# TARGET T0329 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-pb-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 16 (1 pb ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment /projects/compbio/experiments/protein-predict/casp7/T0329/T0329.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2251 # Pos AA A B C D E F G H I J K L M N O P 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.226 0.013 0.273 0.304 0.004 0.059 0.014 0.003 0.010 0.019 0.007 0.006 0.025 0.001 0.002 0.035 2 K 0.032 0.218 0.288 0.425 0.001 0.014 0.001 0.002 0.002 0.001 0.004 0.002 0.004 0.001 0.001 0.005 3 Y 0.007 0.002 0.021 0.515 0.001 0.438 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 4 K 0.001 0.863 0.035 0.098 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 5 A 0.001 0.001 0.005 0.991 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 6 A 0.001 0.001 0.817 0.178 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 7 I 0.001 0.001 0.001 0.990 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 8 F 0.001 0.005 0.003 0.967 0.011 0.011 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 9 D 0.001 0.005 0.001 0.063 0.057 0.861 0.001 0.002 0.001 0.007 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 10 M 0.001 0.035 0.001 0.013 0.327 0.015 0.011 0.012 0.001 0.001 0.567 0.003 0.001 0.012 0.001 0.001 11 D 0.001 0.064 0.002 0.011 0.001 0.015 0.001 0.413 0.007 0.002 0.008 0.112 0.001 0.001 0.361 0.001 12 G 0.003 0.008 0.011 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.406 0.023 0.004 0.002 0.003 0.001 0.002 0.530 13 T 0.949 0.002 0.022 0.008 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.003 0.001 0.001 0.003 14 I 0.017 0.022 0.740 0.045 0.019 0.064 0.039 0.002 0.001 0.001 0.011 0.006 0.021 0.006 0.001 0.007 15 L 0.005 0.123 0.037 0.638 0.015 0.059 0.006 0.037 0.004 0.002 0.018 0.018 0.023 0.002 0.007 0.006 16 D 0.007 0.094 0.044 0.264 0.009 0.325 0.006 0.011 0.047 0.052 0.022 0.037 0.053 0.001 0.003 0.025 17 T 0.045 0.083 0.071 0.105 0.003 0.140 0.003 0.013 0.004 0.009 0.339 0.068 0.106 0.001 0.002 0.007 18 S 0.005 0.007 0.019 0.007 0.003 0.361 0.002 0.002 0.001 0.003 0.144 0.327 0.115 0.002 0.001 0.001 19 A 0.001 0.016 0.007 0.006 0.001 0.007 0.001 0.002 0.001 0.001 0.495 0.183 0.277 0.001 0.003 0.001 20 D 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.395 0.576 0.001 0.001 0.002 21 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.014 0.011 0.971 0.001 0.001 0.001 22 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.043 0.952 0.001 0.001 0.001 23 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.994 0.001 0.001 0.001 24 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.998 0.001 0.001 0.001 25 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 26 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 27 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 28 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 29 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 30 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.001 0.004 31 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.975 0.001 0.003 32 T 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.026 0.001 0.961 0.001 33 G 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.007 0.004 0.001 0.001 0.035 0.003 0.001 0.931 34 H 0.940 0.002 0.007 0.004 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.021 0.003 0.001 0.003 35 R 0.010 0.322 0.408 0.041 0.005 0.033 0.031 0.006 0.002 0.001 0.019 0.016 0.039 0.024 0.020 0.023 36 H 0.021 0.080 0.154 0.471 0.004 0.050 0.021 0.020 0.008 0.005 0.026 0.040 0.032 0.002 0.041 0.025 37 D 0.045 0.136 0.273 0.243 0.004 0.147 0.006 0.003 0.023 0.007 0.017 0.014 0.028 0.001 0.003 0.052 38 F 0.042 0.135 0.229 0.559 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.011 0.007 0.004 0.001 0.001 0.005 39 