# TARGET T0301 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-near-backbone-11-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 11 (1 near-backbone-11 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0301.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 14.6022 # Pos AA A B C D E F G H I J K 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.388 0.140 0.064 0.104 0.071 0.058 0.058 0.038 0.038 0.025 0.015 2 A 0.386 0.159 0.048 0.089 0.071 0.062 0.067 0.042 0.037 0.023 0.015 3 H 0.240 0.179 0.052 0.119 0.096 0.088 0.089 0.054 0.044 0.026 0.014 4 P 0.364 0.159 0.039 0.091 0.077 0.070 0.072 0.045 0.042 0.026 0.014 5 P 0.456 0.135 0.046 0.104 0.076 0.059 0.052 0.027 0.022 0.014 0.010 6 Q 0.196 0.102 0.051 0.150 0.123 0.098 0.093 0.063 0.059 0.041 0.025 7 I 0.064 0.075 0.048 0.117 0.107 0.118 0.157 0.111 0.096 0.065 0.041 8 R 0.091 0.140 0.112 0.251 0.171 0.109 0.070 0.027 0.016 0.008 0.004 9 I 0.014 0.017 0.018 0.029 0.031 0.046 0.138 0.166 0.225 0.188 0.128 10 P 0.065 0.128 0.096 0.274 0.202 0.116 0.072 0.023 0.014 0.007 0.004 11 A 0.009 0.006 0.005 0.009 0.008 0.012 0.041 0.084 0.190 0.266 0.370 12 T 0.037 0.057 0.051 0.155 0.160 0.153 0.170 0.089 0.065 0.036 0.027 13 Y 0.018 0.036 0.028 0.063 0.052 0.066 0.132 0.135 0.175 0.163 0.131 14 L 0.021 0.032 0.030 0.069 0.070 0.080 0.133 0.124 0.156 0.146 0.140 15 R 0.059 0.057 0.040 0.085 0.079 0.084 0.121 0.107 0.129 0.118 0.123 16 G 0.100 0.077 0.028 0.103 0.086 0.084 0.125 0.100 0.114 0.104 0.079 17 G 0.108 0.078 0.035 0.112 0.106 0.106 0.124 0.089 0.096 0.077 0.069 18 T 0.088 0.083 0.031 0.083 0.078 0.083 0.112 0.096 0.116 0.112 0.119 19 S 0.030 0.038 0.019 0.061 0.078 0.100 0.156 0.140 0.162 0.127 0.089 20 K 0.054 0.064 0.037 0.138 0.153 0.150 0.143 0.086 0.082 0.054 0.040 21 G 0.032 0.018 0.011 0.030 0.031 0.040 0.085 0.114 0.200 0.221 0.220 22 V 0.015 0.024 0.018 0.076 0.090 0.129 0.209 0.139 0.141 0.097 0.063 23 F 0.008 0.009 0.014 0.024 0.023 0.031 0.088 0.131 0.223 0.233 0.216 24 F 0.002 0.003 0.006 0.017 0.030 0.049 0.116 0.149 0.220 0.215 0.194 25 R 0.008 0.071 0.088 0.199 0.156 0.127 0.143 0.080 0.070 0.038 0.021 26 L 0.010 0.018 0.021 0.073 0.113 0.153 0.236 0.156 0.122 0.068 0.029 27 E 0.430 0.181 0.122 0.137 0.058 0.029 0.024 0.009 0.006 0.003 0.002 28 D 0.059 0.105 0.079 0.211 0.186 0.144 0.126 0.045 0.026 0.012 0.005 29 L 0.005 0.010 0.006 0.015 0.020 0.032 0.093 0.133 0.220 0.229 0.236 30 P 0.075 0.128 0.076 0.153 0.168 0.169 0.136 0.048 0.029 0.012 0.006 31 E 0.494 0.183 0.144 0.113 0.036 0.015 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 32 S 0.188 0.139 0.066 0.162 0.124 0.111 0.109 0.046 0.031 0.015 0.009 33 C 0.055 0.025 0.020 0.038 0.050 0.089 0.163 0.148 0.170 0.138 0.105 34 R 0.364 0.285 0.132 0.123 0.052 0.025 0.012 0.003 0.002 0.001 0.001 35 V 0.039 0.033 0.048 0.050 0.062 0.101 0.168 0.140 0.156 0.126 0.077 36 P 0.118 0.230 0.044 0.119 0.098 0.098 0.109 0.061 0.057 0.038 0.027 37 G 0.544 0.169 0.032 0.080 0.058 0.043 0.034 0.017 0.013 0.007 0.004 38 E 0.575 0.111 0.052 0.093 0.068 0.042 0.031 0.012 0.009 0.004 0.002 39 A 0.186 0.145 0.079 0.137 0.104 0.103 0.107 0.061 0.044 0.021 0.011 40 R 0.014 0.014 0.015 0.053 0.089 0.170 0.250 0.164 0.131 0.068 0.030 41 D 0.020 0.029 0.125 0.096 0.100 0.140 0.223 0.110 0.085 0.048 0.024 42 R 0.007 0.036 0.349 0.252 0.157 0.095 0.059 0.019 0.014 0.008 0.004 43 L 0.003 0.008 0.039 0.037 0.037 0.056 0.169 0.155 0.207 0.173 0.116 44 F 0.002 0.002 0.013 0.015 0.015 0.022 0.090 0.149 0.254 0.245 0.191 45 M 0.001 0.004 0.035 0.039 0.074 0.133 0.252 0.180 0.155 0.089 0.039 46 R 0.002 0.010 