(c) 1992-2000 Regents of the University of California, Santa Cruz
Sequence Alignment and Modeling Software System
http://www.soe.ucsc.edu/research/compbio/sam.html

Citations (SAM, SAM-T99, HMMs)

Sequence numbers correspond to the following labels:

    • T0296 SP0239 Streptococcus pneumoniae, 445 res
                     10         20        30        40        50       
                     |          |         |         |         |       
   1 ...DLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   2 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACNQVGGLS
   3 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETIGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   4 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   5 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLS
   6 givDLS...LAPTPF.VGD.SVAHILEEMGLERCGAPGTTAALALLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
   7 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
   8 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
   9 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  10 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  11 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  12 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  13 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  14 givDLS...LAPTPA.IGD.SVAHILEEMGLEMVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACGHVGGLS
  15 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVARILETMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSSVGGLS
  16 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARVLEAMGLEVVGTHGTTAALALLNDQVKKGGIMACNQVGGLS
  17 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLSVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
  18 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  19 gilDLS...LAPTPA.VGD.SVARILETMGLTVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASSAVGGLS
  20 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVAAILEAMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  21 givDLS...LAPTPA.VGD.SVARILEEMGLESCGCHGTTAALALLNDAVKKGGVMASSHVGGLS
  22 gvvDLS...LAPTPA.RGD.SIANILEAMGLEKCGTHGSTAALALLNDAVKKGGAMATSYVGGLS
  23 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAQILEEIGLEQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  24 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILEEMGLESCGAPGTTAALALLNDAVKKGGTMASSHVGGLS
  25 gvlDLS...LAPTPE.IGD.SVAAILEAMGLETCGTHGTTAALALLNDAVKKGGSMASSYVGGLS
  26 givDLS...LAPTPN.EGD.SVAEILEEIGLESVGAPGTTAALALLNDAVKKGGVMACEHVGGLS
  27 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVARIIEEIGVEACGAPGTTAALALLNDAVKKGGIMAASHVGGLS
  28 gilDLS...LAPTPA.IGD.SVARILETMGLTVCGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMASGSVGGLS
