# TARGET T0337 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0337.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1092 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.014 0.007 0.008 0.018 0.287 0.666 2 D 0.041 0.074 0.014 0.035 0.206 0.628 3 C 0.038 0.033 0.021 0.038 0.244 0.626 4 M 0.027 0.014 0.053 0.061 0.331 0.515 5 R 0.034 0.032 0.045 0.078 0.384 0.428 6 K 0.018 0.036 0.027 0.065 0.264 0.591 7 L 0.012 0.018 0.011 0.232 0.197 0.531 8 D 0.009 0.008 0.004 0.269 0.145 0.565 9 R 0.001 0.001 0.001 0.991 0.004 0.004 10 V 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 11 D 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 12 M 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 13 Q 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 14 L 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 15 V 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 16 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 17 I 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 18 L 0.001 0.001 0.001 0.994 0.003 0.002 19 S 0.001 0.001 0.003 0.975 0.013 0.009 20 E 0.001 0.001 0.004 0.830 0.084 0.081 21 N 0.001 0.001 0.012 0.371 0.255 0.360 22 S 0.004 0.003 0.014 0.093 0.349 0.537 23 R 0.009 0.015 0.018 0.052 0.315 0.591 24 L 0.017 0.015 0.009 0.051 0.294 0.614 25 T 0.010 0.007 0.002 0.022 0.086 0.874 26 Y 0.002 0.001 0.011 0.942 0.026 0.019 27 R 0.001 0.001 0.006 0.976 0.016 0.003 28 E 0.001 0.001 0.004 0.982 0.012 0.001 29 L 0.001 0.001 0.003 0.985 0.009 0.001 30 A 0.001 0.001 0.003 0.986 0.008 0.003 31 D 0.001 0.001 0.008 0.974 0.013 0.004 32 I 0.001 0.001 0.005 0.961 0.018 0.014 33 L 0.001 0.001 0.004 0.831 0.037 0.126 34 N 0.001 0.001 0.001 0.012 0.039 0.947 35 T 0.002 0.007 0.001 0.006 0.062 0.923 36 T 0.004 0.003 0.001 0.011 0.049 0.933 37 R 0.001 0.001 0.071 0.747 0.065 0.116 38 Q 0.001 0.001 0.073 0.823 0.046 0.056 39 R 0.001 0.001 0.084 0.893 0.015 0.006 40 I 0.001 0.001 0.007 0.986 0.003 0.004 41 A 0.001 0.001 0.002 0.995 0.002 0.001 42 R 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 43 R 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 44 I 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 45 D 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 46 K 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 47 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 48 K 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 49 K 0.001 0.001 0.001 0.977 0.012 0.009 50 L 0.003 0.001 0.005 0.779 0.089 0.124 51 G 0.011 0.003 0.004 0.040 0.220 0.722 52 I 0.163 0.021 0.010 0.025 0.269 0.512 53 I 0.534 0.014 0.013 0.024 0.208 0.207 54 R 0.617 0.007 0.027 0.032 0.182 0.134 55 K 0.714 0.005 0.026 0.025 0.118 0.112 56 F 0.706 0.008 0.023 0.038 0.119 0.106 57 T 0.783 0.011 0.015 0.042 0.066 0.084 58 I 0.817 0.006 0.011 0.030 0.061 0.076 59 I 0.807 0.012 0.014 0.027 0.074 0.066 60 P 0.548 0.022 0.014 0.040 0.138 0.239 61 D 0.247 0.027 0.019 0.056 0.369 0.281 62 I 0.009 0.001 0.669 0.098 0.206 0.018 63 D 0.007 0.001 0.728 0.065 0.184 0.014 64 K 0.007 0.002 0.786 0.084 0.115 0.006 65 L 0.027 0.009 0.303 0.210 0.279 0.173 66 G 0.067 0.006 0.021 0.019 0.317 0.570 67 Y 0.319 0.013 0.012 0.004 0.193 0.458 68 M 0.581 0.004 0.003 0.001 0.084 0.326 69 Y 0.915 0.006 0.001 0.001 0.018 0.059 70 A 0.963 0.001 0.001 0.001 0.006 0.029 71 I 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 72 V 