0.056 0.093 0.107 0.152 0.253 0.139 0.101 0.057 0.030 47 V 0.001 0.001 0.003 0.003 0.004 0.009 0.068 0.140 0.257 0.279 0.235 48 I 0.002 0.003 0.004 0.006 0.008 0.020 0.082 0.125 0.223 0.258 0.269 49 G 0.006 0.019 0.019 0.041 0.043 0.061 0.131 0.138 0.201 0.189 0.151 50 S 0.009 0.021 0.015 0.049 0.055 0.083 0.184 0.175 0.186 0.133 0.090 51 P 0.072 0.057 0.042 0.086 0.087 0.104 0.151 0.113 0.114 0.091 0.084 52 D 0.046 0.085 0.031 0.122 0.132 0.120 0.149 0.096 0.094 0.069 0.056 53 P 0.066 0.072 0.027 0.122 0.130 0.135 0.146 0.093 0.098 0.069 0.042 54 Y 0.104 0.070 0.035 0.135 0.156 0.146 0.141 0.083 0.065 0.040 0.025 55 A 0.160 0.089 0.047 0.143 0.122 0.112 0.123 0.068 0.060 0.042 0.035 56 A 0.010 0.016 0.012 0.048 0.067 0.099 0.163 0.154 0.174 0.149 0.108 57 H 0.007 0.011 0.016 0.038 0.050 0.071 0.150 0.163 0.191 0.159 0.144 58 I 0.006 0.007 0.010 0.014 0.019 0.030 0.074 0.103 0.177 0.228 0.331 59 D 0.012 0.030 0.035 0.099 0.095 0.097 0.167 0.135 0.134 0.112 0.086 60 G 0.038 0.024 0.017 0.041 0.040 0.056 0.113 0.128 0.177 0.179 0.186 61 M 0.024 0.015 0.011 0.024 0.024 0.031 0.067 0.085 0.154 0.219 0.345 62 G 0.016 0.029 0.017 0.055 0.060 0.078 0.140 0.132 0.166 0.156 0.151 63 G 0.062 0.068 0.032 0.083 0.077 0.089 0.129 0.104 0.120 0.110 0.125 64 A 0.055 0.028 0.013 0.036 0.035 0.040 0.075 0.083 0.134 0.187 0.313 65 T 0.105 0.108 0.050 0.152 0.130 0.113 0.109 0.061 0.065 0.053 0.054 66 S 0.126 0.080 0.037 0.102 0.081 0.079 0.093 0.075 0.100 0.104 0.122 67 S 0.184 0.092 0.045 0.112 0.093 0.089 0.100 0.067 0.077 0.069 0.072 68 T 0.059 0.069 0.037 0.118 0.117 0.121 0.147 0.093 0.097 0.075 0.066 69 S 0.023 0.032 0.021 0.065 0.079 0.089 0.149 0.140 0.163 0.134 0.105 70 K 0.010 0.021 0.019 0.097 0.140 0.150 0.189 0.122 0.115 0.077 0.061 71 C 0.002 0.003 0.003 0.012 0.015 0.024 0.069 0.112 0.200 0.258 0.304 72 V 0.001 0.003 0.004 0.022 0.037 0.062 0.180 0.195 0.212 0.171 0.114 73 I 0.001 0.003 0.004 0.010 0.013 0.020 0.072 0.132 0.227 0.251 0.266 74 L 0.001 0.002 0.002 0.009 0.015 0.026 0.079 0.127 0.231 0.262 0.247 75 S 0.014 0.038 0.029 0.151 0.176 0.170 0.196 0.105 0.071 0.033 0.017 76 K 0.074 0.132 0.061 0.234 0.186 0.131 0.105 0.041 0.022 0.010 0.004 77 S 0.088 0.079 0.041 0.117 0.103 0.099 0.129 0.092 0.098 0.079 0.077 78 S 0.291 0.226 0.063 0.178 0.101 0.057 0.041 0.016 0.012 0.008 0.008 79 Q 0.170 0.160 0.048 0.148 0.112 0.097 0.108 0.061 0.047 0.031 0.018 80 P 0.354 0.164 0.050 0.138 0.096 0.073 0.055 0.026 0.021 0.013 0.010 81 G 0.417 0.175 0.053 0.145 0.089 0.053 0.033 0.013 0.010 0.006 0.005 82 H 0.015 0.035 0.023 0.096 0.131 0.157 0.210 0.129 0.105 0.064 0.035 83 D 0.029 0.067 0.041 0.157 0.165 0.154 0.154 0.090 0.071 0.044 0.028 84 V 0.008 0.006 0.005 0.016 0.022 0.034 0.097 0.140 0.227 0.232 0.212 85 D 0.020 0.037 0.040 0.149 0.171 0.156 0.174 0.099 0.080 0.045 0.028 86 Y 0.003 0.006 0.007 0.028 0.034 0.053 0.138 0.181 0.233 0.197 0.122 87 L 0.003 0.004 0.005 0.023 0.038 0.059 0.159 0.193 0.229 0.175 0.114 88 Y 0.002 0.003 0.004 0.014 0.016 0.028 0.085 0.133 0.217 0.256 0.242 89 G 0.002 0.004 0.006 0.016 0.024 0.040 0.124 0.170 0.241 0.223 0.149 90 Q 0.004 0.013 0.016 0.070 0.084 0.116 0.202 0.165 0.156 0.104 0.071 91 V 0.001 0.002 0.003 0.008 0.013 0.024 0.074 0.128 0.231 0.278 0.237 92 S 0.012 0.040 0.025 0.185 0.217 0.176 0.171 0.083 0.055 0.023 0.012 93 I 0.006 0.008 0.004 0.015 0.021 0.038 0.102 0.145 0.229 0.232 0.200 94 D 0.104 0.170 0.089 0.288 0.177 0.088 0.050 0.016 0.010 0.005 0.003 95 K 0.241 0.183 0.063 0.198 0.130 0.082 0.059 0.021 0.013 0.006 0.004 96 P 0.296 0.154 0.059 0.151 0.099 0.072 0.066 0.038 0.031 