# TARGET T0305 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0305.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1149 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 Y 0.308 0.174 0.072 0.125 0.084 0.073 0.069 0.036 0.032 0.019 0.009 2 F 0.233 0.085 0.032 0.083 0.083 0.090 0.130 0.101 0.082 0.051 0.030 3 Q 0.312 0.178 0.076 0.113 0.088 0.072 0.084 0.041 0.025 0.010 0.003 4 S 0.089 0.412 0.096 0.169 0.094 0.059 0.040 0.018 0.013 0.006 0.003 5 M 0.032 0.024 0.022 0.068 0.116 0.158 0.211 0.139 0.116 0.074 0.041 6 K 0.339 0.157 0.139 0.187 0.098 0.045 0.024 0.006 0.003 0.001 0.001 7 Q 0.036 0.130 0.288 0.373 0.117 0.038 0.014 0.003 0.001 0.001 0.001 8 F 0.003 0.005 0.011 0.014 0.019 0.045 0.177 0.191 0.239 0.183 0.112 9 V 0.002 0.006 0.044 0.060 0.108 0.205 0.321 0.137 0.075 0.031 0.010 10 K 0.019 0.037 0.822 0.096 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 11 H 0.001 0.009 0.050 0.077 0.137 0.253 0.319 0.089 0.043 0.017 0.005 12 I 0.001 0.001 0.006 0.005 0.005 0.012 0.066 0.116 0.249 0.298 0.241 13 G 0.016 0.035 0.232 0.226 0.206 0.139 0.100 0.027 0.012 0.005 0.002 14 E 0.020 0.063 0.587 0.169 0.084 0.044 0.022 0.007 0.004 0.001 0.001 15 L 0.004 0.007 0.012 0.022 0.038 0.098 0.254 0.176 0.177 0.133 0.080 16 Y 0.024 0.029 0.041 0.074 0.095 0.138 0.258 0.145 0.111 0.060 0.025 17 S 0.077 0.139 0.369 0.161 0.090 0.062 0.051 0.022 0.016 0.008 0.004 18 N 0.274 0.164 0.157 0.153 0.095 0.067 0.050 0.017 0.013 0.007 0.003 19 N 0.331 0.219 0.053 0.099 0.061 0.055 0.062 0.037 0.036 0.027 0.019 20 Q 0.298 0.176 0.076 0.155 0.120 0.076 0.054 0.022 0.013 0.006 0.003 21 H 0.235 0.170 0.109 0.133 0.096 0.078 0.090 0.043 0.030 0.013 0.005 22 G 0.097 0.196 0.097 0.207 0.157 0.109 0.078 0.030 0.018 0.008 0.003 23 F 0.010 0.012 0.012 0.032 0.052 0.082 0.179 0.168 0.198 0.153 0.101 24 S 0.072 0.087 0.108 0.263 0.228 0.132 0.079 0.019 0.008 0.003 0.001 25 E 0.123 0.148 0.304 0.256 0.098 0.042 0.020 0.005 0.002 0.001 0.001 26 D 0.003 0.007 0.018 0.028 0.042 0.090 0.251 0.210 0.181 0.109 0.060 27 F 0.001 0.001 0.007 0.011 0.027 0.074 0.238 0.222 0.208 0.138 0.073 28 E 0.013 0.038 0.583 0.229 0.090 0.030 0.013 0.002 0.001 0.001 0.001 29 E 0.004 0.029 0.169 0.259 0.233 0.173 0.099 0.021 0.009 0.003 0.001 30 V 0.001 0.001 0.004 0.004 0.005 0.012 0.063 0.119 0.251 0.294 0.249 31 Q 0.017 0.034 0.093 0.201 0.231 0.181 0.162 0.050 0.021 0.008 0.002 32 R 0.034 0.098 0.576 0.151 0.072 0.040 0.020 0.005 0.003 0.001 0.001 33 C 0.004 0.012 0.025 0.051 0.086 0.158 0.305 0.149 0.107 0.068 0.035 34 T 0.228 0.303 0.091 0.132 0.077 0.061 0.059 0.023 0.016 0.007 0.003 35 A 0.109 0.062 0.061 0.093 0.087 0.095 0.148 0.101 0.101 0.079 0.061 36 D 0.389 0.276 0.107 0.131 0.054 0.024 0.013 0.004 0.002 