.034 0.026 0.016 0.069 0.143 0.211 0.215 0.124 0.090 0.047 0.025 150 D 0.706 0.149 0.059 0.052 0.022 0.007 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 151 D 0.007 0.028 0.041 0.368 0.252 0.155 0.105 0.028 0.011 0.003 0.001 152 I 0.001 0.001 0.004 0.003 0.003 0.006 0.039 0.097 0.199 0.308 0.339 153 L 0.001 0.002 0.032 0.102 0.188 0.284 0.258 0.078 0.036 0.014 0.005 154 A 0.003 0.018 0.659 0.190 0.075 0.034 0.015 0.004 0.002 0.001 0.001 155 A 0.001 0.001 0.006 0.013 0.036 0.144 0.378 0.184 0.113 0.079 0.045 156 V 0.001 0.001 0.004 0.003 0.004 0.007 0.056 0.122 0.217 0.269 0.315 157 R 0.041 0.135 0.291 0.231 0.164 0.077 0.040 0.012 0.005 0.003 0.002 158 P 0.293 0.145 0.291 0.150 0.059 0.035 0.019 0.004 0.002 0.001 0.001 159 T 0.306 0.236 0.104 0.186 0.099 0.039 0.023 0.005 0.002 0.001 0.001 160 T 0.001 0.002 0.001 0.006 0.011 0.027 0.123 0.170 0.266 0.221 0.172 161 R 0.004 0.030 0.051 0.170 0.244 0.249 0.166 0.047 0.023 0.009 0.006 162 L 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.014 0.073 0.165 0.237 0.271 0.226 163 V 0.001 0.001 0.001 0.007 0.016 0.035 0.137 0.244 0.238 0.181 0.139 164 T 0.001 0.001 0.002 0.004 0.005 0.009 0.047 0.111 0.237 0.281 0.301 165 I 0.001 0.001 0.002 0.006 0.007 0.012 0.049 0.108 0.233 0.288 0.294 166 M 0.002 0.006 0.009 0.038 0.053 0.088 0.215 0.222 0.200 0.111 0.057 167 L 0.006 0.011 0.010 0.034 0.041 0.064 0.174 0.216 0.205 0.152 0.087 168 A 0.007 0.008 0.010 0.025 0.029 0.041 0.100 0.161 0.238 0.209 0.173 169 N 0.042 0.053 0.024 0.104 0.126 0.134 0.155 0.124 0.106 0.071 0.060 170 N 0.033 0.032 0.018 0.065 0.067 0.086 0.136 0.162 0.173 0.138 0.090 171 E 0.133 0.091 0.044 0.124 0.130 0.128 0.132 0.083 0.066 0.040 0.029 172 T 0.099 0.085 0.043 0.100 0.072 0.070 0.117 0.099 0.107 0.103 0.105 173 G 0.035 0.024 0.012 0.043 0.064 0.083 0.131 0.135 0.174 0.157 0.142 174 I 0.027 0.097 0.046 0.163 0.155 0.138 0.157 0.086 0.063 0.040 0.028 175 V 0.011 0.009 0.008 0.029 0.046 0.067 0.146 0.149 0.195 0.175 0.163 176 M 0.013 0.018 0.016 0.062 0.099 0.118 0.193 0.154 0.149 0.099 0.079 177 P 0.005 0.101 0.026 0.108 0.108 0.119 0.168 0.123 0.107 0.081 0.055 178 V 0.001 0.001 0.001 0.005 0.015 0.034 0.094 0.135 0.209 0.238 0.267 179 P 0.501 0.153 0.078 0.133 0.077 0.034 0.017 0.004 0.002 0.001 0.001 180 E 0.009 0.039 0.054 0.287 0.262 0.166 0.127 0.036 0.013 0.004 0.002 181 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 0.054 0.164 0.303 0.458 182 S 0.001 0.001 0.001 0.007 0.030 0.107 0.293 0.198 0.175 0.113 0.076 183 Q 0.024 0.031 0.779 0.131 0.026 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 184 R 0.001 0.001 0.004 0.025 0.074 0.270 0.456 0.119 0.035 0.013 0.004 185 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.057 0.199 0.352 0.378 186 K 0.003 0.009 0.055 0.174 0.260 0.244 0.175 0.050 0.021 0.007 0.003 187 A 0.014 0.030 0.694 