(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.soe.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0296
              10        20        30        40        50        60     
              |         |         |         |         |         |     
   1 MDIRQVTETIAMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDPDINRAAEKIYQKITTKAANLVAVGDEIAAE
   2 MDIRQVTETIAMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDPDINRAAEKIYQKITTKAANLVAVGDEIAAE
   3 MDIRQVTETIAMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDPNINRAAEKIYQKITTKAANLVAVGDEIAAE
   4 MDIKQVTETIAMIEEQNFDVRTITMGISLLDCIDSNIEKAAEKVYHKIVTKAGKLVQVGDDISAE
   5 MDIRQVRETIEMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDSDIDKAAEKVYTKIVTKAKNLVAVGDEIAAE
   6 -NVGNILETIKMIDEEQLDIRTITMGISLLDCIDPDGDKAREKIYNKIMSSAKDLVKVGKDIERE
   7 -NSQNIMETINMIEKEKLDIRTITMGISLLDCCSSDGKKSRTKIYDKITRLAENLVNVGDMIETE
   8 -DTAQILETIKMISEENLDIRTITMGISLLDCIDSDSDKACQKIYDKITTKAKDLVKVGNQIATE
   9 MDIKQVTETIAMIEEQNFDVRTITMGISLLDCIDSDIDKAAEKVYNKIVSKAKNLVAVGDEIAAE
  10 -SINEVLETIRMVQEENLDIRTITMGISLRDCADANAAKACQRIYDKITTQAANLVKAGEEIERE
  11 MDIQNIKETIAMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDADIDKAAEKIYQKIVKKAGKLVEVGNEIGHE
  12 MDIQNIKETIAMIEEQNFDIRTITMGISLLDCIDADIDKAAEKIYQKIVNKAGKLVEVGNEIGHE
  13 -NPYEIMETIRMIEEEKLDIRTITMGISLRDCAHPSGEVARKNIYDKILRYAGNLVEVARDIELE
  14 -ETNQILETIRMIEEEKLDIRTITMGISLLDCMDGDGEVARKKIYQKIVTKARNLVAVGEAIESE
  15 -ETNQILETIRMIEEEKLDIRTITMGISLLDCMDGDGEAARKKIYQKIVTKARNLVAVGEAIESE
  16 MDIKQVTETIAMIEEQNFDVRTITMGISLLDCIDSDIDKAAEKVYNKIVSKAKNLVAVGDEIAAE
  17 -ETNQILETIRMIEEEKLDIRTITMGISLLDCMDGDGEVARKKIYQKIVTKARNLVAVGEAIESE
  18 MDIKQVTETIAMIEEQNFDVRTITMGISLLDCIDSDIDKAAEKVYNKIVSKAKNLVAVGDEIAAE
  19 ---FEIMETIKMIQEENLDIRTITMGISLRDCASSNSKETRDKIYNKITRLAANLVKVGEDIEKE
  20 -HPEEILETIHMIKAENFDIRTVTMGINLRGCCHSDIDVFNKNIYNKITGYAKELVRTTEEVQNL
  21 --SYDILETIRMIEKEKLDIRTITMGISLLDCADLDGEKARRKIYDKICKNAERLVKTGEEIEEE
  22 -NPKEILETIQMVRMEHLDIRTVTMGISLRDCSHPDIEIFNENIYAKITSRAKDLVRTTNEIQSL
  23 -NSQQIYETSHMISNENLDVRTITMGISLLDCIDSDSTVACQKIYDKITTKAKNLVKVGQQIEAE
  24 -NPKEILETIQMVRMEHLDIRTVTMGISLRDCSHPDIEVFNENIYEKITTRAKELVRTTNEIQSL
  25 -NTNEIMSTIKMIEEQKLDIRTITMGISLRDCCSFNGEESRKRIYDKITRYAQDLVRVGEEIERD
  26 --SNEILETIQMVRMEHLDIRTVTMGISLRDCSHPDPEVFNENIYEKITSRAKELIRTTNEIQSL
  27 --SSEIIETIKMVADQNFDVRTITIGIDLHDCISADIDELNKNIYQKITTIGKDLVETAKILSAK
  28 -DLRRIMETVNMIDNENLDLRTTTMGISLLDCIDSDSDRACQKIYDKITTKAENLVKVARELETE
  29 -QSNEILETIRMVADQNFDVRTITVGIDLHDCISCDIDELNRNIYRKITTVGKDLVETANILSAK
  30 -NTNNILETIKMIEEEKLDVRTITMGISLLDCIDPDGDKARIKIYDKITKSAEHLVEVGRQIETE
  31 --NNEILETISMIKEQNLDVRTITLGLSLMDCACEDVKVLSEKIYDKITKTAENLVKTGENIEKR
  32 --SGEILETVKMVADQNFDVRTITIGIDLHDCISTDIDVLNQNIYNKITTVGKDLVATAKHLSAK
  33 -ETKQIQETINMVEEEHLDIRTVTMGISLLDTIAGDPQQTAKNIYKKVTTYAKDLIKVAEQIERE
  34 --SGEILETVKMVADQNFDVRTITIGIDLHDCISSDINVLNQNIYNKITTVGKDLVTTAKYLSAK
  35 -HPEEILETIKMVTNEHLDIRTVTMGINLRGCSHPDIKVFNEQVYTRIMRCAEKLVATTEDIQNL
  36 -HPEEILETLKMVNNEHLDIRTVTMGISLRGCCHPDMATFNSNVYDRILRCAEKLVRTTEEIQSL
  37 --SGEILETVKMVADQNFDVRTITIGIDLHDCISTDIDVLNQNIYNKITTVGKDLVATAKYLSAK
