PFRMAT RR
TARGET T0293
AUTHOR 5370-1100-4902
REMARK From group SAM-TO6 under the direction of
REMARK Kevin Karplus.
REMARK Residue-residue contact predictions
REMARK  by George Shackelford and Kevin Karplus
REMARK The value given is an approximation of the probability
REMARK as provided by the neural network.
REMARK The predictions are limited to a score >= .18 which
REMARK is an approximation of the probability.
REMARK
METHOD The predictor is an artificial neural network.
METHOD NN: logseploglen.5xt04_ent.5xnearNS_str2.miRpz_entR_pplR.n45.net
METHOD Inputs may include separation and sequence length,
METHOD e-value statistic based on mutual information values,
METHOD a statistic based on propensity of residues in contact.
METHOD Other inputs are distributions from alignments and
METHOD secondary predictions from SAM-t04 and/or SAM-t06 of
METHOD the University of California, Santa Cruz
MODEL 1
VSLNFKDPEAVRALTCTLLREDFGLSIDIPLERLIPTVPLRLNYIHWVE
3 12 0 8 0.139976985067
3 13 0 8 0.21421685506
3 14 0 8 0.258839565304
3 15 0 8 0.22070793975
3 16 0 8 0.424365972893
3 17 0 8 0.24093199183
3 18 0 8 0.255030924453
3 19 0 8 0.240692243939
3 20 0 8 0.169150432301
3 22 0 8 0.19292841343
3 23 0 8 0.20766819184
3 24 0 8 0.227881834241
3 25 0 8 0.301308185987
3 26 0 8 0.212103039869
3 27 0 8 0.484596224057
3 28 0 8 0.171241801624
3 29 0 8 0.279132069767
3 30 0 8 0.141413845901
3 31 0 8 0.168560658996
3 33 0 8 0.169988086059
3 34 0 8 0.252813012484
3 35 0 8 0.377357820679
3 36 0 8 0.175633709733
3 37 0 8 0.206226776772
3 38 0 8 0.234772065013
3 39 0 8 0.177459632273
3 40 0 8 0.202731402161
3 41 0 8 0.20901884753
3 42 0 8 0.210821673597
3 44 0 8 0.218207665273
3 45 0 8 0.37104857022
3 46 0 8 0.238351042349
3 47 0 8 0.218785727691
4 14 0 8 0.135054508695
4 15 0 8 0.17527457585
4 16 0 8 0.185288360556
4 17 0 8 0.153902531495
4 18 0 8 0.155611995765
4 22 0 8 0.142507187369
4 25 0 8 0.138479943284
4 27 0 8 0.210537684576
4 28 0 8 0.216979648599
4 29 0 8 0.208378001742
4 31 0 8 0.154048592286
4 34 0 8 0.206523127286
4 35 0 8 0.234499786879
4 36 0 8 0.157307472031
4 37 0 8 0.214462458395
4 38 0 8 0.141634075646
4 39 0 8 0.193257619489
4 40 0 8 0.208208193874
4 41 0 8 0.186101291329
4 42 0 8 0.166836230814
4 43 0 8 0.176737460879
4 44 0 8 0.171785056683
4 45 0 8 0.145057883723
4 46 0 8 0.129442716474
4 47 0 8 0.171470814535
5 14 0 8 0.257199065149
5 15 0 8 0.249111721435
5 16 0 8 0.206772308947
5 17 0 8 0.257416692475
5 18 0 8 0.254595995104
5 19 0 8 0.240507472159
5 20 0 8 0.241135305849
5 21 0 8 0.180203232969
5 22 0 8 0.191796686275
5 23 0 8 0.252616204514
5 25 0 8 0.267140945347