  29 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILEEIGLEQVGTHGTIAALAMLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
  30 giiDLS...LAPTPA.IGD.SVANILEEMGLEVVGTHGTTAALALLNDAVKKGGVMACSHVGGLS
  31 givDLS...LAPTPA.IGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGVMAAERVGGLS
  32 givDLS...LAPTPA.IGD.SVARVLEEMGLETVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGVMAAERVGGLS
  33 givDLS...LAPTAA.AGD.SVAEVLEEIGVAQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  34 givDLS...LAPTPA.MGD.SVAEIIEAMGLEYCGAPGTTAALMMLTDAVKKGGAMASSMVGGLS
  35 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILETMGLAQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  36 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILEVMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  37 givDLS...LAPTAE.VGD.SVANILEVMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  38 givDLS...LAPTPA.IGD.SIANILEAMGLERCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASRNVGGLS
  39 givDLS...LAPTPA.QGD.SVANILEEIGLESVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  40 givDLS...LAPTNA.QGD.SVAEILEAIGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSYVGGLS
  41 givDLS...LAPTPA.VGD.SVGRVLEEMGLSNCGTHGTTAALALLNDAVKKGGLMASSYVGGLS
  42 givGLS...LAPTAA.AGD.SVAEVLEEIGVAQVGTHGTTAALAMLNDAVKKGGIMACSHVGGLS
  43 gvlDLS...LAPTPA.VGD.SVAAILEAMGLESCGTHGTTAALALLNDAVKKGGSMASSNVGGLS
  44 givDLS...LAPTPT.IGD.SVAHILEEMGLEKCGTHGTTAALALLNDAVKKGGTMASSSVGGLS
  45 gvlDLS...LAPTPA.VGD.SVAAILEAMGLESCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSSVGGLS
  46 givDLS...LAPTPS.VGD.SVAEILEEMGLESVGAPGTTAALALLNDQVKKGGVMASSFVGGLS
  47 givDLS...LAPTPA.IGD.SIANILEAVGLERCGTHGTTAALAMLNDAVKKGGAMASSNVGGLS
  48 givDLS...LAPTAE.LGD.SVAHIMEHMGLDQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  49 givDLS...LAPTPA.RGD.SVAEVLEEIGLEQVGTHGTTAALMLLNDAVKKGGVMASQRVGGLS
  50 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILENMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSHVGGLS
  51 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEILENMGLERCGAHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSHVGGLS
  52 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVGEVLEKIGLEQVGAPGTTAALAMLNDQVKKGGIMASSYVGGLS
  53 givDLS...LAPTPA.VGD.SVAEVLEAMGLECCGTHGTTAALALLNDAVKKGGAMASSYVGGLS
  54 givDLS...LAPTPA.RGD.SVAEVLEEIGLEQVGTHGTTAALMLLNDAIKKGGVMASQRVGGLS
  55 nivDLS...LAPTPA.KGD.SVAQILETMGLSHVGTPGTTAALALLNDAVKKGGIMAAERVGGLS
  56 givDLS...LAPTAE.LGD.SVAHILEHMGLGQVGTHGTTAALALLNDAVKKGGMMACSRVGGLS
  57 giiDLS...LAPTPA.VGD.SVGEVLEKIGLEQVGAPGTTAALAMLNDQVKKGGIMASSYVGGLS
  58 givDLS...LAPTPK.IGD.SIAEILEEMGLEKVGGYGSTFALALLNDAVKKGGAMAASFTGGLS
