# TARGET T0326 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0326.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1929 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.022 0.020 0.012 0.039 0.058 0.093 0.182 0.175 0.161 0.137 0.101 2 P 0.096 0.117 0.060 0.185 0.146 0.096 0.083 0.083 0.065 0.042 0.027 3 I 0.005 0.003 0.004 0.008 0.015 0.031 0.085 0.124 0.225 0.252 0.247 4 N 0.113 0.165 0.084 0.238 0.159 0.088 0.063 0.037 0.025 0.015 0.013 5 V 0.011 0.017 0.008 0.035 0.042 0.061 0.164 0.149 0.180 0.179 0.154 6 P 0.288 0.163 0.043 0.121 0.086 0.062 0.067 0.059 0.046 0.035 0.029 7 S 0.261 0.229 0.042 0.157 0.111 0.077 0.055 0.028 0.023 0.011 0.006 8 G 0.342 0.216 0.056 0.118 0.099 0.067 0.042 0.025 0.021 0.010 0.004 9 L 0.156 0.065 0.019 0.097 0.106 0.117 0.162 0.107 0.083 0.052 0.036 10 P 0.211 0.171 0.093 0.177 0.116 0.086 0.067 0.040 0.023 0.010 0.005 11 A 0.008 0.041 0.045 0.076 0.073 0.082 0.137 0.150 0.155 0.132 0.100 12 V 0.006 0.009 0.015 0.032 0.064 0.130 0.229 0.166 0.159 0.112 0.079 13 K 0.106 0.076 0.264 0.279 0.139 0.066 0.039 0.015 0.010 0.005 0.002 14 V 0.010 0.020 0.041 0.151 0.154 0.186 0.266 0.108 0.038 0.018 0.006 15 L 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.020 0.054 0.193 0.326 0.398 16 A 0.011 0.034 0.073 0.126 0.198 0.207 0.216 0.078 0.032 0.018 0.007 17 K 0.048 0.093 0.577 0.151 0.071 0.034 0.013 0.007 0.004 0.002 0.001 18 E 0.054 0.038 0.045 0.092 0.113 0.191 0.272 0.106 0.052 0.024 0.012 19 G 0.204 0.150 0.069 0.122 0.089 0.086 0.098 0.077 0.063 0.030 0.012 20 I 0.012 0.010 0.021 0.035 0.050 0.093 0.191 0.163 0.171 0.142 0.112 21 F 0.051 0.073 0.146 0.172 0.146 0.129 0.133 0.071 0.041 0.023 0.015 22 V 0.016 0.027 0.056 0.097 0.074 0.084 0.171 0.137 0.137 0.115 0.087 23 M 0.025 0.033 0.035 0.047 0.051 0.066 0.146 0.151 0.164 0.150 0.131 24 T 0.117 0.174 0.082 0.190 0.145 0.107 0.090 0.045 0.029 0.013 0.006 25 E 0.228 0.184 0.130 0.186 0.116 0.076 0.044 0.018 0.011 0.005 0.002 26 K 0.372 0.149 0.116 0.141 0.091 0.062 0.042 0.014 0.009 0.003 0.001 27 R 0.144 0.093 0.105 0.160 0.106 0.110 0.151 0.065 0.038 0.020 0.008 28 A 0.043 0.066 0.198 0.124 0.103 0.120 0.162 0.081 0.052 0.033 0.017 29 I 0.031 0.077 0.285 0.175 0.119 0.112 0.112 0.044 0.024 0.014 0.006 30 H 0.078 0.078 0.274 0.172 0.134 0.116 0.085 0.032 0.018 0.010 0.003 31 Q 0.163 0.089 0.215 0.163 0.100 0.093 0.092 0.038 0.026 0.015 0.006 32 D 0.109 0.119 0.115 0.173 0.123 0.115 0.129 0.063 0.033 0.015 0.006 33 I 0.030 0.026 0.044 0.038 0.047 0.079 0.161 0.173 0.161 0.139 0.102 34 R 0.120 0.166 0.145 0.204 0.133 0.096 0.068 0.035 0.018 0.009 0.005 35 P 0.136 0.152 0.153 0.184 0.131 0.092 0.064 0.038 0.028 0.015 0.007 36 L 0.029 0.026 0.017 0.046 0.063 0.096 0.174 0.140 0.156 0.138 0.115 37 E 0.090 0.121 