# TARGET T0296 # Using neural net t06-IDGaaH13-3-13-7-13-9-13-11-CB-burial-14-7-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 3 13 # 7 13 # 9 13 # 11 7 (1 CB_burial_14_7 ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0296.t06-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(1.3 bits/column, 1) # The weighting was determined by the posterior distribution # after regularizing with /projects/compbio/lib/recode3.20comp. # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 10.9074 # Pos AA A B C D E F G 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 M 0.644 0.184 0.093 0.053 0.020 0.005 0.001 2 D 0.697 0.213 0.064 0.021 0.005 0.001 0.001 3 I 0.371 0.225 0.179 0.140 0.066 0.018 0.001 4 R 0.494 0.272 0.133 0.066 0.025 0.008 0.001 5 Q 0.242 0.328 0.235 0.125 0.051 0.017 0.002 6 V 0.036 0.051 0.105 0.235 0.310 0.231 0.031 7 T 0.151 0.260 0.274 0.192 0.089 0.030 0.004 8 E 0.146 0.206 0.220 0.209 0.135 0.073 0.012 9 T 0.066 0.081 0.093 0.170 0.257 0.279 0.054 10 I 0.055 0.086 0.167 0.289 0.269 0.123 0.011 11 A 0.217 0.419 0.238 0.095 0.025 0.007 0.001 12 M 0.040 0.106 0.198 0.316 0.232 0.101 0.006 13 I 0.018 0.031 0.077 0.246 0.398 0.221 0.010 14 E 0.227 0.438 0.236 0.084 0.014 0.001 0.001 15 E 0.630 0.286 0.064 0.017 0.002 0.001 0.001 16 Q 0.312 0.388 0.205 0.079 0.014 0.002 0.001 17 N 0.353 0.397 0.178 0.060 0.011 0.001 0.001 18 F 0.015 0.053 0.135 0.336 0.364 0.095 0.003 19 D 0.041 0.139 0.236 0.282 0.207 0.083 0.012 20 I 0.005 0.018 0.038 0.084 0.216 0.490 0.149 21 R 0.007 0.018 0.059 0.163 0.244 0.331 0.178 22 T 0.005 0.022 0.041 0.069 0.147 0.354 0.362 23 I 0.002 0.005 0.012 0.046 0.114 0.314 0.508 24 T 0.005 0.021 0.043 0.071 0.138 0.355 0.367 25 M 0.006 0.019 0.036 0.083 0.158 0.337 0.360 26 G 0.009 0.039 0.082 0.159 0.251 0.304 0.156 27 I 0.010 0.019 0.035 0.101 0.227 0.396 0.212 28 S 0.019 0.061 0.128 0.222 0.265 0.239 0.066 29 L 0.028 0.050 0.069 0.132 0.229 0.356 0.136 30 L 0.036 0.098 0.171 0.265 0.252 0.152 0.026 31 D 0.047 0.159 0.245 0.272 0.181 0.083 0.013 32 C 0.046 0.058 0.086 0.173 0.292 0.283 0.061 33 I 0.097 0.138 0.186 0.244 0.211 0.114 0.010 34 D 0.190 0.307 0.274 0.159 0.055 0.014 0.001 35 P 0.435 0.274 0.149 0.086 0.041 0.013 0.003 36 D 0.475 0.297 0.131 0.064 0.024 0.008 0.001 37 I 0.130 0.150 0.226 0.270 0.164 0.057 0.004 38 N 0.460 0.314 0.142 0.060 0.019 0.005 0.001 39 R 0.376 0.374 0.160 0.063 0.020 0.006 0.001 40 A 0.078 0.125 0.192 0.298 0.224 0.079 0.004 41 A 0.043 0.110 0.217 0.328 0.223 0.074 0.006 42 E 0.330 0.407 0.186 0.061 0.013 0.003 0.001 43 K 0.087 0.289 0.331 0.216 0.064 0.012 0.001 44 I 0.009 0.021 0.045 0.154 0.389 0.361 0.020 45 Y 0.011 0.059 0.166 0.341 0.305 0.111 0.006 46 Q 0.198 0.445 0.234 0.092 0.024 0.006 0.001 