0.001 0.001 37 M 0.084 0.056 0.025 0.083 0.095 0.125 0.186 0.124 0.109 0.071 0.041 38 N 0.326 0.270 0.082 0.152 0.079 0.043 0.026 0.010 0.006 0.003 0.002 39 I 0.034 0.031 0.030 0.066 0.094 0.140 0.219 0.142 0.121 0.080 0.041 40 T 0.218 0.359 0.112 0.168 0.072 0.031 0.020 0.008 0.006 0.003 0.002 41 A 0.052 0.037 0.029 0.083 0.107 0.146 0.212 0.130 0.112 0.065 0.029 42 E 0.264 0.220 0.109 0.188 0.102 0.052 0.037 0.013 0.009 0.004 0.002 43 H 0.061 0.083 0.066 0.165 0.147 0.135 0.158 0.086 0.060 0.028 0.010 44 S 0.134 0.061 0.040 0.078 0.084 0.102 0.160 0.121 0.113 0.070 0.037 45 N 0.249 0.234 0.110 0.150 0.099 0.070 0.049 0.019 0.012 0.006 0.003 46 H 0.056 0.088 0.050 0.113 0.120 0.132 0.169 0.110 0.092 0.050 0.020 47 P 0.669 0.134 0.047 0.061 0.033 0.020 0.016 0.008 0.006 0.004 0.002 48 E 0.308 0.166 0.074 0.150 0.113 0.080 0.065 0.024 0.014 0.005 0.002 49 N 0.092 0.050 0.026 0.057 0.057 0.074 0.131 0.138 0.166 0.127 0.081 50 K 0.115 0.103 0.075 0.212 0.187 0.138 0.096 0.038 0.022 0.010 0.004 51 H 0.204 0.197 0.213 0.172 0.094 0.055 0.036 0.014 0.009 0.004 0.002 52 K 0.022 0.038 0.046 0.147 0.150 0.170 0.194 0.099 0.073 0.042 0.019 53 N 0.057 0.042 0.030 0.060 0.064 0.082 0.141 0.144 0.161 0.133 0.086 54 R 0.019 0.042 0.058 0.124 0.143 0.147 0.182 0.108 0.092 0.055 0.030 55 Y 0.019 0.035 0.050 0.088 0.090 0.101 0.165 0.142 0.145 0.105 0.061 56 I 0.061 0.047 0.039 0.133 0.147 0.151 0.169 0.106 0.082 0.044 0.019 57 N 0.086 0.102 0.065 0.168 0.141 0.129 0.140 0.074 0.053 0.027 0.013 58 I 0.011 0.010 0.010 0.023 0.021 0.031 0.088 0.134 0.239 0.246 0.188 59 L 0.038 0.063 0.037 0.090 0.095 0.113 0.184 0.133 0.123 0.076 0.047 60 A 0.025 0.028 0.017 0.033 0.027 0.036 0.087 0.123 0.209 0.216 0.198 61 Y 0.028 0.035 0.023 0.072 0.095 0.122 0.188 0.143 0.136 0.095 0.063 62 D 0.067 0.090 0.044 0.161 0.126 0.108 0.138 0.096 0.086 0.051 0.033 63 H 0.051 0.061 0.036 0.131 0.148 0.150 0.157 0.098 0.079 0.059 0.031 64 S 0.058 0.045 0.032 0.096 0.091 0.096 0.150 0.125 0.145 0.100 0.064 65 R 0.011 0.025 0.020 0.100 0.122 0.144 0.198 0.135 0.114 0.079 0.051 66 V 0.003 0.005 0.005 0.016 0.024 0.041 0.112 0.153 0.231 0.232 0.178 67 K 0.012 0.048 0.044 0.222 0.241 0.168 0.149 0.061 0.034 0.014 0.006 68 L 0.001 0.002 0.002 0.005 0.008 0.016 0.053 0.102 0.206 0.287 0.320 69 R 0.045 0.149 0.099 0.365 0.207 0.076 0.038 0.010 0.005 0.002 0.001 70 P 0.042 0.056 0.028 0.115 0.125 0.138 0.192 0.123 0.096 0.058 0.027 71 L 0.035 0.063 0.043 0.181 0.175 0.146 0.159 0.084 0.060 0.036 0.019 72 P 0.323 0.282 0.055 0.156 0.086 0.045 0.032 0.011 0.006 0.003 0.002 73 G 0.409 0.157 0.051 0.141 0.084 0.057 0.047 0.023 0.015 0.010 0.006 74 K 0.384 0.289 0.063 0.125 0.061 0.031 0.022 0.009 0.007 0.005 0.003 75 D 0.315 0.269 