(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.soe.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0296 SP0239 Streptococcus pneumoniae, 445 res 
                     10         20        30        40        50       
                     |          |         |         |         |       
   1 ...DLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   2 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACNQVGGLS
   3 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETIGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   4 givDLS...LAPTPF.VGD.SVAHILEEMGLERCGAPGTTAALALLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
   5 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   6 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
   7 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
   8 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   9 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  10 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  11 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  12 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  13 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  14 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  15 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
  16 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVARILETMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSSVGGLS
  17 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  18 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLESCGCHGTTAALALLNDAVKKGGVMASSHVGGLS
  19 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  20 gvvDLS...LAPTPA.RGD.SIANILEAMGLEKCGTHGSTAALALLNDAVKKGGAMATSYVGGLS
  21 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILETMGLTVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
  22 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  23 gvlDLS...LAPTPE.IGD.SVAAILEAMGLETCGTHGTTAALALLNDAVKKGGSMASSYVGGLS
  24 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVARIIEEIGVEACGAPGTTAALALLNDAVKKGGIMAASHVGGLS
  25 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILEEMGLESCGAPGTTAALALLNDAVKKGGTMASSHVGGLS
  26 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILETMGLAQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  27 givDLS...LAPTPN.EGD.SVAEILEEIGLESVGAPGTTAALALLNDAVKKGGVMACEHVGGLS
  28 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILEVMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  29 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILEVMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  30 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAQILEEIGLEQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  31 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVARILETMGLTVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASGSVGGLS
  32 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILEEIGLEQVGTHGTIAALAMLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
  33 giiDLS...LAPTPA.IGD.SVANILEEMGLEVVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
  34 givDLS...LAPTNA.QGD.SVAEILEAIGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSYVGGLS
  35 givDLS...LAPTAA.AGD.SVAEVLEEIGVAQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  36 givDLS...LAPTPA.IGD.SIANILEAMGLERCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASRNVGGLS
  37 givDLS...LAPTAE.LGD.SVAHIMEHMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  38 givGLS...LAPTAA.AGD.SVAEVLEEIGVAQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  39 gvlDLS...LAPTPA.VGD.SVAAILEAMGLESCGTHGTTAALALLNDAVKKGGSMASSNVGGLS
  40 givDLS...LAPTPA.IGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGVMAAERVGGLS
  41 givDLS...LAPTPA.IGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGVMAAERVGGLS
  42 givDLS...LAPTPA.MGD.SVAEIIEAMGLEYCGAPGTTAALMMLTDAVKKGGAMASSMVGGLS
  43 givDLS...LAPTPA.VGD.SVGRVLEEMGLSNCGTHGTTAALALLNDAVKKGGLMASSYVGGLS
  44 givDLS...LAPTPS.VGD.SVAEILEEMGLESVGAPGTTAALALLNDQVKKGGVMASSFVGGLS
  45 givDLS...LAPTPT.IGD.SVAHILEEMGLEKCGTHGTTAALALLNDAVKKGGTMASSSVGGLS
  46 givDLS...LAPTPA.QGD.SVANILEEIGLESVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  47 gvlDLS...LAPTPA.VGD.SVAAILEAMGLESCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  48 givDLS...LAPTPA.IGD.SIANILEAVGLERCGTHGTTAALAMLNDAVKKGGAMASSNVGGLS
  49 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILENMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSHVGGLS
  50 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILENMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSHVGGLS
  51 givDLS...LAPTPA.RGD.SVAEVLEEIGLEQVGTHGTTAALMLLNDAVKKGGVMASQRVGGLS
  52 givDLS...LAPTAE.LGD.SVAHILEHMGLGQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  53 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVGEVLEKIGLEQVGAPGTTAALAMLNDQVKKGGIMASSYVGGLS
  54 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEVLEAMGLECCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSYVGGLS
  55 nivDLS...LAPTPA.KGD.SVAQILETMGLSHVGTPGTTAALALLNDAVKKGGIMAAERVGGLS
  56 givDLS...LAPTPA.RGD.SVAEVLEEIGLEQVGTHGTTAALMLLNDAIKKGGVMASQRVGGLS
  57 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVGEVLEKIGLEQVGAPGTTAALAMLNDQVKKGGIMASSYVGGLS
  58 givDLS...LAPTPK.IGD.SIAEILEEMGLEKVGGYGSTFALALLNDAVKKGGAMAASFTGGLS
  59 gvaDLS...LAPAPQ.VGD.SVGEIFQSVGLASIGVPGSTAVLAMLNDAVKKGGAFASSHVGGLS
  60 givDLS...LAPTPS.IGD.SVGEIFQSMGLSSIGAPGSTAALAMLNDAIKKGGAFASSQLGGLS
  61 gavDLS...LAPTPE.EGD.SVAEILEGIGLESCGCPGSTAALHLLMDAVKKGGAAATSRHGGYS
  62 gvvDLS...LAPTPN.VGD.SVGEIFQSLGLQSIGVPGTTAALALLNDAVKKGGAFASSYVGGLS
  63 gvvDLS...LAPTPA.IGD.SVGEIFKILGVDSVGAPGSTAILAMLNDAVKKGGIFASKTVGGLS
