# TARGET T0316 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-str2-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 13 (1 str2 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0316.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 2608 # Pos AA A B C E G H M P Q S T Y Z 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.003 0.012 0.839 0.004 0.002 0.006 0.001 0.001 0.002 0.014 0.005 0.008 0.104 2 S 0.009 0.026 0.688 0.006 0.010 0.015 0.002 0.001 0.004 0.026 0.021 0.132 0.061 3 D 0.014 0.034 0.386 0.009 0.027 0.019 0.003 0.001 0.005 0.125 0.070 0.032 0.275 4 N 0.003 0.011 0.519 0.017 0.050 0.021 0.001 0.001 0.003 0.118 0.135 0.076 0.045 5 S 0.001 0.003 0.272 0.013 0.040 0.007 0.001 0.001 0.003 0.212 0.419 0.011 0.019 6 K 0.002 0.003 0.285 0.012 0.015 0.001 0.001 0.001 0.009 0.361 0.281 0.013 0.017 7 T 0.009 0.007 0.428 0.006 0.003 0.001 0.008 0.002 0.069 0.342 0.036 0.045 0.044 8 R 0.025 0.004 0.282 0.013 0.001 0.001 0.054 0.040 0.386 0.075 0.003 0.029 0.089 9 V 0.051 0.001 0.056 0.011 0.001 0.001 0.204 0.361 0.258 0.003 0.001 0.025 0.031 10 V 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.162 0.734 0.068 0.001 0.001 0.003 0.003 11 V 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.113 0.841 0.029 0.001 0.001 0.001 0.001 12 G 0.027 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.107 0.811 0.050 0.001 0.001 0.002 0.002 13 M 0.037 0.001 0.036 0.005 0.001 0.001 0.087 0.521 0.281 0.001 0.001 0.011 0.019 14 S 0.011 0.004 0.328 0.016 0.001 0.001 0.015 0.055 0.394 0.076 0.009 0.051 0.041 15 G 0.001 0.009 0.335 0.005 0.007 0.004 0.001 0.001 0.046 0.473 0.095 0.004 0.020 16 G 0.001 0.012 0.325 0.001 0.014 0.036 0.001 0.001 0.009 0.465 0.129 0.004 0.004 17 V 0.001 0.025 0.318 0.001 0.019 0.373 0.001 0.001 0.004 0.161 0.093 0.002 0.005 18 D 0.001 0.009 0.180 0.001 0.010 0.692 0.001 0.001 0.001 0.060 0.042 0.001 0.003 19 S 0.001 0.001 0.010 0.001 0.002 0.975 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.001 0.001 20 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 21 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 22 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 23 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 24 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 25 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 26 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 27 K 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.986 0.001 0.001 0.001 0.001 0.013 0.001 0.001 28 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.899 0.001 0.001 0.001 0.001 0.098 0.001 0.001 29 Q 0.001 0.001 0.006 0.001 0.003 0.260 0.001 0.001 0.001 0.015 0.715 0.001 0.001 30 G 0.001 0.001 0.048 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 0.001 0.044 0.896 0.001 0.001 31 Y 0.001 0.005 0.765 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.025 0.192 0.003 0.003 0.003 32 D 0.001 0.009 0.431 0.003 0.001 0.001 0.005 0.002 0.490 0.035 0.001 0.006 0.015 33 V 0.002 0.004 0.141 0.002 0.001 0.001 0.022 0.053 0.750 0.003 0.001 0.005 0.018 34 I 0.003 0.001 0.051 0.058 0.001 0.001 0.048 0.199 0.621 0.005 0.001 0.013 0.003 35 G 0.005 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.076 0.580 0.331 0.001 0.001 0.001 0.004 36 I 0.010 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.071 0.736 0.178 0.001 0.001 0.003 0.001 37 F 0.016 0.001 0.009 0.001 0.001 0.001 0.092 0.443 0.425 0.001 0.001 0.004 0.011 38 