  38 -ESRSILETIQMVAEENLDIRTITMGISLFDCVDSDGERARQKIYDKITTSAKDLVKVAAQIQEE
  39 MDINKINETIQMISEEHFDIRTVTMGISLLDCIGGDGQRTAEKVHRKIVDKAGKLVETAQQLERD
  40 --SSEILETIRMVADQNFDVRTITIGIDLHDCITNDIDQLNQNIYNKITTIGKDLVETAKILSAK
  41 --IMEVHETNKMIEQEKLDVRTITMGISLLDCAADSVDEVCENIYNKITTYAKDLVSTGRAIERD
  42 -NFGEILETLKMIQEENLDIRTITLGVSLLDCVDSSIAKTCENIKQKIREKGQYLVETAKKLEIK
  43 --PEEIIETIKMIKMENLDLRTVTLGLSLRDCVSKDLDELKENIYNKITSSAENLVETAERISEK
  44 --PQEILQTIAMVENENLDIRTITMGISLLDCAGDDVQQVEQKIYDKITRQAEHLVSVGESLAAR
  45 --PQEILQTIAMVENENLDIRTITMGISLLDCAGDDVQQVEQKIYDKITRQAEHLVSVGESLAAR
  46 ---RGILDTIEMIEKYRLDIRTVTMGISLLECARGSMEETATAVYDRVTSQAARLVEVCEGIERE
  47 ---RGILDTIEMIEKYRLDIRTVTMGISLLECARGSMEETATAVYDRVTSQAARLVEVCEGIERE
  48 --ILEVNETNNMIEQEKLDVRTITLGISLLDCCDASLDTLNQKIYAKITRLARNLVSTGREIELE
  49 ---SSILETIEMIEKYRLDIRTVTMGISLLDCVRGTMQETCEAVYNKITTLAKDHVSVCEGIERE
  50 ---RGILDTIEMIEKYRLDIRTVTMGISLLSCARSTMEETCRAVYDRVTTQAARLVEVCEGIERE
  51 --PEEIIETIKMIEYQNLDIRTTTLGINLKDCADKDLDLLKENIYDKITSLGGNLVETANKVSQK
  52 --IMEVHETNQMIEQEKLDVRTITMGISLLDCASDDVDKTCDNIYRKITTYAKDLVSTGKAIERD
  53 ---REVLSTLEMLKNEHLDVRTVTLGVSLFDCAGHDPEKFKENVQRKIFRLAGNLVKVCDEIGIR
  54 --PEEILETIRMIQVENLDIRTITMGISLRDCATASLEETCRRVYDKITRLASDLVAVGEEVAAT
  55 -ETQQIKETIEMISEENLDIRTITMGISLLDCVTGDLQTTADKVYAKIMAKAANLVPVADAISDE
  56 ---REVISTLDMLRNEHLDVRTVTLGISLFDCASDNFDRFATRVQDKISRYAEHLVATCDEVGEK
  57 --SDQILATVEMIQKENLDVRTVTMGINLLDCRGGDVAETCRRIEERIQHYAGNFVATCNEVSKT
  58 --SQEIIETINMVKQSNLDIRTITVGISLFDCSSDIPQRFIDNMRKKIIKYAGNLKNVANEIEDM
  59 ---DEIIETVKMIEYENLDIRTTTLGVNLKDCVDKDLDLLKDNIYQKVTGLGGNLVETADAVANK
  60 -DVEEVIETIEMIRMRNLDVRAVTLGINLLDRAHPDPEELARDVREKIVEVAGDLVEVVEEVEDE
  61 ---NNILETIEMIEKYRLDIRTVTMGINLVPCIRETMEATADAVFERVVDYARNLVPVAQEIERE
  62 ---HEIISTLNMIQNENLDIRTITIGINLFDCASHDFDIFAYRVSSKIIRYATELVPICKQVEEH
  63 -------------------------------------------RYDKITTKAKNLVKVGQQIEAE
  64 -DPKEIGEILEMLLFRELDIRAVTLSVNTLPAIRHRVSDTISALEELLEPYLKKLRPAVEKVASR
  65 --AEEIIEVYQMLNEEDLDIRSVTLSINTLFAISDDLDKSLKKL-EEINNFLERFSKIVDEVGSK
  66 -----------------------------------------------------------------
  67 -------------------IRTITTGISLQSLQD-----------RETIKQAADFNQQAKIFFEK
  68 -----------------------------------------------------------------


         70        80                  90       100       110       120
         |         |                   |         |         |         |
   1 LGIPIVNKRVSVTPISLIGAAT.....DA.....TDYVVLAKALDKAAKEIGVDFIGGFSALVQK
   2 LGIPIVNKRVSVTPISLIGAAT.....DA.....TDYVVLAKALDKAAKEIGVDFIGGFSALVQK
   3 LGIPIVNKRVSVTPISLIGAAT.....DA.....TDYVVLAKALDKAAKEIGVDFIGGFSALVQK
   4 LGIPIVNKRVSVTPISIIGAAT.....DA.....TDYVPLAKALDRAAKEIGVNFIGGFSALVQK
   5 LGLPIVNKRVSVTPIALIGAAT.....DA.....TDYLPLAHALDKAAHEIGIDFIGGFSALAQK
   6 FGIPIVNKRVSVTPISIIAGAT.....DE.....NDYVKFAQTLDKAAEDLGIDFIGGFSALVQK
   7 YGIPIINKRISITPIAHIAQSC.....GD.....HDYVEFAKTLDQAAKAVGINFIGGFSALVQK
   8 YGIPVINKRVSVTPISLIAAAS.....KD.....KDYVKYAKALDKAAQTLGIDFIGGYSALVQK
   9 LGIPIVNKRVSVTPISIIGAAT.....DA.....TDYVPFARALDRAAKEIGINFIGGFSALVQK
