# TARGET T0325 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0325.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 107.445 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.444 0.119 0.057 0.100 0.067 0.057 0.054 0.032 0.032 0.022 0.017 2 S 0.391 0.130 0.038 0.080 0.062 0.062 0.082 0.051 0.047 0.032 0.025 3 N 0.198 0.260 0.109 0.216 0.112 0.053 0.029 0.011 0.007 0.003 0.001 4 K 0.040 0.062 0.034 0.111 0.148 0.161 0.195 0.112 0.078 0.040 0.019 5 K 0.011 0.034 0.041 0.204 0.239 0.208 0.152 0.057 0.033 0.015 0.007 6 L 0.002 0.002 0.003 0.008 0.009 0.015 0.080 0.171 0.286 0.262 0.163 7 I 0.005 0.009 0.012 0.065 0.095 0.127 0.226 0.176 0.148 0.088 0.049 8 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.032 0.096 0.240 0.326 0.295 9 N 0.003 0.008 0.009 0.049 0.063 0.085 0.203 0.195 0.192 0.117 0.076 10 A 0.005 0.006 0.004 0.008 0.010 0.020 0.065 0.126 0.212 0.272 0.273 11 D 0.013 0.036 0.032 0.134 0.135 0.140 0.199 0.120 0.101 0.057 0.032 12 D 0.018 0.023 0.016 0.055 0.071 0.099 0.165 0.157 0.165 0.131 0.100 13 F 0.025 0.032 0.013 0.063 0.067 0.077 0.130 0.125 0.165 0.165 0.138 14 G 0.046 0.037 0.017 0.053 0.062 0.080 0.132 0.131 0.161 0.141 0.140 15 Y 0.045 0.048 0.021 0.067 0.071 0.088 0.144 0.114 0.144 0.134 0.123 16 T 0.036 0.075 0.031 0.099 0.108 0.111 0.142 0.111 0.116 0.093 0.079 17 P 0.403 0.144 0.064 0.152 0.096 0.062 0.039 0.015 0.012 0.007 0.005 18 A 0.260 0.119 0.058 0.117 0.100 0.092 0.105 0.060 0.045 0.027 0.017 19 V 0.008 0.014 0.010 0.032 0.047 0.079 0.150 0.140 0.204 0.174 0.141 20 T 0.009 0.018 0.017 0.051 0.065 0.098 0.199 0.143 0.160 0.128 0.111 21 Q 0.039 0.070 0.118 0.259 0.203 0.133 0.088 0.039 0.026 0.016 0.008 22 G 0.002 0.006 0.009 0.026 0.045 0.082 0.196 0.186 0.204 0.152 0.093 23 I 0.001 0.001 0.003 0.007 0.008 0.010 0.046 0.092 0.224 0.274 0.335 24 I 0.002 0.004 0.033 0.050 0.071 0.120 0.228 0.152 0.155 0.122 0.063 25 E 0.002 0.016 0.109 0.249 0.246 0.181 0.117 0.043 0.023 0.010 0.004 26 A 0.001 0.001 0.006 0.005 0.006 0.014 0.073 0.123 0.241 0.263 0.267 27 H 0.001 0.002 0.005 0.022 0.041 0.070 0.166 0.187 0.218 0.181 0.108 28 K 0.007 0.043 0.169 0.236 0.218 0.160 0.110 0.032 0.016 0.006 0.003 29 R 0.020 0.053 0.081 0.255 0.214 0.188 0.129 0.037 0.015 0.007 0.003 30 G 0.219 0.132 0.050 0.126 0.092 0.093 0.121 0.069 0.051 0.031 0.016 31 V 0.013 0.047 0.032 0.164 0.187 0.161 0.188 0.086 0.061 0.036 0.024 32 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.026 0.074 0.217 0.288 0.383 33 T 0.009 0.044 0.038 0.191 0.206 0.188 0.189 0.073 0.039 0.014 0.009 34 S 0.003 0.003 0.002 0.007 0.009 0.019 0.081 0.159 0.245 0.252 0.221 35 T 0.003 0.002 0.002 0.007 0.011 0.024 0.081 0.135 0.228 0.240 0.267 36 T 0.003 0.003 0.003 0.008 0.010 0.021 0.090 0.141 0.232 0.234 0.256 37 A 