5 26 0 8 0.227050035928
5 27 0 8 0.263001809898
5 28 0 8 0.229688889241
5 29 0 8 0.251419091571
5 30 0 8 0.193445644293
5 31 0 8 0.251183572612
5 33 0 8 0.202796137344
5 34 0 8 0.248725912753
5 35 0 8 0.244422161602
5 36 0 8 0.222091450986
5 37 0 8 0.235041415426
5 38 0 8 0.227897774061
5 39 0 8 0.220107756767
5 40 0 8 0.239315564055
5 41 0 8 0.243315808038
5 42 0 8 0.252182251072
5 43 0 8 0.231502450288
5 44 0 8 0.23658952969
5 45 0 8 0.241543560398
5 46 0 8 0.222093077498
5 47 0 8 0.221003314357
6 15 0 8 0.159089153441
6 16 0 8 0.139680959856
6 17 0 8 0.235307187511
6 18 0 8 0.131329795871
6 20 0 8 0.127936566222
6 23 0 8 0.24276734814
6 27 0 8 0.181300152763
6 28 0 8 0.143563444359
6 29 0 8 0.174732622002
6 31 0 8 0.148858392014
6 34 0 8 0.200500803397
6 35 0 8 0.204655240732
6 36 0 8 0.146070224886
6 37 0 8 0.190772634225
6 38 0 8 0.162714974327
6 39 0 8 0.136391826985
6 40 0 8 0.177703283794
6 41 0 8 0.162251743666
6 42 0 8 0.156374829964
6 43 0 8 0.144758280185
6 44 0 8 0.146740347892
7 16 0 8 0.224478520218
7 17 0 8 0.160733557225
7 18 0 8 0.138428870803
7 22 0 8 0.184441598331
7 23 0 8 0.149451743647
7 27 0 8 0.197265996033
7 29 0 8 0.189670834895
7 31 0 8 0.156677361224
7 34 0 8 0.19911566565
7 35 0 8 0.211766677157
7 36 0 8 0.1535684459
7 37 0 8 0.216772105649
7 38 0 8 0.128958666458
7 39 0 8 0.18155811759
7 40 0 8 0.197981336076
7 41 0 8 0.200142320119
7 43 0 8 0.127302551786
7 44 0 8 0.141154254562
7 46 0 8 0.191171780307
7 47 0 8 0.127307756625
8 17 0 8 0.176051398054
8 18 0 8 0.145975561879
8 20 0 8 0.134455952224
8 22 0 8 0.12654004289
8 23 0 8 0.142065426669
8 26 0 8 0.124890759569
8 27 0 8 0.176074494526
8 29 0 8 0.153339107686
8 31 0 8 0.129868537355
8 33 0 8 0.133764033955
8 34 0 8 0.176818461184
8 35 0 8 0.155714791333
8 36 0 8 0.127230659949
8 37 0 8 0.173470448573
8 40 0 8 0.156699481789
8 47 0 8 0.125565111507
9 35 0 8 0.131667459793
10 19 0 8 0.221909281625
10 20 0 8 0.180200305247
10 22 0 8 0.239646721928
10 23 0 8 0.216933130352
10 25 0 8 0.222269391415
10 27 0 8 0.201070733255
10 29 0 8 0.230095842581
10 30 0 8 0.125295435792
10 33 0 8 0.12933243895
10 34 0 8 0.228788126812
10 35 0 8 0.22824714887
10 36 0 8 0.139237897946
10 37 0 8 0.170535895351
10 38 0 8 0.228993392645
10 39 0 8 0.188663047966
10 40 0 8 0.151310521732
10 41 0 8 0.173234279009
10 42 0 8 0.149112778514
10 43 0 8 0.148802114694
10 44 0 8 0.190208559812
10 45 0 8 0.179242614893
10 46 0 8 0.217592518377
10 47 0 8 0.172723879496
11 20 0 8 0.209245583323
11 21 0 8 0.140371902218
11 22 0 8 0.21135484428
11 23 0 8 0.242193189351
11 24 0 8 0.133564298263