0.056 0.201 0.174 0.140 0.102 0.054 0.039 0.016 0.007 38 I 0.005 0.007 0.016 0.036 0.045 0.071 0.155 0.152 0.182 0.186 0.145 39 L 0.010 0.018 0.034 0.074 0.087 0.100 0.182 0.160 0.137 0.108 0.090 40 I 0.001 0.003 0.011 0.017 0.020 0.028 0.092 0.125 0.221 0.256 0.226 41 L 0.009 0.012 0.043 0.051 0.068 0.083 0.161 0.142 0.162 0.151 0.120 42 N 0.034 0.041 0.079 0.129 0.124 0.131 0.173 0.100 0.094 0.060 0.036 43 L 0.046 0.065 0.059 0.113 0.103 0.119 0.185 0.113 0.094 0.064 0.039 44 M 0.075 0.080 0.033 0.092 0.089 0.101 0.176 0.138 0.102 0.069 0.044 45 P 0.248 0.125 0.064 0.114 0.106 0.096 0.097 0.061 0.047 0.027 0.017 46 D 0.400 0.201 0.112 0.141 0.073 0.037 0.019 0.008 0.005 0.002 0.001 47 K 0.124 0.104 0.053 0.123 0.120 0.120 0.155 0.080 0.061 0.037 0.022 48 I 0.106 0.089 0.055 0.107 0.097 0.106 0.167 0.102 0.083 0.054 0.036 49 K 0.175 0.149 0.171 0.232 0.122 0.072 0.045 0.018 0.009 0.004 0.002 50 T 0.106 0.093 0.166 0.134 0.108 0.110 0.115 0.068 0.051 0.032 0.016 51 E 0.086 0.108 0.084 0.144 0.125 0.126 0.145 0.081 0.056 0.030 0.015 52 I 0.074 0.062 0.077 0.114 0.116 0.140 0.170 0.097 0.077 0.049 0.025 53 Q 0.148 0.131 0.234 0.203 0.112 0.073 0.051 0.023 0.014 0.008 0.004 54 L 0.039 0.065 0.069 0.127 0.117 0.135 0.189 0.114 0.075 0.048 0.024 55 L 0.020 0.021 0.030 0.043 0.054 0.085 0.161 0.146 0.168 0.151 0.121 56 R 0.067 0.092 0.138 0.235 0.163 0.119 0.097 0.039 0.027 0.016 0.008 57 L 0.030 0.048 0.084 0.151 0.148 0.143 0.154 0.099 0.070 0.050 0.022 58 L 0.003 0.003 0.006 0.011 0.017 0.034 0.101 0.140 0.215 0.236 0.234 59 G 0.019 0.032 0.032 0.094 0.111 0.129 0.182 0.152 0.120 0.079 0.051 60 N 0.007 0.011 0.030 0.045 0.052 0.060 0.113 0.127 0.171 0.196 0.188 61 T 0.015 0.016 0.016 0.042 0.057 0.078 0.169 0.152 0.175 0.146 0.134 62 P 0.049 0.052 0.039 0.114 0.097 0.087 0.131 0.109 0.127 0.107 0.087 63 L 0.026 0.036 0.020 0.058 0.066 0.085 0.168 0.130 0.152 0.138 0.120 64 Q 0.179 0.164 0.052 0.158 0.136 0.097 0.083 0.056 0.040 0.022 0.013 65 V 0.123 0.074 0.025 0.079 0.081 0.097 0.143 0.119 0.111 0.085 0.062 66 N 0.294 0.281 0.056 0.155 0.106 0.053 0.026 0.015 0.009 0.003 0.002 67 V 0.018 0.016 0.008 0.026 0.036 0.063 0.140 0.130 0.194 0.190 0.178 68 T 0.125 0.141 0.082 0.216 0.175 0.112 0.076 0.032 0.022 0.011 0.006 69 L 0.023 0.028 0.046 0.123 0.111 0.129 0.201 0.127 0.100 0.074 0.038 70 L 0.008 0.013 0.026 0.041 0.048 0.065 0.141 0.163 0.172 0.172 0.150 71 Y 0.005 0.013 0.019 0.039 0.046 0.070 0.154 0.178 0.202 0.161 0.112 72 T 0.014 0.023 0.065 0.090 0.113 0.123 0.165 0.115 0.120 0.101 0.068 73 E 0.066 0.060 0.117 0.175 0.147 0.130 0.145 0.063 0.050 0.031 0.016 74 T 0.041 0.048 0.044 0.144 0.118 0.116 0.197 0.118 0.089 0.058 0.028 75 H 0.013 0.012 0.017 0.021 0.027 0.043 0.132 0.150 0.191 0.207 0.187 76 K 0.088 