0.130 0.062 0.038 0.021 0.006 0.003 0.001 0.001 188 L 0.003 0.006 0.006 0.022 0.047 0.151 0.394 0.199 0.089 0.061 0.023 189 N 0.238 0.217 0.038 0.076 0.051 0.052 0.086 0.074 0.077 0.058 0.033 190 Q 0.031 0.050 0.065 0.095 0.110 0.117 0.138 0.121 0.119 0.095 0.060 191 E 0.288 0.155 0.182 0.181 0.095 0.047 0.030 0.010 0.007 0.003 0.001 192 R 0.035 0.041 0.037 0.095 0.102 0.130 0.195 0.139 0.109 0.066 0.050 193 V 0.022 0.015 0.017 0.038 0.040 0.079 0.164 0.179 0.191 0.146 0.110 194 A 0.037 0.034 0.104 0.097 0.088 0.127 0.191 0.119 0.095 0.064 0.045 195 A 0.095 0.151 0.382 0.175 0.070 0.043 0.037 0.018 0.014 0.009 0.006 196 G 0.121 0.133 0.053 0.163 0.135 0.132 0.116 0.058 0.044 0.027 0.018 197 L 0.040 0.025 0.011 0.030 0.040 0.058 0.106 0.103 0.158 0.178 0.252 198 P 0.129 0.142 0.063 0.181 0.171 0.128 0.113 0.039 0.022 0.009 0.003 199 P 0.212 0.121 0.067 0.197 0.180 0.115 0.067 0.022 0.012 0.005 0.002 200 I 0.001 0.002 0.002 0.012 0.023 0.043 0.143 0.213 0.228 0.207 0.125 201 L 0.001 0.001 0.003 0.022 0.062 0.167 0.247 0.191 0.143 0.092 0.071 202 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.052 0.142 0.252 0.286 0.256 203 H 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.070 0.156 0.217 0.282 0.258 204 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.028 0.080 0.209 0.310 0.362 205 D 0.001 0.001 0.003 0.014 0.023 0.043 0.136 0.191 0.240 0.201 0.148 206 A 0.001 0.002 0.008 0.009 0.012 0.025 0.116 0.198 0.246 0.231 0.153 207 A 0.002 0.002 0.009 0.013 0.013 0.024 0.082 0.150 0.232 0.250 0.223 208 Q 0.002 0.004 0.009 0.017 0.018 0.036 0.120 0.181 0.242 0.209 0.162 209 A 0.003 0.005 0.013 0.014 0.018 0.032 0.099 0.154 0.234 0.225 0.204 210 L 0.004 0.007 0.010 0.017 0.018 0.031 0.086 0.135 0.235 0.244 0.212 211 G 0.018 0.015 0.009 0.036 0.053 0.075 0.151 0.160 0.199 0.161 0.123 212 K 0.042 0.057 0.041 0.129 0.151 0.157 0.180 0.109 0.074 0.042 0.020 213 Q 0.061 0.053 0.034 0.095 0.121 0.125 0.163 0.116 0.102 0.077 0.051 214 R 0.109 0.122 0.084 0.213 0.140 0.115 0.090 0.049 0.037 0.024 0.018 215 V 0.017 0.014 0.009 0.026 0.044 0.080 0.161 0.156 0.186 0.174 0.133 216 D 0.140 0.286 0.093 0.213 0.112 0.063 0.048 0.020 0.012 0.007 0.006 217 V 0.010 0.004 0.002 0.009 0.017 0.026 0.082 0.123 0.200 0.251 0.275 218 E 0.221 0.197 0.108 0.286 0.115 0.043 0.018 0.005 0.003 0.001 0.001 219 D 0.129 0.184 0.106 0.243 0.146 0.094 0.060 0.021 0.010 0.005 0.004 220 L 0.005 0.006 0.005 0.028 0.043 0.077 0.186 0.183 0.190 0.158 0.121 221 G 0.208 0.220 0.064 0.215 0.148 0.081 0.045 0.010 0.005 0.002 0.001 222 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.031 0.082 0.232 0.293 0.349 223 D 0.002 0.012 0.011 0.087 0.145 0.214 0.289 0.120 0.063 0.032 0.026 224 F 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.019 0.088 0.168 0.252 0.256 0.202 225 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.017 