# TARGET T0333 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0333.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4708 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.140 0.088 0.064 0.138 0.116 0.107 0.120 0.082 0.073 0.044 0.027 2 L 0.016 0.019 0.012 0.045 0.064 0.094 0.184 0.172 0.166 0.133 0.096 3 F 0.008 0.010 0.006 0.021 0.026 0.043 0.113 0.145 0.208 0.210 0.209 4 V 0.010 0.012 0.007 0.021 0.026 0.039 0.101 0.141 0.212 0.203 0.227 5 S 0.021 0.021 0.018 0.035 0.036 0.046 0.098 0.117 0.182 0.201 0.226 6 S 0.035 0.040 0.022 0.062 0.061 0.070 0.118 0.129 0.168 0.159 0.136 7 P 0.104 0.076 0.034 0.125 0.123 0.129 0.152 0.091 0.078 0.051 0.037 8 G 0.095 0.062 0.024 0.078 0.076 0.082 0.128 0.116 0.131 0.114 0.095 9 I 0.074 0.070 0.031 0.116 0.124 0.136 0.154 0.090 0.090 0.066 0.050 10 G 0.036 0.036 0.019 0.046 0.047 0.056 0.101 0.117 0.176 0.176 0.191 11 H 0.010 0.024 0.010 0.032 0.052 0.083 0.167 0.154 0.194 0.152 0.120 12 L 0.010 0.013 0.009 0.035 0.056 0.089 0.155 0.149 0.190 0.164 0.130 13 F 0.077 0.053 0.042 0.115 0.135 0.135 0.167 0.095 0.086 0.057 0.035 14 P 0.001 0.008 0.008 0.045 0.072 0.113 0.198 0.173 0.168 0.128 0.087 15 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.017 0.053 0.197 0.319 0.407 16 I 0.001 0.002 0.010 0.028 0.058 0.129 0.260 0.174 0.161 0.111 0.065 17 Q 0.001 0.009 0.115 0.159 0.186 0.175 0.183 0.087 0.050 0.024 0.011 18 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.038 0.077 0.203 0.301 0.373 19 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.023 0.068 0.192 0.314 0.397 20 W 0.002 0.006 0.170 0.213 0.197 0.162 0.136 0.051 0.035 0.019 0.009 21 G 0.001 0.002 0.010 0.035 0.102 0.239 0.392 0.137 0.054 0.021 0.008 22 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.026 0.131 0.315 0.518 23 R 0.001 0.001 0.004 0.022 0.060 0.131 0.315 0.197 0.129 0.079 0.062 24 T 0.008 0.049 0.569 0.194 0.088 0.048 0.023 0.009 0.006 0.003 0.003 25 A 0.003 0.005 0.004 0.027 0.067 0.199 0.447 0.142 0.059 0.031 0.015 26 G 0.621 0.173 0.046 0.098 0.029 0.011 0.008 0.003 0.004 0.003 0.003 27 H 0.001 0.001 0.001 0.006 0.013 0.031 0.120 0.171 0.238 0.212 0.206 28 D 0.066 0.180 0.114 0.326 0.186 0.081 0.033 0.008 0.004 0.002 0.001 29 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.074 0.210 0.291 0.401 30 L 0.004 0.011 0.011 0.083 0.138 0.180 0.253 0.132 0.092 0.052 0.046 31 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.027 0.079 0.190 0.293 0.403 32 A 0.001 0.001 0.001 0.005 0.011 0.022 0.083 0.142 0.231 0.265 0.241 33 V 0.001 0.003 0.004 0.016 0.024 0.042 0.120 0.168 0.245 0.214 0.165 34 A 0.009 0.017 0.013 0.064 0.086 0.110 0.195 0.170 0.159 0.115 0.062 35 E 0.081 0.095 0.071 0.207 0.173 0.127 0.118 0.059 0.039 0.020 0.010 36 H 0.055 0.086 0.033 0.103 0.100 0.107 0.146 0.108 0.114 0.091 0.058 37 A 0.104 0.087 0.050 0.132 0.122 0.121 0.129 0.080 0.080 0.058 0.038 38 D 0.278 0.150 0.100 0.161 0.099 0.067 0.061 0.031 0.027 0.017 0.010 39 R 0.095 0.083 0.095 0.141 0.118 0.120 0.142 0.081 0.065 0.037 0.022 40 A 0.034 0.019 0.024 0.055 0.065 0.100 0.156 0.129 0.157 0.142 0.119 41 A 0.019 0.049 0.117 0.172 0.174 0.152 0.148 0.065 0.048 0.031 0.024 42 A 0.041 0.082 0.354 0.173 0.108 0.073 0.065 0.033 0.032 0.022 0.017 43 A 0.061 0.048 0.053 0.112 0.114 0.139 0.210 0.107 0.077 0.049 0.029 44 G 0.376 0.227 0.078 0.148 0.078 0.039 0.027 0.010 0.008 0.005 0.003 45 L 0.004 0.004 0.004 0.014 0.021 0.035 0.100 0.129 0.223 0.230 0.235 46 E 0.144 0.272 0.145 0.231 0.110 0.051 0.030 