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 40 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 41 E 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 0.002 0.001 0.001 0.001 42 D 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.010 0.968 0.001 0.001 0.010 43 I 0.001 0.001 0.019 0.001 0.001 0.005 0.005 0.001 0.001 0.001 0.011 0.004 0.951 0.001 0.001 0.002 44 K 0.001 0.005 0.003 0.003 0.001 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.013 0.962 0.001 0.002 0.002 45 N 0.001 0.001 0.002 0.010 0.001 0.004 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.944 0.008 0.002 0.015 46 F 0.002 0.002 0.015 0.003 0.011 0.002 0.113 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.329 0.480 0.007 0.028 47 F 0.002 0.013 0.065 0.011 0.001 0.004 0.013 0.036 0.001 0.001 0.004 0.006 0.319 0.005 0.502 0.019 48 G 0.007 0.003 0.015 0.004 0.033 0.016 0.139 0.001 0.015 0.038 0.008 0.004 0.173 0.236 0.003 0.303 49 S 0.237 0.043 0.035 0.016 0.001 0.008 0.003 0.137 0.001 0.001 0.071 0.025 0.159 0.002 0.253 0.009 50 G 0.007 0.020 0.072 0.018 0.001 0.082 0.003 0.003 0.059 0.121 0.063 0.159 0.273 0.002 0.003 0.115 51 V 0.120 0.014 0.013 0.018 0.001 0.058 0.001 0.001 0.001 0.001 0.157 0.180 0.433 0.001 0.001 0.001 52 V 0.001 0.012 0.021 0.014 0.001 0.040 0.001 0.001 0.001 0.001 0.093 0.306 0.508 0.001 0.001 0.001 53 V 0.001 0.005 0.004 0.019 0.001 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.024 0.092 0.843 0.001 0.001 0.001 54 A 0.001 0.002 0.002 0.010 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.027 0.942 0.001 0.001 0.002 55 V 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.010 0.969 0.001 0.001 0.001 56 T 0.001 0.001 0.002 0.006 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.970 0.002 0.001 0.002 57 R 0.001 0.002 0.003 0.008 0.001 0.003 0.003 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.948 0.009 0.004 0.009 58 A 0.002 0.004 0.018 0.007 0.002 0.005 0.027 0.001 0.001 0.001 0.004 0.005 0.825 0.056 0.012 0.031 59 L 0.004 0.012 0.043 0.011 0.003 0.009 0.043 0.007 0.001 0.001 0.010 0.008 0.682 0.065 0.064 0.038 60 A 0.010 0.019 0.052 0.021 0.005 0.021 0.040 0.012 0.006 0.004 0.018 0.015 0.523 0.052 0.071 0.130 61 Y 0.036 0.023 0.058 0.018 0.008 0.031 0.029 0.010 0.006 0.006 0.074 0.032 0.548 0.022 0.032 0.068 62 E 0.016 0.014 0.025 0.006 0.059 0.015 0.168 0.006 0.002 0.002 0.043 0.033 0.093 0.491 0.008 0.018 63 A 0.006 0.029 0.036 0.014 0.002 0.010 0.011 0.127 0.003 0.001 0.016 0.030 0.071 0.006 0.627 0.010 64 G 0.010 0.022 0.057 0.025 0.005 0.017 0.021 0.007 0.117 0.097 0.025 0.026 0.121 0.010 0.012 0.430 65 S 0.587 0.024 0.060 0.038 0.003 0.033 0.011 0.011 0.004 0.004 0.038 0.056 0.103 0.003 0.012 0.012 66 S 0.020 0.054 0.189 0.044 0.006 0.208 0.012 0.015 0.007 0.011 0.100 0.116 0.179 0.007 0.011 0.020 67 R 0.019 0.053 0.054 0.071 0.006 0.110 0.010 0.012 0.005 0.004 0.219 0.151 0.257 0.005 0.011 0.011 68 E 0.013 0.079 0.073 0.099 0.002 0.046 0.007 0.013 0.007 0.003 0.073 0.245 0.311 0.005 0.009 0.016 69 S 0.014 0.029 0.093 0.097 0.002 0.064 0.008 0.005 0.006 0.002 0.035 0.088 0.518 0.004 0.012 0.025 70 L 0.012 0.020 0.138 0.088 0.004 0.031 0.014 0.003 0.002 0.001 0.063 0.035 0.556 0.005 0.005 0.022 71 V 0.010 0.025 0.070 0.083 0.008 0.090 0.012 0.006 0.001 0.001 0.030 0.077 0.563 0.007 0.006 0.010 72 A 0.004 0.015 0.027 0.032 0.080 0.039 0.111 0.008 0.002 0.001 0.055 0.017 0.220 0.367 0.007 0.015 73 F 0.004 0.046 0.051 0.047 0.002 0.009 0.008 0.124 0.003 0.001 0.026 0.030 0.188 0.004 0.441 0.016 74 G 0.016 0.013 0.059 0.044 0.004 0.020 0.017 0.004 0.065 0.080 0.020 0.021 0.228 0.013 0.006 0.391 75 T 0.444 0.033 0.083 0.068 0.004 0.045 0.011 0.012 0.002 0.002 0.041 0.042 0.184 0.005 0.013 0.011 76 K 0.006 0.043 0.085 0.044 0.004 0.285 0.007 0.016 0.003 0.006 0.090 0.084 0.295 0.008 0.011 0.013 77 D 0.007 0.016 0.013 0.028 0.003 0.117 