0.073 0.162 0.081 0.048 0.029 0.011 0.007 0.004 0.002 76 S 0.345 0.158 0.046 0.132 0.093 0.071 0.066 0.034 0.027 0.016 0.011 77 K 0.528 0.207 0.080 0.096 0.044 0.022 0.012 0.004 0.003 0.002 0.001 78 H 0.112 0.141 0.075 0.232 0.174 0.118 0.082 0.030 0.021 0.011 0.005 79 S 0.067 0.069 0.039 0.118 0.132 0.129 0.147 0.105 0.098 0.063 0.033 80 D 0.018 0.038 0.041 0.135 0.191 0.189 0.193 0.100 0.059 0.026 0.010 81 Y 0.002 0.005 0.005 0.032 0.060 0.104 0.221 0.199 0.174 0.127 0.070 82 I 0.002 0.002 0.002 0.008 0.013 0.023 0.089 0.158 0.244 0.264 0.196 83 N 0.002 0.003 0.005 0.015 0.025 0.042 0.131 0.173 0.238 0.200 0.167 84 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.005 0.010 0.036 0.082 0.185 0.293 0.380 85 N 0.004 0.006 0.005 0.031 0.056 0.090 0.205 0.209 0.204 0.129 0.062 86 Y 0.009 0.020 0.014 0.068 0.082 0.118 0.208 0.168 0.151 0.098 0.064 87 V 0.005 0.006 0.004 0.012 0.016 0.025 0.069 0.107 0.197 0.258 0.300 88 D 0.078 0.102 0.047 0.209 0.171 0.127 0.121 0.058 0.047 0.024 0.015 89 G 0.047 0.056 0.018 0.068 0.066 0.082 0.132 0.132 0.160 0.139 0.099 90 Y 0.077 0.077 0.032 0.139 0.134 0.129 0.141 0.085 0.084 0.055 0.047 91 N 0.228 0.197 0.053 0.152 0.108 0.088 0.084 0.038 0.028 0.014 0.010 92 K 0.173 0.176 0.079 0.206 0.132 0.091 0.073 0.030 0.020 0.012 0.007 93 A 0.279 0.178 0.078 0.185 0.110 0.066 0.051 0.020 0.017 0.010 0.007 94 K 0.034 0.057 0.059 0.192 0.211 0.163 0.142 0.067 0.045 0.021 0.009 95 A 0.001 0.006 0.010 0.055 0.116 0.175 0.262 0.172 0.119 0.059 0.024 96 Y 0.001 0.001 0.001 0.010 0.024 0.057 0.203 0.224 0.220 0.165 0.094 97 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.013 0.074 0.169 0.251 0.266 0.217 98 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.049 0.109 0.220 0.284 0.319 99 T 0.001 0.001 0.001 0.005 0.008 0.016 0.068 0.127 0.249 0.290 0.233 100 Q 0.001 0.004 0.004 0.028 0.039 0.070 0.195 0.195 0.229 0.154 0.081 101 G 0.007 0.014 0.013 0.038 0.057 0.091 0.174 0.183 0.187 0.139 0.098 102 P 0.018 0.057 0.030 0.100 0.097 0.091 0.150 0.121 0.142 0.106 0.088 103 L 0.009 0.020 0.009 0.056 0.127 0.184 0.248 0.149 0.109 0.059 0.030 104 K 0.381 0.182 0.074 0.197 0.095 0.040 0.021 0.006 0.003 0.001 0.001 105 S 0.327 0.164 0.064 0.171 0.122 0.077 0.045 0.014 0.009 0.005 0.003 106 T 0.010 0.023 0.017 0.039 0.039 0.061 0.123 0.138 0.213 0.187 0.149 107 F 0.014 0.026 0.016 0.054 0.088 0.143 0.249 0.158 0.127 0.080 0.046 108 E 0.332 0.200 0.203 0.162 0.058 0.024 0.012 0.004 0.003 0.002 0.001 109 D 0.037 0.049 0.043 0.144 0.161 0.178 0.209 0.094 0.050 0.024 0.011 110 F 0.007 0.006 0.010 0.021 0.022 0.033 0.084 0.127 0.232 0.234 0.223 111 W 0.002 0.005 0.011 0.027 0.047 0.101 0.226 0.181 0.190 0.135 0.074 112 R 0.002 0.015 0.070 0.172 0.191 0.182 