  59 gvaDLS...LAPAPQ.VGD.SVGEIFQSVGLASIGVPGSTAVLAMLNDAVKKGGAFASSHVGGLS
  60 givDLS...LAPTPS.IGD.SVGEIFQSMGLSSIGAPGSTAALAMLNDAIKKGGAFASSQLGGLS
  61 gavDLS...LAPTPE.EGD.SVAEILEGIGLESCGCPGSTAALHLLMDAVKKGGAAATSRHGGYS
  62 gvvDLS...LAPTPA.IGD.SVGEIFKILGVDSVGAPGSTAILAMLNDAVKKGGIFASKTVGGLS
  63 gvvDLS...LAPTPN.VGD.SVGEIFQSLGLQSIGVPGTTAALALLNDAVKKGGAFASSYVGGLS
  64 gavDLS...VAPSPK.VGD.SVAAILEAMGLPRVGSPGSVFALALFVDAVKKGGAMAVSNIGGLS
  65 ttvDLS...LAPSPK.VGD.SVAEIIETMGIEKIGGHGSLAALAILMDAVKKGGAMATSSVGGLS
  66 lgiDVS...L--SPW.KEE.SVAEIIEKRSGKLF-SFGNMSTVAEINKEIFEIAWKLKITPIGFS
  67 lgvDIS...L--SPW.MTE.SVADIIENKSGKLF-SPGNTFAVFGINKELFNLAWQNKIKPIGFS
  68 tgiDNS...LAPSLN.KKN.SIAFAYEKLINGKFGHSGTLSVSGMLTRVLKN----VSVKICGYS
  69 ...---...------.---.---------------------------------------------
  70 assKWSyggIDPTPApLGEvSIGRAIENFIGAPFGSGGTMTAAAIITRAVQS---TPVKQV-GYA
  71 lgvDGS...L--SPW.GEE.SVAKAVERLFGVRLGEPGSHYAIRKLNNAIEE---ARVKKV-GFN


       60        70        80        90       100       110       120  
       |         |         |         |         |         |         |  
   1 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPEDTPAETIAAMIADEAAIGVIN
   2 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPETTPAETIAAMIADEAAIGVIN
   3 GAFIPVSEDEGMIAAVQEGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPANTPDTTIAAMIADEAAIGVIN
   4 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPEDTPAETIAAMIADEAAIGVIN
   5 GAFIPVSEDEGMIAAVQNGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPEDTPAETIAAMIADEAAIGVIN
   6 GAFIPVSEDIGMIDAVNKGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDTSAETISGIIADEAAIGVIN
   7 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGDTPAHTISGIIADEAAIGMIN
   8 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGDTPAHTISGIIADEAAIGMIN
   9 GAFIPVSEDAGMIEAVRAGALNLEKLEAMTSVCSVGLDMIAVPGDTPASTLSAIIADEMAIGVIN
  10 GAFIPVSEDEGMIAAVQSGHINLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPADTPDTTIAAMIADEAAIGVIN
  11 GAFIPVSEDEGMIAAVQSGHINLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPADTPDTTIAAMIADEAAIGVIN
  12 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVPGDTTAETLAAMIADEAAIGVIN
  13 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVPGDTTAETLAAMIADEAAIGVIN
  14 GAFIPVSEDAGMIEAVQQGALNLEKLEAMTAICSVGLDMIAVPGDTTAETLAAMIADEAAIGVIN
  15 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGKTPAHTISGIIADEAAIGMIN
  16 GAFIPVSEDEGMIAPVQSGHITLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPADTPDTTIAAMIADEAAIGVIN
  17 GAFIPVSEDEGMIAAAEAGVLTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGDTPAHTISGIIADEAAIGMIN
  18 GAFIPVSEDAGMIEAVKAGSLTLEKLEAMTSVCSVGLDMIAVPGDTSAATLSAIIADEMAVGVIN
  19 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGSTPAHTISGIIADEAAIGMIN
  20 GAFIPVSEDAGMIEAVKAGALSLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGDTPATTLSAIIADEMAIGVIN
  21 GAFIPVSEDEGMINAIKAGSLNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDTPASTISGIIADEAAIGVVN
  22 GAFIPVSEDSGMVEAVEAGALTLEKLEAMTCVCSVGIDMVAIPGDTPASTISAIIADEMAIGVIN
  23 GAFIPVSEDAGMIDAVNAGSLNIEKLEAMTVVCSVGLDMIAIPGDTPAETISAMIADEAAIGMIN
  24 GAFIPVSEDAGMIKAVKRGSLNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGSTKADTISAVIADEVAIGVIN
  25 GAFIPVSEDAGMIRAVELGALSLEKLEAMTSVCSVGLDMIAIPGDTSAATISAIIADEMAIGMIN
  26 GAFIPVSEDAEMIRAVSAGRLNIEKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGDTSAATISGMIADEAAIGMIN
  27 GAFIPVSEDEGMIAAVKSGALNLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGDTPAETISGIIADEAAIGVIN
  28 GAFIPVSEDEGMIAAAESGILTLDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGKTPAHTLSGIIADEAAIGMIN
  29 GAFIPVSEDAGMIDAVISGSLNLEKLEGMTCVCSVGLDMIAIPGDTPASTIAGMIADEAAIGVIN
  30 GAFIPVSEDAGMIDAVIKGALSIDKLEAMTAICSVGLDMIAVPGNTTAGTLGAMIADEAAIGMIN
  31 GAFIPVSEDEGMIAAVNSGALNIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPEETPASTIAAMIADEAAIGVIN
  32 GAFIPVSEDEGMIAAVNSGALNIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPEETPASTIAAMIADEAAIGVIN
  33 GAFIPVSEDAGMIKAVNAGTLNISKLEAMTAVCSVGLDMIAIPGDTPKETISAMIADEAAIGMIN
  34 GAFIPVSEDMGMVRAVEVGALNIEKLEAMTAVCSVGLDMIAIPGETPVSTIAGIIADEISIGVIN
  35 GSFIPVSEDKGMIDAVRAGTISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTPAEIISGMIADEAAIGVMN
  36 GSFIPVSEDKGMIDAVRTGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTPAETISGMIADEAAIGVMN
  37 GSFIPVSEDKGMIDAVRTGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTPAETISGMIADEAAIGVMN
  38 GAFIPVSEDAGMIEAAEVGALKIEKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGKTPASTISGIIADEMAIGMVN
  39 GAFIPESEDAGMIAAAEKGILTVDKLEAMTAVCSVGLDMIAVPGDTPAETISAMIADEAAIGMIN
  40 GAFIPVSEDNGMIRAVESGALSLEKLEAMTAVCSVGLDMFAVPGDTPAEVIAAIIADEAAIGMIN
  41 GAFIPVSEDECMIEQSKNGFLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGKTSASTISGIIADEAAIGMIN
  42 GAFIPVSEDAGMIKAVNAGTLNISKLEAMTAVCSVGLDMIAIPGDTPKETISAMIADEAAIGMIN
  43 GAFIPVSEDEGMIRAVKRGSLSLDKLEAMTCVCSVGLDMVAVPGDTPAATLSAIIADEMAIGMIN
  44 GAFIPVSEDAGMIDAVKAGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIVVPGDTSEETISAIIADEAAIGVIN
  45 GAFIPVSEDQGMIKAVQRGSLSLDKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGDTSPATISAIIADEMAIGMIN
  46 GAFIPVSEDQGMIDAVIRGSLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGSTPASTISGIIADEAAIGMIN
  47 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALRLEKLEAMTCVCSVGLDMIAVPGKTPASTLSAIMADEMAIGMIN
  48 GSFIPVSEDKGMIDAVRAGNISVDKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTSAELISGMIADEAAIGVMN
  49 GAFIPVSEDAGMIDAAKEGTLTLSKLEAMTAVCSVGLDMIAIPGDTSATTISAMIADEAAIGVQN
