# TARGET T0295 # Using neural net t2k-5740-IDaaHr-5-15-7-15-9-15-13-ebghstl-seeded.net # This is a 4-layer network, with # window units # 5 15 # 7 15 # 9 15 # 13 7 (1 EBGHSTL ) # The input amino acid frequencies were determined from # alignment T0295.t2k-thin90.a2m.gz # with weighted counts, using HenikoffWeight(-1 bits/column, 1) # Counts were regularized to probabilities using # /projects/compbio/lib/recode3.20comp # Total sequence weight for alignment was 3085 # Pos AA E B G H S T C 10N 1S 5N 5N 5N 5N 5N 5N 5N 1 H 0.037 0.014 0.128 0.064 0.191 0.209 0.356 2 L 0.042 0.012 0.189 0.109 0.146 0.276 0.225 3 L 0.039 0.023 0.172 0.104 0.182 0.204 0.276 4 K 0.025 0.037 0.039 0.109 0.368 0.080 0.343 5 N 0.013 0.004 0.003 0.102 0.117 0.013 0.747 6 P 0.001 0.001 0.016 0.953 0.004 0.021 0.005 7 G 0.001 0.001 0.008 0.975 0.003 0.012 0.002 8 I 0.001 0.001 0.005 0.987 0.001 0.005 0.001 9 L 0.001 0.001 0.001 0.996 0.001 0.002 0.001 10 D 0.001 0.001 0.001 0.992 0.001 0.005 0.001 11 K 0.001 0.001 0.001 0.990 0.001 0.006 0.001 12 I 0.001 0.001 0.001 0.991 0.002 0.005 0.002 13 I 0.001 0.001 0.004 0.980 0.003 0.011 0.002 14 Y 0.001 0.001 0.007 0.929 0.003 0.059 0.002 15 A 0.001 0.001 0.018 0.828 0.007 0.135 0.010 16 A 0.005 0.005 0.037 0.485 0.087 0.260 0.121 17 K 0.012 0.007 0.038 0.099 0.059 0.501 0.284 18 I 0.007 0.011 0.019 0.015 0.094 0.040 0.814 19 K 0.011 0.006 0.034 0.004 0.067 0.037 0.841 20 S 0.002 0.003 0.062 0.003 0.154 0.746 0.030 21 S 0.005 0.001 0.043 0.001 0.077 0.840 0.034 22 D 0.174 0.015 0.009 0.001 0.131 0.017 0.653 23 I 0.727 0.024 0.001 0.001 0.028 0.003 0.216 24 V 0.947 0.003 0.001 0.001 0.004 0.003 0.042 25 L 0.965 0.001 0.001 0.001 0.004 0.002 0.026 26 E 0.966 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.026 27 I 0.809 0.006 0.003 0.002 0.020 0.004 0.156 28 G 0.455 0.009 0.009 0.008 0.088 0.013 0.418 29 C 0.183 0.013 0.039 0.037 0.131 0.104 0.494 30 G 0.046 0.031 0.047 0.061 0.199 0.255 0.360 31 T 0.021 0.013 0.037 0.218 0.219 0.303 0.189 32 G 0.013 0.006 0.009 0.392 0.249 0.068 0.263 33 N 0.001 0.001 0.006 0.962 0.009 0.012 0.009 34 L 0.001 0.001 0.006 0.976 0.003 0.010 0.004 35 T 0.001 0.001 0.004 0.983 0.002 0.009 0.001 36 V 0.002 0.001 0.005 0.979 0.003 0.007 0.003 37 K 0.001 0.001 0.007 0.974 0.002 0.014 0.002 38 L 0.001 0.001 0.012 0.953 0.004 0.025 0.005 39 L 0.001 0.001 0.041 0.903 0.005 0.042 0.007 40 P 0.002 0.001 0.055 0.674 0.017 0.241 0.012 41 L 0.002 0.002 0.080 0.379 0.024 0.481 0.033 42 A 0.010 0.005 0.026 0.052 0.165 0.261 0.479 43 K 0.056 0.003 0.016 0.018 0.384 0.161 0.361 44 K 0.456 0.010 0.014 0.014 0.221 0.048 0.237 45 V 0.797 0.008 0.002 0.006 0.014 0.003 0.170 46 I 0.939 0.001 0.001 0.004 0.013 0.001 0.041 47 T 0.960 0.003 0.001 0.004 0.004 0.002 0.026 48 I 0.909 0.002 0.002 0.006 0.007 0.006 0.067 49 D 0.635 0.005 0.008 0.009 0.081 0.022 0.240 50 I 0.112 0.016 0.006 0.008 0.236 0.013 0.610 51 D 0.015 0.002 0.002 0.006 0.099 0.005 0.871 52 S 0.001 0.001 0.123 0.789 0.020 0.060 0.008 53 R 0.001 0.001 0.043 0.913 0.012 0.027 0.004 54 M 0.001 0.001 0.018 0.963 