0.085 0.163 0.229 0.254 0.239 226 T 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.008 0.040 0.105 0.221 0.307 0.307 227 I 0.001 0.001 0.002 0.007 0.009 0.017 0.069 0.135 0.253 0.283 0.224 228 V 0.002 0.006 0.006 0.034 0.043 0.063 0.156 0.201 0.225 0.163 0.102 229 G 0.005 0.007 0.006 0.025 0.039 0.062 0.174 0.214 0.233 0.163 0.073 230 H 0.007 0.019 0.016 0.092 0.117 0.138 0.186 0.167 0.146 0.076 0.036 231 K 0.011 0.021 0.010 0.059 0.085 0.110 0.185 0.187 0.173 0.106 0.052 232 F 0.019 0.021 0.011 0.067 0.085 0.114 0.169 0.180 0.172 0.109 0.054 233 Y 0.019 0.030 0.011 0.068 0.074 0.093 0.166 0.180 0.188 0.115 0.055 234 G 0.065 0.051 0.014 0.081 0.083 0.095 0.142 0.159 0.150 0.097 0.062 235 P 0.168 0.121 0.033 0.140 0.111 0.102 0.115 0.089 0.063 0.039 0.017 236 R 0.142 0.122 0.040 0.191 0.180 0.125 0.100 0.051 0.029 0.014 0.006 237 I 0.006 0.009 0.004 0.021 0.026 0.040 0.105 0.188 0.230 0.223 0.149 238 G 0.004 0.012 0.008 0.049 0.078 0.117 0.213 0.187 0.157 0.108 0.068 239 A 0.001 0.003 0.003 0.012 0.016 0.036 0.110 0.175 0.227 0.230 0.187 240 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.019 0.081 0.179 0.253 0.261 0.192 241 Y 0.001 0.003 0.003 0.019 0.030 0.043 0.127 0.176 0.246 0.205 0.148 242 I 0.001 0.002 0.002 0.013 0.020 0.031 0.095 0.156 0.260 0.242 0.179 243 R 0.019 0.037 0.021 0.161 0.216 0.190 0.186 0.099 0.051 0.017 0.005 244 G 0.118 0.160 0.064 0.189 0.140 0.114 0.111 0.056 0.029 0.014 0.004 245 L 0.132 0.129 0.051 0.201 0.158 0.108 0.097 0.058 0.036 0.022 0.009 246 G 0.504 0.212 0.042 0.092 0.054 0.035 0.027 0.015 0.010 0.006 0.004 247 E 0.146 0.161 0.048 0.167 0.142 0.108 0.104 0.060 0.036 0.018 0.008 248 F 0.035 0.024 0.009 0.035 0.050 0.086 0.169 0.176 0.175 0.141 0.100 249 T 0.124 0.176 0.080 0.199 0.147 0.096 0.079 0.042 0.030 0.017 0.009 250 P 0.392 0.158 0.077 0.157 0.091 0.051 0.036 0.017 0.011 0.007 0.004 251 L 0.028 0.020 0.010 0.033 0.039 0.056 0.123 0.145 0.183 0.188 0.173 252 Y 0.048 0.096 0.054 0.170 0.158 0.137 0.139 0.081 0.062 0.034 0.020 253 P 0.054 0.050 0.039 0.091 0.095 0.108 0.157 0.136 0.124 0.087 0.059 254 M 0.049 0.048 0.048 0.106 0.113 0.115 0.162 0.121 0.102 0.075 0.061 255 L 0.040 0.036 0.030 0.082 0.076 0.092 0.142 0.141 0.152 0.122 0.086 256 F 0.030 0.047 0.035 0.102 0.108 0.132 0.165 0.130 0.123 0.080 0.047 257 G 0.095 0.060 0.056 0.072 0.058 0.069 0.112 0.116 0.130 0.123 0.108 258 G 0.083 0.059 0.024 0.071 0.078 0.081 0.142 0.125 0.131 0.119 0.088 259 G 0.120 0.121 0.047 0.120 0.111 0.110 0.112 0.079 0.079 0.057 0.047 260 Q 0.048 0.049 0.022 0.059 0.066 0.077 0.117 0.119 0.137 0.142 0.163 261 E 0.183 0.128 0.067 0.135 0.111 0.089 0.097 0.062 0.053 0.040 0.034 262 R 0.165 0.092 0.053 0.134 0.137 0.114 0.118 0.069 0.054 0.038 0.026 263 N 0.277 0.170 0.070 0.144 0.098 0.068 0.069 0.038 0.029 0.020 0.017 264 F 0.014 0.012 