0.007 0.006 0.002 0.002 0.257 0.122 0.399 0.006 0.008 0.006 78 E 0.007 0.048 0.019 0.033 0.001 0.012 0.004 0.007 0.004 0.001 0.128 0.268 0.441 0.004 0.010 0.014 79 Q 0.015 0.023 0.090 0.055 0.001 0.017 0.010 0.002 0.005 0.001 0.010 0.090 0.577 0.013 0.016 0.075 80 I 0.007 0.005 0.208 0.026 0.001 0.035 0.015 0.001 0.001 0.001 0.014 0.012 0.651 0.002 0.009 0.013 81 P 0.004 0.009 0.032 0.017 0.002 0.116 0.011 0.003 0.001 0.001 0.096 0.026 0.662 0.008 0.002 0.009 82 E 0.008 0.067 0.012 0.042 0.001 0.020 0.007 0.008 0.003 0.001 0.156 0.131 0.507 0.015 0.009 0.014 83 A 0.005 0.043 0.055 0.033 0.001 0.021 0.024 0.001 0.005 0.001 0.012 0.095 0.603 0.012 0.024 0.065 84 V 0.010 0.018 0.321 0.034 0.001 0.010 0.039 0.002 0.001 0.001 0.012 0.012 0.476 0.006 0.015 0.042 85 T 0.011 0.015 0.051 0.020 0.001 0.307 0.005 0.008 0.001 0.003 0.027 0.037 0.486 0.003 0.009 0.015 86 Q 0.006 0.013 0.010 0.007 0.002 0.036 0.004 0.002 0.002 0.001 0.561 0.021 0.311 0.012 0.002 0.011 87 T 0.005 0.041 0.016 0.013 0.001 0.005 0.001 0.003 0.001 0.001 0.039 0.557 0.300 0.001 0.014 0.003 88 E 0.002 0.002 0.011 0.004 0.001 0.027 0.002 0.001 0.001 0.001 0.012 0.035 0.881 0.002 0.001 0.018 89 V 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.054 0.021 0.897 0.001 0.001 0.001 90 N 0.001 0.004 0.002 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.021 0.095 0.869 0.001 0.001 0.001 91 R 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.016 0.974 0.001 0.001 0.001 92 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.986 0.001 0.001 0.001 93 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.990 0.001 0.001 0.001 94 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.990 0.001 0.001 0.001 95 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.980 0.005 0.001 0.005 96 F 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.981 0.001 0.004 0.003 97 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.988 0.001 0.001 0.002 98 P 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.016 0.009 0.967 0.001 0.001 0.001 99 Y 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.043 0.938 0.002 0.001 0.003 100 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.985 0.001 0.001 0.001 101 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.978 0.002 0.002 0.002 102 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.964 0.007 0.005 0.007 103 H 0.001 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.908 0.017 0.010 0.032 104 C 0.002 0.002 0.024 0.003 0.001 0.004 0.009 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.920 0.004 0.011 0.013 105 Q 0.004 0.009 0.032 0.009 0.002 0.013 0.041 0.001 0.001 0.001 0.009 0.007 0.772 0.048 0.006 0.045 106 I 0.016 0.039 0.048 0.042 0.003 0.017 0.025 0.011 0.002 0.001 0.033 0.024 0.582 0.032 0.089 0.036 107 K 0.007 0.030 0.100 0.023 0.014 0.021 0.192 0.003 0.006 0.004 0.015 0.012 0.215 0.209 0.019 0.128 108 T 0.053 0.111 0.227 0.122 0.002 0.008 0.032 0.029 0.005 0.001 0.013 0.026 0.134 0.005 0.204 0.028 109 G 0.027 0.027 0.222 0.097 0.014 0.086 0.042 0.003 0.034 0.034 0.012 0.020 0.103 0.007 0.004 0.268 110 P 0.207 0.109 0.261 0.293 0.003 0.011 0.002 0.009 0.001 0.001 0.032 0.013 0.041 0.001 0.005 0.011 111 F 0.004 0.002 0.014 0.014 0.269 0.567 0.039 0.001 0.001 0.012 0.009 0.032 0.022 0.015 0.001 0.001 112 P 0.002 0.020 0.003 0.008 0.001 0.012 0.001 0.237 0.001 0.001 0.656 0.013 0.034 0.001 0.014 0.001 113 G 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.021 0.001 0.001 0.059 0.047 0.043 0.762 0.058 0.001 0.001 0.004 114 I 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.091 0.151 0.744 0.001 0.001 0.001 115 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.187 0.801 0.001 0.001 0.001 116 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.992 0.001 0.001 0.001 117 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 118 