# TARGET T0305 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0305.t04-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 1132 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 Y 0.122 0.178 0.084 0.164 0.127 0.109 0.102 0.057 0.033 0.016 0.007 2 F 0.065 0.041 0.027 0.058 0.073 0.101 0.190 0.154 0.132 0.093 0.067 3 Q 0.439 0.154 0.141 0.145 0.060 0.030 0.016 0.007 0.004 0.002 0.001 4 S 0.091 0.218 0.133 0.186 0.144 0.105 0.066 0.031 0.017 0.006 0.002 5 M 0.014 0.020 0.017 0.034 0.044 0.084 0.204 0.174 0.175 0.129 0.104 6 K 0.212 0.102 0.131 0.209 0.146 0.094 0.063 0.024 0.012 0.006 0.002 7 Q 0.099 0.111 0.324 0.248 0.113 0.060 0.027 0.011 0.004 0.001 0.001 8 F 0.001 0.005 0.015 0.011 0.014 0.034 0.122 0.165 0.240 0.221 0.172 9 V 0.005 0.011 0.026 0.048 0.101 0.194 0.302 0.144 0.092 0.054 0.023 10 K 0.036 0.043 0.678 0.162 0.049 0.020 0.008 0.002 0.001 0.001 0.001 11 H 0.007 0.020 0.075 0.121 0.125 0.202 0.292 0.109 0.031 0.014 0.004 12 I 0.001 0.001 0.004 0.003 0.003 0.010 0.060 0.119 0.255 0.296 0.249 13 G 0.026 0.044 0.175 0.197 0.206 0.163 0.125 0.034 0.017 0.010 0.003 14 E 0.050 0.056 0.624 0.147 0.063 0.033 0.017 0.006 0.003 0.002 0.001 15 L 0.025 0.026 0.050 0.077 0.078 0.132 0.310 0.138 0.088 0.050 0.027 16 Y 0.061 0.056 0.052 0.066 0.062 0.092 0.218 0.155 0.115 0.079 0.045 17 S 0.153 0.137 0.244 0.208 0.108 0.061 0.048 0.020 0.011 0.006 0.003 18 N 0.349 0.183 0.226 0.120 0.062 0.033 0.017 0.006 0.003 0.001 0.001 19 N 0.212 0.228 0.062 0.121 0.096 0.088 0.089 0.052 0.032 0.014 0.006 20 Q 0.312 0.145 0.059 0.137 0.126 0.093 0.072 0.032 0.017 0.006 0.002 21 H 0.548 0.083 0.159 0.094 0.045 0.027 0.020 0.011 0.007 0.004 0.002 22 G 0.095 0.203 0.149 0.229 0.147 0.099 0.051 0.019 0.007 0.002 0.001 23 F 0.001 0.005 0.009 0.007 0.009 0.025 0.101 0.170 0.243 0.229 0.201 24 S 0.046 0.064 0.099 0.233 0.261 0.168 0.093 0.024 0.007 0.003 0.001 25 E 0.264 0.066 0.551 0.091 0.019 0.006 0.002 0.001 0.001 0.001 0.001 26 D 0.006 0.031 0.035 0.068 0.094 0.188 0.293 0.166 0.080 0.029 0.010 27 F 0.001 0.002 0.005 0.005 0.011 0.049 0.206 0.198 0.236 0.174 0.113 28 E 0.013 0.028 0.595 0.214 0.094 0.035 0.015 0.003 0.001 0.001 0.001 29 E 0.015 0.050 0.505 0.229 0.103 0.067 0.024 0.007 0.001 0.001 0.001 30 V 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 0.038 0.082 0.241 0.311 0.322 31 Q 0.018 0.028 0.115 0.117 0.164 0.206 0.248 0.059 0.026 0.015 0.004 32 R 0.006 0.024 0.780 0.132 0.037 0.013 0.005 0.002 0.001 0.001 0.001 33 C 0.004 0.008 0.035 0.024 0.037 0.127 0.416 0.195 0.080 0.049 0.025 34 T 0.139 0.180 0.099 0.181 0.104 0.087 0.095 0.060 0.030 0.016 0.007 35 A 0.272 0.125 0.158 0.110 0.085 0.076 0.072 0.046 0.031 0.018 0.007 36 D 0.403 