47 K 0.021 0.103 0.261 0.354 0.198 0.060 0.004 48 I 0.004 0.017 0.042 0.138 0.354 0.408 0.038 49 T 0.028 0.146 0.299 0.325 0.157 0.042 0.002 50 T 0.155 0.497 0.233 0.084 0.024 0.006 0.001 51 K 0.008 0.077 0.234 0.372 0.236 0.070 0.003 52 A 0.002 0.007 0.022 0.135 0.430 0.379 0.024 53 A 0.039 0.318 0.408 0.190 0.040 0.004 0.001 54 N 0.036 0.240 0.386 0.264 0.066 0.009 0.001 55 L 0.003 0.008 0.016 0.073 0.326 0.531 0.043 56 V 0.004 0.033 0.171 0.418 0.295 0.077 0.003 57 A 0.076 0.458 0.317 0.114 0.028 0.006 0.001 58 V 0.018 0.065 0.168 0.337 0.284 0.121 0.008 59 G 0.008 0.021 0.063 0.208 0.383 0.293 0.023 60 D 0.159 0.416 0.279 0.111 0.029 0.006 0.001 61 E 0.170 0.395 0.265 0.130 0.032 0.006 0.001 62 I 0.046 0.092 0.150 0.317 0.285 0.107 0.004 63 A 0.201 0.265 0.241 0.193 0.081 0.018 0.001 64 A 0.691 0.231 0.056 0.018 0.003 0.001 0.001 65 E 0.448 0.324 0.154 0.058 0.014 0.003 0.001 66 L 0.175 0.228 0.255 0.209 0.100 0.032 0.002 67 G 0.231 0.229 0.200 0.172 0.113 0.049 0.005 68 I 0.095 0.106 0.138 0.217 0.237 0.175 0.032 69 P 0.155 0.198 0.199 0.190 0.139 0.094 0.025 70 I 0.101 0.100 0.115 0.175 0.220 0.219 0.070 71 V 0.159 0.155 0.171 0.211 0.162 0.110 0.032 72 N 0.187 0.213 0.171 0.163 0.129 0.100 0.036 73 K 0.150 0.167 0.169 0.197 0.153 0.121 0.043 74 R 0.063 0.111 0.149 0.195 0.206 0.199 0.076 75 V 0.040 0.053 0.068 0.118 0.192 0.333 0.196 76 S 0.042 0.075 0.117 0.196 0.223 0.228 0.120 77 V 0.032 0.050 0.071 0.130 0.204 0.300 0.213 78 T 0.069 0.101 0.140 0.197 0.200 0.192 0.101 79 P 0.061 0.081 0.094 0.131 0.176 0.278 0.178 80 I 0.051 0.069 0.087 0.135 0.193 0.280 0.184 81 S 0.076 0.139 0.170 0.205 0.184 0.165 0.062 82 L 0.056 0.090 0.137 0.192 0.221 0.220 0.084 83 I 0.050 0.067 0.096 0.163 0.237 0.291 0.096 84 G 0.097 0.097 0.123 0.190 0.250 0.205 0.038 85 A 0.203 0.253 0.225 0.185 0.098 0.032 0.004 86 A 0.219 0.299 0.208 0.161 0.081 0.029 0.003 87 T 0.150 0.194 0.221 0.230 0.146 0.053 0.005 88 D 0.464 0.318 0.134 0.061 0.018 0.004 0.001 89 A 0.357 0.287 0.191 0.116 0.039 0.009 0.001 90 T 0.461 0.302 0.144 0.063 0.022 0.007 0.001 91 D 0.154 0.314 0.280 0.168 0.066 0.016 0.001 92 Y 0.015 0.038 0.093 0.236 0.359 0.237 0.022 93 V 0.019 0.076 0.162 0.304 0.296 0.132 0.010 94 V 0.042 0.269 0.315 0.225 0.105 0.040 0.005 95 L 0.003 0.011 0.041 0.160 0.359 0.377 0.050 96 A 0.001 0.002 0.005 0.024 0.155 0.619 0.194 97 K 0.011 0.089 0.277 0.350 0.199 0.068 0.006 98 A 0.005 0.069 0.260 0.383 0.215 0.063 0.004 99 L 0.001 0.002 0.004 0.022 0.174 0.641 0.157 100 D 0.004 0.031 0.139 0.342 0.323 0.150 0.011 101 K 0.050 0.417 0.357 0.134 0.033 0.007 0.001 102 A 0.012 0.062 0.174 0.371 0.288 0.088 0.005 103 A 0.006 0.017 0.049 0.217 0.454 0.246 0.012 104 K 0.182 0.432 0.263 0.100 0.020 0.003 