# TARGET T0301 # Using neural net dunbrack-30pc-1763-t2k-thin90-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-t3c1-near-backbone-11-from-empty.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0301.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 13.8594 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.173 0.103 0.070 0.124 0.109 0.105 0.122 0.077 0.058 0.037 0.021 2 A 0.241 0.174 0.095 0.140 0.106 0.081 0.068 0.041 0.029 0.015 0.009 3 H 0.142 0.134 0.065 0.144 0.117 0.107 0.118 0.076 0.052 0.029 0.016 4 P 0.136 0.114 0.080 0.130 0.125 0.104 0.107 0.073 0.058 0.041 0.031 5 P 0.179 0.150 0.075 0.194 0.128 0.093 0.086 0.043 0.030 0.015 0.008 6 Q 0.143 0.108 0.100 0.183 0.140 0.098 0.084 0.052 0.043 0.031 0.018 7 I 0.024 0.030 0.020 0.056 0.070 0.105 0.212 0.151 0.137 0.118 0.077 8 R 0.080 0.163 0.083 0.250 0.174 0.101 0.060 0.046 0.023 0.013 0.005 9 I 0.003 0.003 0.003 0.005 0.013 0.040 0.098 0.183 0.230 0.239 0.183 10 P 0.131 0.227 0.060 0.247 0.180 0.085 0.031 0.022 0.011 0.004 0.002 11 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.006 0.013 0.051 0.083 0.209 0.297 0.335 12 T 0.049 0.064 0.041 0.140 0.140 0.098 0.117 0.100 0.097 0.078 0.077 13 Y 0.004 0.008 0.011 0.037 0.038 0.057 0.151 0.134 0.197 0.196 0.168 14 L 0.013 0.022 0.031 0.060 0.070 0.082 0.134 0.133 0.146 0.161 0.146 15 R 0.022 0.032 0.021 0.079 0.085 0.114 0.187 0.142 0.145 0.104 0.069 16 G 0.065 0.057 0.048 0.101 0.100 0.106 0.131 0.105 0.121 0.097 0.068 17 G 0.042 0.038 0.020 0.068 0.079 0.105 0.176 0.136 0.133 0.111 0.093 18 T 0.046 0.064 0.028 0.095 0.090 0.096 0.144 0.124 0.126 0.101 0.087 19 S 0.020 0.028 0.019 0.051 0.057 0.071 0.137 0.124 0.154 0.165 0.175 20 K 0.058 0.082 0.037 0.149 0.147 0.135 0.142 0.086 0.075 0.052 0.037 21 G 0.040 0.040 0.029 0.097 0.104 0.117 0.151 0.110 0.139 0.102 0.070 22 V 0.011 0.015 0.011 0.057 0.076 0.100 0.212 0.155 0.149 0.122 0.092 23 F 0.009 0.011 0.020 0.048 0.048 0.051 0.121 0.137 0.192 0.197 0.164 24 F 0.004 0.005 0.016 0.019 0.027 0.039 0.108 0.145 0.202 0.228 0.209 25 R 0.013 0.043 0.060 0.118 0.138 0.133 0.175 0.128 0.093 0.061 0.039 26 L 0.015 0.018 0.029 0.056 0.068 0.096 0.182 0.134 0.158 0.140 0.103 27 E 0.244 0.120 0.109 0.192 0.134 0.084 0.063 0.024 0.018 0.009 0.004 28 D 0.088 0.082 0.061 0.143 0.107 0.110 0.165 0.094 0.071 0.051 0.027 29 L 0.018 0.028 0.013 0.034 0.049 0.080 0.191 0.199 0.155 0.129 0.105 30 P 0.126 0.128 0.077 0.140 0.123 0.106 0.101 0.078 0.058 0.037 0.027 31 E 0.281 0.158 0.137 0.176 0.114 0.062 0.036 0.016 0.012 0.006 0.003 32 S 0.243 0.113 0.055 0.147 0.131 0.093 0.090 0.049 0.042 0.024 0.013 33 C 0.039 0.021 0.011 0.034 0.042 0.066 0.168 0.141 0.188 0.156 0.135 34 R 0.136 0.178 0.128 0.229 0.127 0.077 0.060 0.030 0.018 0.010 0.006 35 V 0.047 0.068 0.066 0.094 0.091 0.111 0.171 0.131 0.092 0.076 0.053 36 P 0.284 0.226 0.069 0.132 0.102 0.071 0.050 0.033 0.020 0.009 0.005 37 G 0.458 0.138 0.048 0.096 0.080 0.062 0.047 0.028 0.025 0.011 0.005 38 E 0.474 0.162 0.073 0.121 0.077 0.043 0.025 0.011 0.008 0.003 0.002 39 A 0.075 0.099 0.052 0.130 0.108 0.114 0.173 0.097 0.077 0.047 0.030 40 R 0.024 0.057 0.065 0.102 0.104 0.125 0.181 0.123 0.095 0.073 0.050 41 D 0.053 0.073 0.162 0.197 0.151 0.142 0.110 0.051 0.034 0.019 0.009 42 R 0.069 0.064 0.160 0.207 0.172 0.145 0.098 0.045 0.024 0.011 0.004 43 L 0.003 0.006 0.011 0.025 0.036 0.060 0.170 0.181 0.197 0.181 0.129 44 F 0.002 0.003 0.010 0.016 0.023 0.038 0.111 0.151 0.215 0.224 0.206 45 M 0.003 0.007 0.053 0.048 0.068 0.091 0.161 0.141 0.162 0.156 0.110 46 R 0.006 0.018 0.067 0.125 0.156 0.169 0.197 0.112 0.073 