# TARGET T0297 # Using neural net t2k-5651-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghtl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 6 (1 EBGHTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0297.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 309 # Pos AA E B G H T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.100 0.010 0.012 0.022 0.208 0.648 2 A 0.204 0.036 0.011 0.020 0.122 0.607 3 V 0.178 0.024 0.007 0.021 0.091 0.679 4 Q 0.139 0.017 0.011 0.023 0.107 0.703 5 L 0.120 0.026 0.009 0.029 0.119 0.698 6 L 0.085 0.016 0.013 0.043 0.190 0.654 7 E 0.070 0.023 0.020 0.061 0.277 0.549 8 N 0.051 0.008 0.062 0.115 0.393 0.371 9 W 0.027 0.007 0.105 0.151 0.448 0.263 10 L 0.019 0.009 0.109 0.240 0.426 0.196 11 L 0.016 0.009 0.067 0.296 0.390 0.223 12 K 0.014 0.006 0.030 0.237 0.367 0.346 13 E 0.013 0.006 0.026 0.307 0.296 0.353 14 Q 0.017 0.007 0.038 0.622 0.181 0.136 15 E 0.035 0.006 0.043 0.697 0.129 0.091 16 K 0.060 0.005 0.046 0.712 0.097 0.079 17 I 0.068 0.004 0.033 0.768 0.064 0.063 18 Q 0.071 0.005 0.021 0.768 0.063 0.072 19 T 0.054 0.002 0.016 0.797 0.056 0.075 20 K 0.049 0.003 0.015 0.797 0.054 0.082 21 Y 0.064 0.005 0.021 0.780 0.062 0.070 22 R 0.070 0.004 0.022 0.762 0.068 0.074 23 H 0.074 0.005 0.023 0.699 0.080 0.119 24 L 0.083 0.006 0.034 0.663 0.094 0.121 25 N 0.060 0.005 0.044 0.599 0.131 0.161 26 H 0.042 0.006 0.060 0.493 0.183 0.216 27 I 0.041 0.012 0.077 0.312 0.288 0.270 28 S 0.033 0.007 0.104 0.195 0.382 0.279 29 V 0.027 0.008 0.077 0.108 0.446 0.335 30 V 0.025 0.015 0.036 0.036 0.367 0.522 31 E 0.034 0.007 0.010 0.008 0.267 0.675 32 P 0.095 0.002 0.005 0.005 0.196 0.697 33 N 0.637 0.006 0.004 0.004 0.075 0.273 34 I 0.978 0.002 0.001 0.001 0.004 0.015 35 L 0.993 0.001 0.001 0.001 0.001 0.004 36 F 0.988 0.001 0.001 0.001 0.002 0.008 37 I 0.881 0.003 0.002 0.003 0.029 0.082 38 G 0.155 0.006 0.032 0.026 0.504 0.277 39 D 0.010 0.004 0.099 0.052 0.696 0.139 40 S 0.011 0.008 0.295 0.072 0.557 0.056 41 I 0.029 0.010 0.361 0.211 0.340 0.049 42 V 0.065 0.012 0.251 0.347 0.236 0.088 43 E 0.119 0.015 0.178 0.328 0.269 0.090 44 Y 0.077 0.008 0.114 0.193 0.409 0.200 45 Y 0.091 0.017 0.069 0.121 0.437 0.265 46 P 0.069 0.029 0.060 0.075 0.459 0.308 47 L 0.047 0.021 0.072 0.087 0.478 0.295 48 Q 0.037 0.017 0.158 0.093 0.485 0.210 49 E 0.025 0.008 0.215 0.092 0.490 0.169 50 L 0.029 0.010 0.219 0.083 0.498 0.160 51 F 0.051 0.016 0.131 0.085 0.480 0.237 52 G 0.082 0.021 0.053 0.032 0.466 0.347 53 T 0.099 0.026 0.026 0.017 0.408 0.425 54 S 0.142 0.015 0.021 0.008 0.331 0.483 55 K 0.333 0.010 0.018 0.015 0.257 0.367 56 T 0.623 0.007 0.010 0.012 0.109 0.238 57 I 0.876 0.008 0.004 0.008 0.034 0.069 58 V 0.875 0.007 0.006 0.009 0.038 0.064 59 N 0.813 0.008 0.005 0.010 0.044 0.120 60 R 0.652 0.007 0.006 0.013 0.082 0.241 61 G 0.373 0.024 0.005 0.012 0.176 0.410 62 I 0.186 0.049 0.009 0.016 0.422 0.317 63 R 0.096 0.021 0.014 0.028 0.464 0.378 64 G 0.058 0.017 0.041 0.099 0.521 0.265 65 Y 0.054 0.016 0.056 0.263 0.397 0.215 66 Q 0.057 0.026 0.054 0.376 0.238 0.249 67 T 0.020 0.008 0.046 0.643 