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 73 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 74 I 0.974 0.001 0.001 0.001 0.005 0.020 75 K 0.943 0.001 0.001 0.001 0.010 0.045 76 S 0.862 0.007 0.001 0.001 0.036 0.094 77 K 0.333 0.033 0.002 0.001 0.165 0.466 78 V 0.059 0.004 0.003 0.003 0.287 0.643 79 P 0.006 0.002 0.196 0.180 0.513 0.103 80 S 0.004 0.001 0.233 0.391 0.319 0.052 81 D 0.003 0.002 0.248 0.575 0.146 0.026 82 A 0.002 0.001 0.025 0.905 0.032 0.036 83 D 0.003 0.001 0.008 0.953 0.016 0.019 84 K 0.004 0.001 0.012 0.961 0.012 0.010 85 V 0.005 0.001 0.004 0.977 0.006 0.008 86 I 0.002 0.001 0.006 0.983 0.005 0.003 87 S 0.001 0.001 0.009 0.975 0.009 0.005 88 E 0.001 0.001 0.025 0.962 0.009 0.004 89 I 0.001 0.001 0.053 0.930 0.014 0.003 90 S 0.001 0.001 0.073 0.862 0.052 0.012 91 D 0.001 0.001 0.032 0.544 0.214 0.209 92 I 0.003 0.001 0.016 0.042 0.553 0.385 93 E 0.010 0.002 0.026 0.023 0.567 0.373 94 Y 0.289 0.017 0.073 0.030 0.447 0.143 95 V 0.850 0.004 0.010 0.008 0.089 0.040 96 K 0.935 0.001 0.003 0.006 0.023 0.032 97 S 0.980 0.001 0.001 0.003 0.005 0.011 98 V 0.967 0.002 0.001 0.007 0.008 0.016 99 E 0.890 0.002 0.003 0.035 0.029 0.041 100 K 0.804 0.004 0.006 0.031 0.082 0.073 101 G 0.643 0.023 0.011 0.062 0.143 0.118 102 V 0.326 0.014 0.017 0.043 0.367 0.233 103 G 0.094 0.007 0.013 0.013 0.553 0.320 104 R 0.079 0.011 0.055 0.007 0.633 0.214 105 Y 0.218 0.035 0.048 0.004 0.517 0.177 106 N 0.358 0.003 0.026 0.001 0.298 0.313 107 I 0.916 0.002 0.002 0.001 0.022 0.057 108 I 0.989 0.003 0.001 0.001 0.002 0.007 109 V 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 110 R 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 111 L 0.990 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 112 L 0.973 0.001 0.001 0.001 0.008 0.018 113 L 0.830 0.006 0.001 0.001 0.031 0.133 114 P 0.085 0.014 0.005 0.001 0.296 0.598 115 K 0.002 0.005 0.054 0.028 0.620 0.291 116 D 0.001 0.001 0.030 0.033 0.499 0.436 117 I 0.001 0.002 0.074 0.709 0.167 0.047 118 K 0.001 0.001 0.014 0.894 0.055 0.037 119 D 0.001 0.001 0.024 0.925 0.039 0.010 120 A 0.002 0.002 0.018 0.939 0.030 0.009 121 E 0.002 0.001 0.006 0.953 0.023 0.014 122 N 0.001 0.001 0.004 0.962 0.019 0.013 123 L 0.001 0.001 0.004 0.975 0.011 0.009 124 I 0.001 0.001 0.003 0.971 0.012 0.012 125 S 0.001 0.001 0.006 0.971 0.013 0.008 126 E 0.001 0.001 0.008 0.958 0.020 0.014 127 F 0.001 0.001 0.012 0.960 0.015 0.012 128 L 0.001 0.001 0.034 0.922 0.026 0.015 129 Q 0.002 0.003 0.083 0.767 0.094 0.051 130 R 0.004 0.003 0.048 0.434 0.248 0.264 131 I 0.007 0.003 0.043 0.050 0.737 0.161 132 K 0.008 0.001 0.039 0.018 0.794 0.139 133 N 0.042 0.005 0.072 0.015 0.768 0.097 134 A 0.338 0.011 0.028 0.010 0.531 0.083 135 E 0.612 0.009 0.013 0.014 0.200 0.152 136 N 0.875 0.005 0.002 0.006 0.045 0.066 137 V 0.900 0.005 0.001 0.008 0.036 0.049 138 E 0.876 0.004 0.002 0.013 0.034 0.069 139 V 0.922 0.002 0.002 0.011 0.020 0.042 140 I 0.964 0.002 0.001 0.007 0.009 0.017 141 L 0.971 0.002 0.001 0.007 0.005 0.014 142 I 0.974 0.002 0.001 0.008 0.004 0.011 143 S 0.940 0.001 0.003 0.018 0.011 0.026 144 E 0.875 0.002 0.005 0.031 0.033 0.054 145 V 0.782 0.009 0.006 0.031 0.069 0.103 146 R 0.587 0.015 0.006 0.044 0.156 0.192 147 K 0.411 0.013 0.011 0.046 0.256 0.262 148 F 0.158 0.012 0.023 0.056 0.403 0.347 149 E 0.044 0.013 0.019 0.045 0.304 0.576 150 I 0.012 0.006 0.006 0.016 0.189 0.770 151 I 0.001 0.002 0.001 0.005 0.058 0.933