  50 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDVEPETIAGIIADEAAIGMIN
  51 GAFIPVSEDAGMIEAVEVGALSIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDVEPETIAGIIADEAAIGMIN
  52 GAFIPVSEDKNMIDAANNGCLKIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDTTAATISGIIADEAAIGMVN
  53 GAFIPLSEDAGMIRAAECGILTLEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDTTAETLAAIIADEMAIGMVN
  54 GAFIPVSEDAGMIDATVAGTLSISKLEAMTSVCSVGLDMIAIPGNTPASTISAMIADEAAIGVQN
  55 GAFIPVSEDANMITAAAKGQISLEKLEAMTAVCSVGLDMVAVPGDTPDATISGMIADEAAIGMIN
  56 GSFIPVSEDKGMIDAVRSGAISIDKLEAMTAICSVGLDMIAIPGDTPAESIAGMIADEAAIGVMN
  57 GAFIPVSEDKNMIDAASSDCLTIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGDTSASTISGLIADEAAIGMVN
  58 GAFIPVSEDSGMVKGVEAGALSLEKLEAMTSVCSVGLDMIVVPGDVEAEVISAMIADEIAIGIYN
  59 GAFIPVSEDLNIAEAAATGRLTLEKLEAMTSVCSVGLDMVAIPGDTPAATIAAIIADEMAIGMIN
  60 SAFIPVSEDASIAAAVQSNILSLEKLEAMTSVCSVGLDMIAIPGDTPASTISGIIADEMAIGVIN
  61 EAFIPVSEDAGMARAAEE-ALTLEKLEAMTAVCSVGIDMVVVPGDTPVETIAGIIADEAAIGVVT
  62 GAFIPVMEDAVLAEAVGDGSLCIEKLEAMTCVCSVGLDMIAIPGSVDAETISAIIADEMALGMIN
  63 GAFIPVSEDLNIAAAASRGYLSMEKLEAMTSVCSVGLDMVALAGDTSAETLAGIIADEMAIGVIN
  64 GAFIPVSEDAVMAQAAAEGAVTLDTLKAMAAVCNTGLDMIGIPGDASADVVAAIIADVMALAVYL
  65 SAFIPVSEDAVMSERSLEGYIDFYTLIALSSVCNSGIDMVGVSKSQGKDKVIGLISDILALGISL
  66 EVMLPVAEDNVLIERVNEGTLTLQGLFLLTSVCVAGIDMVVVKKDY--DLIRKILKDSMALQIVK
  67 EVMLPVAEDITLMKRVEEESLRLPHLQQLTFACVAGLDMVAITRD--KDLYYKIFLDSIAIQFNK
  68 GLMLPVCEDVGLATRANEQTYDITNLLLYSAVCGCGLDTVPIPGDITIEKIAALLIDMATLAIKL
  69 ----------------------------MTAVCSVGLDMIAIPGDTSATTISAMIADEAAIGVQN
  70 GLMVPVLEDAVLAKRWAEGTYNMDSLLAYSAVCAGGLDTIPLPGDISEERLARIMGDVASLAWKW
  71 EVMLPLAEDEELKRLVKNGALNLDKFISYTSVCIPGLDMAPIRIK-DWELLKRALYDLAAIAETK


           130             140        150          160       170       
            |               |          |            |         |       
   1 MKTTAVRII..P.KGK.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMKV.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPIHSFK
   2 QKTTAVRII..P.LGK.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMKV.NQ.AS.SVDFINRGGQIPAPIHSFK
   3 QKTTAVRII..P.KGK.E..GDMIEF.GGLLGYAPVMPV.NK.KS.SADFIARGGQIPAPIHSFK
   4 MKTTAVRII..P.KGK.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMKV.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPIHSFK
   5 MKTTAVRII..P.KGR.E..GDMIEF.GGLLGTAPVMKV.NG.AS.SVDFISRGGQIPAPIHSFK
   6 NKTTAVRII..PvPGK.Gl.GDEVEF.GGLLGRAPIMKV.SK.FS.SVDFVKRGGRIPAPIHSFK
   7 SKTTAVRII..PvTGK.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMPV.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPVQSMK
   8 SKTTAVRII..PvTGK.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMPV.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPVQSMK
   9 RKTTAVRVI..PaPGK.Rv.GDSVEF.GGLLGNAPIMPL.SN.FS.SETFVKRGGRIPAPIQSLT
  10 QKTTAVRII..P.YGK.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMKV.NK.AS.SADFIARGGQIPAPVHSFK
  11 QKTTAVRII..P.YGK.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMKV.NK.AS.SADFIARGGQIPAPVHSFK
  12 NKTTAVRVI..PaSGT.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMPV.NG.KS.SVDFIARGGRIPAPIHSFK
  13 NKTTAVRVI..PaSGT.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMPV.NG.KS.SVDFIARGGRIPAPIHSFK
  14 NKTTAVRVI..PaSGT.Kv.GDMVEF.GGLLGTAPVMPV.NG.KS.SASFIARGGRIPAPIHSFK
  15 SKTTAVRII..PvTGK.Di.GESVEF.GGLLGYAPIMPV.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPVQSMK
  16 QKTTAVRII..P.YGK.E..GDMLEL.GGLLGYAPVMKV.NK.AS.SADFIARGGQIPAPVHSFK
  17 SKTTAVRII..PvTGK.Tv.GDSVEF.GGLLGYAPVMPA.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPVQSMK
  18 KKTTAVRII..PaPGK.Av.GDSVEF.GGLLGSAPIMPV.SS.FS.SETFVNRGGRIPAPIQSLT
  19 SKTTAVRII..PvSGK.Nv.GESVEF.GGLLGYAPIMPV.KE.GS.CEVFVNRGGRIPAPVQSMK
  20 KKTTAVRVI..PaPGK.Ev.GDSVEF.GGLLGSAPVMPV.SN.FS.SETFIKRGGRIPAPIQSLT
  21 NKTTAVRII..P.VHG.KvlGDEAVF.GGLLGRAPIMAV.SK.FS.SADFINRGGRIPAPIHSFK
  22 NKTTAVRII..PvPGK.Ka.GEYVDY.GGLLGKAPIMEV.NK.YS.SEKFIKRGGRIPAPLQALT
  23 NKTTAVRVV..PvPGK.Dv.GETVEF.GGLLGHAPIMAV.NK.VS.SADMINRGGLIPAPVHSFK
  24 NKTTAVRII..PvPGK.Dv.GDEVEF.GGLLGTAPVMDV.SK.FS.SSAFIGRGGRIPAPIHSLK
  25 KKTTAVRLI..PaPGK.Kv.GDSVEF.GGLLGRAPVMKV.SE.FS.SEKFIARGGRIPAPIQALT
  26 NKTTAVRVI..PaTGK.Gv.GDAVEF.GGLFGQAPVMPV.NT.NQ.PTTFIKRGGHIPAPIHSFK
  27 NKTTAVRII..PaIGM.Gv.GDSVEF.GGLFGTAPVMPV.SK.FS.SADFINRGGRIPSPIHSFK
  28 GKTTAVRII..PvTGK.Dv.GESVEF.GGLLGYAPIMPV.KE.GS.CEIFVNRGGRIPAPVQSMK
  29 NKTTAVRII..PaPGC.Ei.GDMVEF.GGLLGRAPVMKV.NG.KS.SELFAQRGGRIPAPIHSFK
  30 NKTTAVRII..PaPGC.Dv.GDMVEF.GGLLGRAPVMPI.ST.NS.SELFTQRGGRIPAPIHSFK
  31 QKTTAVRII..P.MGK.E..GEQIEF.GGLFGVAPVMRV.NK.AS.SADFIARGGQIPAPIHSFK
  32 QKTTAVRII..P.MGK.E..GEQIEF.GGLFGVAPVMRV.NK.AS.SADFIARGGQIPAPIHSFK
  33 NKTTAVRVI..PaPGK.Kv.GDTVEF.GGLLGYAPVMAV.NK.VA.STAMINRGGLIPAPIHSFK
  34 GKTTAVRII..PvPGK.Ka.GEYVEF.GGLLGRTVIMDV.NR.FS.SEKFVMRGGRIPAPIQSLR
  35 HKTTAVRVI..PvPGTvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIPV.NT.VS.NHAFVHRGGFIPAPVHGFR
  36 HKTTAVRVI..PvPGTvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIPV.NT.VG.NSEFIHRGGFIPAPVHGFR
  37 HKTTAVRVI..PvPGTvP..GDEVDF.GGLLGYAPVIPV.NT.VG.NSEFIHRGGFIPAPVHGFR
  38 KKTTAVRLI..PvPNK.Dv.GDHVEY.GGLLGTAPIMPV.SE.FS.SEEFIERGGRIPAPIQSMT
  39 NKTTAVRVI..PvPGK.Dv.GDSIEF.GGLFGYAPIMPV.HK.ES.SAAMINRGGRIPAPVHSFK
  40 NKTTAVRVI..PaPGK.Kp.GETVEF.GGLLGRAPVMEV.NT.YS.PAALVRRGGRIPAPLQALG
  41 NKTTAVRII..PvPNK.Di.GDIVEF.GGLLGSAPIMRV.SP.GN.CDDFISRGGRIPAPVHSLK
  42 NKTTAVRVI..PaPGK.Kv.GDTVEF.GGLLGYAPVMAV.NK.AA.STAMINRGGLIPAPIHSFK