  64 gavDLS...VAPSPK.VGD.SVAAILEAMGLPRVGSPGSVFALALFVDAVKKGGAMAVSNIGGLS
  65 ttvDLS...LAPSPK.VGD.SVAEIIETMGIEKIGGHGSLAALAILMDAVKKGGAMATSSVGGLS
  66 lgiDVS...LSPWKE.--E.SVAEIIEKRSGKLF-SFGNMSTVAEINKEIFEIAWKLKITPIGFS
  67 lgvDIS...LSPWMT.--E.SVADIIENKSGKLF-SPGNTFAVFGINKELFNLAWQNKIKPIGFS
  68 lgiDAS...LSPWME.--S.SVGEIVESRSKKMF-DISNLSAVAEINREIFEGVWRNRVNPIGFS
  69 tgiDNS...LAPSLN.KKN.SIAFAYEKLINGKFGHSGTLSVSGMLTRVLKN----VSVKICGYS
  70 ...---...------.---.---------------------------------------------
  71 assKWSyggIDPTPApLGEvSIGRAIENFIGAPFGSGGTMTAAAIITRAVQS----TPVKQVGYA
  72 agvDLS...ISPWME.E-S.SLA-LVEEVGGVRLPEPGFAYGLRLVNEAI-AAAASKTGYAVGFN
  73 lgvDGS...LSPWGE.--E.SVAKAVERLFGVRLGEPGSHYAIRKLNNAIEE----ARVKKVGFN


       60        70        80        90       100        110       120 
       |         |         |         |         |          |         | 
   1 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.EDTPAETIAAMIADEAAIGVI
   2 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.ETTPAETIAAMIADEAAIGVI
   3 GAFIPVSEDEGMIAAVQEGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.ANTPDTTIAAMIADEAAIGVI
   4 GAFIPVSEDIGMIDAVNKGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDTSAETISGIIADEAAIGVI
   5 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.EDTPAETIAAMIADEAAIGVI
   6 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GDTPAHTISGIIADEAAIGMI
   7 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GDTPAHTISGIIADEAAIGMI
   8 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.EDTPAETIAAMIADEAAIGVI
   9 GAFIPVSEDAGMIEAVRAGALNLEKLEAMTSVCSVGLDMIAVP.GDTPASTLSAIIADEMAIGVI
  10 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVP.GDTTAETLAAMIADEAAIGVI
  11 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVP.GDTTAETLAAMIADEAAIGVI
  12 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVP.GDTTAETLAAMIADEAAIGVI
  13 GAFIPVSEDEGMIAAVQSGHINLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.ADTPDTTIAAMIADEAAIGVI
  14 GAFIPVSEDEGMIAAVQSGHINLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.ADTPDTTIAAMIADEAAIGVI
  15 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GDTPAHTISGIIADEAAIGMI
  16 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GKTPAHTISGIIADEAAIGMI
  17 GAFIPVSEDAGMIEAVKAGSLTLEKLEAMTSVCSVGLDMIAVP.GDTSAATLSAIIADEMAVGVI
  18 GAFIPVSEDEGMINAIKAGSLNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDTPASTISGIIADEAAIGVV
  19 GAFIPVSEDEGMIAPVQSGHITLEKLEAMTAICSVGLDMIAIP.ADTPDTTIAAMIADEAAIGVI
  20 GAFIPVSEDSGMVEAVEAGALTLEKLEAMTCVCSVGIDMVAIP.GDTPASTISAIIADEMAIGVI
  21 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GSTPAHTISGIIADEAAIGMI
  22 GAFIPVSEDAGMIEAVKAGALSLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GDTPATTLSAIIADEMAIGVI
  23 GAFIPVSEDAGMIRAVELGALSLEKLEAMTSVCSVGLDMIAIP.GDTSAATISAIIADEMAIGMI