0.166 0.087 0.066 0.034 0.014 113 M 0.001 0.003 0.004 0.010 0.015 0.034 0.114 0.147 0.220 0.239 0.214 114 I 0.003 0.004 0.006 0.021 0.023 0.030 0.086 0.136 0.220 0.258 0.212 115 W 0.004 0.011 0.016 0.047 0.066 0.097 0.184 0.175 0.184 0.131 0.086 116 E 0.011 0.025 0.041 0.141 0.161 0.164 0.169 0.109 0.090 0.053 0.036 117 Q 0.019 0.023 0.021 0.083 0.108 0.156 0.258 0.148 0.105 0.055 0.023 118 N 0.085 0.132 0.065 0.210 0.171 0.136 0.110 0.044 0.031 0.013 0.005 119 T 0.004 0.005 0.004 0.010 0.011 0.017 0.055 0.107 0.239 0.267 0.281 120 G 0.031 0.077 0.046 0.203 0.218 0.173 0.141 0.057 0.033 0.014 0.007 121 I 0.001 0.002 0.002 0.012 0.020 0.045 0.169 0.244 0.252 0.168 0.084 122 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.052 0.118 0.217 0.266 0.326 123 V 0.002 0.002 0.002 0.004 0.007 0.015 0.068 0.122 0.221 0.266 0.293 124 M 0.001 0.002 0.003 0.007 0.011 0.020 0.080 0.141 0.260 0.269 0.207 125 I 0.001 0.003 0.003 0.015 0.022 0.044 0.122 0.159 0.232 0.215 0.183 126 T 0.005 0.012 0.009 0.034 0.051 0.073 0.171 0.194 0.193 0.154 0.103 127 N 0.081 0.125 0.077 0.233 0.190 0.127 0.096 0.036 0.021 0.009 0.004 128 L 0.041 0.061 0.037 0.121 0.134 0.143 0.172 0.101 0.091 0.063 0.037 129 V 0.150 0.157 0.070 0.199 0.156 0.103 0.077 0.033 0.027 0.016 0.011 130 E 0.145 0.077 0.040 0.081 0.078 0.098 0.158 0.104 0.103 0.070 0.047 131 K 0.321 0.199 0.088 0.152 0.085 0.058 0.050 0.021 0.014 0.008 0.004 132 G 0.472 0.209 0.054 0.091 0.054 0.041 0.035 0.016 0.014 0.009 0.006 133 R 0.104 0.109 0.072 0.187 0.170 0.135 0.107 0.047 0.036 0.021 0.011 134 R 0.164 0.153 0.158 0.181 0.122 0.089 0.070 0.028 0.021 0.010 0.004 135 K 0.032 0.066 0.060 0.164 0.167 0.166 0.170 0.084 0.055 0.025 0.011 136 C 0.014 0.014 0.014 0.027 0.034 0.057 0.159 0.173 0.216 0.179 0.113 137 D 0.052 0.065 0.068 0.175 0.188 0.161 0.159 0.066 0.041 0.018 0.006 138 Q 0.066 0.113 0.151 0.276 0.168 0.090 0.070 0.030 0.021 0.011 0.004 139 Y 0.012 0.024 0.018 0.074 0.113 0.154 0.228 0.162 0.130 0.065 0.021 140 W 0.010 0.014 0.010 0.045 0.078 0.124 0.228 0.198 0.169 0.089 0.036 141 P 0.041 0.116 0.059 0.128 0.154 0.157 0.176 0.086 0.053 0.023 0.008 142 T 0.173 0.242 0.098 0.221 0.125 0.070 0.044 0.015 0.008 0.003 0.001 143 E 0.771 0.118 0.025 0.049 0.019 0.009 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 144 N 0.447 0.248 0.067 0.108 0.054 0.032 0.024 0.009 0.006 0.003 0.001 145 S 0.082 0.094 0.047 0.139 0.128 0.154 0.172 0.082 0.059 0.029 0.013 146 E 0.177 0.145 0.098 0.222 0.149 0.102 0.065 0.022 0.012 0.006 0.003 147 E 0.035 0.121 0.198 0.252 0.188 0.116 0.062 0.015 0.008 0.003 0.002 148 Y 0.004 0.008 0.012 0.053 0.078 0.116 0.206 0.175 0.156 0.119 0.075 149 G 0.275 0.155 0.049 0.189 0.131 0.086 0.072 0.024 0.012 0.005 0.003 