# TARGET T0327 # Using neural net dunbrack-40pc-3157-t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-n_notor-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 8 (1 n_notor ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0327.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 4.61673 # Pos AA G H P A B S M N 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.102 0.023 0.042 0.033 0.071 0.100 0.009 0.620 2 N 0.092 0.036 0.033 0.045 0.069 0.181 0.014 0.529 3 K 0.085 0.029 0.032 0.015 0.031 0.085 0.011 0.712 4 D 0.064 0.064 0.023 0.018 0.022 0.261 0.013 0.534 5 K 0.181 0.051 0.020 0.010 0.013 0.170 0.024 0.530 6 L 0.123 0.105 0.041 0.015 0.024 0.266 0.008 0.419 7 R 0.050 0.185 0.044 0.038 0.066 0.244 0.009 0.365 8 Y 0.029 0.423 0.032 0.027 0.051 0.058 0.004 0.376 9 A 0.028 0.551 0.026 0.037 0.063 0.079 0.007 0.209 10 I 0.023 0.706 0.010 0.019 0.026 0.029 0.005 0.182 11 L 0.025 0.801 0.010 0.015 0.046 0.015 0.006 0.080 12 K 0.017 0.841 0.007 0.010 0.016 0.013 0.006 0.090 13 E 0.035 0.843 0.005 0.007 0.008 0.009 0.013 0.080 14 I 0.079 0.798 0.012 0.009 0.012 0.008 0.021 0.062 15 F 0.054 0.766 0.021 0.018 0.017 0.010 0.020 0.093 16 E 0.048 0.522 0.069 0.028 0.031 0.029 0.030 0.243 17 G 0.099 0.244 0.036 0.015 0.023 0.043 0.069 0.471 18 N 0.358 0.103 0.037 0.010 0.010 0.031 0.104 0.348 19 T 0.108 0.025 0.102 0.026 0.017 0.163 0.019 0.541 20 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 21 L 0.019 0.004 0.031 0.029 0.101 0.251 0.003 0.562 22 S 0.143 0.006 0.012 0.010 0.019 0.229 0.006 0.575 23 E 0.083 0.027 0.013 0.010 0.028 0.053 0.003 0.784 24 N 0.058 0.043 0.013 0.009 0.018 0.264 0.010 0.586 25 D 0.339 0.042 0.016 0.009 0.010 0.132 0.026 0.427 26 I 0.255 0.143 0.055 0.042 0.041 0.077 0.021 0.366 27 G 0.169 0.044 0.096 0.060 0.106 0.109 0.025 0.392 28 V 0.083 0.045 0.266 0.059 0.092 0.081 0.006 0.367 29 T 0.028 0.073 0.060 0.061 0.146 0.222 0.006 0.403 30 E 0.035 0.041 0.034 0.014 0.052 0.062 0.004 0.758 31 D 0.028 0.055 0.014 0.007 0.014 0.463 0.007 0.413 32 Q 0.203 0.043 0.004 0.002 0.003 0.534 0.015 0.197 33 F 0.137 0.563 0.013 0.004 0.006 0.082 0.009 0.185 34 D 0.017 0.538 0.012 0.003 0.011 0.072 0.005 0.340 35 D 0.021 0.543 0.004 0.002 0.004 0.077 0.004 0.344 36 A 0.021 0.880 0.001 0.001 0.002 0.022 0.003 0.070 37 V 0.005 0.970 0.001 0.001 0.002 0.003 0.001 0.018 38 N 0.002 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 39 F 0.006 0.977 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.011 40 L 0.057 0.893 0.003 0.003 0.004 0.002 0.015 0.025 41 K 0.044 0.869 0.010 0.008 0.011 0.004 0.016 0.038 42 R 0.043 0.724 0.026 0.012 0.014 0.014 0.038 0.129 43 E 0.137 0.326 0.038 0.018 0.011 0.032 0.135 0.303 44 G 0.431 0.083 0.036 0.026 0.006 0.012 0.195 0.210 45 Y 0.064 0.004 0.691 0.027 0.028 0.047 0.017 0.122 46 I 0.007 0.003 0.172 0.149 0.135 0.051 0.003 0.481 47 I 0.008 0.002 0.206 0.232 0.373 0.024 0.002 0.153 48 G 0.005 