# TARGET T0338 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0338/T0338.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 986 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 A 0.046 0.091 0.116 0.160 0.016 0.074 0.025 0.017 0.008 0.005 0.080 0.103 0.209 0.012 0.011 0.027 2 S 0.018 0.076 0.160 0.153 0.009 0.107 0.018 0.021 0.008 0.006 0.052 0.088 0.225 0.009 0.024 0.025 3 S 0.017 0.042 0.087 0.083 0.005 0.171 0.012 0.012 0.008 0.007 0.090 0.073 0.354 0.005 0.014 0.021 4 R 0.028 0.097 0.062 0.117 0.002 0.044 0.006 0.008 0.007 0.002 0.165 0.121 0.309 0.005 0.008 0.020 5 W 0.027 0.037 0.094 0.136 0.003 0.046 0.010 0.004 0.005 0.002 0.040 0.159 0.396 0.006 0.009 0.027 6 F 0.012 0.046 0.277 0.168 0.003 0.030 0.011 0.002 0.002 0.001 0.023 0.020 0.366 0.003 0.006 0.032 7 F 0.012 0.059 0.182 0.394 0.006 0.055 0.013 0.005 0.001 0.001 0.010 0.026 0.212 0.004 0.004 0.016 8 T 0.005 0.013 0.027 0.073 0.003 0.612 0.002 0.010 0.001 0.003 0.024 0.015 0.204 0.001 0.004 0.003 9 R 0.001 0.020 0.007 0.024 0.002 0.036 0.001 0.004 0.002 0.001 0.719 0.018 0.159 0.003 0.001 0.004 10 E 0.005 0.049 0.010 0.038 0.001 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 0.016 0.623 0.222 0.004 0.007 0.003 11 Q 0.004 0.010 0.064 0.037 0.002 0.022 0.019 0.002 0.002 0.001 0.011 0.017 0.717 0.019 0.020 0.055 12 L 0.011 0.012 0.112 0.033 0.013 0.024 0.104 0.006 0.001 0.001 0.046 0.018 0.501 0.055 0.023 0.039 13 E 0.022 0.073 0.128 0.086 0.005 0.027 0.027 0.044 0.009 0.004 0.029 0.031 0.344 0.022 0.069 0.082 14 N 0.038 0.061 0.180 0.204 0.005 0.014 0.032 0.006 0.024 0.014 0.015 0.018 0.153 0.019 0.018 0.199 15 T 0.063 0.031 0.210 0.110 0.011 0.267 0.030 0.008 0.002 0.005 0.013 0.023 0.193 0.004 0.011 0.019 16 P 0.011 0.075 0.081 0.077 0.009 0.164 0.009 0.019 0.004 0.004 0.373 0.024 0.129 0.007 0.004 0.010 17 S 0.014 0.148 0.022 0.120 0.010 0.071 0.009 0.010 0.013 0.003 0.077 0.392 0.088 0.007 0.009 0.007 18 R 0.014 0.042 0.107 0.076 0.018 0.061 0.018 0.014 0.009 0.004 0.088 0.090 0.395 0.010 0.023 0.031 19 R 0.008 0.010 0.049 0.015 0.139 0.018 0.251 0.005 0.003 0.002 0.027 0.022 0.062 0.368 0.005 0.015 20 C 0.006 0.024 0.035 0.026 0.002 0.008 0.007 0.275 0.003 0.001 0.010 0.018 0.049 0.002 0.528 0.006 21 G 0.007 0.014 0.031 0.033 0.002 0.012 0.008 0.002 0.193 0.082 0.012 0.008 0.049 0.004 0.003 0.538 22 V 0.740 0.023 0.075 0.083 0.001 0.005 0.003 0.003 0.002 0.001 0.009 0.017 0.027 0.001 0.004 0.007 23 E 0.012 0.024 0.325 0.084 0.011 0.409 0.011 0.003 0.002 0.006 0.011 0.027 0.059 0.003 0.002 0.009 24 A 0.013 0.098 0.051 0.163 0.007 0.145 0.004 0.020 0.002 0.002 0.358 0.030 0.094 0.002 0.005 0.004 25 D 0.006 0.081 0.023 0.098 0.006 0.177 0.004 0.006 0.012 0.005 0.087 0.378 0.105 0.002 0.004 0.007 26 K 0.017 0.050 0.092 0.088 0.002 0.021 0.004 0.009 0.003 0.002 0.177 0.116 0.392 0.002 0.007 0.017 27 E 0.007 0.013 0.037 0.023 0.004 0.156 0.009 0.002 0.002 0.002 0.025 0.180 0.523 0.004 0.003 0.010 28 L 0.002 0.005 0.012 0.006 0.001 0.032 0.003 0.002 0.001 0.001 0.150 0.031 0.747 0.001 0.003 0.003 29 S 0.001 0.014 0.004 0.009 0.001 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.037 0.298 0.613 0.001 0.001 0.004 30 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.015 0.030 0.943 0.001 0.001 0.001 31 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.021 0.965 0.001 0.001 0.001 32 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.013 0.982 0.001 0.001 