150 N 0.048 0.137 0.123 0.391 0.201 0.069 0.023 0.004 0.002 0.001 0.001 151 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.010 0.054 0.125 0.269 0.296 0.241 152 I 0.007 0.089 0.068 0.448 0.258 0.091 0.031 0.005 0.002 0.001 0.001 153 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.037 0.110 0.264 0.328 0.253 154 T 0.023 0.120 0.073 0.460 0.234 0.065 0.020 0.004 0.001 0.001 0.001 155 L 0.002 0.003 0.001 0.005 0.009 0.021 0.091 0.153 0.275 0.264 0.175 156 K 0.052 0.154 0.071 0.345 0.208 0.099 0.049 0.013 0.006 0.002 0.001 157 S 0.276 0.237 0.059 0.162 0.096 0.064 0.058 0.024 0.015 0.007 0.003 158 T 0.154 0.123 0.054 0.187 0.140 0.110 0.104 0.056 0.039 0.023 0.011 159 K 0.274 0.285 0.078 0.174 0.096 0.048 0.027 0.009 0.005 0.002 0.001 160 I 0.112 0.078 0.045 0.116 0.101 0.110 0.151 0.101 0.088 0.060 0.038 161 H 0.114 0.139 0.080 0.204 0.168 0.128 0.095 0.037 0.022 0.009 0.004 162 A 0.249 0.143 0.099 0.147 0.101 0.080 0.082 0.040 0.032 0.018 0.009 163 C 0.069 0.088 0.056 0.200 0.168 0.148 0.138 0.059 0.040 0.023 0.010 164 Y 0.024 0.033 0.028 0.066 0.075 0.096 0.160 0.157 0.176 0.124 0.061 165 T 0.038 0.059 0.055 0.215 0.183 0.145 0.157 0.073 0.046 0.020 0.008 166 V 0.006 0.022 0.050 0.122 0.127 0.126 0.161 0.136 0.124 0.083 0.043 167 R 0.006 0.009 0.014 0.054 0.078 0.121 0.263 0.203 0.154 0.072 0.025 168 R 0.007 0.039 0.064 0.361 0.270 0.141 0.077 0.024 0.011 0.004 0.001 169 F 0.001 0.001 0.004 0.005 0.006 0.014 0.061 0.122 0.271 0.305 0.209 170 S 0.006 0.042 0.064 0.394 0.296 0.114 0.062 0.015 0.006 0.002 0.001 171 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.010 0.050 0.124 0.266 0.320 0.223 172 R 0.006 0.052 0.066 0.382 0.283 0.129 0.060 0.014 0.006 0.002 0.001 173 N 0.045 0.052 0.031 0.091 0.109 0.140 0.214 0.135 0.103 0.057 0.023 174 T 0.072 0.116 0.069 0.254 0.174 0.112 0.104 0.050 0.028 0.014 0.006 175 K 0.318 0.267 0.071 0.152 0.087 0.048 0.034 0.012 0.007 0.004 0.002 176 V 0.049 0.034 0.017 0.058 0.054 0.067 0.127 0.129 0.160 0.160 0.144 177 K 0.164 0.267 0.108 0.207 0.118 0.062 0.040 0.015 0.010 0.005 0.003 178 K 0.172 0.145 0.091 0.196 0.124 0.089 0.084 0.041 0.031 0.018 0.009 179 G 0.250 0.100 0.056 0.107 0.084 0.082 0.101 0.066 0.062 0.051 0.040 180 Q 0.105 0.132 0.116 0.201 0.146 0.106 0.092 0.041 0.031 0.019 0.011 181 K 0.118 0.150 0.102 0.196 0.144 0.098 0.091 0.043 0.033 0.018 0.008 182 G 0.224 0.127 0.093 0.147 0.117 0.096 0.084 0.042 0.035 0.022 0.013 183 N 0.147 0.100 0.051 0.129 0.111 0.096 0.128 0.085 0.073 0.049 0.031 184 P 0.360 0.219 0.066 0.124 0.083 0.055 0.045 0.021 0.015 0.008 0.004 185 K 0.420 0.207 0.064 0.123 0.077 0.046 0.034 0.013 0.009 0.004 0.002 186 G 0.390 0.130 0.046 0.101 0.079 0.067 0.066 0.040 0.038 0.026 0.017 187 R 