  24 GAFIPVSEDEGMIAAVKSGALNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GDTPAETISGIIADEAAIGVI
  25 GAFIPVSEDAGMIKAVKRGSLNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GSTKADTISAVIADEVAIGVI
  26 GSFIPVSEDKGMIDAVRAGTISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIP.GDTPAEIISGMIADEAAIGVM
  27 GAFIPVSEDAEMIRAVSAGRLNIEKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GDTSAATISGMIADEAAIGMI
  28 GSFIPVSEDKGMIDAVRTGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIP.GDTPAETISGMIADEAAIGVM
  29 GSFIPVSEDKGMIDAVRTGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIP.GDTPAETISGMIADEAAIGVM
  30 GAFIPVSEDAGMIDAVNAGSLNIEKLEAMTVVCSVGLDMIAIP.GDTPAETISAMIADEAAIGMI
  31 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GKTPAHTLSGIIADEAAIGMI
  32 GAFIPVSEDAGMIDAVISGSLNLEKLEGMTCVCSVGLDMIAIP.GDTPASTIAGMIADEAAIGVI
  33 GAFIPVSEDAGMIDAVIKGALSIDKLEAMTAICSVGLDMIAVP.GNTTAGTLGAMIADEAAIGMI
  34 GAFIPVSEDNGMIRAVESGALSLEKLEAMTAVCSVGLDMFAVP.GDTPAEVIAAIIADEAAIGMI
  35 GAFIPVSEDAGMIKAVNAGTLNISKLEAMTAVCSVGLDMIAIP.GDTPKETISAMIADEAAIGMI
  36 GAFIPVSEDAGMIEAAEVGALKIEKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GKTPASTISGIIADEMAIGMV
  37 GSFIPVSEDKGMIDAVRAGNISVDKLEAMTAICSVGLDMIAIP.GDTSAELISGMIADEAAIGVM
  38 GAFIPVSEDAGMIKAVNAGTLNISKLEAMTAVCSVGLDMIAIP.GDTPKETISAMIADEAAIGMI
  39 GAFIPVSEDEGMIRAVKRGSLSLDKLEAMTCVCSVGLDMVAVP.GDTPAATLSAIIADEMAIGMI
  40 GAFIPVSEDEGMIAAVNSGALNIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.EETPASTIAAMIADEAAIGVI
  41 GAFIPVSEDEGMIAAVNSGALNIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.EETPASTIAAMIADEAAIGVI
  42 GAFIPVSEDMGMVRAVEVGALNIEKLEAMTAVCSVGLDMIAIP.GETPVSTIAGIIADEISIGVI
  43 GAFIPVSEDECMIEQSKNGFLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GKTSASTISGIIADEAAIGMI
  44 GAFIPVSEDQGMIDAVIRGSLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GSTPASTISGIIADEAAIGMI
  45 GAFIPVSEDAGMIDAVKAGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIVVP.GDTSEETISAIIADEAAIGVI
  46 GAFIPESEDAGMIAAAEKGILTVDKLEAMTAVCSVGLDMIAVP.GDTPAETISAMIADEAAIGMI
  47 GAFIPVSEDQGMIKAVQRGSLSLDKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GDTSPATISAIIADEMAIGMI
  48 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALRLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVP.GKTPASTLSAIMADEMAIGMI
  49 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDVEPETIAGIIADEAAIGMI
  50 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDVEPETIAGIIADEAAIGMI
  51 GAFIPVSEDAGMIDAAKEGTLTLSKLEAMTAVCSVGLDMIAIP.GDTSATTISAMIADEAAIGVQ
  52 GSFIPVSEDKGMIDAVRSGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIP.GDTPAESIAGMIADEAAIGVM
  53 GAFIPVSEDKNMIDAANNGCLKIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDTTAATISGIIADEAAIGMV
  54 GAFIPLSEDAGMIRAAECGILTLEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDTTAETLAAIIADEMAIGMV
  55 GAFIPVSEDANMITAAAKGQISLEKLEAMTAVCSVGLDMVAVP.GDTPDATISGMIADEAAIGMI