M 0.014 0.001 0.103 0.006 0.001 0.001 0.028 0.107 0.681 0.004 0.001 0.036 0.018 39 K 0.008 0.007 0.338 0.013 0.002 0.001 0.009 0.018 0.435 0.073 0.007 0.025 0.064 40 N 0.002 0.029 0.537 0.029 0.015 0.001 0.002 0.002 0.064 0.172 0.054 0.034 0.059 41 W 0.001 0.028 0.466 0.023 0.027 0.003 0.001 0.001 0.013 0.240 0.147 0.011 0.038 42 D 0.001 0.023 0.429 0.007 0.034 0.007 0.001 0.001 0.008 0.276 0.153 0.036 0.024 43 D 0.002 0.020 0.193 0.004 0.049 0.013 0.001 0.001 0.002 0.288 0.391 0.007 0.031 44 T 0.003 0.040 0.282 0.002 0.032 0.015 0.001 0.001 0.003 0.287 0.292 0.025 0.016 45 D 0.001 0.021 0.372 0.002 0.031 0.013 0.001 0.001 0.002 0.335 0.191 0.013 0.018 46 E 0.002 0.009 0.137 0.002 0.045 0.017 0.001 0.001 0.002 0.263 0.503 0.004 0.016 47 N 0.006 0.032 0.152 0.005 0.056 0.034 0.002 0.001 0.004 0.260 0.395 0.032 0.022 48 G 0.009 0.027 0.348 0.005 0.034 0.027 0.002 0.001 0.005 0.324 0.145 0.026 0.047 49 V 0.013 0.081 0.503 0.006 0.014 0.028 0.005 0.001 0.011 0.169 0.042 0.041 0.086 50 C 0.008 0.110 0.557 0.006 0.012 0.023 0.003 0.001 0.008 0.112 0.035 0.033 0.093 51 T 0.002 0.027 0.696 0.003 0.016 0.026 0.001 0.001 0.004 0.127 0.058 0.015 0.024 52 A 0.001 0.010 0.709 0.001 0.020 0.045 0.001 0.001 0.002 0.145 0.049 0.004 0.014 53 T 0.001 0.003 0.144 0.001 0.141 0.499 0.001 0.001 0.001 0.074 0.135 0.001 0.002 54 E 0.001 0.003 0.066 0.001 0.190 0.533 0.001 0.001 0.001 0.057 0.150 0.001 0.001 55 D 0.001 0.004 0.080 0.001 0.147 0.632 0.001 0.001 0.001 0.039 0.095 0.001 0.002 56 Y 0.001 0.001 0.027 0.001 0.030 0.899 0.001 0.001 0.001 0.011 0.030 0.001 0.001 57 K 0.001 0.001 0.015 0.001 0.011 0.936 0.001 0.001 0.001 0.011 0.025 0.001 0.001 58 D 0.001 0.001 0.010 0.001 0.004 0.965 0.001 0.001 0.001 0.005 0.016 0.001 0.001 59 V 0.001 0.001 0.006 0.001 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 60 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 61 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 62 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 63 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 64 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.001 0.001 0.001 0.007 0.001 0.001 65 Q 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.964 0.001 0.001 0.001 0.001 0.034 0.001 0.001 66 I 0.001 0.001 0.009 0.001 0.003 0.438 0.001 0.001 0.001 0.025 0.523 0.001 0.001 67 G 0.001 0.002 0.065 0.003 0.002 0.002 0.001 0.001 0.001 0.043 0.882 0.001 0.001 68 I 0.001 0.003 0.911 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.066 0.001 0.005 0.002 69 P 0.001 0.005 0.627 0.016 0.001 0.001 0.001 0.001 0.311 0.023 0.001 0.004 0.011 70 Y 0.001 0.004 0.041 0.009 0.001 0.001 0.019 0.029 0.874 0.005 0.001 0.002 0.017 71 Y 0.001 0.001 0.010 0.002 0.001 0.001 0.022 0.072 0.869 0.002 0.001 0.021 0.001 72 S 0.002 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.044 0.151 0.765 0.001 0.001 0.001 0.028 73 V 0.002 0.002 0.019 0.001 0.001 0.001 0.012 0.049 0.861 0.003 0.001 0.048 0.002 74 N 0.001 0.005 0.265 0.001 0.001 0.001 0.002 0.006 0.629 0.014 0.001 0.002 0.074 75 F 0.001 0.022 0.558 0.011 0.020 0.029 0.001 0.002 0.143 0.132 0.050 0.016 0.014 76 E 0.001 0.004 0.435 0.001 0.096 0.242 0.001 0.001 0.014 0.123 0.073 0.002 0.009 77 K 0.001 0.001 0.015 0.001 0.237 0.685 0.001 0.001 0.001 0.023 0.039 0.001 0.001 78 E 0.001 0.002 0.010 0.001 0.187 0.752 0.001 0.001 0.001 0.007 0.041 0.001 0.001 79 Y 0.001 0.002 0.005 0.001 0.168 0.768 0.001 0.001 0.001 0.005 