0.021 0.014 97 F 0.070 0.107 0.039 0.163 0.151 0.147 0.157 0.072 0.050 0.027 0.017 98 V 0.007 0.008 0.005 0.015 0.020 0.031 0.083 0.113 0.202 0.239 0.278 99 D 0.040 0.132 0.079 0.222 0.166 0.112 0.096 0.052 0.043 0.029 0.028 100 W 0.053 0.041 0.033 0.078 0.090 0.111 0.165 0.126 0.125 0.101 0.077 101 S 0.155 0.138 0.055 0.179 0.142 0.104 0.092 0.052 0.040 0.026 0.018 102 G 0.205 0.114 0.046 0.150 0.126 0.104 0.102 0.056 0.046 0.032 0.020 103 N 0.065 0.070 0.033 0.099 0.097 0.091 0.121 0.094 0.121 0.106 0.103 104 C 0.022 0.023 0.013 0.042 0.052 0.071 0.128 0.147 0.180 0.165 0.157 105 G 0.077 0.068 0.031 0.097 0.109 0.122 0.157 0.106 0.102 0.075 0.057 106 N 0.046 0.042 0.025 0.083 0.099 0.113 0.160 0.127 0.125 0.099 0.081 107 L 0.023 0.015 0.014 0.028 0.028 0.036 0.084 0.110 0.197 0.220 0.245 108 S 0.017 0.017 0.014 0.043 0.060 0.092 0.148 0.139 0.174 0.155 0.142 109 T 0.017 0.022 0.033 0.051 0.046 0.063 0.130 0.133 0.187 0.174 0.144 110 G 0.008 0.009 0.011 0.026 0.038 0.065 0.146 0.152 0.188 0.181 0.174 111 A 0.004 0.008 0.010 0.014 0.012 0.016 0.050 0.079 0.185 0.260 0.361 112 G 0.004 0.007 0.007 0.020 0.030 0.053 0.128 0.145 0.214 0.208 0.183 113 A 0.030 0.029 0.045 0.078 0.070 0.098 0.155 0.118 0.142 0.127 0.107 114 F 0.008 0.013 0.024 0.040 0.047 0.069 0.157 0.145 0.168 0.170 0.159 115 A 0.004 0.004 0.011 0.015 0.013 0.018 0.048 0.077 0.174 0.255 0.382 116 L 0.001 0.003 0.008 0.016 0.023 0.041 0.107 0.127 0.199 0.229 0.245 117 H 0.009 0.028 0.089 0.118 0.134 0.147 0.180 0.105 0.092 0.055 0.044 118 A 0.036 0.040 0.041 0.101 0.106 0.149 0.225 0.113 0.084 0.062 0.043 119 G 0.253 0.128 0.071 0.141 0.092 0.070 0.085 0.049 0.047 0.037 0.028 120 L 0.012 0.022 0.017 0.040 0.038 0.051 0.123 0.119 0.186 0.183 0.210 121 V 0.010 0.017 0.013 0.030 0.043 0.065 0.135 0.133 0.180 0.171 0.203 122 D 0.147 0.325 0.121 0.220 0.092 0.044 0.030 0.010 0.007 0.003 0.003 123 P 0.096 0.055 0.036 0.112 0.135 0.146 0.176 0.095 0.069 0.048 0.032 124 A 0.502 0.215 0.070 0.106 0.049 0.022 0.016 0.007 0.006 0.004 0.004 125 R 0.062 0.103 0.049 0.172 0.166 0.156 0.150 0.061 0.043 0.023 0.014 126 I 0.010 0.016 0.012 0.043 0.059 0.080 0.147 0.139 0.173 0.165 0.156 127 P 0.212 0.203 0.076 0.167 0.115 0.088 0.070 0.030 0.020 0.011 0.008 128 E 0.532 0.142 0.070 0.121 0.060 0.034 0.022 0.008 0.005 0.003 0.002 129 D 0.489 0.207 0.046 0.113 0.060 0.036 0.025 0.010 0.007 0.004 0.003 130 G 0.249 0.189 0.060 0.175 0.119 0.088 0.061 0.026 0.018 0.010 0.005 131 I 0.023 0.059 0.043 0.180 0.205 0.183 0.156 0.071 0.046 0.022 0.010 132 C 0.008 0.012 0.015 0.032 0.052 0.090 0.203 0.191 0.194 0.126 0.077 133 E 0.009 0.037 0.039 0.304 0.286 0.172 0.099 0.030 0.016 0.007 0.003 134 V 0.002 0.003 0.004 0.008 0.010 0.017 0.070 0.130 0.258 0.285 0.212 135 R 0.007 0.022 0.041 0.198 0.238 0.188 0.166 0.071 0.042 0.018 0.008 136 I 0.003 0.005 0.008 0.010 0.009 0.013 0.056 0.113 0.238 0.280 0.265 137 W 0.003 0.009 0.016 0.084 0.132 0.159 0.235 0.154 0.118 0.062 0.027 138 Q 0.015 0.024 0.043 0.078 0.086 0.131 0.223 0.149 0.133 0.079 0.039 139 A 0.029 0.047 0.073 0.132 0.130 0.132 0.174 0.107 0.087 0.057 0.033 140 N 0.033 0.045 0.045 0.075 0.067 0.091 0.170 0.129 0.152 0.113 0.081 141 I 0.034 0.077 0.038 0.085 0.066 0.069 0.135 0.121 0.149 0.129 0.097 142 G 0.195 0.141 0.077 0.176 0.149 0.108 0.076 0.033 0.024 0.013 0.008 143 K 0.139 0.117 0.096 0.191 0.145 0.114 0.102 0.043 0.028 0.016 0.009 144 T 0.026 0.036 0.035 0.119 0.126 0.139 0.183 0.118 0.101 0.071 0.045 145 I 0.003 0.004 0.006 0.010 0.010 0.016 0.060 0.101 0.215 0.265 0.311 146 I 0.009 0.035 0.064 0.197 0.229 0.187 0.139 