0.002 0.003 0.002 0.007 0.008 0.015 0.063 0.124 0.231 0.282 0.263 38 L 0.003 0.004 0.004 0.012 0.015 0.028 0.083 0.136 0.220 0.229 0.267 39 P 0.009 0.008 0.005 0.013 0.016 0.028 0.078 0.122 0.213 0.238 0.271 40 T 0.007 0.019 0.010 0.039 0.058 0.088 0.181 0.161 0.190 0.149 0.099 41 S 0.014 0.019 0.009 0.038 0.059 0.097 0.162 0.158 0.186 0.145 0.113 42 P 0.243 0.079 0.040 0.086 0.082 0.079 0.114 0.080 0.082 0.063 0.052 43 Y 0.006 0.022 0.011 0.046 0.078 0.128 0.194 0.154 0.162 0.122 0.077 44 F 0.002 0.004 0.005 0.011 0.018 0.033 0.079 0.110 0.219 0.254 0.264 45 L 0.096 0.052 0.068 0.168 0.177 0.156 0.133 0.057 0.047 0.028 0.018 46 E 0.025 0.061 0.194 0.255 0.180 0.127 0.094 0.032 0.019 0.009 0.004 47 A 0.001 0.002 0.008 0.010 0.009 0.015 0.060 0.094 0.206 0.259 0.337 48 M 0.001 0.001 0.006 0.008 0.016 0.043 0.142 0.163 0.220 0.221 0.180 49 E 0.006 0.018 0.480 0.206 0.126 0.073 0.052 0.018 0.013 0.007 0.003 50 S 0.002 0.011 0.075 0.079 0.127 0.210 0.273 0.103 0.064 0.037 0.018 51 A 0.004 0.004 0.008 0.009 0.009 0.016 0.065 0.107 0.228 0.276 0.274 52 R 0.070 0.082 0.079 0.123 0.125 0.138 0.167 0.081 0.067 0.041 0.028 53 I 0.031 0.057 0.148 0.121 0.102 0.110 0.140 0.095 0.092 0.063 0.042 54 S 0.339 0.212 0.085 0.149 0.086 0.056 0.041 0.013 0.009 0.005 0.005 55 A 0.142 0.065 0.024 0.068 0.065 0.080 0.136 0.109 0.116 0.103 0.094 56 P 0.229 0.165 0.063 0.151 0.111 0.093 0.084 0.038 0.031 0.020 0.015 57 T 0.236 0.170 0.080 0.179 0.130 0.086 0.058 0.024 0.018 0.011 0.008 58 L 0.004 0.006 0.005 0.023 0.038 0.067 0.171 0.176 0.211 0.172 0.128 59 A 0.026 0.065 0.054 0.183 0.203 0.174 0.145 0.067 0.044 0.023 0.015 60 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.011 0.065 0.134 0.256 0.267 0.255 61 G 0.003 0.005 0.005 0.025 0.042 0.073 0.170 0.170 0.187 0.165 0.153 62 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.032 0.103 0.260 0.317 0.280 63 H 0.001 0.002 0.002 0.011 0.021 0.045 0.141 0.182 0.229 0.191 0.176 64 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.023 0.072 0.194 0.327 0.375 65 T 0.001 0.004 0.004 0.037 0.070 0.110 0.240 0.213 0.181 0.096 0.045 66 L 0.001 0.002 0.002 0.007 0.010 0.021 0.068 0.138 0.233 0.270 0.248 67 T 0.006 0.023 0.016 0.108 0.156 0.160 0.202 0.130 0.110 0.060 0.029 68 L 0.013 0.024 0.014 0.092 0.117 0.148 0.201 0.145 0.126 0.078 0.043 69 N 0.233 0.174 0.059 0.205 0.145 0.082 0.055 0.023 0.014 0.007 0.003 70 Q 0.214 0.139 0.055 0.170 0.119 0.097 0.095 0.045 0.034 0.018 0.012 71 A 0.231 0.114 0.044 0.111 0.092 0.083 0.102 0.070 0.065 0.051 0.037 72 K 0.041 0.140 0.057 0.214 0.184 0.149 0.121 0.047 0.030 0.013 0.005 73 P 0.011 0.010 0.006 0.018 0.025 0.039 0.094 0.127 0.224 0.234 0.212 74 I 0.018 0.024 0.018 0.069 0.089 0.115 0.207 0.142 0.141 0.096 0.080 75 L 0.010 0.018 0.013 