11 25 0 8 0.32889066776
11 26 0 8 0.145849019233
11 27 0 8 0.250491979646
11 29 0 8 0.253415472585
11 31 0 8 0.181564948941
11 33 0 8 0.152167368333
11 34 0 8 0.255338009947
11 35 0 8 0.231885656551
11 36 0 8 0.15791643818
11 37 0 8 0.193676283716
11 38 0 8 0.228542523477
11 39 0 8 0.187723249246
11 40 0 8 0.195937135606
11 42 0 8 0.220015696179
11 43 0 8 0.156885880082
11 44 0 8 0.21459160346
11 45 0 8 0.233302023332
11 46 0 8 0.221863739285
11 47 0 8 0.202024194678
12 23 0 8 0.174878032188
12 27 0 8 0.178859083328
12 29 0 8 0.127277828801
12 34 0 8 0.201149781746
12 35 0 8 0.182987821771
12 37 0 8 0.187803924248
12 38 0 8 0.131346386294
12 40 0 8 0.15874238105
12 41 0 8 0.149459550905
12 42 0 8 0.132851560639
12 44 0 8 0.187781478381
12 47 0 8 0.136821876798
13 23 0 8 0.197356430108
13 25 0 8 0.17603220521
13 27 0 8 0.173247941711
13 34 0 8 0.178576720818
13 35 0 8 0.177729958593
13 37 0 8 0.214333963935
13 38 0 8 0.134561350211
13 40 0 8 0.139601911366
13 41 0 8 0.144067663126
13 42 0 8 0.126990912058
13 44 0 8 0.131396482869
13 45 0 8 0.134135854633
13 47 0 8 0.192412809078
14 23 0 8 0.230008661529
14 25 0 8 0.404382064311
14 27 0 8 0.26640298966
14 29 0 8 0.260186642667
14 31 0 8 0.159031900213
14 33 0 8 0.155624357258
14 34 0 8 0.264707045236
14 35 0 8 0.223493179157
14 36 0 8 0.183150147683
14 37 0 8 0.199818644202
14 38 0 8 0.23675283151
14 39 0 8 0.143402744959
14 40 0 8 0.191687384659
14 41 0 8 0.200778611673
14 42 0 8 0.214017444671
14 43 0 8 0.167236352803
14 44 0 8 0.241749802139
14 45 0 8 0.254044607485
14 46 0 8 0.223652577348
14 47 0 8 0.217066179045
15 24 0 8 0.189323737202
15 25 0 8 0.576223277926
15 26 0 8 0.166649507219
15 27 0 8 0.26231412056
15 28 0 8 0.132303426044
15 29 0 8 0.252076527783
15 31 0 8 0.194209454399
15 33 0 8 0.181194429473
15 34 0 8 0.260007726331
15 35 0 8 0.249706374277
15 36 0 8 0.21621941682
15 37 0 8 0.245205164552
15 38 0 8 0.260182413736
15 39 0 8 0.199284497611
15 40 0 8 0.229421815946
15 41 0 8 0.219279211477
15 42 0 8 0.241540632677
15 43 0 8 0.254135692165
15 44 0 8 0.232307248501
15 45 0 8 0.249618217318
15 46 0 8 0.226469696392
15 47 0 8 0.249142625166
16 25 0 8 0.219011487577
16 27 0 8 0.257376680276
16 29 0 8 0.185279252088
16 31 0 8 0.124732662588
16 33 0 8 0.132069858899
16 34 0 8 0.215311172435
16 35 0 8 0.259210735377
16 36 0 8 0.150665447013
16 37 0 8 0.200640032838
16 38 0 8 0.17087974002
16 39 0 8 0.145485005814
16 40 0 8 0.197326176982
16 41 0 8 0.197644322759
16 42 0 8 0.173581376702
16 44 0 8 0.188469818323
16 45 0 8 0.177106028532
16 46 0 8 0.19720939341
16 47 0 8 0.177680512623
17 27 0 8 0.236327661234
