# cost function cost = # ( 15 * wet6.5(6.5, /log(length)) + 5 * near_backbone(9.65) + 5 * way_back(8.9) + 15 * dry5(5) + 20 * dry6.5(6.5) + 15 * dry8(8) + 5 * dry12(12) + 2 * phobic_fit + 5 * sidechain + 5 * n_ca_c + 10 * bad_peptide + 5 * bystroff + 20 * soft_clashes + 2 * backbone_clashes + 75 * break + 2 * pred_alpha2k + 2 * pred_alpha04 + 2 * pred_alpha06 + 20 * constraints + 5 * hbond_geom + 10 * hbond_geom_backbone + 50 * hbond_geom_beta + 100 * hbond_geom_beta_pair + 1 * missing_atoms + 0.5 * maybe_metal ) name length wet6.5 near_backbone way_back dry5 dry6.5 dry8 dry12 phobic_fit sidechain n_ca_c bad_peptide bystroff soft_clashes backbone_clashes break pred_alpha2k pred_alpha04 pred_alpha06 constraints hbond_geom hbond_geom_backbone hbond_geom_beta hbond_geom_beta_pair missing_atoms maybe_metal cost 10S 5N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N 10N T0325.try16 262 0.5799 1.7668 1.7815 3.1181 3.0215 3.3796 3.5372 0.4632 -5.5862 0.2717 0.2251 -0.1224 0.5970 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3604 -0.4724 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 179.0813 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5623 1.7668 1.7815 3.0509 2.9958 3.3364 3.5244 0.4415 -4.9305 0.2717 0.2251 -0.1224 0.3357 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3902 -0.5019 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 173.8494 T0325.try16-opt1-scwrl 262 0.5803 1.7786 1.7865 3.1175 3.0140 3.3631 3.5322 0.4427 -5.5815 0.2636 0.2170 -0.1231 0.5725 0.1107 0.1332 0.2417 0.1967 0.1982 -0.3631 -0.4683 -0.3493 -0.0888 -0.0687 0.0000 0.0000 176.0547 T0325.try16-opt1 262 0.5685 1.7774 1.7859 3.0474 2.9805 3.3253 3.5209 0.4181 -4.9986 0.2638 0.2172 -0.1255 0.3421 0.1107 0.1332 0.2393 0.1966 0.1958 -0.3849 -0.5059 -0.3493 -0.0888 -0.0687 0.0000 0.0000 171.1338 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5815 1.7737 1.7874 3.1159 3.0184 3.3705 3.5306 0.4535 -5.5831 0.2726 0.2202 -0.1157 0.6034 0.1260 0.1422 0.2537 0.2060 0.2046 -0.3610 -0.4708 -0.3518 -0.0878 -0.0677 0.0000 0.0000 177.8841 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5657 1.7722 1.7875 3.0461 2.9859 3.3264 3.5216 0.4313 -4.9583 0.2726 0.2202 -0.1195 0.3586 0.1260 0.1422 0.2379 0.1950 0.1919 -0.3897 -0.4983 -0.3518 -0.0878 -0.0677 0.0000 0.0000 172.6109 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5777 1.7578 1.7814 3.1202 3.0282 3.3868 3.5391 0.4620 -5.5788 0.3044 0.2276 -0.1251 0.6340 0.1336 0.1237 0.2380 0.1981 0.1955 -0.3408 -0.4659 -0.3478 -0.0876 -0.0672 0.0000 0.0000 178.1909 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5665 1.7578 1.7816 3.0485 2.9936 3.3362 3.5266 0.4528 -4.9111 0.3044 0.2276 -0.1283 0.3689 0.1336 0.1237 0.2389 0.1990 0.1964 -0.3706 -0.4958 -0.3478 -0.0876 -0.0673 0.0000 0.0000 172.6944 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5811 1.7711 1.7761 3.1231 3.0179 3.3697 3.5314 0.4603 -5.5149 0.2664 0.2258 -0.1095 0.6033 0.1107 0.1519 0.2494 0.2048 0.2017 -0.3632 -0.4731 -0.3476 -0.0890 -0.0684 0.0000 0.0000 178.8495 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5648 1.7718 1.7763 3.0433 2.9914 3.3270 3.5199 0.4376 -4.8927 0.2660 0.2257 -0.1091 0.3384 0.1107 0.1519 0.2253 0.1838 0.1806 -0.3930 -0.4931 -0.3476 -0.0890 -0.0684 0.0000 0.0000 173.1197 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5820 1.7684 1.7829 3.1294 3.0226 3.3772 3.5371 0.4602 -5.5740 0.2756 0.2218 -0.1195 0.5924 0.1107 0.1441 0.2385 0.1958 0.1927 -0.3608 -0.4731 -0.3477 -0.0887 -0.0680 0.0000 0.0000 178.1075 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5679 1.7684 1.7829 3.0526 2.9880 3.3345 3.5241 0.4414 -4.9628 0.2757 0.2218 -0.1195 0.3280 0.1107 0.1441 0.2384 0.1957 0.1925 -0.3824 -0.5010 -0.3477 -0.0887 -0.0680 0.0000 0.0000 172.5061 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5806 1.7663 1.7843 3.1224 3.0200 3.3755 3.5342 0.4500 -5.5794 0.2712 0.2243 -0.1200 0.5938 0.1145 0.1543 0.2290 0.1879 0.1844 -0.3631 -0.4690 -0.3520 -0.0890 -0.0683 0.0000 0.0000 178.4814 