0.004 0.012 0.004 55 I 0.001 0.001 0.001 0.992 0.002 0.003 0.003 56 S 0.001 0.001 0.001 0.989 0.001 0.007 0.002 57 E 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.009 0.001 58 V 0.001 0.001 0.001 0.988 0.001 0.008 0.002 59 K 0.001 0.001 0.001 0.983 0.001 0.013 0.001 60 K 0.001 0.001 0.001 0.959 0.003 0.033 0.003 61 R 0.001 0.001 0.002 0.940 0.005 0.043 0.010 62 C 0.001 0.002 0.008 0.900 0.017 0.039 0.034 63 L 0.001 0.001 0.046 0.848 0.012 0.072 0.020 64 Y 0.001 0.001 0.081 0.669 0.029 0.197 0.021 65 E 0.001 0.001 0.033 0.275 0.074 0.585 0.030 66 G 0.003 0.003 0.010 0.028 0.054 0.820 0.083 67 Y 0.047 0.013 0.012 0.007 0.120 0.055 0.747 68 N 0.126 0.017 0.027 0.007 0.240 0.114 0.469 69 N 0.345 0.008 0.029 0.005 0.171 0.088 0.353 70 L 0.807 0.006 0.003 0.002 0.017 0.004 0.160 71 E 0.950 0.003 0.001 0.002 0.007 0.001 0.038 72 V 0.960 0.005 0.001 0.002 0.002 0.001 0.029 73 Y 0.925 0.005 0.003 0.006 0.006 0.004 0.052 74 E 0.811 0.007 0.007 0.014 0.032 0.013 0.117 75 G 0.417 0.007 0.025 0.033 0.155 0.058 0.305 76 D 0.231 0.021 0.050 0.044 0.170 0.094 0.389 77 A 0.124 0.017 0.252 0.133 0.097 0.156 0.221 78 I 0.094 0.015 0.260 0.125 0.092 0.252 0.163 79 K 0.055 0.016 0.220 0.141 0.174 0.203 0.191 80 T 0.032 0.014 0.050 0.078 0.352 0.099 0.374 81 V 0.017 0.022 0.051 0.044 0.150 0.143 0.574 82 F 0.013 0.008 0.092 0.032 0.216 0.333 0.306 83 P 0.022 0.009 0.083 0.024 0.293 0.365 0.204 84 K 0.090 0.021 0.050 0.017 0.227 0.147 0.449 85 F 0.165 0.007 0.003 0.003 0.134 0.011 0.678 86 D 0.515 0.006 0.002 0.003 0.258 0.005 0.211 87 V 0.954 0.011 0.001 0.002 0.003 0.001 0.028 88 C 0.985 0.001 0.001 0.002 0.001 0.001 0.009 89 T 0.978 0.001 0.001 0.003 0.002 0.002 0.013 90 A 0.864 0.003 0.002 0.005 0.016 0.011 0.099 91 N 0.418 0.008 0.010 0.012 0.202 0.048 0.304 92 I 0.153 0.010 0.045 0.033 0.274 0.086 0.399 93 P 0.058 0.020 0.228 0.085 0.148 0.208 0.252 94 Y 0.060 0.025 0.381 0.111 0.119 0.193 0.111 95 K 0.065 0.011 0.357 0.111 0.151 0.180 0.126 96 I 0.056 0.013 0.227 0.160 0.135 0.228 0.179 97 S 0.056 0.020 0.052 0.123 0.246 0.101 0.400 98 S 0.028 0.015 0.030 0.116 0.276 0.079 0.456 99 P 0.023 0.015 0.030 0.313 0.163 0.092 0.364 100 L 0.006 0.003 0.023 0.838 0.024 0.030 0.075 101 I 0.002 0.001 0.010 0.949 0.009 0.012 0.018 102 F 0.004 0.001 0.008 0.964 0.005 0.009 0.009 103 K 0.003 0.001 0.008 0.966 0.005 0.011 0.007 104 L 0.003 0.001 0.007 0.962 0.005 0.016 0.006 105 I 0.006 0.001 0.011 0.925 0.008 0.041 0.009 106 S 0.006 0.001 0.017 0.828 0.014 0.116 0.018 107 H 0.008 0.003 0.042 0.729 0.035 0.114 0.068 108 R 0.012 0.004 0.136 0.609 0.039 0.119 0.081 109 P 0.013 0.001 0.190 0.438 0.044 0.237 0.076 110 L 0.019 0.006 0.143 0.297 0.081 0.348 0.106 111 F 0.055 0.023 0.033 0.185 0.222 0.124 0.358 112 K 0.062 0.012 0.020 0.058 0.192 0.058 0.600 113 C 0.044 0.009 0.051 0.077 0.157 0.480 0.182 114 A 0.071 0.003 0.044 0.058 0.122 0.580 0.122 115 V 0.520 0.014 0.016 0.065 0.071 0.037 0.278 116 L 0.814 0.008 0.004 0.049 0.020 0.011 0.094 117 M 0.876 0.006 0.005 0.054 0.008 0.007 0.045 118 F 0.857 0.006 0.009 0.069 0.009 