17 29 0 8 0.227431290376
17 31 0 8 0.14179119672
17 33 0 8 0.150314120389
17 34 0 8 0.23244777915
17 35 0 8 0.217555759203
17 36 0 8 0.158309403516
17 37 0 8 0.204804229245
17 38 0 8 0.247940957989
17 39 0 8 0.148757222958
17 40 0 8 0.201280553322
17 42 0 8 0.228563993437
17 43 0 8 0.165500864338
17 44 0 8 0.201883013423
17 45 0 8 0.17438162068
17 46 0 8 0.174377066446
17 47 0 8 0.181705479591
18 27 0 8 0.281559401585
18 29 0 8 0.264797154009
18 31 0 8 0.157380665078
18 33 0 8 0.146156755332
18 34 0 8 0.302846935913
18 35 0 8 0.227055240767
18 36 0 8 0.192293097784
18 37 0 8 0.194679516411
18 38 0 8 0.239193250341
18 39 0 8 0.137804290137
18 40 0 8 0.184720382513
18 41 0 8 0.19169421601
18 42 0 8 0.212172654589
18 43 0 8 0.159817830884
18 44 0 8 0.252887506741
18 45 0 8 0.26222433709
18 46 0 8 0.221006892684
18 47 0 8 0.212045786642
19 28 0 8 0.135804330797
19 29 0 8 0.26332873884
19 31 0 8 0.172602866992
19 33 0 8 0.164940693553
19 34 0 8 0.298604099751
19 35 0 8 0.240674352305
19 36 0 8 0.209536078394
19 37 0 8 0.20450495101
19 38 0 8 0.249235011056
19 39 0 8 0.177003232964
19 40 0 8 0.196794307509
19 41 0 8 0.203565802894
19 42 0 8 0.221647413169
19 43 0 8 0.191856867225
19 44 0 8 0.250321521172
19 45 0 8 0.262646254341
19 46 0 8 0.237506882543
19 47 0 8 0.223779119993
20 29 0 8 0.169130588853
20 31 0 8 0.213280309364
20 33 0 8 0.128058879936
20 34 0 8 0.215759439184
20 35 0 8 0.215148846522
20 36 0 8 0.162550045995
20 37 0 8 0.180068557763
20 38 0 8 0.14151143663
20 39 0 8 0.124844241322
20 40 0 8 0.1755891433
20 41 0 8 0.160346447333
20 42 0 8 0.159842228566
20 43 0 8 0.143580360086
20 44 0 8 0.16830822431
20 45 0 8 0.13043814191
20 46 0 8 0.151189509228
20 47 0 8 0.144201037122
21 34 0 8 0.161337643838
21 35 0 8 0.168235031263
21 37 0 8 0.18792200903
21 40 0 8 0.202214171297
21 41 0 8 0.138945125759
21 42 0 8 0.148138497736
21 44 0 8 0.136609779614
21 47 0 8 0.145302185848
22 31 0 8 0.174600549215
22 33 0 8 0.162662600635
22 34 0 8 0.217885615867
22 35 0 8 0.212649547952
22 36 0 8 0.200602623058
22 37 0 8 0.204930121286
22 38 0 8 0.17902140924
22 39 0 8 0.211266362019
22 41 0 8 0.1881454918
22 42 0 8 0.159763180076
22 43 0 8 0.167647209772
22 44 0 8 0.18210560158
22 45 0 8 0.142301270931
22 46 0 8 0.200068476468
22 47 0 8 0.167130629513
23 33 0 8 0.187383308206
23 34 0 8 0.236038467374
23 35 0 8 0.225675633161
23 36 0 8 0.193826573439
23 37 0 8 0.212123859225
23 38 0 8 0.230696025564
23 39 0 8 0.183839788835
23 40 0 8 0.202249954564
23 41 0 8 0.199925668701
23 42 0 8 0.212841151083
23 43 0 8 0.189515665635
23 44 0 8 0.20111562499
23 45 0 8 0.209120992493