0.062 0.042 0.024 0.013 147 A 0.009 0.016 0.035 0.051 0.059 0.083 0.154 0.149 0.174 0.148 0.122 148 H 0.045 0.079 0.062 0.246 0.209 0.144 0.130 0.045 0.023 0.011 0.006 149 V 0.004 0.004 0.002 0.007 0.009 0.019 0.070 0.118 0.224 0.280 0.263 150 P 0.090 0.249 0.110 0.310 0.148 0.055 0.025 0.006 0.004 0.002 0.001 151 V 0.009 0.008 0.004 0.016 0.021 0.036 0.106 0.151 0.233 0.222 0.194 152 S 0.280 0.259 0.069 0.183 0.097 0.054 0.034 0.011 0.007 0.003 0.002 153 G 0.390 0.230 0.059 0.157 0.081 0.042 0.025 0.008 0.005 0.002 0.001 154 G 0.249 0.116 0.042 0.089 0.071 0.068 0.089 0.067 0.080 0.069 0.059 155 Q 0.069 0.243 0.095 0.267 0.156 0.090 0.052 0.015 0.008 0.003 0.002 156 V 0.011 0.014 0.009 0.030 0.039 0.055 0.125 0.138 0.198 0.196 0.187 157 Q 0.065 0.105 0.074 0.267 0.212 0.128 0.083 0.032 0.019 0.010 0.007 158 E 0.074 0.078 0.069 0.173 0.171 0.141 0.132 0.063 0.049 0.030 0.019 159 T 0.092 0.101 0.057 0.205 0.154 0.128 0.119 0.061 0.042 0.026 0.015 160 G 0.213 0.089 0.041 0.100 0.097 0.100 0.119 0.076 0.069 0.055 0.041 161 D 0.105 0.200 0.115 0.279 0.153 0.072 0.045 0.015 0.009 0.004 0.003 162 F 0.011 0.011 0.010 0.033 0.047 0.073 0.146 0.151 0.198 0.181 0.139 163 E 0.032 0.144 0.101 0.344 0.213 0.089 0.048 0.014 0.008 0.004 0.003 164 L 0.005 0.005 0.005 0.011 0.015 0.029 0.091 0.122 0.226 0.238 0.254 165 D 0.068 0.121 0.107 0.261 0.185 0.113 0.088 0.028 0.015 0.007 0.006 166 G 0.256 0.216 0.070 0.175 0.098 0.062 0.058 0.025 0.019 0.012 0.008 167 V 0.011 0.014 0.008 0.030 0.041 0.052 0.106 0.114 0.171 0.190 0.261 168 T 0.254 0.373 0.094 0.187 0.056 0.021 0.010 0.002 0.002 0.001 0.001 169 F 0.013 0.015 0.008 0.039 0.067 0.108 0.209 0.176 0.167 0.118 0.081 170 P 0.424 0.259 0.067 0.145 0.056 0.023 0.013 0.005 0.004 0.002 0.003 171 A 0.108 0.086 0.045 0.179 0.185 0.157 0.124 0.052 0.033 0.020 0.011 172 A 0.026 0.013 0.008 0.027 0.035 0.056 0.133 0.142 0.195 0.176 0.187 173 E 0.054 0.135 0.110 0.391 0.187 0.077 0.031 0.008 0.004 0.002 0.001 174 I 0.002 0.004 0.005 0.009 0.014 0.028 0.101 0.164 0.256 0.240 0.177 175 V 0.024 0.074 0.083 0.257 0.215 0.148 0.114 0.041 0.025 0.012 0.008 176 L 0.001 0.001 0.001 0.003 0.004 0.009 0.044 0.090 0.222 0.304 0.322 177 E 0.018 0.060 0.070 0.277 0.220 0.132 0.119 0.049 0.030 0.015 0.010 178 F 0.004 0.006 0.004 0.010 0.012 0.023 0.086 0.140 0.214 0.244 0.258 179 L 0.009 0.023 0.021 0.083 0.101 0.119 0.185 0.132 0.133 0.109 0.085 180 D 0.051 0.121 0.057 0.199 0.167 0.130 0.125 0.061 0.047 0.027 0.015 181 P 0.044 0.043 0.024 0.094 0.097 0.103 0.155 0.125 0.131 0.107 0.077 182 S 0.131 0.106 0.049 0.168 0.143 0.107 0.117 0.065 0.052 0.033 0.029 183 D 0.318 0.236 0.062 0.171 0.087 0.048 0.038 0.017 0.012 0.007 0.004 184 D 0.344 0.262 0.067 0.161 0.084 0.045 0.023 0.007 0.004 0.002 0.001 185 G 0.337 0.126 0.056 0.104 0.074 0.063 0.063 0.041 0.048 0.041 0.047 186 E 0.191 0.211 0.080 0.171 0.110 0.081 0.074 0.034 0.025 0.014 0.008 187 D 0.137 0.169 0.087 0.207 0.166 0.113 0.072 0.024 0.015 0.007 0.003 188 G 0.038 0.032 0.018 0.060 0.065 0.068 0.120 0.120 0.162 0.155 0.162 189 G 0.056 0.074 0.054 0.180 0.197 0.163 0.136 0.060 0.041 0.024 0.015 190 A 0.038 0.073 0.068 0.192 0.174 0.143 0.146 0.074 0.052 0.027 0.013 191 I 0.011 0.007 0.006 0.022 0.033 0.057 0.140 0.161 0.208 0.200 0.156 192 F 0.006 0.012 0.010 0.035 0.042 0.057 0.140 0.159 0.208 0.182 0.148 193 P 0.031 0.041 0.028 0.075 0.087 0.103 0.173 0.132 0.144 0.107 0.078 194 T 0.028 0.040 0.028 0.067 0.063 0.071 0.134 0.140 0.163 0.142 0.124 195 G 0.074 0.045 0.026 0.082 0.093 0.117 0.173 0.116 0.114 0.090 0.069 196 N 0.156 0.178 0.076 0.208 0.126 0.080 