0.011 0.034 0.054 0.087 0.168 0.158 0.165 0.155 0.141 265 R 0.113 0.154 0.067 0.163 0.129 0.100 0.102 0.059 0.047 0.036 0.031 266 P 0.069 0.039 0.018 0.051 0.056 0.073 0.138 0.138 0.153 0.145 0.119 267 G 0.082 0.034 0.015 0.049 0.057 0.071 0.133 0.124 0.145 0.136 0.155 268 T 0.045 0.040 0.019 0.060 0.056 0.068 0.122 0.116 0.155 0.153 0.167 269 E 0.110 0.105 0.052 0.163 0.159 0.130 0.112 0.065 0.050 0.032 0.021 270 N 0.022 0.034 0.013 0.053 0.071 0.086 0.167 0.163 0.164 0.129 0.098 271 T 0.026 0.016 0.010 0.036 0.061 0.092 0.154 0.145 0.187 0.159 0.116 272 P 0.034 0.037 0.032 0.101 0.134 0.169 0.211 0.111 0.088 0.051 0.032 273 M 0.001 0.008 0.009 0.026 0.036 0.066 0.168 0.193 0.198 0.168 0.128 274 I 0.008 0.006 0.020 0.017 0.016 0.023 0.067 0.113 0.207 0.256 0.267 275 A 0.011 0.011 0.038 0.081 0.090 0.101 0.168 0.144 0.144 0.116 0.094 276 G 0.001 0.004 0.034 0.034 0.038 0.052 0.129 0.169 0.207 0.179 0.154 277 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.042 0.091 0.206 0.295 0.355 278 G 0.003 0.002 0.024 0.033 0.056 0.134 0.281 0.144 0.147 0.104 0.073 279 K 0.001 0.006 0.068 0.107 0.144 0.199 0.274 0.106 0.052 0.028 0.014 280 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.007 0.047 0.097 0.218 0.303 0.321 281 A 0.001 0.001 0.003 0.004 0.005 0.011 0.057 0.101 0.219 0.307 0.290 282 E 0.006 0.014 0.296 0.218 0.189 0.124 0.094 0.033 0.017 0.006 0.003 283 L 0.001 0.004 0.024 0.032 0.070 0.208 0.359 0.151 0.086 0.045 0.019 284 V 0.001 0.002 0.004 0.010 0.012 0.026 0.110 0.168 0.249 0.264 0.155 285 T 0.030 0.042 0.070 0.098 0.107 0.146 0.261 0.126 0.074 0.031 0.015 286 Q 0.177 0.120 0.375 0.166 0.085 0.040 0.022 0.008 0.003 0.002 0.001 287 N 0.208 0.377 0.081 0.128 0.072 0.054 0.042 0.017 0.012 0.007 0.003 288 C 0.018 0.022 0.017 0.035 0.052 0.102 0.206 0.167 0.183 0.119 0.079 289 E 0.607 0.144 0.131 0.064 0.028 0.013 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 290 A 0.129 0.161 0.263 0.234 0.112 0.057 0.030 0.008 0.004 0.001 0.001 291 Y 0.009 0.010 0.026 0.021 0.023 0.065 0.201 0.197 0.206 0.157 0.086 292 E 0.024 0.021 0.135 0.234 0.198 0.173 0.138 0.044 0.023 0.008 0.003 293 A 0.031 0.032 0.844 0.059 0.020 0.008 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 294 H 0.001 0.006 0.054 0.055 0.082 0.221 0.344 0.126 0.064 0.034 0.013 295 M 0.001 0.003 0.032 0.014 0.021 0.055 0.252 0.217 0.196 0.137 0.070 296 R 0.019 0.044 0.689 0.157 0.064 0.019 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 297 D 0.041 0.066 0.580 0.178 0.090 0.033 0.010 0.002 0.001 0.001 0.001 298 V 0.001 0.001 0.006 0.003 0.004 0.014 0.104 0.133 0.272 0.278 0.186 299 R 0.001 0.002 0.021 0.038 0.102 0.231 0.396 0.129 0.055 0.019 0.007 300 D 0.008 0.027 0.832 0.100 0.024 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 301 Y 0.001 0.005 0.033 0.051 0.123 0.270 0.351 0.107 0.038 0.016 