# cost function cost = # ( 15 * wet6.5(6.5, /log(length)) + 5 * near_backbone(9.65) + 5 * way_back(8.9) + 15 * dry5(5) + 20 * dry6.5(6.5) + 15 * dry8(8) + 5 * dry12(12) + 2 * phobic_fit + 5 * sidechain + 5 * n_ca_c + 10 * bad_peptide + 5 * bystroff + 20 * soft_clashes + 2 * backbone_clashes + 50 * break + 2 * pred_alpha2k + 2 * pred_alpha04 + 2 * pred_alpha06 + 30 * constraints + 5 * hbond_geom + 10 * hbond_geom_backbone + 50 * hbond_geom_beta + 100 * hbond_geom_beta_pair + 1 * missing_atoms + 0.5 * maybe_metal ) name length wet6.5 near_backbone way_back dry5 dry6.5 dry8 dry12 phobic_fit sidechain n_ca_c bad_peptide bystroff soft_clashes backbone_clashes break pred_alpha2k pred_alpha04 pred_alpha06 constraints hbond_geom hbond_geom_backbone hbond_geom_beta hbond_geom_beta_pair missing_atoms maybe_metal cost 10S 5N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N T0325.try24 262 0.5830 1.7608 1.7750 3.1475 3.0642 3.3798 3.5444 0.4223 -5.5699 0.2614 0.2362 -0.1277 0.5801 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3284 -0.4562 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 225.8530 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5690 1.7608 1.7750 3.0762 2.9976 3.3450 3.5338 0.4351 -5.2640 0.2614 0.2362 -0.1277 0.3081 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3318 -0.4712 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 218.8071 T0325.try24-opt1-scwrl 262 0.5829 1.7597 1.7631 3.1072 3.0585 3.4051 3.5437 0.4276 -5.5964 0.2612 0.2530 -0.1254 0.7691 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4006 -0.4086 -0.3128 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 182.5645 T0325.try24-opt1 262 0.5727 1.7602 1.7631 3.0770 3.0118 3.3611 3.5323 0.4467 -5.2506 0.2614 0.2530 -0.1254 0.4374 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4204 -0.4373 -0.3127 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 174.7080 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5884 1.7720 1.7784 3.2154 3.1376 3.4339 3.5434 0.4819 -5.3914 0.2942 0.2593 -0.1292 0.9671 0.2939 0.2209 0.2710 0.2239 0.2285 0.0286 -0.4034 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 206.2847 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5728 1.7720 1.7788 3.1518 3.0882 3.3787 3.5376 0.4728 -5.0613 0.2944 0.2592 -0.1248 0.8703 0.2939 0.2209 0.2621 0.2133 0.2196 0.0237 -0.4343 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 202.6145 T0325.try24-scwrl 262 0.5893 1.7621 1.7779 3.1912 3.0967 3.3828 3.5440 0.4148 -5.5103 0.2707 0.2538 -0.1204 0.7683 0.2557 0.2107 0.2406 0.1984 0.2025 -0.3889 -0.4101 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 184.7307 T0325.try24 262 0.5888 1.7621 1.7771 3.1693 3.0957 3.3768 3.5425 0.4254 -5.3458 0.2707 0.2537 -0.1204 0.9169 0.2557 0.2107 0.2419 0.1997 0.2038 -0.3808 -0.4291 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 188.2431 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5857 1.7694 1.7750 3.1943 3.0827 3.4008 3.5534 0.4550 -5.5758 0.2613 0.2478 -0.1297 0.6782 0.1794 0.2248 0.3109 0.2365 0.2433 -0.0578 -0.4178 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 193.6675 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5754 1.7694 1.7750 3.0877 3.0398 3.3845 3.5481 0.4382 -5.0777 0.2613 0.2477 -0.1297 0.5271 0.1794 0.2248 0.3108 0.2364 0.2432 -0.1149 -0.4399 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 188.3955 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5834 1.7672 1.7738 3.1502 3.0924 3.4123 3.5509 0.4035 -5.5755 0.3036 0.2482 -0.1337 0.6730 0.2214 0.1880 0.2628 0.2007 0.2068 -0.0898 -0.4345 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 189.9193 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5711 1.7677 1.7741 3.1081 3.0307 3.3661 3.5376 0.4233 -4.9924 0.3034 0.2482 -0.1337 0.5124 0.2214 0.1880 0.2629 0.2007 0.2068 -0.1307 -0.4333 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 185.6378 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5855 1.7643 1.7774 3.1570 3.0704 3.3814 3.5473 0.4171 -5.4589 0.2767 0.2694 -0.1244 0.7416 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2702 -0.4205 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 189.0354 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5701 1.7643 1.7774 3.0961 3.0086 3.3619 3.5349 0.4340 -5.1327 0.2767 0.2694 -0.1244 0.5766 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2847 -0.4451 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 184.1044 T0325.try24 262 0.5830 1.7608 1.7750 3.1475 3.0642 3.3798 3.5444 0.4223 -5.5699 0.2614 0.2362 -0.1277 0.5801 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3284 -0.4562 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 225.8530 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5690 1.7608 1.7750 3.0762 2.9976 3.3450 3.5338 0.4351 -5.2640 0.2614 0.2362 -0.1277 0.3081 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3318 -0.4712 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 218.8071 T0325.try24-opt1-scwrl 262 0.5829 1.7597 1.7631 3.1072 3.0585 3.4051 3.5437 0.4276 -5.5964 0.2612 0.2530 -0.1254 0.7691 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4006 -0.4086 -0.3128 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 182.5645 T0325.try24-opt1 262 0.5727 1.7602 1.7631 3.0770 3.0118 3.3611 3.5323 0.4467 -5.2506 0.2614 0.2530 -0.1254 0.4374 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4204 -0.4373 -0.3127 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 174.7080 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5884 1.7720 1.7784 3.2154 3.1376 3.4339 3.5434 0.4819 -5.3914 0.2942 0.2593 -0.1292 0.9671 0.2939 0.2209 0.2710 0.2239 0.2285 0.0286 -0.4034 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 206.2847 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5728 1.7720 1.7788 3.1518 3.0882 3.3787 3.5376 0.4728 -5.0613 0.2944 0.2592 -0.1248 0.8703 0.2939 0.2209 0.2621 0.2133 0.2196 0.0237 -0.4343 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 202.6145 T0325.try24-scwrl 262 0.5893 1.7621 1.7779 3.1912 3.0967 3.3828 3.5440 0.4148 -5.5103 0.2707 0.2538 -0.1204 0.7683 0.2557 0.2107 0.2406 0.1984 0.2025 -0.3889 -0.4101 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 184.7307 T0325.try24 262 0.5888 1.7621 1.7771 3.1693 3.0957 3.3768 3.5425 0.4254 -5.3458 0.2707 0.2537 -0.1204 0.9169 0.2557 0.2107 0.2419 0.1997 0.2038 -0.3808 -0.4291 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 188.2431 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5857 1.7694 1.7750 3.1943 3.0827 3.4008 3.5534 0.4550 -5.5758 0.2613 0.2478 -0.1297 0.6782 0.1794 0.2248 0.3109 0.2365 0.2433 -0.0578 -0.4178 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 193.6675 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5754 1.7694 1.7750 3.0877 3.0398 3.3845 3.5481 0.4382 -5.0777 0.2613 0.2477 -0.1297 0.5271 0.1794 0.2248 0.3108 0.2364 0.2432 -0.1149 -0.4399 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 188.3955 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5834 1.7672 1.7738 3.1502 3.0924 3.4123 3.5509 0.4035 -5.5755 0.3036 0.2482 -0.1337 0.6730 0.2214 0.1880 0.2628 0.2007 0.2068 -0.0898 -0.4345 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 189.9193 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5711 1.7677 1.7741 3.1081 3.0307 3.3661 3.5376 0.4233 -4.9924 0.3034 0.2482 -0.1337 0.5124 0.2214 0.1880 0.2629 0.2007 0.2068 -0.1307 -0.4333 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 185.6378 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5855 1.7643 1.7774 3.1570 3.0704 3.3814 3.5473 0.4171 -5.4589 0.2767 0.2694 -0.1244 0.7416 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2702 -0.4205 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 189.0354 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5701 1.7643 1.7774 3.0961 3.0086 3.3619 3.5349 0.4340 -5.1327 0.2767 0.2694 -0.1244 0.5766 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2847 -0.4451 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 184.1044 T0325.try24 262 0.5830 1.7608 1.7750 3.1475 