0.001 105 E 0.361 0.429 0.149 0.048 0.010 0.002 0.001 106 I 0.019 0.098 0.234 0.340 0.219 0.086 0.005 107 G 0.043 0.136 0.229 0.280 0.208 0.092 0.012 108 V 0.016 0.029 0.047 0.111 0.247 0.409 0.142 109 D 0.012 0.039 0.083 0.162 0.235 0.323 0.146 110 F 0.011 0.018 0.034 0.074 0.165 0.379 0.320 111 I 0.014 0.025 0.037 0.080 0.175 0.389 0.281 112 G 0.028 0.072 0.119 0.175 0.198 0.245 0.164 113 G 0.028 0.050 0.080 0.143 0.211 0.304 0.184 114 F 0.026 0.037 0.050 0.101 0.202 0.371 0.214 115 S 0.065 0.125 0.160 0.198 0.185 0.181 0.085 116 A 0.055 0.113 0.141 0.173 0.193 0.222 0.102 117 L 0.041 0.064 0.097 0.173 0.247 0.271 0.108 118 V 0.060 0.100 0.146 0.207 0.233 0.203 0.052 119 Q 0.209 0.241 0.201 0.167 0.111 0.058 0.013 120 K 0.238 0.246 0.214 0.171 0.088 0.036 0.007 121 G 0.328 0.252 0.164 0.132 0.080 0.039 0.006 122 Y 0.136 0.152 0.191 0.249 0.183 0.081 0.008 123 Q 0.504 0.284 0.124 0.060 0.021 0.006 0.001 124 K 0.585 0.249 0.100 0.046 0.015 0.004 0.001 125 G 0.513 0.265 0.122 0.065 0.026 0.008 0.001 126 D 0.164 0.242 0.251 0.208 0.100 0.031 0.003 127 E 0.109 0.212 0.246 0.233 0.140 0.054 0.006 128 I 0.046 0.139 0.200 0.261 0.221 0.118 0.015 129 L 0.008 0.027 0.070 0.180 0.317 0.348 0.050 130 I 0.004 0.015 0.038 0.121 0.291 0.435 0.097 131 N 0.052 0.214 0.293 0.244 0.126 0.058 0.012 132 S 0.018 0.080 0.202 0.318 0.251 0.115 0.016 133 I 0.007 0.012 0.018 0.060 0.223 0.525 0.154 134 P 0.023 0.068 0.168 0.303 0.276 0.149 0.013 135 R 0.144 0.378 0.270 0.141 0.049 0.015 0.002 136 A 0.031 0.098 0.197 0.319 0.239 0.106 0.010 137 L 0.026 0.042 0.084 0.221 0.352 0.253 0.021 138 A 0.233 0.365 0.235 0.120 0.037 0.008 0.001 139 E 0.481 0.347 0.119 0.042 0.009 0.001 0.001 140 T 0.167 0.238 0.245 0.213 0.102 0.032 0.003 141 D 0.331 0.331 0.191 0.099 0.035 0.011 0.002 142 K 0.129 0.243 0.253 0.210 0.116 0.043 0.006 143 V 0.021 0.042 0.080 0.189 0.300 0.304 0.063 144 C 0.014 0.055 0.102 0.163 0.238 0.308 0.121 145 S 0.029 0.061 0.093 0.157 0.205 0.286 0.168 146 S 0.015 0.047 0.098 0.183 0.235 0.270 0.152 147 V 0.015 0.021 0.033 0.080 0.184 0.379 0.287 148 N 0.032 0.075 0.138 0.207 0.222 0.230 0.096 149 I 0.033 0.050 0.062 0.112 0.188 0.343 0.212 150 G 0.066 0.088 0.109 0.188 0.233 0.235 0.081 151 S 0.139 0.218 0.207 0.203 0.133 0.078 0.021 152 T 0.284 0.248 0.172 0.145 0.090 0.046 0.014 153 K 0.230 0.254 0.188 0.141 0.094 0.068 0.025 154 S 0.163 0.194 0.196 0.181 0.132 0.093 0.040 155 G 0.090 0.156 0.192 0.212 0.189 0.131 0.030 156 I 0.052 0.076 0.107 0.174 0.236 0.260 0.095 157 N 0.045 0.104 0.116 0.131 0.173 0.289 0.142 158 M 0.045 0.070 0.110 0.190 0.261 0.254 0.070 159 T 0.117 0.289 0.274 0.185 0.088 0.039 0.009 160 A 0.034 0.086 0.166 0.268 0.269 0.152 0.026 161 V 0.023 0.031 0.046 0.133 0.302 