0.009 0.005 0.002 0.002 47 V 0.016 0.018 0.014 0.039 0.048 0.074 0.164 0.163 0.194 0.152 0.118 48 V 0.031 0.032 0.026 0.075 0.088 0.100 0.168 0.124 0.131 0.115 0.112 49 D 0.123 0.158 0.087 0.198 0.153 0.104 0.086 0.037 0.028 0.015 0.009 50 V 0.016 0.013 0.011 0.033 0.041 0.061 0.142 0.144 0.184 0.184 0.172 51 A 0.082 0.089 0.041 0.112 0.113 0.111 0.151 0.100 0.090 0.063 0.048 52 P 0.190 0.105 0.041 0.106 0.097 0.098 0.126 0.076 0.075 0.054 0.033 53 D 0.227 0.202 0.058 0.147 0.104 0.074 0.070 0.041 0.036 0.024 0.016 54 Y 0.087 0.044 0.034 0.077 0.095 0.111 0.164 0.122 0.123 0.090 0.052 55 S 0.258 0.269 0.080 0.145 0.081 0.053 0.048 0.025 0.021 0.012 0.008 56 A 0.053 0.054 0.041 0.101 0.116 0.143 0.177 0.119 0.105 0.063 0.029 57 V 0.075 0.043 0.060 0.105 0.113 0.122 0.172 0.104 0.104 0.067 0.036 58 K 0.071 0.114 0.311 0.239 0.125 0.065 0.043 0.015 0.009 0.004 0.002 59 V 0.008 0.011 0.023 0.041 0.053 0.099 0.219 0.171 0.179 0.125 0.072 60 F 0.009 0.011 0.022 0.038 0.062 0.112 0.223 0.178 0.166 0.114 0.065 61 E 0.034 0.066 0.395 0.220 0.132 0.068 0.049 0.017 0.012 0.006 0.002 62 Q 0.069 0.105 0.231 0.186 0.130 0.102 0.090 0.038 0.027 0.014 0.007 63 V 0.029 0.023 0.021 0.051 0.058 0.097 0.193 0.159 0.170 0.124 0.075 64 A 0.057 0.051 0.049 0.080 0.093 0.110 0.190 0.132 0.117 0.077 0.045 65 K 0.143 0.166 0.241 0.182 0.108 0.065 0.048 0.020 0.015 0.008 0.004 66 D 0.234 0.145 0.087 0.144 0.107 0.092 0.085 0.040 0.033 0.021 0.012 67 N 0.105 0.081 0.027 0.080 0.082 0.094 0.140 0.117 0.120 0.092 0.062 68 P 0.220 0.126 0.058 0.126 0.112 0.097 0.103 0.058 0.051 0.031 0.018 69 R 0.177 0.128 0.070 0.133 0.117 0.100 0.106 0.063 0.053 0.034 0.019 70 F 0.054 0.046 0.028 0.081 0.090 0.110 0.165 0.130 0.135 0.098 0.064 71 A 0.057 0.041 0.026 0.063 0.071 0.087 0.142 0.133 0.152 0.128 0.101 72 E 0.163 0.127 0.098 0.153 0.124 0.102 0.100 0.053 0.041 0.024 0.014 73 T 0.087 0.071 0.057 0.099 0.088 0.098 0.143 0.108 0.110 0.083 0.057 74 V 0.063 0.047 0.028 0.072 0.074 0.090 0.156 0.127 0.142 0.116 0.085 75 A 0.166 0.107 0.064 0.121 0.098 0.093 0.116 0.075 0.075 0.051 0.035 76 T 0.127 0.080 0.054 0.089 0.079 0.080 0.119 0.098 0.110 0.092 0.073 77 R 0.082 0.080 0.043 0.103 0.104 0.113 0.155 0.107 0.102 0.070 0.041 78 P 0.189 0.148 0.046 0.105 0.092 0.091 0.103 0.068 0.069 0.053 0.037 79 A 0.136 0.094 0.055 0.121 0.112 0.104 0.123 0.081 0.083 0.056 0.036 80 I 0.114 0.064 0.051 0.090 0.092 0.093 0.141 0.104 0.114 0.084 0.053 81 D 0.077 0.180 0.093 0.194 0.128 0.097 0.099 0.052 0.041 0.024 0.014 82 L 0.018 0.012 0.012 0.035 0.057 0.094 0.174 0.175 0.190 0.143 0.090 83 E 0.217 0.118 0.180 0.203 0.123 0.066 0.050 0.019 0.013 0.007 0.005 84 E 0.029 0.085 0.188 0.188 0.148 0.123 0.114 0.052 0.040 0.022 0.010 85 W 0.009 0.008 0.010 0.022 0.029 0.063 0.155 0.159 0.210 0.192 0.144 86 G 0.090 0.091 0.098 0.140 0.129 0.122 0.137 0.074 0.061 0.039 0.020 87 V 0.045 0.057 0.165 0.129 0.099 0.085 0.118 0.080 0.095 0.077 0.049 88 Q 0.037 0.039 0.037 0.080 0.083 0.110 0.177 0.133 0.140 0.098 0.068 89 I 0.015 0.010 0.014 0.034 0.047 0.084 0.178 0.176 0.198 0.148 0.096 90 A 0.029 0.041 0.132 0.139 0.133 0.127 0.158 0.092 0.076 0.048 0.026 91 A 0.018 0.035 0.097 0.092 0.098 0.114 0.167 0.121 0.122 0.085 0.052 92 V 0.011 0.008 0.011 0.017 0.016 0.026 0.076 0.105 0.205 0.250 0.275 93 N 0.056 0.083 0.084 0.134 0.133 0.125 0.149 0.090 0.075 0.046 0.023 94 R 0.086 0.094 0.120 0.160 0.120 0.112 0.129 0.069 0.060 0.034 0.017 95 P 0.142 0.072 0.046 0.085 0.080 0.081 0.125 