0.042 0.059 0.079 0.167 0.167 0.192 0.149 0.104 76 P 0.139 0.270 0.085 0.200 0.122 0.070 0.054 0.025 0.018 0.010 0.007 77 R 0.194 0.089 0.049 0.164 0.162 0.132 0.113 0.047 0.028 0.014 0.006 78 E 0.529 0.183 0.058 0.116 0.055 0.025 0.017 0.007 0.005 0.003 0.002 79 M 0.039 0.072 0.044 0.167 0.168 0.177 0.175 0.073 0.048 0.023 0.013 80 V 0.005 0.006 0.005 0.014 0.024 0.049 0.134 0.170 0.219 0.199 0.176 81 P 0.140 0.177 0.138 0.175 0.131 0.102 0.079 0.027 0.017 0.009 0.005 82 S 0.097 0.114 0.086 0.202 0.140 0.107 0.109 0.052 0.045 0.031 0.018 83 L 0.005 0.004 0.003 0.012 0.019 0.033 0.090 0.130 0.213 0.243 0.249 84 V 0.011 0.022 0.019 0.062 0.088 0.114 0.183 0.146 0.152 0.110 0.092 85 D 0.030 0.082 0.073 0.175 0.163 0.144 0.148 0.082 0.058 0.031 0.015 86 E 0.399 0.127 0.082 0.138 0.090 0.064 0.051 0.022 0.014 0.009 0.005 87 A 0.323 0.167 0.055 0.154 0.098 0.069 0.062 0.029 0.022 0.013 0.008 88 G 0.060 0.039 0.018 0.054 0.055 0.076 0.144 0.135 0.175 0.145 0.099 89 Y 0.023 0.078 0.051 0.175 0.176 0.166 0.167 0.075 0.053 0.026 0.011 90 F 0.013 0.014 0.016 0.022 0.025 0.035 0.087 0.131 0.222 0.230 0.205 91 W 0.021 0.032 0.030 0.113 0.146 0.161 0.193 0.118 0.095 0.058 0.033 92 H 0.053 0.084 0.060 0.139 0.125 0.115 0.145 0.103 0.094 0.056 0.025 93 Q 0.078 0.079 0.068 0.171 0.165 0.142 0.136 0.071 0.053 0.026 0.010 94 S 0.218 0.093 0.074 0.111 0.085 0.084 0.115 0.076 0.073 0.047 0.025 95 I 0.061 0.069 0.057 0.133 0.124 0.134 0.176 0.104 0.082 0.042 0.017 96 F 0.039 0.031 0.042 0.053 0.057 0.079 0.166 0.154 0.173 0.125 0.081 97 E 0.040 0.069 0.091 0.172 0.192 0.165 0.135 0.061 0.046 0.020 0.010 98 E 0.263 0.141 0.172 0.145 0.092 0.070 0.061 0.024 0.018 0.010 0.005 99 K 0.122 0.092 0.074 0.176 0.142 0.132 0.140 0.062 0.036 0.016 0.007 100 V 0.018 0.015 0.012 0.023 0.035 0.058 0.171 0.213 0.216 0.151 0.086 101 N 0.031 0.582 0.116 0.144 0.060 0.032 0.019 0.007 0.005 0.002 0.001 102 L 0.026 0.022 0.030 0.104 0.217 0.256 0.208 0.079 0.040 0.014 0.004 103 E 0.877 0.080 0.023 0.014 0.004 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 104 E 0.001 0.016 0.053 0.351 0.274 0.181 0.097 0.020 0.005 0.001 0.001 105 V 0.001 0.001 0.009 0.004 0.004 0.009 0.059 0.110 0.231 0.295 0.278 106 Y 0.001 0.005 0.148 0.197 0.251 0.258 0.115 0.018 0.005 0.001 0.001 107 N 0.003 0.023 0.767 0.131 0.045 0.021 0.009 0.002 0.001 0.001 0.001 108 E 0.001 0.001 0.011 0.014 0.038 0.125 0.383 0.199 0.136 0.065 0.026 109 W 0.001 0.001 0.008 0.002 0.003 0.011 0.148 0.203 0.282 0.230 0.112 110 D 0.001 0.008 0.370 0.291 0.186 0.095 0.039 0.006 0.002 0.001 0.001 111 A 0.001 0.017 0.299 0.201 0.199 0.163 0.088 0.022 0.009 0.002 0.001 112 Q 0.001 0.001 0.004 0.002 0.004 0.013 0.105 0.152 0.324 0.254 0.141 113 I 0.001 0.001 0.006 0.004 0.010 0.035 0.223 0.201 0.218 