0.246 0.122 0.129 0.065 0.021 0.008 0.003 0.001 0.001 0.001 37 M 0.124 0.062 0.017 0.048 0.061 0.106 0.202 0.139 0.126 0.073 0.042 38 N 0.339 0.268 0.097 0.172 0.080 0.025 0.010 0.005 0.003 0.001 0.001 39 I 0.057 0.048 0.036 0.063 0.075 0.122 0.207 0.149 0.113 0.079 0.049 40 T 0.229 0.286 0.103 0.205 0.098 0.042 0.018 0.011 0.005 0.002 0.001 41 A 0.044 0.027 0.019 0.041 0.057 0.104 0.184 0.154 0.164 0.123 0.083 42 E 0.287 0.223 0.122 0.199 0.095 0.039 0.019 0.008 0.005 0.002 0.001 43 H 0.095 0.070 0.060 0.147 0.111 0.114 0.172 0.092 0.070 0.047 0.023 44 S 0.136 0.099 0.072 0.093 0.090 0.097 0.128 0.104 0.082 0.058 0.041 45 N 0.170 0.243 0.109 0.203 0.108 0.073 0.050 0.024 0.013 0.005 0.002 46 H 0.198 0.113 0.100 0.119 0.114 0.102 0.101 0.061 0.045 0.030 0.016 47 P 0.488 0.168 0.086 0.117 0.066 0.036 0.021 0.009 0.006 0.002 0.001 48 E 0.255 0.174 0.100 0.154 0.107 0.082 0.066 0.031 0.020 0.008 0.003 49 N 0.064 0.065 0.059 0.081 0.084 0.104 0.164 0.134 0.106 0.081 0.059 50 K 0.106 0.113 0.128 0.169 0.139 0.126 0.106 0.052 0.035 0.017 0.010 51 H 0.117 0.111 0.268 0.193 0.117 0.081 0.054 0.025 0.018 0.010 0.004 52 K 0.040 0.035 0.054 0.099 0.107 0.143 0.215 0.121 0.089 0.062 0.037 53 N 0.038 0.035 0.051 0.069 0.066 0.092 0.164 0.137 0.151 0.117 0.082 54 R 0.026 0.061 0.077 0.154 0.127 0.129 0.167 0.104 0.070 0.052 0.034 55 Y 0.030 0.039 0.064 0.080 0.079 0.099 0.151 0.123 0.125 0.117 0.093 56 I 0.063 0.068 0.049 0.136 0.133 0.134 0.157 0.088 0.080 0.056 0.036 57 N 0.112 0.100 0.068 0.170 0.145 0.121 0.109 0.066 0.058 0.034 0.016 58 I 0.010 0.008 0.008 0.022 0.033 0.056 0.135 0.148 0.197 0.203 0.179 59 L 0.036 0.049 0.040 0.108 0.111 0.116 0.166 0.132 0.110 0.074 0.058 60 A 0.010 0.016 0.031 0.047 0.044 0.051 0.109 0.122 0.177 0.202 0.191 61 Y 0.023 0.033 0.035 0.073 0.098 0.114 0.176 0.130 0.122 0.104 0.092 62 D 0.062 0.089 0.049 0.150 0.116 0.105 0.137 0.095 0.094 0.064 0.038 63 H 0.053 0.057 0.031 0.125 0.139 0.143 0.168 0.102 0.081 0.060 0.041 64 S 0.059 0.058 0.031 0.080 0.077 0.084 0.142 0.125 0.147 0.120 0.077 65 R 0.038 0.051 0.028 0.150 0.164 0.143 0.158 0.109 0.076 0.052 0.031 66 V 0.007 0.006 0.010 0.012 0.019 0.033 0.086 0.123 0.210 0.257 0.238 67 K 0.037 0.088 0.043 0.249 0.218 0.134 0.110 0.063 0.030 0.016 0.009 68 L 0.003 0.003 0.004 0.006 0.009 0.017 0.055 0.096 0.208 0.300 0.300 69 R 0.119 0.120 0.048 0.207 0.169 0.110 0.099 0.052 0.035 0.023 0.018 70 P 0.132 0.132 0.053 0.133 0.106 0.089 0.109 0.082 0.079 0.055 0.029 71 L 0.100 0.072 0.015 0.063 0.083 0.095 0.139 0.141 0.112 0.095 0.085 72 P 0.472 0.247 0.027 0.094 0.062 0.038 0.025 0.016 0.012 0.005 0.003 73 G 0.457 0.171 0.045 0.107 0.077 0.047 0.033 0.022 0.020 0.013 0.008 74 K 