0.049 0.001 0.001 80 W 0.001 0.002 0.011 0.001 0.047 0.899 0.001 0.001 0.001 0.007 0.029 0.001 0.002 81 D 0.001 0.001 0.011 0.001 0.025 0.917 0.001 0.001 0.001 0.008 0.036 0.001 0.001 82 R 0.001 0.001 0.009 0.001 0.014 0.919 0.001 0.001 0.001 0.011 0.043 0.001 0.001 83 V 0.001 0.002 0.022 0.001 0.010 0.917 0.001 0.001 0.003 0.012 0.031 0.001 0.002 84 F 0.001 0.001 0.018 0.001 0.003 0.949 0.001 0.002 0.003 0.006 0.013 0.002 0.002 85 E 0.001 0.001 0.006 0.001 0.002 0.979 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.001 0.001 86 Y 0.001 0.001 0.006 0.001 0.003 0.977 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.001 0.001 87 F 0.001 0.001 0.007 0.001 0.003 0.973 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.001 0.002 88 L 0.003 0.001 0.010 0.002 0.003 0.958 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.003 0.004 89 A 0.003 0.001 0.018 0.001 0.005 0.926 0.001 0.001 0.001 0.007 0.024 0.007 0.005 90 E 0.002 0.001 0.013 0.001 0.005 0.939 0.001 0.001 0.001 0.007 0.027 0.002 0.002 91 Y 0.002 0.004 0.035 0.001 0.008 0.904 0.001 0.001 0.001 0.017 0.021 0.002 0.005 92 R 0.002 0.007 0.031 0.001 0.008 0.861 0.001 0.001 0.002 0.010 0.065 0.005 0.007 93 A 0.001 0.001 0.011 0.001 0.006 0.272 0.001 0.001 0.001 0.014 0.692 0.001 0.001 94 G 0.001 0.001 0.037 0.001 0.004 0.023 0.001 0.001 0.001 0.056 0.877 0.001 0.001 95 R 0.001 0.027 0.524 0.001 0.005 0.011 0.001 0.001 0.005 0.316 0.085 0.007 0.018 96 T 0.001 0.039 0.569 0.002 0.003 0.005 0.001 0.001 0.014 0.289 0.028 0.031 0.019 97 P 0.001 0.043 0.517 0.005 0.007 0.010 0.001 0.001 0.013 0.276 0.070 0.006 0.051 98 N 0.001 0.037 0.664 0.003 0.007 0.011 0.001 0.001 0.008 0.207 0.035 0.016 0.010 99 P 0.001 0.014 0.218 0.001 0.087 0.142 0.001 0.001 0.005 0.208 0.308 0.003 0.013 100 D 0.002 0.014 0.297 0.002 0.103 0.200 0.001 0.001 0.004 0.186 0.172 0.006 0.012 101 V 0.003 0.015 0.158 0.001 0.201 0.273 0.001 0.001 0.002 0.165 0.158 0.013 0.010 102 M 0.003 0.027 0.305 0.001 0.087 0.253 0.001 0.001 0.002 0.063 0.222 0.004 0.032 103 C 0.003 0.028 0.175 0.002 0.043 0.466 0.001 0.001 0.002 0.071 0.195 0.008 0.006 104 N 0.001 0.010 0.350 0.001 0.034 0.413 0.001 0.001 0.001 0.124 0.059 0.002 0.006 105 K 0.001 0.001 0.018 0.001 0.023 0.845 0.001 0.001 0.001 0.024 0.089 0.001 0.001 106 E 0.001 0.001 0.015 0.001 0.010 0.901 0.001 0.001 0.001 0.012 0.060 0.001 0.001 107 I 0.001 0.001 0.015 0.001 0.004 0.961 0.001 0.001 0.001 0.008 0.009 0.001 0.001 108 K 0.001 0.001 0.019 0.001 0.002 0.966 0.001 0.001 0.001 0.003 0.007 0.001 0.001 109 F 0.001 0.001 0.005 0.001 0.001 0.990 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 110 K 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 111 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 112 F 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 113 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 114 D 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 115 Y 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 116 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 117 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.012 0.001 0.001 118 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.945 0.001 0.001 0.001 0.001 0.054 0.001 0.001 119 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.351 0.001 0.001 0.001 0.012 0.634 0.001 0.001 120 G 0.001 0.001 0.052 0.001 0.002 0.008 0.001 0.001 0.001 0.009 0.928 0.001 0.001 121 A 0.001 0.001 0.975 