0.001 33 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.991 0.001 0.001 0.001 34 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 35 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 36 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 37 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 38 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 39 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 40 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 41 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 42 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.990 0.002 0.001 0.003 43 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.989 0.001 0.002 0.001 44 R 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.231 0.675 0.004 0.051 45 L 0.003 0.002 0.027 0.004 0.001 0.001 0.009 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.320 0.002 0.611 0.009 46 N 0.003 0.008 0.036 0.007 0.001 0.009 0.005 0.001 0.008 0.011 0.004 0.003 0.249 0.003 0.002 0.652 47 V 0.454 0.012 0.032 0.030 0.001 0.019 0.006 0.001 0.001 0.001 0.034 0.053 0.344 0.002 0.003 0.008 48 S 0.002 0.010 0.033 0.004 0.001 0.374 0.001 0.001 0.001 0.002 0.051 0.115 0.402 0.001 0.001 0.002 49 Q 0.001 0.004 0.001 0.003 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.650 0.036 0.297 0.001 0.001 0.001 50 L 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.765 0.224 0.001 0.001 0.001 51 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.988 0.001 0.001 0.001 52 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.986 0.001 0.001 0.001 53 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.986 0.001 0.001 0.001 54 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.994 0.001 0.001 0.001 55 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 56 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 57 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 58 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 59 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.002 0.003 0.001 60 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.969 0.005 0.008 0.008 61 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.960 0.004 0.006 0.016 62 F 0.005 0.003 0.015 0.002 0.001 0.002 0.013 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.887 0.012 0.007 0.042 63 Y 0.007 0.009 0.057 0.014 0.003 0.009 0.042 0.001 0.001 0.001 0.005 0.010 0.764 0.030 0.015 0.035 64 M 0.007 0.037 0.075 0.045 0.006 0.035 0.044 0.008 0.002 0.001 0.013 0.016 0.594 0.027 0.035 0.055 65 H 0.024 0.078 0.137 0.127 0.007 0.025 0.045 0.014 0.012 0.005 0.028 0.017 0.267 0.038 0.048 0.129 66 H 0.073 0.047 0.269 0.176 0.003 0.033 0.020 0.018 0.011 0.007 0.028 0.027 0.178 0.006 0.036 0.068 67 S 0.062 0.087 0.284 0.234 0.004 0.065 0.009 0.004 0.011 0.005 0.025 0.024 0.121 0.003 0.005 0.058 68 F 0.064 0.060 0.179 0.363 0.024 0.089 0.025 0.004 0.003 0.003 0.042 0.037 0.086 0.006 0.003 0.014 69 T 0.011 0.078 0.103 0.199 0.035 0.308 0.011 0.029 0.003 0.003 0.049 0.060 0.095 0.003 0.007 0.006 70 K 0.009 0.068 0.030 0.099 0.097 0.165 0.025 0.027 0.018 0.013 0.243 0.044 0.119 0.022 0.005 0.018 71 F 0.024 0.136 0.046 0.067 0.012 0.034 0.021 0.060 0.012 0.008 0.105 0.281 0.135 0.009 0.040 0.011 72 N 0.016 0.038 0.083 0.039 0.003 0.070 0.009 0.017 0.031 0.023 0.053 0.116 0.385 0.003 0.033 0.079 73 K 0.063 0.009 0.068 0.031 0.001 0.043 0.002 0.003 0.007 0.005 0.168 0.079 0.490 0.001 0.002 