0.337 0.170 0.028 0.097 0.096 0.079 0.076 0.045 0.035 0.021 0.016 75 D 0.268 0.184 0.040 0.139 0.098 0.075 0.072 0.048 0.040 0.022 0.014 76 S 0.213 0.143 0.065 0.132 0.102 0.090 0.087 0.060 0.047 0.035 0.027 77 K 0.212 0.197 0.076 0.163 0.115 0.086 0.064 0.036 0.027 0.015 0.009 78 H 0.111 0.111 0.046 0.127 0.111 0.111 0.128 0.087 0.077 0.055 0.037 79 S 0.108 0.093 0.043 0.141 0.132 0.134 0.134 0.078 0.066 0.042 0.029 80 D 0.106 0.098 0.086 0.161 0.131 0.116 0.111 0.067 0.064 0.039 0.021 81 Y 0.013 0.019 0.021 0.078 0.089 0.115 0.200 0.145 0.127 0.109 0.083 82 I 0.005 0.006 0.015 0.021 0.028 0.041 0.107 0.132 0.207 0.224 0.215 83 N 0.005 0.016 0.027 0.088 0.104 0.115 0.200 0.154 0.123 0.097 0.069 84 A 0.008 0.010 0.041 0.042 0.050 0.063 0.114 0.117 0.192 0.195 0.168 85 N 0.011 0.014 0.024 0.066 0.087 0.109 0.220 0.145 0.140 0.110 0.073 86 Y 0.019 0.033 0.038 0.098 0.106 0.103 0.163 0.153 0.135 0.098 0.054 87 V 0.003 0.002 0.004 0.006 0.012 0.028 0.088 0.144 0.228 0.240 0.244 88 D 0.128 0.158 0.103 0.212 0.160 0.100 0.069 0.036 0.021 0.009 0.005 89 G 0.035 0.033 0.036 0.060 0.063 0.079 0.155 0.122 0.155 0.145 0.117 90 Y 0.162 0.116 0.042 0.114 0.117 0.112 0.140 0.080 0.059 0.033 0.024 91 N 0.242 0.193 0.084 0.167 0.097 0.070 0.065 0.035 0.027 0.014 0.008 92 K 0.150 0.153 0.070 0.163 0.128 0.109 0.106 0.055 0.032 0.021 0.013 93 A 0.172 0.166 0.078 0.152 0.124 0.097 0.090 0.049 0.039 0.022 0.011 94 K 0.070 0.074 0.066 0.169 0.149 0.149 0.150 0.065 0.054 0.035 0.019 95 A 0.045 0.057 0.096 0.178 0.169 0.158 0.141 0.068 0.050 0.028 0.013 96 Y 0.001 0.002 0.007 0.022 0.036 0.070 0.212 0.197 0.171 0.162 0.119 97 I 0.002 0.004 0.017 0.024 0.028 0.035 0.094 0.156 0.201 0.224 0.216 98 A 0.001 0.001 0.007 0.007 0.012 0.020 0.062 0.124 0.222 0.274 0.271 99 T 0.005 0.010 0.030 0.042 0.067 0.089 0.155 0.159 0.183 0.142 0.119 100 Q 0.013 0.017 0.023 0.063 0.083 0.109 0.193 0.143 0.155 0.115 0.086 101 G 0.064 0.055 0.030 0.102 0.093 0.101 0.169 0.127 0.116 0.085 0.058 102 P 0.060 0.077 0.027 0.086 0.076 0.083 0.144 0.126 0.132 0.103 0.085 103 L 0.069 0.072 0.025 0.090 0.103 0.121 0.190 0.113 0.096 0.069 0.053 104 K 0.410 0.168 0.096 0.156 0.088 0.039 0.021 0.009 0.006 0.003 0.002 105 S 0.291 0.135 0.064 0.149 0.106 0.090 0.085 0.039 0.024 0.012 0.006 106 T 0.084 0.153 0.045 0.098 0.095 0.092 0.126 0.117 0.095 0.059 0.037 107 F 0.022 0.028 0.016 0.049 0.070 0.125 0.205 0.166 0.143 0.098 0.080 108 E 0.244 0.160 0.240 0.189 0.099 0.041 0.014 0.006 0.004 0.001 0.001 109 D 0.022 0.032 0.039 0.143 0.159 0.176 0.222 0.107 0.055 0.030 0.014 110 F 0.002 0.002 0.006 0.007 0.008 0.013 0.050 0.087 0.234 0.288 0.303 111 W 0.002 0.006 0.026 0.050 0.082 0.147 0.253 0.158 0.136 