0.393 0.072 162 A 0.069 0.214 0.295 0.274 0.121 0.025 0.002 163 D 0.112 0.344 0.298 0.173 0.056 0.014 0.001 164 M 0.023 0.074 0.120 0.241 0.302 0.221 0.020 165 G 0.045 0.124 0.221 0.302 0.213 0.085 0.010 166 R 0.132 0.374 0.272 0.145 0.056 0.018 0.003 167 I 0.016 0.072 0.203 0.301 0.258 0.138 0.012 168 I 0.009 0.020 0.039 0.116 0.305 0.438 0.073 169 K 0.034 0.137 0.264 0.300 0.188 0.068 0.007 170 E 0.199 0.354 0.234 0.140 0.054 0.016 0.002 171 T 0.057 0.138 0.227 0.312 0.196 0.065 0.005 172 A 0.125 0.174 0.217 0.245 0.168 0.065 0.005 173 N 0.396 0.381 0.141 0.061 0.017 0.004 0.001 174 L 0.138 0.214 0.250 0.248 0.116 0.032 0.002 175 S 0.454 0.294 0.138 0.072 0.030 0.010 0.002 176 D 0.342 0.309 0.193 0.104 0.039 0.012 0.001 177 M 0.142 0.210 0.244 0.216 0.135 0.050 0.003 178 G 0.132 0.261 0.240 0.203 0.123 0.037 0.004 179 V 0.014 0.038 0.094 0.227 0.330 0.255 0.042 180 A 0.005 0.019 0.036 0.091 0.258 0.468 0.121 181 K 0.006 0.027 0.089 0.224 0.296 0.255 0.103 182 L 0.002 0.009 0.028 0.070 0.161 0.417 0.313 183 V 0.002 0.003 0.005 0.016 0.058 0.317 0.600 184 V 0.002 0.008 0.024 0.068 0.172 0.410 0.317 185 F 0.003 0.008 0.017 0.056 0.165 0.412 0.339 186 A 0.007 0.018 0.038 0.105 0.244 0.413 0.175 187 N 0.017 0.079 0.149 0.248 0.240 0.203 0.063 188 A 0.027 0.076 0.120 0.227 0.297 0.206 0.047 189 V 0.098 0.175 0.216 0.247 0.164 0.083 0.017 190 E 0.308 0.280 0.177 0.119 0.066 0.036 0.013 191 D 0.212 0.215 0.190 0.166 0.119 0.078 0.020 192 N 0.129 0.146 0.165 0.195 0.187 0.143 0.035 193 P 0.144 0.141 0.139 0.162 0.175 0.169 0.069 194 F 0.092 0.076 0.081 0.124 0.173 0.272 0.182 195 M 0.095 0.084 0.087 0.118 0.157 0.256 0.204 196 A 0.098 0.082 0.089 0.120 0.151 0.223 0.236 197 G 0.095 0.081 0.085 0.111 0.139 0.229 0.261 198 A 0.070 0.069 0.091 0.128 0.156 0.241 0.244 199 F 0.065 0.062 0.070 0.109 0.160 0.269 0.265 200 H 0.073 0.086 0.105 0.147 0.180 0.232 0.177 201 G 0.143 0.157 0.144 0.159 0.153 0.155 0.090 202 V 0.095 0.108 0.119 0.171 0.200 0.206 0.101 203 G 0.186 0.201 0.161 0.164 0.138 0.109 0.041 204 E 0.161 0.205 0.173 0.177 0.145 0.103 0.036 205 A 0.075 0.129 0.149 0.208 0.220 0.163 0.056 206 D 0.035 0.126 0.198 0.237 0.202 0.147 0.054 207 V 0.004 0.013 0.037 0.112 0.262 0.401 0.170 208 I 0.002 0.006 0.016 0.046 0.134 0.392 0.404 209 I 0.001 0.002 0.004 0.012 0.047 0.288 0.645 210 N 0.003 0.006 0.014 0.030 0.071 0.254 0.621 211 V 0.001 0.003 0.005 0.013 0.051 0.245 0.683 212 G 0.004 0.009 0.023 0.065 0.140 0.342 0.418 213 V 0.006 0.013 0.024 0.057 0.141 0.388 0.370 214 S 0.023 0.044 0.081 0.171 0.252 0.301 0.128 215 G 0.043 0.099 0.150 0.211 0.226 0.205 0.066 216 P 0.061 0.125 0.164 0.215 0.210 0.167 0.057 217 G 0.085 0.190 0.205 0.232 0.171 0.096 0.022 218 V 0.033 0.061 0.109 0.207 