Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)
10 20 30
| | |
1 ...M.....ASK..KP.....DKTYEEMVKEVERLKLENKTLKQKVKS....S..GA..V..S..
2 ...M.....ASR..RS.....CADVEELEKELQKLKIENKALKKKLVQ....-..-H..T..S..
3 ...M.....ASR..RS.....CADVEELEKELQKLKIENKALKKKLVQ....-..-H..T..S..
4 ...M.....ASR..RS.....CADVEELEKELQKLKIENKALKKKLVQ....-..-H..T..S..
5 ...M.....ASK..RP.....CAGVEELEKELQKLKLENKTLKKQLIQ....-..-Q..A..G..
6 ...M.....ASG..RA.....SSDVEELQKELQKLKLENKALKKKMLQ....G..N-..-..-..
7 ...M.....ASR..RS.....CADVEELEKELQKLKIENKALKKKLVQ....-..-H..T..S..
8 ...M.....ASK..KP.....SVDVDELQKELQRLKLENKTLKKKMQQ....-..--..V..S..
9 ...M.....ASK..KP.....SVDVDELQKELQKLKLENKALKKKMQQ....-..--..V..S..
10 ...M.....ASK..KP.....SVDVDELQKELQKLKLENKALKKKMQQ....-..--..V..S..
11 sgsR.....KNP..KA.....QPTMEDLEAKIAQLQLENKQLKKRIKH....GtdPQ..P..L..
12 ...Rpkt..RAP..KK.....ELTMEELAAQVQKLSVENKQLKKLINS....G..DP..Tr.S..
13 ...Rpkt..RAP..KK.....ELTMEELAAQVQKLSVENKQLKKLINS....G..DP..Tr.S..
14 ...KtrvpsGKG..MA.....EMSVEDMAARLARLESENKALKQQVRR....G..GT..C..As1
15 aapR.....GRP..KK.....DLTMEDLTAKISQLTVENRELRKAL--....G..ST..A..D..
16 k..V.....RLPsvKAv....DMSMEDMAARLARLESENKALKQQVLR....G..GA..C..As1
17 k..V.....RLPsvKAv....DMSMEDMAARLARLESENKALKQQVLR....G..GA..C..As1
18 aapR.....GRP..KK.....DLTMEDLTAKISQLTVENRELRKAL--....G..ST..A..D..
19 ...M.....ASK..KP.....DKTYEEMVKEVERLKLENKTLKQKVKS....S..GA..V..S..
20 ipaM.....ASS..KKsk6aeGMSMEELVTRLTRLEMENKTLKNQVKSksqsA..DP..Iq.S..
21 qstK.....GAP..GQ.....GQTMAQLAAQLAQLQMENRNLKRQIRK....Sv.GH..P..E..
22 ...M.....--D..PK.....NLTVEQLAAELTKLQMENSHLKRKLRRsv..G..GP..PkeP..
23 gkpQ.....AGG..PA.....DNSVEKLAAELTRLQMENSKLRRKLRQst..G..GAscL..L..
24 ggsK.....RCP..KK.....QPTPEELAEELVKLRMENKALKSKLKE....-..-H..V..G..