3.0642 3.3798 3.5444 0.4223 -5.5699 0.2614 0.2362 -0.1277 0.5801 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3284 -0.4562 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 225.8530 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5690 1.7608 1.7750 3.0762 2.9976 3.3450 3.5338 0.4351 -5.2640 0.2614 0.2362 -0.1277 0.3081 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3318 -0.4712 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 218.8071 T0325.try24-opt2 262 0.5705 1.7493 1.7548 3.0473 2.9794 3.3337 3.5202 0.3907 -5.2801 0.2729 0.2629 -0.1280 0.3796 0.1718 0.1819 0.1745 0.1353 0.1384 -0.4481 -0.4765 -0.3291 -0.0705 -0.0527 0.0000 0.0000 166.7321 T0325.try24-opt1-scwrl 262 0.5829 1.7597 1.7631 3.1072 3.0585 3.4051 3.5437 0.4276 -5.5964 0.2612 0.2530 -0.1254 0.7691 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4006 -0.4086 -0.3128 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 182.5645 T0325.try24-opt1 262 0.5727 1.7602 1.7631 3.0770 3.0118 3.3611 3.5323 0.4467 -5.2506 0.2614 0.2530 -0.1254 0.4374 0.2099 0.2221 0.2735 0.2234 0.2278 -0.4204 -0.4373 -0.3127 -0.0637 -0.0443 0.0000 0.0000 174.7080 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5884 1.7720 1.7784 3.2154 3.1376 3.4339 3.5434 0.4819 -5.3914 0.2942 0.2593 -0.1292 0.9671 0.2939 0.2209 0.2710 0.2239 0.2285 0.0286 -0.4034 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 206.2847 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5728 1.7720 1.7788 3.1518 3.0882 3.3787 3.5376 0.4728 -5.0613 0.2944 0.2592 -0.1248 0.8703 0.2939 0.2209 0.2621 0.2133 0.2196 0.0237 -0.4343 -0.3029 -0.0536 -0.0348 0.0000 0.0000 202.6145 T0325.try24-scwrl 262 0.5893 1.7621 1.7779 3.1912 3.0967 3.3828 3.5440 0.4148 -5.5103 0.2707 0.2538 -0.1204 0.7683 0.2557 0.2107 0.2406 0.1984 0.2025 -0.3889 -0.4101 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 184.7307 T0325.try24 262 0.5888 1.7621 1.7771 3.1693 3.0957 3.3768 3.5425 0.4254 -5.3458 0.2707 0.2537 -0.1204 0.9169 0.2557 0.2107 0.2419 0.1997 0.2038 -0.3808 -0.4291 -0.3109 -0.0616 -0.0443 0.0000 0.0000 188.2431 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5857 1.7694 1.7750 3.1943 3.0827 3.4008 3.5534 0.4550 -5.5758 0.2613 0.2478 -0.1297 0.6782 0.1794 0.2248 0.3109 0.2365 0.2433 -0.0578 -0.4178 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 193.6675 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5754 1.7694 1.7750 3.0877 3.0398 3.3845 3.5481 0.4382 -5.0777 0.2613 0.2477 -0.1297 0.5271 0.1794 0.2248 0.3108 0.2364 0.2432 -0.1149 -0.4399 -0.3113 -0.0587 -0.0423 0.0000 0.0000 188.3955 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5834 1.7672 1.7738 3.1502 3.0924 3.4123 3.5509 0.4035 -5.5755 0.3036 0.2482 -0.1337 0.6730 0.2214 0.1880 0.2628 0.2007 0.2068 -0.0898 -0.4345 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 189.9193 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5711 1.7677 1.7741 3.1081 3.0307 3.3661 3.5376 0.4233 -4.9924 0.3034 0.2482 -0.1337 0.5124 0.2214 0.1880 0.2629 0.2007 0.2068 -0.1307 -0.4333 -0.3120 -0.0624 -0.0438 0.0000 0.0000 185.6378 T0325.try9-opt2.pdb-scwrl 262 0.5855 1.7643 1.7774 3.1570 3.0704 3.3814 3.5473 0.4171 -5.4589 0.2767 0.2694 -0.1244 0.7416 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2702 -0.4205 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 189.0354 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5701 1.7643 1.7774 3.0961 3.0086 3.3619 3.5349 0.4340 -5.1327 0.2767 0.2694 -0.1244 0.5766 0.3015 0.2588 0.2706 0.2246 0.2299 -0.2847 -0.4451 -0.3182 -0.0634 -0.0494 0.0000 0.0000 184.1044 T0325.try24 262 0.5830 1.7608 1.7750 3.1475 3.0642 3.3798 3.5444 0.4223 -5.5699 0.2614 0.2362 -0.1277 0.5801 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3284 -0.4562 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 225.8530 T0325.try9-opt2.pdb 262 0.5690 1.7608 1.7750 3.0762 2.9976 3.3450 3.5338 0.4351 -5.2640 0.2614 0.2362 -0.1277 0.3081 0.1298 0.2012 0.2531 0.1940 0.1995 1.3318 -0.4712 -0.3383 -0.0823 -0.0680 0.0000 0.0000 218.8071