0.181 0.122 114 I 0.001 0.008 0.583 0.231 0.105 0.043 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 115 S 0.001 0.004 0.035 0.083 0.164 0.242 0.304 0.096 0.044 0.020 0.007 116 F 0.001 0.001 0.007 0.002 0.002 0.003 0.024 0.060 0.220 0.342 0.339 117 M 0.001 0.002 0.014 0.054 0.145 0.230 0.323 0.130 0.064 0.027 0.012 118 K 0.009 0.052 0.583 0.200 0.092 0.042 0.015 0.004 0.002 0.001 0.001 119 S 0.005 0.014 0.013 0.055 0.096 0.199 0.349 0.140 0.074 0.040 0.016 120 G 0.675 0.155 0.032 0.052 0.021 0.015 0.018 0.010 0.009 0.007 0.007 121 R 0.070 0.075 0.026 0.092 0.103 0.128 0.188 0.125 0.096 0.059 0.037 122 R 0.153 0.251 0.099 0.215 0.141 0.075 0.039 0.013 0.009 0.004 0.002 123 P 0.007 0.003 0.001 0.005 0.007 0.016 0.052 0.097 0.215 0.251 0.346 124 D 0.070 0.120 0.064 0.191 0.175 0.128 0.120 0.063 0.039 0.018 0.012 125 H 0.013 0.024 0.012 0.050 0.061 0.093 0.188 0.182 0.177 0.123 0.077 126 I 0.004 0.003 0.002 0.007 0.010 0.018 0.060 0.100 0.207 0.274 0.315 127 D 0.005 0.014 0.012 0.050 0.061 0.083 0.172 0.164 0.184 0.140 0.115 128 S 0.005 0.007 0.005 0.016 0.019 0.026 0.082 0.144 0.244 0.251 0.201 129 H 0.003 0.008 0.005 0.037 0.068 0.110 0.189 0.162 0.170 0.141 0.106 130 H 0.009 0.015 0.012 0.055 0.069 0.095 0.164 0.167 0.190 0.145 0.080 131 N 0.007 0.014 0.010 0.069 0.113 0.144 0.212 0.160 0.138 0.086 0.045 132 V 0.005 0.010 0.008 0.024 0.029 0.042 0.090 0.137 0.234 0.235 0.185 133 H 0.018 0.021 0.012 0.087 0.139 0.168 0.213 0.141 0.118 0.058 0.024 134 G 0.248 0.181 0.078 0.180 0.108 0.077 0.061 0.029 0.021 0.011 0.006 135 K 0.116 0.147 0.063 0.187 0.161 0.127 0.109 0.045 0.028 0.012 0.005 136 N 0.062 0.069 0.018 0.077 0.099 0.128 0.184 0.127 0.113 0.075 0.049 137 K 0.194 0.130 0.063 0.165 0.143 0.120 0.097 0.040 0.026 0.014 0.008 138 K 0.068 0.124 0.074 0.221 0.194 0.143 0.105 0.039 0.019 0.008 0.004 139 L 0.001 0.002 0.003 0.007 0.009 0.018 0.077 0.129 0.275 0.272 0.208 140 L 0.001 0.004 0.006 0.034 0.064 0.108 0.223 0.179 0.180 0.126 0.074 141 G 0.064 0.097 0.268 0.265 0.153 0.077 0.045 0.014 0.009 0.005 0.003 142 V 0.001 0.001 0.002 0.011 0.026 0.059 0.216 0.227 0.204 0.161 0.092 143 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.014 0.055 0.212 0.337 0.378 144 L 0.001 0.001 0.012 0.035 0.083 0.199 0.320 0.139 0.113 0.065 0.032 145 A 0.001 0.011 0.255 0.199 0.175 0.144 0.116 0.045 0.029 0.015 0.008 146 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.027 0.171 0.198 0.237 0.200 0.155 147 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.026 0.077 0.217 0.341 0.331 148 R 0.003 0.022 0.151 0.299 0.280 0.148 0.070 0.016 0.007 0.002 0.001 149 K 0.020 0.069 0.330 0.207 0.162 0.126 0.063 0.014 0.006 0.002 0.001 150 Y 0.002 0.003 0.003 0.016 0.030 0.084 0.308 0.237 0.174 0.102 0.041 151 Q 0.430 