0.068 0.038 0.031 0.023 0.017 197 L 0.033 0.032 0.024 0.072 0.089 0.104 0.163 0.135 0.141 0.116 0.092 198 V 0.025 0.037 0.034 0.108 0.107 0.114 0.141 0.103 0.118 0.103 0.110 199 D 0.025 0.043 0.042 0.124 0.141 0.146 0.192 0.112 0.083 0.056 0.036 200 D 0.049 0.104 0.094 0.256 0.181 0.123 0.099 0.040 0.026 0.015 0.011 201 L 0.004 0.003 0.003 0.007 0.010 0.015 0.049 0.079 0.174 0.263 0.392 202 E 0.082 0.232 0.128 0.326 0.136 0.053 0.028 0.007 0.004 0.002 0.002 203 V 0.006 0.013 0.009 0.028 0.035 0.052 0.128 0.140 0.196 0.189 0.204 204 P 0.349 0.182 0.075 0.183 0.091 0.054 0.035 0.012 0.008 0.005 0.005 205 G 0.513 0.195 0.054 0.134 0.058 0.025 0.012 0.003 0.002 0.001 0.001 206 V 0.064 0.063 0.031 0.102 0.091 0.094 0.128 0.102 0.112 0.105 0.109 207 G 0.134 0.212 0.067 0.231 0.149 0.105 0.063 0.019 0.011 0.006 0.005 208 T 0.073 0.180 0.101 0.295 0.178 0.084 0.054 0.017 0.010 0.005 0.003 209 F 0.002 0.002 0.001 0.006 0.014 0.028 0.093 0.151 0.261 0.237 0.204 210 K 0.015 0.101 0.075 0.392 0.276 0.098 0.033 0.006 0.002 0.001 0.001 211 A 0.001 0.001 0.001 0.002 0.003 0.009 0.048 0.124 0.252 0.292 0.270 212 T 0.004 0.008 0.009 0.053 0.103 0.158 0.278 0.184 0.114 0.055 0.035 213 M 0.001 0.001 0.001 0.003 0.003 0.007 0.044 0.101 0.219 0.286 0.333 214 I 0.002 0.002 0.002 0.009 0.015 0.027 0.087 0.132 0.217 0.261 0.245 215 N 0.009 0.014 0.013 0.040 0.040 0.061 0.143 0.155 0.209 0.171 0.147 216 A 0.030 0.041 0.031 0.079 0.073 0.089 0.175 0.143 0.144 0.112 0.082 217 G 0.033 0.045 0.027 0.097 0.093 0.104 0.162 0.129 0.141 0.103 0.067 218 I 0.016 0.037 0.020 0.089 0.113 0.137 0.212 0.136 0.128 0.076 0.036 219 P 0.013 0.015 0.017 0.038 0.053 0.073 0.144 0.158 0.198 0.159 0.131 220 T 0.009 0.014 0.015 0.058 0.077 0.113 0.178 0.148 0.158 0.137 0.093 221 V 0.004 0.008 0.009 0.022 0.017 0.026 0.103 0.152 0.249 0.246 0.164 222 F 0.003 0.006 0.015 0.027 0.028 0.040 0.104 0.123 0.204 0.211 0.239 223 V 0.001 0.002 0.006 0.006 0.010 0.021 0.080 0.122 0.215 0.256 0.282 224 N 0.009 0.070 0.076 0.319 0.239 0.119 0.099 0.037 0.020 0.008 0.004 225 A 0.001 0.002 0.002 0.004 0.007 0.018 0.060 0.110 0.215 0.268 0.315 226 E 0.095 0.140 0.119 0.309 0.182 0.087 0.048 0.011 0.005 0.002 0.002 227 E 0.087 0.159 0.104 0.232 0.164 0.113 0.087 0.027 0.015 0.007 0.004 228 I 0.009 0.010 0.010 0.031 0.038 0.062 0.138 0.141 0.198 0.197 0.166 229 G 0.357 0.206 0.054 0.123 0.078 0.057 0.053 0.025 0.020 0.014 0.012 230 Y 0.030 0.025 0.018 0.040 0.052 0.081 0.180 0.155 0.171 0.143 0.106 231 R 0.175 0.423 0.084 0.165 0.075 0.038 0.021 0.007 0.005 0.003 0.002 232 G 0.155 0.085 0.032 0.096 0.107 0.119 0.130 0.081 0.082 0.063 0.049 233 T 0.479 0.198 0.074 0.122 0.061 0.029 0.019 0.007 0.006 0.003 0.002 234 E 0.091 0.124 0.091 0.185 0.150 0.125 0.118 0.052 0.036 0.018 0.009 235 L 0.024 0.042 0.025 0.061 0.068 0.097 0.180 0.149 0.152 0.116 0.088 236 R 0.050 0.046 0.066 0.177 0.234 0.200 0.138 0.047 0.025 0.011 0.004 237 E 0.142 0.152 0.469 0.142 0.047 0.021 0.015 0.005 0.004 0.002 0.001 238 E 0.021 0.045 0.093 0.184 0.170 0.171 0.179 0.069 0.040 0.018 0.009 239 I 0.021 0.012 0.013 0.017 0.022 0.046 0.142 0.154 0.207 0.205 0.161 240 N 0.162 0.157 0.226 0.170 0.120 0.080 0.053 0.016 0.010 0.004 0.002 241 G 0.226 0.119 0.194 0.122 0.072 0.066 0.072 0.037 0.036 0.034 0.023 242 D 0.060 0.542 0.066 0.116 0.065 0.052 0.047 0.023 0.017 0.009 0.005 243 P 0.775 0.069 0.040 0.052 0.032 0.017 0.010 0.003 0.002 0.001 0.001 244 Q 0.682 0.135 0.055 0.067 0.032 0.014 0.009 0.003 0.002 0.001 0.001 245 Q 0.003 0.013 0.052 0.073 0.096 0.175 0.269 0.162 0.099 0.041 0.016 246 L 0.006 0.007 0.025 0.086 