# TARGET T0332 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-o_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 o_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0332.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1412 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 L 0.046 0.008 0.009 0.025 0.025 0.106 0.052 0.730 2 G 0.147 0.012 0.006 0.015 0.030 0.069 0.078 0.641 3 K 0.036 0.004 0.007 0.011 0.015 0.102 0.040 0.786 4 S 0.076 0.010 0.026 0.024 0.049 0.121 0.087 0.608 5 I 0.058 0.005 0.031 0.015 0.030 0.135 0.063 0.662 6 S 0.013 0.005 0.110 0.037 0.076 0.170 0.059 0.531 7 R 0.003 0.003 0.269 0.051 0.124 0.099 0.066 0.386 8 L 0.001 0.002 0.448 0.107 0.181 0.047 0.066 0.149 9 I 0.001 0.001 0.706 0.098 0.117 0.007 0.048 0.022 10 V 0.001 0.002 0.671 0.129 0.120 0.007 0.036 0.033 11 V 0.005 0.003 0.695 0.120 0.107 0.010 0.028 0.032 12 A 0.011 0.004 0.487 0.108 0.152 0.039 0.071 0.128 13 S 0.046 0.008 0.196 0.075 0.137 0.121 0.074 0.343 14 L 0.097 0.008 0.060 0.036 0.065 0.154 0.089 0.491 15 I 0.024 0.005 0.027 0.016 0.030 0.172 0.053 0.672 16 D 0.035 0.008 0.023 0.014 0.024 0.134 0.061 0.701 17 K 0.143 0.042 0.014 0.014 0.017 0.133 0.149 0.488 18 P 0.056 0.102 0.019 0.008 0.013 0.137 0.068 0.597 19 T 0.026 0.144 0.036 0.010 0.014 0.141 0.082 0.546 20 N 0.028 0.813 0.007 0.004 0.004 0.020 0.054 0.070 21 L 0.016 0.938 0.003 0.001 0.001 0.006 0.017 0.018 22 G 0.011 0.897 0.005 0.002 0.003 0.007 0.052 0.023 23 G 0.009 0.384 0.012 0.004 0.008 0.011 0.549 0.022 24 L 0.002 0.646 0.007 0.001 0.003 0.008 0.324 0.009 25 C 0.002 0.962 0.005 0.001 0.002 0.002 0.021 0.005 26 R 0.011 0.878 0.029 0.008 0.011 0.006 0.040 0.017 27 T 0.032 0.739 0.028 0.004 0.005 0.015 0.148 0.029 28 C 0.189 0.196 0.119 0.009 0.005 0.020 0.386 0.077 29 E 0.572 0.099 0.008 0.006 0.004 0.030 0.047 0.233 30 V 0.036 0.007 0.008 0.001 0.001 0.059 0.052 0.835 31 F 0.008 0.008 0.064 0.008 0.014 0.253 0.072 0.572 32 G 0.095 0.013 0.038 0.009 0.017 0.102 0.090 0.636 33 A 0.031 0.006 0.030 0.012 0.010 0.165 0.047 0.700 34 S 0.006 0.004 0.364 0.028 0.099 0.103 0.093 0.303 35 V 0.008 0.003 0.383 0.058 0.130 0.058 0.109 0.252 36 L 0.001 0.001 0.718 0.070 0.054 0.021 0.030 0.105 37 V 0.003 0.001 0.683 0.078 0.085 0.026 0.027 0.098 38 V 0.009 0.002 0.445 0.088 0.097 0.071 0.052 0.236 39 G 0.114 0.008 0.174 0.048 0.057 0.121 0.068 0.410 40 S 0.173 0.009 0.040 0.018 0.033 0.116 0.081 0.528 41 L 0.047 0.006 0.033 0.014 0.026 0.140 0.040 0.695 42 Q 0.020 0.008 0.038 0.029 0.054 0.114 0.062 0.676 43 C 0.040 0.017 0.021 0.021 0.024 0.134 0.036 0.707 44 I 0.086 0.055 0.028 0.035 0.032 0.148 0.065 0.551 45 S 0.044 0.145 0.008 0.005 0.006 0.070 0.031 0.691 46 D 0.108 0.733 0.003 0.002 0.003 0.018 0.040 0.093 47 K 0.037 0.767 0.012 0.005 0.006 0.026 0.041 0.106 48 Q 0.040 0.806 0.006 0.006 0.010 0.019 0.028 0.085 49 F 0.066 0.410 0.028 0.008 0.015 0.035 0.336 0.101 50 Q 0.034 0.533 0.015 0.016 0.026 0.042 0.216 0.118 51 H 0.047 0.301 0.043 