0.276 0.071 0.132 0.054 0.022 0.011 0.003 0.001 0.001 0.001 152 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.011 0.049 0.102 0.233 0.285 0.308 153 P 0.202 0.275 0.091 0.196 0.105 0.064 0.040 0.013 0.008 0.004 0.003 154 L 0.014 0.018 0.008 0.033 0.041 0.068 0.155 0.169 0.210 0.164 0.119 155 R 0.038 0.043 0.025 0.086 0.103 0.126 0.182 0.127 0.121 0.086 0.064 156 N 0.065 0.083 0.038 0.136 0.136 0.132 0.154 0.099 0.080 0.050 0.028 157 A 0.058 0.037 0.020 0.050 0.057 0.073 0.136 0.133 0.164 0.148 0.124 158 S 0.163 0.158 0.087 0.168 0.113 0.084 0.088 0.050 0.044 0.027 0.017 159 R 0.131 0.096 0.052 0.145 0.131 0.122 0.136 0.075 0.059 0.037 0.016 160 S 0.170 0.150 0.068 0.148 0.104 0.081 0.094 0.062 0.060 0.038 0.024 161 I 0.125 0.059 0.045 0.079 0.087 0.100 0.148 0.108 0.112 0.085 0.054 162 E 0.198 0.221 0.083 0.151 0.101 0.078 0.073 0.036 0.030 0.019 0.011 163 T 0.107 0.139 0.060 0.128 0.113 0.101 0.120 0.084 0.075 0.047 0.026 164 K 0.419 0.131 0.083 0.131 0.092 0.058 0.044 0.018 0.013 0.008 0.004 165 D 0.264 0.218 0.105 0.179 0.093 0.055 0.043 0.018 0.014 0.007 0.003 166 Y 0.020 0.016 0.017 0.041 0.057 0.102 0.191 0.173 0.184 0.125 0.075 167 L 0.043 0.035 0.055 0.105 0.123 0.146 0.200 0.119 0.093 0.055 0.027 168 E 0.065 0.131 0.380 0.195 0.112 0.057 0.032 0.012 0.009 0.004 0.002 169 L 0.008 0.012 0.025 0.056 0.073 0.127 0.223 0.151 0.146 0.109 0.072 170 Y 0.026 0.023 0.023 0.056 0.069 0.091 0.161 0.157 0.163 0.131 0.099 171 Q 0.079 0.093 0.162 0.153 0.125 0.107 0.131 0.063 0.048 0.027 0.013 172 D 0.234 0.143 0.102 0.184 0.130 0.089 0.065 0.025 0.017 0.009 0.004 173 V 0.018 0.011 0.005 0.018 0.018 0.027 0.078 0.115 0.204 0.239 0.267 174 R 0.093 0.143 0.065 0.174 0.157 0.125 0.119 0.056 0.039 0.020 0.011 175 T 0.027 0.043 0.024 0.049 0.051 0.063 0.121 0.133 0.193 0.166 0.129 176 P 0.031 0.038 0.017 0.062 0.083 0.106 0.161 0.139 0.155 0.116 0.092 177 D 0.110 0.079 0.051 0.159 0.147 0.126 0.136 0.077 0.063 0.035 0.018 178 E 0.047 0.059 0.055 0.176 0.159 0.140 0.166 0.088 0.059 0.034 0.018 179 M 0.011 0.007 0.011 0.019 0.019 0.030 0.088 0.132 0.233 0.240 0.211 180 L 0.008 0.015 0.023 0.055 0.062 0.094 0.194 0.164 0.181 0.131 0.074 181 Y 0.012 0.033 0.102 0.116 0.114 0.117 0.155 0.113 0.119 0.079 0.039 182 Q 0.020 0.042 0.073 0.135 0.151 0.158 0.190 0.099 0.074 0.040 0.019 183 F 0.016 0.017 0.014 0.045 0.056 0.084 0.178 0.178 0.198 0.140 0.075 184 Y 0.020 0.026 0.025 0.052 0.067 0.095 0.185 0.155 0.171 0.124 0.080 185 D 0.068 0.115 0.091 0.170 0.156 0.127 0.121 0.063 0.051 0.025 0.013 186 K 0.390 0.131 0.079 0.135 0.091 0.065 0.056 0.023 0.017 0.009 0.004 187 A 0.239 0.102 0.043 0.117 0.097 0.094 0.122 0.076 0.057 0.033 0.019 188 I 0.007 0.008 0.005 0.019 0.033 0.059 0.160 0.198 0.217 0.177 0.118 189 S 0.025 0.541 0.086 