0.091 0.048 112 R 0.004 0.020 0.221 0.157 0.140 0.143 0.145 0.078 0.046 0.032 0.014 113 M 0.001 0.003 0.013 0.026 0.038 0.081 0.247 0.220 0.165 0.129 0.077 114 I 0.005 0.004 0.018 0.014 0.015 0.024 0.079 0.135 0.243 0.263 0.199 115 W 0.010 0.022 0.068 0.081 0.099 0.124 0.201 0.132 0.123 0.088 0.051 116 E 0.016 0.039 0.121 0.130 0.146 0.162 0.179 0.074 0.061 0.044 0.026 117 Q 0.043 0.061 0.087 0.175 0.109 0.124 0.201 0.078 0.056 0.043 0.024 118 N 0.076 0.130 0.085 0.202 0.150 0.122 0.119 0.062 0.030 0.017 0.006 119 T 0.005 0.005 0.005 0.011 0.019 0.052 0.139 0.165 0.209 0.206 0.184 120 G 0.065 0.102 0.072 0.222 0.208 0.153 0.093 0.044 0.025 0.011 0.006 121 I 0.001 0.004 0.008 0.026 0.040 0.057 0.149 0.145 0.187 0.207 0.177 122 I 0.001 0.001 0.003 0.008 0.013 0.018 0.064 0.109 0.216 0.249 0.318 123 V 0.001 0.001 0.004 0.009 0.017 0.030 0.104 0.154 0.246 0.228 0.206 124 M 0.001 0.003 0.022 0.031 0.046 0.055 0.136 0.169 0.192 0.180 0.166 125 I 0.001 0.001 0.006 0.009 0.015 0.028 0.101 0.150 0.242 0.227 0.220 126 T 0.005 0.007 0.015 0.024 0.034 0.051 0.140 0.167 0.217 0.192 0.147 127 N 0.069 0.086 0.104 0.196 0.182 0.144 0.119 0.051 0.030 0.013 0.006 128 L 0.060 0.044 0.049 0.083 0.087 0.121 0.201 0.121 0.114 0.073 0.046 129 V 0.162 0.123 0.076 0.155 0.114 0.099 0.131 0.059 0.043 0.023 0.014 130 E 0.103 0.090 0.088 0.128 0.100 0.105 0.166 0.083 0.063 0.045 0.028 131 K 0.159 0.162 0.154 0.173 0.125 0.091 0.075 0.031 0.016 0.009 0.005 132 G 0.224 0.182 0.134 0.161 0.102 0.075 0.062 0.030 0.018 0.009 0.004 133 R 0.263 0.119 0.092 0.131 0.118 0.099 0.082 0.043 0.030 0.015 0.007 134 R 0.248 0.119 0.123 0.139 0.101 0.087 0.081 0.042 0.034 0.017 0.009 135 K 0.057 0.092 0.095 0.174 0.141 0.125 0.144 0.079 0.047 0.029 0.016 136 C 0.012 0.018 0.031 0.041 0.049 0.076 0.159 0.159 0.163 0.159 0.132 137 D 0.063 0.074 0.102 0.179 0.150 0.136 0.126 0.068 0.051 0.032 0.019 138 Q 0.085 0.068 0.131 0.195 0.153 0.119 0.111 0.052 0.044 0.028 0.013 139 Y 0.034 0.023 0.026 0.058 0.060 0.076 0.175 0.142 0.153 0.145 0.107 140 W 0.035 0.048 0.025 0.072 0.077 0.095 0.176 0.166 0.135 0.097 0.072 141 P 0.065 0.103 0.075 0.113 0.097 0.093 0.128 0.110 0.092 0.070 0.055 142 T 0.325 0.189 0.074 0.160 0.119 0.062 0.037 0.017 0.009 0.005 0.002 143 E 0.580 0.144 0.044 0.078 0.058 0.035 0.024 0.014 0.013 0.006 0.003 144 N 0.350 0.214 0.034 0.134 0.097 0.064 0.054 0.027 0.016 0.007 0.003 145 S 0.139 0.080 0.038 0.092 0.101 0.107 0.156 0.108 0.088 0.056 0.036 146 E 0.230 0.143 0.193 0.179 0.102 0.059 0.044 0.020 0.015 0.009 0.006 147 E 0.144 0.208 0.142 0.226 0.129 0.073 0.046 0.020 0.008 0.003 0.001 148 Y 0.020 0.018 0.014 0.027 0.042 0.067 0.156 0.185 0.163 0.162 0.146 149 G 0.296 0.230 