0.138 0.085 0.227 0.163 0.112 0.103 0.043 0.022 0.012 0.007 77 P 0.228 0.159 0.199 0.153 0.104 0.061 0.041 0.022 0.017 0.010 0.005 78 K 0.231 0.128 0.046 0.135 0.119 0.104 0.122 0.055 0.034 0.018 0.009 79 H 0.496 0.196 0.052 0.096 0.065 0.038 0.023 0.018 0.011 0.004 0.002 80 T 0.042 0.037 0.013 0.033 0.057 0.101 0.160 0.200 0.158 0.112 0.087 81 P 0.167 0.359 0.091 0.175 0.107 0.054 0.021 0.014 0.007 0.003 0.001 82 I 0.012 0.009 0.008 0.026 0.040 0.070 0.153 0.136 0.192 0.189 0.165 83 E 0.259 0.157 0.103 0.216 0.139 0.064 0.033 0.015 0.009 0.004 0.002 84 H 0.004 0.010 0.011 0.050 0.046 0.069 0.187 0.157 0.188 0.165 0.115 85 I 0.005 0.009 0.019 0.021 0.030 0.043 0.110 0.144 0.191 0.225 0.204 86 L 0.025 0.038 0.077 0.165 0.138 0.136 0.178 0.098 0.071 0.049 0.025 87 K 0.090 0.112 0.249 0.188 0.147 0.102 0.056 0.028 0.017 0.008 0.003 88 F 0.020 0.021 0.018 0.044 0.049 0.082 0.214 0.160 0.170 0.131 0.090 89 Y 0.139 0.090 0.050 0.124 0.117 0.109 0.145 0.096 0.066 0.041 0.022 90 T 0.110 0.087 0.128 0.135 0.105 0.099 0.116 0.076 0.067 0.046 0.031 91 T 0.119 0.243 0.114 0.196 0.130 0.086 0.060 0.029 0.014 0.006 0.003 92 F 0.032 0.024 0.013 0.041 0.056 0.086 0.184 0.158 0.165 0.137 0.103 93 S 0.431 0.178 0.107 0.141 0.072 0.034 0.020 0.009 0.006 0.003 0.001 94 A 0.165 0.156 0.091 0.242 0.160 0.092 0.056 0.023 0.010 0.004 0.001 95 V 0.014 0.009 0.013 0.011 0.018 0.035 0.098 0.145 0.208 0.231 0.218 96 K 0.082 0.173 0.079 0.259 0.174 0.111 0.076 0.028 0.012 0.005 0.002 97 D 0.104 0.101 0.307 0.159 0.106 0.078 0.058 0.033 0.027 0.019 0.008 98 R 0.091 0.070 0.077 0.148 0.127 0.138 0.177 0.074 0.045 0.032 0.021 99 K 0.175 0.206 0.085 0.180 0.124 0.092 0.063 0.041 0.022 0.009 0.003 100 F 0.004 0.005 0.005 0.012 0.021 0.049 0.115 0.173 0.195 0.218 0.202 101 D 0.063 0.134 0.067 0.195 0.185 0.152 0.093 0.054 0.032 0.014 0.010 102 G 0.004 0.006 0.009 0.040 0.055 0.078 0.153 0.136 0.193 0.184 0.143 103 F 0.002 0.003 0.005 0.022 0.035 0.043 0.114 0.135 0.181 0.206 0.253 104 I 0.001 0.001 0.002 0.008 0.012 0.018 0.073 0.133 0.236 0.261 0.257 105 I 0.001 0.001 0.004 0.004 0.008 0.010 0.033 0.088 0.191 0.292 0.370 106 T 0.001 0.003 0.007 0.014 0.029 0.050 0.124 0.183 0.233 0.189 0.167 107 G 0.012 0.022 0.027 0.066 0.091 0.110 0.153 0.160 0.162 0.112 0.086 108 A 0.008 0.012 0.007 0.026 0.038 0.064 0.151 0.148 0.193 0.176 0.177 109 P 0.089 0.094 0.023 0.130 0.118 0.106 0.141 0.106 0.089 0.060 0.043 110 V 0.039 0.026 0.014 0.047 0.056 0.075 0.143 0.115 0.156 0.160 0.168 111 E 0.183 0.164 0.061 0.201 0.144 0.091 0.076 0.033 0.025 0.014 0.009 112 L 0.051 0.038 0.021 0.073 0.070 0.075 0.151 0.126 0.143 0.142 0.109 113 L 0.076 0.065 0.026 0.066 0.081 0.096 0.149 0.130 0.122 0.099 0.091 114 P 0.181 0.240 0.069 0.207 0.121 0.070 0.052 0.029 0.019 