0.155 0.234 0.269 0.118 0.063 0.028 0.010 247 A 0.021 0.058 0.781 0.081 0.034 0.016 0.007 0.001 0.001 0.001 0.001 248 R 0.001 0.008 0.072 0.147 0.191 0.230 0.231 0.064 0.039 0.015 0.004 249 F 0.001 0.001 0.003 0.002 0.003 0.007 0.048 0.105 0.239 0.302 0.292 250 E 0.006 0.008 0.144 0.143 0.209 0.221 0.198 0.046 0.018 0.006 0.001 251 R 0.001 0.017 0.372 0.217 0.179 0.124 0.066 0.015 0.006 0.002 0.001 252 I 0.001 0.001 0.012 0.007 0.008 0.016 0.088 0.120 0.249 0.285 0.212 253 R 0.001 0.001 0.006 0.006 0.009 0.025 0.148 0.186 0.271 0.228 0.119 254 V 0.002 0.008 0.198 0.152 0.186 0.163 0.137 0.065 0.049 0.026 0.013 255 A 0.002 0.008 0.036 0.068 0.116 0.213 0.341 0.115 0.063 0.030 0.010 256 G 0.001 0.003 0.019 0.018 0.012 0.017 0.084 0.126 0.249 0.276 0.197 257 A 0.002 0.002 0.020 0.008 0.009 0.020 0.069 0.101 0.187 0.252 0.330 258 L 0.001 0.006 0.144 0.103 0.094 0.115 0.194 0.128 0.114 0.064 0.036 259 R 0.001 0.005 0.046 0.042 0.072 0.136 0.281 0.163 0.132 0.080 0.042 260 M 0.001 0.001 0.004 0.004 0.005 0.014 0.074 0.108 0.221 0.287 0.280 261 G 0.016 0.027 0.029 0.051 0.056 0.081 0.171 0.150 0.177 0.131 0.110 262 L 0.012 0.018 0.023 0.038 0.042 0.066 0.151 0.134 0.190 0.175 0.152 263 I 0.014 0.019 0.016 0.059 0.084 0.123 0.252 0.175 0.130 0.077 0.051 264 K 0.165 0.094 0.074 0.145 0.127 0.103 0.122 0.066 0.051 0.033 0.021 265 T 0.064 0.518 0.082 0.149 0.075 0.046 0.030 0.013 0.010 0.007 0.006 266 P 0.095 0.077 0.044 0.143 0.169 0.151 0.126 0.072 0.061 0.039 0.022 267 E 0.774 0.132 0.029 0.039 0.015 0.006 0.003 0.001 0.001 0.001 0.001 268 E 0.056 0.152 0.186 0.359 0.140 0.059 0.032 0.010 0.004 0.002 0.001 269 A 0.054 0.018 0.012 0.026 0.029 0.065 0.153 0.142 0.181 0.160 0.160 270 A 0.062 0.064 0.140 0.131 0.130 0.172 0.161 0.064 0.040 0.021 0.012 271 T 0.054 0.134 0.556 0.146 0.049 0.025 0.017 0.006 0.006 0.004 0.002 272 R 0.070 0.063 0.073 0.131 0.126 0.146 0.161 0.078 0.066 0.048 0.035 273 Q 0.360 0.169 0.072 0.144 0.085 0.057 0.050 0.023 0.019 0.012 0.009 274 H 0.055 0.055 0.047 0.116 0.129 0.138 0.176 0.101 0.092 0.057 0.034 275 T 0.029 0.054 0.042 0.119 0.142 0.142 0.172 0.107 0.097 0.061 0.035 276 P 0.009 0.011 0.008 0.029 0.048 0.077 0.173 0.183 0.212 0.156 0.094 277 K 0.006 0.009 0.008 0.044 0.083 0.118 0.224 0.190 0.162 0.098 0.057 278 I 0.001 0.002 0.002 0.008 0.012 0.024 0.090 0.153 0.242 0.247 0.219 279 A 0.001 0.002 0.002 0.008 0.011 0.021 0.087 0.149 0.240 0.262 0.216 280 F 0.001 0.002 0.002 0.005 0.008 0.015 0.071 0.144 0.254 0.276 0.222 281 V 0.001 0.002 0.003 0.009 0.013 0.022 0.082 0.139 0.243 0.257 0.229 282 A 0.003 0.006 0.006 0.034 0.058 0.087 0.183 0.187 0.204 0.151 0.082 283 P 0.029 0.090 0.040 0.193 0.190 0.165 0.152 0.072 0.044 0.019 0.007 284 P 0.025 0.039 0.022 0.079 0.104 0.133 0.188 0.145 0.132 0.085 0.049 285 R 0.280 0.175 0.070 0.191 0.125 0.069 0.049 0.018 0.012 0.006 0.004 286 D 0.229 0.193 0.075 0.171 0.112 0.075 0.068 0.033 0.023 0.013 0.007 287 Y 0.034 0.033 0.026 0.073 0.076 0.099 0.152 0.137 0.153 0.129 0.087 288 R 0.099 0.112 0.082 0.155 0.141 0.129 0.128 0.061 0.047 0.030 0.017 289 T 0.099 0.109 0.119 0.195 0.140 0.107 0.101 0.052 0.041 0.024 0.014 290 A 0.153 0.059 0.041 0.089 0.086 0.095 0.132 0.091 0.094 0.087 0.072 291 S 0.257 0.278 0.063 0.141 0.083 0.058 0.049 0.026 0.022 0.014 0.009 292 G 0.430 0.111 0.046 0.087 0.064 0.055 0.063 0.042 0.045 0.035 0.022 293 K 0.227 0.235 0.090 0.165 0.113 0.071 0.053 0.021 0.015 0.007 0.004 294 L 0.054 0.059 0.053 0.120 0.103 0.102 0.130 0.104 0.120 0.089 0.066 295 V 0.032 0.037 0.029 0.103 0.136 0.149 0.188 0.117 0.096 0.066 0.049 296 A 0.147 0.177 