0.199 0.161 0.071 0.166 0.128 0.095 0.084 0.042 0.030 0.016 0.010 188 Q 0.226 0.210 0.089 0.179 0.112 0.077 0.058 0.025 0.015 0.007 0.003 189 N 0.175 0.090 0.066 0.152 0.137 0.122 0.126 0.060 0.040 0.022 0.011 190 E 0.072 0.116 0.093 0.287 0.199 0.110 0.071 0.025 0.016 0.008 0.004 191 R 0.005 0.011 0.016 0.058 0.094 0.138 0.254 0.193 0.139 0.069 0.023 192 V 0.008 0.033 0.049 0.267 0.272 0.181 0.125 0.037 0.018 0.007 0.003 193 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.008 0.046 0.120 0.251 0.318 0.248 194 I 0.002 0.011 0.019 0.190 0.262 0.201 0.183 0.076 0.040 0.013 0.004 195 Q 0.001 0.003 0.003 0.011 0.016 0.030 0.106 0.180 0.273 0.233 0.145 196 Y 0.001 0.003 0.004 0.028 0.054 0.083 0.184 0.212 0.229 0.146 0.057 197 H 0.005 0.019 0.014 0.066 0.086 0.123 0.246 0.192 0.151 0.070 0.028 198 Y 0.004 0.008 0.006 0.029 0.039 0.053 0.124 0.179 0.243 0.201 0.113 199 T 0.034 0.066 0.040 0.187 0.191 0.163 0.166 0.080 0.047 0.018 0.007 200 Q 0.143 0.151 0.050 0.206 0.165 0.111 0.088 0.043 0.027 0.012 0.004 201 W 0.015 0.021 0.010 0.048 0.062 0.088 0.157 0.175 0.202 0.146 0.077 202 P 0.082 0.099 0.042 0.144 0.145 0.145 0.155 0.078 0.059 0.032 0.018 203 D 0.167 0.149 0.064 0.156 0.122 0.095 0.099 0.065 0.045 0.026 0.014 204 M 0.077 0.062 0.026 0.109 0.112 0.128 0.183 0.117 0.096 0.061 0.029 205 G 0.232 0.153 0.048 0.131 0.105 0.087 0.083 0.049 0.048 0.036 0.027 206 V 0.041 0.047 0.020 0.064 0.065 0.078 0.150 0.139 0.164 0.129 0.103 207 P 0.063 0.060 0.031 0.085 0.097 0.118 0.169 0.125 0.118 0.077 0.058 208 E 0.262 0.199 0.084 0.201 0.113 0.057 0.043 0.018 0.013 0.007 0.004 209 Y 0.081 0.144 0.048 0.140 0.135 0.135 0.141 0.071 0.057 0.032 0.018 210 A 0.039 0.027 0.020 0.065 0.103 0.136 0.166 0.125 0.129 0.101 0.090 211 L 0.095 0.135 0.081 0.206 0.160 0.123 0.119 0.042 0.024 0.011 0.005 212 P 0.005 0.029 0.025 0.103 0.154 0.192 0.229 0.125 0.077 0.042 0.019 213 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.005 0.009 0.048 0.100 0.237 0.279 0.318 214 L 0.001 0.002 0.006 0.023 0.054 0.120 0.250 0.172 0.169 0.126 0.076 215 T 0.004 0.026 0.196 0.356 0.219 0.104 0.059 0.019 0.011 0.005 0.002 216 F 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.016 0.101 0.167 0.268 0.255 0.180 217 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.011 0.054 0.118 0.253 0.310 0.245 218 R 0.003 0.011 0.185 0.228 0.220 0.159 0.127 0.039 0.020 0.007 0.002 219 R 0.001 0.007 0.052 0.091 0.160 0.251 0.285 0.095 0.040 0.014 0.004 220 S 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.012 0.072 0.129 0.268 0.301 0.210 221 S 0.025 0.033 0.039 0.119 0.146 0.178 0.242 0.105 0.066 0.033 0.014 222 A 0.063 0.121 0.337 0.231 0.120 0.063 0.037 0.014 0.009 0.004 0.002 223 A 0.022 0.034 0.033 0.067 0.086 