0.009 0.005 115 F 0.163 0.070 0.037 0.080 0.094 0.095 0.124 0.097 0.094 0.082 0.063 116 E 0.401 0.210 0.053 0.134 0.084 0.047 0.034 0.016 0.012 0.006 0.003 117 E 0.150 0.181 0.057 0.186 0.137 0.095 0.088 0.049 0.033 0.017 0.007 118 V 0.048 0.024 0.018 0.042 0.066 0.100 0.183 0.155 0.145 0.121 0.100 119 D 0.337 0.178 0.164 0.192 0.070 0.032 0.015 0.005 0.003 0.001 0.001 120 Y 0.034 0.092 0.084 0.138 0.125 0.129 0.163 0.110 0.067 0.041 0.018 121 W 0.015 0.014 0.011 0.024 0.042 0.079 0.209 0.207 0.172 0.123 0.104 122 E 0.474 0.134 0.164 0.151 0.046 0.018 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 123 E 0.096 0.203 0.191 0.209 0.154 0.087 0.039 0.014 0.006 0.002 0.001 124 L 0.004 0.011 0.008 0.014 0.019 0.050 0.164 0.195 0.230 0.168 0.137 125 T 0.040 0.043 0.051 0.171 0.219 0.222 0.167 0.051 0.023 0.009 0.003 126 E 0.078 0.052 0.609 0.179 0.055 0.018 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 127 I 0.001 0.001 0.007 0.008 0.015 0.038 0.163 0.219 0.233 0.192 0.124 128 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.012 0.066 0.150 0.290 0.266 0.210 129 E 0.003 0.013 0.518 0.184 0.144 0.076 0.041 0.012 0.005 0.003 0.001 130 W 0.002 0.010 0.173 0.156 0.141 0.209 0.211 0.073 0.016 0.007 0.002 131 S 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.003 0.029 0.064 0.246 0.328 0.325 132 R 0.013 0.022 0.050 0.078 0.131 0.194 0.305 0.109 0.051 0.034 0.013 133 H 0.027 0.066 0.587 0.161 0.068 0.039 0.025 0.011 0.008 0.005 0.002 134 N 0.070 0.085 0.113 0.142 0.133 0.173 0.189 0.058 0.023 0.009 0.004 135 V 0.174 0.100 0.051 0.083 0.065 0.082 0.131 0.111 0.099 0.068 0.036 136 Y 0.134 0.100 0.081 0.151 0.131 0.126 0.118 0.064 0.048 0.029 0.019 137 S 0.041 0.065 0.066 0.132 0.140 0.144 0.160 0.095 0.074 0.049 0.033 138 T 0.008 0.015 0.018 0.055 0.064 0.086 0.155 0.141 0.165 0.151 0.141 139 M 0.003 0.004 0.008 0.024 0.034 0.055 0.133 0.145 0.199 0.201 0.194 140 F 0.002 0.006 0.013 0.039 0.052 0.065 0.136 0.154 0.187 0.181 0.165 141 I 0.001 0.001 0.004 0.009 0.015 0.025 0.077 0.122 0.222 0.256 0.268 142 C 0.001 0.002 0.006 0.015 0.023 0.037 0.100 0.142 0.219 0.228 0.228 143 W 0.001 0.004 0.009 0.028 0.046 0.070 0.165 0.165 0.193 0.174 0.146 144 A 0.001 0.005 0.009 0.031 0.048 0.078 0.168 0.150 0.195 0.166 0.149 145 A 0.001 0.001 0.003 0.010 0.020 0.041 0.136 0.143 0.222 0.221 0.204 146 Q 0.001 0.002 0.005 0.027 0.048 0.074 0.210 0.185 0.175 0.148 0.127 147 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.013 0.061 0.117 0.223 0.276 0.298 148 G 0.001 0.001 0.002 0.005 0.012 0.018 0.074 0.150 0.233 0.248 0.257 149 L 0.001 0.001 0.004 0.003 0.007 0.011 0.048 0.101 0.242 0.285 0.299 150 Y 0.001 0.002 0.014 0.023 0.053 0.086 0.207 0.178 0.181 0.139 0.117 151 Y 0.001 0.004 0.013 0.024 0.030 0.051 