0.005 302 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.027 0.076 0.236 0.333 0.321 303 E 0.001 0.001 0.025 0.071 0.235 0.312 0.259 0.063 0.024 0.007 0.002 304 E 0.032 0.042 0.813 0.092 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 305 R 0.001 0.003 0.009 0.021 0.058 0.173 0.433 0.172 0.084 0.034 0.011 306 L 0.001 0.001 0.003 0.003 0.003 0.009 0.064 0.144 0.233 0.279 0.261 307 E 0.013 0.069 0.370 0.254 0.188 0.069 0.028 0.006 0.002 0.001 0.001 308 A 0.087 0.086 0.575 0.126 0.056 0.035 0.021 0.007 0.004 0.002 0.001 309 E 0.048 0.046 0.025 0.066 0.083 0.127 0.268 0.137 0.096 0.064 0.040 310 F 0.133 0.067 0.022 0.049 0.050 0.085 0.171 0.135 0.138 0.098 0.052 311 G 0.521 0.174 0.060 0.087 0.053 0.038 0.028 0.014 0.011 0.008 0.006 312 Q 0.091 0.099 0.059 0.135 0.119 0.111 0.141 0.098 0.072 0.049 0.024 313 K 0.271 0.169 0.059 0.159 0.117 0.083 0.068 0.033 0.022 0.013 0.007 314 R 0.037 0.048 0.034 0.155 0.155 0.161 0.170 0.101 0.074 0.042 0.024 315 I 0.009 0.007 0.009 0.020 0.029 0.056 0.135 0.184 0.230 0.197 0.124 316 H 0.015 0.066 0.099 0.234 0.198 0.139 0.121 0.065 0.039 0.017 0.009 317 L 0.003 0.007 0.010 0.017 0.023 0.039 0.124 0.177 0.226 0.220 0.155 318 N 0.013 0.025 0.024 0.098 0.130 0.135 0.205 0.137 0.112 0.075 0.047 319 S 0.101 0.105 0.047 0.157 0.138 0.110 0.140 0.086 0.066 0.034 0.014 320 Q 0.218 0.148 0.077 0.195 0.125 0.091 0.068 0.035 0.023 0.013 0.007 321 F 0.071 0.067 0.030 0.088 0.096 0.109 0.168 0.129 0.104 0.084 0.052 322 P 0.266 0.228 0.037 0.107 0.082 0.067 0.075 0.052 0.042 0.029 0.015 323 G 0.429 0.142 0.049 0.101 0.076 0.057 0.055 0.033 0.027 0.018 0.012 324 T 0.232 0.102 0.048 0.123 0.087 0.079 0.103 0.069 0.062 0.052 0.043 325 Q 0.183 0.157 0.091 0.210 0.136 0.083 0.060 0.034 0.024 0.014 0.009 326 R 0.047 0.060 0.036 0.113 0.129 0.142 0.177 0.129 0.090 0.051 0.027 327 L 0.017 0.018 0.012 0.032 0.050 0.070 0.139 0.166 0.180 0.162 0.154 328 P 0.057 0.052 0.032 0.087 0.093 0.094 0.144 0.135 0.139 0.101 0.067 329 N 0.036 0.023 0.013 0.075 0.098 0.133 0.205 0.143 0.127 0.088 0.059 330 T 0.005 0.005 0.004 0.014 0.017 0.029 0.081 0.143 0.208 0.245 0.249 331 C 0.003 0.003 0.002 0.010 0.014 0.026 0.081 0.147 0.227 0.251 0.236 332 N 0.007 0.018 0.020 0.059 0.065 0.094 0.157 0.163 0.168 0.133 0.115 333 F 0.004 0.005 0.006 0.018 0.028 0.057 0.131 0.180 0.210 0.214 0.145 334 S 0.026 0.053 0.027 0.159 0.202 0.142 0.174 0.100 0.061 0.032 0.023 335 I 0.005 0.004 0.003 0.011 0.015 0.023 0.067 0.104 0.203 0.259 0.306 336 R 0.181 0.220 0.092 0.248 0.128 0.066 0.040 0.013 0.007 0.003 0.002 337 G 0.147 0.095 0.027 0.115 0.122 0.119 0.148 0.093 0.069 0.044 0.021 338 P 0.289 0.247 0.061 0.121 0.080 0.059 0.056 0.033 0.024 0.019 0.012 339 R 0.147 0.134 0.050 0.197 0.168 0.125 0.101 0.035 0.024 0.012 0.007 340 L 0.090 0.045 0.022 0.057 0.068 0.090 0.141 0.136 0.153 0.114 0.083 