0.022 0.040 0.057 0.218 0.273 52 L 0.042 0.473 0.024 0.021 0.027 0.075 0.099 0.241 53 S 0.099 0.418 0.059 0.016 0.027 0.053 0.135 0.193 54 V 0.064 0.256 0.032 0.023 0.023 0.091 0.112 0.399 55 S 0.079 0.166 0.072 0.015 0.018 0.072 0.230 0.347 56 A 0.384 0.159 0.017 0.015 0.016 0.054 0.107 0.247 57 E 0.176 0.026 0.024 0.009 0.014 0.081 0.116 0.555 58 Q 0.009 0.017 0.027 0.015 0.026 0.116 0.039 0.751 59 W 0.014 0.009 0.038 0.008 0.025 0.124 0.042 0.740 60 L 0.120 0.018 0.085 0.060 0.036 0.132 0.099 0.452 61 P 0.102 0.016 0.127 0.040 0.104 0.106 0.078 0.427 62 L 0.023 0.004 0.100 0.036 0.122 0.070 0.049 0.595 63 V 0.005 0.002 0.231 0.209 0.275 0.055 0.033 0.190 64 E 0.006 0.002 0.110 0.078 0.115 0.059 0.030 0.600 65 V 0.005 0.003 0.151 0.191 0.105 0.086 0.024 0.434 66 K 0.057 0.043 0.063 0.026 0.031 0.094 0.049 0.638 67 P 0.353 0.260 0.014 0.007 0.006 0.048 0.084 0.229 68 P 0.046 0.300 0.017 0.008 0.005 0.060 0.064 0.499 69 Q 0.022 0.874 0.002 0.001 0.001 0.009 0.029 0.062 70 L 0.020 0.964 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 0.005 71 I 0.020 0.933 0.003 0.001 0.001 0.003 0.026 0.013 72 D 0.019 0.897 0.005 0.001 0.001 0.005 0.035 0.036 73 Y 0.075 0.846 0.009 0.001 0.001 0.008 0.034 0.026 74 L 0.194 0.671 0.010 0.001 0.001 0.010 0.053 0.060 75 Q 0.053 0.152 0.020 0.005 0.004 0.027 0.232 0.507 76 Q 0.030 0.143 0.015 0.003 0.003 0.066 0.221 0.518 77 K 0.118 0.027 0.111 0.009 0.005 0.089 0.302 0.339 78 K 0.787 0.004 0.003 0.001 0.001 0.019 0.012 0.172 79 T 0.154 0.002 0.002 0.001 0.001 0.024 0.019 0.799 80 E 0.005 0.002 0.039 0.002 0.009 0.259 0.007 0.677 81 G 0.006 0.002 0.080 0.008 0.035 0.095 0.035 0.739 82 Y 0.004 0.003 0.161 0.124 0.045 0.113 0.036 0.514 83 T 0.003 0.003 0.708 0.044 0.081 0.024 0.038 0.099 84 I 0.008 0.007 0.358 0.167 0.166 0.029 0.068 0.196 85 I 0.005 0.004 0.724 0.091 0.073 0.014 0.017 0.072 86 G 0.009 0.015 0.341 0.113 0.161 0.040 0.110 0.211 87 V 0.022 0.062 0.245 0.100 0.114 0.071 0.094 0.293 88 E 0.165 0.138 0.094 0.058 0.068 0.081 0.102 0.294 89 Q 0.082 0.069 0.043 0.026 0.030 0.103 0.163 0.484 90 T 0.183 0.141 0.015 0.013 0.020 0.075 0.118 0.435 91 A 0.165 0.082 0.015 0.012 0.017 0.095 0.085 0.529 92 K 0.053 0.072 0.010 0.014 0.027 0.107 0.042 0.676 93 S 0.034 0.030 0.016 0.014 0.028 0.111 0.141 0.626 94 L 0.030 0.061 0.035 0.044 0.044 0.145 0.117 0.525 95 D 0.147 0.096 0.032 0.033 0.055 0.082 0.084 0.471 96 L 0.122 0.030 0.039 0.043 0.046 0.089 0.108 0.522 97 T 0.110 0.022 0.034 0.047 0.078 0.082 0.061 0.565 98 Q 0.085 0.004 0.018 0.031 0.044 0.080 0.036 0.703 99 Y 0.010 0.002 0.020 0.044 0.055 0.120 0.026 0.724 100 C 0.014 0.001 0.019 0.014 0.033 0.108 0.023 0.788 101 F 0.084 0.001 0.024 0.017 0.016 0.143 0.061 0.654 102 P 0.051 0.004 0.029 0.012 0.011 0.128 0.062 0.703 103 E 0.009 0.003 0.063 0.009 0.024 0.259 0.053 0.580 104 K 0.001 0.001 0.470 0.032 0.087 0.089 0.099 0.220 105 S 0.001 0.001 0.695 0.050 0.066 0.017 0.113 0.058 106 L 0.001 0.001 0.845 0.030 