0.169 0.164 0.209 0.189 0.147 152 F 0.006 0.007 0.012 0.028 0.043 0.075 0.190 0.184 0.174 0.159 0.123 153 Y 0.045 0.050 0.041 0.083 0.088 0.112 0.182 0.137 0.119 0.083 0.061 154 G 0.113 0.144 0.051 0.162 0.137 0.110 0.115 0.075 0.050 0.027 0.016 155 I 0.039 0.022 0.008 0.025 0.041 0.061 0.138 0.137 0.170 0.170 0.189 156 P 0.357 0.261 0.054 0.177 0.082 0.034 0.020 0.007 0.005 0.002 0.001 157 K 0.155 0.100 0.056 0.161 0.134 0.103 0.120 0.062 0.051 0.037 0.021 158 Y 0.156 0.074 0.038 0.081 0.088 0.097 0.151 0.100 0.095 0.070 0.050 159 E 0.232 0.236 0.102 0.215 0.105 0.053 0.030 0.015 0.008 0.003 0.001 160 L 0.032 0.035 0.025 0.039 0.059 0.096 0.171 0.186 0.142 0.126 0.089 161 P 0.294 0.245 0.072 0.154 0.099 0.058 0.035 0.021 0.012 0.005 0.004 162 Q 0.310 0.135 0.075 0.141 0.106 0.081 0.064 0.033 0.031 0.017 0.008 163 K 0.284 0.164 0.094 0.157 0.118 0.071 0.049 0.025 0.020 0.012 0.007 164 L 0.034 0.042 0.017 0.074 0.077 0.115 0.226 0.152 0.125 0.084 0.055 165 S 0.065 0.082 0.076 0.134 0.115 0.107 0.118 0.105 0.082 0.066 0.048 166 G 0.061 0.074 0.074 0.121 0.108 0.118 0.142 0.109 0.088 0.064 0.041 167 V 0.094 0.111 0.067 0.166 0.151 0.118 0.098 0.074 0.059 0.038 0.023 168 Y 0.016 0.015 0.007 0.024 0.037 0.062 0.141 0.153 0.200 0.191 0.154 169 K 0.113 0.153 0.053 0.244 0.182 0.106 0.069 0.038 0.024 0.012 0.006 170 H 0.023 0.013 0.020 0.034 0.038 0.057 0.124 0.118 0.194 0.211 0.167 171 R 0.090 0.101 0.068 0.209 0.164 0.115 0.117 0.058 0.038 0.024 0.016 172 V 0.016 0.022 0.021 0.042 0.042 0.060 0.154 0.153 0.182 0.176 0.131 173 A 0.107 0.119 0.062 0.133 0.121 0.110 0.122 0.090 0.059 0.044 0.034 174 K 0.239 0.241 0.082 0.158 0.108 0.069 0.046 0.025 0.018 0.009 0.005 175 D 0.289 0.167 0.050 0.134 0.118 0.087 0.065 0.038 0.029 0.016 0.008 176 S 0.252 0.093 0.029 0.105 0.112 0.108 0.116 0.071 0.063 0.033 0.019 177 V 0.112 0.083 0.071 0.155 0.127 0.112 0.127 0.078 0.066 0.041 0.027 178 L 0.012 0.026 0.043 0.083 0.077 0.081 0.162 0.139 0.138 0.129 0.110 179 F 0.008 0.008 0.021 0.025 0.038 0.063 0.147 0.160 0.183 0.186 0.161 180 R 0.082 0.101 0.135 0.233 0.151 0.105 0.089 0.044 0.030 0.018 0.011 181 G 0.128 0.129 0.094 0.148 0.134 0.113 0.104 0.067 0.047 0.025 0.011 182 H 0.049 0.033 0.011 0.036 0.045 0.066 0.143 0.159 0.176 0.150 0.132 183 D 0.331 0.226 0.067 0.142 0.099 0.060 0.036 0.019 0.013 0.005 0.003 184 D 0.158 0.130 0.105 0.179 0.133 0.097 0.084 0.044 0.035 0.023 0.013 185 F 0.127 0.095 0.058 0.119 0.122 0.121 0.135 0.082 0.066 0.043 0.029 186 F 0.045 0.045 0.032 0.087 0.090 0.118 0.173 0.130 0.130 0.091 0.058 187 W 0.042 0.063 0.074 0.139 0.127 0.130 0.142 0.102 0.078 0.061 0.043 188 A 0.012 0.018 0.021 0.048 0.058 0.085 0.157 0.151 0.162 0.155 0.133 189 P 0.028 0.040 0.033 0.078 0.085 0.095 0.136 0.135 0.146 0.125 0.100 