0.135 0.147 68 G 0.005 0.001 0.042 0.859 0.055 0.038 69 L 0.003 0.001 0.050 0.907 0.030 0.009 70 L 0.003 0.001 0.051 0.917 0.024 0.005 71 L 0.003 0.001 0.041 0.921 0.025 0.008 72 E 0.004 0.001 0.040 0.905 0.033 0.017 73 N 0.004 0.002 0.029 0.856 0.054 0.055 74 L 0.004 0.005 0.033 0.593 0.119 0.246 75 D 0.007 0.003 0.131 0.527 0.198 0.134 76 A 0.006 0.002 0.160 0.565 0.191 0.075 77 H 0.004 0.003 0.218 0.550 0.182 0.043 78 L 0.008 0.005 0.157 0.525 0.235 0.070 79 Y 0.009 0.002 0.163 0.442 0.278 0.106 80 G 0.012 0.009 0.119 0.321 0.376 0.162 81 G 0.009 0.020 0.054 0.111 0.420 0.386 82 A 0.010 0.005 0.012 0.006 0.452 0.515 83 V 0.036 0.001 0.006 0.002 0.486 0.468 84 D 0.376 0.005 0.004 0.001 0.279 0.335 85 K 0.989 0.002 0.001 0.001 0.003 0.006 86 I 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.002 87 F 0.997 0.001 0.001 0.001 0.001 0.003 88 L 0.987 0.001 0.001 0.001 0.001 0.011 89 L 0.867 0.002 0.001 0.001 0.014 0.117 90 I 0.363 0.004 0.005 0.004 0.169 0.455 91 G 0.130 0.020 0.013 0.008 0.329 0.500 92 T 0.070 0.034 0.036 0.031 0.389 0.439 93 N 0.037 0.030 0.084 0.059 0.481 0.309 94 D 0.028 0.012 0.175 0.107 0.451 0.226 95 I 0.009 0.007 0.388 0.195 0.325 0.076 96 G 0.008 0.009 0.380 0.128 0.445 0.030 97 K 0.006 0.002 0.176 0.111 0.632 0.072 98 D 0.013 0.003 0.048 0.045 0.673 0.219 99 V 0.035 0.056 0.007 0.016 0.452 0.434 100 P 0.018 0.032 0.003 0.019 0.149 0.778 101 V 0.001 0.001 0.048 0.882 0.046 0.022 102 N 0.001 0.001 0.044 0.915 0.033 0.006 103 E 0.001 0.001 0.041 0.934 0.021 0.003 104 A 0.001 0.001 0.009 0.970 0.012 0.008 105 L 0.001 0.001 0.004 0.982 0.009 0.004 106 N 0.001 0.001 0.003 0.980 0.010 0.007 107 N 0.001 0.001 0.002 0.982 0.005 0.011 108 L 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 109 E 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 110 A 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 111 I 0.001 0.001 0.001 0.997 0.001 0.001 112 I 0.001 0.001 0.001 0.997 0.002 0.001 113 Q 0.001 0.001 0.001 0.995 0.003 0.001 114 S 0.001 0.001 0.001 0.996 0.002 0.001 115 V 0.001 0.001 0.004 0.988 0.006 0.002 116 A 0.001 0.001 0.018 0.962 0.015 0.005 117 R 0.001 0.001 0.019 0.902 0.051 0.028 118 D 0.001 0.001 0.020 0.724 0.108 0.146 119 Y 0.003 0.005 0.007 0.026 0.428 0.531 120 P 0.010 0.005 0.012 0.005 0.571 0.398 121 L 0.051 0.006 0.022 0.003 0.614 0.304 122 T 0.431 0.010 0.013 0.002 0.357 0.187 123 E 0.824 0.003 0.002 0.001 0.037 0.132 124 I 0.981 0.003 0.001 0.001 0.003 0.013 125 K 0.984 0.001 0.001 0.001 0.003 0.013 126 L 0.972 0.001 0.001 0.001 0.003 0.024 127 L 0.890 0.002 0.001 0.001 0.012 0.094 128 S 0.607 0.005 0.001 0.002 0.050 0.335 129 I 0.277 0.012 0.002 0.003 0.100 0.607 130 L 0.132 0.026 0.003 0.003 0.139 0.697 131 P 0.104 0.018 0.012 0.011 0.276 0.577 132 V 0.055 0.014 0.028 0.025 0.405 0.473 133 N 0.036 0.017 0.044 0.058 0.412 0.433 134 E 0.027 0.018 0.043 0.091 0.376 0.446 135 R 0.020 0.013 0.050 0.186 0.273 0.458 136 E 0.016 0.016 0.095 0.359 0.254 0.260 137 E 0.014 0.006 0.129 0.454 0.257 0.140 138 Y 0.018 0.004 0.112 0.474 0.252 0.140 139 Q 0.022 0.006 0.074 0.530 