0.029 74 N 0.019 0.051 0.052 0.034 0.001 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.398 0.401 0.001 0.001 0.004 75 I 0.002 0.001 0.010 0.019 0.001 0.044 0.001 0.001 0.001 0.001 0.073 0.024 0.826 0.001 0.001 0.001 76 I 0.001 0.006 0.003 0.004 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.090 0.879 0.001 0.001 0.001 77 S 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.019 0.964 0.001 0.001 0.001 78 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.986 0.001 0.001 0.001 79 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 80 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 81 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 82 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 83 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 84 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.004 0.002 0.004 85 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.977 0.001 0.012 0.007 86 K 0.002 0.001 0.008 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.826 0.016 0.005 0.134 87 V 0.011 0.003 0.022 0.008 0.001 0.010 0.008 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.889 0.009 0.012 0.017 88 E 0.003 0.011 0.026 0.006 0.005 0.028 0.031 0.001 0.001 0.001 0.026 0.011 0.794 0.033 0.005 0.020 89 E 0.010 0.112 0.033 0.057 0.004 0.013 0.027 0.020 0.003 0.001 0.046 0.077 0.456 0.045 0.055 0.041 90 Q 0.013 0.028 0.091 0.044 0.003 0.039 0.056 0.007 0.011 0.008 0.020 0.068 0.434 0.017 0.055 0.106 91 A 0.048 0.044 0.198 0.036 0.003 0.037 0.029 0.006 0.005 0.003 0.051 0.019 0.389 0.006 0.026 0.101 92 R 0.061 0.172 0.215 0.203 0.001 0.014 0.005 0.007 0.004 0.005 0.033 0.081 0.151 0.003 0.009 0.037 93 K 0.011 0.004 0.018 0.017 0.002 0.702 0.003 0.001 0.001 0.005 0.008 0.042 0.180 0.001 0.001 0.003 94 L 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.052 0.001 0.001 0.001 0.001 0.796 0.009 0.133 0.001 0.001 0.001 95 E 0.001 0.015 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.019 0.879 0.080 0.001 0.001 0.001 96 H 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.022 0.960 0.001 0.001 0.003 97 V 0.001 0.001 0.015 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.001 0.001 0.012 0.006 0.952 0.001 0.001 0.002 98 I 0.001 0.005 0.004 0.007 0.001 0.003 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.028 0.943 0.001 0.002 0.001 99 K 0.001 0.002 0.005 0.017 0.001 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.937 0.005 0.001 0.015 100 V 0.004 0.009 0.022 0.027 0.001 0.010 0.017 0.001 0.001 0.001 0.008 0.008 0.848 0.019 0.010 0.017 101 A 0.004 0.027 0.122 0.054 0.002 0.014 0.021 0.005 0.001 0.001 0.009 0.013 0.613 0.024 0.050 0.042 102 H 0.013 0.024 0.071 0.091 0.007 0.037 0.033 0.004 0.003 0.002 0.024 0.010 0.535 0.039 0.028 0.079 103 A 0.058 0.122 0.192 0.179 0.005 0.013 0.028 0.013 0.006 0.002 0.018 0.015 0.173 0.030 0.039 0.107 104 C 0.043 0.045 0.270 0.210 0.006 0.107 0.040 0.008 0.009 0.008 0.012 0.022 0.130 0.006 0.025 0.059 105 L 0.052 0.141 0.300 0.289 0.005 0.039 0.011 0.004 0.005 0.003 0.034 0.009 0.058 0.002 0.004 0.045 106 H 0.051 0.064 0.121 0.505 0.008 0.120 0.008 0.004 0.003 0.006 0.018 0.057 0.026 0.002 0.002 0.006 107 P 0.007 0.050 0.054 0.154 0.015 0.564 0.005 0.010 0.002 0.003 0.064 0.024 0.042 0.001 0.001 0.003 108 L 0.005 0.199 0.030 0.221 0.003 0.054 0.002 0.015 0.006 0.002 0.332 0.065 0.058 0.001 0.003 0.004 109 E 0.013 0.051 0.064 0.147 0.011 0.128 0.018 0.004 