  56 GAFIPVSEDAGMIDATVAGTLSISKLEAMTSVCSVGLDMIAIP.GNTPASTISAMIADEAAIGVQ
  57 GAFIPVSEDKNMIDAASSDCLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GDTSASTISGLIADEAAIGMV
  58 GAFIPVSEDSGMVKGVEAGALSLEKLEAMTSVCSVGLDMIVVP.GDVEAEVISAMIADEIAIGIY
  59 GAFIPVSEDLNIAEAAATGRLTLEKLEAMTSVCSVGLDMVAIP.GDTPAATIAAIIADEMAIGMI
  60 SAFIPVSEDASIAAAVQSNILSLEKLEAMTSVCSVGLDMIAIP.GDTPASTISGIIADEMAIGVI
  61 EAFIPVSEDAGMARAAEE-ALTLEKLEAMTAVCSVGIDMVVVP.GDTPVETIAGIIADEAAIGVV
  62 GAFIPVSEDLNIAAAASRGYLSMEKLEAMTSVCSVGLDMVALA.GDTSAETLAGIIADEMAIGVI
  63 GAFIPVMEDAVLAEAVGDGSLCIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIP.GSVDAETISAIIADEMALGMI
  64 GAFIPVSEDAVMAQAAAEGAVTLDTLKAMAAVCNTGLDMIGIP.GDASADVVAAIIADVMALAVY
  65 SAFIPVSEDAVMSERSLEGYIDFYTLIALSSVCNSGIDMVGVS.KSQGKDKVIGLISDILALGIS
  66 EVMLPVAEDNVLIERVNEGTLTLQGLFLLTSVCVAGIDMVVVK.KDY--DLIRKILKDSMALQIV
  67 EVMLPVAEDITLMKRVEEESLRLPHLQQLTFACVAGLDMVAIT.RD--KDLYYKIFLDSIAIQFN
  68 ELMLPIAEDNLLRERVKEGSLTLKDLLLMSYVCVAGIDMVGIY.SDLV--TYENILKSVYYIQYT
  69 GLMLPVCEDVGLATRANEQTYDITNLLLYSAVCGCGLDTVPIP.GDITIEKIAALLIDMATLAIK
  70 ----------------------------MTAVCSVGLDMIAIP.GDTSATTISAMIADEAAIGVQ
  71 GLMVPVLEDAVLAKRWAEGTYNMDSLLAYSAVCAGGLDTIPLP.GDISEERLARIMGDVASLAWK
  72 EVQLPVAEDSKLKVRVAELETSARDLLRLSGVCLAGLDMAVIP.ASL--DGVAGLLLEARAYSRA
  73 EVMLPLAEDEELKRLVKNGALNLDKFISYTSVCIPGLDMAPIRiKDW--ELLKRALYDLAAIAET


            130               140        150           160       170   
             |                 |          |             |         |   
   1 NMKTTAVRII..P.KG..K.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMK.V.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPI
   2 NQKTTAVRII..P.LG..K.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMK.V.NQ.AS.SVDFINRGGQIPAPI
   3 NQKTTAVRII..P.KG..K.E..GDMIEF.GGLLGYAPVMP.V.NK.KS.SADFIARGGQIPAPI
   4 NNKTTAVRII..PvPG..K.Gl.GDEVEF.GGLLGRAPIMK.V.SK.FS.SVDFVKRGGRIPAPI
   5 NMKTTAVRII..P.KG..K.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMK.V.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPI
   6 NSKTTAVRII..PvTG..K.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMP.V.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPV
   7 NSKTTAVRII..PvTG..K.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMP.V.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPV
   8 NMKTTAVRII..P.KG..R.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMK.V.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPI
   9 NRKTTAVRVI..PaPG..K.Rv.GDSVEF.GGLLGNAPIMP.L.SN.FS.SETFVKRGGRIPAPI
  10 NNKTTAVRVI..PaSG..T.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMP.V.NG.KS.SVDFIARGGRIPAPI
  11 NNKTTAVRVI..PaSG..T.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMP.V.NG.KS.SVDFIARGGRIPAPI
  12 NNKTTAVRVI..PaSG..T.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMP.V.NG.KS.SASFIARGGRIPAPI