190 H 0.021 0.025 0.020 0.065 0.074 0.093 0.151 0.132 0.162 0.141 0.117 191 S 0.045 0.041 0.036 0.090 0.095 0.103 0.143 0.109 0.134 0.113 0.093 192 R 0.022 0.034 0.023 0.086 0.088 0.100 0.173 0.125 0.138 0.118 0.093 193 Y 0.014 0.019 0.018 0.044 0.049 0.065 0.135 0.135 0.178 0.181 0.162 194 T 0.026 0.026 0.025 0.067 0.078 0.099 0.177 0.134 0.143 0.123 0.102 195 E 0.119 0.102 0.092 0.174 0.133 0.103 0.103 0.062 0.054 0.035 0.022 196 V 0.025 0.027 0.021 0.053 0.059 0.078 0.162 0.124 0.160 0.150 0.140 197 K 0.062 0.080 0.042 0.104 0.095 0.097 0.164 0.108 0.105 0.082 0.062 198 K 0.098 0.084 0.063 0.181 0.150 0.122 0.134 0.065 0.050 0.033 0.019 199 E 0.255 0.114 0.124 0.130 0.101 0.082 0.079 0.043 0.036 0.022 0.013 200 D 0.077 0.115 0.046 0.190 0.139 0.109 0.150 0.077 0.048 0.030 0.018 201 I 0.043 0.028 0.022 0.044 0.060 0.079 0.181 0.155 0.164 0.134 0.091 202 D 0.257 0.120 0.185 0.203 0.110 0.054 0.036 0.013 0.011 0.007 0.005 203 K 0.150 0.224 0.136 0.227 0.133 0.068 0.040 0.014 0.006 0.002 0.001 204 V 0.021 0.016 0.009 0.021 0.033 0.051 0.139 0.210 0.178 0.179 0.144 205 P 0.295 0.180 0.040 0.107 0.100 0.092 0.075 0.062 0.030 0.012 0.007 206 E 0.277 0.299 0.163 0.147 0.083 0.022 0.004 0.002 0.001 0.001 0.001 207 L 0.004 0.003 0.002 0.005 0.014 0.039 0.110 0.151 0.209 0.222 0.243 208 E 0.118 0.147 0.041 0.238 0.199 0.119 0.068 0.035 0.023 0.008 0.004 209 I 0.003 0.006 0.022 0.044 0.042 0.061 0.163 0.146 0.172 0.202 0.140 210 L 0.007 0.012 0.034 0.064 0.080 0.086 0.159 0.168 0.139 0.134 0.117 211 A 0.003 0.003 0.009 0.010 0.014 0.029 0.091 0.143 0.255 0.251 0.192 212 E 0.042 0.125 0.101 0.244 0.190 0.120 0.088 0.046 0.023 0.013 0.008 213 S 0.041 0.036 0.023 0.039 0.048 0.078 0.158 0.150 0.173 0.142 0.112 214 D 0.336 0.235 0.037 0.162 0.098 0.056 0.039 0.018 0.011 0.005 0.003 215 E 0.459 0.218 0.057 0.113 0.069 0.041 0.021 0.011 0.007 0.003 0.001 216 A 0.032 0.032 0.011 0.047 0.077 0.110 0.178 0.151 0.141 0.118 0.103 217 G 0.056 0.108 0.047 0.173 0.169 0.160 0.125 0.072 0.055 0.022 0.012 218 V 0.002 0.003 0.011 0.026 0.036 0.060 0.151 0.138 0.190 0.203 0.182 219 Y 0.002 0.005 0.017 0.055 0.089 0.106 0.243 0.198 0.121 0.093 0.071 220 V 0.001 0.001 0.003 0.004 0.004 0.006 0.034 0.079 0.235 0.322 0.312 221 V 0.001 0.001 0.019 0.009 0.019 0.030 0.089 0.145 0.231 0.248 0.208 222 A 0.005 0.019 0.069 0.091 0.123 0.146 0.217 0.142 0.105 0.055 0.028 223 N 0.016 0.029 0.056 0.065 0.077 0.126 0.222 0.154 0.120 0.082 0.053 224 K 0.194 0.171 0.075 0.160 0.112 0.097 0.098 0.048 0.027 0.013 0.006 225 S 0.335 0.197 0.084 0.139 0.085 0.064 0.048 0.022 0.014 0.007 0.003 226 E 0.104 0.081 0.044 0.109 0.124 0.143 0.174 0.082 0.064 0.044 0.031 227 R 0.094 0.127 0.084 0.201 0.167 0.135 0.101 0.043 0.030 0.013 0.006 228 Q 0.006 0.009 0.023 