0.144 0.075 0.048 0.037 0.018 0.014 0.008 0.005 190 T 0.071 0.040 0.038 0.144 0.252 0.230 0.137 0.049 0.026 0.010 0.003 191 E 0.850 0.073 0.025 0.027 0.011 0.005 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 192 T 0.001 0.009 0.018 0.149 0.184 0.220 0.244 0.104 0.048 0.018 0.007 193 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.010 0.056 0.118 0.242 0.289 0.279 194 L 0.002 0.007 0.189 0.222 0.244 0.200 0.098 0.023 0.010 0.004 0.001 195 Q 0.001 0.015 0.367 0.235 0.163 0.112 0.072 0.018 0.011 0.005 0.001 196 L 0.001 0.001 0.002 0.003 0.005 0.013 0.078 0.127 0.237 0.273 0.263 197 L 0.001 0.001 0.004 0.005 0.012 0.036 0.186 0.226 0.256 0.191 0.084 198 D 0.004 0.026 0.482 0.241 0.130 0.062 0.034 0.011 0.007 0.003 0.001 199 M 0.002 0.008 0.043 0.046 0.082 0.181 0.332 0.143 0.092 0.050 0.020 200 V 0.005 0.004 0.007 0.010 0.011 0.021 0.087 0.132 0.237 0.266 0.220 201 V 0.024 0.048 0.059 0.101 0.112 0.134 0.196 0.110 0.098 0.069 0.048 202 C 0.016 0.038 0.088 0.137 0.116 0.124 0.153 0.104 0.104 0.073 0.047 203 S 0.085 0.082 0.040 0.097 0.093 0.111 0.169 0.105 0.096 0.068 0.053 204 E 0.385 0.154 0.065 0.133 0.089 0.061 0.052 0.022 0.017 0.011 0.009 205 G 0.237 0.161 0.067 0.158 0.117 0.083 0.078 0.038 0.031 0.019 0.011 206 E 0.058 0.095 0.063 0.192 0.205 0.157 0.121 0.050 0.034 0.016 0.008 207 V 0.001 0.002 0.002 0.008 0.016 0.032 0.102 0.183 0.258 0.222 0.175 208 F 0.001 0.001 0.001 0.007 0.018 0.046 0.166 0.212 0.234 0.174 0.139 209 E 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.059 0.129 0.234 0.268 0.292 210 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.032 0.095 0.219 0.312 0.332 211 N 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.009 0.044 0.104 0.226 0.279 0.330 212 C 0.001 0.001 0.001 0.004 0.007 0.015 0.059 0.125 0.232 0.285 0.270 213 H 0.001 0.002 0.002 0.013 0.026 0.052 0.159 0.209 0.248 0.179 0.110 214 P 0.005 0.008 0.005 0.020 0.030 0.053 0.122 0.157 0.209 0.203 0.188 215 A 0.010 0.010 0.006 0.026 0.041 0.064 0.135 0.157 0.217 0.204 0.130 216 F 0.012 0.019 0.010 0.061 0.096 0.134 0.193 0.156 0.160 0.104 0.056 217 I 0.007 0.012 0.006 0.024 0.037 0.057 0.105 0.129 0.209 0.224 0.190 218 D 0.020 0.043 0.022 0.100 0.133 0.161 0.191 0.125 0.112 0.060 0.033 219 T 0.372 0.152 0.084 0.143 0.079 0.054 0.051 0.025 0.020 0.013 0.007 220 I 0.114 0.080 0.049 0.115 0.097 0.099 0.143 0.098 0.095 0.067 0.043 221 L 0.019 0.016 0.015 0.035 0.039 0.059 0.124 0.135 0.195 0.186 0.178 222 Q 0.042 0.063 0.085 0.179 0.187 0.152 0.137 0.069 0.047 0.027 0.013 223 N 0.116 0.156 0.291 0.183 0.099 0.065 0.043 0.019 0.014 0.008 0.004 224 Q 0.098 0.072 0.061 0.138 0.135 0.147 0.161 0.078 0.057 0.036 0.018 225 S 0.229 0.122 0.036 0.078 0.062 0.064 0.093 0.083 0.097 0.078 0.058 226 G 0.228 0.111 0.049 