0.277 0.254 0.058 219 V 0.018 0.036 0.062 0.136 0.274 0.400 0.074 220 K 0.076 0.232 0.297 0.236 0.116 0.038 0.004 221 R 0.059 0.293 0.342 0.204 0.076 0.022 0.003 222 A 0.010 0.030 0.061 0.179 0.357 0.329 0.034 223 L 0.012 0.037 0.104 0.265 0.375 0.196 0.011 224 E 0.247 0.425 0.223 0.085 0.018 0.003 0.001 225 K 0.200 0.408 0.263 0.103 0.021 0.004 0.001 226 V 0.059 0.118 0.217 0.322 0.221 0.060 0.002 227 R 0.362 0.361 0.178 0.075 0.019 0.003 0.001 228 G 0.639 0.244 0.076 0.032 0.008 0.001 0.001 229 Q 0.389 0.336 0.179 0.075 0.019 0.003 0.001 230 S 0.170 0.378 0.272 0.132 0.040 0.007 0.001 231 F 0.017 0.044 0.120 0.305 0.368 0.139 0.008 232 D 0.101 0.330 0.316 0.175 0.062 0.014 0.001 233 V 0.040 0.139 0.256 0.300 0.192 0.068 0.005 234 V 0.013 0.021 0.032 0.102 0.300 0.470 0.062 235 A 0.015 0.053 0.153 0.305 0.302 0.157 0.015 236 E 0.101 0.324 0.291 0.174 0.072 0.033 0.005 237 T 0.027 0.081 0.164 0.305 0.278 0.132 0.012 238 V 0.010 0.013 0.031 0.127 0.329 0.423 0.068 239 K 0.082 0.227 0.282 0.236 0.122 0.045 0.005 240 K 0.238 0.388 0.223 0.105 0.034 0.010 0.002 241 T 0.058 0.113 0.172 0.266 0.230 0.139 0.021 242 A 0.074 0.130 0.154 0.206 0.220 0.178 0.038 243 F 0.072 0.114 0.150 0.223 0.224 0.171 0.046 244 K 0.066 0.139 0.185 0.219 0.189 0.146 0.055 245 I 0.039 0.055 0.076 0.135 0.209 0.304 0.182 246 T 0.053 0.092 0.128 0.187 0.213 0.230 0.097 247 R 0.077 0.111 0.147 0.192 0.187 0.187 0.100 248 I 0.053 0.060 0.076 0.127 0.187 0.309 0.187 249 G 0.047 0.061 0.071 0.107 0.169 0.309 0.236 250 Q 0.073 0.119 0.146 0.194 0.188 0.176 0.104 251 L 0.041 0.070 0.115 0.186 0.233 0.239 0.116 252 V 0.033 0.033 0.036 0.071 0.158 0.367 0.301 253 G 0.023 0.044 0.077 0.135 0.215 0.335 0.171 254 Q 0.118 0.228 0.254 0.209 0.117 0.059 0.014 255 M 0.033 0.136 0.245 0.308 0.190 0.076 0.012 256 A 0.011 0.022 0.038 0.127 0.320 0.422 0.059 257 S 0.019 0.070 0.146 0.290 0.314 0.151 0.010 258 E 0.255 0.448 0.195 0.079 0.019 0.003 0.001 259 R 0.084 0.320 0.366 0.181 0.042 0.007 0.001 260 L 0.011 0.037 0.090 0.253 0.411 0.189 0.008 261 G 0.138 0.393 0.290 0.132 0.039 0.007 0.001 262 V 0.005 0.025 0.079 0.261 0.401 0.215 0.014 263 E 0.031 0.122 0.253 0.328 0.188 0.066 0.012 264 F 0.004 0.011 0.027 0.071 0.197 0.498 0.192 265 G 0.006 0.014 0.040 0.106 0.167 0.376 0.290 266 I 0.004 0.009 0.016 0.035 0.099 0.335 0.503 267 V 0.003 0.005 0.009 0.029 0.090 0.283 0.582 268 D 0.008 0.016 0.027 0.056 0.126 0.318 0.450 269 L 0.024 0.032 0.054 0.087 0.115 0.265 0.422 270 S 0.046 0.061 0.067 0.102 0.133 0.262 0.329 271 L 0.070 0.058 0.059 0.095 0.148 0.268 0.302 272 A 0.084 0.078 0.078 0.115 0.154 0.247 0.244 273 P 0.095 0.099 0.115 0.148 0.159 0.206 0.178 274 T 0.104 0.129 0.131 0.161 0.158 0.186 0.131 275 P 0.162 0.166 0.145 