0.049 0.029 47 V 0.001 0.002 0.004 0.007 0.010 0.020 0.075 0.117 0.225 0.280 0.257 48 I 0.009 0.009 0.009 0.026 0.038 0.056 0.135 0.180 0.199 0.184 0.155 49 G 0.026 0.033 0.039 0.066 0.074 0.088 0.136 0.137 0.157 0.129 0.116 50 S 0.051 0.060 0.036 0.089 0.102 0.119 0.159 0.110 0.112 0.084 0.079 51 P 0.137 0.122 0.032 0.117 0.098 0.091 0.122 0.082 0.086 0.063 0.049 52 D 0.151 0.111 0.024 0.111 0.095 0.094 0.135 0.085 0.080 0.062 0.050 53 P 0.235 0.183 0.046 0.151 0.113 0.082 0.075 0.044 0.035 0.022 0.016 54 Y 0.128 0.116 0.041 0.129 0.117 0.104 0.116 0.078 0.078 0.055 0.037 55 A 0.105 0.080 0.049 0.135 0.131 0.123 0.133 0.076 0.075 0.054 0.039 56 A 0.046 0.046 0.051 0.132 0.115 0.117 0.175 0.093 0.092 0.078 0.054 57 H 0.022 0.037 0.048 0.111 0.111 0.110 0.162 0.132 0.109 0.097 0.061 58 I 0.003 0.004 0.006 0.010 0.017 0.034 0.091 0.145 0.213 0.244 0.233 59 D 0.036 0.055 0.053 0.115 0.125 0.128 0.137 0.115 0.101 0.074 0.060 60 G 0.021 0.031 0.026 0.074 0.086 0.100 0.150 0.125 0.147 0.133 0.106 61 M 0.027 0.024 0.013 0.045 0.057 0.071 0.127 0.123 0.174 0.168 0.171 62 G 0.033 0.035 0.015 0.074 0.078 0.094 0.166 0.127 0.148 0.125 0.104 63 G 0.037 0.046 0.032 0.107 0.101 0.093 0.133 0.109 0.123 0.118 0.101 64 A 0.016 0.014 0.011 0.027 0.036 0.054 0.119 0.130 0.191 0.203 0.200 65 T 0.060 0.087 0.038 0.141 0.133 0.118 0.133 0.098 0.087 0.060 0.046 66 S 0.027 0.027 0.020 0.050 0.055 0.074 0.138 0.121 0.164 0.166 0.158 67 S 0.073 0.090 0.032 0.134 0.137 0.120 0.140 0.097 0.078 0.057 0.042 68 T 0.047 0.053 0.026 0.100 0.092 0.100 0.146 0.117 0.133 0.106 0.080 69 S 0.018 0.025 0.018 0.063 0.080 0.095 0.151 0.120 0.150 0.146 0.135 70 K 0.009 0.021 0.016 0.080 0.110 0.136 0.207 0.134 0.132 0.094 0.062 71 C 0.002 0.003 0.007 0.025 0.035 0.052 0.133 0.142 0.203 0.210 0.189 72 V 0.001 0.002 0.005 0.016 0.031 0.048 0.153 0.195 0.196 0.189 0.164 73 I 0.001 0.002 0.008 0.015 0.017 0.018 0.062 0.123 0.218 0.262 0.273 74 L 0.001 0.001 0.004 0.005 0.011 0.019 0.068 0.118 0.224 0.263 0.286 75 S 0.031 0.044 0.087 0.148 0.158 0.128 0.163 0.089 0.076 0.047 0.029 76 K 0.068 0.079 0.068 0.180 0.159 0.142 0.155 0.070 0.045 0.023 0.010 77 S 0.103 0.057 0.027 0.052 0.059 0.081 0.161 0.145 0.137 0.103 0.074 78 S 0.265 0.253 0.036 0.153 0.097 0.069 0.063 0.035 0.016 0.008 0.005 79 Q 0.316 0.192 0.070 0.101 0.095 0.069 0.056 0.040 0.030 0.019 0.012 80 P 0.415 0.207 0.044 0.123 0.092 0.053 0.032 0.016 0.010 0.005 0.003 81 G 0.440 0.170 0.049 0.116 0.093 0.059 0.030 0.018 0.015 0.006 0.003 82 H 0.027 0.023 0.011 0.041 0.059 0.095 0.177 0.163 0.158 0.133 0.113 83 D 0.030 0.085 0.046 0.170 0.140 0.121 0.132 0.111 0.076 0.050 0.040 84 V 0.002 0.003 0.006 0.009 0.014 0.027 0.072 0.116 0.209 0.273 0.270 85 D 0.041 0.070 0.068 0.189 0.199 0.160 0.112 0.072 0.047 0.026 0.016 86 Y 0.003 0.005 0.007 0.028 0.038 0.060 0.148 0.141 0.201 0.202 0.168 87 L 0.006 0.011 0.010 0.039 0.050 0.058 0.133 0.161 0.193 0.187 0.153 88 Y 0.002 0.004 0.007 0.020 0.027 0.040 0.107 0.133 0.211 0.229 0.220 89 G 0.008 0.016 0.041 0.073 0.093 0.106 0.182 0.136 0.141 0.122 0.083 90 Q 0.008 0.013 0.023 0.078 0.103 0.114 0.190 0.153 0.139 0.109 0.069 91 V 0.004 0.003 0.005 0.008 0.013 0.026 0.092 0.134 0.233 0.256 0.226 92 S 0.058 0.110 0.056 0.201 0.162 0.116 0.119 0.087 0.047 0.027 0.017 93 I 0.006 0.009 0.006 0.011 0.020 0.036 0.099 0.144 0.197 0.227 0.243 94 D 0.269 0.274 0.046 0.172 0.116 0.057 0.032 0.017 0.010 0.004 0.003 95 K 0.288 0.143 0.040 0.142 0.116 0.089 0.072 0.038 0.038 0.023 0.012 96 P 0.278 0.120 0.041 0.123 0.113 0.091 0.092 0.048 0.046 0.030 0.018 97 F 0.078 0.078 0.029 