  10 YGIPIINKRISVTPISLVAESS.....DA.....NNYTPFAEAMDRAAKEVGVNFIGGFSALVHK
  11 LGIKIVNKRVSVTPIAIIGAAT.....AA.....DDYTPLALAMDRAAKEIGIDFIGGYSALVQK
  12 LGIKIVNKRVSVTPIAIIGAAT.....AA.....DDYTPLALAMDRAAKEIGIDFIGGYSALVQK
  13 YGIPIINKRIAVTPISLVAESS.....SE.....EDFIKFAETLDKAAGEVGVDFIGGFSALVHK
  14 FGIPIINKRISVTPIAIIAGSS.....AD.....TDYVEFAKTLDAAAKEVGVNFIGGYSALVQK
  15 FGIPIINKRISVTPIAIIAGSS.....AD.....TDYVEFAKTLDAAAKEVGVNFIGGYSALVQK
  16 LGIPIVNKRVSVTPISIIGAAT.....DA.....TDYVPFARALDRAAKEIGINFIGGFSALVQK
  17 FGIPIINKRISVTPIAIIAGSS.....AD.....TDYVEFAKTLDAAAKEVGVNFIGGYSALVQK
  18 LGIPIVNKRVSVTPISIIGAAT.....DA.....TDYVPFARALDRAAKEIGINFIGGFSALVQK
  19 FGIPIVNKRISVTPISLVAESS.....DE.....ENYIKFAETLDKAADAVGVNFIGGFSALVQK
  20 YGIPITNKRIAVTPIAIVAESC.....NT.....EDYVSIAKTLDRAAEDVGIDFIGGFSALVHK
  21 YGIPIIHKRISVTPISIIAGAS.....QD.....TNYVEFAKVLDKAASTVGVNFIGGFSSLVQK
  22 YGIPIINRRISVTPIAIAAESC.....RS.....RDFVSIAKTMDEAAKEAGVDFIGGFSALVHK
  23 YGIPIANKRVTVTPISLIAAAS.....QD.....HDYVKYAKTLDKAAKTLGIDFIGGYSALVQK
  24 YGIPIINKRISVTPIAVAAESC.....RA.....PDFVSIAKTMDEAAKDAQVDFIGGFSALVHK
  25 YGIPIINKRISVTPISMIAESS.....DD.....KDYVEYAKTLDRAAKAVGVNLIGGFSALVHK
  26 YGIPIINRRISVTPISIAAESC.....RS.....QDFVSVAKTMDEAAKEAGVDFIGGFSALVHK
  27 YGIPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....KA.....DSYVSIAQTLDRAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  28 YGIPIANKRITVTPISLIAAAS.....GD.....SDYVKYAVTLDKAAKAVGVDLIGGFSALVHK
  29 YGVPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....KA.....DSYVSVAQTLDRAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  30 FGIPIVNKRVSITPMSIIAGAT.....NE.....TSYVEFARTLDRAAETLGIDFLGGFSALVQK
  31 FGIPIINKRISVTPISIVAASC.....NC.....NSYLSIAKAMDKAAKEVGVDFIGGFSALVHK
  32 YGVPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....KA.....DSYVSVAQTLDKAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  33 YGIPITNKRISVTPIALIAGHA.....TP.....DDMLYYAHALDDAAKAVGVDFIGGYSALVQK
  34 YGVPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....HA.....DSYVSVAQTLDKAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  35 YGIPIINKRISVTPIAIVAEAC.....QE.....EDLSSVAEALDRAAQETGIDFIGGFSALVQK
  36 YGMPIINRRISVTPIAIVAESC.....QA.....DDYCSVAETLDRAARETGIDFIGGFSALVQK
  37 YGVPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....HA.....DSYVSVAQTLDKAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  38 YGIPIINKRIAVTPIALIAAAS.....QD.....QDYVAYAVTMERAAQALGVDLIGGFSALVQK
  39 FGVPIVNKRISVTPVSLLAGNA.....DY.....DGLIKIARALDQAAADVGVDFLGGYSALIQK
  40 YGVPIVNQRISVTPIAQIAAAT.....KA.....DSYVSIAQTLDRAAKAIGVSFIGGFSALVQK
  41 FGIPIVNKRITVTPISLVGASSck...SS.....EDFVKIAHALDRAAKKVGVDLIGGYSALVSK
  42 YGIPIVNARVAVTPVSLLAGGF.....TE.....TETVKIGYALEEIAQEIGVNFIGGFSALVHK
  43 YGIPIVNKRIAVTPISLVIGGAik8eeQI.....KACVEVGEVLDKAAKKVRVDFLGGYSALVHK
  44 YGIPIVNKRVSVTPVALLGSNF.....NP.....EEMVRLAKALDRAAKTVGINFLGGFSALVQK
  45 YGIPIVNKRVSVTPVALLGSNF.....NP.....EEMVRLAKALDRAAKTVGINFLGGFSALVQK
  46 LGIPIVNKRISVTPIALVTAGC.....SG.....-DPVDVARALDKAAKDVGVNFIGGYSALVEK
  47 LGIPIVNKRISVTPIALVTAGC.....SG.....-DPVDVARALDKAAKDVGVNFIGGYSALVEK