0.184 0.199 0.117 0.070 0.052 0.023 0.016 0.009 0.006 297 A 0.141 0.087 0.064 0.145 0.123 0.116 0.133 0.070 0.055 0.039 0.026 298 G 0.428 0.178 0.057 0.119 0.073 0.049 0.041 0.019 0.016 0.012 0.009 299 D 0.087 0.146 0.073 0.201 0.159 0.115 0.102 0.048 0.036 0.020 0.012 300 I 0.016 0.024 0.018 0.058 0.095 0.133 0.204 0.152 0.143 0.099 0.060 301 D 0.028 0.072 0.056 0.235 0.223 0.167 0.128 0.043 0.027 0.013 0.007 302 L 0.005 0.005 0.006 0.016 0.018 0.026 0.080 0.133 0.231 0.253 0.226 303 L 0.010 0.012 0.023 0.071 0.096 0.121 0.202 0.150 0.149 0.099 0.066 304 V 0.005 0.010 0.022 0.041 0.044 0.060 0.132 0.156 0.208 0.185 0.137 305 R 0.003 0.008 0.026 0.052 0.070 0.104 0.208 0.175 0.169 0.118 0.067 306 A 0.007 0.012 0.029 0.045 0.046 0.067 0.159 0.160 0.189 0.159 0.128 307 L 0.004 0.007 0.013 0.021 0.022 0.031 0.091 0.118 0.215 0.248 0.229 308 S 0.023 0.073 0.069 0.141 0.133 0.127 0.155 0.096 0.091 0.055 0.037 309 M 0.104 0.083 0.040 0.097 0.096 0.113 0.153 0.105 0.095 0.068 0.045 310 G 0.295 0.131 0.061 0.141 0.117 0.091 0.083 0.037 0.025 0.014 0.008 311 K 0.187 0.180 0.078 0.178 0.134 0.095 0.072 0.031 0.022 0.013 0.009 312 L 0.065 0.046 0.031 0.058 0.050 0.060 0.106 0.099 0.155 0.152 0.177 313 H 0.069 0.065 0.037 0.077 0.082 0.110 0.175 0.121 0.119 0.084 0.061 314 H 0.143 0.099 0.101 0.170 0.142 0.122 0.111 0.045 0.034 0.020 0.012 315 A 0.058 0.044 0.045 0.056 0.052 0.064 0.135 0.108 0.137 0.138 0.163 316 M 0.044 0.039 0.033 0.077 0.083 0.119 0.197 0.122 0.131 0.094 0.061 317 M 0.030 0.062 0.080 0.084 0.062 0.086 0.190 0.121 0.130 0.094 0.062 318 G 0.021 0.025 0.058 0.058 0.080 0.121 0.208 0.130 0.129 0.097 0.072 319 T 0.012 0.021 0.057 0.056 0.045 0.064 0.175 0.135 0.172 0.151 0.111 320 A 0.004 0.011 0.053 0.043 0.030 0.042 0.141 0.131 0.200 0.197 0.150 321 A 0.001 0.005 0.057 0.022 0.024 0.040 0.117 0.119 0.192 0.211 0.212 322 V 0.002 0.005 0.088 0.035 0.023 0.033 0.132 0.118 0.193 0.199 0.172 323 A 0.001 0.003 0.055 0.035 0.024 0.032 0.132 0.140 0.205 0.216 0.158 324 I 0.001 0.001 0.028 0.013 0.014 0.025 0.089 0.104 0.194 0.250 0.283 325 G 0.001 0.001 0.026 0.013 0.011 0.020 0.104 0.131 0.217 0.243 0.232 326 T 0.001 0.003 0.060 0.046 0.043 0.070 0.188 0.150 0.173 0.151 0.115 327 A 0.001 0.003 0.028 0.017 0.017 0.038 0.132 0.134 0.194 0.213 0.222 328 A 0.002 0.003 0.016 0.024 0.033 0.065 0.185 0.168 0.200 0.164 0.140 329 A 0.005 0.016 0.036 0.061 0.074 0.111 0.196 0.146 0.148 0.113 0.094 330 I 0.011 0.016 0.021 0.040 0.049 0.083 0.174 0.139 0.181 0.153 0.133 331 P 0.225 0.205 0.096 0.150 0.091 0.084 0.081 0.030 0.020 0.011 0.007 332 G 0.177 0.124 0.070 0.152 0.130 0.119 0.105 0.047 0.036 0.024 0.016 333 T 0.058 0.102 0.054 0.136 0.116 0.098 0.129 0.082 0.083 0.070 0.071 334 L 0.008 0.011 0.008 0.029 0.039 0.061 0.128 0.140 0.191 0.194 0.191 335 V 0.007 0.009 0.009 0.017 0.021 0.033 0.090 0.116 0.188 0.205 0.306 336 N 0.025 0.027 0.038 0.106 0.105 0.115 0.164 0.117 0.117 0.096 0.090 337 L 0.016 0.030 0.056 0.110 0.105 0.107 0.168 0.118 0.114 0.098 0.078 338 A 0.014 0.020 0.031 0.057 0.055 0.066 0.127 0.120 0.167 0.165 0.178 339 A 0.018 0.023 0.028 0.047 0.045 0.059 0.123 0.119 0.179 0.182 0.176 340 G 0.161 0.175 0.097 0.178 0.115 0.089 0.081 0.039 0.032 0.021 0.013 341 G 0.384 0.169 0.068 0.120 0.071 0.058 0.057 0.027 0.021 0.014 0.010 342 G 0.434 0.153 0.039 0.087 0.064 0.051 0.053 0.033 0.034 0.028 0.025 343 E 0.207 0.204 0.069 0.162 0.112 0.083 0.066 0.031 0.029 0.020 0.017 344 R 0.073 0.080 0.052 0.139 0.149 0.132 0.130 0.081 0.076 0.051 0.036 345 S 0.137 0.123 0.097 0.198 0.153 0.106 0.090 0.043 0.029 0.015 0.009 346 A 0.053 