0.156 0.146 0.143 0.082 276 A 0.239 0.205 0.156 0.149 0.116 0.092 0.044 277 V 0.096 0.147 0.163 0.181 0.163 0.169 0.082 278 G 0.113 0.164 0.159 0.167 0.165 0.161 0.071 279 D 0.112 0.178 0.186 0.199 0.184 0.111 0.030 280 S 0.045 0.132 0.193 0.240 0.207 0.144 0.040 281 V 0.007 0.014 0.030 0.088 0.207 0.408 0.245 282 A 0.015 0.051 0.101 0.181 0.282 0.298 0.072 283 R 0.045 0.165 0.261 0.288 0.162 0.068 0.011 284 V 0.017 0.055 0.134 0.246 0.277 0.224 0.047 285 L 0.007 0.016 0.023 0.069 0.224 0.488 0.172 286 E 0.024 0.100 0.185 0.297 0.256 0.120 0.018 287 E 0.085 0.285 0.295 0.199 0.091 0.037 0.008 288 M 0.027 0.092 0.201 0.302 0.230 0.126 0.022 289 G 0.077 0.141 0.171 0.232 0.211 0.145 0.023 290 L 0.133 0.196 0.190 0.213 0.167 0.086 0.015 291 E 0.339 0.323 0.178 0.101 0.039 0.016 0.004 292 T 0.160 0.224 0.240 0.200 0.114 0.052 0.009 293 V 0.122 0.102 0.117 0.179 0.222 0.201 0.057 294 G 0.159 0.193 0.166 0.162 0.140 0.126 0.054 295 T 0.172 0.174 0.154 0.171 0.153 0.127 0.049 296 H 0.129 0.138 0.151 0.189 0.188 0.145 0.060 297 G 0.094 0.096 0.116 0.155 0.177 0.225 0.137 298 T 0.045 0.054 0.069 0.105 0.164 0.295 0.268 299 T 0.042 0.056 0.073 0.133 0.223 0.280 0.193 300 A 0.023 0.029 0.051 0.109 0.189 0.300 0.298 301 A 0.007 0.008 0.011 0.021 0.054 0.292 0.607 302 L 0.002 0.004 0.008 0.021 0.065 0.280 0.620 303 A 0.007 0.027 0.076 0.172 0.268 0.291 0.159 304 L 0.005 0.011 0.039 0.149 0.315 0.350 0.131 305 L 0.002 0.005 0.005 0.013 0.067 0.483 0.424 306 N 0.003 0.010 0.038 0.154 0.343 0.397 0.055 307 D 0.034 0.207 0.312 0.275 0.123 0.044 0.005 308 Q 0.019 0.051 0.153 0.340 0.292 0.130 0.015 309 V 0.007 0.011 0.021 0.111 0.346 0.428 0.077 310 K 0.074 0.296 0.314 0.205 0.083 0.025 0.004 311 K 0.185 0.355 0.248 0.139 0.051 0.017 0.004 312 G 0.056 0.125 0.200 0.287 0.206 0.104 0.020 313 G 0.125 0.192 0.225 0.214 0.139 0.088 0.017 314 V 0.152 0.136 0.124 0.156 0.182 0.181 0.069 315 M 0.152 0.156 0.140 0.150 0.155 0.168 0.079 316 A 0.198 0.154 0.149 0.159 0.143 0.130 0.067 317 C 0.170 0.140 0.123 0.154 0.173 0.160 0.081 318 N 0.246 0.254 0.189 0.142 0.084 0.055 0.030 319 Q 0.169 0.190 0.203 0.201 0.132 0.075 0.030 320 V 0.077 0.074 0.079 0.125 0.197 0.278 0.171 321 G 0.080 0.110 0.141 0.196 0.182 0.185 0.106 322 G 0.043 0.049 0.065 0.100 0.156 0.293 0.295 323 L 0.016 0.018 0.019 0.038 0.100 0.313 0.496 324 S 0.012 0.019 0.035 0.069 0.129 0.275 0.462 325 G 0.011 0.021 0.033 0.057 0.101 0.255 0.523 326 A 0.003 0.006 0.010 0.026 0.078 0.261 0.616 327 F 0.003 0.007 0.018 0.052 0.113 0.312 0.496 328 I 0.004 0.009 0.019 0.036 0.081 0.277 0.574 329 P 0.010 0.026 0.042 0.082 0.140 0.322 0.377 330 V 0.012 0.044 0.073 0.134 0.208 0.295 0.235 331 S 0.016 0.041 0.052 0.088 0.163 0.328 0.311 332 E 0.008 