  48 YGIPIVNKRISVTPIALIAGSAcq...SP.....EDFVSIAQTLDKAAADMGVNFIGGYSAIVSK
  49 LGIPIVNKRISVTPISLIASAV.....EG.....-SPVEIAHALDKAAKTVGVNFIGGYSALVEK
  50 LGIPIVNKRISVTPVALITAGC.....SG.....N-PADVAHALDRAAKEVGVNFIGGYSALVEK
  51 YGIPIVNKRISVTPIGLIMGSTvkgl.--sd6avDACVEVGITLDKIAKEVGVDFIGGYSALVQK
  52 YGIPIVNKRITVTPISLVGASSck...TS.....EDFVKIAHALDKAAKEVGVDLIGGYSALVSK
  53 YGIPVVNKRVAVSPIAVAACSF.....SR.....PQMVEVARKLDETAADIGIDFIGGFGALVEK
  54 YGIPIVNKRIAVTPIAQVGEPS.....GE.....DDLTPLARALDRAAEAVGVNFIGGFSALVHK
  55 YGIPIVNKRISVTPVSLLAGAD.....QN.....LDFRPIAQAMDRAAKDLGVDLIGGYTALVQN
  56 YGIPVVNKRISISPMAVVGAPF.....GP.....DDMVRAAQVLDKAACNAGVDFLGGFTALVEK
  57 YGIPVVNKRISVTPIAFVGAGF.....DK.....DGFIELAKSLDRAATAVGVDILGGFSAQVEK
  58 FGLPIVNRRVALTPISLLTFSY.....SY.....EDLLKVALAIDEIAKELEIDLIGGYSASVHK
  59 YGIPIVNKRISVTPIGLIMGPT.....LKgl8aiDACVEVGVTLDKIAKDVGVDFIGGYSALVQK
  60 LGVPIVNKRIAVTPCSIVAASAvrke.GR.....EAVLTLAEALDEAAEEVGVDYLGGYTALVYD
  61 LGIPIVNKRISVTPVGILASAV.....EG.....-NPVRIAEALDRAANEVGVNFIGGYSALVDK
  62 FGIPIINKRISVSPIGVLGASF.....ST.....EQFIKTCQLIDETAESVGVDFIGGYSALIEK
  63 YGIPIANKRVTVTPISLIAAAS.....QD.....HDYVKYAKTLDRAAKTLGIDFIGGYSALVQK
  64 LGVRIVTVRLAVSPVSIMLEPI.....GDa....KSTVELAYFLDDLAGKYGVDMVGGFSAFEHA
  65 YGIRIVTKRVSVSPIQFFLEVL.....DE.....KDGIELAKYLDRIAERNNIDYISGYSAFADK
  66 ----------------------.....--.....-------------------------------
  67 QGYEVQTTRIATNTWEEYLQDL.....SK.....IEIINEIQTLEQLCQSLNISFFNIGYA----
  68 ----------------------.....--.....--------TLDKAAKAVGVDLIGGFSALVHK


             130       140       150       160       170               
              |         |         |         |         |               
   1 GYQKGDEILINSIPRALAETDKVCSSVNIGSTKSGINMTAVADMGRIIKETA....N....LSDM
   2 GYQKGDEILINSIPRALAETDKVCSSVNIGSTKSGINMTAVADMGRIIKETA....N....LSDM
   3 GYQKGDEILINSIPRALAETDKVCSSVNIGSTKSGINMTAVADMGRIIKETA....N....LSDM
   4 GYQKGDEILINSIPKALAETDFVCSSVNIGSTKSGINMTAVRDMGRIIKETS....A....ASEM
   5 GYQKGDEILINSIPQALAQTSKVCSSVNIGSTKTGINMTAVRDMGRIIKETA....E....ASDM
   6 GYTKGDKILIKSIPKALASTNKVCASVNVGSTRCGINMDAVKEMGEIIKETAeltkD....AKGF
   7 GYTKGDKILIDSIPEALATTERVCSSVNIGCTKSGINMDAVRDMGEIIKRTAyltrD....QDSL
   8 GYQNGDRTLIKSLPQALAETNLVCASVNVGSTRSGINMDAVKEMGQVVKSAS....E....LDFM
   9 GYQKGDEILIDSIPRALAETDFVCSSVNIGSTKTGINMTAVRDMGRIIKEAS....E....ADPM
  10 GFTKGDRILINSIPEALATTERVCSSVNVGSTKDGINMDAVYRMGQVVKECAertaD....KDGL
  11 GYQKGDEILIKSMPKALAATERVCASVNVGSTKTGINMTAVRDMGETIKIMS....K....GDKW
  12 GYQKGDEILIKSMPKALAATERVCASVNVGSTKSGINMTAVRDMGETIKIMS....K....GDKW
  13 GFTTGDKKLINSIPRALANTERVCSSINVATTRAGINMEAVSRMGKIIKKTAretrD....KGGL
  14 GYTKGDEILIRSIPQALAQTERVCSSVNVGSTRTGINMDAVRQMGEVIKETAdltaD....TQGL
  15 GYTKGDEILIRSIPQALAQTERVCSSVNVGSTRTGINMDAVRQMGEVIKETAdltaD....TQGL
  16 GYQKGDEILIDSIPRALAETDFVCSSVNIGSTKTGINMTAVRDMGRIIKEAS....E....ADPM
  17 GYTKGDEILIRSIPQALAQTERVCSSVNVGSTRTGINMDAVRQMGEVIKETAdltaD....TQGL
  18 GYQKGDEILIDSIPRALAETDFVCSSVNIGSTKTGINMTAVRDMGRIIKEAS....E....ADPM
  19 GYTIGDRRLIASIPEALSSTKKVCSSVNVASTKAGINMDAVREMGHVIKKAAelsaD....SGGL