341 Q 0.019 0.180 0.053 0.194 0.148 0.121 0.113 0.070 0.051 0.032 0.019 342 G 0.010 0.009 0.006 0.021 0.043 0.077 0.165 0.175 0.202 0.165 0.127 343 H 0.082 0.060 0.049 0.174 0.222 0.198 0.127 0.045 0.026 0.012 0.005 344 V 0.004 0.028 0.066 0.259 0.256 0.175 0.136 0.044 0.021 0.008 0.004 345 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.029 0.080 0.199 0.304 0.377 346 L 0.001 0.001 0.004 0.011 0.029 0.079 0.215 0.188 0.207 0.161 0.106 347 A 0.008 0.018 0.567 0.235 0.097 0.043 0.021 0.006 0.003 0.001 0.001 348 Q 0.001 0.001 0.005 0.014 0.041 0.173 0.444 0.173 0.084 0.044 0.020 349 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.017 0.068 0.194 0.337 0.378 350 R 0.026 0.036 0.111 0.201 0.208 0.184 0.136 0.051 0.026 0.013 0.008 351 V 0.014 0.047 0.345 0.175 0.131 0.132 0.088 0.033 0.020 0.010 0.005 352 L 0.002 0.004 0.004 0.012 0.022 0.048 0.173 0.204 0.211 0.190 0.130 353 M 0.029 0.023 0.011 0.032 0.034 0.060 0.158 0.146 0.161 0.155 0.190 354 A 0.017 0.022 0.033 0.047 0.057 0.066 0.117 0.132 0.173 0.168 0.168 355 S 0.072 0.065 0.034 0.116 0.116 0.125 0.161 0.112 0.093 0.060 0.046 356 V 0.020 0.014 0.007 0.027 0.034 0.047 0.112 0.152 0.183 0.201 0.204 357 G 0.029 0.023 0.011 0.042 0.054 0.079 0.151 0.157 0.183 0.145 0.127 358 A 0.010 0.010 0.008 0.021 0.026 0.049 0.116 0.146 0.200 0.206 0.209 359 A 0.003 0.003 0.002 0.007 0.010 0.019 0.064 0.124 0.202 0.258 0.307 360 C 0.004 0.003 0.003 0.011 0.014 0.027 0.081 0.138 0.208 0.233 0.278 361 H 0.006 0.011 0.009 0.028 0.033 0.048 0.118 0.156 0.200 0.196 0.195 362 S 0.008 0.012 0.009 0.036 0.048 0.074 0.137 0.169 0.195 0.165 0.145 363 D 0.161 0.104 0.049 0.157 0.128 0.109 0.097 0.070 0.055 0.043 0.028 364 H 0.074 0.062 0.027 0.099 0.117 0.111 0.179 0.128 0.103 0.067 0.034 365 G 0.133 0.053 0.021 0.062 0.054 0.062 0.108 0.109 0.137 0.129 0.131 366 D 0.043 0.040 0.020 0.085 0.098 0.116 0.156 0.124 0.114 0.104 0.100 367 Q 0.063 0.130 0.044 0.122 0.105 0.102 0.120 0.102 0.093 0.074 0.046 368 P 0.087 0.038 0.018 0.059 0.077 0.098 0.130 0.133 0.139 0.128 0.093 369 S 0.084 0.051 0.014 0.058 0.069 0.075 0.143 0.130 0.156 0.128 0.091 370 P 0.110 0.085 0.063 0.159 0.121 0.106 0.111 0.078 0.079 0.055 0.034 371 V 0.019 0.013 0.009 0.031 0.036 0.049 0.110 0.133 0.184 0.193 0.224 372 L 0.021 0.024 0.028 0.057 0.056 0.083 0.140 0.161 0.173 0.146 0.112 373 L 0.019 0.026 0.040 0.109 0.135 0.163 0.190 0.132 0.095 0.058 0.033 374 S 0.058 0.065 0.118 0.110 0.093 0.088 0.123 0.100 0.103 0.076 0.066 375 Y 0.040 0.028 0.029 0.072 0.090 0.123 0.209 0.143 0.122 0.090 0.054 376 G 0.191 0.127 0.059 0.118 0.089 0.072 0.097 0.065 0.071 0.060 0.050 377 V 0.015 0.027 0.021 0.054 0.069 0.098 0.149 0.140 0.152 0.145 0.129 378 P 0.262 0.242 0.103 0.160 0.097 0.055 0.041 0.018 0.012 0.007 0.005 379 F 0.121 0.063 0.030 0.098 0.101 0.125 0.178 0.105 0.088 0.055 0.035 