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.009 0.011 0.001 0.001 0.002 122 D 0.001 0.001 0.207 0.106 0.004 0.001 0.001 0.002 0.030 0.639 0.002 0.006 0.001 123 Y 0.002 0.001 0.006 0.002 0.001 0.001 0.039 0.465 0.471 0.003 0.002 0.001 0.008 124 V 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.054 0.883 0.057 0.001 0.001 0.001 0.001 125 A 0.003 0.001 0.004 0.001 0.001 0.001 0.032 0.862 0.096 0.001 0.001 0.001 0.001 126 T 0.010 0.001 0.046 0.005 0.001 0.002 0.026 0.538 0.349 0.005 0.002 0.009 0.006 127 G 0.012 0.004 0.317 0.007 0.012 0.022 0.016 0.059 0.340 0.104 0.048 0.016 0.044 128 H 0.024 0.014 0.238 0.021 0.050 0.058 0.016 0.014 0.171 0.176 0.103 0.053 0.063 129 Y 0.014 0.024 0.294 0.023 0.064 0.074 0.008 0.008 0.090 0.150 0.124 0.058 0.070 130 A 0.034 0.017 0.332 0.013 0.068 0.065 0.011 0.009 0.037 0.159 0.101 0.036 0.119 131 R 0.053 0.025 0.237 0.007 0.051 0.083 0.013 0.009 0.048 0.153 0.073 0.180 0.069 132 V 0.023 0.051 0.330 0.018 0.038 0.088 0.007 0.004 0.031 0.117 0.079 0.033 0.182 133 A 0.007 0.026 0.376 0.030 0.029 0.139 0.003 0.002 0.013 0.152 0.125 0.048 0.052 134 R 0.005 0.012 0.274 0.014 0.048 0.128 0.001 0.001 0.006 0.188 0.262 0.032 0.028 135 D 0.008 0.010 0.213 0.004 0.126 0.216 0.001 0.001 0.008 0.125 0.218 0.011 0.059 136 E 0.023 0.019 0.136 0.014 0.144 0.262 0.005 0.005 0.014 0.104 0.195 0.041 0.039 137 D 0.023 0.014 0.135 0.008 0.091 0.256 0.005 0.004 0.018 0.113 0.243 0.042 0.049 138 G 0.041 0.011 0.212 0.009 0.044 0.170 0.007 0.004 0.015 0.197 0.194 0.023 0.072 139 T 0.059 0.026 0.263 0.004 0.021 0.194 0.009 0.006 0.026 0.096 0.053 0.179 0.065 140 V 0.041 0.019 0.118 0.003 0.091 0.426 0.005 0.002 0.013 0.038 0.088 0.024 0.131 141 H 0.053 0.011 0.125 0.011 0.136 0.299 0.006 0.002 0.011 0.048 0.178 0.079 0.042 142 M 0.062 0.023 0.096 0.010 0.162 0.241 0.007 0.002 0.009 0.068 0.220 0.023 0.077 143 L 0.019 0.016 0.250 0.012 0.113 0.168 0.003 0.001 0.007 0.147 0.187 0.036 0.043 144 R 0.007 0.013 0.184 0.006 0.093 0.126 0.001 0.001 0.002 0.151 0.362 0.016 0.037 145 G 0.007 0.017 0.267 0.004 0.100 0.122 0.001 0.001 0.002 0.135 0.305 0.014 0.025 146 V 0.003 0.029 0.386 0.002 0.114 0.147 0.001 0.001 0.004 0.128 0.151 0.011 0.024 147 D 0.002 0.020 0.239 0.003 0.146 0.151 0.001 0.001 0.002 0.115 0.295 0.012 0.014 148 N 0.001 0.013 0.119 0.003 0.110 0.115 0.001 0.001 0.002 0.130 0.492 0.004 0.010 149 G 0.001 0.010 0.395 0.002 0.050 0.063 0.001 0.001 0.003 0.232 0.230 0.006 0.008 150 K 0.001 0.015 0.369 0.003 0.036 0.098 0.001 0.001 0.004 0.300 0.158 0.008 0.008 151 D 0.002 0.020 0.307 0.002 0.062 0.187 0.001 0.001 0.007 0.130 0.254 0.005 0.021 152 Q 0.003 0.019 0.245 0.005 0.104 0.374 0.001 0.003 0.018 0.105 0.089 0.017 0.016 153 T 0.006 0.024 0.209 0.009 0.139 0.394 0.002 0.002 0.020 0.070 0.080 0.011 0.034 154 Y 0.007 0.011 0.104 0.004 0.172 0.477 0.003 0.004 0.020 0.065 0.095 0.019 0.019 155 F 0.009 0.020 0.113 0.002 0.155 0.478 0.003 0.004 0.024 0.045 0.099 0.021 0.026 156 L 0.013 0.015 0.138 0.004 0.197 0.384 0.002 0.002 0.009 0.052 0.127 0.012 0.045 157 S 0.015 0.011 0.102 0.009 0.155 0.277 0.002 0.001 0.004 0.086 0.292 0.023 0.021 158 Q 0.013 0.010 0.131 0.002 0.117 0.222 0.002 0.001 0.004 0.097 0.365 0.010 0.030 159 L 0.003 0.021 0.442 0.001 0.013 0.081 0.001 0.001 0.003 0.340 0.056 0.024 0.015 160 S 0.001 0.010 0.785 0.001 0.010 0.089 0.001 0.001 0.001 0.059 0.023 0.003 0.019 161 Q 0.001 0.001 0.011 0.001 0.123 0.781 0.001 0.001 0.001 