0.146 0.123 0.117 0.157 0.111 0.079 0.052 0.030 98 V 0.008 0.009 0.011 0.015 0.024 0.046 0.099 0.156 0.203 0.219 0.208 99 D 0.063 0.122 0.096 0.189 0.135 0.112 0.100 0.068 0.050 0.033 0.031 100 W 0.036 0.046 0.031 0.079 0.084 0.098 0.154 0.117 0.129 0.126 0.101 101 S 0.181 0.122 0.034 0.122 0.108 0.091 0.097 0.075 0.074 0.055 0.041 102 G 0.172 0.133 0.031 0.141 0.116 0.111 0.106 0.066 0.064 0.037 0.023 103 N 0.072 0.077 0.033 0.106 0.104 0.105 0.124 0.098 0.112 0.097 0.073 104 C 0.018 0.024 0.014 0.064 0.076 0.104 0.182 0.132 0.141 0.127 0.118 105 G 0.014 0.026 0.030 0.082 0.091 0.105 0.162 0.127 0.142 0.124 0.098 106 N 0.003 0.007 0.013 0.045 0.056 0.080 0.164 0.142 0.161 0.169 0.160 107 L 0.001 0.002 0.005 0.013 0.023 0.036 0.097 0.131 0.215 0.245 0.231 108 S 0.001 0.002 0.005 0.018 0.031 0.048 0.125 0.159 0.209 0.206 0.196 109 T 0.001 0.002 0.006 0.012 0.019 0.028 0.081 0.120 0.220 0.246 0.265 110 G 0.001 0.003 0.006 0.020 0.037 0.056 0.147 0.175 0.204 0.187 0.165 111 A 0.001 0.002 0.004 0.011 0.018 0.028 0.086 0.124 0.219 0.246 0.263 112 G 0.001 0.002 0.004 0.013 0.027 0.055 0.149 0.167 0.226 0.189 0.166 113 A 0.002 0.004 0.010 0.036 0.057 0.083 0.187 0.171 0.188 0.145 0.115 114 F 0.002 0.002 0.007 0.019 0.033 0.051 0.166 0.180 0.204 0.183 0.154 115 A 0.002 0.003 0.009 0.017 0.021 0.026 0.091 0.138 0.216 0.236 0.242 116 L 0.001 0.002 0.007 0.009 0.016 0.026 0.093 0.133 0.210 0.251 0.253 117 H 0.013 0.037 0.059 0.122 0.157 0.156 0.191 0.113 0.076 0.049 0.027 118 A 0.048 0.057 0.074 0.167 0.162 0.163 0.151 0.073 0.056 0.032 0.016 119 G 0.110 0.061 0.060 0.122 0.108 0.115 0.176 0.092 0.080 0.052 0.024 120 L 0.031 0.032 0.018 0.074 0.076 0.087 0.179 0.181 0.131 0.117 0.075 121 V 0.005 0.007 0.006 0.009 0.020 0.044 0.105 0.197 0.215 0.197 0.196 122 D 0.098 0.213 0.086 0.261 0.145 0.078 0.052 0.030 0.018 0.010 0.009 123 P 0.172 0.076 0.042 0.105 0.115 0.098 0.117 0.069 0.082 0.072 0.053 124 A 0.478 0.142 0.031 0.132 0.079 0.042 0.042 0.018 0.018 0.011 0.007 125 R 0.281 0.191 0.031 0.153 0.100 0.071 0.077 0.044 0.029 0.015 0.008 126 I 0.077 0.065 0.015 0.041 0.058 0.080 0.139 0.179 0.139 0.112 0.094 127 P 0.419 0.319 0.067 0.108 0.049 0.020 0.008 0.005 0.002 0.001 0.001 128 E 0.474 0.192 0.049 0.098 0.081 0.047 0.027 0.015 0.010 0.005 0.002 129 D 0.598 0.155 0.033 0.074 0.059 0.034 0.020 0.011 0.009 0.004 0.002 130 G 0.184 0.144 0.035 0.141 0.122 0.115 0.117 0.063 0.047 0.021 0.011 131 I 0.068 0.091 0.099 0.184 0.137 0.114 0.109 0.077 0.055 0.040 0.026 132 C 0.006 0.012 0.022 0.034 0.048 0.084 0.173 0.169 0.168 0.159 0.125 133 E 0.024 0.065 0.081 0.203 0.201 0.175 0.114 0.071 0.040 0.019 0.009 134 V 0.002 0.002 0.006 0.010 0.014 0.030 0.088 0.125 0.225 0.266 0.232 135 R 0.017 0.027 0.026 0.115 0.158 0.154 0.195 0.147 0.084 0.048 0.029 136 I 0.001 0.001 0.005 0.006 0.007 0.011 0.041 0.078 0.212 0.304 0.334 137 W 0.006 0.012 0.023 0.044 0.079 0.107 0.190 0.164 0.154 0.124 0.097 138 Q 0.019 0.028 0.067 0.110 0.099 0.106 0.164 0.107 0.131 0.102 0.068 139 A 0.046 0.048 0.065 0.137 0.130 0.146 0.200 0.092 0.067 0.044 0.026 140 N 0.049 0.057 0.036 0.091 0.074 0.084 0.167 0.144 0.126 0.103 0.069 141 I 0.027 0.041 0.017 0.046 0.060 0.091 0.171 0.171 0.154 0.123 0.099 142 G 0.175 0.169 0.100 0.178 0.144 0.098 0.060 0.031 0.024 0.013 0.008 143 K 0.150 0.095 0.063 0.162 0.152 0.126 0.115 0.055 0.043 0.025 0.013 144 T 0.054 0.053 0.032 0.120 0.125 0.113 0.159 0.118 0.104 0.072 0.049 145 I 0.003 0.004 0.004 0.011 0.015 0.027 0.096 0.140 0.219 0.246 0.235 146 I 0.012 0.029 0.062 0.125 0.145 0.128 0.149 0.115 0.093 0.079 0.063 147 A 0.008 