0.010 0.005 0.033 0.366 0.138 0.004 0.004 0.006 110 P 0.013 0.044 0.108 0.138 0.004 0.069 0.008 0.021 0.002 0.001 0.138 0.035 0.387 0.003 0.014 0.015 111 L 0.010 0.089 0.095 0.207 0.014 0.057 0.035 0.004 0.017 0.003 0.039 0.106 0.229 0.030 0.007 0.056 112 L 0.031 0.049 0.189 0.250 0.008 0.024 0.036 0.014 0.003 0.001 0.018 0.032 0.282 0.007 0.035 0.020 113 D 0.015 0.034 0.177 0.185 0.019 0.144 0.030 0.012 0.014 0.012 0.019 0.017 0.200 0.016 0.010 0.097 114 T 0.057 0.080 0.119 0.219 0.055 0.045 0.039 0.020 0.006 0.007 0.130 0.024 0.134 0.023 0.012 0.031 115 K 0.015 0.080 0.079 0.094 0.057 0.209 0.058 0.043 0.007 0.011 0.043 0.106 0.112 0.044 0.025 0.017 116 C 0.013 0.061 0.045 0.052 0.005 0.148 0.011 0.086 0.014 0.015 0.181 0.055 0.209 0.005 0.075 0.023 117 D 0.032 0.085 0.032 0.044 0.003 0.042 0.006 0.008 0.049 0.019 0.211 0.236 0.158 0.004 0.010 0.060 118 A 0.151 0.037 0.111 0.054 0.003 0.032 0.008 0.006 0.006 0.002 0.069 0.218 0.257 0.007 0.012 0.027 119 Y 0.015 0.016 0.170 0.026 0.009 0.122 0.036 0.004 0.003 0.002 0.048 0.090 0.418 0.013 0.007 0.020 120 L 0.007 0.067 0.045 0.039 0.004 0.052 0.020 0.011 0.002 0.001 0.111 0.071 0.534 0.005 0.015 0.015 121 Q 0.011 0.053 0.053 0.091 0.001 0.025 0.004 0.009 0.011 0.005 0.036 0.134 0.507 0.002 0.011 0.045 122 Q 0.015 0.006 0.027 0.013 0.002 0.067 0.006 0.001 0.001 0.003 0.032 0.067 0.743 0.003 0.002 0.013 123 T 0.002 0.002 0.007 0.002 0.001 0.073 0.001 0.001 0.001 0.001 0.108 0.045 0.753 0.001 0.002 0.001 124 R 0.001 0.006 0.002 0.002 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.066 0.165 0.755 0.001 0.001 0.001 125 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.062 0.933 0.001 0.001 0.001 126 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.004 0.991 0.001 0.001 0.001 127 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.986 0.001 0.001 0.001 128 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.997 0.001 0.001 0.001 129 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 130 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 131 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 132 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 133 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 134 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 135 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 136 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.088 0.869 0.001 0.030 137 L 0.001 0.002 0.015 0.001 0.001 0.001 0.006 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.165 0.003 0.797 0.003 138 G 0.001 0.009 0.020 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.002 0.001 0.001 0.043 0.002 0.003 0.903 139 F 0.895 0.001 0.021 0.045 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.022 0.001 0.001 0.006 140 E 0.008 0.076 0.811 0.077 0.001 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.009 0.001 0.001 0.006 141 I 0.002 0.007 0.020 0.949 0.001 0.014 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 142 T 0.004 0.031 0.170 0.730 0.012 0.039 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.001 0.001 0.001 143 I 0.006 0.024 0.018 0.680 0.036 0.185 0.004 0.005 0.002 0.003 0.024 0.003 0.006 0.001 0.001 0.002 144 E 0.004 0.225 0.034 0.660 0.005 0.022 0.001 0.012 0.003 0.001 0.013 0.013 0.003 0.001 0.001 0.002 145 H 0.004 0.016 0.011 0.106 0.023 0.756 0.006 0.003 0.005 0.015 0.010 0.027 0.016 0.001 0.001 0.002 146 P 0.005 0.065 0.023 