0.001 0.106 0.157 0.237 0.038 0.002 0.453 49 V 0.011 0.001 0.247 0.227 0.279 0.040 0.002 0.193 50 H 0.004 0.001 0.055 0.241 0.223 0.038 0.001 0.437 51 Y 0.010 0.001 0.034 0.085 0.219 0.060 0.002 0.590 52 S 0.019 0.003 0.048 0.145 0.211 0.128 0.003 0.442 53 D 0.016 0.001 0.011 0.019 0.037 0.068 0.004 0.843 54 D 0.037 0.003 0.012 0.013 0.022 0.413 0.015 0.486 55 R 0.330 0.005 0.028 0.021 0.021 0.220 0.030 0.346 56 P 0.001 0.001 0.004 0.002 0.002 0.016 0.001 0.974 57 H 0.010 0.004 0.094 0.076 0.163 0.162 0.004 0.488 58 L 0.107 0.016 0.113 0.081 0.252 0.098 0.004 0.328 59 Y 0.033 0.022 0.207 0.256 0.311 0.042 0.006 0.123 60 K 0.062 0.017 0.064 0.087 0.154 0.098 0.012 0.507 61 L 0.103 0.022 0.191 0.060 0.176 0.061 0.028 0.361 62 G 0.030 0.009 0.033 0.047 0.074 0.188 0.007 0.612 63 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 64 E 0.024 0.003 0.022 0.025 0.044 0.155 0.005 0.722 65 L 0.333 0.014 0.059 0.023 0.025 0.074 0.009 0.464 66 T 0.064 0.052 0.099 0.061 0.106 0.098 0.007 0.512 67 E 0.049 0.046 0.059 0.027 0.050 0.076 0.004 0.688 68 K 0.032 0.029 0.013 0.008 0.014 0.580 0.007 0.317 69 G 0.265 0.081 0.011 0.009 0.018 0.219 0.029 0.369 70 E 0.101 0.335 0.031 0.015 0.028 0.159 0.010 0.321 71 N 0.018 0.254 0.014 0.022 0.029 0.153 0.010 0.500 72 Y 0.097 0.457 0.010 0.023 0.055 0.056 0.009 0.293 73 L 0.086 0.676 0.010 0.025 0.073 0.018 0.007 0.105 74 K 0.036 0.687 0.015 0.030 0.059 0.020 0.011 0.143 75 E 0.059 0.672 0.014 0.015 0.021 0.018 0.029 0.172 76 N 0.270 0.346 0.009 0.012 0.009 0.016 0.124 0.215 77 G 0.568 0.061 0.027 0.013 0.005 0.021 0.110 0.195 78 T 0.075 0.034 0.094 0.011 0.021 0.375 0.014 0.376 79 W 0.070 0.047 0.019 0.015 0.062 0.197 0.007 0.582 80 S 0.045 0.135 0.015 0.012 0.023 0.260 0.006 0.506 81 K 0.042 0.149 0.007 0.005 0.008 0.203 0.005 0.580 82 A 0.045 0.728 0.006 0.009 0.012 0.044 0.004 0.153 83 Y 0.017 0.861 0.003 0.014 0.022 0.013 0.005 0.064 84 K 0.029 0.801 0.004 0.027 0.036 0.014 0.004 0.083 85 T 0.007 0.770 0.005 0.016 0.020 0.011 0.003 0.170 86 I 0.005 0.897 0.003 0.019 0.031 0.005 0.003 0.037 87 K 0.008 0.853 0.005 0.016 0.018 0.009 0.004 0.086 88 E 0.014 0.834 0.004 0.013 0.014 0.013 0.005 0.103 89 I 0.035 0.838 0.006 0.008 0.014 0.009 0.008 0.084 90 K 0.013 0.867 0.004 0.006 0.007 0.007 0.005 0.090 91 D 0.038 0.726 0.005 0.007 0.008 0.013 0.021 0.182 92 W 0.136 0.613 0.020 0.009 0.013 0.016 0.030 0.162 93 I 0.069 0.670 0.024 0.037 0.026 0.014 0.020 0.140 94 K 0.006 0.091 0.023 0.010 0.015 0.020 0.006 0.829 95 L 0.063 0.310 0.042 0.044 0.071 0.070 0.015 0.385 96 E 0.173 0.291 0.048 0.024 0.039 0.127 0.026 0.272 97 H 0.182 0.221 0.031 0.024 0.028 0.096 0.035 0.381 98 H 0.149 0.275 0.071 0.024 0.025 0.064 0.023 0.368 99 H 0.163 0.160 0.044 0.031 0.042 0.080 0.034 0.446 100 H 0.157 0.087 0.052 0.032 0.048 0.086 0.031 0.507 101 H 0.101 0.060 0.054 0.033 0.054 0.097 0.019 0.582 102 H 0.077 0.042 0.041 0.031 0.049 0.096 0.013 0.650