0.141 0.245 0.137 0.118 0.074 0.043 224 R 0.057 0.068 0.039 0.109 0.106 0.130 0.192 0.109 0.092 0.060 0.037 225 M 0.096 0.111 0.075 0.125 0.106 0.107 0.139 0.079 0.071 0.049 0.042 226 P 0.275 0.140 0.081 0.140 0.096 0.081 0.082 0.037 0.030 0.020 0.017 227 E 0.557 0.162 0.048 0.105 0.052 0.032 0.024 0.008 0.006 0.004 0.003 228 T 0.287 0.233 0.089 0.199 0.102 0.045 0.026 0.008 0.006 0.003 0.002 229 G 0.007 0.020 0.017 0.078 0.143 0.179 0.228 0.145 0.107 0.054 0.023 230 P 0.001 0.008 0.011 0.075 0.175 0.242 0.266 0.123 0.062 0.026 0.010 231 V 0.001 0.001 0.001 0.002 0.007 0.018 0.091 0.184 0.248 0.249 0.200 232 L 0.001 0.001 0.001 0.004 0.008 0.021 0.101 0.168 0.218 0.233 0.247 233 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.004 0.027 0.079 0.193 0.312 0.382 234 H 0.001 0.001 0.001 0.005 0.009 0.016 0.060 0.121 0.224 0.277 0.284 235 C 0.001 0.002 0.002 0.010 0.015 0.025 0.072 0.128 0.212 0.248 0.284 236 S 0.013 0.030 0.019 0.130 0.169 0.168 0.187 0.117 0.084 0.051 0.033 237 A 0.024 0.031 0.017 0.091 0.097 0.108 0.161 0.135 0.134 0.110 0.092 238 G 0.093 0.071 0.032 0.120 0.114 0.104 0.115 0.082 0.094 0.088 0.086 239 V 0.050 0.047 0.018 0.073 0.069 0.081 0.125 0.107 0.142 0.139 0.150 240 G 0.075 0.066 0.025 0.079 0.085 0.100 0.142 0.109 0.125 0.105 0.089 241 R 0.035 0.048 0.022 0.088 0.109 0.127 0.164 0.114 0.122 0.092 0.078 242 T 0.024 0.026 0.015 0.046 0.054 0.064 0.118 0.126 0.186 0.175 0.166 243 G 0.014 0.017 0.013 0.050 0.084 0.119 0.184 0.153 0.165 0.112 0.089 244 T 0.002 0.004 0.004 0.014 0.020 0.038 0.119 0.156 0.239 0.222 0.181 245 Y 0.001 0.002 0.004 0.012 0.016 0.030 0.098 0.132 0.223 0.251 0.231 246 I 0.001 0.002 0.006 0.008 0.009 0.015 0.059 0.116 0.209 0.255 0.320 247 V 0.001 0.001 0.001 0.003 0.005 0.010 0.053 0.107 0.227 0.285 0.309 248 I 0.001 0.001 0.002 0.004 0.006 0.013 0.064 0.120 0.254 0.291 0.248 249 D 0.001 0.003 0.012 0.045 0.091 0.170 0.298 0.168 0.118 0.065 0.029 250 S 0.001 0.002 0.008 0.022 0.038 0.076 0.217 0.209 0.196 0.145 0.087 251 M 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 0.073 0.246 0.335 0.315 252 L 0.001 0.001 0.004 0.014 0.031 0.086 0.228 0.171 0.195 0.164 0.107 253 Q 0.001 0.008 0.161 0.199 0.196 0.156 0.142 0.065 0.040 0.021 0.009 254 Q 0.001 0.001 0.003 0.007 0.021 0.071 0.273 0.224 0.203 0.128 0.071 255 I 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.023 0.061 0.186 0.300 0.424 256 K 0.001 0.008 0.039 0.146 0.267 0.263 0.190 0.053 0.023 0.008 0.003 257 D 0.061 0.133 0.294 0.259 0.129 0.076 0.035 0.008 0.003 0.001 0.001 258 K 0.198 0.187 0.088 0.205 0.117 0.087 0.075 0.022 0.012 0.006 0.003 259 S 0.305 0.192 0.038 0.135 0.100 0.087 0.085 0.028 0.017 0.009 0.005 260 T 0.100 0.153 0.057 0.256 0.200 0.123 0.068 