0.013 0.070 0.001 0.001 162 E 0.001 0.001 0.012 0.001 0.154 0.711 0.001 0.001 0.001 0.012 0.108 0.001 0.001 163 Q 0.001 0.001 0.011 0.001 0.187 0.689 0.001 0.001 0.001 0.009 0.100 0.001 0.002 164 L 0.001 0.005 0.114 0.005 0.058 0.651 0.001 0.001 0.003 0.056 0.095 0.004 0.008 165 Q 0.004 0.004 0.224 0.011 0.050 0.395 0.002 0.001 0.016 0.120 0.129 0.019 0.026 166 K 0.019 0.014 0.237 0.010 0.032 0.277 0.008 0.005 0.051 0.117 0.113 0.030 0.087 167 T 0.038 0.046 0.217 0.006 0.027 0.201 0.029 0.013 0.103 0.054 0.069 0.064 0.133 168 M 0.024 0.055 0.226 0.033 0.042 0.186 0.023 0.014 0.110 0.077 0.069 0.039 0.102 169 F 0.006 0.010 0.268 0.016 0.064 0.113 0.004 0.003 0.055 0.216 0.068 0.141 0.037 170 P 0.004 0.015 0.271 0.005 0.200 0.135 0.002 0.003 0.043 0.071 0.133 0.008 0.110 171 L 0.005 0.012 0.205 0.007 0.326 0.112 0.002 0.003 0.017 0.063 0.216 0.009 0.025 172 G 0.004 0.007 0.144 0.007 0.268 0.067 0.001 0.001 0.010 0.163 0.303 0.010 0.016 173 H 0.003 0.010 0.258 0.005 0.161 0.047 0.001 0.001 0.008 0.180 0.296 0.008 0.023 174 L 0.001 0.024 0.648 0.001 0.005 0.007 0.001 0.001 0.003 0.268 0.019 0.017 0.008 175 E 0.001 0.009 0.931 0.001 0.001 0.008 0.001 0.001 0.001 0.033 0.004 0.001 0.013 176 K 0.001 0.001 0.009 0.001 0.007 0.972 0.001 0.001 0.001 0.005 0.007 0.001 0.001 177 P 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.994 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 178 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.996 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 179 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 180 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 181 R 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 182 L 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 183 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 184 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.995 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.001 0.001 185 E 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.969 0.001 0.001 0.001 0.001 0.030 0.001 0.001 186 A 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.382 0.001 0.001 0.001 0.003 0.613 0.001 0.001 187 G 0.001 0.001 0.031 0.001 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.014 0.950 0.001 0.001 188 L 0.001 0.004 0.962 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.031 0.001 0.001 0.001 189 S 0.001 0.019 0.885 0.001 0.003 0.001 0.001 0.001 0.043 0.027 0.003 0.012 0.008 190 T 0.002 0.083 0.285 0.006 0.066 0.005 0.011 0.009 0.297 0.032 0.015 0.008 0.180 191 A 0.002 0.012 0.281 0.092 0.133 0.012 0.010 0.020 0.249 0.056 0.024 0.076 0.033 192 K 0.003 0.008 0.295 0.008 0.144 0.029 0.006 0.010 0.268 0.092 0.023 0.021 0.094 193 K 0.001 0.026 0.445 0.015 0.026 0.036 0.002 0.004 0.185 0.134 0.024 0.027 0.074 194 K 0.001 0.017 0.467 0.033 0.023 0.033 0.001 0.003 0.030 0.160 0.194 0.018 0.021 195 D 0.001 0.019 0.455 0.010 0.015 0.021 0.001 0.003 0.025 0.238 0.181 0.012 0.020 196 S 0.002 0.023 0.532 0.005 0.041 0.028 0.001 0.001 0.012 0.197 0.108 0.014 0.036 197 T 0.003 0.017 0.229 0.004 0.056 0.042 0.001 0.001 0.007 0.223 0.372 0.021 0.022 198 G 0.008 0.020 0.257 0.006 0.068 0.040 0.002 0.001 0.008 0.235 0.293 0.015 0.046 199 I 0.017 0.025 0.445 0.007 0.046 0.052 0.003 0.001 0.012 0.191 0.071 0.078 0.052 200 C 0.035 0.045 0.391 0.007 0.036 0.070 0.008 0.002 0.016 0.083 0.093 0.045 0.169 201 F 0.057 0.036 0.266 0.013 0.054 0.138 0.010 0.004 0.015 0.095 