0.099 0.106 0.090 0.073 96 L 0.030 0.034 0.019 0.045 0.054 0.077 0.146 0.131 0.180 0.157 0.128 97 V 0.048 0.055 0.045 0.094 0.119 0.133 0.168 0.111 0.106 0.072 0.049 98 D 0.198 0.148 0.173 0.209 0.117 0.064 0.048 0.018 0.013 0.008 0.004 99 G 0.105 0.110 0.073 0.167 0.137 0.122 0.126 0.063 0.050 0.030 0.017 100 T 0.009 0.010 0.005 0.015 0.023 0.037 0.100 0.145 0.240 0.221 0.196 101 M 0.008 0.009 0.019 0.065 0.137 0.220 0.271 0.119 0.085 0.045 0.022 102 A 0.056 0.105 0.415 0.199 0.093 0.048 0.037 0.016 0.014 0.009 0.007 103 L 0.001 0.004 0.011 0.042 0.067 0.132 0.290 0.175 0.136 0.082 0.061 104 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.006 0.026 0.069 0.180 0.308 0.404 105 D 0.021 0.070 0.207 0.276 0.219 0.120 0.061 0.014 0.007 0.003 0.001 106 D 0.157 0.143 0.300 0.228 0.087 0.045 0.026 0.007 0.004 0.002 0.002 107 Y 0.016 0.013 0.006 0.033 0.048 0.092 0.250 0.198 0.167 0.114 0.063 108 R 0.099 0.200 0.090 0.252 0.188 0.096 0.052 0.012 0.007 0.002 0.001 109 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.028 0.085 0.240 0.292 0.346 110 D 0.003 0.014 0.013 0.083 0.146 0.215 0.280 0.130 0.071 0.028 0.017 111 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.010 0.062 0.149 0.249 0.271 0.254 112 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.035 0.092 0.188 0.287 0.389 113 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.011 0.054 0.116 0.230 0.268 0.311 114 Y 0.001 0.002 0.002 0.008 0.012 0.021 0.071 0.128 0.226 0.270 0.260 115 E 0.008 0.015 0.010 0.065 0.090 0.124 0.198 0.172 0.156 0.098 0.063 116 Q 0.015 0.029 0.014 0.076 0.101 0.126 0.197 0.162 0.140 0.089 0.052 117 G 0.005 0.014 0.006 0.027 0.050 0.081 0.155 0.163 0.204 0.169 0.127 118 A 0.009 0.009 0.004 0.021 0.047 0.089 0.172 0.162 0.202 0.166 0.120 119 T 0.019 0.017 0.010 0.045 0.078 0.125 0.203 0.163 0.161 0.112 0.067 120 V 0.001 0.002 0.003 0.011 0.016 0.030 0.088 0.122 0.225 0.257 0.245 121 G 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.016 0.044 0.165 0.296 0.471 122 L 0.001 0.002 0.029 0.028 0.032 0.053 0.127 0.127 0.203 0.203 0.195 123 L 0.001 0.001 0.037 0.054 0.075 0.102 0.215 0.142 0.152 0.125 0.097 124 A 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.005 0.029 0.058 0.153 0.269 0.479 125 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.044 0.094 0.216 0.302 0.331 126 D 0.001 0.003 0.052 0.081 0.124 0.189 0.269 0.127 0.077 0.043 0.036 127 R 0.001 0.004 0.031 0.030 0.059 0.142 0.316 0.157 0.119 0.078 0.061 128 A 0.002 0.003 0.003 0.011 0.013 0.032 0.146 0.153 0.216 0.224 0.196 129 G 0.536 0.255 0.066 0.094 0.029 0.011 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 130 V 0.001 0.002 0.002 0.008 0.012 0.025 0.089 0.148 0.251 0.230 0.232 131 P 0.035 0.087 0.040 0.146 0.169 0.174 0.182 0.076 0.049 0.024 0.019 132 A 0.003 0.008 0.005 0.027 0.038 0.066 0.175 0.178 0.201 0.161 0.139 133 V 0.002 0.002 0.001 0.006 0.008 0.017 0.062 0.106 0.198 0.266 0.331 134 Q 0.003 0.006 0.006 0.020 0.028 0.043 0.117 0.158 0.220 0.207 0.191 135 R 0.006 0.011 0.010 0.033 0.039 0.052 0.120 0.155 0.216 0.201 0.158 136 N 0.012 0.020 0.017 0.066 0.078 0.103 0.169 0.161 0.173 0.126 0.075 137 Q 0.034 0.046 0.034 0.113 0.112 0.124 0.182 0.128 0.116 0.074 0.037 138 S 0.122 0.096 0.045 0.097 0.087 0.088 0.132 0.105 0.106 0.074 0.048 139 A 0.160 0.096 0.046 0.106 0.089 0.085 0.110 0.083 0.097 0.077 0.053 140 W 0.129 0.099 0.040 0.119 0.120 0.117 0.132 0.087 0.078 0.051 0.028 141 R 0.146 0.111 0.063 0.123 0.107 0.103 0.113 0.074 0.075 