0.027 0.004 0.062 0.001 0.024 0.001 0.001 0.735 0.019 0.029 0.001 0.001 0.002 147 H 0.004 0.025 0.009 0.019 0.006 0.077 0.004 0.004 0.011 0.008 0.090 0.680 0.052 0.007 0.002 0.003 148 T 0.008 0.017 0.021 0.015 0.001 0.020 0.002 0.011 0.001 0.001 0.227 0.151 0.493 0.001 0.027 0.004 149 D 0.002 0.005 0.005 0.004 0.001 0.024 0.001 0.001 0.004 0.001 0.056 0.178 0.698 0.001 0.001 0.020 150 V 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.082 0.879 0.001 0.001 0.001 151 V 0.001 0.003 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.043 0.941 0.001 0.001 0.001 152 K 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.987 0.001 0.001 0.001 153 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.986 0.001 0.001 0.001 154 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.985 0.001 0.001 0.001 155 Q 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.985 0.001 0.001 0.001 156 L 0.001 0.002 0.003 0.003 0.001 0.002 0.017 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.755 0.166 0.006 0.040 157 V 0.002 0.004 0.035 0.006 0.001 0.002 0.022 0.002 0.001 0.001 0.003 0.006 0.717 0.007 0.176 0.017 158 R 0.004 0.009 0.041 0.008 0.001 0.012 0.018 0.001 0.002 0.003 0.005 0.005 0.551 0.017 0.008 0.314 159 A 0.151 0.039 0.069 0.034 0.002 0.019 0.020 0.008 0.002 0.002 0.052 0.029 0.471 0.023 0.028 0.050 160 S 0.007 0.012 0.051 0.004 0.003 0.286 0.017 0.003 0.001 0.004 0.054 0.059 0.463 0.008 0.015 0.012 161 K 0.006 0.028 0.012 0.006 0.001 0.010 0.002 0.005 0.001 0.001 0.544 0.063 0.307 0.001 0.006 0.008 162 D 0.004 0.011 0.004 0.004 0.001 0.013 0.001 0.001 0.003 0.001 0.012 0.686 0.253 0.001 0.001 0.006 163 L 0.002 0.001 0.011 0.001 0.001 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.038 0.018 0.917 0.001 0.001 0.002 164 A 0.001 0.006 0.004 0.002 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.097 0.878 0.001 0.001 0.001 165 Q 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.013 0.974 0.001 0.001 0.001 166 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.017 0.971 0.001 0.001 0.001 167 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.007 0.984 0.001 0.001 0.001 168 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.987 0.001 0.001 0.001 169 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.995 0.001 0.001 0.001 170 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 171 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.985 0.002 0.001 0.001 172 T 0.001 0.002 0.002 0.005 0.001 0.004 0.004 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.948 0.009 0.015 0.004 173 N 0.001 0.004 0.003 0.005 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.005 0.916 0.004 0.019 0.033 174 S 0.011 0.003 0.009 0.005 0.001 0.003 0.014 0.001 0.001 0.001 0.008 0.011 0.847 0.027 0.006 0.054 175 L 0.011 0.013 0.058 0.013 0.001 0.005 0.013 0.002 0.001 0.001 0.009 0.021 0.808 0.005 0.024 0.016 176 H 0.007 0.034 0.091 0.073 0.003 0.023 0.016 0.002 0.005 0.002 0.008 0.014 0.526 0.014 0.010 0.172 177 L 0.038 0.044 0.132 0.152 0.009 0.054 0.051 0.003 0.002 0.001 0.023 0.018 0.427 0.007 0.011 0.027 178 T 0.010 0.085 0.119 0.075 0.006 0.256 0.015 0.015 0.003 0.004 0.037 0.045 0.300 0.004 0.012 0.015 179 T 0.015 0.084 0.043 0.112 0.005 0.078 0.008 0.012 0.009 0.004 0.311 0.049 0.233 0.009 0.007 0.022 180 F 0.027 0.128 0.084 0.144 0.002 0.038 0.005 0.006 0.007 0.001 0.039 0.251 0.233 0.003 0.018 0.016 181 C 0.021 0.021 0.161 0.106 0.008 