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 119 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 120 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.002 121 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.994 0.001 0.001 0.001 122 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.002 123 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 124 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 125 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.993 126 V 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 127 K 0.001 0.048 0.927 0.019 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 128 L 0.001 0.003 0.008 0.984 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 129 A 0.001 0.001 0.073 0.920 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 130 V 0.001 0.002 0.013 0.931 0.040 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 131 V 0.001 0.013 0.003 0.696 0.198 0.075 0.004 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 132 S 0.001 0.115 0.002 0.246 0.038 0.459 0.002 0.103 0.007 0.006 0.012 0.004 0.002 0.001 0.002 0.001 133 N 0.007 0.438 0.020 0.215 0.007 0.033 0.002 0.022 0.085 0.048 0.090 0.017 0.002 0.001 0.001 0.013 134 K 0.147 0.080 0.145 0.163 0.024 0.137 0.011 0.010 0.013 0.033 0.042 0.172 0.012 0.002 0.003 0.007 135 P 0.007 0.024 0.045 0.014 0.002 0.558 0.001 0.016 0.001 0.004 0.219 0.045 0.058 0.001 0.004 0.001 136 N 0.001 0.011 0.001 0.003 0.001 0.058 0.001 0.001 0.003 0.002 0.590 0.248 0.078 0.001 0.001 0.001 137 E 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.065 0.758 0.164 0.001 0.001 0.001 138 A 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.118 0.856 0.001 0.001 0.003 139 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.016 0.974 0.001 0.001 0.001 140 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.992 0.001 0.001 0.001 141 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.993 0.001 0.001 0.001 142 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.992 0.001 0.001 0.001 143 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 144 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.975 0.014 0.002 0.004 145 E 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.852 0.073 0.036 0.026 146 L 0.002 0.002 0.073 0.002 0.001 0.001 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.552 0.017 0.063 0.270 147 F 0.011 0.001 0.033 0.001 0.017 0.007 0.397 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.288 0.192 0.004 0.042 148 P 0.028 0.032 0.038 0.007 0.002 0.044 0.012 0.242 0.002 0.001 0.045 0.010 0.234 0.016 0.273 0.014 149 G 0.008 0.105 0.014 0.023 0.001 0.015 0.007 0.007 0.138 0.063 0.138 0.060 0.159 0.008 0.014 0.240 150 S 0.392 0.123 0.124 0.061 0.001 0.006 0.013 0.001 0.007 0.001 0.011 0.087 0.113 0.003 0.014 0.044 151 F 0.019 0.004 0.519 0.047 0.001 0.230 0.014 0.002 0.001 0.001 0.013 0.015 0.124 0.002 0.003 0.006 152 D 0.004 0.701 0.105 0.102 0.001 0.012 0.004 0.001 0.001 0.001 0.005 0.023 0.035 0.001 0.002 0.004 153 F 0.005 0.004 0.018 0.923 0.001 0.007 0.001 0.001 0.002 0.001 0.014 0.002 0.018 0.001 0.001 0.005 154 A 0.008 0.008 0.704 0.216 0.011 0.006 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.021 0.002 0.001 0.008 155 L 0.003 0.022 0.037 0.907 0.005 0.011 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.002 156 G 0.002 0.014 0.017 0.296 0.032 0.605 0.003 0.004 0.002 0.008 0.005 0.001 0.008 0.001 0.001 0.002 157 E 0.006 0.110 0.007 0.059 0.029 0.358 0.002 0.026 0.002 0.003 0.372 0.010 0.013 0.001 0.001 0.001 158 K 0.005 0.126 0.014 0.049 0.032 0.035 0.009 0.034 0.022 0.006 0.291 0.344 0.012 0.015 0.003 0.003 159 S 0.014 0.120 0.117 0.096 0.004 0.027 0.012 0.072 0.019 0.005 0.029 0.190 0.093 0.005 0.177 0.020 160 G 0.032 0.025 0.183 0.092 0.008 0.041 0.026 0.008 0.043 0.028 0.042 0.025 0.195 0.009 0.012 0.231 161 I 0.209 0.044 0.156 0.159 0.009 0.058 