0.051 0.032 142 T 0.123 0.098 0.056 0.107 0.103 0.106 0.129 0.091 0.087 0.061 0.040 143 R 0.184 0.117 0.072 0.143 0.114 0.098 0.104 0.061 0.054 0.035 0.019 144 G 0.282 0.132 0.068 0.098 0.080 0.068 0.084 0.057 0.057 0.043 0.032 145 M 0.053 0.044 0.027 0.064 0.065 0.082 0.143 0.123 0.157 0.135 0.108 146 H 0.061 0.064 0.035 0.082 0.094 0.116 0.167 0.120 0.120 0.086 0.053 147 R 0.136 0.111 0.139 0.183 0.139 0.103 0.088 0.040 0.032 0.018 0.010 148 S 0.133 0.096 0.119 0.142 0.107 0.100 0.121 0.068 0.056 0.035 0.021 149 I 0.014 0.018 0.022 0.042 0.043 0.064 0.147 0.151 0.211 0.172 0.114 150 A 0.011 0.013 0.039 0.058 0.084 0.139 0.237 0.145 0.136 0.091 0.048 151 S 0.033 0.060 0.410 0.212 0.121 0.067 0.048 0.020 0.015 0.009 0.005 152 F 0.007 0.016 0.052 0.069 0.089 0.142 0.241 0.141 0.122 0.079 0.041 153 L 0.004 0.008 0.024 0.027 0.019 0.023 0.080 0.114 0.222 0.251 0.228 154 T 0.007 0.016 0.070 0.084 0.126 0.175 0.228 0.120 0.094 0.055 0.026 155 D 0.045 0.076 0.329 0.213 0.118 0.079 0.068 0.029 0.023 0.013 0.007 156 L 0.015 0.019 0.027 0.048 0.060 0.103 0.242 0.169 0.158 0.106 0.054 157 M 0.011 0.007 0.010 0.014 0.015 0.025 0.076 0.115 0.215 0.245 0.267 158 D 0.041 0.094 0.120 0.195 0.172 0.134 0.121 0.055 0.038 0.019 0.010 159 K 0.010 0.032 0.059 0.122 0.129 0.164 0.214 0.126 0.087 0.042 0.015 160 H 0.006 0.005 0.006 0.016 0.023 0.042 0.133 0.171 0.227 0.206 0.164 161 Q 0.006 0.006 0.005 0.016 0.021 0.035 0.115 0.148 0.218 0.221 0.210 162 V 0.002 0.004 0.005 0.013 0.020 0.035 0.112 0.156 0.246 0.230 0.177 163 S 0.016 0.030 0.020 0.059 0.069 0.089 0.169 0.148 0.173 0.130 0.096 164 L 0.006 0.013 0.007 0.028 0.042 0.061 0.144 0.171 0.215 0.181 0.134 165 P 0.198 0.172 0.083 0.200 0.131 0.083 0.067 0.027 0.020 0.011 0.008 166 E 0.179 0.116 0.049 0.174 0.150 0.116 0.112 0.049 0.031 0.016 0.008 167 P 0.097 0.080 0.035 0.094 0.091 0.102 0.143 0.105 0.113 0.083 0.059 168 V 0.015 0.022 0.019 0.067 0.105 0.160 0.225 0.139 0.127 0.075 0.045 169 A 0.187 0.166 0.176 0.171 0.103 0.069 0.060 0.026 0.021 0.012 0.008 170 T 0.046 0.106 0.112 0.205 0.164 0.141 0.131 0.048 0.028 0.012 0.006 171 I 0.015 0.010 0.011 0.022 0.029 0.052 0.127 0.143 0.206 0.203 0.182 172 E 0.121 0.173 0.117 0.211 0.153 0.095 0.077 0.026 0.016 0.007 0.003 173 S 0.305 0.159 0.139 0.158 0.093 0.059 0.043 0.019 0.014 0.008 0.003 174 F 0.023 0.018 0.010 0.038 0.061 0.102 0.207 0.178 0.163 0.125 0.074 175 P 0.166 0.200 0.039 0.107 0.090 0.091 0.109 0.074 0.066 0.039 0.020 176 P 0.349 0.088 0.035 0.087 0.089 0.095 0.095 0.059 0.050 0.035 0.019 177 S 0.267 0.128 0.057 0.106 0.082 0.068 0.085 0.061 0.064 0.048 0.034 178 L 0.048 0.047 0.031 0.076 0.084 0.107 0.152 0.137 0.129 0.109 0.082 179 L 0.032 0.053 0.043 0.136 0.124 0.121 0.167 0.112 0.092 0.068 0.051 180 L 0.019 0.033 0.069 0.085 0.102 0.115 0.167 0.125 0.123 0.098 0.065 181 E 0.064 0.113 0.157 0.321 0.153 0.079 0.058 0.022 0.017 0.010 0.006 182 A 0.203 0.097 0.062 0.140 0.106 0.091 0.102 0.062 0.056 0.046 0.034 183 E 0.313 0.168 0.073 0.142 0.082 0.061 0.059 0.033 0.028 0.021 0.018 184 P 0.320 0.253 0.069 0.134 0.076 0.051 0.042 0.021 0.017 0.011 0.006 185 E 0.418 0.200 0.069 0.118 0.072 0.046 0.034 0.016 0.013 0.008 0.005 186 G 0.228 0.166 0.068 0.148 0.106 0.073 0.067 0.043 0.046 0.031 0.024 187 W 0.072 0.072 0.053 0.143 0.147 0.135 0.132 0.083 0.078 0.053 0.032 188 F 0.063 0.069 0.053 0.138 0.141 0.128 0.145 0.095 0.083 0.053 0.031 189 M 0.060 0.042 0.044 0.084 0.096 0.107 0.150 0.120 0.126 0.098 0.072 190 R 0.023 