0.053 0.036 0.002 0.005 0.002 0.029 0.037 0.430 0.021 0.008 0.059 182 L 0.020 0.059 0.140 0.154 0.006 0.043 0.020 0.015 0.001 0.001 0.067 0.044 0.393 0.005 0.017 0.015 183 Q 0.017 0.103 0.160 0.360 0.009 0.025 0.012 0.007 0.020 0.004 0.009 0.020 0.141 0.009 0.007 0.097 184 Y 0.062 0.028 0.277 0.398 0.007 0.029 0.015 0.004 0.002 0.005 0.008 0.014 0.120 0.001 0.007 0.022 185 K 0.008 0.027 0.127 0.099 0.011 0.453 0.003 0.005 0.002 0.008 0.034 0.019 0.191 0.001 0.001 0.010 186 P 0.003 0.004 0.002 0.015 0.001 0.213 0.001 0.002 0.001 0.001 0.538 0.043 0.178 0.001 0.001 0.001 187 T 0.001 0.017 0.001 0.002 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.861 0.093 0.001 0.001 0.001 188 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.125 0.046 0.824 0.001 0.001 0.001 189 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.047 0.950 0.001 0.001 0.001 190 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.996 0.001 0.001 0.001 191 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.997 0.001 0.001 0.001 192 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 193 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 194 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 195 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 196 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 197 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 198 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.002 0.001 199 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.948 0.011 0.004 0.030 200 W 0.002 0.001 0.006 0.001 0.005 0.001 0.074 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.203 0.664 0.011 0.029 201 S 0.003 0.007 0.026 0.003 0.001 0.004 0.020 0.025 0.001 0.001 0.004 0.003 0.214 0.016 0.653 0.022 202 N 0.009 0.021 0.025 0.008 0.001 0.006 0.017 0.003 0.037 0.019 0.010 0.007 0.118 0.022 0.017 0.680 203 W 0.701 0.017 0.051 0.028 0.001 0.010 0.017 0.004 0.004 0.002 0.021 0.026 0.071 0.005 0.015 0.026 204 E 0.025 0.146 0.622 0.072 0.001 0.011 0.010 0.002 0.006 0.001 0.003 0.014 0.025 0.002 0.006 0.055 205 I 0.032 0.023 0.269 0.625 0.001 0.014 0.004 0.001 0.002 0.001 0.003 0.004 0.011 0.001 0.001 0.010 206 P 0.016 0.018 0.279 0.342 0.025 0.276 0.009 0.002 0.001 0.002 0.007 0.005 0.014 0.001 0.001 0.003 207 V 0.006 0.148 0.029 0.547 0.014 0.092 0.002 0.018 0.002 0.001 0.115 0.010 0.011 0.001 0.001 0.002 208 S 0.005 0.101 0.025 0.242 0.048 0.316 0.007 0.011 0.022 0.010 0.031 0.147 0.026 0.002 0.002 0.004 209 T 0.012 0.066 0.066 0.065 0.139 0.099 0.114 0.023 0.005 0.006 0.259 0.036 0.068 0.031 0.006 0.007 210 D 0.009 0.135 0.062 0.093 0.003 0.037 0.005 0.254 0.016 0.005 0.054 0.144 0.036 0.002 0.132 0.012 211 G 0.029 0.038 0.095 0.109 0.004 0.041 0.006 0.007 0.152 0.062 0.062 0.044 0.112 0.004 0.009 0.227 212 K 0.333 0.045 0.175 0.131 0.009 0.037 0.021 0.004 0.004 0.002 0.048 0.059 0.108 0.006 0.004 0.012 213 H 0.014 0.078 0.268 0.223 0.004 0.158 0.007 0.025 0.003 0.002 0.026 0.050 0.119 0.002 0.011 0.009 214 W 0.008 0.099 0.087 0.464 0.006 0.081 0.004 0.008 0.010 0.004 0.049 0.026 0.124 0.003 0.005 0.023 215 W 0.027 0.035 0.131 0.428 0.010 0.073 0.010 0.006 0.004 0.002 0.053 0.038 0.163 0.005 0.005 0.010 216 E 0.017 0.054 0.196 0.358 0.011 0.061 0.015 0.013 0.003 0.003 0.036 0.046 0.153 0.007 0.009 0.017 217 Y 0.017 0.073 0.095 0.381 0.036 0.119 0.023 0.008 0.009 0.003 0.028 0.021 0.113 0.014 0.007 0.053 218 V 0.018 0.169 0.215 0.387 