0.013 0.044 0.059 0.063 0.080 0.163 0.129 0.157 0.166 0.118 148 H 0.040 0.051 0.039 0.162 0.183 0.149 0.151 0.103 0.064 0.038 0.018 149 V 0.005 0.003 0.003 0.006 0.009 0.021 0.072 0.115 0.234 0.276 0.255 150 P 0.116 0.178 0.056 0.229 0.159 0.095 0.074 0.044 0.024 0.014 0.010 151 V 0.024 0.029 0.013 0.029 0.040 0.059 0.126 0.153 0.176 0.185 0.167 152 S 0.284 0.264 0.031 0.131 0.102 0.066 0.048 0.033 0.021 0.011 0.009 153 G 0.476 0.211 0.028 0.105 0.075 0.044 0.025 0.015 0.013 0.006 0.003 154 G 0.332 0.108 0.022 0.082 0.094 0.082 0.080 0.061 0.065 0.044 0.030 155 Q 0.176 0.146 0.037 0.175 0.133 0.099 0.097 0.054 0.045 0.023 0.016 156 V 0.014 0.017 0.020 0.042 0.044 0.060 0.140 0.133 0.175 0.190 0.167 157 Q 0.041 0.072 0.104 0.166 0.136 0.114 0.131 0.080 0.060 0.051 0.043 158 E 0.036 0.060 0.058 0.129 0.109 0.122 0.177 0.112 0.090 0.068 0.039 159 T 0.106 0.108 0.062 0.161 0.143 0.113 0.107 0.078 0.056 0.041 0.024 160 G 0.086 0.062 0.021 0.069 0.081 0.103 0.155 0.135 0.137 0.095 0.055 161 D 0.186 0.147 0.058 0.194 0.159 0.096 0.061 0.041 0.031 0.017 0.009 162 F 0.013 0.010 0.010 0.021 0.031 0.051 0.125 0.125 0.188 0.216 0.210 163 E 0.063 0.135 0.049 0.229 0.182 0.111 0.093 0.066 0.036 0.022 0.013 164 L 0.002 0.002 0.003 0.005 0.010 0.021 0.063 0.114 0.203 0.273 0.304 165 D 0.128 0.140 0.051 0.199 0.164 0.109 0.084 0.053 0.035 0.021 0.015 166 G 0.101 0.079 0.037 0.131 0.115 0.095 0.108 0.092 0.110 0.083 0.049 167 V 0.027 0.020 0.007 0.025 0.040 0.059 0.118 0.134 0.187 0.188 0.196 168 T 0.109 0.167 0.030 0.199 0.138 0.099 0.104 0.067 0.047 0.024 0.015 169 F 0.040 0.031 0.025 0.053 0.060 0.069 0.117 0.118 0.147 0.171 0.171 170 P 0.189 0.228 0.047 0.179 0.127 0.082 0.067 0.038 0.023 0.012 0.007 171 A 0.078 0.091 0.030 0.138 0.124 0.104 0.129 0.097 0.093 0.070 0.046 172 A 0.062 0.048 0.016 0.057 0.077 0.094 0.150 0.142 0.144 0.125 0.086 173 E 0.176 0.190 0.067 0.258 0.178 0.078 0.027 0.014 0.007 0.002 0.001 174 I 0.002 0.002 0.003 0.004 0.009 0.022 0.072 0.130 0.212 0.291 0.253 175 V 0.026 0.077 0.033 0.189 0.204 0.148 0.124 0.102 0.052 0.028 0.017 176 L 0.001 0.001 0.003 0.004 0.007 0.016 0.053 0.102 0.222 0.306 0.283 177 E 0.029 0.083 0.065 0.246 0.248 0.152 0.094 0.045 0.020 0.011 0.007 178 F 0.002 0.003 0.004 0.012 0.013 0.024 0.082 0.106 0.229 0.287 0.237 179 L 0.027 0.024 0.018 0.062 0.087 0.100 0.163 0.148 0.142 0.129 0.099 180 D 0.047 0.068 0.041 0.130 0.114 0.118 0.160 0.121 0.099 0.063 0.039 181 P 0.029 0.033 0.023 0.053 0.059 0.070 0.122 0.137 0.161 0.158 0.155 182 S 0.118 0.082 0.025 0.082 0.087 0.090 0.138 0.109 0.113 0.082 0.073 183 D 0.278 0.195 0.065 0.171 0.104 0.061 0.052 0.026 0.023 0.014 0.010 184 D 0.229 0.157 0.042 0.138 0.118 0.093 0.096 0.051 0.038 0.024 0.016 185 G 0.359 0.160 0.037 0.098 0.081 0.067 0.068 0.049 0.044 0.024 0.015 186 E 0.301 0.178 0.062 0.144 0.100 0.074 0.058 0.033 0.026 0.015 0.010 187 D 0.150 0.157 0.069 0.141 0.126 0.106 0.103 0.061 0.044 0.027 0.017 188 G 0.080 0.088 0.045 0.125 0.115 0.109 0.136 0.101 0.086 0.065 0.049 189 G 0.107 0.081 0.063 0.127 0.126 0.127 0.126 0.083 0.078 0.050 0.031 190 A 0.061 0.072 0.074 0.185 0.161 0.132 0.123 0.071 0.060 0.039 0.022 191 I 0.007 0.008 0.011 0.030 0.041 0.065 0.159 0.149 0.183 0.190 0.157 192 F 0.015 0.019 0.026 0.055 0.059 0.071 0.135 0.148 0.170 0.162 0.140 193 P 0.013 0.027 0.034 0.067 0.078 0.097 0.161 0.157 0.145 0.124 0.096 194 T 0.030 0.042 0.032 0.071 0.081 0.091 0.135 0.138 0.142 0.127 0.110 195 G 0.130 0.085 0.029 0.098 0.110 0.112 0.128 0.101 0.101 0.064 0.041 196 N 0.170 0.147 0.053 0.178 0.135 0.090 0.082 0.049 0.046 0.030 0.020 