0.033 0.010 0.043 0.038 107 L 0.001 0.001 0.869 0.039 0.042 0.009 0.021 0.018 108 L 0.005 0.002 0.784 0.037 0.061 0.031 0.036 0.043 109 L 0.018 0.009 0.601 0.028 0.060 0.097 0.062 0.125 110 G 0.101 0.025 0.198 0.027 0.063 0.176 0.103 0.307 111 N 0.051 0.011 0.168 0.026 0.048 0.171 0.192 0.332 112 E 0.223 0.012 0.031 0.013 0.026 0.152 0.040 0.502 113 R 0.200 0.005 0.017 0.012 0.019 0.092 0.207 0.447 114 E 0.011 0.009 0.009 0.005 0.011 0.183 0.022 0.751 115 G 0.004 0.011 0.006 0.006 0.012 0.109 0.022 0.829 116 I 0.029 0.279 0.006 0.015 0.006 0.078 0.025 0.561 117 P 0.068 0.908 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.008 118 A 0.035 0.904 0.002 0.001 0.001 0.005 0.032 0.021 119 N 0.022 0.890 0.008 0.002 0.002 0.006 0.040 0.031 120 L 0.141 0.631 0.012 0.002 0.002 0.012 0.153 0.047 121 I 0.150 0.135 0.052 0.010 0.010 0.046 0.459 0.139 122 Q 0.086 0.067 0.019 0.004 0.006 0.060 0.189 0.569 123 Q 0.044 0.019 0.015 0.002 0.002 0.070 0.057 0.791 124 L 0.070 0.017 0.035 0.009 0.017 0.247 0.066 0.538 125 D 0.019 0.004 0.021 0.005 0.014 0.103 0.061 0.774 126 V 0.008 0.003 0.393 0.047 0.097 0.116 0.073 0.262 127 C 0.004 0.002 0.333 0.048 0.090 0.052 0.073 0.399 128 V 0.002 0.001 0.512 0.200 0.097 0.035 0.021 0.131 129 E 0.005 0.001 0.585 0.042 0.072 0.046 0.031 0.218 130 I 0.048 0.006 0.273 0.124 0.087 0.113 0.094 0.256 131 P 0.071 0.012 0.089 0.019 0.023 0.119 0.039 0.629 132 Q 0.189 0.046 0.036 0.011 0.020 0.112 0.079 0.507 133 Q 0.084 0.063 0.032 0.016 0.028 0.111 0.057 0.610 134 G 0.038 0.068 0.043 0.031 0.048 0.116 0.123 0.533 135 I 0.058 0.175 0.034 0.032 0.045 0.106 0.131 0.419 136 I 0.060 0.258 0.037 0.029 0.034 0.085 0.153 0.344 137 R 0.048 0.550 0.012 0.012 0.018 0.043 0.058 0.259 138 S 0.018 0.513 0.011 0.004 0.007 0.029 0.302 0.116 139 L 0.005 0.797 0.004 0.004 0.004 0.010 0.138 0.036 140 N 0.006 0.688 0.002 0.001 0.002 0.005 0.284 0.011 141 V 0.001 0.953 0.001 0.001 0.001 0.001 0.040 0.003 142 H 0.001 0.979 0.001 0.001 0.001 0.001 0.017 0.002 143 V 0.001 0.978 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.002 144 S 0.001 0.949 0.001 0.001 0.001 0.001 0.045 0.002 145 G 0.001 0.965 0.001 0.001 0.001 0.001 0.032 0.001 146 A 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 147 L 0.001 0.989 0.003 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 148 L 0.003 0.966 0.005 0.001 0.001 0.001 0.021 0.002 149 I 0.003 0.242 0.017 0.001 0.001 0.003 0.729 0.004 150 W 0.002 0.808 0.003 0.001 0.001 0.003 0.172 0.009 151 E 0.008 0.957 0.003 0.001 0.001 0.004 0.010 0.015 152 Y 0.028 0.818 0.012 0.006 0.004 0.016 0.070 0.046 153 T 0.061 0.625 0.021 0.006 0.006 0.020 0.156 0.105 154 R 0.281 0.374 0.006 0.004 0.004 0.027 0.065 0.239 155 Q 0.150 0.053 0.022 0.012 0.009 0.091 0.177 0.487 156 Q 0.061 0.018 0.010 0.009 0.010 0.110 0.111 0.670 157 L 0.068 0.008 0.006 0.004 0.006 0.072 0.038 0.798 158 L 0.061 0.006 0.008 0.006 0.008 0.100 0.028 0.782 159 S 0.045 0.007 0.007 0.006 0.010 0.091 0.026 0.808