0.016 0.017 0.034 0.015 0.003 0.002 0.018 0.014 0.039 0.016 0.017 0.020 219 D 0.006 0.015 0.037 0.047 0.005 0.788 0.013 0.008 0.004 0.009 0.005 0.015 0.030 0.002 0.010 0.006 220 P 0.009 0.055 0.012 0.017 0.001 0.017 0.002 0.006 0.003 0.002 0.838 0.008 0.016 0.001 0.001 0.011 221 T 0.046 0.431 0.042 0.083 0.001 0.010 0.002 0.001 0.016 0.001 0.004 0.331 0.009 0.001 0.004 0.020 222 V 0.012 0.020 0.800 0.131 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.015 0.001 0.002 0.011 223 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 224 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 225 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.002 0.001 0.001 0.001 226 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.994 0.001 0.001 0.002 227 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.994 0.001 0.001 0.001 228 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 229 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.995 0.001 0.001 0.001 230 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 231 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 232 H 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 233 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 234 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 235 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 236 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 237 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.980 0.010 0.002 0.005 238 L 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.935 0.025 0.014 0.008 239 E 0.001 0.004 0.010 0.001 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.848 0.016 0.034 0.070 240 K 0.022 0.022 0.065 0.018 0.001 0.001 0.016 0.001 0.003 0.001 0.002 0.003 0.291 0.047 0.027 0.482 241 T 0.024 0.003 0.192 0.006 0.006 0.168 0.119 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.427 0.009 0.018 0.014 242 P 0.005 0.065 0.031 0.007 0.003 0.045 0.010 0.022 0.001 0.001 0.598 0.010 0.170 0.013 0.007 0.012 243 N 0.009 0.081 0.007 0.026 0.001 0.017 0.003 0.009 0.018 0.004 0.044 0.671 0.082 0.006 0.014 0.009 244 R 0.022 0.017 0.090 0.018 0.003 0.034 0.023 0.004 0.006 0.004 0.051 0.079 0.579 0.008 0.018 0.044 245 L 0.017 0.024 0.118 0.030 0.002 0.044 0.019 0.009 0.002 0.001 0.087 0.091 0.511 0.007 0.017 0.020 246 K 0.013 0.031 0.069 0.061 0.002 0.035 0.010 0.008 0.005 0.002 0.059 0.112 0.554 0.005 0.013 0.021 247 K 0.018 0.026 0.073 0.111 0.002 0.030 0.008 0.004 0.005 0.002 0.034 0.060 0.578 0.006 0.007 0.034 248 I 0.019 0.023 0.128 0.104 0.008 0.060 0.029 0.003 0.002 0.001 0.025 0.036 0.507 0.018 0.007 0.028 249 R 0.008 0.067 0.165 0.145 0.004 0.049 0.016 0.013 0.001 0.001 0.035 0.031 0.417 0.006 0.024 0.017 250 N 0.011 0.030 0.077 0.163 0.007 0.120 0.012 0.011 0.008 0.005 0.044 0.037 0.409 0.012 0.011 0.043 251 W 0.033 0.057 0.095 0.155 0.004 0.042 0.009 0.011 0.004 0.003 0.109 0.041 0.396 0.006 0.011 0.025 252 R 0.016 0.057 0.083 0.117 0.015 0.115 0.031 0.005 0.005 0.003 0.038 0.098 0.350 0.030 0.009 0.028 253 A 0.012 0.046 0.117 0.097 0.022 0.076 0.059 0.019 0.003 0.001 0.073 0.034 0.359 0.026 0.036 0.021 254 N 0.010 0.146 0.117 0.136 0.011 0.048 0.022 0.036 0.017 0.008 0.041 0.064 0.219 0.015 0.040 0.069 255 Q 0.060 0.033 0.098 0.087 0.053 0.076 0.098 0.011 0.023 0.017 0.050 0.038 0.196 0.062 0.016 0.078 256 A 0.039 0.089 0.210 0.062 0.026 0.061 0.074 0.046 0.005 0.004 0.091 0.046 0.136 0.024 0.066 0.023