0.166 0.053 0.094 202 I 0.041 0.033 0.247 0.005 0.042 0.165 0.007 0.002 0.013 0.118 0.175 0.087 0.066 203 G 0.016 0.009 0.298 0.003 0.044 0.183 0.002 0.001 0.005 0.154 0.186 0.028 0.070 204 E 0.016 0.006 0.222 0.007 0.049 0.369 0.002 0.001 0.004 0.130 0.140 0.018 0.035 205 K 0.018 0.009 0.128 0.002 0.055 0.563 0.002 0.001 0.003 0.068 0.081 0.042 0.028 206 N 0.011 0.013 0.101 0.001 0.056 0.629 0.002 0.001 0.004 0.049 0.069 0.014 0.049 207 F 0.009 0.006 0.090 0.004 0.050 0.732 0.001 0.001 0.003 0.021 0.050 0.016 0.019 208 K 0.006 0.003 0.035 0.002 0.071 0.772 0.001 0.001 0.001 0.024 0.069 0.005 0.013 209 N 0.005 0.003 0.050 0.001 0.074 0.699 0.001 0.001 0.001 0.036 0.110 0.011 0.009 210 F 0.005 0.006 0.038 0.001 0.093 0.712 0.001 0.001 0.001 0.029 0.100 0.003 0.012 211 L 0.002 0.013 0.146 0.002 0.082 0.615 0.001 0.001 0.002 0.060 0.055 0.009 0.014 212 S 0.001 0.003 0.051 0.001 0.355 0.386 0.001 0.001 0.001 0.022 0.171 0.002 0.007 213 N 0.001 0.002 0.048 0.001 0.276 0.356 0.001 0.001 0.001 0.051 0.257 0.003 0.005 214 Y 0.001 0.008 0.095 0.001 0.283 0.330 0.001 0.001 0.001 0.047 0.225 0.001 0.008 215 L 0.001 0.018 0.443 0.002 0.085 0.105 0.001 0.001 0.002 0.244 0.081 0.010 0.009 216 P 0.001 0.007 0.367 0.003 0.129 0.058 0.001 0.001 0.001 0.078 0.344 0.003 0.009 217 A 0.001 0.008 0.354 0.001 0.103 0.053 0.001 0.001 0.002 0.157 0.310 0.002 0.009 218 Q 0.001 0.015 0.575 0.001 0.012 0.014 0.001 0.001 0.002 0.334 0.032 0.009 0.006 219 P 0.001 0.006 0.463 0.010 0.042 0.023 0.001 0.001 0.001 0.159 0.284 0.002 0.010 220 G 0.001 0.004 0.258 0.011 0.077 0.030 0.001 0.001 0.002 0.211 0.383 0.009 0.012 221 R 0.012 0.030 0.448 0.009 0.063 0.033 0.003 0.001 0.024 0.135 0.059 0.084 0.099 222 M 0.048 0.036 0.230 0.009 0.022 0.033 0.014 0.003 0.060 0.026 0.011 0.063 0.445 223 M 0.131 0.025 0.133 0.098 0.009 0.024 0.033 0.005 0.064 0.021 0.010 0.300 0.146 224 T 0.107 0.010 0.166 0.009 0.009 0.020 0.023 0.004 0.056 0.024 0.016 0.156 0.399 225 V 0.093 0.013 0.197 0.027 0.018 0.038 0.021 0.003 0.040 0.059 0.069 0.140 0.283 226 D 0.023 0.011 0.190 0.022 0.016 0.050 0.006 0.002 0.014 0.117 0.314 0.182 0.053 227 G 0.011 0.004 0.270 0.008 0.010 0.017 0.002 0.001 0.005 0.319 0.251 0.012 0.092 228 R 0.018 0.014 0.402 0.002 0.008 0.021 0.004 0.001 0.011 0.217 0.031 0.230 0.042 229 D 0.016 0.078 0.305 0.003 0.016 0.030 0.005 0.001 0.012 0.051 0.022 0.021 0.441 230 M 0.011 0.022 0.330 0.097 0.092 0.110 0.004 0.001 0.006 0.057 0.179 0.050 0.041 231 G 0.011 0.010 0.375 0.019 0.075 0.059 0.002 0.001 0.005 0.130 0.206 0.049 0.057 232 E 0.010 0.014 0.457 0.012 0.073 0.059 0.003 0.001 0.006 0.160 0.089 0.024 0.091 233 H 0.011 0.020 0.330 0.009 0.085 0.107 0.003 0.001 0.007 0.120 0.156 0.076 0.077 234 A 0.010 0.010 0.198 0.035 0.066 0.059 0.002 0.001 0.003 0.235 0.306 0.025 0.050 235 G 0.018 0.010 0.297 0.016 0.034 0.035 0.004 0.001 0.009 0.233 0.160 0.126 0.058 236 L 0.042 0.011 0.396 0.020 0.013 0.025 0.009 0.002 0.016 0.050 0.021 0.030 0.365 237 M 0.154 0.009 0.147 0.039 0.011 0.030 0.032 0.007 0.048 0.042 0.012 0.372 0.096 238 Y 0.270 0.005 0.050 0.012 0.006 0.028 0.064 0.012 0.058 0.012 0.005 0.060 0.417 239 Y 0.326 0.003 0.055 0.033 0.004 0.031 0.066 0.012 0.055 0.012 0.006 0.309 0.087 240 T 0.360 0.005 0.054 0.006 0.003 0.028 0.065 0.011 0.050 0.008 0.006 0.094 0.309 241 I 0.279 0.007 0.105 0.038 0.006 0.047 0.042 0.016 0.049 0.025 0.024 0.162 0.200 242 G 0.205 0.006 0.141 0.013 0.012 0.040 0.018 