197 L 0.040 0.048 0.014 0.073 0.078 0.091 0.175 0.137 0.136 0.118 0.089 198 V 0.040 0.047 0.026 0.103 0.112 0.108 0.147 0.111 0.115 0.101 0.090 199 D 0.053 0.060 0.068 0.148 0.116 0.105 0.158 0.089 0.085 0.072 0.044 200 D 0.048 0.058 0.043 0.191 0.195 0.133 0.127 0.094 0.053 0.038 0.018 201 L 0.004 0.002 0.002 0.003 0.006 0.015 0.051 0.113 0.249 0.287 0.269 202 E 0.103 0.221 0.052 0.282 0.178 0.078 0.042 0.025 0.011 0.005 0.003 203 V 0.011 0.008 0.005 0.010 0.017 0.031 0.089 0.137 0.204 0.252 0.237 204 P 0.420 0.251 0.037 0.138 0.080 0.034 0.018 0.010 0.007 0.003 0.003 205 G 0.367 0.257 0.030 0.118 0.079 0.053 0.042 0.023 0.019 0.008 0.003 206 V 0.264 0.129 0.021 0.102 0.105 0.082 0.082 0.070 0.056 0.047 0.042 207 G 0.312 0.220 0.028 0.120 0.096 0.077 0.066 0.039 0.027 0.011 0.006 208 T 0.152 0.196 0.082 0.244 0.158 0.076 0.036 0.026 0.016 0.009 0.004 209 F 0.003 0.003 0.002 0.006 0.015 0.039 0.103 0.143 0.209 0.238 0.240 210 K 0.033 0.092 0.039 0.266 0.246 0.153 0.082 0.050 0.025 0.010 0.005 211 A 0.001 0.001 0.002 0.004 0.007 0.015 0.055 0.095 0.196 0.298 0.329 212 T 0.004 0.008 0.014 0.044 0.066 0.073 0.144 0.184 0.170 0.150 0.143 213 M 0.001 0.001 0.003 0.007 0.010 0.016 0.055 0.112 0.232 0.288 0.278 214 I 0.002 0.004 0.009 0.014 0.029 0.049 0.099 0.147 0.210 0.212 0.224 215 N 0.011 0.025 0.023 0.081 0.099 0.124 0.182 0.148 0.148 0.092 0.065 216 A 0.007 0.011 0.010 0.037 0.046 0.070 0.148 0.137 0.177 0.182 0.175 217 G 0.018 0.026 0.013 0.057 0.064 0.085 0.165 0.146 0.165 0.140 0.121 218 I 0.004 0.010 0.008 0.043 0.056 0.076 0.169 0.138 0.161 0.167 0.168 219 P 0.005 0.009 0.010 0.037 0.050 0.074 0.160 0.141 0.182 0.176 0.156 220 T 0.006 0.010 0.013 0.074 0.100 0.113 0.192 0.147 0.145 0.113 0.088 221 V 0.001 0.002 0.004 0.010 0.016 0.026 0.094 0.141 0.227 0.260 0.220 222 F 0.001 0.002 0.005 0.018 0.029 0.033 0.102 0.161 0.218 0.227 0.205 223 V 0.001 0.001 0.007 0.005 0.010 0.018 0.062 0.143 0.245 0.276 0.230 224 N 0.008 0.056 0.041 0.191 0.221 0.174 0.151 0.093 0.039 0.016 0.008 225 A 0.002 0.003 0.004 0.006 0.010 0.023 0.077 0.107 0.219 0.264 0.285 226 E 0.152 0.123 0.061 0.267 0.177 0.094 0.080 0.022 0.013 0.008 0.004 227 E 0.204 0.167 0.114 0.218 0.128 0.075 0.049 0.024 0.013 0.006 0.002 228 I 0.006 0.004 0.003 0.007 0.015 0.042 0.132 0.188 0.214 0.202 0.185 229 G 0.206 0.246 0.089 0.181 0.111 0.073 0.045 0.025 0.015 0.006 0.003 230 Y 0.053 0.055 0.089 0.098 0.090 0.098 0.141 0.100 0.102 0.100 0.074 231 R 0.145 0.222 0.064 0.172 0.134 0.096 0.082 0.044 0.022 0.011 0.008 232 G 0.135 0.079 0.025 0.092 0.086 0.105 0.145 0.113 0.119 0.065 0.035 233 T 0.398 0.150 0.088 0.142 0.089 0.051 0.034 0.020 0.015 0.009 0.005 234 E 0.074 0.105 0.055 0.170 0.142 0.129 0.153 0.073 0.053 0.029 0.017 235 L 0.022 0.045 0.036 0.068 0.060 0.073 0.160 0.147 0.152 0.138 0.099 236 R 0.064 0.071 0.093 0.191 0.189 0.148 0.132 0.052 0.032 0.020 0.010 237 E 0.234 0.106 0.307 0.187 0.078 0.042 0.026 0.009 0.007 0.003 0.001 238 E 0.080 0.076 0.076 0.178 0.149 0.134 0.165 0.077 0.038 0.020 0.008 239 I 0.015 0.011 0.011 0.012 0.021 0.050 0.168 0.203 0.213 0.172 0.124 240 N 0.225 0.225 0.205 0.210 0.082 0.032 0.013 0.005 0.002 0.001 0.001 241 G 0.242 0.209 0.161 0.106 0.095 0.079 0.050 0.030 0.017 0.008 0.003 242 D 0.333 0.211 0.044 0.108 0.092 0.072 0.062 0.039 0.023 0.009 0.006 243 P 0.518 0.140 0.040 0.098 0.070 0.054 0.040 0.019 0.013 0.005 0.002 244 Q 0.338 0.160 0.188 0.158 0.081 0.039 0.018 0.008 0.006 0.002 0.001 245 Q 0.016 0.050 0.064 0.092 0.092 0.139 0.231 0.131 0.096 0.055 0.034 246 L 0.008 0.017 0.049 0.080 0.090 0.138 0.248 0.140 0.107 