0.052 0.061 0.098 0.199 0.152 0.152 0.139 0.108 229 I 0.002 0.005 0.014 0.036 0.058 0.087 0.198 0.194 0.153 0.136 0.115 230 F 0.001 0.001 0.006 0.010 0.013 0.019 0.061 0.113 0.220 0.272 0.284 231 V 0.001 0.001 0.008 0.007 0.013 0.022 0.065 0.116 0.224 0.270 0.274 232 T 0.002 0.006 0.018 0.044 0.072 0.094 0.180 0.170 0.176 0.133 0.105 233 G 0.002 0.004 0.009 0.016 0.023 0.042 0.115 0.145 0.224 0.219 0.200 234 H 0.014 0.019 0.015 0.052 0.069 0.096 0.183 0.165 0.163 0.124 0.102 235 P 0.053 0.048 0.045 0.092 0.081 0.091 0.161 0.108 0.128 0.106 0.086 236 E 0.090 0.083 0.047 0.163 0.143 0.122 0.154 0.074 0.057 0.039 0.027 237 Y 0.073 0.055 0.033 0.068 0.071 0.086 0.160 0.119 0.138 0.112 0.087 238 D 0.126 0.154 0.064 0.182 0.128 0.101 0.111 0.055 0.039 0.024 0.016 239 R 0.166 0.115 0.078 0.142 0.129 0.108 0.112 0.060 0.046 0.029 0.015 240 Y 0.324 0.121 0.090 0.131 0.095 0.072 0.071 0.039 0.031 0.017 0.010 241 T 0.250 0.181 0.089 0.176 0.108 0.077 0.063 0.028 0.017 0.008 0.004 242 L 0.039 0.061 0.039 0.059 0.069 0.094 0.168 0.146 0.137 0.110 0.078 243 R 0.111 0.158 0.092 0.195 0.153 0.120 0.088 0.041 0.024 0.011 0.006 244 D 0.229 0.108 0.173 0.168 0.120 0.087 0.056 0.027 0.020 0.009 0.003 245 E 0.108 0.077 0.092 0.180 0.153 0.133 0.131 0.064 0.035 0.018 0.008 246 Y 0.006 0.009 0.017 0.026 0.028 0.047 0.142 0.150 0.219 0.198 0.159 247 Y 0.010 0.021 0.080 0.075 0.089 0.114 0.187 0.134 0.119 0.104 0.066 248 R 0.026 0.057 0.244 0.212 0.157 0.126 0.098 0.038 0.023 0.014 0.006 249 D 0.054 0.052 0.126 0.131 0.114 0.134 0.164 0.096 0.067 0.042 0.019 250 I 0.033 0.034 0.026 0.065 0.068 0.094 0.200 0.164 0.146 0.105 0.065 251 G 0.074 0.063 0.074 0.092 0.094 0.105 0.143 0.113 0.112 0.079 0.051 252 R 0.072 0.078 0.106 0.180 0.149 0.123 0.132 0.062 0.046 0.032 0.021 253 N 0.138 0.122 0.121 0.165 0.126 0.097 0.096 0.054 0.042 0.026 0.014 254 L 0.040 0.034 0.020 0.058 0.060 0.082 0.178 0.148 0.149 0.129 0.103 255 K 0.227 0.174 0.082 0.140 0.114 0.085 0.070 0.047 0.034 0.019 0.011 256 V 0.140 0.108 0.063 0.133 0.114 0.107 0.119 0.077 0.066 0.044 0.029 257 P 0.309 0.217 0.071 0.138 0.100 0.063 0.045 0.026 0.017 0.009 0.005 258 I 0.084 0.071 0.023 0.081 0.084 0.097 0.158 0.124 0.118 0.091 0.069 259 P 0.221 0.207 0.072 0.174 0.123 0.077 0.055 0.031 0.022 0.012 0.007 260 A 0.112 0.074 0.063 0.158 0.137 0.122 0.131 0.068 0.064 0.044 0.026 261 N 0.149 0.094 0.096 0.168 0.132 0.103 0.110 0.056 0.045 0.030 0.017 262 Y 0.034 0.044 0.035 0.101 0.092 0.101 0.179 0.151 0.116 0.091 0.056 263 F 0.025 0.031 0.025 0.039 0.053 0.077 0.141 0.182 0.166 0.144 0.118 264 P 0.182 0.174 0.096 0.187 0.131 0.085 0.060 0.036 0.025 0.014 0.009 265 N 0.361 0.160 0.077 0.134 0.103 0.063 0.044 0.022 0.019 0.011 0.005 266 D 0.338 0.149 0.032 0.111 0.097 0.076 0.079 