# TARGET T0320 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0320.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 22 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 N 0.061 0.005 0.007 0.002 0.337 0.425 0.163 2 E 0.191 0.009 0.001 0.001 0.365 0.009 0.425 3 P 0.385 0.116 0.001 0.002 0.037 0.004 0.455 4 I 0.754 0.051 0.003 0.002 0.018 0.005 0.168 5 C 0.775 0.010 0.013 0.004 0.040 0.010 0.148 6 G 0.751 0.013 0.016 0.006 0.031 0.010 0.173 7 L 0.719 0.011 0.026 0.012 0.032 0.042 0.159 8 Y 0.606 0.027 0.042 0.015 0.074 0.123 0.115 9 G 0.445 0.013 0.042 0.019 0.130 0.157 0.194 10 K 0.118 0.014 0.029 0.019 0.163 0.527 0.130 11 G 0.177 0.024 0.015 0.007 0.127 0.496 0.154 12 F 0.471 0.031 0.006 0.002 0.103 0.026 0.362 13 T 0.608 0.048 0.006 0.002 0.058 0.013 0.265 14 S 0.479 0.055 0.025 0.007 0.096 0.060 0.279 15 I 0.249 0.021 0.051 0.015 0.156 0.239 0.269 16 G 0.116 0.013 0.057 0.013 0.279 0.280 0.242 17 G 0.114 0.049 0.053 0.012 0.212 0.120 0.440 18 I 0.088 0.072 0.077 0.024 0.198 0.263 0.279 19 N 0.060 0.058 0.078 0.021 0.226 0.275 0.283 20 N 0.039 0.035 0.072 0.023 0.225 0.243 0.363 21 S 0.028 0.056 0.059 0.046 0.257 0.276 0.277 22 L 0.026 0.031 0.024 0.028 0.413 0.108 0.370 23 P 0.016 0.022 0.024 0.020 0.330 0.109 0.479 24 N 0.019 0.038 0.036 0.039 0.179 0.055 0.633 25 P 0.017 0.012 0.332 0.115 0.063 0.213 0.248 26 H 0.040 0.009 0.378 0.097 0.056 0.216 0.204 27 L 0.065 0.043 0.382 0.115 0.101 0.080 0.215 28 R 0.117 0.125 0.097 0.129 0.135 0.053 0.344 29 K 0.077 0.035 0.043 0.083 0.165 0.092 0.504 30 D 0.045 0.024 0.036 0.043 0.173 0.142 0.537 31 S 0.027 0.016 0.057 0.084 0.176 0.283 0.357 32 N 0.018 0.010 0.061 0.080 0.219 0.366 0.246 33 N 0.021 0.010 0.073 0.094 0.310 0.178 0.313 34 P 0.030 0.018 0.060 0.102 0.290 0.138 0.362 35 A 0.068 0.036 0.065 0.194 0.132 0.150 0.355 36 L 0.078 0.045 0.055 0.208 0.107 0.121 0.387 37 H 0.071 0.021 0.045 0.227 0.128 0.107 0.402 38 F 0.076 0.015 0.052 0.399 0.109 0.150 0.200 39 E 0.085 0.008 0.041 0.491 0.077 0.127 0.172 40 W 0.117 0.012 0.030 0.511 0.061 0.055 0.214 41 E 0.163 0.011 0.026 0.564 0.045 0.039 0.151 42 I 0.148 0.014 0.037 0.615 0.041 0.045 0.101 43 I 0.134 0.007 0.041 0.657 0.032 0.038 0.092 44 H 0.118 0.007 0.044 0.658 0.035 0.049 0.088 45 A 0.091 0.005 0.041 0.652 0.046 0.067 0.098 46 F 0.077 0.007 0.037 0.616 0.056 0.083 0.123 47 G 0.081 0.008 0.037 0.555 