  20 GITPGDMKLINSIPQALASTKKVCASINVATTKAGINMDAVAMMGHIVKKTAeatkD....ADGI
  21 GYTKGDRILIESIPEALASTEKVCSSVNIGCTKSGINMDAVKQMGEIIKKTAeltkE....NAGI
  22 GETGGDLKLINSIPEALASTEKVCSSVNVATTKAGINMDAVGLMGKVIKKTAeltsD....RDGI
  23 GYQTGDRTLIASLPEALAETDFVCASVNVGSTRSGINMDAVAQMGEVVVAGS....K....LDMM
  24 GATVGDLKLINSIPEALKSTEKVCSSINVATTKTGINMDAVGLMGSIIKKTAdltaD....RDGI
  25 GCTKGDKILLQSIPEALHTTDIVCSSVNVGSSKTGINMNAVKQMGHIIKDVA....NlsasTNGM
  26 GETRGDLKLINSIPEALASTEKVCSSVNVATTKAGINMDAVGLMGKVIKKTAeltaE....RDGI
  27 GMSPSDEVLIRSIPEAMQTTDIVCSSINIGSTRAGINMDAVKLAGETIKRTA....Dit..PEGF
  28 GYQNGDRVLIKSIPQALKETERVCSSVNVGSTRSGINMDAVKEMGQIVIENE....K....INPL
  29 GMSPSDEVLIRSIPEAMKTTDIVCSSINIGSTRAGINMDAVKLAGETIKRTA....Dit..PEGF
  30 GCTKGDKILISSIPEALAVTKKVCASVNVGCTKSGINMNAVRDMADVIKRTAeltkD....QKGF
  31 GFTESDLKLIKSLPESLANTDIVCSSVNIGSTRYGINMDAVKLMGETIKETSli..T....PDGF
  32 GMSPSDEVLIRSVPEAMKTTDIVCSSINIGSTRAGINMDAVKLAGETIKRTA....Eit..PEGF
  33 GFANGDLALIKSLPRALTETDLVMSSVNIGSTKAGINLDAIKLMGETVKGIS....E....KSDT
  34 GMSPSDEVLIRSIPEAMKTTDIVCSSINIGSTRAGINMDAVKLAGETVKRTA....Eit..PEGF
  35 GMTPGDLSLINSIPQALASTKKVCSSVNVATTKAGINMDAVAKMGHIIKQTAeltrD....SNGL
  36 GMTPGDLKLIESIPRALAITEKVCSSVNLASTKAGINMDAVALMGRIIRETArltaD....RGAI
  37 GMSPSDEVLIRSIPEAMKTTDIVCSSINIGSTRAGINMDAVRLAGETIKRTA....Eit..LEGF
  38 GYQSGDRKLIASIPAALAATSRVCSSVNVGSTRAGINLDAVGEMGRIIKQIA....A....DDPV
  39 GSTPTEKMLIDSFPEVLSTTKLLMSSINIASTKAGINLNAVGKTGRTIKRIS....E....VDPL
  40 GMSPSDEVLIRSIPEAMKSTDIVCSSINIGSTRAGINMNAVKLAGETIKRTA....Dit..PEGF
  41 SMTPAEEMLIRSLPQALSETDIVCSSVNVGSTKTGIDMNSVELLGHIVKDIAhataD....NDSY
  42 GFTKGDINVLNTIPRVLAETERVCASINVATTRAGINMDGINFSARIIKETAertrD....KDGL
  43 DATKEDRALIDSIPFMMEKTERVCSSVNVASTKTGINMDAVKRMGEIIKETAfr..T....EKAI
  44 GLTKGDRSLIEAIPQALAETEFVCSSVNIGSTKSGINMDAVLRMGEVILDSA....RrtaaQDGI
  45 GLTKGDRSLIEAIPQALAETEFVCSSVNIGSTKSGINMDAVLRMGEVILDSA....RrtaaQDGI
  46 GGTTSDIRLIRSIPEALSTTDVVCGSVNVASSRAGINMNAVNEMGKVVKQAAeltkD....RSAI
  47 GGTTSDIRLIRSIPEALSTTDVVCGSVNVASSRAGINMNAVNEMGKVVKQAAeltkD....RSAI
  48 GMTWTDELLIRSIPHALSATERVCSSVNIGSTKTGINMDAVRLMGQIIKETAeatqE....QNSL
  49 GMTAGDKNLIDSIPQALTETDLVCSSVNIGSSRSGINMDAVREMGIVVKKAAeltkD....RSAI
  50 GGTTADINLIRSIPEALSQTDVVCGSVNVASSRAGINMNAVNEMGKVVKQAAtltaD....QSAI
  51 RATYEEKMLIRSIPKLMTKTDKVCASVNVATTKAGINMYAVKKMGEIVKETS....Eit..KDAI
  52 SMTPAEELLIRSLPQALSETDIVCSSVNVGSTKTGIDMNAVELLGHIIKDVAertaD....NDSY
  53 GFTEGDRALIAAIPEALASTRRVCSSVNVASTRAGINMDAVYLMGKTIKDAAeltrE....ADGI
  54 GFTHGDRALFNSLPEALATTERVCASVNVATTKAGMNMDAITWLGHLIKETArltaS....RGGL
  55 GSTPAETALMKSLPEVLDTTERVCASVNIGSTRSGLNMDAVKLMGTVVKEVA....M....RKPQ
  56 GMTKGDRALIDALPEALATTGRVCSSVNVGSSRSGINMDAVALMGDTIVQIAgrtaD....RDGI
  57 GMTATDKEYIASIPEALAATTKVCASINIATTHKGINMDALAMIGRTVKDLAeitkD....QNGF
  58 NYDENTKKFISSIPDALASTDRLCSSVDVGTTRSGINLDVIAHLGHIIKDIAqktkD....KDSF
  59 KATPEEKRLIQSIPKLMTKTDRVCSSVNVATTKAGINMYAVKKMGEIIKETSli..T....KDAI
  60 GFTEADEAVLDTIPEAIEGTERLCASVVVADERYGINMDAVYRTAEAVKETA....Er...TDGH
  61 GATRGELDLIRSLPEALNETNVVCASVNVGSSKAGINMNAVREMGQVIKDAStyg.P....GGTL