0.006 0.032 0.061 0.063 0.276 0.127 243 Q 0.155 0.016 0.159 0.014 0.030 0.054 0.015 0.004 0.021 0.095 0.074 0.048 0.315 244 R 0.118 0.026 0.173 0.018 0.057 0.075 0.012 0.004 0.018 0.066 0.138 0.177 0.116 245 G 0.044 0.012 0.127 0.025 0.042 0.040 0.005 0.002 0.006 0.158 0.387 0.066 0.086 246 G 0.035 0.009 0.238 0.028 0.021 0.014 0.004 0.001 0.005 0.208 0.321 0.027 0.089 247 L 0.051 0.025 0.365 0.014 0.014 0.011 0.006 0.001 0.010 0.160 0.046 0.206 0.088 248 G 0.090 0.024 0.277 0.013 0.018 0.011 0.011 0.001 0.018 0.104 0.054 0.102 0.278 249 I 0.230 0.023 0.158 0.034 0.021 0.009 0.025 0.003 0.020 0.056 0.041 0.130 0.250 250 G 0.222 0.013 0.143 0.020 0.016 0.008 0.018 0.003 0.014 0.047 0.048 0.276 0.172 251 G 0.151 0.014 0.203 0.019 0.014 0.006 0.013 0.002 0.020 0.090 0.054 0.092 0.323 252 Q 0.123 0.026 0.224 0.011 0.008 0.006 0.010 0.001 0.015 0.099 0.020 0.274 0.183 253 H 0.056 0.124 0.258 0.008 0.005 0.006 0.007 0.001 0.010 0.103 0.034 0.059 0.331 254 G 0.004 0.021 0.662 0.003 0.013 0.005 0.001 0.001 0.003 0.083 0.122 0.019 0.064 255 G 0.002 0.003 0.140 0.002 0.025 0.006 0.001 0.001 0.001 0.165 0.630 0.013 0.014 256 D 0.001 0.002 0.109 0.001 0.020 0.006 0.001 0.001 0.001 0.135 0.717 0.006 0.004 257 N 0.001 0.003 0.297 0.001 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.559 0.119 0.003 0.008 258 A 0.002 0.034 0.574 0.001 0.003 0.008 0.001 0.001 0.002 0.248 0.021 0.082 0.024 259 P 0.010 0.129 0.309 0.004 0.011 0.022 0.002 0.001 0.003 0.055 0.030 0.006 0.421 260 W 0.054 0.036 0.364 0.128 0.043 0.035 0.006 0.001 0.003 0.029 0.044 0.209 0.049 261 F 0.090 0.029 0.201 0.012 0.077 0.051 0.011 0.001 0.008 0.054 0.048 0.097 0.322 262 R 0.063 0.017 0.290 0.020 0.061 0.039 0.007 0.001 0.009 0.089 0.065 0.166 0.174 263 Y 0.046 0.026 0.311 0.019 0.038 0.029 0.008 0.001 0.007 0.135 0.082 0.107 0.189 264 R 0.031 0.053 0.321 0.015 0.024 0.018 0.006 0.001 0.007 0.223 0.076 0.068 0.156 265 Q 0.001 0.014 0.647 0.021 0.008 0.003 0.001 0.001 0.002 0.195 0.034 0.040 0.034 266 P 0.001 0.006 0.178 0.022 0.029 0.003 0.001 0.001 0.001 0.175 0.572 0.003 0.013 267 D 0.001 0.004 0.216 0.012 0.024 0.001 0.001 0.001 0.001 0.189 0.533 0.008 0.010 268 S 0.008 0.012 0.443 0.007 0.013 0.001 0.003 0.001 0.014 0.318 0.028 0.090 0.064 269 K 0.056 0.006 0.406 0.035 0.002 0.001 0.018 0.001 0.028 0.043 0.008 0.042 0.356 270 V 0.379 0.003 0.048 0.011 0.001 0.001 0.080 0.005 0.027 0.007 0.001 0.288 0.153 271 T 0.579 0.001 0.011 0.003 0.001 0.001 0.056 0.003 0.008 0.001 0.001 0.208 0.131 272 V 0.653 0.001 0.008 0.005 0.001 0.001 0.056 0.001 0.005 0.001 0.001 0.028 0.243 273 H 0.277 0.001 0.016 0.004 0.001 0.001 0.019 0.001 0.006 0.001 0.001 0.629 0.048 274 V 0.086 0.002 0.046 0.004 0.001 0.001 0.010 0.001 0.004 0.008 0.004 0.015 0.821 275 K 0.075 0.015 0.164 0.045 0.006 0.001 0.006 0.001 0.003 0.087 0.085 0.375 0.139 276 G 0.006 0.004 0.045 0.009 0.020 0.001 0.001 0.001 0.001 0.234 0.580 0.046 0.056 277 E 0.005 0.001 0.043 0.010 0.009 0.001 0.001 0.001 0.001 0.237 0.668 0.007 0.021 278 K 0.306 0.002 0.097 0.008 0.003 0.001 0.009 0.001 0.001 0.070 0.064 0.268 0.171 279 T 0.685 0.001 0.011 0.001 0.001 0.001 0.024 0.001 0.001 0.002 0.001 0.066 0.209 280 E 0.763 0.001 0.002 0.001 0.001 0.001 0.034 0.001 0.001 0.001 0.001 0.142 0.058 281 V 0.720 0.001 0.004 0.006 0.001 0.001 0.040 0.001 0.001 0.001 0.001 0.091 0.137 282 I 0.647 0.001 0.011 0.018 0.001 0.001 0.039 0.001 0.001 0.002 0.001 0.114 0.165 283 F 0.309 