0.027 0.023 0.068 0.087 0.106 0.180 0.147 0.150 0.115 0.074 191 W 0.063 0.060 0.043 0.100 0.119 0.128 0.159 0.111 0.103 0.070 0.045 192 V 0.012 0.009 0.007 0.021 0.027 0.041 0.102 0.136 0.201 0.216 0.227 193 P 0.072 0.081 0.044 0.125 0.116 0.107 0.144 0.098 0.090 0.068 0.056 194 Y 0.008 0.008 0.006 0.019 0.026 0.042 0.112 0.147 0.221 0.220 0.191 195 G 0.015 0.010 0.007 0.018 0.023 0.035 0.088 0.126 0.196 0.217 0.266 196 G 0.028 0.024 0.014 0.041 0.040 0.060 0.127 0.132 0.186 0.179 0.169 197 G 0.030 0.027 0.015 0.043 0.051 0.067 0.140 0.145 0.175 0.166 0.142 198 A 0.025 0.023 0.012 0.031 0.030 0.042 0.098 0.119 0.191 0.200 0.231 199 V 0.015 0.020 0.014 0.037 0.047 0.063 0.119 0.126 0.187 0.187 0.185 200 L 0.023 0.060 0.043 0.131 0.132 0.133 0.176 0.107 0.097 0.061 0.037 201 G 0.119 0.094 0.063 0.129 0.126 0.122 0.132 0.079 0.068 0.042 0.026 202 D 0.485 0.164 0.072 0.119 0.065 0.037 0.029 0.012 0.009 0.005 0.004 203 R 0.186 0.153 0.064 0.152 0.131 0.114 0.105 0.042 0.030 0.015 0.008 204 L 0.020 0.022 0.013 0.033 0.044 0.065 0.129 0.128 0.188 0.180 0.178 205 P 0.239 0.256 0.082 0.150 0.092 0.062 0.056 0.024 0.018 0.011 0.009 206 P 0.215 0.082 0.043 0.089 0.093 0.098 0.130 0.085 0.076 0.055 0.034 207 V 0.132 0.093 0.028 0.106 0.100 0.107 0.147 0.090 0.083 0.062 0.052 208 P 0.223 0.113 0.038 0.115 0.099 0.097 0.107 0.063 0.060 0.044 0.042 209 A 0.517 0.142 0.042 0.087 0.052 0.042 0.043 0.022 0.021 0.016 0.016 210 R 0.300 0.197 0.077 0.156 0.097 0.067 0.056 0.022 0.015 0.008 0.004 211 P 0.149 0.140 0.065 0.193 0.143 0.094 0.088 0.046 0.041 0.024 0.016 212 E 0.011 0.044 0.033 0.178 0.259 0.214 0.159 0.060 0.028 0.011 0.004 213 V 0.001 0.001 0.002 0.015 0.052 0.115 0.271 0.242 0.175 0.092 0.036 214 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.017 0.089 0.179 0.244 0.245 0.216 215 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.060 0.147 0.252 0.291 0.238 216 T 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.039 0.105 0.240 0.307 0.298 217 M 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.043 0.095 0.221 0.312 0.312 218 G 0.001 0.004 0.004 0.022 0.036 0.063 0.143 0.179 0.219 0.191 0.139 219 T 0.012 0.042 0.025 0.137 0.142 0.143 0.187 0.131 0.099 0.053 0.030 220 I 0.015 0.019 0.013 0.060 0.102 0.135 0.206 0.163 0.141 0.094 0.052 221 E 0.125 0.136 0.061 0.227 0.171 0.114 0.085 0.034 0.025 0.012 0.007 222 L 0.053 0.052 0.027 0.086 0.099 0.115 0.151 0.114 0.131 0.102 0.069 223 Q 0.230 0.152 0.088 0.165 0.114 0.091 0.071 0.032 0.027 0.018 0.013 224 A 0.182 0.140 0.105 0.154 0.117 0.092 0.092 0.047 0.036 0.022 0.014 225 F 0.094 0.086 0.056 0.128 0.122 0.121 0.156 0.090 0.073 0.046 0.028 226 G 0.157 0.235 0.059 0.137 0.105 0.088 0.081 0.041 0.042 0.030 0.025 227 I 0.021 0.019 0.011 0.041 0.066 0.093 0.169 0.150 0.174 0.141 0.115 228 G 0.498 0.131 0.084 0.108 0.064 0.041 0.035 0.015 0.012 0.007 0.005 229 A 0.016 0.073 0.048 0.142 0.158 0.154 0.169 0.095 0.072 0.045 0.028 230 V 0.001 0.002 0.002 0.005 0.008 0.017 0.061 0.111 0.243 0.279 0.271 231 E 0.015 0.018 0.027 0.090 0.150 0.213 0.244 0.108 0.077 0.040 0.018 232 P 0.071 0.103 0.328 0.253 0.115 0.056 0.040 0.014 0.010 0.006 0.004 233 I 0.001 0.001 0.006 0.013 0.017 0.031 0.118 0.154 0.231 0.229 0.202 234 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.005 0.012 0.051 0.101 0.218 0.284 0.320 235 A 0.002 0.010 0.250 0.165 0.180 0.163 0.138 0.046 0.028 0.013 0.006 236 A 0.001 0.013 0.116 0.119 0.171 0.222 0.219 0.069 0.040 0.020 0.011 237 