0.007 0.044 119 Q 0.786 0.005 0.014 0.096 0.016 0.015 0.068 120 K 0.695 0.006 0.031 0.116 0.033 0.028 0.091 121 E 0.560 0.010 0.041 0.135 0.075 0.058 0.122 122 F 0.423 0.013 0.057 0.138 0.102 0.089 0.178 123 A 0.314 0.010 0.084 0.109 0.121 0.131 0.232 124 E 0.237 0.007 0.115 0.103 0.160 0.195 0.182 125 R 0.399 0.012 0.080 0.099 0.109 0.079 0.224 126 M 0.483 0.019 0.050 0.084 0.086 0.055 0.223 127 L 0.529 0.025 0.029 0.066 0.084 0.064 0.202 128 A 0.402 0.048 0.016 0.051 0.112 0.042 0.329 129 N 0.185 0.020 0.014 0.021 0.094 0.048 0.618 130 V 0.046 0.009 0.035 0.028 0.118 0.586 0.178 131 G 0.013 0.007 0.029 0.015 0.158 0.634 0.144 132 D 0.020 0.010 0.049 0.036 0.322 0.173 0.390 133 S 0.031 0.011 0.043 0.096 0.284 0.198 0.337 134 N 0.038 0.013 0.064 0.270 0.152 0.280 0.184 135 Y 0.079 0.015 0.035 0.393 0.090 0.123 0.264 136 S 0.166 0.018 0.019 0.478 0.066 0.061 0.191 137 R 0.152 0.008 0.013 0.698 0.029 0.025 0.076 138 L 0.129 0.004 0.010 0.789 0.010 0.014 0.044 139 T 0.141 0.002 0.010 0.792 0.012 0.014 0.029 140 I 0.208 0.002 0.012 0.731 0.012 0.013 0.022 141 N 0.170 0.002 0.015 0.773 0.009 0.013 0.018 142 V 0.142 0.002 0.018 0.786 0.012 0.021 0.020 143 K 0.176 0.003 0.021 0.709 0.019 0.039 0.034 144 L 0.203 0.004 0.029 0.578 0.041 0.085 0.060 145 F 0.228 0.010 0.032 0.447 0.062 0.115 0.106 146 C 0.165 0.006 0.037 0.321 0.114 0.199 0.158 147 K 0.218 0.006 0.039 0.161 0.180 0.231 0.165 148 V 0.543 0.012 0.019 0.083 0.083 0.057 0.204 149 T 0.692 0.008 0.012 0.065 0.047 0.021 0.156 150 K 0.769 0.006 0.015 0.062 0.029 0.015 0.103 151 V 0.778 0.008 0.020 0.047 0.023 0.021 0.104 152 C 0.759 0.005 0.014 0.032 0.051 0.017 0.121 153 N 0.738 0.009 0.008 0.022 0.040 0.011 0.172 154 V 0.460 0.025 0.004 0.017 0.062 0.009 0.421 155 N 0.142 0.008 0.008 0.008 0.083 0.020 0.730 156 R 0.027 0.004 0.161 0.034 0.144 0.490 0.139 157 S 0.031 0.010 0.253 0.036 0.139 0.406 0.124 158 S 0.101 0.033 0.167 0.039 0.183 0.105 0.373 159 F 0.159 0.048 0.018 0.013 0.156 0.040 0.566 160 N 0.084 0.016 0.004 0.002 0.219 0.043 0.632 161 P 0.094 0.092 0.004 0.002 0.227 0.033 0.548 162 P 0.054 0.017 0.006 0.001 0.220 0.029 0.674 163 P 0.035 0.009 0.018 0.001 0.410 0.070 0.458 164 K 0.128 0.039 0.028 0.001 0.155 0.102 0.547 165 V 0.330 0.020 0.006 0.001 0.084 0.019 0.540 166 D 0.596 0.017 0.005 0.001 0.211 0.011 0.160 167 S 0.825 0.039 0.005 0.001 0.011 0.006 0.114 168 V 0.907 0.002 0.004 0.001 0.011 0.018 0.058 169 I 0.964 0.001 0.001 0.001 0.010 0.007 0.018 170 V 0.958 0.001 0.001 0.001 0.006 0.002 0.033 171 K 0.949 0.002 0.001 0.001 0.004 0.001 0.044 172 L 0.896 0.009 0.001 0.001 0.005 0.001 0.088 173 I 0.782 0.013 0.001 0.001 0.020 0.003 0.181 174 P 0.596 0.013 0.002 0.001 0.079 0.013 0.295 175 K 0.234 0.009 0.006 0.003 0.128 0.026 0.594 176 E 0.114 0.016 0.004 0.004 0.208 0.026 0.628 177 S 0.051 0.017 0.004 0.005 0.194 0.024 0.706 178 S 0.022 0.012 0.003 0.005 0.197 0.033 0.728 179 F 0.016 0.023 0.004 0.009 0.148 0.042 0.758 180 L 0.003 0.006 0.001 0.004 0.003 0.014 0.970 181 T 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.001 0.999