0.066 0.171 0.105 0.061 0.036 0.019 0.010 0.004 0.002 150 N 0.276 0.161 0.143 0.180 0.129 0.059 0.022 0.014 0.010 0.004 0.001 151 I 0.018 0.012 0.008 0.018 0.035 0.072 0.169 0.182 0.189 0.165 0.132 152 I 0.086 0.149 0.051 0.250 0.180 0.111 0.076 0.053 0.028 0.011 0.005 153 V 0.004 0.003 0.010 0.007 0.013 0.028 0.078 0.133 0.216 0.272 0.236 154 T 0.102 0.201 0.099 0.281 0.165 0.083 0.041 0.017 0.007 0.003 0.002 155 L 0.024 0.023 0.018 0.036 0.037 0.062 0.149 0.142 0.199 0.183 0.126 156 K 0.236 0.239 0.061 0.179 0.119 0.068 0.050 0.024 0.013 0.007 0.004 157 S 0.339 0.204 0.072 0.149 0.091 0.063 0.043 0.020 0.013 0.005 0.002 158 T 0.352 0.126 0.093 0.116 0.093 0.075 0.062 0.035 0.026 0.015 0.008 159 K 0.210 0.203 0.111 0.186 0.112 0.078 0.060 0.022 0.012 0.005 0.002 160 I 0.045 0.058 0.090 0.105 0.089 0.108 0.183 0.119 0.091 0.071 0.041 161 H 0.073 0.094 0.161 0.180 0.142 0.127 0.115 0.051 0.029 0.018 0.010 162 A 0.122 0.121 0.263 0.190 0.114 0.087 0.056 0.023 0.016 0.007 0.002 163 C 0.048 0.045 0.072 0.124 0.124 0.143 0.184 0.115 0.074 0.048 0.023 164 Y 0.023 0.021 0.030 0.040 0.051 0.087 0.181 0.180 0.172 0.125 0.089 165 T 0.040 0.103 0.119 0.211 0.137 0.111 0.115 0.075 0.048 0.026 0.014 166 V 0.018 0.026 0.075 0.072 0.085 0.104 0.161 0.115 0.127 0.123 0.095 167 R 0.078 0.081 0.090 0.185 0.138 0.118 0.144 0.066 0.050 0.034 0.017 168 R 0.090 0.108 0.092 0.228 0.178 0.123 0.090 0.048 0.027 0.013 0.004 169 F 0.007 0.005 0.009 0.010 0.016 0.040 0.116 0.168 0.219 0.231 0.179 170 S 0.090 0.183 0.093 0.257 0.167 0.099 0.060 0.029 0.013 0.006 0.002 171 I 0.014 0.014 0.031 0.028 0.036 0.062 0.130 0.135 0.182 0.209 0.160 172 R 0.134 0.195 0.088 0.230 0.146 0.090 0.067 0.025 0.013 0.007 0.004 173 N 0.115 0.108 0.052 0.141 0.109 0.109 0.136 0.088 0.073 0.048 0.021 174 T 0.128 0.080 0.044 0.090 0.093 0.097 0.125 0.106 0.098 0.082 0.059 175 K 0.222 0.215 0.073 0.189 0.121 0.079 0.050 0.025 0.016 0.006 0.003 176 V 0.029 0.028 0.026 0.052 0.061 0.080 0.142 0.134 0.158 0.164 0.128 177 K 0.114 0.122 0.070 0.172 0.139 0.111 0.116 0.062 0.045 0.028 0.020 178 K 0.075 0.074 0.066 0.147 0.112 0.106 0.136 0.092 0.086 0.067 0.039 179 G 0.073 0.072 0.054 0.116 0.115 0.114 0.147 0.103 0.085 0.070 0.051 180 Q 0.106 0.100 0.046 0.131 0.104 0.098 0.132 0.094 0.086 0.061 0.040 181 K 0.146 0.103 0.049 0.131 0.126 0.107 0.117 0.080 0.066 0.047 0.029 182 G 0.292 0.155 0.069 0.124 0.092 0.071 0.068 0.045 0.040 0.026 0.018 183 N 0.204 0.162 0.039 0.154 0.125 0.095 0.096 0.054 0.037 0.021 0.013 184 P 0.307 0.139 0.045 0.085 0.076 0.066 0.080 0.067 0.062 0.043 0.030 185 K 0.345 0.202 0.045 0.150 0.101 0.063 0.046 0.022 0.014 0.007 0.004 186 G 0.459 0.210 0.080 0.095 0.063 0.037 0.024 