  13 NQKTTAVRII..P.YG..K.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMK.V.NK.AS.SADFIARGGQIPAPV
  14 NQKTTAVRII..P.YG..K.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMK.V.NK.AS.SADFIARGGQIPAPV
  15 NSKTTAVRII..PvTG..K.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMP.A.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPV
  16 NSKTTAVRII..PvTG..K.Di.GESVEF.GGLLGYAPIMP.V.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPV
  17 NKKTTAVRII..PaPG..K.Av.GDSVEF.GGLLGSAPIMP.V.SS.FS.SETFVNRGGRIPAPI
  18 NNKTTAVRII..P.VH..G.KvlGDEAVF.GGLLGRAPIMA.V.SK.FS.SADFINRGGRIPAPI
  19 NQKTTAVRII..P.YG..K.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMK.V.NK.AS.SADFIARGGQIPAPV
  20 NNKTTAVRII..PvPG..K.Ka.GEYVDY.GGLLGKAPIME.V.NK.YS.SEKFIKRGGRIPAPL
  21 NSKTTAVRII..PvSG..K.Nv.GESVEF.GGLLGYAPIMP.V.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPV
  22 NKKTTAVRVI..PaPG..K.Ev.GDSVEF.GGLLGSAPVMP.V.SN.FS.SETFIKRGGRIPAPI
  23 NKKTTAVRLI..PaPG..K.Kv.GDSVEF.GGLLGRAPVMK.V.SE.FS.SEKFIARGGRIPAPI
  24 NNKTTAVRII..PaIG..M.Gv.GDSVEF.GGLFGTAPVMP.V.SK.FS.SADFINRGGRIPSPI
  25 NNKTTAVRII..PvPG..K.Dv.GDEVEF.GGLLGTAPVMD.V.SK.FS.SSAFIGRGGRIPAPI
  26 NHKTTAVRVI..PvPG..TvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIP.V.NT.VS.NHAFVHRGGFIPAPV
  27 NNKTTAVRVI..PaTG..K.Gv.GDAVEF.GGLFGQAPVMP.V.NT.NQ.PTTFIKRGGHIPAPI
  28 NHKTTAVRVI..PvPG..TvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIP.V.NT.VG.NSEFIHRGGFIPAPV
  29 NHKTTAVRVI..PvPG..TvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIP.V.NT.VG.NSEFIHRGGFIPAPV
  30 NNKTTAVRVV..PvPG..K.Dv.GETVEF.GGLLGHAPIMA.V.NK.VS.SADMINRGGLIPAPV
  31 NGKTTAVRII..PvTG..K.Dv.GESVEF.GGLLGYAPIMP.V.KE.GS.CEIFVNRGGRIPAPV
  32 NNKTTAVRII..PaPG..C.Ei.GDMVEF.GGLLGRAPVMK.V.NG.KS.SELFAQRGGRIPAPI
  33 NNKTTAVRII..PaPG..C.Dv.GDMVEF.GGLLGRAPVMP.I.ST.NS.SELFTQRGGRIPAPI
  34 NNKTTAVRVI..PaPG..K.Kp.GETVEF.GGLLGRAPVME.V.NT.YS.PAALVRRGGRIPAPL
  35 NNKTTAVRVI..PaPG..K.Kv.GDTVEF.GGLLGYAPVMA.V.NK.VA.STAMINRGGLIPAPI
  36 NKKTTAVRLI..PvPN..K.Dv.GDHVEY.GGLLGTAPIMP.V.SE.FS.SEEFIERGGRIPAPI
  37 NHKTTAVRVI..PvPGt.K.P..GEEVNF.GGLLGYAPVIP.V.ST.VD.NSAFIHRGGFIPAPV
  38 NNKTTAVRVI..PaPG..K.Kv.GDTVEF.GGLLGYAPVMA.V.NK.AA.STAMINRGGLIPAPI
  39 NKKTTAVRII..PaPG..T.Vv.GDVVEF.GGLLGSAPVMA.V.HN.FS.AETFIGRGGRIPAPI
  40 NQKTTAVRII..P.MG..K.E..GEQIEF.GGLFGVAPVMR.V.NK.AS.SADFIARGGQIPAPI
  41 NQKTTAVRII..P.MG..K.E..GEQIEF.GGLFGVAPVMR.V.NK.AS.SADFIARGGQIPAPI
  42 NGKTTAVRII..PvPG..K.Ka.GEYVEF.GGLLGRTVIMD.V.NR.FS.SEKFVMRGGRIPAPI
  43 NNKTTAVRII..PvPN..K.Di.GDIVEF.GGLLGSAPIMR.V.SP.GN.CDDFISRGGRIPAPV
  44 NQKTTAVRLI..PvIG..K.Dv.GDMVEF.GGLLGHAPVQQ.V.NT.FD.CSKFINRGGRIPAPI
  45 NNKTTAVRII..PaPG..K.Kv.GDIVEF.GGLLGSGPVMK.V.SN.FS.SRDFINRGGRIPAPL
  46 NNKTTAVRVI..PvPG..K.Dv.GDSIEF.GGLFGYAPIMP.V.HK.ES.SAAMINRGGRIPAPV
  47 NKKTTAVRVItaP.GT..K.V..GDMVEF.GGLLGSAPVMP.V.HN.FS.SETFIARGGKIPAPI