0.087 0.081 0.076 0.103 0.076 0.087 0.062 0.041 227 Y 0.094 0.081 0.031 0.089 0.100 0.117 0.163 0.109 0.109 0.070 0.037 228 C 0.085 0.081 0.031 0.098 0.096 0.102 0.136 0.115 0.119 0.080 0.057 229 M 0.166 0.092 0.057 0.130 0.130 0.111 0.127 0.074 0.058 0.035 0.019 230 P 0.138 0.211 0.103 0.183 0.120 0.090 0.072 0.036 0.026 0.013 0.006 231 R 0.020 0.022 0.025 0.058 0.075 0.106 0.184 0.158 0.167 0.117 0.068 232 I 0.069 0.048 0.069 0.132 0.134 0.143 0.178 0.090 0.075 0.042 0.020 233 R 0.027 0.078 0.222 0.279 0.174 0.105 0.069 0.024 0.013 0.006 0.002 234 E 0.007 0.008 0.023 0.030 0.036 0.066 0.182 0.180 0.206 0.156 0.107 235 V 0.005 0.008 0.039 0.050 0.056 0.090 0.208 0.166 0.178 0.126 0.075 236 E 0.013 0.043 0.340 0.214 0.146 0.103 0.080 0.028 0.019 0.010 0.003 237 I 0.004 0.017 0.072 0.095 0.112 0.148 0.246 0.127 0.101 0.055 0.024 238 L 0.002 0.003 0.008 0.007 0.009 0.018 0.080 0.134 0.251 0.263 0.226 239 T 0.008 0.068 0.071 0.121 0.143 0.156 0.199 0.094 0.072 0.044 0.024 240 S 0.012 0.078 0.086 0.143 0.183 0.187 0.178 0.072 0.041 0.015 0.005 241 Q 0.814 0.079 0.048 0.037 0.013 0.005 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 242 E 0.134 0.139 0.108 0.278 0.172 0.086 0.055 0.016 0.007 0.003 0.002 243 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.009 0.056 0.120 0.265 0.285 0.261 244 K 0.001 0.002 0.015 0.116 0.241 0.329 0.194 0.055 0.031 0.013 0.004 245 E 0.030 0.053 0.814 0.071 0.020 0.007 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 246 A 0.001 0.001 0.006 0.028 0.075 0.219 0.414 0.147 0.069 0.027 0.013 247 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.016 0.052 0.172 0.327 0.430 248 E 0.003 0.023 0.361 0.329 0.206 0.061 0.016 0.002 0.001 0.001 0.001 249 E 0.008 0.036 0.751 0.117 0.052 0.024 0.008 0.001 0.001 0.001 0.001 250 R 0.003 0.004 0.002 0.017 0.042 0.154 0.431 0.189 0.096 0.046 0.015 251 G 0.494 0.239 0.067 0.126 0.045 0.017 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 252 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.008 0.038 0.079 0.197 0.283 0.387 253 L 0.045 0.260 0.122 0.272 0.151 0.092 0.040 0.010 0.005 0.002 0.001 254 L 0.005 0.011 0.007 0.029 0.035 0.062 0.170 0.174 0.214 0.156 0.137 255 A 0.040 0.031 0.022 0.073 0.107 0.128 0.194 0.129 0.113 0.084 0.078 256 N 0.063 0.250 0.098 0.321 0.154 0.063 0.034 0.009 0.005 0.002 0.001 257 Y 0.013 0.010 0.005 0.017 0.021 0.032 0.086 0.121 0.207 0.226 0.263 258 E 0.257 0.235 0.121 0.216 0.102 0.041 0.019 0.005 0.003 0.001 0.001 259 S 0.129 0.187 0.107 0.241 0.140 0.091 0.066 0.021 0.011 0.005 0.002 260 L 0.055 0.032 0.024 0.050 0.046 0.060 0.118 0.123 0.172 0.170 0.151 261 A 0.248 0.225 0.069 0.122 0.095 0.087 0.073 0.033 0.025 0.014 0.008 262 M 0.335 0.164 0.104 0.122 0.077 0.059 0.054 0.029 0.027 0.018 0.011