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5637 1.7666 1.7838 3.0553 2.9952 3.3318 3.5233 0.4294 -4.9485 0.2713 0.2244 -0.1200 0.3461 0.1145 0.1544 0.2289 0.1878 0.1843 -0.3935 -0.5037 -0.3520 -0.0891 -0.0683 0.0000 0.0000 173.3935 T0325.try16 262 0.5799 1.7668 1.7815 3.1181 3.0215 3.3796 3.5372 0.4632 -5.5862 0.2717 0.2251 -0.1224 0.5970 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3604 -0.4724 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 179.0813 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5623 1.7668 1.7815 3.0509 2.9958 3.3364 3.5244 0.4415 -4.9305 0.2717 0.2251 -0.1224 0.3357 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3902 -0.5019 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 173.8494 T0325.try16-opt1-scwrl 262 0.5803 1.7786 1.7865 3.1175 3.0140 3.3631 3.5322 0.4427 -5.5815 0.2636 0.2170 -0.1231 0.5725 0.1107 0.1332 0.2417 0.1967 0.1982 -0.3631 -0.4683 -0.3493 -0.0888 -0.0687 0.0000 0.0000 176.0547 T0325.try16-opt1 262 0.5685 1.7774 1.7859 3.0474 2.9805 3.3253 3.5209 0.4181 -4.9986 0.2638 0.2172 -0.1255 0.3421 0.1107 0.1332 0.2393 0.1966 0.1958 -0.3849 -0.5059 -0.3493 -0.0888 -0.0687 0.0000 0.0000 171.1338 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5815 1.7737 1.7874 3.1159 3.0184 3.3705 3.5306 0.4535 -5.5831 0.2726 0.2202 -0.1157 0.6034 0.1260 0.1422 0.2537 0.2060 0.2046 -0.3610 -0.4708 -0.3518 -0.0878 -0.0677 0.0000 0.0000 177.8841 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5657 1.7722 1.7875 3.0461 2.9859 3.3264 3.5216 0.4313 -4.9583 0.2726 0.2202 -0.1195 0.3586 0.1260 0.1422 0.2379 0.1950 0.1919 -0.3897 -0.4983 -0.3518 -0.0878 -0.0677 0.0000 0.0000 172.6109 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5777 1.7578 1.7814 3.1202 3.0282 3.3868 3.5391 0.4620 -5.5788 0.3044 0.2276 -0.1251 0.6340 0.1336 0.1237 0.2380 0.1981 0.1955 -0.3408 -0.4659 -0.3478 -0.0876 -0.0672 0.0000 0.0000 178.1909 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5665 1.7578 1.7816 3.0485 2.9936 3.3362 3.5266 0.4528 -4.9111 0.3044 0.2276 -0.1283 0.3689 0.1336 0.1237 0.2389 0.1990 0.1964 -0.3706 -0.4958 -0.3478 -0.0876 -0.0673 0.0000 0.0000 172.6944 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5811 1.7711 1.7761 3.1231 3.0179 3.3697 3.5314 0.4603 -5.5149 0.2664 0.2258 -0.1095 0.6033 0.1107 0.1519 0.2494 0.2048 0.2017 -0.3632 -0.4731 -0.3476 -0.0890 -0.0684 0.0000 0.0000 178.8495 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5648 1.7718 1.7763 3.0433 2.9914 3.3270 3.5199 0.4376 -4.8927 0.2660 0.2257 -0.1091 0.3384 0.1107 0.1519 0.2253 0.1838 0.1806 -0.3930 -0.4931 -0.3476 -0.0890 -0.0684 0.0000 0.0000 173.1197 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5820 1.7684 1.7829 3.1294 3.0226 3.3772 3.5371 0.4602 -5.5740 0.2756 0.2218 -0.1195 0.5924 0.1107 0.1441 0.2385 0.1958 0.1927 -0.3608 -0.4731 -0.3477 -0.0887 -0.0680 0.0000 0.0000 178.1075 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5679 1.7684 1.7829 3.0526 2.9880 3.3345 3.5241 0.4414 -4.9628 0.2757 0.2218 -0.1195 0.3280 0.1107 0.1441 0.2384 0.1957 0.1925 -0.3824 -0.5010 -0.3477 -0.0887 -0.0680 0.0000 0.0000 172.5061 T0325.try16-opt2.pdb-scwrl 262 0.5806 1.7663 1.7843 3.1224 3.0200 3.3755 3.5342 0.4500 -5.5794 0.2712 0.2243 -0.1200 0.5938 0.1145 0.1543 0.2290 0.1879 0.1844 -0.3631 -0.4690 -0.3520 -0.0890 -0.0683 0.0000 0.0000 178.4814 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5637 1.7666 1.7838 3.0553 2.9952 3.3318 3.5233 0.4294 -4.9485 0.2713 0.2244 -0.1200 0.3461 0.1145 0.1544 0.2289 0.1878 0.1843 -0.3935 -0.5037 -0.3520 -0.0891 -0.0683 0.0000 0.0000 173.3935 T0325.try16 262 0.5799 1.7668 1.7815 3.1181 3.0215 3.3796 3.5372 0.4632 -5.5862 0.2717 0.2251 -0.1224 0.5970 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3604 -0.4724 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 179.0813 T0325.try16-opt2.pdb 262 0.5623 1.7668 1.7815 3.0509 2.9958 3.3364 3.5244 0.4415 -4.9305 0.2717 0.2251 -0.1224 0.3357 0.1069 0.1589 0.2415 0.2006 0.1974 -0.3902 -0.5019 -0.3486 -0.0886 -0.0679 0.0000 0.0000 173.8494