0.002 0.045 0.019 0.001 0.001 0.032 0.001 0.004 0.012 0.005 0.331 0.240 284 A 0.100 0.007 0.213 0.023 0.003 0.001 0.011 0.001 0.009 0.095 0.020 0.091 0.428 285 E 0.018 0.011 0.388 0.032 0.010 0.003 0.002 0.001 0.008 0.261 0.028 0.145 0.095 286 P 0.008 0.016 0.551 0.019 0.031 0.007 0.002 0.001 0.011 0.100 0.070 0.035 0.148 287 Q 0.015 0.032 0.363 0.024 0.123 0.025 0.006 0.001 0.040 0.077 0.086 0.045 0.162 288 R 0.038 0.017 0.239 0.024 0.062 0.021 0.013 0.005 0.084 0.141 0.055 0.165 0.135 289 A 0.063 0.039 0.186 0.011 0.020 0.009 0.020 0.005 0.064 0.084 0.033 0.098 0.368 290 I 0.031 0.053 0.327 0.023 0.004 0.005 0.009 0.003 0.036 0.104 0.012 0.180 0.213 291 T 0.001 0.014 0.718 0.015 0.001 0.001 0.001 0.001 0.008 0.097 0.004 0.063 0.077 292 P 0.001 0.002 0.012 0.006 0.018 0.006 0.001 0.001 0.001 0.058 0.893 0.001 0.004 293 G 0.003 0.002 0.033 0.012 0.012 0.001 0.001 0.001 0.001 0.088 0.836 0.009 0.004 294 Q 0.042 0.009 0.498 0.026 0.016 0.002 0.006 0.001 0.007 0.178 0.048 0.045 0.124 295 A 0.392 0.008 0.151 0.013 0.003 0.002 0.040 0.006 0.019 0.039 0.011 0.052 0.264 296 V 0.705 0.001 0.007 0.003 0.001 0.001 0.065 0.020 0.006 0.003 0.001 0.148 0.039 297 V 0.828 0.001 0.003 0.001 0.001 0.002 0.059 0.013 0.003 0.001 0.001 0.026 0.063 298 F 0.742 0.001 0.007 0.004 0.001 0.003 0.104 0.006 0.004 0.001 0.001 0.068 0.058 299 Y 0.636 0.002 0.037 0.013 0.001 0.003 0.043 0.003 0.007 0.011 0.011 0.100 0.134 300 D 0.267 0.005 0.172 0.014 0.005 0.007 0.011 0.002 0.012 0.101 0.060 0.160 0.184 301 G 0.054 0.005 0.216 0.010 0.029 0.035 0.003 0.001 0.007 0.237 0.203 0.060 0.140 302 E 0.054 0.009 0.152 0.040 0.117 0.100 0.004 0.001 0.005 0.186 0.175 0.069 0.087 303 E 0.112 0.014 0.083 0.012 0.092 0.131 0.013 0.003 0.012 0.069 0.063 0.197 0.199 304 C 0.170 0.026 0.081 0.023 0.065 0.108 0.026 0.004 0.012 0.032 0.043 0.073 0.337 305 L 0.116 0.018 0.133 0.050 0.053 0.160 0.020 0.011 0.022 0.054 0.134 0.095 0.133 306 G 0.057 0.004 0.098 0.033 0.042 0.137 0.006 0.002 0.006 0.133 0.380 0.044 0.057 307 G 0.066 0.003 0.129 0.047 0.031 0.117 0.009 0.002 0.006 0.205 0.275 0.046 0.065 308 G 0.230 0.007 0.199 0.005 0.011 0.081 0.025 0.006 0.011 0.055 0.036 0.096 0.237 309 L 0.303 0.017 0.088 0.002 0.009 0.121 0.044 0.013 0.022 0.014 0.020 0.244 0.104 310 I 0.238 0.010 0.104 0.009 0.016 0.127 0.043 0.014 0.026 0.019 0.018 0.048 0.328 311 D 0.117 0.003 0.110 0.409 0.023 0.092 0.015 0.005 0.019 0.035 0.023 0.083 0.066 312 N 0.061 0.003 0.124 0.031 0.097 0.204 0.011 0.002 0.017 0.094 0.127 0.082 0.146 313 A 0.052 0.010 0.155 0.012 0.082 0.290 0.012 0.002 0.020 0.060 0.083 0.061 0.162 314 Y 0.026 0.030 0.304 0.024 0.034 0.280 0.008 0.004 0.020 0.061 0.058 0.064 0.087 315 R 0.023 0.010 0.198 0.005 0.047 0.378 0.003 0.002 0.005 0.067 0.158 0.036 0.070 316 D 0.005 0.005 0.103 0.018 0.047 0.188 0.001 0.001 0.002 0.081 0.522 0.014 0.013 317 G 0.004 0.002 0.149 0.009 0.039 0.062 0.001 0.001 0.001 0.185 0.523 0.011 0.014 318 Q 0.016 0.014 0.482 0.004 0.030 0.113 0.003 0.001 0.006 0.104 0.117 0.023 0.087 319 V 0.030 0.031 0.409 0.004 0.036 0.110 0.008 0.002 0.020 0.055 0.030 0.150 0.116 320 C 0.047 0.016 0.264 0.029 0.109 0.162 0.010 0.003 0.022 0.042 0.031 0.039 0.227 321 Q 0.037 0.009 0.212 0.046 0.096 0.153 0.011 0.003 0.029 0.061 0.053 0.228 0.063 322 Y 0.043 0.015 0.207 0.005 0.091 0.135 0.014 0.003 0.047 0.032 0.074 0.029 0.304 323 I 0.015 0.012 0.559 0.035 0.012 0.036 0.005 0.002 0.026 0.071 0.011 0.137 0.076