0.088 0.071 0.275 0.225 0.143 0.090 0.028 0.015 0.007 0.004 347 V 0.002 0.002 0.002 0.007 0.011 0.020 0.076 0.129 0.235 0.265 0.251 348 R 0.013 0.053 0.053 0.194 0.205 0.157 0.161 0.076 0.049 0.024 0.014 349 F 0.003 0.003 0.003 0.007 0.009 0.017 0.065 0.118 0.229 0.273 0.272 350 G 0.045 0.063 0.035 0.184 0.190 0.156 0.149 0.070 0.054 0.032 0.023 351 H 0.014 0.023 0.010 0.043 0.048 0.066 0.148 0.167 0.198 0.167 0.117 352 P 0.120 0.087 0.044 0.137 0.123 0.110 0.122 0.074 0.072 0.056 0.052 353 S 0.119 0.118 0.052 0.169 0.133 0.105 0.114 0.070 0.055 0.037 0.028 354 G 0.072 0.057 0.026 0.104 0.122 0.142 0.180 0.116 0.092 0.059 0.031 355 T 0.050 0.104 0.088 0.281 0.204 0.118 0.076 0.032 0.023 0.014 0.011 356 L 0.003 0.003 0.004 0.011 0.017 0.035 0.111 0.145 0.217 0.234 0.219 357 R 0.026 0.100 0.108 0.401 0.212 0.082 0.043 0.014 0.008 0.004 0.002 358 V 0.005 0.006 0.005 0.012 0.017 0.031 0.106 0.146 0.227 0.239 0.205 359 G 0.047 0.120 0.105 0.302 0.203 0.108 0.066 0.022 0.014 0.007 0.005 360 A 0.009 0.009 0.007 0.016 0.021 0.038 0.119 0.134 0.207 0.223 0.217 361 E 0.078 0.203 0.150 0.326 0.135 0.054 0.032 0.011 0.006 0.003 0.002 362 A 0.017 0.019 0.016 0.038 0.053 0.079 0.163 0.152 0.181 0.158 0.125 363 S 0.121 0.216 0.115 0.256 0.132 0.070 0.047 0.017 0.013 0.008 0.007 364 Q 0.102 0.090 0.069 0.180 0.159 0.140 0.127 0.057 0.041 0.023 0.013 365 A 0.279 0.135 0.083 0.139 0.085 0.065 0.071 0.039 0.037 0.030 0.036 366 N 0.341 0.246 0.071 0.152 0.078 0.045 0.033 0.014 0.010 0.006 0.004 367 G 0.453 0.177 0.054 0.121 0.073 0.049 0.035 0.015 0.012 0.007 0.005 368 E 0.159 0.200 0.089 0.240 0.153 0.081 0.045 0.015 0.010 0.005 0.003 369 W 0.009 0.024 0.025 0.088 0.121 0.149 0.202 0.141 0.122 0.080 0.040 370 T 0.015 0.070 0.052 0.254 0.251 0.168 0.115 0.041 0.021 0.009 0.004 371 V 0.005 0.003 0.004 0.009 0.012 0.018 0.059 0.110 0.222 0.255 0.303 372 T 0.022 0.045 0.050 0.192 0.227 0.179 0.170 0.064 0.033 0.013 0.005 373 K 0.023 0.075 0.067 0.263 0.219 0.154 0.116 0.044 0.025 0.010 0.004 374 A 0.003 0.002 0.003 0.006 0.007 0.013 0.056 0.104 0.206 0.271 0.329 375 I 0.010 0.031 0.036 0.129 0.151 0.166 0.220 0.115 0.082 0.040 0.021 376 M 0.001 0.005 0.009 0.014 0.015 0.024 0.081 0.126 0.244 0.257 0.224 377 S 0.007 0.020 0.029 0.099 0.162 0.202 0.226 0.112 0.079 0.043 0.023 378 R 0.023 0.032 0.047 0.115 0.118 0.151 0.226 0.125 0.094 0.048 0.021 379 S 0.005 0.015 0.034 0.061 0.053 0.059 0.149 0.144 0.188 0.160 0.131 380 A 0.004 0.004 0.017 0.019 0.021 0.037 0.118 0.138 0.223 0.230 0.189 381 R 0.012 0.019 0.101 0.176 0.180 0.163 0.155 0.079 0.061 0.037 0.017 382 I 0.003 0.009 0.057 0.070 0.104 0.172 0.246 0.134 0.102 0.065 0.038 383 L 0.001 0.004 0.019 0.020 0.015 0.021 0.077 0.100 0.198 0.262 0.283 384 M 0.002 0.006 0.015 0.016 0.018 0.035 0.141 0.166 0.228 0.213 0.160 385 E 0.018 0.084 0.252 0.307 0.172 0.086 0.046 0.016 0.010 0.005 0.003 386 G 0.020 0.021 0.028 0.043 0.061 0.106 0.233 0.161 0.144 0.114 0.069 387 W 0.070 0.111 0.101 0.274 0.164 0.099 0.093 0.039 0.027 0.014 0.008 388 V 0.010 0.010 0.008 0.011 0.014 0.026 0.078 0.107 0.198 0.250 0.290 389 R 0.031 0.120 0.110 0.318 0.200 0.108 0.063 0.023 0.015 0.007 0.005 390 V 0.027 0.035 0.019 0.051 0.066 0.090 0.165 0.153 0.171 0.134 0.089 391 P 0.188 0.206 0.093 0.219 0.122 0.071 0.049 0.021 0.015 0.009 0.005 392 G 0.408 0.154 0.049 0.106 0.081 0.060 0.058 0.031 0.024 0.017 0.010 393 D 0.475 0.206 0.060 0.118 0.058 0.033 0.023 0.011 0.009 0.005 0.003 394 A 0.238 0.163 0.056 0.134 0.101 0.083 0.079 0.051 0.046 0.030 0.020 395 F 0.248 0.143 0.058 0.117 0.089 0.083 0.087 0.057 0.056 0.038 0.025