0.078 0.045 247 A 0.060 0.051 0.419 0.206 0.092 0.068 0.056 0.024 0.013 0.008 0.003 248 R 0.012 0.060 0.132 0.171 0.171 0.184 0.154 0.074 0.028 0.011 0.003 249 F 0.001 0.001 0.006 0.005 0.007 0.021 0.085 0.123 0.248 0.266 0.239 250 E 0.032 0.041 0.126 0.179 0.203 0.174 0.148 0.050 0.027 0.014 0.005 251 R 0.023 0.047 0.334 0.259 0.146 0.094 0.058 0.024 0.009 0.004 0.001 252 I 0.001 0.001 0.005 0.003 0.004 0.012 0.068 0.102 0.217 0.287 0.300 253 R 0.003 0.009 0.025 0.038 0.066 0.126 0.251 0.180 0.145 0.104 0.053 254 V 0.005 0.017 0.220 0.133 0.104 0.117 0.145 0.080 0.077 0.065 0.036 255 A 0.008 0.018 0.063 0.096 0.130 0.200 0.273 0.118 0.051 0.028 0.014 256 G 0.004 0.004 0.007 0.016 0.015 0.024 0.093 0.147 0.236 0.258 0.196 257 A 0.013 0.010 0.025 0.032 0.040 0.058 0.132 0.140 0.189 0.186 0.175 258 L 0.011 0.035 0.072 0.114 0.124 0.121 0.174 0.102 0.103 0.082 0.063 259 R 0.014 0.032 0.042 0.102 0.114 0.138 0.212 0.123 0.102 0.075 0.046 260 M 0.030 0.021 0.021 0.059 0.061 0.081 0.165 0.146 0.159 0.149 0.110 261 G 0.108 0.100 0.064 0.157 0.135 0.122 0.130 0.080 0.057 0.031 0.016 262 L 0.014 0.019 0.020 0.044 0.045 0.055 0.129 0.135 0.184 0.186 0.168 263 I 0.051 0.036 0.029 0.060 0.089 0.113 0.191 0.137 0.127 0.094 0.074 264 K 0.183 0.190 0.156 0.246 0.101 0.051 0.037 0.015 0.011 0.006 0.003 265 T 0.065 0.118 0.047 0.117 0.119 0.130 0.176 0.106 0.063 0.039 0.021 266 P 0.127 0.083 0.026 0.088 0.093 0.106 0.159 0.120 0.101 0.058 0.037 267 E 0.476 0.144 0.123 0.135 0.067 0.030 0.014 0.005 0.003 0.001 0.001 268 E 0.151 0.126 0.132 0.222 0.158 0.098 0.070 0.025 0.012 0.005 0.002 269 A 0.017 0.015 0.029 0.026 0.029 0.047 0.153 0.155 0.197 0.179 0.154 270 A 0.059 0.096 0.140 0.193 0.163 0.134 0.127 0.049 0.022 0.012 0.005 271 T 0.114 0.129 0.479 0.152 0.069 0.032 0.014 0.006 0.003 0.001 0.001 272 R 0.115 0.070 0.090 0.109 0.120 0.158 0.174 0.083 0.047 0.023 0.011 273 Q 0.338 0.176 0.108 0.123 0.082 0.067 0.051 0.027 0.018 0.007 0.003 274 H 0.071 0.078 0.096 0.136 0.121 0.127 0.144 0.100 0.062 0.042 0.023 275 T 0.044 0.070 0.079 0.101 0.115 0.143 0.154 0.123 0.083 0.051 0.037 276 P 0.020 0.034 0.043 0.096 0.094 0.124 0.162 0.123 0.131 0.096 0.077 277 K 0.011 0.021 0.028 0.094 0.122 0.144 0.198 0.122 0.109 0.088 0.064 278 I 0.002 0.004 0.006 0.028 0.036 0.051 0.135 0.146 0.206 0.207 0.178 279 A 0.001 0.002 0.004 0.013 0.020 0.030 0.096 0.143 0.214 0.241 0.237 280 F 0.001 0.003 0.011 0.016 0.022 0.027 0.077 0.130 0.219 0.254 0.241 281 V 0.002 0.003 0.010 0.017 0.031 0.047 0.126 0.160 0.214 0.206 0.184 282 A 0.021 0.025 0.041 0.067 0.083 0.100 0.171 0.146 0.152 0.111 0.085 283 P 0.063 0.104 0.049 0.165 0.141 0.127 0.152 0.087 0.060 0.033 0.019 284 P 0.080 0.062 0.023 0.061 0.071 0.087 0.157 0.139 0.135 0.107 0.078 285 R 0.266 0.174 0.043 0.152 0.117 0.082 0.075 0.039 0.026 0.015 0.010 286 D 0.345 0.202 0.077 0.151 0.102 0.056 0.033 0.016 0.011 0.005 0.002 287 Y 0.125 0.062 0.037 0.086 0.100 0.109 0.154 0.106 0.097 0.073 0.053 288 R 0.192 0.140 0.076 0.164 0.119 0.095 0.095 0.049 0.037 0.021 0.013 289 T 0.075 0.094 0.089 0.154 0.119 0.104 0.127 0.089 0.066 0.051 0.032 290 A 0.056 0.080 0.043 0.083 0.096 0.114 0.158 0.143 0.096 0.074 0.057 291 S 0.224 0.190 0.056 0.159 0.116 0.086 0.063 0.046 0.033 0.017 0.009 292 G 0.328 0.130 0.063 0.121 0.111 0.082 0.059 0.037 0.036 0.021 0.012 293 K 0.238 0.127 0.050 0.159 0.127 0.093 0.091 0.044 0.038 0.021 0.012 294 L 0.057 0.045 0.028 0.088 0.084 0.094 0.176 0.131 0.128 0.099 0.070 295 V 0.050 0.058 0.065 0.091 0.083 0.093 0.148 0.119 0.109 0.096 0.088 296 A 0.107 0.188 0.113 0.219 0.133 0.089 0.075 