0.028 0.019 0.005 0.005 0.069 0.062 0.144 0.008 0.010 0.014 162 R 0.025 0.134 0.205 0.298 0.004 0.050 0.010 0.013 0.015 0.006 0.017 0.052 0.117 0.004 0.013 0.036 163 R 0.042 0.026 0.159 0.521 0.005 0.037 0.008 0.004 0.009 0.006 0.031 0.021 0.095 0.003 0.004 0.030 164 K 0.051 0.030 0.261 0.365 0.013 0.089 0.009 0.003 0.002 0.003 0.026 0.024 0.104 0.003 0.002 0.013 165 P 0.012 0.064 0.078 0.518 0.005 0.071 0.002 0.012 0.001 0.004 0.067 0.053 0.101 0.001 0.002 0.006 166 A 0.002 0.007 0.004 0.026 0.003 0.649 0.001 0.002 0.001 0.003 0.039 0.054 0.206 0.001 0.001 0.001 167 P 0.001 0.004 0.001 0.002 0.001 0.026 0.001 0.001 0.001 0.001 0.597 0.056 0.311 0.001 0.001 0.001 168 D 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.018 0.807 0.164 0.001 0.001 0.001 169 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.012 0.978 0.001 0.001 0.001 170 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.013 0.984 0.001 0.001 0.001 171 S 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.996 0.001 0.001 0.001 172 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.994 0.001 0.001 0.001 173 C 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 174 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 175 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 176 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 177 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 178 G 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 179 V 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 180 P 0.001 0.001 0.040 0.001 0.002 0.952 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 181 R 0.001 0.009 0.001 0.002 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.976 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 182 D 0.001 0.253 0.001 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 0.714 0.001 0.001 0.001 0.001 183 K 0.018 0.014 0.770 0.063 0.001 0.001 0.004 0.001 0.007 0.001 0.001 0.001 0.014 0.001 0.003 0.105 184 C 0.009 0.001 0.941 0.044 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 185 V 0.006 0.010 0.295 0.681 0.002 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 186 Y 0.001 0.001 0.004 0.871 0.096 0.022 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 187 I 0.002 0.034 0.011 0.638 0.072 0.127 0.002 0.098 0.001 0.001 0.008 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 188 G 0.001 0.187 0.004 0.327 0.010 0.233 0.001 0.031 0.074 0.075 0.040 0.011 0.002 0.001 0.001 0.005 189 D 0.076 0.222 0.031 0.192 0.007 0.149 0.003 0.013 0.021 0.023 0.118 0.130 0.011 0.001 0.001 0.003 190 S 0.010 0.029 0.041 0.017 0.003 0.487 0.002 0.008 0.002 0.004 0.201 0.153 0.040 0.001 0.002 0.002 191 E 0.004 0.025 0.017 0.012 0.003 0.036 0.003 0.003 0.002 0.001 0.655 0.167 0.062 0.006 0.001 0.004 192 I 0.005 0.048 0.016 0.037 0.001 0.010 0.001 0.007 0.002 0.001 0.042 0.607 0.202 0.001 0.018 0.003 193 D 0.001 0.002 0.006 0.002 0.001 0.025 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.026 0.912 0.001 0.001 0.013 194 I 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.020 0.002 0.001 0.001 0.001 0.095 0.024 0.853 0.001 0.001 0.001 195 Q 0.001 0.015 0.004 0.007 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.169 0.785 0.001 0.003 0.001 196 T 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.977 0.001 0.001 0.006 197 A 0.001 0.001 0.007 0.002 0.001 0.002 0.012 0.001 0.001 0.001 0.003 0.002 0.963 0.005 0.001 0.002 198 R 0.001 0.003 0.003 0.002 0.001 0.003 0.004 0.003 0.001 0.001 0.005 0.006 0.952 0.003 0.011 0.004 199 N 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.039 0.902 0.002 0.020 200 S 0.002 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.003 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.040 0.001 0.918 0.003 201 E 0.001 0.010 0.015 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.020 0.003 