0.023 0.012 0.005 0.003 261 V 0.001 0.003 0.003 0.009 0.017 0.043 0.142 0.177 0.255 0.203 0.147 262 N 0.009 0.167 0.089 0.323 0.215 0.114 0.056 0.016 0.007 0.003 0.002 263 V 0.001 0.002 0.002 0.008 0.013 0.024 0.092 0.156 0.256 0.252 0.194 264 L 0.024 0.026 0.024 0.111 0.229 0.267 0.216 0.061 0.029 0.009 0.003 265 G 0.060 0.123 0.139 0.363 0.148 0.081 0.060 0.016 0.007 0.002 0.001 266 F 0.001 0.001 0.005 0.011 0.017 0.032 0.139 0.186 0.256 0.209 0.144 267 L 0.001 0.001 0.004 0.004 0.006 0.016 0.091 0.142 0.235 0.271 0.231 268 K 0.001 0.008 0.269 0.337 0.227 0.099 0.043 0.009 0.004 0.002 0.001 269 H 0.001 0.010 0.084 0.150 0.223 0.277 0.192 0.042 0.015 0.005 0.001 270 I 0.001 0.001 0.005 0.004 0.003 0.007 0.049 0.104 0.258 0.317 0.253 271 R 0.001 0.004 0.024 0.029 0.048 0.117 0.363 0.198 0.124 0.066 0.025 272 T 0.006 0.036 0.624 0.198 0.083 0.033 0.012 0.004 0.002 0.001 0.001 273 Q 0.004 0.012 0.037 0.039 0.078 0.189 0.378 0.133 0.075 0.039 0.015 274 R 0.011 0.011 0.020 0.024 0.024 0.040 0.144 0.175 0.246 0.198 0.108 275 N 0.075 0.094 0.136 0.161 0.136 0.137 0.134 0.055 0.038 0.022 0.011 276 Y 0.058 0.084 0.120 0.233 0.162 0.128 0.111 0.049 0.034 0.016 0.005 277 L 0.025 0.036 0.032 0.053 0.054 0.074 0.164 0.138 0.174 0.144 0.107 278 V 0.010 0.012 0.019 0.027 0.039 0.058 0.138 0.143 0.189 0.185 0.180 279 Q 0.019 0.087 0.112 0.175 0.164 0.139 0.138 0.070 0.051 0.029 0.016 280 T 0.019 0.191 0.082 0.200 0.160 0.128 0.117 0.055 0.031 0.013 0.005 281 E 0.528 0.110 0.048 0.144 0.104 0.044 0.016 0.003 0.001 0.001 0.001 282 E 0.509 0.184 0.071 0.114 0.052 0.030 0.024 0.008 0.005 0.002 0.001 283 Q 0.001 0.003 0.005 0.031 0.062 0.137 0.272 0.205 0.173 0.078 0.035 284 Y 0.001 0.001 0.004 0.009 0.018 0.048 0.190 0.210 0.235 0.184 0.100 285 I 0.001 0.008 0.112 0.209 0.289 0.217 0.104 0.033 0.019 0.007 0.002 286 F 0.001 0.002 0.019 0.032 0.061 0.126 0.263 0.192 0.164 0.096 0.045 287 I 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.041 0.099 0.252 0.303 0.293 288 H 0.001 0.001 0.008 0.010 0.021 0.054 0.279 0.235 0.211 0.133 0.048 289 D 0.001 0.005 0.109 0.287 0.280 0.181 0.094 0.025 0.012 0.005 0.001 290 A 0.001 0.001 0.008 0.005 0.007 0.020 0.131 0.162 0.249 0.242 0.174 291 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.003 0.008 0.058 0.125 0.282 0.322 0.198 292 L 0.001 0.003 0.096 0.068 0.076 0.138 0.290 0.141 0.102 0.057 0.028 293 E 0.001 0.007 0.119 0.131 0.177 0.207 0.189 0.083 0.046 0.027 0.013 294 A 0.001 0.002 0.012 0.009 0.011 0.032 0.177 0.188 0.255 0.204 0.108 295 I 0.002 0.007 0.042 0.029 0.015 0.020 0.089 0.120 0.227 0.245 0.203 296 L 0.012 0.059 0.180 0.177 0.193 0.168 0.118 0.043 0.028 0.014 0.007 297 G 0.193 0.162 0.177 0.153 0.095 0.080 0.073 0.030 0.021 0.010 0.006