0.014 0.011 0.005 0.003 187 R 0.221 0.135 0.034 0.137 0.119 0.100 0.113 0.062 0.039 0.023 0.016 188 Q 0.423 0.208 0.089 0.106 0.068 0.043 0.028 0.016 0.012 0.005 0.002 189 N 0.149 0.152 0.088 0.194 0.134 0.101 0.089 0.043 0.027 0.015 0.008 190 E 0.200 0.144 0.121 0.140 0.123 0.102 0.076 0.043 0.029 0.015 0.007 191 R 0.064 0.055 0.063 0.125 0.112 0.130 0.169 0.106 0.086 0.057 0.033 192 V 0.091 0.124 0.142 0.198 0.157 0.120 0.083 0.045 0.024 0.011 0.004 193 V 0.004 0.006 0.014 0.019 0.025 0.048 0.120 0.146 0.205 0.222 0.191 194 I 0.034 0.059 0.081 0.140 0.148 0.151 0.159 0.096 0.067 0.040 0.024 195 Q 0.014 0.022 0.054 0.095 0.086 0.100 0.164 0.127 0.141 0.122 0.075 196 Y 0.017 0.019 0.035 0.057 0.074 0.103 0.183 0.142 0.141 0.127 0.101 197 H 0.025 0.046 0.043 0.121 0.098 0.101 0.168 0.126 0.123 0.092 0.058 198 Y 0.015 0.018 0.025 0.048 0.061 0.082 0.162 0.144 0.157 0.162 0.125 199 T 0.077 0.072 0.065 0.131 0.124 0.116 0.141 0.089 0.083 0.059 0.041 200 Q 0.125 0.114 0.070 0.179 0.140 0.106 0.109 0.065 0.048 0.030 0.015 201 W 0.039 0.027 0.015 0.037 0.047 0.064 0.131 0.140 0.162 0.172 0.166 202 P 0.130 0.160 0.042 0.147 0.123 0.102 0.110 0.070 0.056 0.034 0.027 203 D 0.155 0.145 0.061 0.157 0.124 0.090 0.089 0.063 0.053 0.040 0.024 204 M 0.206 0.091 0.029 0.094 0.112 0.108 0.113 0.084 0.073 0.052 0.038 205 G 0.376 0.196 0.045 0.130 0.089 0.058 0.040 0.027 0.023 0.011 0.005 206 V 0.037 0.043 0.014 0.061 0.070 0.082 0.147 0.140 0.142 0.135 0.127 207 P 0.100 0.084 0.030 0.084 0.091 0.094 0.136 0.117 0.110 0.082 0.073 208 E 0.268 0.181 0.102 0.220 0.100 0.053 0.035 0.017 0.013 0.008 0.005 209 Y 0.109 0.154 0.056 0.128 0.137 0.124 0.116 0.069 0.053 0.034 0.019 210 A 0.088 0.084 0.021 0.105 0.101 0.115 0.161 0.120 0.105 0.061 0.039 211 L 0.249 0.102 0.063 0.154 0.111 0.097 0.090 0.055 0.041 0.024 0.014 212 P 0.058 0.146 0.092 0.201 0.189 0.133 0.089 0.051 0.026 0.011 0.005 213 V 0.002 0.005 0.008 0.014 0.017 0.030 0.089 0.129 0.235 0.235 0.237 214 L 0.010 0.009 0.019 0.044 0.089 0.141 0.234 0.174 0.140 0.092 0.048 215 T 0.025 0.053 0.239 0.337 0.169 0.089 0.053 0.021 0.008 0.003 0.001 216 F 0.001 0.001 0.006 0.006 0.009 0.023 0.092 0.156 0.259 0.264 0.184 217 V 0.001 0.001 0.004 0.006 0.015 0.043 0.148 0.186 0.251 0.212 0.133 218 R 0.016 0.030 0.420 0.215 0.133 0.086 0.060 0.020 0.011 0.006 0.002 219 R 0.004 0.022 0.102 0.172 0.173 0.218 0.207 0.075 0.018 0.007 0.002 220 S 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.003 0.028 0.070 0.227 0.330 0.338 221 S 0.018 0.032 0.087 0.148 0.210 0.208 0.205 0.052 0.022 0.014 0.004 222 A 0.031 0.045 0.639 0.168 0.061 0.029 0.016 0.005 0.003 0.002 0.001 223 A 0.026 0.020 0.066 0.077 0.082 0.145 0.344 0.117 