23 46 0 8 0.205004615542
23 47 0 8 0.230428301664
24 34 0 8 0.128731605361
24 35 0 8 0.155950635595
24 37 0 8 0.136236007121
24 46 0 8 0.221687100065
24 47 0 8 0.150543458602
25 34 0 8 0.296883978454
25 35 0 8 0.264589285756
25 36 0 8 0.199495293586
25 37 0 8 0.233565843603
25 38 0 8 0.30228891465
25 39 0 8 0.173990281856
25 40 0 8 0.235422344571
25 41 0 8 0.210086164803
25 42 0 8 0.466830964422
25 43 0 8 0.215450727178
25 44 0 8 0.237224845336
25 45 0 8 0.259125831443
25 46 0 8 0.248996564374
25 47 0 8 0.302328828025
26 35 0 8 0.248785443097
26 36 0 8 0.15366896435
26 37 0 8 0.223169177937
26 38 0 8 0.192054976405
26 39 0 8 0.149834624607
26 40 0 8 0.175432672831
26 41 0 8 0.204145491824
26 42 0 8 0.193406933304
26 44 0 8 0.201693036804
26 46 0 8 0.21389025142
26 47 0 8 0.219043692518
27 36 0 8 0.22062889126
27 37 0 8 0.242759540882
27 38 0 8 0.252151347342
27 39 0 8 0.207272624085
27 40 0 8 0.234502714601
27 41 0 8 0.239526034727
27 42 0 8 0.25298639868
27 43 0 8 0.227869472749
27 44 0 8 0.25204269633
27 45 0 8 0.27529131405
27 46 0 8 0.339415867543
27 47 0 8 0.251502368994
28 37 0 8 0.238259307064
28 38 0 8 0.13635767023
28 40 0 8 0.213493057153
28 41 0 8 0.242697082816
28 42 0 8 0.179339880319
28 43 0 8 0.19930303985
28 44 0 8 0.194811263895
28 45 0 8 0.253920016654
28 47 0 8 0.210643407866
29 38 0 8 0.423007611078
29 39 0 8 0.256325628125
29 40 0 8 0.247869716757
29 41 0 8 0.257795995109
29 42 0 8 0.260506414956
29 43 0 8 0.255142828489
29 44 0 8 0.315219472957
29 45 0 8 0.456862282876
29 46 0 8 0.346599555342
29 47 0 8 0.257014293369
30 39 0 8 0.15580002057
30 40 0 8 0.20970425975
30 41 0 8 0.216126055022
30 42 0 8 0.198054529123
30 43 0 8 0.18740119984
30 44 0 8 0.207664938816
30 45 0 8 0.156930121212
30 47 0 8 0.143709179848
31 40 0 8 0.244599451427
31 41 0 8 0.226546467766
31 42 0 8 0.229874311626
31 43 0 8 0.217575927953
31 44 0 8 0.222608356547
31 45 0 8 0.20120801088
31 46 0 8 0.205284375632
31 47 0 8 0.196169401541
32 41 0 8 0.192863678246
32 42 0 8 0.163488868808
32 43 0 8 0.153187191451
32 44 0 8 0.141096676032
32 47 0 8 0.140113612088
33 42 0 8 0.198123818541
33 43 0 8 0.174272319063
33 44 0 8 0.191051418408
33 45 0 8 0.158192294641
33 46 0 8 0.162195141043
33 47 0 8 0.195962509195
34 43 0 8 0.253856257378
34 44 0 8 0.268388338129
34 45 0 8 0.305529052885
34 46 0 8 0.259635905653
34 47 0 8 0.252503975176
35 44 0 8 0.242657395919
35 45 0 8 0.268968482014
35 46 0 8 0.419244655718
35 47 0 8 0.248591237547
36 45 0 8 0.219071668527
36 46 0 8 0.211651194794
36 47 0 8 0.22392322897
37 46 0 8 0.219706333568
37 47 0 8 0.257915381101
END