0.038 0.021 0.011 0.006 297 A 0.202 0.114 0.066 0.116 0.107 0.094 0.102 0.073 0.057 0.042 0.028 298 G 0.452 0.213 0.040 0.114 0.076 0.045 0.029 0.015 0.010 0.004 0.002 299 D 0.347 0.213 0.060 0.140 0.105 0.061 0.033 0.020 0.014 0.006 0.002 300 I 0.024 0.020 0.011 0.028 0.050 0.090 0.162 0.165 0.178 0.148 0.124 301 D 0.083 0.138 0.090 0.247 0.187 0.124 0.067 0.035 0.019 0.007 0.003 302 L 0.002 0.003 0.009 0.015 0.022 0.041 0.114 0.144 0.192 0.241 0.218 303 L 0.006 0.015 0.024 0.068 0.089 0.102 0.170 0.171 0.144 0.113 0.098 304 V 0.001 0.002 0.007 0.012 0.015 0.027 0.080 0.112 0.240 0.269 0.235 305 R 0.006 0.011 0.037 0.073 0.110 0.127 0.199 0.138 0.125 0.103 0.071 306 A 0.005 0.009 0.023 0.046 0.050 0.070 0.162 0.153 0.197 0.169 0.115 307 L 0.005 0.007 0.012 0.023 0.031 0.053 0.142 0.159 0.194 0.198 0.176 308 S 0.031 0.059 0.048 0.095 0.096 0.107 0.168 0.140 0.114 0.082 0.060 309 M 0.047 0.058 0.039 0.097 0.107 0.122 0.165 0.120 0.107 0.078 0.059 310 G 0.266 0.118 0.064 0.124 0.109 0.093 0.085 0.048 0.047 0.028 0.018 311 K 0.139 0.130 0.049 0.180 0.143 0.112 0.113 0.054 0.042 0.024 0.014 312 L 0.017 0.023 0.014 0.044 0.051 0.073 0.161 0.144 0.169 0.161 0.143 313 H 0.025 0.030 0.033 0.070 0.077 0.098 0.166 0.136 0.139 0.121 0.105 314 H 0.039 0.074 0.103 0.208 0.175 0.139 0.119 0.062 0.042 0.026 0.014 315 A 0.010 0.012 0.022 0.043 0.049 0.070 0.139 0.129 0.180 0.188 0.159 316 M 0.007 0.010 0.010 0.034 0.052 0.081 0.184 0.164 0.182 0.157 0.121 317 M 0.008 0.021 0.032 0.090 0.094 0.105 0.161 0.140 0.144 0.119 0.084 318 G 0.002 0.003 0.007 0.017 0.029 0.053 0.132 0.148 0.194 0.210 0.205 319 T 0.004 0.010 0.014 0.054 0.078 0.099 0.184 0.170 0.166 0.126 0.096 320 A 0.001 0.001 0.003 0.012 0.020 0.033 0.105 0.125 0.209 0.240 0.251 321 A 0.001 0.001 0.003 0.009 0.021 0.036 0.116 0.149 0.222 0.223 0.218 322 V 0.001 0.001 0.003 0.012 0.023 0.038 0.128 0.166 0.225 0.207 0.198 323 A 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.014 0.066 0.134 0.232 0.266 0.277 324 I 0.001 0.001 0.001 0.003 0.008 0.014 0.064 0.144 0.247 0.249 0.271 325 G 0.001 0.001 0.002 0.002 0.005 0.010 0.046 0.109 0.242 0.273 0.311 326 T 0.001 0.001 0.006 0.016 0.039 0.066 0.198 0.223 0.202 0.138 0.111 327 A 0.001 0.001 0.005 0.005 0.008 0.015 0.061 0.100 0.228 0.264 0.314 328 A 0.003 0.005 0.014 0.032 0.049 0.080 0.226 0.177 0.166 0.137 0.111 329 A 0.013 0.038 0.043 0.106 0.103 0.112 0.191 0.148 0.108 0.083 0.055 330 I 0.008 0.012 0.008 0.025 0.043 0.089 0.192 0.175 0.170 0.147 0.131 331 P 0.179 0.193 0.061 0.188 0.150 0.099 0.059 0.032 0.023 0.010 0.005 332 G 0.030 0.023 0.013 0.060 0.083 0.123 0.193 0.139 0.145 0.112 0.079 333 T 0.018 0.022 0.012 0.056 0.076 0.091 0.173 0.166 0.153 0.119 0.113 334 L 0.001 0.004 0.005 0.018 0.023 0.031 0.093 0.138 0.200 0.230 0.256 335 V 0.002 0.003 0.011 0.015 0.022 0.030 0.074 0.113 0.198 0.252 0.280 336 N 0.010 0.014 0.035 0.085 0.117 0.130 0.188 0.127 0.134 0.095 0.067 337 L 0.008 0.014 0.024 0.075 0.086 0.105 0.210 0.139 0.144 0.117 0.077 338 A 0.007 0.008 0.010 0.027 0.031 0.043 0.130 0.155 0.203 0.213 0.173 339 A 0.016 0.017 0.015 0.032 0.044 0.067 0.154 0.172 0.182 0.163 0.138 340 G 0.146 0.177 0.126 0.186 0.133 0.087 0.066 0.035 0.024 0.013 0.008 341 G 0.185 0.120 0.043 0.113 0.117 0.110 0.124 0.076 0.056 0.034 0.021 342 G 0.423 0.180 0.036 0.093 0.074 0.054 0.051 0.034 0.029 0.016 0.011 343 E 0.290 0.224 0.041 0.153 0.101 0.069 0.058 0.029 0.020 0.010 0.005 344 R 0.132 0.111 0.056 0.134 0.133 0.113 0.116 0.071 0.059 0.043 0.032 345 S 0.121 0.112 0.065 0.168 0.129 0.108 0.126 0.068 0.052 0.032 0.019 346 A 0.080 