  62 GMTPGEKNLIESLPEALAVTNRVCSSINVASSLAGINMDAVALMGQKILDVAsatsT....ANGI
  63 GYQTGDRSLIASLPAALAETDFVCASVNVGSTRSGINMGAVAQMGEVVIAGS....K....LDMM
  64 GVSRGDRALMEGLAEALNGTSRLAGFLNVASTMTGINLDAVRKSADIILSL-....-....-KPH
  65 GFTRGSLRVLKTLTDALNKTKRLAGMINAASTMSGMNIDAIKIFVDRIFEIP....P....ESS-
  66 --------------------------------------------GETVKGIS....E....KSDT
  67 ----SKPETIDIIPDINKNTSIIYCSSRIGDSETGINFENARESAKVIKRIS....Qes..ENGY
  68 GYQNGDRVLIKSIPQALKETERVCSSVNVGSTRSGIN---------------....-....----


      180       190       200       210       220             230      
       |         |         |         |         |               |      
   1 GVAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.QSFDVVAE
   2 GVAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.QSFDVVAE
   3 GVAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.QSFDVVAE
   4 GPAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.QSFDVVAE
   5 GAAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.ESFDVVAE
   6 GCAKLVVFCNAVEDNPFMAGAFHGVGEADRIINVGVSGPGVVKRALEKV.....KG.EPFDVVSE
   7 GCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEGECVINVGVSGPGVIKSSIENL.....KG.ESFDVIAE
   8 TNAKMVIFCNAVEDNPFMAGGFHGVGEPDAVINVGVSGPGVVKSALEKV.....KG.ASMDVVAE
   9 GPGKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVQRAVEKV.....PG.ESFDVLAE
  10 ACAKLVVFCNVPEDNPFMAGAFHGIGEAECVINVGVSGPGVVKNAVEKV.....KG.TDFGTLAE
  11 LNAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADTIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.ESFDILAE
  12 LNAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADTIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.ESFDILAE
  13 GCAKLVVFANVPEDNPFMAGAFHGIGEPECVINVGISGPGAVKAALKKV.....KG.QKFDTVAE
  14 GCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADCVINVGVSGPGVVKRAIEKV.....KG.EPFDIVAE
  15 GCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADCVINVGVSGPGVVKRAIEKV.....KG.EPFDIVAE
  16 GPGKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVQRAVEKV.....PG.ESFDVLAE
  17 GCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADCVINVGVSGPGVVKRAIEKV.....KG.EPFDIVAE
  18 GPGKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVQRAVEKV.....PG.ESFDVLAE
  19 ACAKLVVFANVPEDNPFMAGAFHGVGEPECVINVGVSGPGVVKSALEKV.....RG.ADFETVSE
  20 GCAKLVIFANAPEDNPFMAGAFHGIGEPDCVINVGVSGPGVVNSAVREL.....KD.PDLGEISE
  21 GSAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEGDCVINVGVSGPGVVKAALEHV.....KG.QSFDVVAE
  22 GCAKLVVFANAPDDNPFMAGAFHGIGEPECVINVGVSGPGVVNAAVCEL.....EN.PDLTEISE
  23 TNAKLVIFCNAVEDNPFMAGGFHGVGEPDVVINVGVSGPGVIKTALEKV.....KG.ESMDVVAE
  24 GCAKLVVFANAPEDNPFMAGAFHGIGEPECVINVGVSGPGVVNAAIREL.....EN.PNLTEISE
  25 ECMKLVVFANAIEDNPFMAGAFHGVGEAECVINVGISGPGVVKASLEKV.....KG.EPFDVVAE
  26 GCAKLVVFANAPEDNPFMAGAFHGIGEPECVINVGVSGPGAVNTAVCEL.....EN.PNLTEISE
  27 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGSGEADAIINVGVSGPGVVKEALENS.....NA.TTLTEVAE
  28 NNGNLVIFCNAVEDNPFMAGGFHGVGESDVALNVGVSGPGVVKTALEKV.....KG.ESMDVVAE
  29 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGAGEADAVINVGVSGPGVVKEALANS.....HA.DTLTEVAE