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.032 0.070 0.187 0.305 0.397 238 G 0.025 0.021 0.016 0.046 0.062 0.106 0.228 0.157 0.141 0.105 0.091 239 E 0.152 0.166 0.276 0.196 0.091 0.053 0.035 0.013 0.009 0.005 0.004 240 V 0.083 0.076 0.048 0.146 0.141 0.160 0.181 0.069 0.047 0.029 0.019 241 D 0.299 0.225 0.092 0.187 0.095 0.047 0.028 0.010 0.008 0.005 0.004 242 A 0.003 0.006 0.004 0.020 0.041 0.076 0.201 0.202 0.221 0.140 0.087 243 D 0.017 0.072 0.061 0.259 0.264 0.176 0.099 0.028 0.014 0.006 0.003 244 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.037 0.103 0.228 0.300 0.323 245 V 0.001 0.003 0.004 0.023 0.045 0.082 0.209 0.198 0.185 0.132 0.117 246 L 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.032 0.093 0.222 0.317 0.326 247 A 0.001 0.004 0.004 0.027 0.046 0.066 0.163 0.186 0.226 0.171 0.105 248 L 0.002 0.005 0.004 0.016 0.024 0.046 0.125 0.175 0.250 0.205 0.149 249 G 0.055 0.077 0.039 0.160 0.158 0.150 0.176 0.087 0.056 0.029 0.014 250 D 0.220 0.224 0.083 0.208 0.118 0.065 0.045 0.018 0.010 0.005 0.002 251 L 0.102 0.064 0.026 0.091 0.102 0.104 0.146 0.110 0.112 0.089 0.056 252 D 0.175 0.298 0.072 0.173 0.108 0.072 0.052 0.021 0.016 0.009 0.006 253 I 0.041 0.036 0.024 0.076 0.096 0.114 0.177 0.138 0.140 0.097 0.060 254 S 0.324 0.161 0.079 0.121 0.089 0.069 0.069 0.033 0.027 0.016 0.011 255 P 0.142 0.193 0.112 0.233 0.137 0.085 0.059 0.019 0.012 0.006 0.003 256 L 0.021 0.013 0.007 0.021 0.028 0.045 0.114 0.139 0.207 0.207 0.197 257 G 0.239 0.194 0.095 0.172 0.112 0.074 0.059 0.024 0.017 0.009 0.006 258 T 0.233 0.175 0.109 0.184 0.113 0.070 0.051 0.024 0.020 0.013 0.007 259 L 0.020 0.021 0.014 0.052 0.074 0.120 0.185 0.141 0.139 0.122 0.114 260 P 0.060 0.063 0.031 0.088 0.099 0.117 0.163 0.121 0.114 0.082 0.063 261 R 0.514 0.146 0.075 0.105 0.059 0.037 0.031 0.014 0.009 0.005 0.003 262 N 0.169 0.160 0.073 0.228 0.172 0.101 0.062 0.018 0.010 0.005 0.002 263 V 0.003 0.002 0.001 0.005 0.007 0.012 0.034 0.074 0.192 0.282 0.388 264 R 0.012 0.083 0.058 0.294 0.252 0.155 0.099 0.028 0.012 0.005 0.003 265 A 0.003 0.006 0.009 0.012 0.017 0.030 0.095 0.151 0.241 0.231 0.206 266 V 0.019 0.028 0.023 0.111 0.142 0.162 0.218 0.114 0.089 0.055 0.039 267 G 0.497 0.178 0.054 0.110 0.057 0.035 0.031 0.014 0.012 0.007 0.005 268 W 0.046 0.041 0.022 0.090 0.097 0.110 0.177 0.129 0.125 0.092 0.071 269 T 0.032 0.045 0.019 0.064 0.070 0.080 0.149 0.136 0.158 0.129 0.117 270 P 0.089 0.336 0.056 0.161 0.114 0.083 0.068 0.033 0.029 0.017 0.013 271 L 0.023 0.022 0.009 0.050 0.103 0.140 0.189 0.159 0.147 0.096 0.062 272 H 0.273 0.108 0.051 0.146 0.133 0.111 0.092 0.035 0.028 0.015 0.009 273 T 0.079 0.108 0.090 0.309 0.184 0.106 0.070 0.026 0.015 0.008 0.006 274 L 0.002 0.003 0.004 0.013 0.015 0.026 0.091 0.130 0.228 0.243 0.245 275 L 0.001 0.003 0.012 0.022 0.028 0.053 0.126 0.149 0.213 0.209 0.183 276 R 0.011 0.040 0.293 0.226 0.163 0.111 0.091 0.029 0.019 0.011 0.006 277 T 0.013 0.035 0.063 0.134 0.170 0.197 0.226 0.081 0.047 0.023 0.011 278 C 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.004 0.035 0.106 0.277 0.311 0.263 279 T 0.027 0.073 0.053 0.199 0.238 0.207 0.130 0.039 0.021 0.008 0.004 280 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.046 0.126 0.265 0.281 0.270 281 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.014 0.085 0.163 0.236 0.227 0.264 282 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.033 0.077 0.177 0.278 0.424 283 H 0.001 0.003 0.003 0.008 0.012 0.021 0.065 0.119 0.217 0.273 0.278 