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.940 202 M 0.937 0.001 0.009 0.008 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.001 0.001 0.001 203 D 0.001 0.800 0.181 0.010 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 204 E 0.001 0.002 0.011 0.962 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 0.010 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 205 I 0.001 0.008 0.812 0.168 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 206 A 0.001 0.002 0.009 0.973 0.005 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 207 V 0.004 0.011 0.028 0.711 0.105 0.124 0.003 0.004 0.001 0.001 0.002 0.001 0.006 0.001 0.001 0.001 208 N 0.001 0.040 0.005 0.194 0.438 0.235 0.013 0.025 0.002 0.007 0.025 0.002 0.004 0.007 0.001 0.001 209 W 0.003 0.153 0.006 0.156 0.020 0.065 0.002 0.414 0.020 0.008 0.091 0.032 0.004 0.001 0.021 0.002 210 G 0.014 0.089 0.029 0.071 0.013 0.093 0.016 0.022 0.169 0.168 0.101 0.113 0.038 0.006 0.009 0.049 211 F 0.231 0.072 0.088 0.074 0.007 0.045 0.020 0.020 0.014 0.009 0.144 0.160 0.069 0.005 0.022 0.019 212 R 0.035 0.124 0.249 0.110 0.003 0.073 0.009 0.015 0.015 0.010 0.045 0.159 0.092 0.003 0.015 0.043 213 S 0.048 0.108 0.211 0.268 0.002 0.073 0.005 0.004 0.010 0.005 0.032 0.064 0.129 0.001 0.006 0.034 214 V 0.026 0.010 0.119 0.094 0.006 0.326 0.008 0.002 0.002 0.004 0.112 0.050 0.235 0.001 0.001 0.004 215 P 0.005 0.100 0.038 0.098 0.002 0.064 0.002 0.012 0.001 0.001 0.246 0.164 0.262 0.001 0.001 0.002 216 F 0.002 0.032 0.007 0.128 0.002 0.118 0.003 0.002 0.007 0.001 0.031 0.261 0.392 0.005 0.002 0.007 217 L 0.002 0.011 0.048 0.050 0.002 0.013 0.017 0.001 0.001 0.001 0.028 0.028 0.783 0.002 0.008 0.007 218 Q 0.003 0.006 0.022 0.021 0.003 0.023 0.006 0.005 0.001 0.001 0.033 0.033 0.819 0.003 0.004 0.017 219 K 0.004 0.002 0.004 0.002 0.016 0.001 0.024 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.018 0.914 0.001 0.006 220 H 0.001 0.005 0.016 0.004 0.001 0.001 0.003 0.028 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.001 0.921 0.001 221 G 0.001 0.009 0.019 0.005 0.001 0.001 0.002 0.001 0.031 0.011 0.001 0.001 0.017 0.002 0.001 0.897 222 A 0.925 0.001 0.007 0.013 0.001 0.028 0.001 0.001 0.001 0.001 0.005 0.004 0.014 0.001 0.001 0.001 223 T 0.002 0.793 0.169 0.017 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 0.003 0.001 0.001 0.002 224 V 0.002 0.002 0.031 0.958 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.002 0.001 0.001 0.002 225 I 0.002 0.002 0.866 0.122 0.002 0.005 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 226 V 0.002 0.007 0.006 0.283 0.023 0.664 0.001 0.001 0.001 0.001 0.006 0.001 0.005 0.001 0.001 0.001 227 D 0.001 0.461 0.004 0.388 0.001 0.025 0.001 0.029 0.001 0.001 0.071 0.012 0.003 0.001 0.001 0.001 228 T 0.001 0.002 0.001 0.003 0.001 0.933 0.001 0.001 0.001 0.002 0.002 0.047 0.009 0.001 0.001 0.001 229 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.962 0.005 0.026 0.001 0.001 0.001 230 E 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.947 0.040 0.001 0.001 0.001 231 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.968 0.006 0.001 0.016 232 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.985 0.001 0.001 0.001 233 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.988 0.001 0.001 0.001 234 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.965 0.013 0.003 0.007 235 A 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.850 0.032 0.019 0.068 236 I 0.002 0.001 0.072 0.001 0.003 0.002 0.311 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.358 0.183 0.015 0.048 237 L 0.010 0.035 0.145 0.015 0.002 0.007 0.031 0.043 0.001 0.001 0.006 0.004 0.330 0.021 0.287 0.062 238 G 0.018 0.022 0.039 0.018 0.023 0.060 0.093 0.005 0.035 0.061 0.038 0.013 0.243 0.087 0.011 0.232 239 E 0.157 0.109 0.083 0.023 0.011 0.029 0.056 0.039 0.003 0.001 0.173 0.050 0.144 0.027 0.080 0.016