  30 GCAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEAERIINVGVSGPGVVKRALEKV.....RG.ASFDVVAE
  31 GCAKLVVFCNAVEDNPFMAGAFHGVGEAEKVINVGVSGPGVVKKALEEV.....RG.KSFEEVAE
  32 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGSGEADAVINVGVSGPGVVKAALENS.....DA.VSLTEVAE
  33 ANAKLVIFANAVEDNPFMAGAFHGVSEADVVINVGVSGPGVVKRALEKV.....KG.ESIQVVAE
  34 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGSGEADAVINVGVSGPGVVKAALENS.....DA.TTLTEVAE
  35 GCAKLVVFANAPEDNPFMAGAFHGIGEPDCVINVGVSGPGVVNSAVRAL.....QN.PALGDISE
  36 GCAKLVVFANAPEDNPFMAGAFHGVGEPDCVINVGVSGPGVVNAAVRGL.....QGsPTLGDIAE
  37 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGSGEADAVINVGVSGPGVVKAALENS.....DA.TTLTEVAE
  38 NCMSLVVFANAVDDNPFMAGAFHGVGEADRVINVGISGPGVVKRALEEV.....RG.QSIDIVSE
  39 GNAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVSEDDAVINVGVSGPGVVKRALETV.....RD.RSIDVVAE
  40 GCAKIVVFCNAVEDNPFMAGAFHGSGEADAVINVGVSGPGVVKEALANS.....NA.TSLTEVAE
  41 GCVKFVAFCNAPDDNPFMAGGFHGVTEGDAVINVGVSGPGVVSRALDEA.....KG.KDFEFLCE
  42 GCAKIVVFANAPEDNPFMAGAFHGVGEADYVVNVGVSGPGVVKRVVEKI.....PG.ADLEELAN
  43 GCAKLVVFANAPEDNPFMAGAFHGVGEGDKVINVGVSGPGVVRAVIEKL.....PD.ADFGTLAN
  44 AAAKLVVFCNAPEDNPFMAGAFHGVGEPEAVINVGVSGPGVVAHAVKKS.....PQ.ADLGELAN
  45 AAAKLVVFCNAPEDNPFMAGAFHGVGEPEAVINVGVSGPGVVAHAVKKS.....PQ.ADLGELAN
  46 ACAKLVVFANSVGDNPFMAGAFHGIEEPDCVVSVGVSGPGVVSRALGNL.....QG.ATLDQVAE
  47 ACAKLVVFANSVGDNPFMAGAFHGIEEPDCVVSVGVSGPGVVSRALGNL.....QG.ATLDQVAE
  48 GCAKLVVFCNAPDDNPFMAGAFHGISEADAVIHVGVSGPGVVKHALESV.....RG.KDFEVLCE
  49 ACAKLVVFANAVGDNPFMAGAFHGVEEPDCVVSVGVSGPGVVDRALGDL.....DG.ATLDQVAE
  50 ACAKLVVFANSVGDNPFMAGAFHGIEEPDCVVSVGVSGPGVVSRALEHL.....EG.ASLDQVAE
  51 GCAKIVVFCNAPEDNPFMAGAFHGPGEGDAVINAGVSGPGVVRAVVEQL.....KG.KDIGTVSD
  52 GCVKFVAFCNVPDDNPFMAGGFHGVTEGDAVINVGVSGPGVVSRALDAA.....KG.KDFEFLCE
  53 ACAKLCVFANIPEDVPFMAGAYLGVGEPDSVINVGVSGPGVVKKAIDRAraan.PH.LDLGALSD
  54 GCAKLVTFCNAPEDNPFMAGAFHGPGEPECVINVGISGPGAVLAAIRQY.....PE.ADLGQLAT
  55 NAMKLVVFCNAVEDNPFMAGAFWGISEGDVAINTGVSGPGVVERAIAAK.....PA.ASFEEICE
  56 GCAKLVVFTNIPQDVPFMAGAYLGTGEPDVVINVGVSGPGVVKKAIDRAmqs..GD.RSLGDIAE
  57 GAAKFVVFCNQPGDNPFMAGAIHGLEEADVVLNVGVSGPGVIARALERLia6tdKT.LTLDRLAE
  58 GCARFVVFANAPDDNPFMAGAFHGTGEGDSAINVGISGPGVVKRALEGK.....KD.ASIDEVYE
  59 GCAKIVVFCNAPEDNPFMAGAFHGVGEGDSVINVGVSGPGVVRAVLEKL.....PG.EKIDVVSD
  60 GCARLVALTNAPENTPFMAGAFHGVGQPEACVNVGISGPGVVRAVVEEL.....KD.VDFRTLHD
  61 ACAKLVVFANSVSDNPFMAGAYHGVEEQDCVINVGVSGPGVVDRAVAEM.....EG.ATLNEVSE
  62 GCAKLVVFSNIPQDIPFMAGAYLGIGEPDVVINVGVSGPGVIKKAIDRAlstc.DT.CTFTELYD
  63 TNAKLVIFCNAVEDNPFMAGGFHGVGEPDVVINVGVSGPGVIKTALEKV.....KG.ESMDVVAE
  64 AAARFAVTANLPEDVPFMPGAYHGLGLPDAVINIAVSGPGVVEAVVRNL.....PE.ADARTLHD
  65 --SRTAIMSNVPPDSPFVPSAHHGMGMPEATINVAVSGPGVIKAAIERS.....KP.KTLQELHD
  66 ANAKLVIFANAVEDNPFMAGAFHGVSEADVVINVGVSGPGVVKRALEKV.....KG.ESIQVVAE
  67 GNFRFCAWANCQPGIPFFPTAYHRGNTSFAI---GLELGDLVMQAFSQA.....K-.--------
  68 -------------------------------------------------.....--.--------


       240       250       260       270  
        |         |         |         |  