0.066 0.037 0.020 224 R 0.083 0.071 0.060 0.078 0.060 0.084 0.197 0.141 0.105 0.077 0.044 225 M 0.127 0.150 0.183 0.169 0.110 0.083 0.083 0.044 0.025 0.016 0.010 226 P 0.368 0.249 0.136 0.113 0.067 0.035 0.018 0.009 0.004 0.002 0.001 227 E 0.544 0.204 0.034 0.075 0.057 0.037 0.022 0.014 0.009 0.004 0.002 228 T 0.487 0.203 0.032 0.092 0.075 0.048 0.027 0.016 0.012 0.005 0.003 229 G 0.103 0.087 0.030 0.114 0.130 0.140 0.142 0.091 0.083 0.048 0.032 230 P 0.019 0.036 0.035 0.132 0.142 0.153 0.172 0.116 0.090 0.059 0.045 231 V 0.001 0.002 0.006 0.017 0.025 0.043 0.125 0.156 0.200 0.219 0.205 232 L 0.001 0.002 0.008 0.018 0.028 0.037 0.094 0.157 0.199 0.226 0.230 233 V 0.001 0.001 0.004 0.005 0.009 0.015 0.052 0.112 0.235 0.281 0.286 234 H 0.002 0.005 0.015 0.029 0.047 0.061 0.124 0.169 0.200 0.180 0.167 235 C 0.003 0.005 0.008 0.019 0.030 0.053 0.132 0.147 0.220 0.200 0.182 236 S 0.058 0.070 0.049 0.133 0.133 0.132 0.146 0.098 0.088 0.056 0.037 237 A 0.031 0.034 0.017 0.069 0.076 0.108 0.195 0.136 0.134 0.113 0.088 238 G 0.081 0.081 0.033 0.099 0.100 0.104 0.135 0.110 0.109 0.083 0.064 239 V 0.026 0.026 0.015 0.054 0.063 0.090 0.164 0.133 0.152 0.141 0.136 240 G 0.063 0.083 0.057 0.137 0.130 0.119 0.126 0.084 0.084 0.065 0.051 241 R 0.010 0.016 0.012 0.058 0.068 0.093 0.181 0.135 0.147 0.147 0.134 242 T 0.011 0.018 0.014 0.052 0.060 0.075 0.140 0.134 0.170 0.172 0.155 243 G 0.003 0.008 0.007 0.039 0.058 0.083 0.167 0.149 0.177 0.166 0.142 244 T 0.001 0.003 0.005 0.022 0.037 0.056 0.128 0.138 0.208 0.206 0.195 245 Y 0.001 0.001 0.003 0.014 0.027 0.043 0.131 0.157 0.218 0.207 0.199 246 I 0.001 0.001 0.004 0.011 0.017 0.023 0.092 0.155 0.213 0.244 0.240 247 V 0.001 0.001 0.002 0.003 0.006 0.010 0.041 0.111 0.234 0.283 0.310 248 I 0.001 0.001 0.002 0.002 0.006 0.014 0.058 0.119 0.266 0.255 0.279 249 D 0.003 0.006 0.029 0.068 0.124 0.162 0.244 0.169 0.110 0.056 0.030 250 S 0.001 0.002 0.007 0.025 0.042 0.080 0.236 0.219 0.170 0.125 0.092 251 M 0.001 0.001 0.002 0.003 0.004 0.008 0.037 0.097 0.254 0.293 0.301 252 L 0.001 0.002 0.006 0.017 0.044 0.091 0.243 0.182 0.172 0.144 0.098 253 Q 0.026 0.037 0.294 0.203 0.151 0.109 0.097 0.039 0.025 0.014 0.006 254 Q 0.005 0.013 0.034 0.115 0.124 0.170 0.303 0.128 0.065 0.030 0.012 255 I 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.006 0.045 0.090 0.224 0.332 0.294 256 K 0.018 0.059 0.130 0.232 0.218 0.153 0.133 0.032 0.014 0.009 0.004 257 D 0.070 0.131 0.386 0.174 0.090 0.065 0.047 0.021 0.010 0.005 0.002 258 K 0.193 0.105 0.085 0.147 0.125 0.121 0.124 0.053 0.027 0.013 0.007 259 S 0.343 0.166 0.063 0.086 0.070 0.079 0.086 0.046 0.036 0.017 0.007 260 T 0.166 0.133 0.117 0.229 0.156 0.084 0.055 0.030 0.018 0.009 