0.047 0.038 0.020 0.012 267 D 0.245 0.154 0.035 0.112 0.092 0.086 0.102 0.071 0.054 0.030 0.020 268 P 0.225 0.168 0.080 0.144 0.108 0.082 0.073 0.049 0.035 0.021 0.014 269 T 0.247 0.187 0.111 0.154 0.109 0.073 0.053 0.029 0.020 0.011 0.007 270 K 0.207 0.152 0.061 0.148 0.120 0.098 0.093 0.053 0.036 0.020 0.011 271 T 0.238 0.145 0.064 0.141 0.112 0.093 0.082 0.053 0.039 0.022 0.012 272 P 0.130 0.139 0.081 0.144 0.123 0.114 0.103 0.067 0.053 0.029 0.016 273 I 0.078 0.087 0.076 0.164 0.149 0.136 0.132 0.077 0.054 0.030 0.015 274 L 0.056 0.035 0.058 0.083 0.082 0.106 0.166 0.129 0.123 0.097 0.065 275 T 0.048 0.094 0.105 0.209 0.159 0.134 0.125 0.061 0.037 0.019 0.010 276 W 0.009 0.019 0.041 0.045 0.044 0.066 0.147 0.142 0.185 0.178 0.125 277 W 0.031 0.036 0.050 0.103 0.131 0.158 0.204 0.117 0.081 0.056 0.033 278 S 0.140 0.136 0.204 0.225 0.116 0.078 0.052 0.025 0.015 0.006 0.002 279 H 0.015 0.033 0.040 0.076 0.092 0.122 0.200 0.151 0.124 0.092 0.054 280 A 0.011 0.014 0.019 0.031 0.043 0.082 0.174 0.154 0.208 0.153 0.110 281 H 0.040 0.046 0.165 0.227 0.181 0.138 0.114 0.039 0.028 0.015 0.006 282 L 0.013 0.023 0.100 0.146 0.128 0.150 0.225 0.109 0.053 0.036 0.018 283 F 0.001 0.002 0.009 0.009 0.010 0.018 0.077 0.120 0.225 0.269 0.260 284 F 0.003 0.006 0.018 0.022 0.039 0.080 0.188 0.198 0.189 0.157 0.101 285 S 0.030 0.056 0.250 0.204 0.179 0.129 0.077 0.033 0.025 0.013 0.006 286 N 0.031 0.035 0.071 0.126 0.131 0.174 0.223 0.102 0.061 0.031 0.014 287 W 0.007 0.011 0.013 0.033 0.033 0.045 0.143 0.160 0.210 0.197 0.148 288 L 0.003 0.004 0.010 0.013 0.020 0.045 0.138 0.153 0.212 0.211 0.191 289 N 0.016 0.046 0.191 0.192 0.184 0.145 0.115 0.050 0.033 0.019 0.010 290 Y 0.009 0.020 0.061 0.098 0.107 0.145 0.224 0.133 0.100 0.068 0.035 291 C 0.007 0.006 0.014 0.022 0.025 0.038 0.121 0.140 0.214 0.222 0.190 292 I 0.014 0.022 0.033 0.068 0.077 0.105 0.213 0.164 0.141 0.102 0.063 293 Y 0.010 0.023 0.083 0.092 0.098 0.105 0.163 0.112 0.122 0.108 0.084 294 Q 0.028 0.032 0.059 0.099 0.099 0.124 0.221 0.115 0.098 0.076 0.047 295 K 0.078 0.091 0.091 0.199 0.147 0.114 0.120 0.066 0.048 0.032 0.015 296 T 0.021 0.028 0.022 0.042 0.049 0.083 0.192 0.169 0.166 0.137 0.092 297 P 0.119 0.122 0.061 0.172 0.159 0.118 0.104 0.067 0.041 0.023 0.013 298 Y 0.127 0.069 0.066 0.082 0.084 0.094 0.128 0.107 0.109 0.083 0.052 299 R 0.172 0.241 0.074 0.230 0.139 0.069 0.041 0.019 0.009 0.004 0.002 300 L 0.017 0.011 0.008 0.018 0.027 0.052 0.146 0.137 0.204 0.201 0.179 301 E 0.246 0.182 0.122 0.235 0.114 0.050 0.031 0.010 0.006 0.003 0.002 302 D 0.134 0.148 0.130 0.223 0.130 0.090 0.077 0.036 0.019 0.010 0.003 303 I 0.046 0.034 0.024 0.035 0.051 0.085 0.166 0.189 0.160 0.122 0.088 304 H 0.278 0.226 0.084 0.164 0.099 0.067 0.041 0.021 0.012 0.005 0.002