0.087 0.083 0.209 0.178 0.127 0.098 0.061 0.040 0.025 0.012 347 V 0.006 0.006 0.009 0.014 0.022 0.042 0.113 0.146 0.209 0.237 0.196 348 R 0.046 0.093 0.055 0.218 0.191 0.129 0.106 0.083 0.043 0.024 0.013 349 F 0.003 0.003 0.005 0.007 0.012 0.024 0.064 0.115 0.216 0.280 0.271 350 G 0.167 0.192 0.068 0.209 0.155 0.091 0.053 0.031 0.018 0.009 0.006 351 H 0.027 0.030 0.012 0.047 0.053 0.072 0.138 0.133 0.172 0.174 0.143 352 P 0.122 0.125 0.021 0.099 0.106 0.103 0.124 0.105 0.086 0.060 0.048 353 S 0.180 0.165 0.039 0.182 0.125 0.088 0.076 0.053 0.045 0.028 0.019 354 G 0.094 0.075 0.023 0.083 0.097 0.100 0.131 0.118 0.116 0.098 0.066 355 T 0.089 0.108 0.033 0.191 0.157 0.108 0.102 0.071 0.064 0.042 0.035 356 L 0.010 0.012 0.008 0.025 0.034 0.053 0.138 0.135 0.201 0.219 0.164 357 R 0.046 0.096 0.055 0.267 0.222 0.122 0.081 0.054 0.028 0.018 0.010 358 V 0.002 0.002 0.002 0.004 0.009 0.023 0.074 0.155 0.248 0.277 0.203 359 G 0.070 0.145 0.044 0.232 0.209 0.121 0.068 0.058 0.030 0.014 0.008 360 A 0.004 0.003 0.003 0.006 0.011 0.023 0.070 0.111 0.231 0.282 0.255 361 E 0.126 0.162 0.055 0.271 0.198 0.090 0.053 0.023 0.012 0.006 0.003 362 A 0.016 0.015 0.014 0.033 0.031 0.050 0.144 0.121 0.198 0.208 0.171 363 S 0.127 0.139 0.071 0.205 0.150 0.102 0.104 0.044 0.028 0.018 0.011 364 Q 0.147 0.146 0.099 0.177 0.111 0.086 0.103 0.053 0.039 0.025 0.013 365 A 0.286 0.184 0.066 0.136 0.100 0.076 0.073 0.042 0.021 0.012 0.006 366 N 0.462 0.239 0.055 0.103 0.062 0.035 0.021 0.012 0.007 0.003 0.001 367 G 0.336 0.187 0.059 0.095 0.092 0.077 0.063 0.039 0.030 0.015 0.007 368 E 0.381 0.197 0.071 0.154 0.109 0.050 0.020 0.010 0.005 0.002 0.001 369 W 0.065 0.031 0.029 0.047 0.066 0.111 0.179 0.172 0.145 0.095 0.059 370 T 0.048 0.174 0.089 0.258 0.166 0.105 0.075 0.049 0.022 0.009 0.005 371 V 0.001 0.002 0.006 0.007 0.010 0.024 0.080 0.108 0.203 0.270 0.288 372 T 0.060 0.102 0.144 0.234 0.195 0.122 0.076 0.033 0.019 0.010 0.004 373 K 0.030 0.055 0.085 0.226 0.178 0.167 0.137 0.065 0.036 0.016 0.005 374 A 0.006 0.004 0.011 0.012 0.016 0.033 0.105 0.146 0.223 0.246 0.199 375 I 0.026 0.053 0.056 0.141 0.136 0.145 0.184 0.119 0.077 0.042 0.021 376 M 0.004 0.012 0.058 0.034 0.040 0.067 0.131 0.135 0.189 0.192 0.138 377 S 0.024 0.048 0.082 0.150 0.164 0.186 0.188 0.075 0.043 0.025 0.015 378 R 0.059 0.062 0.079 0.150 0.108 0.123 0.167 0.103 0.078 0.050 0.022 379 S 0.021 0.039 0.044 0.098 0.094 0.104 0.177 0.137 0.123 0.098 0.065 380 A 0.007 0.010 0.015 0.027 0.037 0.072 0.167 0.153 0.214 0.173 0.125 381 R 0.024 0.034 0.131 0.171 0.164 0.143 0.147 0.064 0.059 0.042 0.022 382 I 0.009 0.022 0.075 0.141 0.126 0.144 0.239 0.108 0.063 0.047 0.024 383 L 0.001 0.003 0.009 0.013 0.015 0.025 0.100 0.134 0.207 0.257 0.235 384 M 0.005 0.008 0.017 0.023 0.033 0.060 0.158 0.188 0.192 0.185 0.132 385 E 0.033 0.068 0.144 0.207 0.201 0.139 0.093 0.051 0.034 0.021 0.010 386 G 0.027 0.025 0.037 0.061 0.078 0.112 0.187 0.135 0.151 0.115 0.071 387 W 0.044 0.043 0.023 0.109 0.111 0.108 0.166 0.132 0.121 0.087 0.056 388 V 0.007 0.005 0.007 0.012 0.019 0.038 0.118 0.138 0.216 0.231 0.209 389 R 0.050 0.090 0.083 0.211 0.157 0.113 0.115 0.072 0.046 0.033 0.030 390 V 0.014 0.023 0.016 0.035 0.042 0.061 0.144 0.150 0.177 0.178 0.162 391 P 0.176 0.162 0.038 0.142 0.115 0.085 0.091 0.069 0.055 0.037 0.029 392 G 0.388 0.159 0.038 0.125 0.099 0.068 0.052 0.027 0.024 0.012 0.007 393 D 0.434 0.177 0.049 0.124 0.089 0.051 0.034 0.018 0.014 0.007 0.003 394 A 0.107 0.088 0.027 0.100 0.095 0.102 0.161 0.115 0.098 0.063 0.044 395 F 0.073 0.074 0.055 0.089 0.090 0.101 0.148 0.121 0.109 0.080 0.060