  48 NKKTTAVRII..PvPG..K.Dv.GDYVEY.GGLLGTAPIMP.V.SE.FS.SEELIERGGRIPAPI
  49 NKKTTAVRVI..PaIG..K.Kv.GDRVEF.GGLLGSAPVIK.L.NP.FS.SREFIRRGGRIPAPI
  50 NKKTTAVRVI..PaIG..K.Kv.GDRVEF.GGLLGSAPVIK.L.NP.FS.SREFIRRGGRIPAPI
  51 NNKTTAVRIL..PtLG..T.Kv.GDMVDY.GGLLGTAPVMP.V.VE.KS.SADFINRGGHIPAPI
  52 NHKTTAVRVI..PaVG..T.Kv.GDEVDF.GGLLGYAPVIG.V.NR.AS.SADFINRGGFIPAPL
  53 NQKTTAVRVI..PvEG..K.Gv.GEMANF.GGLMGYAPIIP.V.NQ.TS.CEAFVTRGGRIPAPI
  54 NFKTTAVRII..PaPG..K.Tv.GDRVEF.GGLLGHAPIIP.V.KQ.AG.AQEFVTRGGRIPAPI
  55 NNKTTAVRVI..PvPG..K.Qv.GDIVEF.GGIFGTAPIMA.I.ND.GD.AQQFINRGGRIPAPI
  56 NNKTTAVRVI..PvPG..K.Sv.GDSIDF.GGLLGRAPIMP.V.IE.KS.STAFINRGGHIPAPI
  57 NQKTTAVRVI..PvAG..K.Gv.GEMANF.GGLMGYAPIMP.V.NQ.TS.CEAFVTRGGRIPAPI
  58 NNKTTAVRVI..PaYG..K.Ke.GDEVNF.GGLLGRSKVMS.I.NK.SS.PKRLIERGGRVPPPV
  59 NNKTTAVRII..PvPG..K.Ka.GDTVSF.GGLLGESAIMP.V.PGsGG.SEKFIRLGGRMPAPI
  60 NKKTTAVRII..PvPG..K.Kv.GEKAFF.GGLLGEATITP.V.PK.GN.ATTFIKHGGCIPAPL
  61 TGKPTAVRII..PaPG..K.Ep.GDEFEM.GGLLGRAPVMD.V.SD.YR.PTMF-RRDGRIPPKF
  62 NKKTTAARLI..PvPG..K.Ka.GEKASF.GGLLGEAVIIA.VsSN.FG.SREFISLGGRIPAPI
  63 NGKTTAARLI..PvPG..K.Ev.GDHVSF.GGLFGASPIMP.I.NN.IGkSSRFIQWGGRIPAPI
  64 LDKPLGVRLV..PvPGg.K.P..GDYYDL.GGLYGKVAVME.I.SR.YS.KIPLMSRGGTAPPGV
  65 LNKILGARII..P.ID..S.Pp.GSYIDL.GGLLGKIVVMK.L.KD.VN.VSKFTSYRGFIPSTV
  66 KRRPYGVRLI..P.ST..D.S..G-YVYL.KD-YGRIPEIK.T.L-.--.---------------
  67 KRRPYGIRII..P.ST..G.S..G-YIFI.NG-YGKIPEIKtV.--.--.---------------
  68 KRKPYGVRMI..P.TN..-.-..GSPV-L.TKMFGEIPEVK.V.V-.--.---------------
  69 LDKPLSARLF..PiPN..K.Ka.GEMTTF.NSPY-LVD---.-.--.--.---------------
  70 NNKTTAVRIL..PtLG..T.Kv.GDMVDY.GGLLGTAPVMP.V.VE.KS.SADFINRGGHIPAPI
  71 WHKPLAARLL..PaPG..KhP..GDHTEFdDGRMANTLVR-.-.--.--.---------------
  72 KGSIVGVRLI..P.LDgvE.P..GDEVFL.K-RFGEVPVIP.I.--.--.---------------
  73 KGRPIGVRIF..P.VD..A.-..-EEYYI.EG-FGPTPALL.L.--.--.---------------


             
            
   1 HSFK.N.
   2 HSFK.N.
   3 HSFK.N.
   4 HSFK.N.
   5 HSFK.N.
   6 QSMK.N.
   7 QSMK.N.
   8 HSFK.N.
   9 QSLT.N.
  10 HSFK.N.
  11 HSFK.N.
  12 HSFK.N.
  13 HSFK.N.
  14 HSFK.N.
  15 QSMK.N.
  16 QSMK.N.
  17 QSLT.N.
  18 HSFK.N.
  19 HSFK.N.
  20 QALT.N.
  21 QSMK.N.
  22 QSLT.N.
  23 QALT.N.
  24 HSFK.N.
  25 HSLK.N.
  26 HGFR.N.
  27 HSFK.N.
  28 HGFR.N.
  29 HGFR.N.
  30 HSFK.N.
  31 QSMK.N.
  32 HSFK.N.
  33 HSFK.N.
  34 QALG.N.
  35 HSFK.N.
  36 QSMT.N.
  37 HGFR.N.
  38 HSFK.N.
  39 QALT.N.
  40 HSFK.N.
  41 HSFK.N.
  42 QSLR.N.
  43 HSLK.N.
  44 HSFR.N.
  45 NSLR.N.
  46 HSFK.N.
  47 QSLT.N.
  48 QSLT.N.
  49 TSLS.N.
  50 TSLS.N.
  51 HSFK.N.
  52 HGYR.N.
  53 HSFK.N.
  54 QSLK.N.
  55 HSFK.N.
  56 HSFK.N.
  57 HSFK.N.
  58 ISLR.N.
  59 HSLK.N.
  60 SSLR.N.
  61 PR--.-.
  62 HSLI.N.
  63 HSFK.N.
  64 ERLK.Kg
  65 KRLElG.
  66 ----.-.
  67 ----.-.
  68 ----.-.
  69 ----.-.
  70 HSFK.N.
  71 ----.-.
  72 ----.-.
  73 ----.-.