0.060 0.113 0.146 48 K 0.084 0.007 0.056 0.462 0.083 0.154 0.154 49 D 0.093 0.014 0.060 0.474 0.092 0.111 0.156 50 A 0.092 0.017 0.064 0.443 0.094 0.106 0.184 51 E 0.109 0.016 0.066 0.379 0.085 0.169 0.175 52 G 0.065 0.014 0.069 0.284 0.135 0.234 0.199 53 E 0.046 0.012 0.052 0.181 0.226 0.189 0.294 54 R 0.037 0.016 0.040 0.123 0.204 0.218 0.363 55 S 0.032 0.025 0.046 0.098 0.225 0.184 0.391 56 S 0.024 0.013 0.059 0.088 0.230 0.188 0.398 57 A 0.026 0.018 0.107 0.141 0.177 0.258 0.275 58 I 0.041 0.023 0.117 0.162 0.185 0.205 0.267 59 N 0.060 0.017 0.083 0.137 0.187 0.196 0.319 60 T 0.083 0.023 0.049 0.174 0.170 0.138 0.363 61 S 0.117 0.031 0.026 0.128 0.179 0.063 0.456 62 P 0.131 0.028 0.019 0.095 0.051 0.058 0.616 63 I 0.069 0.018 0.021 0.094 0.036 0.024 0.737 64 S 0.134 0.025 0.047 0.199 0.044 0.072 0.479 65 V 0.064 0.011 0.085 0.268 0.103 0.192 0.276 66 V 0.064 0.009 0.085 0.268 0.126 0.201 0.247 67 D 0.082 0.007 0.071 0.318 0.152 0.188 0.182 68 K 0.114 0.011 0.054 0.330 0.135 0.161 0.195 69 E 0.176 0.025 0.039 0.314 0.139 0.066 0.241 70 R 0.180 0.048 0.050 0.328 0.062 0.100 0.233 71 F 0.192 0.026 0.075 0.279 0.069 0.157 0.202 72 S 0.107 0.014 0.098 0.222 0.105 0.273 0.181 73 K 0.070 0.012 0.055 0.139 0.187 0.247 0.289 74 Y 0.050 0.014 0.047 0.092 0.223 0.177 0.397 75 H 0.040 0.013 0.073 0.037 0.238 0.187 0.413 76 D 0.022 0.003 0.092 0.031 0.254 0.495 0.103 77 N 0.053 0.008 0.090 0.023 0.206 0.423 0.198 78 Y 0.248 0.038 0.013 0.015 0.204 0.025 0.457 79 Y 0.383 0.033 0.006 0.008 0.065 0.011 0.495 80 P 0.669 0.030 0.018 0.021 0.034 0.015 0.213 81 G 0.741 0.005 0.041 0.039 0.029 0.028 0.116 82 W 0.773 0.004 0.058 0.048 0.021 0.039 0.057 83 Y 0.853 0.008 0.022 0.031 0.012 0.023 0.051 84 L 0.664 0.037 0.020 0.039 0.041 0.043 0.156 85 V 0.345 0.018 0.010 0.032 0.216 0.045 0.334 86 D 0.099 0.011 0.021 0.059 0.297 0.094 0.420 87 D 0.041 0.008 0.066 0.260 0.206 0.234 0.185 88 T 0.031 0.007 0.060 0.496 0.129 0.186 0.091 89 L 0.032 0.007 0.052 0.661 0.091 0.054 0.103 90 E 0.030 0.006 0.052 0.671 0.066 0.070 0.104 91 R 0.030 0.008 0.061 0.594 0.046 0.131 0.130 92 A 0.029 0.008 0.046 0.333 0.095 0.284 0.205 93 G 0.036 0.008 0.045 0.164 0.112 0.442 0.193 94 R 0.081 0.021 0.040 0.074 0.185 0.082 0.517 95 I 0.104 0.060 0.049 0.095 0.146 0.041 0.504 96 K 0.063 0.031 0.023 0.083 0.015 0.079 0.706 97 N 0.001 0.001 0.001 0.005 0.002 0.002 0.990