  43 KKTTAVRII..PaPGT.Vv.GDVVEF.GGLLGSAPVMAV.HN.FS.AETFIGRGGRIPAPIQALT
  44 NKTTAVRII..PaPGK.Kv.GDIVEF.GGLLGSGPVMKV.SN.FS.SRDFINRGGRIPAPLNSLR
  45 KKTTAVRVItaP.GTK.V..GDMVEF.GGLLGSAPVMPV.HN.FS.SETFIARGGKIPAPIQSLT
  46 QKTTAVRLI..PvIGK.Dv.GDMVEF.GGLLGHAPVQQV.NT.FD.CSKFINRGGRIPAPIHSFR
  47 KKTTAVRII..PvPGK.Dv.GDYVEY.GGLLGTAPIMPV.SE.FS.SEELIERGGRIPAPIQSLT
  48 HKTTAVRVI..PvPGT.Kp.GEEVNF.GGLLGYAPVIPV.ST.VD.NSAFIHRGGFIPAPVHGFR
  49 NKTTAVRIL..PtLGT.Kv.GDMVDY.GGLLGTAPVMPV.VE.KS.SADFINRGGHIPAPIHSFK
  50 KKTTAVRVI..PaIGK.Kv.GDRVEF.GGLLGSAPVIKL.NP.FS.SREFIRRGGRIPAPITSLS
  51 KKTTAVRVI..PaIGK.Kv.GDRVEF.GGLLGSAPVIKL.NP.FS.SREFIRRGGRIPAPITSLS
  52 QKTTAVRVI..PvEGK.Gv.GEMANF.GGLMGYAPIIPV.NQ.TS.CEAFVTRGGRIPAPIHSFK
  53 FKTTAVRII..PaPGK.Tv.GDRVEF.GGLLGHAPIIPV.KQ.AG.AQEFVTRGGRIPAPIQSLK
  54 NKTTAVRVI..PvPGK.Sv.GDSIDF.GGLLGRAPIMPV.IE.KS.STAFINRGGHIPAPIHSFK
  55 NKTTAVRVI..PvPGK.Qv.GDIVEF.GGIFGTAPIMAI.ND.GD.AQQFINRGGRIPAPIHSFK
  56 HKTTAVRVI..PaVGT.Kv.GDEVDF.GGLLGYAPVIGV.NR.AS.SADFINRGGFIPAPLHGYR
  57 QKTTAVRVI..PvAGK.Gv.GEMANF.GGLMGYAPIMPV.NQ.TS.CEAFVTRGGRIPAPIHSFK
  58 NKTTAVRVI..PaYGK.Ke.GDEVNF.GGLLGRSKVMSI.NK.SS.PKRLIERGGRVPPPVISLR
  59 NKTTAVRII..PvPGK.Ka.GDTVSF.GGLLGESAIMPV.PGsGG.SEKFIRLGGRMPAPIHSLK
  60 KKTTAVRII..PvPGK.Kv.GEKAFF.GGLLGEATITPV.PK.GN.ATTFIKHGGCIPAPLSSLR
  61 GKPTAVRII..PaPGK.Ep.GDEFEM.GGLLGRAPVMDV.SD.YR.PTMF-RRDGRIPPKFPR--
  62 GKTTAARLI..PvPGK.Ev.GDHVSF.GGLFGASPIMPI.NN.IGkSSRFIQWGGRIPAPIHSFK
  63 KKTTAARLI..PvPGK.Ka.GEKASF.GGLLGEAVIIAVsSN.FG.SREFISLGGRIPAPIHSLI
  64 DKPLGVRLV..PvPGG.Kp.GDYYDL.GGLYGKVAVMEI.SR.YS.KIPLMSRGGTAPPGVERLK
  65 NKILGARII..P.IDS.Pp.GSYIDL.GGLLGKIVVMKL.KD.VN.VSKFTSYRGFIPSTVKRLE
  66 RRPYGVRLI..P.STD.S..G-YVYL.KD-YGRIPEIK-.--.--.-------------------
  67 RRPYGIRII..P.STG.S..G-YIFI.NG-YGKIPEIK-.--.--.-------------------
  68 DKPLSARLF..PiPNK.Ka.GEMTTF.NSPY-LVD----.--.--.-------------------
  69 NKTTAVRIL..PtLGT.Kv.GDMVDY.GGLLGTAPVMPV.VE.KS.SADFINRGGHIPAPIHSFK
  70 HKPLAARLL..PaPGK.Hp.GDHTEFdDGRMANTLVR--.--.--.-------------------
  71 GRPIGVRIF..P.VDA.E..EYYIE-.-G-FGPTP----.--.--.-------------------


         
        
   1 .N.
   2 .N.
   3 .N.
   4 .N.
   5 .N.
   6 .N.
   7 .N.
   8 .N.
   9 .N.
  10 .N.
  11 .N.
  12 .N.
  13 .N.
  14 .N.
  15 .N.
  16 .N.
  17 .N.
  18 .N.
  19 .N.
  20 .N.
  21 .N.
  22 .N.
  23 .N.
  24 .N.
  25 .N.
  26 .N.
  27 .N.
  28 .N.
  29 .N.
  30 .N.
  31 .N.
  32 .N.
  33 .N.
  34 .N.
  35 .N.
  36 .N.
  37 .N.
  38 .N.
  39 .N.
  40 .N.
  41 .N.
  42 .N.
  43 .N.
  44 .N.
  45 .N.
  46 .N.
  47 .N.
  48 .N.
  49 .N.
  50 .N.
  51 .N.
  52 .N.
  53 .N.
  54 .N.
  55 .N.
  56 .N.
  57 .N.
  58 .N.
  59 .N.
  60 .N.
  61 .-.
  62 .N.
  63 .N.
  64 .Kg
  65 lG.
  66 .-.
  67 .-.
  68 .-.
  69 .N.
  70 .-.
  71 .-.