0.038 0.082 0.186 0.262 0.315 0.108 333 D 0.003 0.016 0.060 0.178 0.331 0.343 0.070 334 E 0.111 0.322 0.313 0.177 0.061 0.015 0.001 335 G 0.051 0.285 0.359 0.216 0.069 0.018 0.002 336 M 0.005 0.008 0.018 0.095 0.368 0.475 0.031 337 I 0.022 0.087 0.220 0.359 0.248 0.063 0.002 338 A 0.230 0.554 0.175 0.036 0.005 0.001 0.001 339 A 0.043 0.153 0.352 0.340 0.101 0.012 0.001 340 V 0.050 0.080 0.158 0.344 0.303 0.064 0.001 341 Q 0.408 0.404 0.143 0.038 0.006 0.001 0.001 342 N 0.662 0.260 0.059 0.016 0.002 0.001 0.001 343 G 0.173 0.339 0.288 0.157 0.038 0.006 0.001 344 S 0.200 0.336 0.264 0.150 0.043 0.007 0.001 345 L 0.034 0.052 0.103 0.254 0.354 0.190 0.013 346 N 0.097 0.295 0.287 0.180 0.092 0.044 0.005 347 L 0.040 0.073 0.163 0.308 0.306 0.104 0.005 348 E 0.232 0.416 0.225 0.093 0.027 0.006 0.001 349 K 0.080 0.235 0.294 0.242 0.110 0.036 0.003 350 L 0.020 0.026 0.049 0.172 0.386 0.320 0.028 351 E 0.084 0.198 0.241 0.253 0.162 0.055 0.008 352 A 0.100 0.185 0.228 0.224 0.148 0.097 0.018 353 M 0.023 0.045 0.069 0.136 0.249 0.369 0.109 354 T 0.023 0.045 0.085 0.170 0.249 0.263 0.165 355 A 0.020 0.042 0.066 0.108 0.176 0.321 0.266 356 I 0.011 0.018 0.044 0.099 0.146 0.299 0.383 357 C 0.010 0.019 0.040 0.095 0.152 0.281 0.403 358 S 0.016 0.032 0.044 0.073 0.146 0.318 0.372 359 V 0.025 0.032 0.041 0.086 0.148 0.257 0.411 360 G 0.012 0.028 0.058 0.107 0.148 0.293 0.355 361 L 0.007 0.010 0.016 0.041 0.103 0.328 0.495 362 D 0.005 0.008 0.017 0.051 0.135 0.342 0.442 363 M 0.007 0.012 0.020 0.034 0.082 0.320 0.526 364 I 0.007 0.011 0.018 0.038 0.092 0.293 0.541 365 A 0.005 0.012 0.026 0.074 0.178 0.406 0.298 366 I 0.016 0.029 0.052 0.132 0.296 0.358 0.116 367 P 0.045 0.131 0.211 0.292 0.211 0.097 0.013 368 E 0.118 0.300 0.273 0.190 0.086 0.029 0.005 369 D 0.241 0.294 0.206 0.153 0.071 0.029 0.006 370 T 0.100 0.189 0.227 0.238 0.163 0.075 0.008 371 P 0.209 0.252 0.220 0.180 0.097 0.037 0.005 372 A 0.231 0.326 0.241 0.136 0.052 0.013 0.001 373 E 0.191 0.363 0.247 0.128 0.053 0.017 0.001 374 T 0.024 0.093 0.204 0.320 0.266 0.086 0.007 375 I 0.004 0.008 0.015 0.069 0.268 0.526 0.111 376 A 0.005 0.037 0.133 0.305 0.320 0.179 0.021 377 A 0.013 0.041 0.108 0.233 0.294 0.265 0.047 378 M 0.006 0.009 0.016 0.038 0.140 0.472 0.318 379 I 0.009 0.009 0.015 0.041 0.121 0.394 0.411 380 A 0.009 0.027 0.075 0.176 0.269 0.280 0.164 381 D 0.020 0.027 0.044 0.099 0.196 0.362 0.253 382 E 0.044 0.041 0.061 0.127 0.187 0.327 0.214 383 A 0.072 0.063 0.108 0.161 0.168 0.248 0.179 384 A 0.209 0.119 0.102 0.129 0.149 0.182 0.108 385 I 0.160 0.091 0.084 0.126 0.173 0.242 0.125 386 G 0.114 0.095 0.112 0.158 0.183 0.232 0.107 387 V 0.091 0.096 0.110 0.176 0.213 0.228 0.087 388 I 0.103 0.123 0.141 0.217 0.234 0.151 0.030 389 N 