   1 TVKKTAFKITRIGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
   2 TVKKTAFKITRIGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
   3 TVKKTAFKITRIGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
   4 TVKKTAFKITRIGQLVGSLASERLGVKFGIVDLSLA
   5 TVKKTAFKITRIGQLVGNMASERLGVKFGIVDLSLA
   6 TVKKTAFKITRVGQLVAKEASSRLDVPFGIIDLSLA
   7 AIKKTAFKITRIGQLVANEASTRLGVPFGIVDLSLA
   8 TIKQTAFKVTRMGQLVGSIAAEKLNVPFGIVDLSLA
   9 TVKKTAFKITRVGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
  10 TVKKTAFKITRMGELVGRAAAKKLGVPFGIVDLSLA
  11 TIKKTAFKITRIGQLVGQMASERLNVEFGIVDLSLA
  12 TIKKTAFKITRIGQLVGQMASERLNVEFGIVDLSLA
  13 TIKKTAFKITRAGQLVAREASKRLNVPFGIVDLSLA
  14 TVKQTAFKITRMGQLVGQVASEKLGVPFGIVDLSLA
  15 TVKQTAFKITRMGQLVGQVASEKLGVPFGIVDLSLA
  16 TVKKTAFKITRVGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
  17 TVKQTAFKITRMGQLVGQVASEKLGVPFGIVDLSLA
  18 TVKKTAFKITRVGQLVGQMASERLGVEFGIVDLSLA
  19 TIKKTAFKITRMGQLVAREASRRLGVAFGIVDLSLA
  20 AIKKTAFKITRMGEMVGREVSRRLNVDFGVLDLSLA
  21 TIKKTSFKITRMGQLVAKEASRRLNVPFGIVDLSLA
  22 TIKRTAFKITRMGEMVGREVSRRLGVEFGILDLSLA
  23 TIKKTAFKVTRMGQLVGTVGAERLGVQFGIVDLSLA
  24 TIKKTAFKITRMGEMVGREVSRRLGVEFGILDLSLA
  25 TIKKTAFRITRAGQLVAREASKKLDVPFGIIDLSLA
  26 TIKKTAFKITRMGEMVGKEVSRRLGVEFGILDLSLA
  27 VVKKTAFKITRVGELIGQEASKMLNIPFGILDLSLA
  28 TIKQTAFKVTRMGQLVGQEASKRLGVDFGIVDLSLA
  29 VVKKTAFKITRVGELIGQEAAKMLNIPFGILDLSLA
  30 TIKQTAFKVTRMGELVANEASRRLDVPFGIVDLSLA
  31 TIKKTSFKVTRMGQLVAKEASKLMDIPFGIVDLSLA
  32 VVKKTAFKITRVGELIGREASKMLNIPFGILDLSLA
  33 TVKKTAFKITRVGQMVGALAAERLGVEFGIVDLSLA
  34 VVKKTAFKITRVGELIGREASKMLNIPFGILDLSLA
  35 CIKKTAFKITRMGEMVGREVARRLDAQFGVLDLSLA
  36 CIKKTAFKITRMGEMVGREVARRLDAQFGVLDLSLA
  37 VVKKTAFKITRVGELIGREASKMLNIPFGILDLSLA
  38 QIKKTAFKVTRMGQFVGSIASERLHVPFGIVDLSLA
  39 KIKTTAFKITRIGQLIGGLTAKKLGLPFGIVDLSLA
  40 VVKKTAFKITRVGELIGQEASKMLNIPFGILDLSLA
  41 TIKRTAFKITRVGQLVAQEASRRLGIPFGIIDLSLA
  42 EIKKTAFKITRVGELIGKEAAKMLGVKFGIVDLSLA
  43 EIKKVAFKITRVGELIGREVSKELGVKFGVVDLSLA
  44 LIKRTSFKITRMGELIGREASQALQVPFGIVDLSLA
  45 LIKRTSFKITRMGELIGREASQALQVPFGIVDLSLA
  46 EIKKAAFKITRTGQLVGAMASERLGVPFGIVDLSLA
  47 EIKKAAFKITRTGQLVGAMASERLGVPFGIVDLSLA
  48 TVKKTAFKVTRVGQLVAQVASERLGVPFGIVDLSLA
  49 AIKKAAFKITRAGQLVGNLASERLGVPFGIVDLSLA
  50 EIKKAAFKITRTGQLVGSLASERLGVPFGIVDLSLA
  51 EIKKTAFKITRMGELVGKEVANELGVNFGIVDLSLA
  52 TIKRTAFKITRVGQLVAQEASRRLGIPFGIIDLSLA
  53 IIKRTSFKVTRVGELIGRQVAEKLGVPFGVVDLSLA
  54 IIKNTAFKVTRMGELVGREVSKRLGVPFGIVDLSLA
  55 TIKQTAFKVSRMGQFVGKVAADRLDVPFNIVDLSLA
  56 VIKRTAFKVTRVGEIIGREVAERLGVPFGVADLSLA
  57 EIKQTTFRVTRCGELIGRQVSKKLGIEFGVVDLSLA
  58 TIKKMAFKITRAGQLVLKYASERLNIPMGIVDLSLA
  59 QIKKTAFKITRMGELIGGEVAKNLDVEFGIVDLSLA
  60 EIKRTAFKITRVGELVGRRVAERLGVEFGAVDLSLA
  61 EIKRAAFKITRTGQLVGVMAAQRLGVPFGIVDLSLA
  62 IIKQTAYKITRVGEIVGKEVASRLKIPFGIVDLSLA
  63 TIKKTAFKVTRMGQLVGTVAAERLGVQFGIVGLSLA
  64 AIKRAAFKITRLGELVGREVSKELGVPFGAVDLSVA
  65 IIKRAAFKITRLGELVGRTVAENMGINFTTVDLSLA
  66 TVKKTAFKITRVGQMVGALAAERLGVEFGIVDLSLA
  67 ------------------------------------
  68 ------------------------------------