284 H 0.007 0.013 0.011 0.048 0.056 0.089 0.171 0.165 0.182 0.138 0.120 285 G 0.015 0.020 0.011 0.043 0.053 0.070 0.149 0.162 0.179 0.160 0.138 286 G 0.014 0.030 0.014 0.071 0.098 0.118 0.172 0.136 0.152 0.112 0.081 287 G 0.027 0.028 0.010 0.045 0.072 0.101 0.151 0.140 0.164 0.142 0.120 288 G 0.049 0.036 0.014 0.064 0.092 0.123 0.170 0.131 0.136 0.108 0.077 289 T 0.006 0.015 0.006 0.035 0.057 0.092 0.164 0.153 0.195 0.157 0.119 290 V 0.003 0.004 0.004 0.012 0.016 0.022 0.058 0.095 0.215 0.263 0.308 291 M 0.010 0.007 0.015 0.027 0.030 0.046 0.100 0.116 0.197 0.220 0.232 292 T 0.002 0.005 0.019 0.055 0.072 0.095 0.174 0.156 0.166 0.141 0.114 293 A 0.001 0.001 0.004 0.006 0.006 0.009 0.033 0.063 0.158 0.258 0.462 294 I 0.001 0.001 0.003 0.007 0.009 0.019 0.069 0.107 0.198 0.259 0.329 295 D 0.002 0.007 0.033 0.056 0.087 0.134 0.216 0.150 0.151 0.097 0.066 296 A 0.002 0.006 0.009 0.025 0.037 0.079 0.212 0.167 0.180 0.154 0.129 297 G 0.161 0.087 0.045 0.141 0.110 0.092 0.118 0.076 0.075 0.055 0.038 298 I 0.004 0.012 0.010 0.042 0.065 0.102 0.213 0.188 0.179 0.114 0.071 299 P 0.002 0.004 0.005 0.019 0.037 0.071 0.168 0.192 0.211 0.162 0.128 300 Q 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.015 0.079 0.142 0.232 0.241 0.280 301 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.006 0.012 0.064 0.120 0.214 0.259 0.317 302 L 0.001 0.002 0.002 0.005 0.007 0.011 0.046 0.084 0.195 0.275 0.371 303 A 0.002 0.005 0.003 0.014 0.020 0.033 0.097 0.138 0.224 0.235 0.228 304 P 0.030 0.050 0.033 0.135 0.137 0.139 0.174 0.118 0.093 0.057 0.034 305 D 0.040 0.066 0.028 0.134 0.172 0.169 0.183 0.099 0.061 0.033 0.015 306 P 0.101 0.153 0.045 0.156 0.144 0.120 0.108 0.063 0.055 0.034 0.021 307 R 0.244 0.104 0.041 0.128 0.128 0.112 0.103 0.051 0.045 0.028 0.016 308 D 0.179 0.140 0.065 0.143 0.108 0.092 0.107 0.061 0.054 0.031 0.019 309 Q 0.031 0.027 0.026 0.065 0.073 0.100 0.176 0.150 0.155 0.117 0.080 310 F 0.029 0.051 0.055 0.093 0.092 0.103 0.149 0.108 0.130 0.108 0.083 311 Q 0.018 0.036 0.095 0.145 0.152 0.153 0.165 0.090 0.077 0.046 0.022 312 H 0.085 0.076 0.197 0.242 0.158 0.096 0.077 0.030 0.021 0.012 0.005 313 T 0.052 0.088 0.073 0.150 0.134 0.138 0.163 0.088 0.063 0.034 0.017 314 A 0.003 0.006 0.004 0.013 0.025 0.054 0.149 0.189 0.252 0.186 0.119 315 R 0.010 0.015 0.034 0.081 0.153 0.236 0.251 0.101 0.069 0.034 0.017 316 E 0.064 0.110 0.405 0.218 0.090 0.045 0.033 0.013 0.010 0.006 0.004 317 A 0.002 0.008 0.021 0.068 0.082 0.135 0.267 0.162 0.130 0.076 0.048 318 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.003 0.004 0.017 0.049 0.147 0.290 0.484 319 S 0.003 0.021 0.096 0.204 0.277 0.197 0.129 0.041 0.021 0.009 0.003 320 R 0.024 0.064 0.273 0.214 0.152 0.126 0.084 0.031 0.019 0.009 0.004 321 R 0.024 0.022 0.012 0.071 0.098 0.157 0.285 0.152 0.094 0.057 0.028 322 G 0.163 0.125 0.047 0.148 0.121 0.108 0.125 0.064 0.051 0.031 0.017 323 I 0.007 0.011 0.008 0.026 0.031 0.040 0.096 0.126 0.214 0.216 0.225 324 G 0.018 0.022 0.014 0.038 0.040 0.066 0.140 0.140 0.185 0.168 0.169 325 L 0.005 0.015 0.013 0.049 0.065 0.098 0.207 0.169 0.179 0.122 0.077 326 V 0.008 0.014 0.012 0.044 0.056 0.071 0.149 0.147 0.181 0.156 0.162 327 S 0.010 0.012 0.009 0.027 0.041 0.055 0.129 0.146 0.209 0.193 0.169 328 T 0.127 0.179 0.071 0.228 0.157 0.102 0.082 0.028 0.016 0.007 0.003 329 S 0.088 0.082 0.037 0.155 0.184 0.168 0.146 0.064 0.042 0.022 0.011 330 D 0.370 0.350 0.072 0.122 0.048 0.019 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 