0.204 0.223 0.188 0.180 0.125 0.065 0.015 390 M 0.157 0.266 0.223 0.176 0.100 0.058 0.020 391 K 0.039 0.121 0.208 0.280 0.208 0.114 0.030 392 T 0.006 0.033 0.067 0.152 0.297 0.336 0.109 393 T 0.001 0.007 0.035 0.136 0.266 0.351 0.204 394 A 0.001 0.001 0.003 0.012 0.063 0.394 0.527 395 V 0.001 0.001 0.001 0.005 0.031 0.289 0.673 396 R 0.001 0.001 0.003 0.011 0.056 0.316 0.613 397 I 0.001 0.001 0.002 0.006 0.041 0.339 0.612 398 I 0.001 0.002 0.009 0.050 0.209 0.506 0.224 399 P 0.003 0.023 0.084 0.246 0.382 0.239 0.024 400 K 0.040 0.251 0.340 0.254 0.095 0.018 0.002 401 G 0.316 0.391 0.186 0.083 0.021 0.004 0.001 402 K 0.371 0.308 0.179 0.099 0.035 0.008 0.001 403 E 0.404 0.338 0.166 0.069 0.019 0.004 0.001 404 G 0.113 0.283 0.300 0.197 0.087 0.019 0.001 405 D 0.055 0.195 0.261 0.254 0.168 0.062 0.004 406 M 0.011 0.082 0.222 0.320 0.249 0.105 0.010 407 I 0.009 0.023 0.040 0.114 0.298 0.429 0.087 408 E 0.016 0.093 0.231 0.336 0.227 0.087 0.011 409 F 0.015 0.027 0.044 0.128 0.290 0.392 0.103 410 G 0.047 0.176 0.258 0.275 0.156 0.075 0.013 411 G 0.093 0.188 0.238 0.242 0.137 0.081 0.022 412 L 0.090 0.110 0.130 0.167 0.208 0.223 0.072 413 L 0.092 0.102 0.134 0.195 0.200 0.197 0.079 414 G 0.106 0.133 0.139 0.149 0.157 0.193 0.124 415 T 0.080 0.129 0.159 0.205 0.187 0.169 0.070 416 A 0.056 0.078 0.095 0.150 0.209 0.264 0.148 417 P 0.048 0.106 0.148 0.196 0.203 0.220 0.078 418 V 0.036 0.100 0.159 0.218 0.218 0.199 0.069 419 M 0.035 0.061 0.086 0.174 0.283 0.289 0.072 420 K 0.042 0.181 0.298 0.286 0.142 0.046 0.005 421 V 0.030 0.044 0.082 0.229 0.367 0.224 0.024 422 N 0.148 0.340 0.279 0.165 0.054 0.013 0.001 423 G 0.299 0.369 0.200 0.097 0.028 0.007 0.001 424 A 0.251 0.265 0.228 0.165 0.071 0.018 0.002 425 S 0.386 0.300 0.177 0.097 0.031 0.008 0.001 426 S 0.254 0.267 0.219 0.158 0.075 0.025 0.002 427 V 0.295 0.271 0.205 0.145 0.065 0.017 0.001 428 D 0.255 0.313 0.233 0.133 0.051 0.014 0.001 429 F 0.102 0.111 0.150 0.242 0.245 0.135 0.014 430 I 0.139 0.174 0.190 0.238 0.172 0.078 0.009 431 S 0.405 0.302 0.158 0.090 0.032 0.011 0.002 432 R 0.307 0.226 0.179 0.163 0.085 0.035 0.005 433 G 0.354 0.218 0.160 0.129 0.080 0.049 0.011 434 G 0.289 0.191 0.164 0.164 0.107 0.070 0.015 435 Q 0.281 0.255 0.184 0.138 0.079 0.049 0.014 436 I 0.176 0.096 0.095 0.161 0.203 0.212 0.059 437 P 0.306 0.260 0.189 0.122 0.065 0.045 0.013 438 A 0.388 0.178 0.126 0.116 0.092 0.074 0.026 439 P 0.381 0.236 0.160 0.117 0.061 0.035 0.009 440 I 0.375 0.183 0.141 0.137 0.098 0.055 0.010 441 H 0.478 0.243 0.137 0.085 0.038 0.017 0.003 442 S 0.473 0.273 0.140 0.076 0.028 0.010 0.001 443 F 0.390 0.187 0.170 0.153 0.072 0.025 0.002 444 K 0.666 0.216 0.077 0.030 0.008 0.002 0.001 445 N 0.811 0.130 0.038 0.015 0.004 0.001 0.001