380 D 0.524 0.181 0.051 0.091 0.053 0.035 0.026 0.012 0.011 0.008 0.007 381 V 0.018 0.038 0.028 0.090 0.102 0.126 0.182 0.123 0.125 0.094 0.075 382 A 0.024 0.021 0.014 0.039 0.061 0.091 0.183 0.151 0.152 0.129 0.135 383 R 0.061 0.092 0.094 0.260 0.213 0.120 0.085 0.038 0.021 0.011 0.006 384 N 0.010 0.016 0.017 0.072 0.126 0.176 0.273 0.148 0.086 0.048 0.027 385 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.010 0.040 0.089 0.183 0.263 0.402 386 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.012 0.078 0.170 0.257 0.276 0.199 387 R 0.001 0.001 0.005 0.009 0.012 0.028 0.086 0.157 0.222 0.224 0.257 388 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.033 0.084 0.177 0.311 0.386 389 S 0.001 0.001 0.002 0.008 0.012 0.025 0.112 0.208 0.273 0.210 0.148 390 V 0.004 0.007 0.009 0.016 0.018 0.035 0.103 0.142 0.225 0.230 0.211 391 G 0.015 0.021 0.019 0.079 0.101 0.111 0.159 0.152 0.147 0.119 0.077 392 R 0.023 0.035 0.020 0.089 0.124 0.143 0.209 0.143 0.116 0.062 0.036 393 S 0.061 0.030 0.016 0.043 0.067 0.085 0.164 0.158 0.171 0.121 0.084 394 T 0.051 0.092 0.027 0.103 0.118 0.130 0.143 0.105 0.098 0.075 0.058 395 T 0.032 0.182 0.039 0.122 0.119 0.122 0.138 0.089 0.069 0.055 0.034 396 R 0.393 0.176 0.070 0.160 0.117 0.055 0.021 0.005 0.002 0.001 0.001 397 A 0.622 0.137 0.061 0.085 0.042 0.024 0.020 0.006 0.003 0.001 0.001 398 E 0.003 0.018 0.024 0.087 0.086 0.133 0.251 0.165 0.122 0.070 0.041 399 V 0.001 0.001 0.005 0.004 0.008 0.026 0.150 0.205 0.232 0.210 0.160 400 D 0.008 0.025 0.419 0.302 0.149 0.066 0.023 0.005 0.002 0.001 0.001 401 L 0.001 0.014 0.153 0.257 0.243 0.195 0.104 0.023 0.007 0.002 0.001 402 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.005 0.047 0.099 0.213 0.303 0.328 403 V 0.001 0.001 0.012 0.009 0.024 0.092 0.476 0.207 0.110 0.050 0.021 404 Q 0.003 0.010 0.802 0.139 0.035 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 405 D 0.001 0.002 0.027 0.034 0.089 0.257 0.412 0.118 0.040 0.017 0.005 406 L 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.003 0.044 0.098 0.271 0.302 0.267 407 K 0.006 0.010 0.323 0.226 0.185 0.136 0.095 0.014 0.003 0.001 0.001 408 Q 0.005 0.020 0.727 0.182 0.051 0.012 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 409 A 0.001 0.001 0.008 0.003 0.006 0.034 0.291 0.228 0.229 0.139 0.061 410 V 0.001 0.001 0.017 0.011 0.022 0.072 0.343 0.236 0.166 0.096 0.037 411 A 0.001 0.006 0.898 0.061 0.024 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 412 Q 0.001 0.009 0.175 0.164 0.256 0.243 0.116 0.026 0.007 0.003 0.001 413 L 0.001 0.003 0.028 0.004 0.006 0.012 0.091 0.137 0.267 0.264 0.186 414 E 0.016 0.031 0.217 0.186 0.194 0.144 0.144 0.043 0.017 0.006 0.002 415 D 0.059 0.074 0.773 0.064 0.021 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 416 Q 0.165 0.159 0.138 0.140 0.117 0.099 0.102 0.039 0.022 0.013 0.006