331 K 0.323 0.110 0.041 0.141 0.130 0.106 0.083 0.034 0.018 0.009 0.004 332 V 0.298 0.185 0.045 0.101 0.082 0.070 0.087 0.051 0.042 0.023 0.015 333 D 0.073 0.345 0.087 0.213 0.116 0.078 0.048 0.018 0.012 0.006 0.003 334 A 0.142 0.067 0.047 0.149 0.175 0.162 0.132 0.057 0.037 0.021 0.011 335 D 0.545 0.179 0.123 0.084 0.033 0.018 0.012 0.003 0.002 0.001 0.001 336 L 0.006 0.037 0.055 0.229 0.195 0.186 0.177 0.065 0.032 0.014 0.005 337 L 0.008 0.005 0.009 0.014 0.020 0.037 0.124 0.166 0.234 0.212 0.172 338 R 0.010 0.029 0.238 0.219 0.210 0.163 0.097 0.021 0.009 0.003 0.001 339 R 0.013 0.063 0.407 0.307 0.116 0.053 0.027 0.008 0.005 0.002 0.001 340 L 0.002 0.007 0.019 0.026 0.032 0.058 0.222 0.180 0.210 0.156 0.087 341 I 0.005 0.004 0.012 0.012 0.024 0.063 0.209 0.210 0.224 0.153 0.084 342 G 0.065 0.182 0.332 0.202 0.098 0.050 0.036 0.013 0.009 0.007 0.004 343 D 0.015 0.371 0.181 0.180 0.097 0.073 0.054 0.017 0.009 0.003 0.001 344 E 0.857 0.063 0.032 0.027 0.013 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 345 S 0.798 0.107 0.037 0.036 0.012 0.005 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 346 L 0.001 0.005 0.020 0.039 0.065 0.161 0.285 0.194 0.143 0.064 0.023 347 R 0.003 0.005 0.035 0.067 0.117 0.221 0.303 0.131 0.076 0.033 0.010 348 T 0.012 0.025 0.882 0.051 0.018 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 349 A 0.001 0.010 0.177 0.180 0.183 0.204 0.161 0.044 0.026 0.010 0.002 350 A 0.001 0.001 0.003 0.001 0.002 0.006 0.048 0.101 0.234 0.309 0.296 351 R 0.001 0.004 0.182 0.154 0.233 0.205 0.170 0.035 0.012 0.003 0.001 352 E 0.004 0.015 0.862 0.078 0.027 0.009 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 353 V 0.001 0.002 0.012 0.016 0.037 0.133 0.366 0.170 0.143 0.084 0.037 354 R 0.001 0.001 0.011 0.005 0.008 0.021 0.143 0.190 0.275 0.223 0.123 355 E 0.003 0.012 0.607 0.205 0.108 0.041 0.018 0.004 0.002 0.001 0.001 356 E 0.008 0.044 0.596 0.159 0.097 0.056 0.030 0.006 0.003 0.001 0.001 357 M 0.001 0.002 0.006 0.008 0.015 0.055 0.218 0.181 0.224 0.179 0.111 358 V 0.008 0.013 0.029 0.047 0.080 0.126 0.285 0.169 0.128 0.075 0.040 359 A 0.080 0.127 0.561 0.128 0.058 0.025 0.012 0.003 0.002 0.001 0.001 360 L 0.038 0.061 0.067 0.165 0.145 0.165 0.195 0.081 0.048 0.024 0.011 361 P 0.254 0.079 0.025 0.067 0.066 0.077 0.133 0.100 0.089 0.068 0.042 362 T 0.088 0.398 0.059 0.150 0.101 0.069 0.059 0.031 0.024 0.013 0.009 363 P 0.046 0.062 0.034 0.104 0.145 0.155 0.160 0.108 0.096 0.062 0.029 364 A 0.302 0.164 0.054 0.144 0.152 0.101 0.056 0.015 0.009 0.002 0.001 365 E 0.109 0.190 0.193 0.348 0.104 0.035 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 366 T 0.001 0.002 0.004 0.016 0.030 0.074 0.222 0.217 0.222 0.136 0.077 367 V 0.001 0.001 0.004 0.004 0.009 0.031 0.155 0.201 0.246 0.208 0.144 368 R 0.002 0.012 0.470 0.327 0.126 0.043 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 369 R 0.001 0.007 0.089 0.149 0.232 0.268 0.189 0.040 0.017 0.006 0.002 370 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.025 0.071 0.217 0.325 0.355 371 V 0.001 0.001 0.010 0.020 0.051 0.149 0.398 0.195 0.113 0.050 0.014 372 E 0.005 0.028 0.779 0.139 0.036 0.009 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 373 R 0.001 0.004 0.015 0.021 0.067 0.222 0.459 0.127 0.055 0.022 0.007 374 I 0.003 0.004 0.010 0.009 0.006 0.010 0.063 0.111 0.254 0.292 0.240 375 S 0.076 0.206 0.169 0.213 0.156 0.099 0.051 0.015 0.008 0.005 0.003 376 G 0.349 0.173 0.221 0.127 0.056 0.037 0.021 0.007 0.005 0.002 0.001