0.004 261 V 0.029 0.014 0.020 0.022 0.034 0.074 0.166 0.183 0.175 0.148 0.135 262 N 0.040 0.171 0.082 0.277 0.178 0.111 0.070 0.039 0.018 0.008 0.005 263 V 0.001 0.004 0.007 0.010 0.012 0.024 0.076 0.102 0.201 0.275 0.287 264 L 0.035 0.029 0.023 0.116 0.167 0.175 0.192 0.110 0.078 0.047 0.028 265 G 0.118 0.092 0.116 0.276 0.156 0.102 0.071 0.037 0.021 0.008 0.002 266 F 0.001 0.003 0.004 0.012 0.018 0.029 0.094 0.150 0.231 0.249 0.211 267 L 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.015 0.066 0.133 0.270 0.262 0.242 268 K 0.012 0.027 0.263 0.209 0.196 0.132 0.094 0.033 0.019 0.011 0.004 269 H 0.009 0.030 0.164 0.189 0.171 0.198 0.155 0.058 0.017 0.007 0.002 270 I 0.001 0.001 0.003 0.003 0.003 0.008 0.052 0.094 0.257 0.306 0.272 271 R 0.011 0.016 0.037 0.060 0.094 0.158 0.294 0.144 0.091 0.065 0.031 272 T 0.021 0.051 0.492 0.189 0.099 0.066 0.044 0.017 0.012 0.008 0.003 273 Q 0.011 0.026 0.074 0.098 0.103 0.170 0.289 0.111 0.059 0.037 0.021 274 R 0.019 0.023 0.028 0.046 0.041 0.068 0.185 0.159 0.174 0.156 0.100 275 N 0.048 0.049 0.097 0.147 0.129 0.140 0.171 0.082 0.065 0.045 0.027 276 Y 0.057 0.064 0.155 0.164 0.143 0.132 0.136 0.065 0.046 0.026 0.013 277 L 0.022 0.020 0.038 0.069 0.066 0.082 0.182 0.139 0.155 0.129 0.097 278 V 0.030 0.026 0.037 0.046 0.049 0.070 0.164 0.155 0.168 0.142 0.113 279 Q 0.040 0.110 0.111 0.174 0.133 0.113 0.132 0.077 0.053 0.034 0.023 280 T 0.070 0.116 0.092 0.120 0.115 0.125 0.141 0.090 0.068 0.041 0.023 281 E 0.320 0.157 0.083 0.168 0.121 0.076 0.042 0.018 0.011 0.005 0.002 282 E 0.283 0.128 0.102 0.166 0.103 0.085 0.070 0.030 0.020 0.009 0.003 283 Q 0.014 0.035 0.044 0.089 0.099 0.131 0.214 0.132 0.116 0.080 0.047 284 Y 0.003 0.006 0.030 0.031 0.040 0.088 0.217 0.150 0.177 0.154 0.105 285 I 0.013 0.026 0.267 0.218 0.149 0.126 0.115 0.042 0.022 0.016 0.007 286 F 0.003 0.011 0.055 0.083 0.084 0.131 0.261 0.172 0.094 0.072 0.035 287 I 0.001 0.002 0.006 0.005 0.007 0.016 0.061 0.113 0.248 0.284 0.257 288 H 0.005 0.008 0.022 0.045 0.080 0.147 0.248 0.157 0.141 0.095 0.052 289 D 0.028 0.049 0.220 0.243 0.193 0.124 0.079 0.034 0.019 0.009 0.003 290 A 0.001 0.002 0.005 0.013 0.021 0.045 0.183 0.190 0.203 0.187 0.149 291 L 0.001 0.002 0.006 0.006 0.008 0.014 0.058 0.113 0.248 0.283 0.262 292 L 0.002 0.005 0.056 0.052 0.086 0.127 0.232 0.134 0.131 0.109 0.065 293 E 0.010 0.027 0.223 0.182 0.164 0.152 0.144 0.050 0.027 0.015 0.007 294 A 0.004 0.007 0.023 0.037 0.035 0.062 0.208 0.168 0.192 0.162 0.102 295 I 0.012 0.011 0.022 0.024 0.030 0.054 0.172 0.173 0.188 0.182 0.132 296 L 0.061 0.097 0.160 0.191 0.143 0.118 0.116 0.051 0.032 0.019 0.011 297 G 0.138 0.126 0.175 0.152 0.125 0.106 0.090 0.041 0.026 0.014 0.007