40 50 60 70 80 9
| | | | |
1 ...S..DD.....SI....LTAAKRESIIVSSSRALGAVAMRKIEAKVRSRAAKAVTEQELTSLL
2 ...P..ED.....EL....LTPAQKDAIINSTVNKLTKKAEEKIRERVLKDVLPLVSKNQCMEAI
3 ...P..ED.....EM....LTSAQKDAIINSTVNKLTKKAEEKIRERVLKDLLPLVSKNQCMGAI
4 ...P..ED.....EM....LTSAQKDAIINSTVNKLTKKAEEKIRERVLKDLLPLVSKNQCMEAI
5 ...P..DD.....EI....LTPSQKDALITSVVNKLTKQADEKIRIKVTKDLLPLVTKKQCMEAI
6 ...P..EE.....EM....LTPPQKEILINSLVSKLTKQAELKIRERVTKDLLPLVTKNQCMEAI
7 ...S..ED.....EM....LTSAQKDAIINSTVNKLTKKAEEKIRERVLKDLLPLVSKNQCMEAI
8 ...P..ND.....EM....LTPSQKESIINSVVNSLTKNAEKKIRLRVSNDLLPLVTKQQCVDAI
9 ...P..ND.....EI....LTPSQKETIINSVVNSLTKNAEKKIRLRVSNDLLPLVTKHQCMEAI
10 ...P..ND.....EI....LTPSQKETIINSVVNSLTKNAEKKIRLRVSNDLLPLVTKQQCMEAI
11 ...P..GD.....PI....VTPAQREAMIGAATAALTSQASKKIEAKVRHHTSRAVTKEELEAAI
12 ...G..SD.....PV....ISNTEKEAKIAAAVSALCNVATRKIEAKVRAATAKAVTRGQMEDAL
13 ...G..SD.....PV....ISNSEKEAKIAAAVSALCNVATRKIEAKVRAVTAKAVTRGQVEEAL
14 0plP..PP.....EP....LTPRQREVMITQATGRLVSLAMQKIEDKVRKAVDGVNTRPEMEDIL
15 ...P..RD.....RH....LTPTEKEAQLTATVGALSAAAAKKIEARVRTIFSKVVTQKQVDDAL
16 0pvP..PP.....EP....LTARQREVMITQATGRLASQAMKKIEDKVRKSVDGVTTRNEMENIL
17 0pvP..PP.....EP....LTARQREVMITQATGRLASQAMKKIEDKVRKSVDGVTTRNEMENIL
18 ...P..RD.....RP....LTATEKEAQLTATVGALSAAAAKKIEARVRTIFSKVVTQKQVDDAL
19 ...S..DD.....SI....LTAAKRESIIVSSSRALGAVAMRKIEAKVRSRAAKAVTEQELTSLL
20 ...P..PGggrtrEV....LTARQKQVLITQAISRLSSQAMQKIEQRVVAEMEDVRTRDEAEQKI
21 ...DisQP.....KS....LNPRQKQALISSYLTKFSSLATKKLEFKLATLTAPLQTKEEIEAVL
22 ...P..KP.....RE....LTEPERQLVLARWHNRFSSRSSELLRRQLDKLTATLVTEEDIDEVL
23 ...P..GE.....ETkpgkLSPEDKNILLAAWHTKFAAKASEKLYRKIKALTAEEDDEEGINKVL
24 ...D..DD.....VV....LTQAAKEAMVGSVVSGLTRSAAKQIEERIRKETLKATTKNEFEEVI
0 100
| |
1 QSLTLRVDVSMEE...
2 AHIKYRIDVSIDEtyn
3 ARIKYRIDVSVDEtcd
4 ARIKYRIDVSVDEtcd
5 TILKYRIDVSTDEpqd
6 ADIKYRIDVSTKEsqd
7 ARIRYRIDVSVDEtcd
8 ANIKYRIEVSPEEpqd
9 ANIKYRIEVFPEEpqd
10 PNIKYRIEVSPEEpqd
11 ANIRIRVDLSMEDvtl
12 AGISIRVDVSMDEttr
13 AGINIRVDVSMDEttr
14 KNLTVRLQVSMSGakg
15 KGLSLRIDVCMSDggt
16 QNLTLRIQVSMLGakg
17 QNLTLRIQVSMLGakg
18 KGLSLRIDVCMSDggt
19 QSLTLRVDVSMEEttv
20 QSLTIRIQVSMSCskc
21 EGTTIRLHLTLQDlvp
22 KNADFRLHFRPDPsen
23 ASSTIRVHASVDPedr
24 KTLSFRVSLSYADlgg