0.231 0.136 140 Q 0.012 0.004 0.057 0.609 0.206 0.113 141 A 0.012 0.008 0.045 0.610 0.190 0.135 142 V 0.013 0.008 0.049 0.559 0.201 0.168 143 Y 0.011 0.006 0.034 0.593 0.178 0.177 144 I 0.010 0.004 0.026 0.644 0.147 0.169 145 R 0.008 0.003 0.023 0.724 0.102 0.140 146 S 0.007 0.003 0.011 0.811 0.055 0.113 147 N 0.004 0.001 0.007 0.895 0.034 0.059 148 E 0.003 0.001 0.006 0.938 0.022 0.032 149 K 0.002 0.001 0.007 0.949 0.016 0.024 150 I 0.001 0.001 0.004 0.975 0.007 0.012 151 Q 0.001 0.001 0.003 0.981 0.007 0.008 152 N 0.001 0.001 0.003 0.984 0.005 0.007 153 W 0.001 0.001 0.002 0.986 0.004 0.008 154 N 0.001 0.001 0.001 0.989 0.003 0.006 155 Q 0.001 0.001 0.001 0.992 0.003 0.004 156 A 0.001 0.001 0.001 0.989 0.004 0.005 157 Y 0.001 0.001 0.001 0.984 0.005 0.008 158 Q 0.001 0.001 0.004 0.970 0.012 0.013 159 E 0.001 0.001 0.005 0.960 0.019 0.016 160 L 0.001 0.001 0.007 0.956 0.017 0.019 161 A 0.001 0.001 0.029 0.904 0.041 0.025 162 S 0.001 0.001 0.072 0.828 0.075 0.023 163 A 0.001 0.001 0.072 0.690 0.159 0.076 164 Y 0.003 0.004 0.065 0.160 0.665 0.103 165 M 0.004 0.002 0.026 0.037 0.780 0.152 166 Q 0.010 0.002 0.022 0.013 0.758 0.195 167 V 0.133 0.009 0.013 0.009 0.572 0.265 168 E 0.516 0.014 0.007 0.007 0.124 0.332 169 F 0.879 0.016 0.002 0.005 0.022 0.075 170 V 0.879 0.014 0.001 0.009 0.020 0.076 171 P 0.599 0.020 0.003 0.032 0.055 0.291 172 V 0.091 0.003 0.074 0.469 0.138 0.226 173 F 0.030 0.003 0.168 0.510 0.160 0.129 174 D 0.013 0.003 0.260 0.559 0.126 0.039 175 C 0.014 0.004 0.186 0.635 0.116 0.046 176 L 0.022 0.009 0.100 0.695 0.120 0.054 177 T 0.023 0.004 0.091 0.660 0.146 0.075 178 D 0.016 0.003 0.056 0.563 0.210 0.151 179 Q 0.010 0.005 0.058 0.462 0.253 0.211 180 A 0.012 0.009 0.069 0.404 0.302 0.205 181 G 0.020 0.007 0.080 0.315 0.371 0.207 182 Q 0.036 0.012 0.078 0.204 0.393 0.276 183 L 0.038 0.014 0.111 0.212 0.375 0.249 184 K 0.041 0.013 0.184 0.169 0.358 0.236 185 K 0.048 0.019 0.253 0.170 0.315 0.195 186 E 0.090 0.026 0.213 0.138 0.327 0.206 187 Y 0.176 0.050 0.104 0.124 0.280 0.267 188 T 0.136 0.057 0.049 0.083 0.485 0.190 189 T 0.057 0.017 0.031 0.045 0.711 0.139 190 D 0.025 0.005 0.033 0.020 0.766 0.152 191 G 0.100 0.023 0.031 0.024 0.636 0.185 192 L 0.313 0.131 0.020 0.021 0.271 0.245 193 H 0.229 0.097 0.012 0.029 0.238 0.396 194 L 0.094 0.055 0.012 0.036 0.277 0.526 195 S 0.009 0.012 0.004 0.076 0.154 0.745 196 I 0.001 0.001 0.006 0.977 0.011 0.006 197 A 0.001 0.001 0.003 0.988 0.008 0.002 198 G 0.001 0.001 0.003 0.991 0.005 0.001 199 Y 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 200 Q 0.001 0.001 0.001 0.999 0.001 0.001 201 A 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 202 L 0.001 0.001 0.001 0.998 0.001 0.001 203 S 0.001 0.001 0.001 0.995 0.002 0.001 204 K 0.001 0.001 0.002 0.989 0.004 0.004 205 S 0.001 0.001 0.005 0.984 0.006 0.005 206 L 0.001 0.001 0.014 0.956 0.017 0.011 207 K 0.001 0.001 0.101 0.824 0.051 0.021 208 D 0.001 0.001 0.148 0.712 0.093 0.046 209 Y 0.003 0.001 0.118 0.577 0.129 0.173 210 L 0.011 0.017 0.032 0.247 0.114 0.578 211 Y 0.002 0.005 0.006 0.045 0.069 0.873